Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA022113

[Submit comment/correction]

Sequence	AA022113
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA022113
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGACAGAAGCTGGATAACAAAAGGAGTTAGAAGGCTTTCTTATGAGCA TCTAAGGGGAGTGGATGAGTTCATGCGATTTTTTCATAGAAGTGTTCCCG ATGATGCTCAAGTTTTATGCCCATGCCCCAGCTGTATGAATCGTGTTGAA CAAACTCTACCAAATGTAGAGGCTCATATGCTAATGCGTTTGATGGCATG CACGTATGATAGGTGGATCCATCATGGAGAGCCTTTACATCCAGAACCCA GAGCTGAACCTGAACCCGGTGAAGGCGCAGATCATGTTGATGATGGCGGT GAGTTTGTACAAGATGATGTTCCGCAAGAAGATGTTGGTTTGGAGGCAGA GGATGGCTATGAGGATGATAGAATCCCTGATCTATTTAGGGATTTGTACG AGTCTGAACCGCAAGGTGCTGGAGAGCATACAATCTATGCAGAGCTGATA GAGGAGGCCAAGCGCGCAGCTAGTGATGGTGGGACATTGTCCAGATTTTC TTTTACCGTGAAGTTACTCCATGTCAAGTCCTTTCTACCGAATCAGCAAT GTCGCCTTCAACGCAATACTCCGTATATTGACCATCCAATACCCTAAAAG TGCAATTCCCAAATCTTATGAAGAAGCATTGGGTATAATCGATAGATTGG GGCTTGGTTATGATTCAATCCATGTCTGCCCGAACAACTGTATCTTGTTT CGGAACAGGTACGCCAAGCATGACAGGTGCCCGAAATGTGATGCCTCAAG GTGGAAAGATGCGGATGGGAGGAAGCAGATACCGGAGAAGGTGTTGAGGT ACTTTCCTGTGATTCCAAGGCTTCAGAGGATGTTCATTTTGAAGTAACAG TCGGAGGATGTACAGTGGCACAAGCTAAAGCGGCAAACCGTGGATAATGA ACTTAGCCATCCAGCCGACGGAAAGGCATGGAAAGATTTTGATGATAAAC ATAAAGAGTTTGCCGCCGAGGCGAGGAACATCATACTCGGCCTTGCCACA GATGGCTTTAATACATTTGGAATGAGCTCGAAATATAGCATGTGGCCGGT ATTTGTTGTGTCGTACAATCTTCCACCATGGGCATGTATGGAGCAGTCCA ACTTCATGATGGCTTTGCTAATCCCAGGTCCAAAATCTCCAGGAAAGCAT TTTGATGTCTTTATGGAGCCCCTAGTAGAAGATCTCCTCAAACTCTGGAA GGGTGTCCGTACCTATGATGCCCTGAGTCCTGATAAGTTCGATCTCCGTG CTGCGGTAATATGGTGTATCCATGATTTCCCAGCGCTGCAAACTTTGTCG GGGAGGCTCACGTCTGGTTATCAAGCATGTGTGCGTTGTGACAAGGATTC GTTCTCGGAAAGAATAAGGAACAAGATATGTTGGACCGGGGGGCGTCGTT TCCACCATCCTTGGCGAAAAAGCAAAGATTTCAATGGAAAAAACTGAAAC CCGTGACCAGCCGACGGAGTTCACTAAAGAAGAGCTCGAGCAACAGCTTC ACAATGTGAAAGATGTGAGACCTGGAAAACATCAGAAGAAAAGGAAGCGT GAGGATGGACAATGTTGGGACCGGAGGGATATTTTGTGGGACCTCCCTTA CTGGGAAGATCTCAAGTTGAGGCACAACCTTGATGTAATGCATATCGAGA AAAAAATATGTGATAATCTGCTTGGCACATTTATGAACATCGACGGGAAG TCAAAGTATACAGTTAACTCTAGGCTTGATTTGGAAGACTTGGGCATAAG