Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA003250

[Submit comment/correction]

Sequence
AA003250
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003250
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGATGACGGTGGTCGCCGGGCGGCGCCGTATGCGTACGAGAAGCCACGC
GTGGCACCCCACCATCAGCGCCAGCCCCAGCGGCATCAGCACGTAGTCCA
GCGCCTCCTTCCCCATCTCTCTGCATGTCCCCTTCCTGCCCGAGGAAGAA
GAGAAGAGGAACAGAACCTCACACTGAGCTTAATGGGCCTCAGCTCAGAC
CCAGGCCCGTATTGGCTGGACTCTTTGGGCCGTGATGCCGCCCACATCGA
CTTCTTCCTTTTTATCGCCCACGCATGTCTCGACTGTAGCAGTTCTTGGA
GAAGCAGAGCAACGCGGCGTCGCACCAAGCCCTACTCCGCACCACCCCCG
CCGGCGGCGCCGGCGGGACGAGGCGACCAGCCGCAGCAGAGCGATTGCTT
CCCTTAGGACGGCGAGAGAAACCCTAGCTACCTCGCCTGTCCCCCCGACC
CGGAGAGAGCGTCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGGGACCATGA
CGATCGGTGCAAAGTACAAGACCACGGTCAGGGACCCCGGCACCACCGGC
ATCCTACGCATGGTTCGTCCCATCCCCAATCTCCGTCTCCAGCCCCTCAG
CTTTCCTCCCATCTGAAATCCCCTTTCCATCATCTCCGGGGAGCTCGTAT
TGGTTGGGTTGGCTTGTGCAACGGCGCTGCTTTTGCTGCTCGGCCGCTGG
GTTGAGGGTCGTGTGGGGAGGGGATTTAGTCGTGTTCGGTTTCCCAACCG
ATCGATCTCGAGCAGGTCGATACAGTACAAAATTGAAGCTTGGATCGGAG
GAATGCTAGCGTGTGCCTGTGCCTTGAGCATGGACCGAATTATTTTGGGG
TTTGTGCTTTCCACATCGTTTCAGGTCACCTGGCCCCGTGGTTTGGTCGC
AGAACATTGTGTGCCAAACGTGATCCTTCATTTGCTCGTACTGTGTGATT
GTGTCCCGGTTTACCCTCCAAGTTGGATTCCAGTTTTGCTTGACAGGAAT
TGGGCTCGAAGTAGTTGTTTGGTTACTTCATTTATTCCTTTCTTGCCCAC
TGCTACTGATTGCAAATTGATCATTATGAGCTTGCTTGATCTAAATCGAA
TCAATCATTTGTTCTTGTAATTGCAGAGTGAAGATAAGTTAACATTTACT
CCTAATGATCCGCGATCACTAATGAAGCTCAATGTCGATTTCCGAACCAT
CAAAGGTAACTTACCCTTTGTCCATACGTAGTGCTGGTTTCAAAAACATA
CTTTACTGTTTTACAAAAATCAAAGTACTGTCATTGTCACGATGACTGAT
GTGGTTCGAAACTATTAACTTTGTAGATAAATGGGCATTTACTGTATGTG
GTTTGTGATTTCCTGTGGAGTTGCTTGAAATTATTTATCACAATGCAGAG
TAACTGAATAAATACATCCAAGGTTACATATTCAGTTGTGCCAGAGTAGG
CCATGCATCATGGTGGTTGATGAAACACTTTAAATTGATTTCATGTACAT
TACCAATATGCTTGGTGGTAATTTTGTACTTTATTCTTCCATGCGCTTCA
GGTCACAAGTTCAATAAGGTAGATGGTAGCAAACCAACACCACCATTATT
