Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA007838

[Submit comment/correction]

Sequence	AA007838
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA007838
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ACATCACGAAAGAAAGTTGCATCTAATTAAGACCAACGGAAAACTTAAGA CTGAGCAGCTAGCTAGCAGCTATGGGGTTCGCGGTGACGAGGACGAGCAT GTCGCTGGTGCCGCCGTCATCACCAACTCCGGCGGGGGAGACGCTGCCGC TGTCGGCGCTGGACCGCGTGCCAGGGCTGCGGCACCTGGTGCTGTCGCTG CACGTCTTCGACGGTGCCGACGACGGCAAGGCAGGCATCTCCCCGGCGAG CGTTGTGCGGGAGGCGCTGGGGAAGGCGTTGGTGGACTACTACCCGTTCG CGGGGAGGTTCGTGGCGGAGGAGGATACCGAGGAGGTGCGGGTGGCGTGC ACGGGCGAGGGCGCGTGGTTCGTGGAGGCGGCGGCGGCGTGCACGCTGGA GGAGGTGAAGCACCTTGACCACCCCATGGCCATCCCCAAGGAGGAGCTGC TGCCGGAGCCGGCGCCCGGCGTGCCGCCGCTCGACATGCCAATCATGGTG CAGGTACGTACAGGGCCGGCTCTAAGCTTTGCAGGGCCCTTGTGCGAAGT TGACATATGGGCCCTAAGATTAATGTATTTGTAGATATATCTAAATATAT ATATATATATAATTTTATTTTAGAAATACTAAAAGTTAACATCCAAATAC ATATTTTGTTTCAAAATATAACAAGTACTCCATGTGTCCTAAAATAAGTG ACTTCTGTTTGTCTAAATTCACATCTATCTATATACCAAAACGTGTCTAG ATACATCTAAATTTAGACGGAAGAAGTAGTATGTCCTGCCAGTATCACCT AAAATTGTGAGGAAATTGAGTATATATTGCATAAAGAATTAACAATAGAA CCCTAATGCTATCCTGCAAGCAAGGGCATATTCTTTTAGTGAGAGGCGAC GTTTCCGTCGACAACGAGGTGTCCATGGTGACTTCGTCAATCTCAAGACC TGATCCGCCGAATCGGTCTATCGGAGGTGCTCATAGGGGTAGGGTGTGCG TGTGTGCGTTCATACGGGTGGGTGCATGTACGTGTTATGAGTGTCTACGA TACCGTGTTTCTCAAAAAAAAAAAAGTTTGTAGAAAGGTTGTGATCGGCT TTGATGTGCCTTCTATTTTCTCCATGGATGTGTAGGTGATATAGTACAGA AAACTAAGTAGTGATGGGCCCCTTGCCAGCATGGGCCCTTGGCCGTTGCA CAAGGCTGCCATGCCCTAGAGCCGGCCCTGGGTACGTACGTACGTGCATG ACTACGGTACCAACACTAATAAGGGCATCACTAATGTATAAGATGAACCA TAAGATAAGACCCACATAGCTTATGAAAATGGCTATAATGTATAAGGTCA AGTTACCATAAGCTGGGACCCACATGTCTGATAAAAATACACACTAGCAA GAGAGGAAGGAGAGAGTAAAATAATTGTTTATTGCTTATGGACAACCCAT AAGGGCATCCACTATGTTGTCCACAAGAGGTTCCACAAGCAAAAAGTAGT CCATAAAGATGCCTATATACATAATGGAGCTTGTATATAAGCAAAATTTC TTATAGATGACCTACAAGCTTATGGGTTGTCCACAAGCAATAAAAAATTG TTTCTCTTTCTCCTCTCTCTCTTGCATGTATGTACTTTTAACACATAAGT