Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA022718

[Submit comment/correction]

Sequence	AA022718
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA022718
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAAAAAGTAAAAAAAAGGAACGCACAGAAAACCAACCCAAAAACCAGAG GAAACCCTCTCGTGTTCCCTCCGCCCTCTTCCCCATCCCCTCCTCGCCGG CGGCGAATTCAAGCTCAGGAGCTCGCAACTCGGGTATTCGCCCTTCCCCG TAATCTCTGACCTCCAATATTCCACCGAAATCCCCCAAATTCCTGAATAT ATTTTTGAGATATCGTTCGTTCTTTCCGCTCCGAGATTGTTTTGAACCGT AAATTTCTCTAGGGTTTCAGCGGGTCAGCGAAGGAGCGGGATTAGGCGGA GCATTCGTGATGGCAGGCACGAAGGCGGATGCGAAGGCGGAGACCGCGGC GGCGGCTCTTTCAGCGAGAAGGGGCTCGCAGAGAAGCTAAATAAACTCAA CAGCTCAGCGGCGAGCATCCAGAGTATCCTTGTCTCCGTTGGTTTATTTC TTGCGCGCCTGCAAATTTGATAGCTTAGCCTGTTTTCGTTCCCTGTGTTG ATGTAGTATTGAACTGTGGCGAGGTAAAGCCCTAAATTGCAATGTGGATG AGTAAAACTGACCCAGGAGATCCGATTTGGGGTTGATGCGTTGTCTTGTC CGCCACTCGCCTGTTTTTCTGCTTATCACGGTGCCTATCGTTCTTAGCCT GTTGGCTTTGGTTCAGCCGAGTGGCCTGCTTCTTGTGGTTAATTTATTGA TGCATAACTGTATTTGGCCTCCTACGAGTATAACTGTATTCAGACTAGTA TTTCTGCAGCTCGTGGATTGTTCTTTTGTTTGTACACCCTTCTTGCACTC TTATGAGGGATTTTTTGTTTTGTTTTTAATGCATTGGGGATGTAAAAATG AACATGGGCAAGGTTTTTGATTTTGAACTAGCTTTGTTGGGTATTCAAAT TTGTTTCATGACTGCTGATGCTTGCTTTTCTCTCTTTTCTTCGAACTACA GCACAAAGTTGTTTTCATTATCTTTTGAGGGCATTCCCCTTAAAAGATAA CAAACGACGGCAGGAACTGTTAGGACTATACGTCACAGCGCAGTAGTATC CCATAGGCTGTCTATGTTTCTTGGCTGTCGGGATAGAATTATTCTCGTCC TCGATTCAGCAAATCTAGCAGTTTTCTTTTTGAGGAAGAGTGAGCAGAAT GAATCATATGCCACGTCCTTCTGTACGGAACTAAACTAAGACATGTGGTT CTAGCTATCAAATTATTTCCTTCTAATTGTTGATGTTAGGGTATCATTAT GGTGGTATTCATATTTTTGAGACTTCATTGGTTGTTTAGATGATCTCTGT GGGGTTGCTATTCTGATGGTATTTATCTTGTTTGTTACCTAGTTGTATTC GCAAAGCAACTTAACTTTGGACTTCATGACCATATCCTCATGTTGAGCCA CTTAACCAGCTAGGTAGACCATATGTCCATATCATACACTATCATCACTT AAGCTAGCCTTAAGTGACAACTGAAATGTGCTAGAAGCGGACCTTAATTA GTTTGTTTTACAAGGACATAAGCATTCATCATTCGGATGATTTCCTATAT TTATCATGAAAAGGGCAGATTACATGTCTGTTTCACGTCTTTGTGTTTTC ATCTTATGTGAGGAATATACTACTCCCTCCGATCCAAAATAAGTGCGGAG ATGTAGTACAAACTTTGTACTAAAACAGAACTAAATCACCGACACTTATT ATGGATCGGAGGGAGTACAACATTTCTATTTGTAAGGCTGTCTTGACATA TCATTTGAAGCTATTTCTTTCACACCTGATTAATGATAAACTACTTAGAT TTATTGGTTAACAATACATAACATTGATCTTTCATGAAAATAGTTTCACT CTTACATGTTTAGATGTTCAATTCTTCATACAAAGGTTTACGTTCAAAGT