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GrainGenes Sequence Report: AA000258

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Sequence
AA000258
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000258
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCGGTTCCGACCCGACCCGACCCTCTCGCCTCTCTCGTCACGCACTCCC
CAGCGAGTCCTGCCCCCCGCTCCGACTCGCTAGGGTTCCGCTCGCCGCCG
ACAGTTCTCCCCGTCGACGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCCCCGGCCCAAC
CACCACCTCCTCCCACCGCCCTACCCCGTGGCCCCACCCGTCTGCGCCGA
CGCCACCCAGAATTACACATACTACAGCCAAGCCGACGCCAACCTCTCTG
CCGCTGTTGGCCGCCGCCGCCGCCTCTCACGCGCGGCGCCGACGCCACCG
CCGGCCCCCGTCTACCTCATCGGGGCATCGCGTCCCTTCTGCCCTGACCC
CGTCCGCGGTCCCTGGGCATTGGTTTTCGAGGTATGTATGCACGAGCTCT
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GCGAATTTCGACTTCTGAGTCGTATGCGCGCCAATTTTTAATTTGATAGA
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ATGTGCAAGTATGGTAATCCCCTCAACTGTTTTCCAAGCAGCCCCCCAGG
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GCCCATGCAGGTAAACTAGAACATTTGGTTAATATTATTGCTTCTTTCTG
CAGTCTGATCTTTAGTAATCATATATGTTAGGTTTCTAATGCTGCTATTA
TGTGCTCAATTTTCAGTTTAGACCAGCTGGTCCGCCACAACAGCCTCCTC
AGTTCATGCAACAGGCGCCGCAACAGTTTCGACCTGTTCAGGCCATGCCA
GGAGTTAACATGGGCATGCCAGGGCAGATGCCACATTTTCCGCAACCTGG
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TTGATGTATATGTGGAATGCTTCTCCCTGTCAATAGTATATGTATATCTT
GCTGACAAGTTAATTGATGCTGCATTTCAGTATCAACCAACATCGGTTCC
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CCAGTAAGTACCGCTGGTCCTGTGCTACATTTCCACCCCTTTATTTTGTC
TACCATGTAAAATTTAAAACCTTTACCGCATCCTTCCATTTTGCATGCTA
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TGGAGGTTAGTTCTGTTGTATGCATATATACGGCATATATTTATTCTTTG
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TGTGCTATTTCAACATACCATTTTTCATTTTATCAAAATATTTACGATCA
TGATTATCATTTGATATTTAGATGGTATAACTCGAACTTATCTTGTTTAA
TTGATTATTTATCTTTGTCAGTAACATGTGCAGCTTTTGCATTGCGGGCC
TATTATTTTCTTTTTTCACATGACTGATATCTAAATTTAAAAAAATTGAG
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GCAGTAGCGCACTCTAACTTATTTGGTATGATATGTGCAACATGTTTTCT
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AGAATTTACAATTAATCCAAAATTGCATTCTTCATCCTTACCCCTCCAGA
GGGGCGAGGACAGTGCAGATGGTAACTGAAGAAACATGTTTGTCTTGTAG
GGACACTGCATTTCATTGTTTAATTCTTCTTTGGTCTATATTTAATAGAG
TTTACGATTTTCATTCTATGCTTTTTGTAATGGTATAGCGAGCTGATGCC
TCAACTGAATGGAAAGAATTTACTACAGCTGAAGGACGAAAGTAAGTTCA