AGGTCTCAGCTTATGGCAAAGTTGACCTCTCATACATTGTAGCTATTTCC ATAAGCTATGTGGGTCCCAGCTTATGGCTAAAGTGAACCTTATACATAGG TGATGTCCTAAGCTTGTAGGTCACCCTTAAGAAAAATCTTCTAAAGTAAA CCTCTACTATGTATATGGATAGCCTTATGGACTATTTTTTGGCTTGTGGA TAGCTTTATGGACTACATAGTGGATGCATTAAGGGCATCACCTATGTATG TGGTAAACTTTAGCCATAAGGTGGGACCCACCTCTCTTGTCAAATCTTCC ACTATGTAAGGTGAACTTTAACCTTAAGCTGGGACCCACATGTCTCATCA TGTACACTCATGCATGAGAGGGAAGAGATGGTAAATTATTTTCTACTCCC TCCATTTCAGGGCTTAAGGCGTCCTCGTTTTGCGTGTTTTTTCTTTGACC AAGAATTACTCTAAATACGTAAAGAGTTTTGGTATAAAACTAGTATAACT GGAAAGTATTTTTCAGTACGAATCCAACGGTACTAATTATGTATAATATA ATCAAGATTTTGTTGCTTAATTCTTTTGGTCAACTTTGCTTTGGAAAACG TGTATGCCTTAAGCCTTGAAACGGAGGTAGTATTACTTGTGGACAACCCA TAAGCTTAAGGTCACTTATAAGCTGATGGACAACTCATATTTCCTCCACT ATGTATAAGATAGAATACAAGCATTGTCACATAGGACTTAAGGTGTGGTT TTTTACACATAGTGGATGCCCTAAGAGAGGGAAAATGGTCGAGTACCTAC CTACGTGACCTGCAGTGCATCTCATAGCTTAGCTAGGCTAGGTAGGTAGG TGCACAAATAGCACTCCAAACCTGCACCCGCAAAGTTCGACAGAGACGAT GGAAGAAGGTGTGCGTGTAGTTACCTTTAAAAACACTTTCCTTCGACCGA TGCTCTAACTAGCATTTCTATTGACGCCTATCTGTTGATGAACTCTTCGA GACGAATTTGTAAAGGAAAACTTAAATAATTACTTCCTCCCTTTCAAAAT ATAAGATGTTTAAGCTTTATGAAGCAAATATGTATCTATACTTGTTTTAG TGCGTAGATTTACTTCAAACCTGAATAAAACTATACACTAAAAAAAGTCT AAATACATTTGTTTTATAAATCTAAAACATCTTATATTTTAAAACGGAGG GAATGACAACTTTCAAACTTTATATACAAAGATGCAACCTTTTGAGAGGA TGATCCTGGAGTAAAAACTTTTCGAGCGAGAGCAGAGAGGACCCGCATAT GAACCTCTTAGACAACATTTGCACGATAATTGTGGTGGATATATATGTAC TCACATGAAGATAGCGACAAAGCATACTAGCTTGGGATTTTTCATTTGGA TTGTTGTGCTTTATTTATGAAGCAAGACAAAAGCCTATTTCAAGAAGAAA ACATGCACTACGTACTCTTTCGGTGACATGGAAAAAAAACATGTCTAACG CTGCACCAGCGAAGTTACGCGAGGGTCATTGGATGAAGGGTGTTATTGAT GATTCTTAATAGATCAGTGAAATTTCGGAAAAAAAAAAGAGAAGAAGGGT GACATTTAGCTCGATATGTGTGCAAGGCCGGGTATCCTGGGTATGTGGAT AGTGGAGATCAGTTATATATCTTCACCGGAGTGGAGAGTGGAGTTTGAGA CTCGAGATCAATCGAGCTAGCACCTTACTGCCACGCACCACCTTCTGCTT TTGCACAACTTGTTTTCGAGTTAAAAGTGACAAAATAGAGGTATACATGG TATATTATGCGGCATGTGTACCGCAACTAGTTATGATAAGATTGGTCGCC