Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA020851

[Submit comment/correction]

Sequence
AA020851
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020851
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGAGGGCGATGGTGGAATGCTTGGGAAGGCAACCATGGGAACAAGCC
GATGGGCGAGAGGGTGCTCAGGATGGTAGCGATAGCGATGGTGGATGAGG
TGAATATGAATTAGGAGTGTCAAAGAGCCACTCTTGCCTTGTATGGTGAA
AACCTAAGGTCTATGATCGAGCTGAGTCGTGCTTGTGCGTTGTTTCCTAC
TTGGACGTGTCGCTTTTGGAGAATTTGGAGTTCGTGTTCTATCTCGGTGA
TGGTTTGCGTTGCCGCTACTATGTTTTTATCACCGTAGCAGGATCTTTTG
TTCATCCTTTTATATTTTTGTTCTAGGGCTGTGTGCATCCATAATATCGT
TAGGACATGCCGTTGCTGCAGAGGCCGGATGTAATTGGTATCTACGCGAT
ATTAGTATATTCCTTTGTTAAAAAAAACCTAACTATACATAGCCTCTGCA
AAATTAATTGACCTTTCACAAAATCTCAAATGTAGTTCTCTAAATGTAAA
TTTAATTTTTACGGTACTCCCATCATATATAACTCAATAAGTCTCAGAGT
ACTGCAGAAATAACAAATCTGTTATTGATGAATCACACCAGTTTTTTGTG
TTTTCAGACAGGTCGATCATGTTTGCACATACAACAAATTTTAAGATCAA
TTTTCAAGAAATATAATTTGAAATTTAAATACAAACTTGAACTCTAATGT
CTTTTGGGTTAGTCAGGAACTCTCGGGCAATTCATTAATGTTCTGTGATG
TGCTACAGTGTCATCCTGATTATTATTTTTAAGGATATTCTGATAAATTA
TACTAAAGTAATTTACACTAAAGAAAACCAGATCTGGGTGCTTATTGGCT
AAACACATGAGCGGTAAAATGAGGCCTTTTTCTTATGGACTTGGATCTGA
GTCAAGTCGCCCTACTTCGTTTACCAGTCTGAAGATAGTACTATATTTTT
TCGGGCTGCCCGCTCACTTGGCTCACCTTCCTCTTTTTAAGGGCTGCTGG
ATGGGATCCTTCTCGCGAAGGAGCACCGCCCCCTCTTCATTTCCTATAGT
TCCTTCTGCGCAGAGCTTCTCTCTCCAGGTAAGTTCAAAGCACCATCTTG
ATTCTTAGTTTCTTCTACGTTTATTCTTGAAGGGTTATTTTTTATATAAA
AAGAGTTTTCTCGAATCTGATGATAGTATGGGCACCATACCGCACATACA
AGTGTATATACTTTTGTAGAAGTTGGGGAAGTTTGCCTGCATGGTTCTGT
TTTAACCTGTTCCTAGTTCACATCTGGCTAGAATGAAGTTAATAGCACTG
CATGGTTCTGTTCTTTAAGATGAGTTTAATCTTACGTTCTGCGATGGACT
GCGCAAGTCACATAACATGCGTGTATCTTATGTCAAGACTAAATTCTACT
CTCGGCTCTTGCCTTAAGCTAGACCCCATAGCCAGAAGCCATGCCTTGTA
TTAAATTTTCAGCATGAGAAGTGGGAGATAAAGGAGGCGTTTTTGCCTTC
TGGTCGTTCTAAATTTCTGAAGAAACAAGCATGGCTATGACAATAATAGC
TTTACCACGGCCACACACCTCCATCGAGAAACAAGTGATTCCTCGCCCAA
TGCAAACTGTAGATGTTTAGGTAAACCAAACAAGCCAAGATTTGACTCTG
GCTTCTGCTTGCTTAATGATAATTTTTAGTGCTAGACGTACTTAATTTCA
