Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA045515

[Submit comment/correction]

Sequence
AA045515
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045515
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTAAAATCTGATTAAGCCAACTCCACTTTGAGCCGTTTTAAGCCATCTGA
TTACATGTCAGACAATCAACGGCGTCCCATTTCTTTGGTTCTTCCCCCAT
CGATCCTTTAGCTCGCGGCGGCGATGTCCGAGGAGGCAACCAGGAGCAGG
GTCCTGGTTGTCGGCGCCACCGGCCGCCTCGGTGGCAGCCTCGTGCGCGC
GAGCCTCGCCGCCGGCCATCCCACCTTCGCGCTTGTCCGCCCCCACCACT
TCGCCCTCCCCGACAACATCCCCTTCAAGTCGCTCGCCGCCGCCGGCGCG
ACGCTCCTCAAGGTAAATACCCCCTTGATCTCATGGTCCGGCTGTGCCAG
ACCTCCGTTCTTCATGGTCGACTCGAAAGTGTCTGACCGTCTGATTCAGG
GGTCGCTGGAAGATTACCCGAGCTTGCTACAAGCTGTGCGGCAGGTGGAT
GTGGTCATCTGCGCGGTGCCCACGAAGCATGCGCTCGAGCAGAAGCCTCT
GGTTCGGGCTATAAAAGAAGCTGCGTGCGTGAAGGTGAGGTCGCAAGTCC
AACTGTATTATGCATATCCCTTTTGTGTTTTCATTTTCCAAAAAAAATTA
TGCATATGTAATTAGTTGGGAAAATCCTCAAAAGGAAAGTCCCCACCACA
CGTACAGATACAATCAAAACAGGACAGAATGGTTGCACTGAAGTGAACAG
TCAAAAAATGTATCCTAAACAGACATAATATAAAATAATGTCCGTCCTTT
AGCCGTCTGAGTTTTTCCTTCACAATCTAATGACGATCGCTTTGTAATAT
AGTCCCCCACCCACCCAAAAAAAAGTTTGGAATATAGTAGTGGTGACTCG
TCGCATTACGAAACAAAATGTGAAGCATTGTTTCTGACCTTGCGGGAAAT
TCATGCAGAGATTTATCCCGGCGGAATTTGGAGTTGATCACACAAAGATA
AAGATTTCTGACATGGACCATGGTTTCTATGAGAAGAAAGCTGAAATCCG
TCGTTTAATTGAGAGTGAAGATATTCCTCACACATACGTCTACTGCAACT
TCCTCATGCGCTATTTGCTTCCTTCACTGGTGCAGCCAGGTCTAGATGCT
CCTCCAAGAGATGAATTTATGATATTTGGAGGAGGAAATACTAAAGGTCT
GGTGATATTACATCTCTCTATTCCTGAAAAGTGAAAATTCTCCCATTTTC
TTGTTTTTTTTCCCTCAAAGAAGAATCTGTTTCTTCAGGTATCTTTGTCG
AAGAGAGTGATGTGGCTAAATTTACGGTGTGCACCATAGAGGACCCAAGA
ACAATAAACAAGTCACTGTATCTGAGACCTCCAGGAAATGTCTACTCGCT
GAATGAATTAGCTGGCCTCTGGGAGACAAAAATCAAGAAACGCCTAAAAA
AGATACATATAACAGAAGAGCAACTGCTTAAAAACATCCATGGTAAGGAT
TAAAGGTTTCGGTGATGTATTAGTACGATTTTTGCTGTTGCTTCTGTATG
TGTCCTGCTGCCAGGGTTGTTTGTTCCATATTAAGTTGTCATTTCCTGTT
TTAGCAACCAGTACCAGCCTACTACCAGGTGTAATCAAATCCAACTTTGA
GGAAGGTTCTGATGAACTTTCCTGATATCATGGGCTGTAAATGGAAGGAC
ACAGCTTCATTCTTTTAGTTAGAAAACAGAACCATGGTTACGACTTTTGA