TGCTTACGGAAGACTGCAAAGTGTCTAGTGTCATCTATTCTGGAACATAG CAGTTAATATACAGGAACATTAATTGTCAAAGTAGGCTGAGATGACTGGA AGTGTGGGCCATCTTCTAATGGGGATATCCATTGGTTTCTTTCTCTCTGG ATTAAAGTAGAGCATGTGTTAACTGGGGATAGTTTGACAAAGGATGAAAA AAATAAACAGATTGTAGCAAGGCTGGTAGTTGGTGACAAGCCAATTGCCG CCCTCTTTCAGTTTCTATATTTCCATTATGTACGTGTACATTTTCCTAAA AGCATTGTGTTTTTTGGTGTTCCGTGAACATCATATCAAGATTACATTTA ATTAGTTGAAAGTATGCATCTTCCCAACCAATATTCTTCGTACTGGTAAC CTTGGTTTTTTAAATCGCTGAGTATGGCCCATTTCCCTTTGCTCTTCTTT TATCACACTGTACTTAGTCCTGTTCAATGGCAGCTATAGATATATATTTG GTTGTTTTTTCATTTCTTTTGACCATGATACATATAATTTTACCAGCATA CTTTTTCCCTTCCAATCCATATTGCAGTAGCTTATCTTTTGGTATTCCTG AACTCTTAAGTAGCACTTTCACATTGGTGTGTTTTTCACCGGAAGAGGGC CAGAAGAATCGTTGACACATGGGAGAAACAGTTTAATAATGCAACGAAGG ATAAAAAAGTATCATTCCTGTATCTATCAAATGACATCTTGCAAAATAGC AAACGCAAGGGCGGAGAATTTGTGAATGAGTTCTGGAGGGTTCTTCCTGG ATCACTGAAAGGTGTCTACGATAATGGGGGAGAACATGGAAAGAAAGTGG TTGCAAGATTAGTAAGTTGTCCCTATCTCATCATTACTTGCTTCTTTTAG AATTATAGGTGTATTTTCAGTGGGCACAAGGATTAATCTGGTTATGAAAC CAAGAATAAAGGCGGAGGAATTACCATGCTATCCATATATGAGGCGAGCT GAGACATCATATCTATGAACAACAAAGAGAAACATCAATGAATTTGCATG CACGACTTGTATCTGAAATGAAATGGAACTTTTTATATACCTACCTTATA AAAAGAAACAAAGAGATTACATGTTTATTGGTTAAAATAATGGTCAGCAG TTGAGAAATACCTTTTTCCACAGTGATGCTAGGGTTTTGTCCCTCCCGAC AACTGGAGAGATCTCAATCTGTGGTGCTATCATGGTACTACAGCACCATA CAATTAAGGACCTATCACTGTGGAAAAGAGATTACATGTTTATTGGTTAA AATAATGGTCAGCAGTTGAGAAATACCTTTTTTCCACAGTGATGCTAGGG TTTTGTCCCTCCCGACAACTGGAGAGATCTCAATCTGTTGGTGCTATCAT GGTACTACAGCACCATACAATTAAGGACCTATCATTCTTAATTAATCTAG CAAACTATTGGATGCAAATTCTGTTGCTGTTTTAGGTTGTTCCGCTATCC AGCTCTTCCCCCAGTATATTATTCTCCAGATTGTTGCGCAAGGTGCATTT ACATGACACAATAAAAGTTTGACTAAAACTATTTCCAAAACGTCATCCTT TTAAAGGCTGGAGGGAAAGGAGTAAACACTATTGTATGGATCTTCTGAAA ATTTGGTTGATTCATATTCATGTTGTGCACTGTTAGGAACCACATTGCAT TATGACCATTGATACAGTCTAGGAATACGCATAGTTAATTTAACGAGTTG CTTAACTATTTGATCTCAAGGGAAAAAAAGTTCAATCTTGTTTCTGTAAA CTGTGCAGATAGGGATTTGGGACGAGCGCAAGGTTTTTGGAACCCGTATT GAGAGCCTAAAGTTGAAATCCTTGGTGAGAATCCTCCTACATTGGATAAC AACGACCATAGTTCAAATCCTAGCCCTAATCCCTCTTCAGATCTCAAAGC TGCTCGGAAGGATTCCGATACATTTATAAATGTATGTTCCAGTTCTTGTC TGTTGTTTTCTCTTTCTCTCTCTTACTGTTGTATTTGAGATGGATTCGTA AATCTGAATGAATTTGAGCGAGCTCTCCTTGTTGTTTGCCTTCCGCTGTA