Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA042924

[Submit comment/correction]

Sequence
AA042924
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042924
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGGGCTCTGTCATATTCTCGGTGCGGCCAGATCTCACATTCGCAGGCCG
TCTGCTCCGAGGCTCTTTCTCCCCCGCATCTTCTTTCGCCCCCACCGCTC
TCCGGTGTACGGCTCCGACGGGATGGCCGCCCCACTCCGGCGGGTCTTCC
CCGGCCTAGGTCGCGCCCTGCTATCGCCTACGCCCGCGCGGATGCTCTCC
GCAGAGGCCTCCGACGCCCTCGTGGAGATCAAGCCCGGCGAGATCGGCAT
GGTCTCCGGCATCCCCGAGGAGCACCTCCGCCGCAAGGTAACGTTACCTA
GCCTTTCCTGACTGTGCTGTCACCGCAATAGACCAGTATTTAGTGGATCC
GTGTGGGCATCTCTCGAGATGTTCGGGCTTCTAGGTTTTTTTGGTTGTTA
GATGTGAGGCGATGAGTCCATTTCGACGCGTTAGTTGTGTCTGGAGTTTG
TATTGACAGAAATGCGAATTTAGTGGTAGTAGTGTACTTCCAAATTTCAA
TTGGTTTGAGCTATGGTGATGAGAAATGTATGGGAGGTTGGGTTTCATCC
GGCATAGATTATGCCAAAATTTCAACCCAATGACGATGTGGAGCAACTGT
GTTAGAACATTTTTGTTGGGGTATAGAGAGACATGTCTCTGCAATGAAAA
CAAAAGGTAGAGAGGCATCAACCACATTACTCCTTGCGGCCTGTATTTTG
CTATAGTTTTGAGTTTGCTTGTCCATTGTGTACAGCCAATAGTTATATGT
GCCTCCAAGAATTTTTTGAAAATGCTTAATGGGAGTTGATAATATTTGGT
CAGAAACTCTGCAATTTTGGAGCTTACAGTGTGATGGTTTAAATGCTAAT
TATAAACTTTCAGGAGGATAGGTGCTAAATCTTAAATGCCTAGTTTGAAT
TCAGGAATCCACTTTCAGAGGATAGATGCTAGTGCCCAGTTTTTTTTTGT
ATCTAAACCTTTTCTCCCCTTTTTAAACAGTCACTTTATCCTTGGAAATA
CGCAGGTTCTAATCTATTCACCAGCTAGAACTGCATCTCAGCAAGGTTCT
GGCAAAGTCGGGAGGTGGAAAATCAACTTCGTGTCGACTCAAAAGTATGA
TTCTTCTTGTGCTTTGTTGGTTCTCTTGTTCTTTCTGATGGGCCATACAT
CCCAAATTTCTGTGATAGTGTGATGTTGTTAGAAGGGCTAGCTCAAGATG
ACATGAAATTAAACAAATGGCCTTGTTTAAATTAAGTATTACTCCCTCCG
TTTAGAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGGAGATGTATCTAGACAC
CTTTTAGTGTATAGGTTCAAATGAATCTAGACACTAAAAGGTGTCTAGAT
ACATCTTATTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTCCAAACGGAGGGAGT
ACCTTCCAAGAGGATCAAAACTACTGACTGTGCCTTGAGATCTGTGCACA
TTCTCCCATCGCTATTGCTATAACTGTATGTTAACAGAATTTGCCAGATC
TCAAGGGCCATTTGATGGTTAAAGTAGTGGGAGTTCACCTATGCAAGCAC
AGACCCACTCATGCATATTATCAGAATGCTAATACCTATTGAACACCTGT
GCTTCTTAATCACCTTACCATGACTCACACTTTTTGGGTAACTTCTAAGT
TCTAACTAACAATCAACTTGATGCATGGGTTACTAGTGGACGGCACAAAG
AATAACCCCATGGTTAGAGATGTTATTGTATCTGTAGCTATAACTCAGGT
CTCAACTATTGACCATATCTCAGTGTACTTCTATGTTTATAAAGAACTGA