GAATCTTTCAAAAGATTCTGACAAGGTACGATCAATTAACTTGAAGCATT
CTGTTGTGGTCTGCTTTATAGGCATATGCTCTGCATTTGTTTCTTTCACC
GAGGAGATTGTGATATGTATGCTTTCTTTTTCTCAGGGCGGTGGCTACAT
GTTTGAGTTTGATAATGTTGGTAACCGCGATTCATGTCGCGACTTTGTAG
GTAATGCTCATTCAAAGCAATCATCTATTGGTACATCCTTTTCTGTCAGA
CTTGTTTTAGCATGCTGTTATGTAATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATCACATCGTTTGGGAACTG
ATTTTTCTGTTTCAGATAGATGATTATTATTTAGTTTTCTGATGTTACTT
CTGGTCCTTACTTTAATTATTCTGATTTTGAGTTTCACCTCTAGTCTATA
CACTTATTCCAAACATAATGTATATATAACTGATGACATTGTCCTTCCAG
CTAGGGTTTTAGGCAAACATCAAGGTATTGTGCCTCCTAGACCAAATGCA
CCTCCTGAAAAATCAGTTGCGTCAACTGGTCCAGATCAGCTCAGTTCCGC
CGAAATGGAAATACGGATGAAATTGCTGCGAGAAGACAGGTAATTTAATT
ATTTCAAACAACCCAGCATGTTTCTTCTGCTGATAATAACATGAGGTAGT
GATGATAATCTAATGCTAAGCCGCAATGGTCTAAGTTGACTTACTCTCTT
AAATAATTTTCTGGGCTCTTACATGCTTGTGTTTTTCAATCGGTCAACTG
ACTCTGAGGTTTTTTTTCTTGTGAAATACACATTTGGTCTAAAGAGGTTG
TGCTAATATTTAACATTTACATGTTGTATAAAGAGAGAATGGTACAGACA
GATTGGCAAACTATCATGGCCAAAAAATGAGAACATAATTATGTTGTATT
GTTGACTTGTTGAACCCTTTTCTGTTTAGCAGTGAAATGCAGAAGTTACA
TAAGAAGCTTGTTCATAATTATTTTATATTATTGACTCGTTGAATCCTTT
TCTATTTGGCAGTGAATTGCAGAAGTTGCATAAGAAGTTTGTTCTTGGCA
ATATTCTGCAAGAGTCTGAATTTTGGGCTACAAGGAAGGTATTGCACATA
TACAATTTCTACCTTTTTCATGGTATATTTGTGTCTGATTTATTCAGTTG
AAAACAGTACTTATTTTTAAGGCCTTCTGCAGAATTTACTTGACGACGAA
GCAAACGAAGCATCAAAACAAAAGCCAGGTTTCAAAAGTGCCATGCTAGC
TGATGTTAGGCCATCGGCTGATGGACAGGTATGCCATGGGTTGTTTGTTG
TTGCGGGCCCATGATTTCTGGTATATTATGAGGTTTCTGTTATAAATGGA
TAAATGATTGTGTCCTCTCAGATATTGACACTGGTGATTGTTCATGATGT
TAATTTACTCACATCTACTTTATGTGTAACCTTCTACAGACGAATAAGGT
TACTTTCAGTCTGACTACTGAGATTATCCATCAGGTATGTTCTTTCTACT
TTGGTCATGAATCATCATCTAAATGCAGGTCTGGCTGCTAGTATCATTTT
TTGATTTCCTAATTGTCATGAGTGCAGTGCTATGCTTTAGTGAAAAGTTA
TATCTACTTTGCTGGCAACGGGATTTGCAAACAATTGTGTTGTTTAATCG
CTTAAACTTTCATCAACTACTGAGTAGCTCATACCTATTGCTATCCGTGG
AAGAAAGATGTCCGGTTCTGGTGGGCTTTTCATGTTGATTTGTTATTGAC
TTACTGGAGTCGTTTGCTGGTCCACAGGCCACTCCCTTCTCATTCTGTTC
