Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039252

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039252
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039252
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGCAGTGTGGAAGAAGCGCTGCTGCTTAAGCCGCCACCGTCGGCGGT GGTGTGCCTCCGTGCTGCAGCGGCGGAGGCGGCGGAGGCATGCCACCACG ACGGTTGCCCCGGTTGTGCGATGGACCGGAGGAAGGCGAGCCTCTCCGGG AGGATCCCTTCCAAGGAGCTTTTCTTCGTCGGTGCCACCTCTCTCGCAGC TGGTAAGACTATTTATTATGTCCGTCTGAACGAGCACCTTCAATATTAGC ATGGTAGTATAAGACAAAATATGCTCGTGCTTTGTCCTTTTCAGCTCTAC CAATCACGTGCCTCTTCCCCTTCATGTATTTCATGGTATGTATCTCATCG CAAAATATACTTGATTAGTGTACATAAGCTTTATGAGTCTTACGAACCTT GTCTCCGTAATAAAAAAATTAATTGCCCCTACCAAATATAAAATGCTCTG AATTTAAGTTCATAATAAAATCCATAAACCAGTAATCTCCATGAGATAAT ATAGGAGATAAAGGTTGCATCAGAGGGTTTATGGCTTATACGATCCCCGT TACTTATTACATCCCTTTTTACAGGTTAGAGACTTCAACATTGCTAAATC GGAGGAAGATATTGGAGCCTATGCTGGTTTTCTTGGTATGGTTCATGCTT CCTCTGTTAAAATGTAGTTTCATCACAATTGAGTTATTGATTTGCATAGA TTGTACTTTTGATGTCACATTGTCACACACATATATAGACTAATGTATGC GTATTTTTCCCAATGTAGCTGCTTCATACATGATTGGTAGAGCCATTTCC TCGATTTTCTGGGGTATCGCCTCAGATCGCCTTGGACGAAAGCCTATAAT TGTGTTTGCAATGTTATCCGTGTAAGTATGATATGAAGTCAAAGTGCATT CAACACCATTCCTGTGTGTAAGTACATATATAGTCACTTAGCCATACGTG TGACTTGTATATATTGCAGGGTCATACTTCAGACATTCTTCGGACTAAGT ACAAAGTATTGGATGGCCGTTGCTTCTAGACTTCTTCTAGGTTCTCTAAA TGGTTTACTTGGACCAATTAAGGTACTTAATATGTAGTGTTTCATTCAGC ATGTTGATGTACGTAGGCATCTCAGTTATGATTTATATGTCTCCTAAGAG TCTGTGACAACATAATTTGAGACCATTGCAGGCTTATGCTATTGAAGTTT GTCCAACTGAACACCAAGCTCTTGGGATCTCAATTGTAATCTCTTGAGCA ACTCTACGTACTTTCTATCCAAAAGTAACATTACTATTCGTATATATAAT ACGCTTAACATAACGATTGGAAGAATCTAATTTCCATATATGAAAGGGAG AATTTATTTTTATTTAATTATTCTTCTGGAAAAAATATAATTACAGGTGA GCACCATGTGGGGCTTTGGTCTAGTCATTGGTCCAGGTCTTGGAGGCTAC CTTTCCCAGGTACGACTAACTAGCAGAGTGGCTTGTGCAATTGCACGGAC AATATCAATAAATGTTCTCATTCTTGTAAATTAAAAAAAATGAATGTAAC TGACAATGTACGAATCACAGTCAATGCATGTATGGTTTTTCTGTTTTCAA CACACATGTATGTAGTCAATGTTGACAATATTAAAAATATATTATGTCGC TGTAATAAATGAAAGAAATAGAAGTGTCATCCCTAAAGTGGGAAATATTA TATAGAAAACATAAAACAATGCTTACATAATTTTGTTCATTTGCACATAT AGTTCTTTGCTAACTAGCTAGCTTGAAATGTGTCCTCCACTCTCTTTGTC TCTAGCCACTGAAATAATTTTTGCAAATCCTTCTCAGTATAGATTGGGTT GATTGTCTAGCCTTGGATTACTGCAAATGACTTTTGGATTGGCTAATAAG ACATCCATTAATTCCACCTCATCTTTGTTGCATTTTTTTATAAAAGGAAT ATATTAATATCAAGACGATACCAAATACACCTAGCCTCTGCAACAACATA ATGTCTGGAGAAACTATAGACATCACATATGCACACAACCAAAAAGAAAA AACAAAGAAACGAAAAAAAACTGTCGAGACAAACAGAGACTCATAGTAGT ACAAGCACCACCGACGGTGACACCACCTAGACTCCGAAAAAGATTCTCCA