TCTAATCGATTTTTTCCGATACGAGATTTGTATAATAGTTTTATCTTTCA
TATTCTTACAAGTTCCAGCCCCGACCTTTTGTTTTTCCAAGCCTTCACAT
AAAGTTGCAACAACATATGCTTCATGAAACGGAACTATGCTTCTATGTTA
GAAGTATTTCGTGAATACAATGGAGTTGATGAAATAGGAACACAATCTCA
AACCTTCCCTGTTTCTATAATTATATTTTTCATGTATCTCATTCTCTTTT
TTTCATCTGCAGATGCACCGTTTCCCTTGGAAATGGATTTGATATTTATC
TATTCAGCTTTTGTTAAGGGAGACCACACATATTTTGAAATTGACTCGAG
AACTGAAGGAACTCAATTATATCCTCGTGTAAAGTATACCACAGTGAGTG
AGTATTTGGATACACTAGTTTAGAATGTCGGTTTGATCTGTATCTTGCTC
ATAAATAACATCCTTTGTTTCAGATGGCATTTTGATGAATATGTTTGAGT
TACTTGTGCTCAGTTAATTCAGTAATTTAATAAAATGGTCTCATTCTTTT
CTGTTTTCAGAAAGAAGTGGGTACTGAGTAGTGATGTATATTTGTCGAGT
TTTGTGTGCTCGGTAAATTTATGATGTTTGTCACATGTTTCTTTTTTTTC
CTGTTCTGCCTGTTAATTAACTGGCTCTTAGCCCATTCTTTCAGATCCTT
TTAGCTAAGCTTGCAAAGCGCCAGCTTTTGTCCTGTGGTCATGTTCCTTG
AATCCGATGTACTCTCTCCGTCACAAATTAGTTGTCCCAACTTTGCCTAG
ATTCGCATGTATCTATACACTAAAACACGTCTAGATACATGCGTATCTAA
ACAAAGTTGGGACAACTAATTTGGGACGGTGGGAATATTATTTTGTTGTG
CTGTATTGTGTATCCAGTAATATAGTTATTTCAGTAGCCAGTAGGGATTG
TCATCAGGATTATCTGAGTCATAATACAATATTCATTAGCTGTTAGGTCC
TACATATATTTGCTCCCTTTAGGTATATGTTTAGTGTTCCTAGGAATAGA
TGACTGTTCTTAGAATGAGCAGCCTCGGAAATGGAGAAGTGTGTCTGCTT
TCTCTCTTCTTTGGTTTCTTCTCTCCTTGTTGGAGTGGAAGAAGAGGACA
AGAATGATAAGACAGCTGAGCAAAATATGCATTTCTTGCCCTTTCTACTT
ATTTGTCTCCTTATAACTCTTACTCTTGTCCTCCCTTTGGGCCTCTACCT
GTGGATGTTGGAAGAAAACCATACTGCTCTAGGCCCTTCAGGTAACATTT
TTTCTGAATCATCTTTGATCCGTTTATTACGTGATTCATAATTTGCATTA
CACATTTAATTTTTTTGGAAACTGCAACTGGTGTGATTTTCTCTGACCAC
ATACAGGTTCTTTGATTTGTCCTATAAACAAAGTCAATTATTGCAATTTA
GTAGTACAATATTTCATGGATGACATGAAAAAGCAAATGGGAGAATAAAC
AAGTGGACATTTTTTTATTAAAGAGGCCATACGGCTCCCAGTTTCATTAT
GAAATCGGATTCTGTAAAACAAGGTAGCAAACAACCAACAACCAAAAAGA
AACTACAGACATTGCATCAGTGAAGCTACAACCAACAACCTTTGGAGTCC
ATAATCATACTAATGAACTGGCTGTGGTCTGTTGAGTCTGAATGGAATGA
ACAGTAGAGATTTTGCATTTTGCACCTGCAATTTTTTTACTTATTATTCT
AGCGTTCTCGTCTCGTACAAGTCATCCAAGATTGCTGCCAAGCAAAATTG
TTTAGCAGAATGACTAATCATTGTTTTCGTTGCATAATTGCTATATTCTC
ATGGAATAGGATGAGCAAGAAATTACTTTGGATTTGTTTGAATTTCAGGC