AGACATCCCAGGCATTCTCTTTATGCACTGTCGAGCTGGACACAAACTTA
AAAAGCATTTGTAACACAGTTATATTTATTAGGACTGGAAGTGTTTTTGG
TATTTTTCTTTCAGAGGTGCTGTTTGTTATGGGCTCTTGTTGTACTTGAA
AGAAGATATCTCTCTCTATATATATAATATAGAAGTGCTCAGTGCACGGT
AAATCATCTTACAATCCATTTATCATGCCATGTGGGTAGAGGTAGACATC
TGAATGCCAATCTAATTTGATGACATCACACAACTACTGTAGGCCTTTTT
GTCTTGCTTCTAGCATTGTTGTCTATAATACCCTCAATACCTAAGTGACA
TGATCTTGAGGTCCCCGATTAAGTAGTATCTTATTTTGTGTCGTGGTACC
ATAACGTTCCATGTAATCCGGTTTGCTTCTAAAAGCACACTGGATGCTAG
AAGCTTATAACTGTTCTCTTTGACTTGGTATACCTTACAAGTACTATCTG
GAACACTGTTGTATTAGCTGGATCGAGGATAAGTAACTTGAGAAGGACTG
CTCTATCACTGCAGAATGCAGATCGTGCATGTTTCAGTAGGCTGATTGCA
GCATACTTTAAACTTCATGTAGAATTTGCAGTTACAAAACAAGGAAGAAT
CTGGAAACTGCTGCAGTTTTTCCTGCTTTCATTTTTATCATTGTTGCAAA
ATGTAAACCTTGAAGATCACAGCCGATGTATTTGAGCTCCTATTAAGCAG
GTCTCTTTGATTAGGTGCTACAGTTTGCCTTTTTTCCTCTTTTATATGGC
TCAGGGTCATGACTTGTGCATTTATTCTGGTCTTGTCTCTTTAAATTAGA
TTTTGGTTAGCAAACTGACACTATCTGATACTGTTCCTTTTTCTGTTTGA
GAAACTGGCTCTAACATTTGAATTCATGATAGGTGGGAGAACCCATTAAT
GGGATGGACATCTACTGGTGATCCTTATGCTAATGTTGGTGAAGCTGGAC
TTACATTTGACAGTGCTGACTCAGCAAAGGCATTTGCTGAAAAACATGGA
TGGGAATATGTGGTGGGTCCTTCTCCCCCTTCTTGGTATTCTGGTAGATA
AGTCGCAAATCAGATATTCTATTCAGGATGGGAACTTCAAGAATATTCGG
AAGAATGGAAGGATGATTTGTTACACTTTTGAACACTAGGATAGTTTGAT
ACTTGGTTCTTCTCTAATTTAAATATTCAAACTGGGCAGTGTTGTAGGGT
TCCTTTCATCCCATGGTAAGTTTGCAAACCAGTTTAGGCCCATTCAATCA
AGTACAGATGGAGACGGATTTCAAGTTAGTCATATAAAGTTAAATATTCT
CTCATTGTGGATTTTCTTTCTTCGTAGCTTAATTTGCCTAATAGATAGGC
GGTTTAAGTACTGTTCTACTGCTACCTATTGATGCATCCTTGAAATTTTG
CGAACGGTTCTTATCTCGGTTATTTAACTCAATTAAGTCAGTTAAAATTC
TTTTCTCCACAAATAACCTCCCACCTTTTTTGCCTTGAAATTTACCATTT
ATGTCACATGCCTATTGATTAATATATCCTTCTTATGTCTTAGACATATG
ATAATAAATTGTGCCTGTGAAAAGTCAAATTCTTGGTCATGTCCCTTCTC
TAAAATCCATTAGGGTGAGATATCATCTATAAGCTTATTGTATTCTTTCC
AATTTAGTGGTATTGGATGTTTTGGTGCTAAAGTCGCATTAAACTTTTTT
TAAACTTAGCTGAAGCCATCATTAATTTTGAAGTCCATTTCTGGCTATGT
TCTAAATATTACTACTTGGTGTGCAGTCGGTCAGTCGGTGACTTGTGATT
AGAGAGGTAGTCAGACAATTAATTAATCTAGACGGTAGGCCTCACTGTCC
CAAGCTACCAAAAGACACTAAAAGATGCAGAGCTACCAAGCCTCACTGTC
CCAAACAAGCACAACCCATTAGCCACAAATCACTATTTGAAAATACTGAC
TCCCAAACAGGCAGAACCAAGCAGTCAACTGAATCATAAATACAAACAGA