AAACGACGCCTCCAGGAAGAAAACAATGTACAAACACAATTGTTGTCCGA TCCAACCAATTAGTAAGATGCAGAGTTTTCACCCAAGAGAAGGTCCCTTC TCCAAACAATGCCTTTAAAAAGAGAACGACTATAAAGCCGCCATTGCTAG TACAACCACGAAGGTGAGGCCAAGGGTTTTCACCCTGGAAGATAGAGACC ACCAAGAACGAAATCTGCCAGTGTGAGCGTCCCCACTCGTCATGAACATT GTTGTAGAGCTCCGATCATATGACACCCATCCTTCTTCCAAACCGCTACG AGTAAACTCATGGCCCATGTGCAACAAAGACATATGAAAAAGGTTGGGTT AATTCAGTGAGGCCTCGTGATATGAAGATTTTTGTTAGTTCCCGCATAGT TAAGGGGCAATGAAATAATTAAAACGGTTATGTTTAAATGCAATCCATTT AAAAGCAGCTTTCAAATTATTTATGTGTGGGTTGTTAATTTCGGGATGAT CAAAATGCAGGTAAATTTCAAGTATTAGAGTAAATATTCACGGGATGGTC AAATATTAGCTACTTCATTTTATTGGAATTATGTAGGTTTGCATTAATGA AGATATCATTAATATAAGTTTCATAAAATAAAGTTGTAATTCTGATTATA AGGTGCTTGCGTTGTTGTAATCTACTGGGTTATACTATGAAAAATACTAA GAAGGCACACACAAAAAGTTAAACCACACATGTAGTTATACGGACTTGCA ACTTAATTGTTAAAGGATACAAACATTTATGGTCACCATGTTGCCTCTAG AACTTCGTGATTGGCACATGTAGACACTTGGACATATTATATTAAAGATC ATTTGGTGCTCTCATAAGCAATGACGTGCTAAAACTATGTGTGGACTTTA ATTGCTTTGTCTCAATATTGAGTTAGTAAACAAATTATAAAATGATCTAG TCCCTCCGTCCCGGTTTAAAGGACACAATTTGCAAACCATGCAATCCCAA AATATTTAGACACAAAATCATTTAATCTCTATAATTACTCCTATGTGAAA ACAATAAAATGCTTGCATGCACATGTGTAAACAAATGTGAATGCTTTGCT GGCTCTTTTTCTTCTCATGCATGTTCTTCTTCACACTATTAAATGGACGA ATTAGAGGACTCCTAGGGCCTAGAGAATTGTAAATTGTGTCCTTTAAACC GGGACAGAGGAAGTATATATATATAGTTCACCTTTATATACCCATGAACT CGACAAAATAAATAAATGGAAAATTAATAATATCAAACGGAAATATTATC CAAAGATGTGCTTATTTGACCCGCTTTCTTCTTATTAACTATGTTGCTTC TTGGCGTTGTTGTGGCTTCACAATAAGCTAGACGGCAAACACGGGGCCAT AGAATCCCTGCTAGCAACATCAAACCACTTGCACCAAAGGAAATAAATAT CAACTTGCACAACCTTTAGCGTCAACCCATCATTTAAGGGTAACATTAAC CTCACAATGAGGAGACTAATGGCTAGGAACCTAATCCATACCAATATCAT CCTGACTAATGTGTAGAACCAATATGAGCTGAATATACATGATATCGACA CATTCTTTGCATAATGAATATCGACAAATTGAACACCATGCTACATATCA GTAGAGGCCTAAGGTTGCCGTGAGATGGACGAGGTGAGCAACATCAAACA ACTTGCACCAACGATGTGATGCTCACCTCTACATTCTCCATTGCCACCGT CACCAGACCTGTCGCTTCGGCTATCATCCTATTTACTCCATACCTGGTCA ATATATCAAGCCATATGTCTCCATATACAGTTGGGCACCATAGCCAAATT TAAAAGCTTTAGGCAATACATAATTTGTTAGATTTTCTTGGAGTGTACAT AATTGATATAATTTCAAATTTATGACTTGATACATACAAAAAAATCTACT GGGTGTGGATTCGCGTGTATGATTTATATTTCAACAAAAAATAAGAGATG AGCTACTTTAATTTCCTAATCACTTCATTCTCTTTTTGTCAGCCTGCTGA AAAATATCCACAAATATTCTCCAAAGGCTCAGTTTTTGGGAGGTAGATCC TGCATCCTTCAAGCACATGATATATTTAGTTATCAAATTGCTTGCAACTT ACAACATTACTTATATATAATTAACTGGATTGTACAGATTCCCCTATCTC TTACCTTGTCTGGCTGTGTCATTCTTTGCGGCTATTGTTTTGATAAGTTG TATATGGCTTCTGGTATGTATAGTTCCGCACTATGTAATCCATGTTATTG TGAATTTTTTGTGATACGAATTGTGGTTTCCTAAAAGTGCAGGTGTATAC TCTTTCGAGGAAAAAGTATTTGCAGTTCAATATTTAAAAATCTAGGCACA