GGAACTGACTGTCAGCGGGATGCCTGAAAATATTGCGACTGCATATCAAT CTGTAGTTGATCAATATTTTGATGAAGATACAGCTTTAAACAATTGTAAG ACTACTGCTAACGTTTTGGAGAAGATGGACAAAGATGTTGATAATGCTTG TACCCATGGTAAGGATTTTGCTTGCTTCATTAATTCTGAAAATGTTGGAT ATCTGCCACTGCATTTGCAGAATGTTTGGCACTATTCTTCCTTTTTGGCC TGTTTTTGTTGTTATGGATATCTGCCACTGCATTTGAAGAATGTTTGGCA CTATTCTTCGTTTTTGGCCTGTTTTCTGTCATGTTGGTTGCATCCAGTTC CATGATGCAGTGTTAATGAAAAGAAAATGAAGAACCTGTCTGTTGATGAA TCACATGTTTCTTCTTGAACACTTTACCTTACTGATATATACTATCTTTT CTACAACATGTAAACTTTAAAGAGCTAAATACACCACTAGTCCAAAAAGT TGTCTAAGATGTGCAAATTAGTCCCACTACTTATAAAATGAGATCAAGTA GTCCCAAAAGTTGCAAAAGTGTGCAAAACTAGTCCCATATGCCTTTGCTG CTGACACATGGCGCTGAGTTTTTTCAAAAAACACCATTACATATTAGTGT TTTGCACATGCGGCCATATTATGGTCTTACAGTCTAGGCCCATCTGTCAG AGGGAGGAAAGATGTATCTAAAAATACAAAATCAGTGGGTTTTGAACCCT GCACCTCCAGGTTGGATACGCATATGTCTAACCACTATAATCAAATTACT TTGCAAATAACAAATAGTTCAAGCTTTGTTATGGCTGGTCTGCATGAACC AGTTGGCCCTTCACCCTTGGGCGCCTTATGACCGCCCATATGTGACATCC ATTGCATTATCATGCACCCGTCAAATATGTGTGAGCTAGTTCATGCATCA AAGTATCAAACCATGCCTGCATGTATCAAGCGTGTCCTCACTGTTCCGCT CATGGCAACGAGTAACGACGGACTGTGTGGACTAGGCTACTGTGTTTCTA TCTTTCTTCCCAATACACGATCATCCACTTACCGTCCATGCAGATCTGGC TCGCCACAGCGCAAACATGTTCTTGGTATCCTTGGCATTGGCGTGTCGTG CTCGTGTGTGTTCAATCTTTGGTGCGGCTCGTCCAGGCTGTGCTCGTCTA GGTGTAGCAGTTCATCATGCTTGACAGGTTCAACCTGTTGGTTATGGTCG GGCAAGTTATGTACTCCCTTCGTCCTAAAATAGATGTCTCAGATTTTTCT AAATTTGGATGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTCATCCAAAATT TAACAAATCTAAGACATCTATTATAGGACGGAGGGAGTATAACAAATTGT ATGTCATAATTTTAGCATCTCTCATGTATAGTATCAGTCTTGAACTTTTG AATGGTATATAAGCATCAGATTTGACATTACAATAGTTATCGCTCCTTAC GATTAGAGTATATCACTTCTTCTCCGTGTATGTTTTGATAATTTAAATTT CATCGACCACCAGCCATTGTGTAATTTGCCACAGTATCTTTACATCCAAG ATAACTTCAAAAAATAACGGTTTTACTTACTCCCTCTGGCCCATATTAAT TGAATTGGATTTGTCAAATTTTGGATGAACCTATATTTACTAAAGAGTGT CTAGATTCATTTAAATTTTGACAAATCCAAGTCAATTAATATGGGTCGGA GGGAGTATTTGATTTCTCAGGGGGTCATGTGTTTATTTTCTTTTGTTCGA AGTTTATACATGGACTTCGGACATGCTGTGTAGGTACCGGCGTCGTTGCT TTTGAAGGCACGGACTGGCTAATCGTTATGTTGTTTGTATACTGAAATGT ACAATTTCTTTTGGACTACAAAAAAATAAAAAAGGATTGTCATTTGTAGT GGCTAGACACGTGCGTGGGGAAGCTGGAGGTCGAGGGTTCAAAACCCAGC GGTTCTGTATTTTTAGATATCGCCTTTCCTCCTCTATGACAGGTGGGCTA AACCGTAAGAAAATAATATGGTCACATGTGCAGAACAAGAATATATAGGG