GGCTACGAGGTAGCACTATTCTTTGTAAAATATTATATAATATCATATCT
TGTATTGTGGGAAGGCAGTCGTTGAAGAAGGACAAAGACGTCCAAAAGCT
AGTCCCATTTGGAGAAAATGTCATCGACGGAGGCATCCAGCATCCCATTT
CAGACGATAAAAACAATAACTGATGATTTTTCCGACACTAAAAAGATCGG
TAGTGGTGGCTATGGAGAAGTCTACAGGGTATGGTTAACCAAAGTTTTTT
CTCGGAACTAACTAATCGTCTTTTTTGTTTCAGTAATTATGGATCTTCCT
TGTAACCTTCCCTCAATCTATATGAACAGGGATTGCTTAATGGGGATGAA
GTAGCCGTGAAGAAGCTTTTTCCAGTTAACGACATTGTCGATGTCGACTT
TAATAATGAATTTAGTAACCTTATGAAGGTTCAGCATAAGAATATCGTAC
GGTTGCTTCATTACTGCTATGAGAAAGTACATAAGCATACAGAGCAGAAT
GGGCAATTTTTCTTTTCAGAAGTAACAGACCGAGCTTTGTGCTTTGAATA
TATGAAGCTTGGAAGCCTTTCCAAACATATTTCCGGTGAGTTCTTTTAAG
ATGCTCTAACTTGCCTCTTGAGTGGAAAGAGGAGTAATGATGTCCTACAC
ATTAGTTAGATAAAATAATATTGACTGCTTGTTAGTGAAATGATTCCACC
ATGTTGGGCATAAGTAAATAGTAAACATGCTACCCCCCTTTTGCAGATGA
GTCATGCGACTACGATTGGCCTACAACATACAAAATTATTAAAGGAACTT
GCGAGGGCCTTCACCATCTTCATAAAGGTCGAGGAGAGAAGAATTACATT
TATCATTTAGATTTAAAACCTGATAATATATTGTTGGATGAAAATTTGGT
GCCCAAAATTGGAGACTTTGGTTTGTCGAGGCTCTTTGGTGATTCAAAGA
CCCACGAAACAAGCAAAACAAAAGGAACAATGTAAGTTTACACACGATTC
ATGTGGATACAGCGAATCTTGGTTTTATAGATCGTTAGTAAGCATGGGGT
GTAGCTGAATATTGCACTAAAATTGTCCTGCATTCGGTGCTTATGATTTT
GTGCAGTGGGTTCATGCCACCAGAATACATAAATAATGCCAAGGTGACAC
CCAAGAATGATGTGTTTAGTCTCGGAGTTATAATTTTTTACATATTGGCG
GGGAAGAAGGGCTACGATGATTATAGTGACGCGCTTCGTCGTCAGAATTA
TTCACCAAATATTCGTCAAGGCTTTATCGAGAGTGTAAGAAAGTTCAGCC
CTCTTATTTTGCAGATTGTTATGGTTTACTTTTTTTTTTATTCACGACAT
GCACATAAAAAATGCTTGTATATATATTGTAATTTGACAGGTAAAAGATT
ACTGGAAGAAAAAGATGGAGGCAATTGTTGGTTATAGATGGGACAAAACA
GACATCCTGGGAATAACAAAATGTGCCGAAATTGCAATAAGTTGTGTGCA
TGCCGAGCGAGACAGTAGGCCTTCAACGATGGCGATTGTCGGCGATCTGA
ACAAACTGGATGCTCAGATCGAGGAAATACTAAAAAATGATCCGAAGCCA
CTTATAGGTGTGGTACAGTATGAAAAGCTTACACTCCTGGTAATACAACC
CTCCATACTCATTGTGATTAATCATATGTATCAAGTCAATTAATTAATGG
CATGTAATTTTGCTTCTGTAGGAAAGCAGTCCCATTGTTGTGGAAGCGAT
CAAAGAGAAAATGAGTGTCGCTGATTCAGGAAAAGATATTGTGGTGGATC
CGTCATTGGAGCTCCGGTTCCCTTTCGAGCCGAAGAGGGACATGCCATGC
TGCCTGCAGCTTACCAACAAGGCAGCCAGCTTCATTGCCTTTAATATAAA
CCTGCGCCAAGACAAGTACCTAGCGCAGCCAAACAAAGGAATTCTGCCAC