TATTGGAAATACTTGCCACATCTTCTATTTATTTGTCAGGGTCATGGATT
TTCTTTCTTCTTTTGTCTCACTATATTCTGTTGTCCCAGGTACTATTACA
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TACAATTACTCTCTGCTTTCTATTCAGATTGCACGTGAATTAGCAGAAAA
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CTGTTGCATTTGCTTCTGTTAAAGTGGAGCCTTCCTCTTTACCTGTCAAC
CAGCCTTCATCTTTAGTAGGATCAATTGCTTCAAGCGCACAAGATGTGGT
AGCAAACTTGCCTCCTGTTGCTCCTCCTGTTGCTGGCCTGTCGTACAATG
GGGATATATCTTCTTCCTCTGGTTCCATGCAAAATGGTGCAGCAAGTGCT
GCTGTTGTTACCCCTGTTACACCGAGCACAGCAGTTTCATCAGTTGCTGG
TGATGCAGGGACAAGCAGGTATTTGCAGAGGTTTTCTCAATTTCCCCTAA
TTCTTGCTCACATTATTTAAATGGGGCTCAGATTGTGTTATATGTCTATC
TTTGAAGAAATACTTACGAAAGTTTGTCTCTAACAAGCAGTACCGACACA
AAAATTGGAACATCTGCTGAAGATTTGGAGGTATGTTTTGGTACCTTTTC
ACATGCTTTTTATTTGGCAGCAGTACATCATGTGTCTAGCCAGTGTTGAT
CTGCTTGCAATTATTTAGAATCATTTCCCCCCTCTATTTTGTGCAAAGCC
TGCATTGTTATACGTTTCTCACATTTGCTTTGTCTTACAGTCATAATACT
TGTAGCATTGTTTAGTTTGTATGTGAATGGTTCTTCTTTACAGCATCGTT
ACCTTGTCTGTTAATGGCTGTTAATTTTTTGTTTTTCTCTAATGTTCAGT
CAAGGGGGAATGCTTTGGGTTTTCTTATCCAGGTCCTACTTATGCAAACT
GACTACACTAGTATCCTATATTACTAATTACCAATTTGTTGAGCTATTTA
GGGAGTGCTACATTCAAGCATGTCTTCCCTGTGAAAAATTGTTACCAGGC
ATGGTTCTCTTATAATTACTGTGAAGCACTTGCCTTATTGATTGATTTAT
AGAGAGTTTCAGAAATCAAAGTTACTGTAATGGTGAGGATATGGTTTACA
CTGGGCATGTGGATAATATCTAGTGTTACTGGTTCCCCTTGCGCATGCTT
GGATCAGAACATTCTGATAGGAAGTTTGCAAGGATTCAAGGACTGCCGCG
GCACAAAATCTCATTTGGTGATTTCATTCATAGACGAGACTAAGAAGTTC
TGTTTTATTTCCTTGTTTTTTAAATCTACTGCTCAATGCATCATATAGTA
GTCTGAATTCTTCTTTTTTCTCATGGAAAAGTTTATTGGATAATCTGAGG
TTCCCACTTTAGTTGGGACTGGTATGTCAACATCGTGAGCAGTTTTCCAA
CAGAAACTGCTATTTTTATACATCTCGACATATTCACATGTTCTGTTTTG
GATTTTTTCATGAAATGAAATTTGAATAGGTAACTGTATGGATGTAACTG
TATTTCCTGCTTCCATTTTGCTATTCTGCCCTGTGAGAAGCATCTCTCTG
CCTCTGTCTCTGTCTCTGTACATTAATATTATTTTTTTCACTGGCATCTA
GGAGGCCAAAAGGATGATGCCAACTGCAGGGAAGATTAATGTTAGTCCAC
TGGAGGATAAAACAAGTGAAGAAGAGCCTGTTGTTTATGCTAATAAGTTG
GTGAGGGGACTAGGACAGAAGTAAATTAAGGATCAGCAATTGATTTATTT
TTGAGATCCTAATCTTTTTCAAACCGTAGGAAGCAAAGAATGCATTCAAG
TCCCTGCTTGAATCTGCGAATGTTGAGGCTGATTGGTCATGGGATCAGGT
TTGCAACTTAAACTTGAGTATTTAGCTATTACTAATCAAATGCCTGACAG
TGATATAATCTTCCCAGGCCATGAGAGTTATTATAAATGACAAAAGATAT
GGTGCGTTGAAATCTCTTGGAGAGAGAAAGCAGGCTTTCAATGAGGTTAC
TATTTCTTTCTTATAAGAGATAACATTGTTGTGGAATCCTCCAGTGTAGT
ATCGTCATTTCAATAGTGGTAAATTGTTAACTTAGGTTTACATCTTCTGT
TTTGCAGTACTTAAACCAGCGTAAAAAGATTGAAGCTGAGGAGAGGCGTG
TCAAGCAGAGGAAAGCACGTGATGATTTTATCACAATGCTGGAAGTAAGA