GTGTTTTTTGCAGAAAACTCAACACCACGTGTCCGCAGCAGAGACATCTG GGACTAGTTTTGCACCGTTTTGTAACTTTTGGACTACTTGATCCCACTTT ATAAGTAGTGGGTCTAATTTGCACATCCTAGACAACTATTGGGACCAGTG GTGTATTTAGCTCAACTTTAAATCAAGCCAAACTACACTACCTGCTTTGT CTTTTGAAATGGAAAAAATTATGATCTGCTAGTTACAAAACTAATTCTGA TTCATAATTTACTAGCTATGATTTGGTAGGTACAAAACTAATTCAACTTA CAAATGGTTTCTGCGTTTACTAGCTATGATTTGGTAGGTACATGTTGTGG GATTTACTGCATAGCTGCTTCTGATTCATAATTTTGTACTCCCTCTGTCC AGAAATAACTGACTTAGGTTTGTCTAGATTCAAATGTATCTAGACATGTT TTAGTTTATAGATACATTCATATCTAGACAAACTCAAGTCAGTTATTTCT GGACGGAGGGAGTATGACTGTTGACAGAATCGATTGATACTGAAGGATTT GATTGTGCCTTTTACTTTTTTTTCTAGAAAAATTGTAATGATGGGACTGT ATCATGGTTTGGGCACAATGAATGGAAGAAAACATTTTCTGGCACGTATC ATGCATCTATATTTTTTGGTATATTACATCCTTCTGCTTAGCATATATTT TACATGAGATAATTCTTCCGTGTCAACTGTGAGTCTGTGACACAATTTTG GTTTGTACACTATATCAAATTAGATATATATATGTTCTTTTTCACGAGTT CTGGAGTTAATAGCATGGAGGTTTCCTATTTAAATGTTCCCTGGCTATGG AGGTCCCTGCTATAATCTGAAACCTGTAATTACACCATCTGGATTTGTCA AGTAAAATGATGGTTGTATAATGCTGACATTGCAAGACTTCTTTTCACAG GTACTCCACAAGAATCATCATTGATTACGGACCTCCAAGAACAGGAAGCA ATCCTCAAGAAGTGTATAGAGCAACTTGAAAGTGTTGACACGGCTAGGAT AAACCTGATTAATCAACTAAAAGTAGCCATCAATGAACAGGTCTTCAGCA CCTTTTTTCTATTATCTTCCAAATGTTTTACCTTGATGGTTATTATCTTG CTTACAGTCAGAAAACCCTTTATAGAAGAGTGGGTGCTTCTACTATGCCA ACCATTGAGTGCATGTTGCCATCTGTGTACATTCTCTCACCCATGTTACA ATAACTATATGGTAGGCGAATGTACACAAATCTCAAGGCGCATCAATGGC TGCGACAGTGGAAGAGCCCACTTGTACAAGCATATAGTCCTCTTGCTTTC AATTTACAGATTTTCATATTTTTTTGTTTATTATACATTATAACAGGAAG CAAAGTCGGAGCTTCTTCGTACTCAGTTGCAAGTAAGCTTTTTTTTTCTC TTTTGTCCTGTATTCCTCTTACATGTTATTGTTATATCCATTACTTTGTT GATCTTCCTGCAAAATCATGTAGAAGACCATTTCTTGGTGCTTTTGGCTG TAACCCAATTAAAAGAGTCTTGTCCGGTCAAATTCCCCGATTGTGTTGTC TATTCTCTTGGATTCATTAACTTCCTCGTTATGAATTATGATGCCTGATT GTCTTTTACCAGCTGTTCTGTATTTGATAATTAGATGTGGGCACCATTCT TGAAAATTAATGCTGCTGAGATGTCCTATGAGAGGCGTAACTATAGTTTT GCTTTGTTATTGACACCCCTTGGTGAAGTTTTGTCAACATGTTCAGGATG AATTATTTGATGAAAGAAAGAAAAGACCGTATGAACACGTTCAGACACAC ATCACATGCACATATTGCTTAAGCTCTCTAATAGGATAGGAAATAACTAC TGTACATGTGGTACAGTTCAGCTTTGTGATGAAAGATTGAAAGACAGTAG GCCAACCATGGTCTGCTTGGCTGATGGGCACTCAGGTTCAGCGACTAATT TAGCATCCCACTTTAAGCACAGTTCTGTACTTCTGTCCCTGAACTACTCC CATTACATGCCAAACCACTTCCCAAGTGCTCTCTGGTTCCAACTTAGGCC