CACTGCTTCCATATGAATCATCACAAGCTACATGCTAGTAATTGTATATT CTTGTCCACCGTTCAAAAAAAGTATATATATATAATATTATTGTTGGATT CACCACTACTTAATTTGTATGAGATTGACCGGTTGTTAGACTTTGCTTAT AACACGGGACGAAATCCTGTTTTCAGATAGAGGTTAAATAAGTTGTTGCT ACGTAGCTACACTCGGTCCTGCATGCAGCCGTGGGGTTGCTGTTGTCGTT AGTTCTAGGTGTGGTGATGCTTTATGGTCGACGGGTACACAATTTGTTAA ATGCACATGTACAGAAAGCCTTTTATTTGGACAATATAATGGGGTTGTTG TTCATCTCTCTGCACCAACTTTATTCCACAAGATCTGCACCTACTTTGTT GAGCACGTAAGTTGCCTTGTGCTGGCTTATCTATCTAGTACGTGTTAGGC TATTCATGAAGCCTGGTTTGCTGGTTGACCTTCGCCTGAAAGAGAATCTT CTAGCTATATATGTAGCATTATTTGATGCCTTTGTGGCGAACTTAAAAGA GATTTTGGATGTAATCGACCAAGAGCGATTCTACCACACCTCGCAAGTAC TACCTCGCTCCCATCTGTCCTTTTAGAATTTTTGCCACTGGCAGATTTAT ACTGTATATATAATAGGTTTTAACCATCCGTAGTGCTGGTAGTTGCAAAG CTGATAAGTAAGTTGTAATTAAATAAAAGTGGAAAATGGGCTCGATCGGA TAATTAGAAGGATCTAGCTAGAGATATGTAGATGCACACATCAAGTTAGA AGCCAGTGGAAGAAAGTGTGTGCGTTGTCGCATCAGTGAAAATGGAAAAT ATTGACCAACCATTGATCGGTTAGCGCTGCACGCGGTCGGGGGTATATTG TCGGGTCACATTTTTGGAGTAGGTCTGAAGAGTCCGTCATATCGTTCGAC CAAGTAGCTCTCATATGGCGATGACCACGATGGTGTTACCTGCTACCAAC CTTGAAAACCAGAGCTCGCTTGCCACATTTCACAAACTGGACATATATAT GCTTAACTAGTTCAACACATTAATTAGTTGTTCCTCTTGTCCATTTCATT GAGTAGGCAAAAAAAGGTGTACTGCCTATATAGAGATAGCTAGATCGAAC TAACTCAAGTCCTATTTACTGAATCGAGTACAAGTCCATGGCTAAAAACA CCCTACAAGTCCTTAATGGATGGCTCCTATGTCCATAGATCAATGGAACA TAGTAAGAGATACTCCCTCCGTTTACTAAATAGTGTATCTCCAACATTTT TGGAAATTCAAATTATTTTATATTTAATTATGTATATTCAAAAAGGGGCA TACATTTATGCAACCGAATTAGTATAATTTTATTCGCGATAAAATATATT TCCATCATATTACTATTTTTAGTTTCAAAGTTAGACATAGTTTAACTTTA GATTGTGTCCTTTAGAAGTTTAGGTAGATGCATGCATCAGGTTAGAAGCC AATGGGGCAAGTACACGAGTTGGTAAAAATGGCAGGTTTTGACCAACTAT TGATCGGTATATTTCTGGGTCACATTCTTGGATGGGTCACGTAGTAGGCC AGAAGATTCGATCATAGCATTCAACCAAGTAGCTTTCATATATTGACGAC TCCAAGTGGTGTTACCTACTACCAACCTTGAAAACCAGAGCTCGTTTGCT ACCTTTCACAAGCTGGAAAAATAGATATATGCTTAACTAACTCTACACAT TAATTAGTTGTTTCTGTTGCCAATTTCATTGAGTAGGCAAAAATAGTTGC ACTGGCTGTATATAGACAGCTAGATCTAAATACCTCTTGCCCTAATTGCT