TAGCCCATAATTGATCTTGGTCCTTCTCAGTAATTCCACAAATGTTCTAG
TGATTTATTTTGTTTATCATAATAATGCTATTTTTTCTAACCACAGAAGC
TTAAATTTGATTGATCAAGCATGCTAGCAGCAGAGAGCAACTCAGCGAAC
AATAGGCAGTCCCGCCATGATGCTTCCACAAGGCACAGAAGTGGCTATGA
ACCTTCAGACACGGAAACTGAGTGGCATGAAAGCCCTTGGAATGATGCGA
TACTGAAATCACAGAGGACTCGGTTGCCTAAAGATCCTGGTAGGAGTCCC
CAAGTTGGTGCTAGAAGGCAAAACACATCCCCGAACCGTGGAAGAGAGCA
TTCTGATGAGAAAACTTCAAATATGAGAAACAATCGTACTCCTCCCAGGC
TCACAGAACAAAGGCACCAAACTTCCCCGTACGCTGGTGGAAAAAGTGAG
TCACGCAAGAAGAGCAACAGAACACCCCCCAAATCTCGATCTTCTATGGA
TAAATTTAGCCGTTCATCAATCAAGGAGAAGATTTCTCATCGGTCAATTT
CTACTCCGAAACTACGACCACAAGAGAAGGGACATCCTTCTAGAGTTCCT
GCTTTCCATGGCACTCCTGTCTCAAAACAGGCAGAAAGAGACTCAACTGA
TTTTATGAAAGCAGATTCACATGCAGAAAACTATTCGCAAGAGATCAATG
AGTTGATTGCAAATGGCAAGTCGCCCAATTCCAGGAAAAATGAGTATATA
TGTACAAGCACAGAGTCTACAAGTGACATCTTCTTTTCCCGTGATTGTAG
GGCTCCGCTTGAGAAAACATCAGTAAAGCATAATAATATCGACAAATCCT
TCACCTCTGATTCACATGTCGATGCTGATAATGATGGTCCTGTTACTCAG
TCAAATAGCAGTAATTTGGTCAGGACGTCACAGTTTGTTTCAGTCCGGAC
TGGTCTGTCACGAACAACTACAACCACCAGCTATGCTACTGGTCGCCATT
CCCAAATTAAACGCACCACCACTTTGAGTAGCCAGTTTAATGGTGACAGA
TTTAGTGGGGACAGTGGAAAGTTCAGTGATTTCACTGGGAAACTAGTTGG
AGGCGTCATGAAACTCACATCCAACATGCAGAAGTCGCAAAATGATGCTT
GGCTTCCATGCATGACTGGAAAGTTATGCCGTAAACCAAGATCACCGAAC
AGCAAAGCTGTTGATGAATCCGAATCAACTTTCATTCAGAAGGCAATCGT
CATAGAGAAGATTAGACTTTTCTGGGCGGATAAATATCGTCCACGAACTT
TGAGTGGATTTACTTGCCACAGGGAGCAAATTCAACAGCTTAAACAATTG
GTAACACCTTCTACCTCTTTCCTGATTACATGAGTTTTTTCGATCTTAGA
TTTCTGATTCTTGCTGTTAGTCCATTCTACCTCGCAGTTAAATAAAATCC
AAACTGCTAACTTGTATGGATTTTCTTGGCAATTGCATGGCTATGTTGTT
CTATAGATGATTGCTCTAGTAGCTCAAAATTAGTTCTCTAGTCTTCTGAA
TGCTAGTTTCCTGTTGTGGCAGGTTTCCCCTGACTTTTGCCCTCATATTA
TTCTCAAAGGGCCTCCGGGATCAGGAAAGAGGTCATTGTGCAGAGCCATA
CTCACAGAGATCTTTGGCGATTCGTCCCTAAATGTACAAACTTTTGCAGT
GAAAATTGAAAGCCATGTTACTACCCATTACATACCACATTAAGTATTTC
TTGTTGCTTTTCCAGGTATCTCACTATTTGAAGAGTTGCACTGGCCAAGT
AAGTTATATTGATAGAGTACTTCCCATTTGTGATTGCCTTCATATCGAAC
AACTTGAATCCATTTTAATGAAGCATTCATATGCAACCTGTAGTTTGCAT