TAACTATGATGTATCCTTCTCTACATCTGTTTCAAGAGAATGCCATTGTA CAGCACCTTGTCCGCCTTCAGTATCACTATACAGGTTCTAGATCTTTATT TTGATCGAGGTGGCCTCTGTATTACCCTGTGTGATTGCATGTGCTGATAC AGTAACTTGCCTGTGGTTGATGGGCCCATGCATGTGTTTTTAGCTAGTGC AGATCCTTATGTAATCAGTTTATATCAGGAAGTTCAGGGGTGGAGGTCAG GGATAGGTTTGGTAGATATATAGGGCAATGGGCCACATAGGTCTCAGTCC AAATTTATGTTATTCACCGACTTAAGTTGGAAGTTTTCAAACACATATGT ACTCTTATGTAGTATATGTGTTTCTGTTGCTGTTTTTCTTTTCTTTGGAG GCACATTTGACTTTATTAAACAGTTGCTATCATAGATAAGATTGTACCGT CTTTCTGCTGCTGTAGTGACGTTTTAGCAGTTATTGGCAGAAATAGAGGG CAATGAATGGGCCGCATAGGTGTCAGTCCTAACCTATGTTATTCTTTGAG TTAAGTTGAAAGCTTTGGAACACATATTTACTTATGTAGTATCTGTTTAT ATTAGTTTGCTAGATTTTTTCTGCGTAGGCACATTTGATTTTATCTGACA TTGCTAGCTATCTTAGATAGGATTGTACTGTCTTTCTGTTTCTGTAGTGG CATTTAGCAGTTATTCGCAAAACTACTACTGATCTACAGCTAATCCTAAG TTATTTGTCAAATAGGTTGCTCGAGCTGAGGCTGAACATGCCATACAACT GAGACAACGACTTGATGGTGCTACTATCACAAATGGTGCAGGATCTAGTT CTAGTGCACCCATTATTACATTTCCCTTGGAGCAAACAACTGCTATGATG CAGAGTTCAACTGCAATACCAATATCCCCACAGTTTCAGACAGTGCAACC AGCAACCTCACTTCCCACCATGACCAATGCTACAAGCGATGAGGCTAAGA CAACAGCAGCAGCTATGGCAGAAAAGCTTGCATCTTTGTCATCTCGGGAG CAAGTGCTGTCCTCCATTTTCTCATCCCTTGCTGCTGAACAAGCTGCTTC ACTAAATGGTGGCTCGCCTTCTGGAGAACTCTCTGCAGGGCCTCCAGGCT TTGAGAGGCTAAAGAGGCCTAGACTTGAACAGCAGGCTGGGGATACGAGT GCTCCCCCTTTCTTTCCACAAGTAGCACAGGTGCAACAACAGATGGGAGC AGCACCTACTTCTCTTGGGAGCACACAGTCACCAGTACAGGCTAACCAAG CAGCAGGTTCATTTCCATTTCCTCCACCTCCATTGCAACCTATGGTGCCG CCACTTATGCAGCAATTTAGTCAAAATACTGGAGGTCCTGGAGGAATGTT CGGGATGATACCTTTTGGAATGATGGCAGGCTCTTTGCCACCCCCACTTC CAATGTTGCCGGCAGGTTTTGCAATGCCAAGTGGACCACCCCTTCCACCT CCTCTGCCACCAGTTCAGAACCAGCAACAGCAGCAGCAGTCTCCACAGGC ACCACAGCAATCTCCAACATCAACCGGATTCTTCCCAACGTCAGGCACTG GGTTCTTCCCTCCGGTGCAGGTGCAGCAATCTCCATCCGTCCAACGGCAG TGATGTTCAGTTACAAATGTCGGGGTATAAAGACAGCACCTTGTGCTATC TTTGTACATTAACAATAATCCCCGAGTATTATGCGGTTAGTTTACAGGTC CTGTAGGCGAAACAGGACCTGATGCCTACGGAAAATAGGCGTATGGCTTG TGTGATGTATAACTGTTCCTTTTGGTCTGGGGAATTTGTTTGATACTTCC TGGCCATATGAAGTAGTTAGACTTTTTCTTTTCTTTGGATAGTAGCTCAT TAATTAGCGGAGAGGAAAACAAACGGGTGGCAGTTACATTGTTGCTTAAT AGTTGTTTCCCAATATTATTACATTTTTAGGCTACTCAAATGTAGAACTT ACCAATAGATGGGATCTGAACTGTAACTATTTTTCATATACTCTGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.