TGCTCTAGAAAGCTTTCACTTTCCTTATTTTTTTTACAGTATTAACCACT
TCCCATGTATTTCAGGAATCTAAGGACCTTACATCCTCGACAAGATGGAG
GTATATTCTCCAACTCCTTGTATATGGCAACTATAACGGAAAGCTCTATG
CTTTTCATAATTTCTTGTAATAATCATATTTTCTGTTTTAGTATGTTCTG
TTGCATACACTTAGCATGATGTTTTTCACCATGCAGCAAAGCAACAACTA
TGTTTGAGGATGATGAAAGGTTCAAAGCTGTTGATCGCCCGCGGGAGCGT
GAAGATTTATTTGAGAACTATCTTGTGGAGCTACAAAAGAAGGTTATATG
AGATGAAACACTAATTTATAATTGTGGTGGTTGTCATACTATTAAAATGG
AGATTGTTATATATGAGATGCTGTTCACCTGTTGTGACTCTTGAGAGTGA
AGGCTACTGTTCAAAAGCCAGCGCTGATCTTTCATGATTGTCTGTCCTAG
GGATAGCCCTGCTTATGAACTGCTTGCTTTTGCAATTTAATTTTACTTTA
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TGTTATATGTAGCCAGCTTAATGTTTTGTTCATTTCAAATAAGTAATCTG
GAGCATTGCTTCATGGTTTTGGAAAATTGCTTTATGCAAAAAAGGTTCCT
GGATAAACCAACACACGCCTGATGCAGGATTTGCTGTGTCCCATGACTGC
TTGGTTTATTCGGTGCTGGCCGCTCTCACACGTCATTCCGTGATTTTTGT
GGCATGACCATAATACTGTATATTTTATTTTGTGTAGACATAGTAGCATG
GTGAATGACAACTGATTCCCTTAAACCAAACAAGAGTGGATTAAAGTTCC
TCTGATGAATAATTACCCAAACCATACAAATCACTTCTCCAGAATAACAG
ATTTCTGAGGCTTGAATTTCCACATGTACCTGACTATATGTTAGCTTATG
ACACGAAGTTGTTGCATTCTCTGTGGACCTAACAAGTACTCCCTCAGCAA
GCTGTTTTAGCTTGCTATAAAACGTCTTATATTTTGCAACCGAGGGAGTA
CCTGGGAGTATTTTTTGATGGAAAACTAATTTCATATGTTGTAGCTTAAA
ATATATCACATAGTGATCTTGATCTAATACATACTGTGTTGCTTTGTAGG
AAAAAACAAAGGCTGCTGAAGAGCACAAAAGACACGTAGCGGAATATAGA
GCTTTTCTTGAATCATGTGATTTCATCAAGGTTATTTCTTAGACCTTATC
ATCTAGCGAATTAGTATGCTCACAGTGCAATAATTGTGATTTCACTGTGT
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CAAAACACTTGTGTCCATTTCAGGAGTATATACGGGATCTGGAGAAAGAA
GAGGAAGAGCAGAGGCGAATACAGAAGGTATTTCATTATCTTACTTTATG
ACTAGTATTTAATTCTTTACTGCTATAGATGTGTAAGTTACATTACTCTT
TAAATGCAGGAGCAAACAAGGAGACAAGAGCGGAAAAACCGTGATGAGTT
CCGCAAGATGTTGGAAGACCATGTTGCTGATGGCACACTTAATGCAAGAA
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AATAAGTTCGAGGAAAGTCCTTCGTTCCTCAACTCTAAAATCGTGCAGAA
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GGTGTCTGCATTGATACCAGATTGATATGTTTGCATATCAGATTAGCATT
AGAGTCATGTTAGGATCCCCCTTCTGTTTACGTTGAGTTGGAATTTCATA
AGGAGCTACAGGCTGCACATGGATCTCAAGTTATCAATAAAGATTAGTCG
TGTCCTTAACTTTCTCTTCTCCTTTGCTGCTGCCTATTGTGCTCGCTACG
ACACCCACCTGTCGGGTTTTCTTGGGCCCTCAAATTCTTGATGCGCCACA
GCTACACCCTACGCTCTGGTAGCTCTAAGAGGCCCTCAAATTCTTGCTGC
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AATAGCTGCAAGATGAGAAGTACACTTTTTATACTAGTGTACCCTGATTC
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AGCTTCAAATTTGTCTGGTTCCAAGCCAAAAGATCTCTTTGATGATGTCA