AAAGTAATCATACTTCTGGTTGAAAGGCGACGTAAACAGTTTCTGGTTTT
GTTGAAGGAAAAAAGAGATATCTTTATTTAGTTCCTTGTGGGTTTGTTTG
CTAGCTCATCATTTTATCAGAAGCATAGTAAATAATTTACCAGGACCACA
ACACTGTTCATCCAAAATGTTACTGCTTCAAAACTTAGTAAAATGTTAAC
CTTATATACCACTACTTCCGTGGCAGGTTAGTTATTTGTTTTCTTCGCTG
TAATTAGAAAAATAAAATCTCAAAACCATCATTTCTGTCACAACAACTTT
TGAGTTGGAGCCTGGTAGAAACATAAATTCATTTAAACATGTAATCATTT
CCATACCATGTTGTACTTGCTTTCTATTAATTTAACAATATGTCACATCC
ATCAGTCGACAGGAAAAATGTTTTCATCATTATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATATATGGAAAATAGTGGGCTATCTAGGATGCTAT
ATGTGCATACTAATCCAACTATTGGATATTCTATAGAGAGCATGAAGTTG
AGGAGCAGGAGCACAAAATATCAACGGAAAACATCACCCCCGTTACATCA
AGAGCATTTTTTGCATGCATTGCTAGTACATGCAAATACACATGCATGCA
AACTAGCAACAGCTCACGCATGCATGCGAGCTAGAAATACTAGTAGACCA
CTGAACTGGCTAAAATTTTAGCACGCATTCTAGAATACATTCAGACCATT
GAACCGGACAAAATTTCAGCACGCATTCTAGCACTACATGTAGACCATTG
AACATACCATTTTTCGAGCATGTAAATTTTTCTATCAGGTGTGTGTGTAT
ATATATATATAGGTAAAATATATATATATTCTTGTGCTATTGAGGAACCG
ACCATTGAACCGGCAAATTAAGCTGATTCCATCAGGGAAACACTATCATT
GAGGAATCGGTCATTCGATTAGACATACAGTAGAAAAATAACATCTCAAT
CTCATTGAGGAACCGGTCATTCGATTAGTTGGTCTACTCCCACGGTTGGT
TTTATTGCAGAATTTTTTTGTATGTTTTCATGCTAGGATTCATGCTAACA
TGCACACATCCCCATCAACTAGTACAGCTAGTCAGGTCTAGTGCATGCAA
GTACAACTAGCATACCGCGTGCAGTTTGTAGAAATTTTTGCAACAATATA
GGCTGGTTGGTCCGCTACAATACAGTCTGGTCTTGCCATTCTACAAACGG
CAAATAACACTGTTAACTGCATGCAAGATTTTGGCTCTCTCTCATCTTGG
CAGCTAGTTCACGTACTCTCTGTATCCAACATCAACGCCTGTGTGCATTG
GTAGCATCCTAGATAGTAAATCCGCGTTGATATATATATATTCATAAAAA
TCACCATATAGAGTAATTATGTTATAGGAATTCTAAGTGAGCACTTGTTT
CCCTGAGTTTGGCAGGGGTCTGCATCTGTGCCCATTCTTGTCCCTTTATC
ATCAAGTGATCACCATGTTGAACTTGATATGAGATATCAATCCAAGAATG
CTAGATATGCTTTGACAGCTCTGGCGAATGAAATACCAAATAAGCATAAA
ACCACTGCGATAGCTCCGAGAAAGAACTTTAAAGGTATATACTTAAATCA
TGTGACCGTTGTTTTTGGAAATCCCATTTCTGTTGGAATCTCCCTAACAT
GTTTTTTTGTTGATTCCAGTAATTGTTCTGTATGATGTTGACAAAGTTAG
TGAGAATAATCAACGTTTGATAAAATGGATTATTGACTCCTCCTCTGATG
CATGCAAGATAATAATGACTTGCAAAGATGAGCCCAATCTTCTTGATTCC
ATTATAAGCCGTTGCAAGATTATTAGCATTAGTATGCCCAATGCACGAGA