AAAAGATTTGCATCTTCAGCCTGTTGAAGGTGGAGAGTCGTTTGAGATGC CAGAAGCATGGTGTACAATGACTAAAGAAGAAAAGCTTGCATTCTGTGAA TTTATAAGAGCGGTGAGATTTCCATATGGGTATGCCGCTAACCTAGCATA ATGCGTGTCTCCTGATGGATGCAAGCTCCAGGGACTAAAAACTCATGACT GTCACATCCTCCTTCAAAGGACCGGCTGGACTCCGTGGAATTTTGGTAAA GAAATATATGAAGCAGTTGCTGAGCTGGGGAATTTCTTCAGAGAATTGTG CGCCAAAACTGAATGATGTAGCCCGACCTACGGTCGTTACCACATCTTGG TCTCCAACTTACGCCAAGTTGTCATGGACTCCAAAGGTGAATCCGTTCCT CTATGCGAGCCCCCTTCCTACCCTATTGAATGGTATGCTACTTCATACTC CGTCACATATGCATGATAGGTTCACAATGACAAGTACGGAGGCCAGGGAG GAAGCCCGGAGCATCAAGACCGACAAGACGGAGGCTTGGAAGAGGAGGTG GAAGAAGACAGATCGCCAAATGCTCTCTATCTCCAGCGGTACTACGGGAT CTGGCGACCGGTACTACCGGCCACTACTACCGCCCCATACAGACGACGCC AACAGAAGTCCCAGGACTGCAAGCGGTACTACCGGATCTGGATCCGGTAC TACCGGTCAGCGGTACTACCGGACCTAAGTCCGGTACTACCGGTCATGTG TGCCTGCACGCACCTGTTGGGCCTTCGACCCATGTACCCCTCTAGCTCGT CCAAACCCTAGTTTTATCCCTAAACTACCCCTGTTTATGTGGTTGGCCTA TAAATAGAGCCCCCACCCCTCATGTATCCCTTAGGCATAGATGATAGACT AAAGACAACCCCCATTGTGGAATCTCTAGTTTTGCCTCATCCCCTTTACC AAGGGGACCGACTATCGTCACCAACCTCGATTGGACTTTGCATCACGCAT CCATCGTTGAACAAGGCCTTGGAGTTCGATGTCCCGTCTCCAAGTTGTCA AGACCCTCCCCAAGGTGTTCTTCCCTCTCCGATGTGGATTTGAGGGAGCA CGTTGACCGATCTTTCCTTGCGAGGATTCTATCGGACCGGTGGCCGTCAT TCGGAAGCAATCGGCCTTGTATCGTGTGAGTTTTGCGTGTGTTCATCGTG TTCTTCGCGAGGTGTGTGTTCGCTTCCGCTTCCGCTACCTTCTCCCTTTC CCCTCGCTTTCCCATCGATTTGACCACGAGATCCGTGAAGATCGGGCCAC CCAAGAGGTTAACCCCTCCATCATCTGGTATCAGCAGCTTTTGGTTGCCA CGGATTTCTCATCGATTTGGTCTTTTCCCCATAAATTCGAAAATTCCACC AAAAATAGCCCCAATTCGTGTTTTGGATCGATCTGTGATTTGAGTGCGTT TTGGTAGGTTTTGATCCATGGATTGCTTGCTAAACTAATTGATCTACCTT CCTTTGCGTTCCCATAGCCTAATTCCTTGATTTCCCCCTTCGATTTGGTG TTTTTCTTGAAGATTTTCCGCCCAAATCACCCCAACATCGCGAAACCGCG TCAAAACTGGGAGTTTCTGGACCCAGCGGTACTACGGGGCTTAAAATCCG GTACTACCGCCCTTTTCCGGTACTACCGCCGAGTACAGAAAGAAAACAGC AGGTTCCCAGATTTCAGCCTTTCACCGTTTTGAGCATAACTTTTGCATTC GAACTCGGATTTTGGTGTTCTTTAGCTTGTTTCGAAGAGGATAAGGAGCT CTACATCATCATCCACGTTGTTCATGCTATCTACTCCATCCAAATTCTGT GAGCAAGGCGGAATCCAACAATAAAGGGTGAAGATCGTCGACGAAAGGTA TAAACATTTCGCGACTTCTCCCCGCTTGCATTCCTTTGTGAACCCCACTA