TTGAGGAGCTTGATAAGCAGGTTAATTTCTGAAAAATCTGAGTATATTCT
TGTAATCATTTATCAATGTATATATGTCCTACTATAGTTTATCAGTTGTG
GTACTTGGATAAGTAGTCCATGTATTGTGTTGGATTATTGGTGATTGACA
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TATGACAGTAAAGATAATGAATTAATGATAATTGGAACATAGCTTGGAAC
TTGCATCATTGTTGGGTGGACTCAGTATGTTGAGAAAAAAATGCTAATAC
TAGATTCTACAATAGCTGTACTTAAGCTGTCATCTCTGGCATGCTTTAAT
TCTTAATTCTTTGAATAGAAACTTACTCTTTTGCCTCTCAAATGAGTACA
GTTTTTTAACAGCCTTTTAATTTTTTATGGTGACACTCTGCATTTTAGAT
GTTCTTTGATGATTTAATCTGGAATGGTACAACTTTGTCTTGCTGCCATT
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TTGATAATCATTGAACTTTCTTGTATATTTTGTTCTTTTGCACGGGTATC
CTTCACTCTCAGCAGTTGCAAGCTTAGCATTATATATGTCCGATCGGATG
TTGGTTCATATTATTCATTTATTCCAATTCGAGTTGAATATTCTCTGTAA
AATCCTACTTGTTGATTCATTTAATGTTCATGGTTTGAATAAAATCTGCT
GGGAAAAAGTATTAGTTCTGTTCATGTTCAATCCAAAGCCTACTCAGATA
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AACTGCATTTTATGGTAATAGTTTTTATGAGCAACTTGGCGCATATGGTT
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TGAGTTGTAGCCATGACTGGTAATGTTGCTTCTCTTTTATGGATGTGCTA
CAGCTTATCTATGAGGACCAAATTGAAAGGCTCAAGGAAAAGGAACTAAA
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ACAGCCTAAGTGCCTTTTTCATATCGAGTTTAACCTTAAGTGCATCTTTG
CTCTGTTCCACGAAGCACTAGCACTGGATCAGCATTTTTTGATAAGGAGT
AAGATCATACAAACACATTGGTTCCAAACTTGGTTTGGCCGTTTTATCTG
AATGTATTCAGTCGTCCTGTGCGTGTGATAGTTAACTGGCATACCTCTTC
TATTTTGAGGCTTGGGCTGATGGGCTAGTGGATCAACCCTGTCCCCAGTT
GCACCCCTATTGATAATCCACTGGCATGGTGGCTCATAGATTTCCTTAGA
TGCACAAATAGTATATGAGTTGCAACCACAAGTGCTTTTGTTCCTCTAGT
TAGCCACTAGCAGCAGAGAACTGTTTTCATAGATGAATTTGCACCAGCTA
TTCAAAAGGACATAAATTTGGGCCCTAAATGTTAGATGATGGTTCAGGTT
CTTACTGTAGCCGGATCCTGTAGGTCCCAAAACTTGCTTGATATTCAATT
TTTTAACCTTTACTTTTCTGTTATAACTATAATGTTGGCTTTGGACTCCA
GCTGCCATGAACATATTGAATCATTGTCAATGTCAGTTCAATTCAGTTTC
TGACATTTATAGCAAAAATGGTCAGAATGTTTTGAGGAAACCTGCTGGTT
TCCAATGGAAACCGGAAACTTGTGTGTGGCCACATTCGTCAATCTATGTT
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TAACAGGAAGCCATACCACGTTGTTGCACAAATACTTTCACCAATCCTCT
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TAGCAAAAAAGAAGCTGAGTTGGATCTGAATTTTTTTGTGTGAAGGTCCT
GCGATTGAGATTTGTAATGAATCTGTGTATTGCTAGTTACAAGATAGCCA
CTTTTCAAGAACTTCTGTATACATTAAGTGATTAAGCTTTATAAGCCATG
ATAGTTGATATCAAGCCTTATTAATGTCTGTTTGAAATTATCAATACCCT
ATGTGTAAATAAATTCAAAGTGTCCTGATGACCTTATGTAAAATTGGCGC
GTTGAAACAATTCTGGTAAAAAAAAGGGTTGTTCAAGTACCTATAAACAA