CATGTTCCAAGTGCTACATCACCCTAACTTTGAAAGCTCAGGAGGAGGCG
CCCCCTGGTATGAAGTGCCTTGATATGGCCATTGTGCAGGCCACAAGAGT
GGCCCAGGGCTTCATGTCCGATAAAATCACTGAAGATTTCCTCAAGAAAG
CCAGCGCCGTGGATGAGGTGACACTGCCGATTGTTTATGTTCCTCTGCAG
TAGTCTCTACAGGAATTGTCACAAGGGAGCAAACTTCATGTTATGTGGGT
GCTTTCTATCGGAGAAATGCTTCAGGAAAGACCATCAGATCAATCGGGTC
CACCGTCGTCTCTGTTCTATGCCGGCACAATTTAAACTATTTCTCCAGTA
TTTGTTTTTTCTACATCAGTTGTGTGAACTGCTCCACCATTTATATGATC
ATATGATCATATAAGCATTGTAATGTCACTGTCGTTCATCTCCAATTTAC
TTGACCTGTAATAAAATTATTTTTCTTATTACTGTAATATTCCCAGAGAG
TGGGTTTGGTTCACATCAGAAGGATTAAAACAACAGCTTGATCTTGCTGA
AACGGGATTGGACCTCACTCAGAGTTTTCCTCCGGTGTTCAAGGAGTTGT
TTCTTCACCCGAGTGTGGACGGGTGCAGCTTCTCATGGGTTCCACAGTGC
ACTCGGCACGCAGTGGAGCGGACAGAGCGAGAGTCTGACAACGGGTAGAT
CAGTGCGCGGCGATTCTACGCCACTCCAATGGGAGGGCACTACAGAAAAT
CAGTAATTTGCAGCCTATGGCAAAGGCTAAAAAACTCACGGCAAAGTGTT
TGTCGTAGACAAACTCATAGAAATCGTTACGGCAAATTTGGAGTTGGCAA
ACCAGCGATTTGCCGAGTGCTTATTTGCGGGCACATGGCAAACGCGGGAC
GGAGTGAAGAATATATGGAGAGAGGATGATCAGGAGCTAGGTGAAGAGAA
TAAGATTGAAGAGAAGAGCCAGAGCACCAAAGTGGCGTTGGAGTCAGAGT
ACTAATGTGAGCATTAGTCCCGGTTTGAACGGTTAGGACGTCTCAAGGGG
TAGGGCAAGCATTAGTCCTAGTTCGAATAGGACTTTTATTCCCGGTTGGA
GACATCAACCAAGACTAAAGGGCCATGTTCCTACATATAATAAACCCCCT
AGCCCGACATGCTTGTGTGTGAGCTGGTTTGTTTTTTCCTTCTTATGCAC
AAGTGGTGTATTCTACTTTGTTTTTCCCCTCTATGCACAAGAGGCGCTCG
ATGAAATGCGTGAGAGCATGATGTCACTGGAGAGTTCACACAAAACAAAC
ATGATATGTGCGAGAGCCACACTTAAGCTTTCTCCTCGATCGAGGTTAGC
AACTTTATCATTTCATCTGTCATTGATATGAACTTCTCAGAAAAATATGA
AAAATTTACAGAAAATCAAAATAACTAAAATGAGTGTACTGTTCTAATTT
GAGCCATTTCTGGGAAGATTTGCATCGATAAACTGACATTTTCTGTTTTT
TCTAAAAAATTGTCAAATTTTGGCAAAAATTTGAACTTCTCAGAAAAATC
TGAAAATTTTACAGAATGTCAAGAACACTAATATGAGTCTACTGATTTTC
AGATTTTTCTAAGAAGTTCAATTTTTTGCCAAAATTTGAAAAATTCAAAT
TTTTTGGTGCCCCAAACACCCAAAAGGGCCACCGAAATCTGAATACAGGG
TTATTATGGTCAATACTAAAGTATACACTAAAATACGCTCATTTATTGAA
CTGTTTTCCACTTGTATTGAAGAAAATGGCATATGAGGAGGTATTGAAAA
GTTAGAGTGGCATATTCACAAGTTGTGTTTTTGTAATGGCATATGTGCAA
CCTTTAAATTGGGAGTGGCATAAAACCAATTAGCCCTATTTTTATTTATT