AAATCGTGCAAGTCCACGGCTAAAAAGCCCCTACACGTCCTTAATGACTA GCTGCCTTCAAAGTCCATTGATCAATGGAAAAGAGTAAGAGATACTCCCT CCGTTTACAAAAGAGTATATCTCCAACATTCTTGGAAAGTCAAACTATTT TATGTTTTATTATGTTTATTCGAAAATAGATATACATTTATGTAACCGAA TTAGTATCATTAGATTCATGATAAAAATATATTTCCATAATATTACTATT TTGTTTCATAGTTATAGTTTTATGTAAATTCGGCGAAAGTTTGATATAGT TTAACTAAGATGGATGCAAGTGTGGGAGTCAGGGTATCGATCTCCATCAC GGATAGCTTGATAGTGGAGAACGTTTCTCCACCGGAGTGGAGAGTGGAGA GTGGAGACTCGCTTTTGCACAACTTGTTTTCTAGTTAAGTGATAAAATGC ATGGAGATGCACATGGTATGCGGGCATGCGTACCCACCACTTCCATGAAT CATCATAGCTACGTATGTAGTACTATTAGTATATTCTTGTTGGGTATAGG TTAAGTGGGTGTGTGTGTCCGACACGAGAGGGTTCCACGGATGATATATT GGACACATCGTCCTCATGGGACATGCAAATACCATGCTCAGACACCGTTG CATGCAGCCGTGGGATCTCTGTTATCGTTAGTTGTAGCCGGTGATGACAG TGGGACGACTAGGACCATAACACATGTGATTTCAGTTCTCTTCTCTGAGT GAAATTCATCATCCGTAAATTCAGAATTCCCAATACTAATGTGCTAGATA GAGAATGCCTTTTAGTTCGTGGGGTTACCTTTTATCCCTCCCCAACAACT TTTTGGCATAATATCTGCATCATGGTACGTACGTGTTGAACTGACTGGTT GCTATATTAATATAGCGGAACGATTGCATGTTTCAAGATAGTAATTGAAA AGCTCATAAGTAAGTTATAAATAAAAAATGGAAAATTGGCTCGATCAGAT ACATGCCAGGCAGGATCTAGCTAGTATCTAGCTAGATAGATGCATGCATC CCAAGATAGAAAGCAAGTGCGCCAGTTGTCGCGTCATCGGTGAAAAACGG GAGGTTTTGACCAACCCTGATCAGTTTTAGCCCATCACTCGACCGCGGTA TATATTGTTGGGTCGCATTCTTGGATGAGTCAGCCGGGCGGTAGTAGGTC AGACCATGTCGATCAATCAAGCTAGTGCTCTCTCATTGACAGCGAGTGGT GTTTACCTACTACCAACCATGAAAAAACACAACTCACTTGCCACCTTCCA CAAACTTGACATATATATGTTTAACTAACTCTACACATTATTTAGTTGTT TCTCTTGGCCATTTCATCAAGAAGATAAATAAAAAAATAGGTCCGTATAC GTATACACAGGTAGATGGAAAACTAGGGCAAGTCCTTATTAATGGCTGGC TTACAAGTCCACGGCCAAAAAGACCCTACAAAGGTAGGCATCTGGCATCC GATAAAACAACACAACACACTGGTAACTACTATCTTTAGTATGGTGTGTT GTTTAGTATATAGATTCATTCAAAAAAACTAATCAAGCGTGATGGATACT CAGTGCCACTCAATCCGTACCGTTGTCATATCTCGGCATATAGGAGTAGT GTAATTAATTAGTAAGTGCGCGAGGTTGTTGAAGCGTCGATCGGTGAAAA GGGCAAGCAAGATTAGTTATTACGGGTGAGATAGAGGAGTCAATCCGCCA GGTAGCTTTCACCGGCAGATTTGCAATTGCAAGTGACTTGCAGTGGTAAA ATACACGACCGCGACTGATCTTATCTTCTGGAGCTGTGCGCCATAGATCG