TTAGTTATTTTTTCCGAGAGTACGCCAAGGCACTCCTTTAGTTATTATGT
TCCATTTTCCAAACACAGTTAGATCATATCAATGTGTTATCATCCTTTGT
GAGTCATTTACCCAGATTCATTGGGGCCAAATTCCTAATGAGTGCCCAGA
AGAACATTACCCCTTTTCACGCACATGTGAAACCACCCATGAGGCCACAC
ACATTGTGACCTGATATCTCAATCCGGTCGAGCAGGATTTTTTGCAACTA
TGGTCCTTGCTCCAATCGAGCTTGTTCTGGTCCTTGAGCTGGGCTGCATC
AGCTCAATAATAGTAGTATACCTGGCATACATTATTAACCTTGTAAATGC
TAAACGACAAGATTATTTATTTGGATGTTGGAAACTTGCAGTACTTAAAA
GTCCATCAAATTACTTGATGTGAACATTTTTTTTTATGTTTTGCAGATTT
TTGCAGAAAAGCCAGCCGTGCATCGGGCGTTTTTGGATTATGTTCCGAAG
AAGGTAGATACTGAATATTTGTATTATACTGTTATCATGCGTGTGTCATT
AGCTTTAGGAAATCTGGGTTTAAGTTGGAGTTAGTTTTACAATATATCTG
TATCGTTGTAAAGTGGATTTGAATTCTCATTTAGGTTTGTTTTCCTTCAT
CTCTCATGAACTATGTCCAAAAAGTTGTCCGAAAAAGATTTTTGGACAAA
ATACTGTAGAGCTGAGTATCTACTTAGGACAAAGAATACTTTAGCTGCAA
AAGCTGAGGCTGCTGAAGACGAGGAATTAGCTATGTTCTTAAAAAATGAT
GATATACTTGCCAAAGAGGCAAAAGTCAAGGTATGATTCTGGCTGTATAT
TGTTGTAATTCTACCTATTTTGTAATGCCTTGTGCCATTCCTTGTGATTC
TTCTTTTGTTTTAGTGACTCAATTCTTGTTTACAGATAAAACAAGTAGAT
CCAACATTAGACATGGAGGCAGATGCAGGGGATGACTACATCCATCTTCC
GGTGCGTTTTTATTCTAGCTACTGCTTTGCTAAATCTACAATTTCGCAAA
GCCAAGCGGTTTATCGTGATTCATTATCTCTTGAAGTGCTTATCCTATCT
TGAAAGTGGTCATATCATTGTTCTTTTTGGCACATAGGATCATGGAATTC
TCCGTGATGGCAGCAGAGAGACAGTTGATGCTGATAGTGAATTAGCTAGG
AGAACACTTTCTCAGGATCTAAATCGGCATGCTGCTGTTGTTCTTGAAGG
GAGATCAACAGGTAGAAGTTTTGTACTCAGCTAAAAAGTTTTTATGTTGT
ATATTACTATTATGTCATGATAATGACCCCAGATATTTGGGTATGCAAAC
AGTTCTTCTGCAATTACACTTGTTTATTCTGGCTTCCTATCCATCTAAAT
GATGTACTCTGGTACTAATTCTTGATCAACTATGTCCTGAAAGATAATGC
ATTGAAAATTGTACAAATCGATGGTCCTAAACTGCTGGTTGAAAAGCTAT
AGTGTTGTAGTAATTATTGTATGTTTGTGTGCTGTCCCCTTCGTGTTAGA
GGAATTCTAACTTTAGGTTACATTTTTTAGCTCTGCATTTACTTATTGAC
TGTTAATTTCAAAGCATTGGAGATGTTTTTCAGTGCGTGAGGTAATTATA
TTGTTTTATGGGTGCTTTTGCAGATGTCGAATCAACTGATACAAAGACTG
TGGCTGAAGCACTTGCAAGGTCCAAGAAGGGTTAGAAATCATATCTCAGT
TTGTGTTTTATTTTTCACCTTGAATAGTTTCTTATTGTGCTGATGAGTTA
TATACTGCAGAACCACCTTCAAGTTCTGTTTCTGATGATGCTAGTCATGA