TTAGTAGACGATTTGTTTAGCATGGATGATTCACTTGGACTATCATTATA
GAATACTCTGTTCTTTCCCATGAGTAAGGAGCCTGAGCAATTCAAGCTAA
ACTTTGACCATAGGAATTGAACAACAATATCTCAATTATATAGTACTCCT
ATATGTGTATATAATTGTTATTATTAGATTTGTATTGAAAAACAATTTCT
AATGTTACCAATTCTACGTCAAATATTCCTAATATATATACATGAGTTAG
TTCTCGACAAAGTTAAATTTTGTGAAGTGTGCGATGAATTATTTATTAAA
TGTGTAATTGATAAAATATGGTTGTGTGTGCGTCAATAGATGCAGATGCC
GGTAATCTTTTTCTTAAAAAATCGTAAAACACAAGTCATGTATAAAGAAA
CTTTAAATTAAATTTAGGATACTGCTAGGCGTCCCCCGGACGATGGGAGT
TCCCATCGTCCTCCTTTCCTGCGCGACACGTGTCCACAAAATTGCCCCAA
ATCCCGCTTTTGATGCAAAACATCCCGCGTTTGCTGCATATGTCCCTGCT
TTTGCTTCCGAAGCAAAAAAAAAAAGGGTTCGTTTTAAAAATAGAACGTC
CCTCGGAGACCATGCAGCAAAATTATTGTGCTAATGCAGCAAAACTGACT
TTGCCGGAAACATCGTCGGAAAAAACTTGCCGGTGACTCTCGCCGGAGAT
CTTGTAGCAAAAAGTTGACACTGTTGTAGCAAAAACATGAGACGGTTGTA
GCAACAAAGTTCTTCTAATGTAGCAAAAAACCTACTTCGCCGGAGACATC
ACCGGAGAATTTAGCGGAAGACCTCGTCGTAGAACTTGTAACAAAAAATT
TATGGTATTGTAGAAAAACAAAAAAACAAAGATAGCAAAAAATATATATC
AATGTAGCAAAATCAGAGGCTAGGTTTTGTAGGCGGCCTTAAGGGCTTGC
AAGAGCGGCGGCCATGGCATCCAAGCTTGCAGCAGATGTGGCCGTCTCCT
GTAGCAGTGTCGCCCTGCCTCTGTAGCAAAGGAAGGCATCCGTTTGTAGC
AGCATCAGTGACGACGAGGGCTTGCAGCAGCGAGGATGCCATGTCGGAAT
CTTGTGGCAAGGGGCCCGCGACGGCGGACCTCTACCTTGCCATGGCACCG
CCTCGCCCCACCCTCGGGGCTAGCAGCTCTGCTCGGAAGCGTGCGGCGGC
GTTGGATCCCCATGGCAGTACGGCGGTGGCGAAGTCCAGCCCGACGGCGC
TGTTTTGACGGAGGAACAAGACAGGCGGATTTCCGACGGAGGAGCAGTGG
GGTGCGATGATGGTGAAGCCTAGATGTGCGGTGTGTGCTGGGAGGAGTAG
TGCCGCTCGCCGGCGGGAGAAATCTGAGATCGCAGTGGAGAGGACGGGGT
GAGAACGAGTGGTTAGAATTAATTAGAGATATGGTAGACGGGCCCACTTT
AACCTGGCAACGAAGAGACAACCAGACGCGCGCGTGAGTCAACCCGGACG
ATCGAAACGCCCCATCGTCCGGGGGAACAGGATCATTTTCCTTAAATTTA
TCAGCTCAAGCATCCATGCTCCATCTCCGGCGGAAAAATAATGTAAAATT
GTCCTTCTGGACATCGATGTACACCGCACCAGTTGTCCATCGATTAAAGC
GGCCATGTGATCACATGGATGGCATATTCCCAAAGGGTATCTTAGGTTAG
AGTCAACTTCACCCGGGTCCATATCTTAAACAAACTTCACACCAACCGAT
ATCTCTCGTTGTTGGGTTGCTTTATGTGTGTACATCTGCAGCAAGGAAAT
CACTCATCTCAGTGCTTCAGACCCTTTCGTTGTTGTTCTCTTCCGGGTGT
TCATCTCAAGGTTAGTGCTTTCAAGAACTTGGTTATTTCCAATTGTTCAT
ACAACAAGGTCGTAGTATTATGTTTCGACACACATAGTCTATGTTGTTCA