GGTGAGCTATCTGGTATTTTCATTGGGGTTTGTGAGTATATAGATTGCAG
AACAAGTATCTAATGTCTACGTGTAATTTCACAGGCTTCCAGCGATTATA
GTACATATTACCTTCTTATCAACTAGCTTAGTTCCAAATTCAAAAGCACA
AATATGGCATTCTACAACATTAACACTGTAGATATATTTTTCTTTCTGAG
AACCACTAAGATTGTACTTTCAACTCAACATTAGCAGGACGAGTTCATAA
TATGAAACAGAGACAAACTTCCATTTCTTTTGTACATTATACTTTAACTT
CATTATTTTGCTACGATCATTGACTGACAAATAAAAACCCAGATTGTGGA
GATTCTTACTTACATATCAAAAAGAGAGAATTTTGATCTTCCTGCAAGTT
TTGCTGCTACCATTGCAACTCAATCTAGGCAGAACATGAGGGAGGCGATA
TTGGCCCTGGAGGCATGCAAAACCAACAAGTATTCTTTCAGTATTTTACT
TGTTACGAAGTGTTCTTGTTTTCTTTGGATTTATATGTATTATGGTTCCA
ATACCTGCTATTTATTTTTATCTCCCTTTCATTTACCAGTTACCCCTTCG
TTGCGGGACAAGCTATACCGGTAGGATGGGAGAATGTTCTTCAGGAACTT
GCAGCAGATATTTTGGACGATCCTTCTCCCAAAAGGTTAGGCATTTGGAG
TCAGAAGCCAAGAAATGTTTCATTTCCCTTTCCAACTTCTCATTTACTGT
GAACTTGTGGTAACTGTACTTTTCTGAGCAGCAGCTTTTCGCTTTATAAA
ATGCAGCATTTTTTGATCGGTCAATTTAGTGAATATTGTTCTGTGTGATT
ACATTCACAGATCTATTTTGTATAACAGATGAAAACATCGTGCAGGTTGT
TTTTGGTACGAGGCAAGCTCCAAAAGCTCTTGGTTGAATTCGTACCACCT
AAACTTATTCTCCAGGTAATTTATGCAAAACAAACGGAAATATTTTGCTA
ATGAGTTATGCAGATTCACCTCAAGGATGATATTGTCTTCTCATATGTAA
CCATACAATTAAACTTCATTCTTGATTCTTTTTCCCTGCAGAAACTTGTA
GAGCTGTTCCTGAAGGGAGTCCATGCTAGCATAAAGAGGGACGTTTATTA
TTGGCATGCCTACTACGTGAGTTTCCTCTCTGTTTCAAATGCAATTCCTC
GGTAAGCTATGATAACCAGTATGGAAATAACGAATTTCAGGACAAGAGGT
TGCCGGCTGGTGCAAGTGCACTGCTGAAACTGGAAGGTAATTCGCCACTC
CTCCGCCCCCACCATCTGCATCGTCTTCGTCATTTGTTACCTTTTAAGCT
AAAACAGCCCAAAACCATGATCCTAGGGACTGCAGATAAACCCTGAAAGT
TAATTGCTGCCTTTTCTTTTGCAGAATTTATTGCCAAGTTCATGAGCATC
CATCGGAAGAACGTGTCGGGTGTTTCATGAACACACGTGGTTCAGCTGCA
GCCAGTGTTCAGTTTACCTGTCATGGAGCCGTTGTTTGTATTTTGGATCG
GGAAAACAGAAATGTACAGAGAATAAGTCTGCTGCACAAAGCAGGATGAA
ATCAGTCTGTTGTGCAGTTAGTCTGTGTTACATACGCCTTTGTGCATTTG
GTCATTGGACTCAACCAACCGATGATGCATCTGTACATTGTTAGTGGATT
AAAACTGTACCGGGAATAAGCTCTTGCAGGCGTTTGAAACGTCTCATGAG
AGTGTTTTGTGGTATGATCGTCGTTTTATGTTAATTTATGTATGCGTGTG
AATTCCTTTGAGAAACATGGTCGGTCAGTATTTTCCCCTAGAAAAAGACA
TGGTCTCTCAGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.