ACATAAGTAAAATGCTGGTTTCAGTGTTGTATGTTTACAGAAGTCCCTCT
CTGAAACTGGAGTTGGGCGTTATCTGTTTTATAGTATTTGCTAATTTTTT
CCTCTTGGGACATTGAATGATTCTGTTTGCTGTATATCTCACAGGGATTT
GGACGGTGAGACATATGCTAGAGAGCTTTTTGAAGAGTATATCGTCCGCC
TCAAAGAAAGGTTTAAAGAGAAAGAACGCATGAGGGAGGAAGAAAAGGTA
ATGCTACTGTTTTTTGCTGAATCATTTACCATTAGTCCTATCAACTGTTT
GGTTCTTGTTATGCTATTTTTGTTTCACAGGGAGCTATGGAAAATGAATT
TTGTCTACTATAGTTTTCTGAACTTTTTTTTTTGTAAAATGATTTTAATC
CTCAAGGTTGGGTGGTTTTCCACACTCATCACTCCCACTTGTTTTGTGGG
TGGTGCGAAGTGCACATGCAACATAGTGTCATAGTCACACTCGTTACTAA
CTGTAATGTGCACGTTTATGCTCATTGCCCACATGTGTATACCCATGAAT
GCAACATAACGTTTGTATTGTTCACCTACATATGCCTTCATGTACATGTT
TTTCTATGCAGGCAAAAAAAGAGAAAGACCGTGAAGAGAGAGAAAAGAAG
AAAGATAAAGAAAAAGAAAGGAAGGATAAAGATCGCAAAGAAAAAGAAAG
AGACCGAGAGAAGGAAAGAGAAAAGGAAAAAGGAAAGGATAAGGATCGGT
CAAAGAGAGATGAAATGGAGATTGATGGTGATGATGCGGAGATTCATGGC
TCAAAAGATAAGAAACGGGAAAAGGATAAAGAAAAGAAGCATAAAAGACG
CCACCATGACACCGCAGATGATGTAAGCTCTGAAAGGGATGAGAAGGATG
ACTCGAAGAAGTCTCGAAGGCATAGCAGTGATCGCAAGAAATCTAGGAAG
GTATAACATTTGTTATCCTCTTGTGCAATCAAGGTACTTAGAATATGGTT
GGCACATTGCCTCCAACACCTACTCCATTCAAGACTTGGCGCAAATTAAG
TGCTCCCCAATTTGAAATATGTGATAGTGAACTTTGAATATTCCACCCTT
TGTATCGTGATGTTTAAATATTGACAGTTTGGTGAGGGATGTGTGTATGT
ATTGTTACACATTTATACACATCAGTTTTAAATTGGTAAAATGGTGCACT
TGTGATATTTCCAGTATATGATATTTGTGTTGTGTGATAGTGAATTTAGG
ATATTCTTGCCTTTGTATTGTGTGGTGTTTACATATTTTGACAGTTTGCT
GAGTCATTTGTGTAATACACAGTAGTTTCATATTGTTAAAAGGTGCACTT
GTGATATTGCCAGTATATGAATGAGATCTGTATTATGTAAAATATCGAGA
ACTAGCATGGTTTTTGATTGGTGCATGACACAAATGATTCATATCACATG
GATATATGATATTGAGATTGTTTTGTCTGTCATTGATGCAGCATACCCAT
GCTTCAGACTCGGATGGTGAGAACCGGCATAGAAGACATAAAAGGGATCG
AGATAGTTCCCGCAAAAGTGGTGTAAACGAGGAGCTTGAAGATGGCGAGC
TTGGAGAAGATGGGGAGATTCATTAGGCAGAGTTTCCTTTTTACCTCTAA
AGATCGTCAGTACTTGCTGTCTCTTGTCTTGTCAATTGCTGCTATTTTGC
CTAGCATCAACAAACTTTGCTTCAGTACTTACCTGTGTTATAATTATTGA
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GTAGTCCTGGGGTTTTGTACCCTTCTTTGTTGGCTTGTATGCAGAGTCGT
AGTGTAAAAGGTATGTTCAGTCGGACTAGCATATCTCTGGCGCATGTTCC
TAACTTGTTCCTAGCCTTGTGCTTGATCTCTGAGCAAGTTTGTTACTGAC
AGTTTTTGGTGGCAACATATAAAGCCACTTGGCATGGATGGATATAGCAG
CACTAACACAGACAGAGGCTCCTGCCGCTGCAGCAGTTCATCATCTCAGC
TCCCAGATGAGGTATATGGTTCCTATTACAAACAGTTGTCTGACAGTTTT
GGGATTCAGTTGGCAGATTGTAATATTATCCATTGATATGTACTCCTTTT
CAGAGACTCGTTCATACTTTAGAATGGTTGGTTTTACTGGGAGGGTAGTT
GCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.