TCTTTGCGAGCAACAAACACCTATTGAGACTAGTTCCTCTTATGATTGCT TAGGCTATGCACATTTGATACCTTGTAGAATTCCGAGCAAACATTGTGAG CGCTCTCTCATATAGTTATCTTGTATAGTTGTTGGCACAAGGAAGAGGCA AGTGAAAAAGAAAAAGAAAGAAATAAAAATAAAAAGAGAAAAAAATAGAA AAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGATATATACATGTGCCTTATAGAATAGGAA GCGCAAGCTCGATGAACATCATATAGGTGGTACTTATTATGCATATCTTG TAGCCCACCAATTTTGTGCAATGGAACTAGCGTCTCTCCTTGTACTTGTG TGACACGAGCTTATAGTCTTCGCTAGGTAATCATTTGGTTCTTAGCTCAC TTTCTCCGTCGCACAATCCCATTTATCCCACCGTGTGTGTTTCCTTGTAT ATATTCCCTATCTTATGGATTGACTTGTTTTGCTTTGTGATCATTGTGGT TCTTTACTTGCCATTACAACATCTTGATTTCTGATTGATTCTTGACATGC CACTTTCCATACCTATCCACCATAGGCCTTGTGTGTGTGTTTTTTTTGGT TCGTAGTTGGTTTTAGTGTTCCGCGTGAACTTCACTTTGCTTGGTTTATT GCTCTCAAGTATGGCCACTTGTACGATACGATCTTCCAAGGTAAATTAAG GTTTGATGTTGTATCCCTAACTCCCACTACCACTTCCATATACACCGCTT GGTCTTGTGCATCATGTCTAGGGACTCCGGAACCGAGGATGATATCTATG AAGAATCCATGATGAGCCACCATGACTACGACTCCACAAGTATAGAGGAC ATGACGGAGCACAACACCGACAATGGCTCCGCATGCTTTGAGGACCCGGA GAACTACACCTACGATGACTCCACATGCATGGAAGACATGGAGCTCTACG TCGACAATGGCTCCTCATGCATGGAGACTATGGAGCACTACACCGACAAT GGCTCCACATGCTTGGGTGATATGGAGTACTACACCAACAATTACTCCCC AAACATGGATGACTTCGAGTGCGACATCGACGACGCCTCGCCAAGCATGG AGGACATGGAGAACTTCATCGAGTTTGATGGCTCCTCCACGCGCCATGAA GAATTCCTCCACCGCGTGGAGATGGAATCCTACTACGCAAAGCAAGAGGA GGCGCATCATCAAGATTCCATGACCTTCAAGGCCAAGCGTGCCACACCAA AGGGCACCACCTACTTCGATGATCCACCTCCAAGGCGACAAGTGCCACCA CCTAGATGGCGTCAAGTGCCACCATCTCCAAGGCGCCAAGCTCCATCACC TCCAAGGCGTCAAGCTCCACCATCTCCAAGGAGCCAAGCTACATCACCTC CAAGGCGCCAAGCTCCAACTCCTATCCAAACAAGAGTGGCGTCCAAACAT CATATACATCAAGAGGCGCCAAGAAACAAGAATCTTCGTCGACAAACATC CTGTCATGAGCATGGCCACCATAAAGAGGATACAAGATATCGTCAAAGGC ATCTTCGCCACAAAGAGGAAGAATTCGTGATGAGCACCAACCATAATGCT CAAGCAAGCTCAAGAAGGCACCACAAGCACAAGAAGAGTGCCAAGGCAAG TGATCATCATCGCGAGTGTCATGTGGACGACCAAGTGCGCCACCTACATC AACCATCGGCAAGGCACGCCAATGACCTCCGTCGACACCATCATAGGGCA CCTTCAACTACTCGTGCCACCACCACAATGGCACCAAGAGCAATCCTTCC TCCACGCCATCAAGCTTCAATGCCTACGCTTGACTTCCACAACCTCGCCA ACGAGGAAAATGTAGACCTCTACTTCGCCAAGTTGGATAGCATGAGCCTA CCTCCACCACTACTACGCGATGGCCACGAGACGGTCGAGAATGGGATTTT