GAGATTGGTAAAGGTGGCCCGCATGACTGAGATAGAGGATCTGCAAGCTC
CACGAAGTCTCCCATACGCACCACTTTGTATAAAGGTAAGGTTGGTTCAT
ATGGCTTAAGAACAGATATATCAACCACCATAATATATTGCAAGGTTATG
GATTCTTATGCCTTTCTTATCTTAATAGGATCCTCGAGAGTATTTTGATT
CCCAACAAGCAAATGCTCTGAGACCTTTAGGTGGCAGCAATGATGGAAGA
AAGGCCCGCAGCTGCAGCCTGAGTACAGATGACGCATTCCGTCATTTGAT
GGATCAGATATCTTCCGTCAAAGATAATAAATTGAACATTCCGGTTCTTC
AGTCAGATGTGGCTCTTAAGGTAAACAGTTCAATTTGAGACCTGATCCCA
ATCTTCTTTATGAACTTTATTATGGGTATTAGGACATGTAAGATCCAGCT
CCGCAAATAGAGCAGATTAAGTATTAGTTAATATTTTTTCTGTTGAAATA
CTTATTCATATCAAGGGGAATGTACAAAAATTAGTTTAGATAACTGGTAT
CCCAATCTTCTTTATGAACTTTATTATGGGTATTAGGACATGTCTCCTCG
AAAGATCCAGCTCCGTAAATAGAGCAGATTAAGTATTAGTTAATATTTTT
TCTGTTGAAATACTTATTCATATCAAGGGGAATGTGCAAAAAATAGTTTA
GATAACTGGTATGGATAGTGGATACCACAAGGTTATTATTAGTTCCCGGT
CGGCTGTGAGTGTTAGATTTTGTTGTTCCTTTGCTAGTCAGGTCGCTTGC
AATGATGGTGGTCAACTAGCATGTGACAGGTTATGTTTGATGTTCAACTC
TGATAAAAATAAGAGATGGTCATTTTCTCCTTTTCTTGTTTGATTTATGG
GGGTACATCATCACAACGCCCTCTCTTTGCTCATGGGTGTGACTGTTTCA
TCTCCCTTTTGTCCCGGGGTCAGCGTAGGTCAGTGTTGTCTGTTCTGTCC
ATAGCTGGGTTGTGGTAGTGTTTCTCTGTGCCAGTAGATATTTTACTGAA
ACGAATACGCCCTTCCTAAACTTTTGAAGAATAATTGCATTGAAATTTGA
ACCAACCAATCAGCTCCCAACCATTTCTTTAATGCAATTATAAGCCCAAC
ATTTCTGTGAGTGCAGTGATAGTTACAAACACTTCTACTGAAATGTGTAA
TGTGTTTGGTATGACCCTGAGAAAACTTCTATTGACTGTTCGTGTAAATT
TCTATGTATTACTAACACCTCATCTTGCCCACAACTTGCATTGCCAAGAA
AACAGCATCTATACAGGAGTGGTTTTTCATATAGCTCTTGTACATTCCCT
CTGCTTCACACCCTCTTCGTTTGTACATTATTTTTCCTTCTTAACAAAAT
TTCACTGTCGGGGCCTCCCTACAGTTTTCTGGTAAAAAAAACTAGTTTGT
CTTGTTCCTGTCCAATTCTTATTGCATGAGATCCATCCCGTCTTCTACAA
CTATGTTCGACTTATCATGTCATCCATATTCCAATACTTTTTCCTGTACA
AACACATATTATGCATGATGTTGTATTGCTGCTACCGTGGCTTCTCTACT
CTTAAGCTACTAAATTGCATGAGCAGGCAAACCTAACTACCTACATGGTA
TGGGCCTAGGTTCTTAATGAATTGAATGAAGGAATTTCACGCTCGCGAAG
GCTTAATCTTAAGAATCCCCAAGACAGCCTCCTTGGTCATCTTCCTCACC
GTACTCGAGATGAACTTATGGATGTGAGTTGCTCTACCTTTTATGCAGAA
GATGTAACTATAGTTTTAGTGTGTTCTAGAATATTTATTTTTCCAGACTT
GATCTGAATGTACCTTTTTTGTTATGTATATTTTGTTCAACCATTTTAAA