TTTTTACCGTCTTACTTTGTTAAACCGAAAGTTTTTAAGATTCCAGATCT
TGTAGCTACTCACAAGCGTAACTTCTTAAATCATCAGAAATGGCCACCAA
AGAGAGCGTTCTAAGCAAACTACCACAAGAGCTAAACTTGACCTATCTGA
AAGAGATTACACAAGATTTTTCCGACGAGCAAAAAATCGGTACAGGTTCA
TTTGGAACAGTTTACAAGGTATGATTGCGCTGTAGCTAGCTTTTTTCTGT
CTTCTCGGAAGTTCATGTGCTAATATATCTAGCATCTATATATGAGGTTA
AACAGGGTACTCTGGAAGATGGCGATCTCATTGCTGTGAAGAAACTTCAG
GCAAATTCGCCACTGGGACGCGACAAAGATTTCAAAACTAAGGTTCGAGA
TGTCATGGCGCTGAAACATGAGAATATAGTGAAGATGATTGGGTACTGCC
GTGAAGAACAAACCAAATCGGTGGAGAGGAGTGGAAGATATGTTCATGAA
GAAACTGTCGAAACTTTACTCTGCTACGAATATTCACCTAAAGGAAGCCT
CGCCAACTATATTTATGGTAAGTAGTTCACATAATCCTTTGTACTACTAC
TATTTTGCGTTTCTCTTTGAGTTTCTCTTAAACTTTACCTTGCCAGTTTT
GACATCATCTATTGTATCATTTTTGAATATCTACACTAATCTGCCATGAC
CAGTATAATATATTATCAACATTACAAATACAGTTTGTTCTTTCCGTGAA
ACCTATGAACAACATTTGTACTGTTTTTATTCTGCATTTGATGTCATATA
ACTTCCTGAATATTATTTGCTTCTCCAGATGGACATGATATCATTGATTG
GGACATACGCTTCAAAATAATCAAAGCGATATGCCAGGGTTTACTTTTCC
TACACACGTTGAGGGTACCCATTATCCATATGGATCTTAAGCCTGCAAAT
TTATTGATGGATGAAAGAATGGTGCCGAAAATTTCTGACTTTGGACTCGC
GAGACTTTTTGGTGAAAAAGCAACCCACATCATGACACAAAATGTTATGG
GTTCATAGTAAGCCCATCACAACCTATGCTATTATTTCACTCCTTACTGT
GAAGTAAGTTGTGTCAGCACCTGTACATGTTAAGTAATCTCTCTTATTTC
GAATGATTTCAGTGGATACATTGCACCAGAATATCGATACAGTGGACAAG
TCTCACTCCAAGCAGATATATATAGTCTGGGCATACTAATCATGGAGATC
ACCACCGGAGAAAAAAATCTTTCCAATGACAAGGACTTGCCTGGAATGCA
ATATATTGAGAATGTATGAGAATGAGAAAATATTTGGATATTGAAATTTA
CAAGATTGTGTTATTTTCAGTTCTTATATGATAACCAGTGACCATTATTT
TAATTTTGTATGTATAGGTGAGACAAATTTGGACTGAAGAGCACATAGTG
TCCAAGTACCCAAAGTTAGATGGAACCCGTTTCCATGAAGTAAAGGCCTG
CATCAAGATTGGTGTAGAATGTGTTAAGCTTGAGAGGAAGGAGAGACCAT
CCATAAATGAAATTGTCGAATGGCTCAATGGTACGAGGTAGGAATCAAAT
GGGAACCTCTTTGATCTCCCTACCAAGATGATTTAGTTTTATGAAAATGT
AGGAAACGAACTTATAGCTTCTCTCTGGGCAAACAGGTCTGGCTGGTTGT
TGTTTCCCTGTCCCAACATGTCATAATAAAGCTAGGGTAGAAGTTACTCG
TTGCAAGTTATGTTTTGATTTGACGTCTGTTACTCTGATATGAAAACAAT
AAAGTGATGTTGTAGGATATGAGTCCAACTTTTTTTAGGGTGAAAGGCAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.