CCCTTCGACCATGGAGGAGAGCGATGAGGCCCACCTTATGGCATCCAACC TTGAAGGAGACAAGGTTAAGAATGGTGAGCATGGGATTTTCCCTTCATCA AAGGAGGCGCATGGAGTTGAGGAAACCGAGCCTATCCCCATATGCTTGAG TGATGATGTGGTACCAATCCCATGCGAGTATGAGAGCCACTTAGCCCACT TGAGTGAGAACAAGAGTGAGATGAGTGACTCCACCTTATGTGAGATTGAG TGCTTCCACTTGGAGGGCATGAGCGATACTCCTAGTGAGTTGAGAGTGGT AGTTGATAGGTCAAGTGAGACCATTTCGATTTCTAACAACTTACCCTCTA CCTCTAGTGTGTTCTCTTGTGTTATGCTAGGTTCCATGGATGAAGACGCG CCAAGCCATGAAGCAATGATGCCTCAATTGGAGAAGATGTACATGGTGCA CGAAGATGATGCTACGCCATGGCTACATCAAGAAAATGAAGTCGTCCACA AGGAGGCCACTACTTCCACAACACCCACTTCATATGAGAGGTATGGCCAA GGTAATAATAAGGGTGTTGATGATGCCATGATCCCACTAGTGGACATGAT GAATTGTGAGGATATGCATGCTATGGATGTTACTTGTGACATTACATATG CTTCATCCACTTTCCCATGTGATGCTTTGCCTTTGCATAATATTGATCAT GTGGAATTGTTTGATTGCGATATCATTGCCATAAACATGCCATGCTATGC ATCTTGTGTGTATCCTCCAATTGCTTCGGACTTGTCTTGTCATGCTAGTC ATTCAATTTCTCCCGTTGCTTGCGATAAGATGAATGCTTGCTATTTCACT TGTTTTGCTTGCAACAATATTGATCATATGCGTTCTAATGAGATGGCCCC CATAGCTTTCTCAATTTTTGGAGATTTTGATGATTGCCATGATAAGCATG TTCCCCACTTGCATACTCACCATGCATCTATTTCATACTTGATTGAAATT AATGGTGATGTGCACAAGAAGAGATACGTCATGATGGATGATGTGTATAT CTGCCATGCACACACGTTTTTCCTTTTACATATGATGTGTGTAGGTACCC GCACGAGAATGCCAACCTCGGTTGAGCACGAGTTGACAAAAGATCTCTTG AGAGCATCCCACAAGTGAGTTCAAGACCGAACCCAGCTCTGATACCTTTT GCATGCTTTGCATCTTTCATGTTGACAAATTGCTCTTTCCTATGGTTTGC TTGCAAGCATGTTAATGGTATTATCTCCCCTTGTGACATTCATGTTTCTT CGCTTTTAGATAATGATGTTTTGTGTGTTGTAACAAAATTGTTGAACAAT TTCTCTCTCCGATGTTTTGTATGCAACCACAATTCCATTAAGAGCATGTA TTGTCATGAGAGCTTCCAAGAATCTTGTCTTGTAGTTGCAACAAACATAA GGACCACTAGCTCTTTCATTTGGTTTGTTTGCAAACGTGTTATTTTTGCT TTCGTTTGGGATACTCATGATCCCATGATATTTTATTTTGATGATTTGTG TGTGACATCCAACATGTCGAACAATTTCTCTTTCCAATGGTTGGTTGGCA CACATAATAATGTTGCTTTGGACATTCTTCCTTTTGTGTTTTTGCCAAAT TCTCCTAGTTTTGCATCAAAGATGTTGATCAAATTTCTATTTCGATTGCT TTGAATGCCATGATAAGATGTTATTTGGAGTTTTTGAGTTCCCACATTTG GATGATTTTGCAATGACTTCCATGCACTTTGACCTTGCATATGCATCCCG TTTGCTATACTTGAGTTGTGCTAATCGTGTCGTGAACAAGAATGGACATG CCACAAATGACATGCTCCTCTATCACACACAAACATATGTTGCTTGGTCT TTGTTGTATGAAGGTACAAATGCATACACGTCAACCTCTATGGACTATAT