ATCATATCACTATACTAGAAATGTTTTGTATGTACATATTGTTCTTGTAT
TGATTGAGTTTCTTGTGAACTATCTATTTTCTTAGCATTGGACAGCTATC
GAGGAGTTGCTACGCCATTTTTGGTCATCATATCCTATAACGACCACAGT
CCTGTATAATAAGGTGCATTGTCCCTCCTATCTTATTTGCACTATTTTGT
AACCAATGGGTGGTATTTGGGTGGAGGTTCGTAAAAGTACCATAGTGGCT
AGCTATATTTTGGTTCATAGAATGGTTACGGGAATTTAGTCTTTCTGTTT
CTCAAGAATGAGAAGAATATCATTGCATATTAAAAGCGCCGTGTTAACTA
ATGTGCATGCAAGTATAAATGAGCAGCTTTGCTGGTAGAGTTTGATGCAT
TGCCAATACGGGTGTCTGTTTTCTCACTATTATAATTATGGAGTTAAATG
CAGTGTCTTACTGTCATGAACTTATGATCAGAAATTGACTACCACCAGGT
TTGCTTTTGGTTTTCTCATACTGCATTGATTCTAATAAAAAACAATTGTT
AGAAAATAGCAGATGTTTAATTGTGTATTATATAGTCCAGTATTGGTATA
CATAGCGTGCCTGCAAATCAAGTATGTCTGGATTGACATTCTTGTTCCAC
TATAGTCTGCTCTTCTGTCACTAATTCTAGGCAGTCCAGCTGCCTGGTAG
AACTGCTAGATATAGTAAACTGTCTTTAGTTAAAACGTCCAGACCCTTTC
TTTTTAGTATCTATTGCTTCAATGTTTATGTACTCGTAGTTGTTCCACAG
ATTCAAAGGCTTAAGGATGCAATGACACAGATATATCAGAAGTTACAGGT
AAATCTCCCCCCAGCACAGTTGATACATGGATTTCAATATTCCCTATTCT
GATGCCCCTAAAACGTGAATTACAACTGAGTTTACTGATGCTGCCTTTGA
CTTTTATTATTTAAATGCAATTGTTATGGAATTGTTTATGTTGTTGCTAA
AAGATTGGTGATGAGATTCCATGTGCAACTTTGTACGTGCAGGAAATAAA
GGAATCAGCACAGCCTGATGTAAGACATGAAATATCTCAGCTTGTAAAGC
CCATGACACAGGTTCCTATCATCGTTCCTTACTGTATTTCATTACTATCC
GCTAAAGAGCTTTATCTGAACTTCGTTGTGATGATGTAGAGCAAACTATG
CTCTTTCCCTTTCTCATAAATTAACTGGGTGCATCCATATTTGTATTTTC
TTGAAACCAAGGGAAAGCTTGCCTTTTCATCATCAATAATAAAGCAGATG
CCCACACACATCATAGCAAATGTTTATTTTAGTGCTTTATTTTTATTTTT
ATTTCTGTTCTTCATCCTCATTTCCATCACATAATAAACCACCTGACACA
TGCATCGCCATGGATTTAGTTTCCTTTGATATTTTTCAGCAATGTGATTT
ACTTGTATATTTTTCCCAGGCACTGGATGCTGCCTTCAACCATGATATTG
ACCAGCAGCAGAAATCTTCTAAGGCTGGGAACAAGCCCAACGGGTTTTGA
GCAGAGAAGGCTTGAAATATATGGATTCAACTTGGTTACTACAGTACTAG
AGAGCGAAGGCCTCCATGAGCTCTAGCTGCATTGCTGCCCTGTTTATGGG
CTTGCATTTCATTCAAGAGCTGGCTCCTGGAGGCTCGAATTTTTGCCCTG
TTGTTTTTATTTACACGCGTGGAGCATTAACATTCTATACATGCCAATTT
TGCAATTGCTCCGAGGCACGTTTGCATTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.