ATCCTTTGGAGCCTACCTTTGGAGCTAGCTACCATGCATGCACTATCCTG GGTTACTATGCTGCCACCTGCCTTTCAAATGTTCTTTGTACTGGATTTTT TATTTTTGTAGCCGATCAGGCTACATATACGATGTAAGCATAGAGTAGTT ACGAAAAATTGTTTCGGAATGCAACCCAAGGTTTTACATAATTTTCTAAC AGTAAAAAGTAGAAAATTTATCATGCATGAAAAAACACAACCGTAAATAT TTTCAATAATGGGCTAAAAATGAAAAATCAGTTAAAATTTGTAATTTTGA AAATATGCATTGTCAATTATACTTGGATCCATACTTATTTTAATTTTTTG TGTAGCTCAAAAATACAAAGTATTTTAGTGTAAAAAAATTCTAGTTAATT TGTACCATACATATAACTGAGTGCATCGAGATTTTTTTGACAGTTTTTGA ACTTTTGAACAACACGTCTGAATTTTTGGAAAGAAGGAAGTCACTTTAGC TCGGGAGCAAACAATCCCGCTATTATGGGCCTAAAATAATAATGTCACGC TGAGCACTTACTACTATGTGCTAAACTAGATCTGGTAGCCTTAATTTAAT AACATAGTAAGGTTTATGAGAAAAAATAAAGTAAAATTAGACCAGCGCAT AGAATTCTTAGTTTCAGATTTGTTTTAGAAAACACGAATAATTCAAGCCT CAACCTCTTTGATCGTGCAGGTGACGGAGTTCGGCTGCGGCGGCTTCGTG CTGGGCCTGATCTCGGTGCACACCATCGCCGACGGCTTGGGCGCCGGGCA GTTCATCAACGCGGTGGCCGACTACGCGCGCGGCCTCTCCAAGCCCCGCG TGTCCCCGGTCTGGGCCCGTGACCTCGTCCCGGACCCTCCCCGCATGCCG GCGCCGCCGCCGAAGCTGGAGCTCCTCGACCTCCGCGGCCTCACTGTCGA CTTCAGCCCGGACCACATCGCCAAAACAAAGGCCGACTTCTTCGCGTCCA CCGGGCAGCGTTGCTCCGCCTTCGACGTGTGCGTGGCCAAGACGTGGCAG TCCCGCACCCGCGCGCTCCGCCTCGCCGGCGGCGCCTTCTCGGACGACGA CAGCCCCGTCCACGTCTGCTTCTTCGCCAACACCCGCCACCTCATGCTCG CCGGCGCGGGCGCCGGGTTCTACGGCAACTGCTTCTACCCGGTGACGGTG ACGTGCGGGAGCGGGGAGGTGGCGGCCGGGGAGGTGGTGGACGTGGTGCG CGCGGTGCGGAACGCCAAGGCGAAGCTCGCCGGCGACGTGGCGCGGTGGG CGGTGGGCGGGTTCGCGCAGGACCCCTACGAGCTGAGGTTCACGTACGAC TCTCTGTTCGTCTCCGACTGGACGCGGCTCGGGTTCCTGGAGGCGGACTA CGGCTGGGGCCCGCCGGCGCACGTCGTGCCGTTCTCGTACCACCCGTTCA TGGCCGTCGCCGTCATCGGAGCGCCGCCGGCGCCCAAGGTCGGGGCCAGG GTCATGACCATGTGCGTCGAGGAGGCACACCTGCCGGAGTTCAGCGACCA GATGAACGCCTTCGCCTCCTCCGCCGGCAAGTGAAGTGAAGTCAGCATCG TCATCGTCCTCGTCTACACCCAGTTAATTAATCAAGGCCTTAATCAAGTG TGCAAATACGGTGCAAGCTCTTCTAGTATAGCAGTATACATGTCTACCTG GATTTCGGTGTGCCTAGTATGTGTCCTAATGGATTTACCGTGCTTGTACG GACGTGCCTGGAAGAAATCTGGCCAGCTCTTATATAATATAATCGATGTA CCCGGCCTATCTCAGGGTGCTATGAAGCAAGGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.