GTTGAAAACAAGAACCGAAGAGAGTTACCTATGGCTACCCTTCATCGAGC AATCTCTACACGATAAGGTGACTTCCTTCTACTTGAGGACTCATGCAATA CTCTTCATGAATTGGCTACGCTTTGAGTGTTGCTTTGCTTTTGTTGTGAG CTTTGTAGGCTTCAAGGAAGGTGAAGGAACATTGAAGTGTTGTCAAGTCA ATCTTCCCGAGGACGACTATATGGTGAACCCCAGGATCAAGAAGGTCTCT CGACCGCTTCTACTTTGTGATGAGCATGTAGAGTCGAGGATGACTCTTTT TGAAGGGGGGAGCTGATGTAGCCCGACCTACGGTCGTTACCACATCTTGG TCTCCAACTTACGCCAAGTCGTCATGGACTCCAAAGGTGAATCCGTTCCT CTATGCGAGCCCCCTTCCTACCCTATTGAATGGTATGCTACTTCATACTC CGTCACATATGCATGATAGGTTCACATTGACAAGTACGGAGGCCAGGGAG GAAGCCCGGAGCATCAAGCCCGACAAGACGGAGGCTTGGAAGAGGAGGCG GAAGAAGACAGATCGCCAAATGCTCTCTGTCTCCAGCGGTACTACCGGAT CTGGCGACCGGTACTACCGGCCAGCGGTATTACCGCCCACTACTACCGCC CCATACAGACGACGCCAACAGAAGTCCCAGGACTGCAAGCGGTACTATCG GATCTGGACCCGGTACTACCGGTCAGCGATACTACCGGACCCAAGTCCGG TACTACCGGTCATGTGTGCCTGCGCGCACCTGTTGGGACTTCGGCCCATG TACCCCTCTAGCTCGTCCAAACCCTAGTTTTATCCCTAAACTACCCCTGT TTATGTGGTTGGCCTATAATTAGAGCCCCCACCCCTCATGTATCCCTTAG GCATAGATGATAGACTAAAGACAACCCCCATTGTGGAATCTCTAGTTTTG CCTCATCCCCTTTACCAAGGGGACCGACTATCGTCACCAACCTCGATTGG ACTTTGCATCACGCATCCATCGTTGAACAAGGCCTTGGAGTTCGATGTCC CGTCTCCAAGTTGTCAAGACCCTCCCCAAGGTGTTCTTCCCTCTCTGATG TGGATTTGAGGGAGCACGTTGACCAATCTTTCCTTGCGAGGATTCTATCG GACCGGTGGCCGCCGTTCGGGAGCAATCGGCCTTGTATCGTGTGAGTTTT GCGTGTGTTCATCGTGTTCTTCGTGAGGTGTGTGTTCGCTTCCGCTACCT TCTCCCTTTCCCCTCGCTTTCCCATCGATTTGACCACGAGATCCGTGAAG ATCGGGCCACCCAAGAGGTTAACCCCTCCATCACTGAAGCTATCTGTTCT TGAAAGACTCGAAAAAGAAATCGTGGTTATCCTTTGCAAGCTTGAAAAGA TCTTTCCTTAGGCCTTCTTCACGGTGATATTTCATTTGACTGTGCATTAA CCCATAGAGGCAATGCTTAGAGGCCCCGTACAATACGGCTGGATGTACCC TGTCGAAAGAAGTATGCTTACATTTAAGCGTTATGTACGAAACACCGCCA GGCCTGAAGGGTCGATTGCCGAGGCATATATTGTTGATGAGTGCCTTACA TTTTGCTCGAGGTACTTCGACGATCTGGAAACAAGATTCAATAGGCCGGG CAGAAATAGAGAGAGGGATGATTCGCACATTGGTGATGTCTCTGTTTTCA ACCATGGTGTAAACCTTCTTGGAGGGTCAGAGTACTCGGAGGCTGGTGAT GAATATGACAAGATGCATTGGTATGTTCTAAGGAGTTTCCCTAAGATTCT ACCGTATATCGAGTATGTCATCTCTTGTGCATGCACCCTTATCTTTTTTA TTGAGTTGGAAGGAACCCATTTGCAAGCCTGATGATTTAATTAACTTTAT GTTTTTGTTGGCATTGCAGGTTGTGCAAAATAGAGCTGAATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.