GCAAAGCACTAGAGCAGAGCACAAGAGTGCTGCAGTTTGATTCGACCCAG
TTAGCAGAAGCAGAGCCGAAGGAGCATGTTGAAGCAGAAGCAGAGGCGGA
GGGCAGCTTGTCGCAGTCAGCGTGCCTGCTTTGTTCTGAGGGCGGCGGCA
TAGATGATCACGGGCACGCCTCTCTGCTGGCTCGATCTGTTTCACTGCAT
GCCTCTGCCAAAAATCCGAGTCTTCCCAGGAAACAATTAAACTTTCTCTG
CACATTAGTCTGCCTTGGACCGACTGAAGCCGTGTATGACCAGTCTAATT
GGTTTGCCACACATGAGCCAATTATGGCCTAATCACCATGGTGGGGTTCA
GTACAGCATTTTACATGGGTGTTTATTTGTCTAGGCGGCTGATTTTTTGA
ACATTAATTATGTTGAGTTGAATCTCCTTGGGCTATTGTGTAGTATTCAG
TAATTTGTGCTTGGCATTTTTTTGGAATGCCCCTTTTGTATTTATTTTCT
TGGTAAATGAGAACTGTATACTTACATCTACATATACTTTATTGCAGGTG
AGGAAACGTCATACACCTCTTTTGAAGGTCTGTATACCCTACACATCCTT
CATTTTGACTTGGTTAATGCATCTTGCATCTCTAGTCTTTTTAACTGAAT
ACACACATTCACTTCGTTTAGGCATAATACTTGCAACTATGGCTTCTGAA
TCTGTTTGTGCTTACATGTAGTGTGTCATAATTATAGAATATGTACTTTT
CCAAGTGTTCCTACACATCTTCTGTGTTGATTTACTGTATAGACATAGAC
ATACCTCATAGAAAGTACTTAACATTGAGTTGCAAGCAAGATACTAAGTG
AATCTTCTGAAAAGAGAAATTAGTGGTGACGATTTTGTACTAAGCACTAA
TATGCTTATTTCCTCAAGCGGTGTGATCCTCATTAGTCAGGATAACTCAT
GTTATATTATAATACGGGAAATGGAGCGGAGATGAAATTAAGACATATTT
GGAAGTTGGATGTGAGGGTGGTGACTTGGGTGTTTCCACCTTTGGACTGG
AGGGCAATGGTGCCACTGCCAGCCTGCTAATGGCTTCTTAAGCTTGGGTA
GAGGCAAGGGAGGATAACATGTAAGAGTAATGAGTGAAGACTAACTTGGT
AATGACTAGCGGGGACTAGCTTTAACTTGGGGGTCTGAGGAGGAGATGAA
GGAATTGTGAAGACCAAGTGAGGAGGCAAATCCTGCATTTAATGGGTAGC
CTGTTGCTTGGTTTGCGACACATTTTTCATGTATCCGATGTGCTGGAACT
TCGACCTGAAGGCTTTTCTCTTTCATGGAAATTAGCTTGCCGTTAGTTCG
AGTCCTTCCTCGGTACTTAGAAGTCAGCTGTCTAGAGAAAAAACAAAATT
GTCATCAACATTTGAAGCGCATCGAATGTGAACTGGGCTAGAGTACAACA
TTATAAGTACAACGAATGTGAACTTGGCCAGAGTTATACAGTCCTCATCA
TCCTTATCTATTTTGTTACTAGAAACTTGATGAGGACAAGCGAGTCAGTA
CTTGCTGCCGTGCTGGTTGAATTTATGTGCCTACACTACACCATAGTGAG
GAACGAGACCACTGTTTTGGCAGTGTTTTGACGGTGCCAAGGATTTGACT
TATCAGCTAAAAAAACAAGTTGATGTTAGTTAGTCTGATGCGATTCTCTA
GAATTGCATACGTATGAGCTACTTAAACAAAATACATATAGGATTCAGAT
AATAAGACTAATGAACATGCCAATTGCAACCCTACACCAGATACTTTGCA
TGCTTAGCAAGCTATTTTTGCCCGAGTTCTCTGTGTATTGAAGATATTGT
TGTACTTAACGGTTGCTGTTCAAATCATTGCAGCCCAAAACGTATTCAGA
AAACTTCAAGTGGAAAGGTCCCCCGAAGACGGAGGAAGCAGCCTGAGCCC
CGGACTTGCATGTTGTGTGTGAAGGATGTGATCAGATGTTGCCTCCGTTC
ATATTATGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.