TGTGTGTTTTGGAATTATGTGAGAATTTCTTTCCATATATTAATGTCAAG GAAAAAAACGCGCTAAAAGAAATGGCGCCGGCCTCCTCCAAATGCTATGC ACGCTATAACGTTCTAATAGCGTGCTATATTTCAAAATAGCGTTTTGAAA ATAATACAAAATATAGCCAAAAAGTAAAAGATTTAAGTAAGAATAAAAGA TATATTCCAAAAGTTGTTATAACAATACATACATAACCATATAAAAAATA CTTTTCCAATCTAACATAAATATCCCACGAGGTAACGACATATCATTGAC TTCTAGAAGCATAACATCAACATTTCAACAGGCTAAAAAATAGAGCGCTA TTTTTCCCTAACGCTATGACGTTTTAGCGCGATATAGCATGCTATTTCGC AAATAGAACCACAGCGATCAAATTTGATAAAATTTAGTGTGACCTCTCCA TATATGCTATAGCGCGCTATTTTTTCCATGATTAGTGTGCAAATGCTAAA ATTGCCATTTATAGGCTTTTAGTAACTTCATCATATGCTGATAGGCATGT GTACGTAAGTTTTTACAATGAATATGCCCCAGAGTTACTATTAATATAGT TATATTTCAAATGAAACTGACAGGAGACTATACATAGACATAAAGTTACT GAAAATCATAGCAGAATAGTCAAAGCCTTGCCATCACAGAAGTCTCATTG GGATATGCCTCGTAAGAAGAGTTTACTCCAGAATTTGCCATGGATATCAA CTATGGCATCATCTTGTTTGTTTGGTCTTCATGAAACAGCATATAGTGAG GTAACTATCAGGTTGTTTTAGAATTCCCGTGCTTCATATTTTGCATGTTA CCTTGTAAGTCTATTTAAATAATTTTCTGGGTAAATCCACTCACTGTTAC TCAATTAATTTCTCTTAAAAATCAACTGTTTTTATTAATGTTTAATACTT AATACCTGCTAATTCTGCAAATTTGAATTATCTTGCAACACTAGATACTT TCCATATGGGCCGTGAGTGACAGAAAGTACGGTGGTCTTAGCTTCTCATC CGGTGATATTGGTCAGGTTCTTTCTATGGCAGGTACATAACCTTGACATT TTCTTCCTAACATTTTGATTTCTTCTTTACACATGAACTTTCAGTGCATG TACAGAGAAATAATATGGCTTTCTCCTTTGGCTGCAGGTGCCAGTCTTCT TGTATATCAGCTTTTCCTTTATAATCGGGTTAATAAAGCTCTCGGGCCAC TGATTACATCACGTATTGCTTCGGTGAGTTGTCTCTCATTGTGCCTTAAT TCCAGATAAACATATAGGAAGGTTTGTCTTATGGTGATCACTCATATGTT GTTAATGATATTGCAGTCCCTGTCTATTATTGTCCTCGCTACATTCCCCT TTATGACATACTTGTCTGGAGCAAAACTTTCTTTCGTTCTTTACTCTGCA GCTATGATGAAGAGTGTTCTTGGAGTAAGCATTCATGTTCCTTTATTTGA AACCTTGAAGTGCAGAGTCTAAAGTGCTGGAGCCTCCAGGCTTGTAGCAG AAAATATGGCTCAATTTACTTCATTCATGTTTATCTAATATTTGCCCCTT GTAAATTCGTGTAGATTACTATTAGCACAGGAACGTGCCTTCTTCAGAAT AATGCCGTGGTATGCATATATAACTCAATTAAGTAGAGTTTCTACCATAA TGTATTTAGGCAAACAAAAGATTCATGCAATGTTTCTAAATTCATACATA ACAGCGTCAAGACCAAAGAGGCACCGCAAATGGTATATCAACAAGCGTCA TGTCCTTTTTCAAGGCAATTTCTCCAATAGGGGCAGGTCTTGTGTGAGTA TGCCCTATTTTATCAAAAAGTTTCATTAACAAGAGAAATATCTTATATGA TTCACATTTCTTTGTCCACTTATCAATGTTTTCCTGATAGTGGAAGAGTT TCATGAACCTCTAGCTAATGTTACTACTGATCAATGCAGATTCTCATGGG CCCAAAAACGTCAAGACGTCACCTTCTTCCCAGGTGAATATTTAAGCTAT CAGTTTACACAATACAATGTATCATAATTACCTCTTAAATCTAGCCACTT CAGTAAATTTGTCTGATTAATTAGAGATTGCCATGGAGGGAAAATTTAGA AAATGAATTTGTGGTTATCAAGTTGATCAAACTCGGCTTTCATTCAAAAT CTGCAGGTGACCAAGTGGTGTTCTTGATGCTAATTTTGGTGCAGATTTGT GGACTCATATCAACCTTTGAGCCATTTCTGGTGTTGCCTCCAGTTGACGA A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.