Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA039622

[Submit comment/correction]

Sequence
AA039622
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039622
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGCCGCCGCAGCAGGCATCCTCCACCCCTCCCAAGTAGGCAGGCACCGC
GCGCGAGTCCAACCCTAGCCGCCAGCCGCCACCCCTCCCAAGTAGGCAGG
CTAAACCCTATCCATCCTTCTCCTCGCCCGCCACCGTCGTGATGTCGTCG
GAGCCTCCACCGGCCTCCACCTCCACGGAGGAGCTCGAGGCCGATCTCTC
CGCCGCCACGATCAGCAAGAAGCAGCTGAACAAGGAGGCCCGGAAGGCCG
CAAAGGCAGCCAAGGCAGAAAAGGCAGGGAAGGTCGACAAGCAGTCTCAG
GCGGAAGAAGAAGTTGACCCGTTCGCGGCCAACTACGGCGACGTTCCCGT
CGAGGAGATCCAGTCCAAGGTCATCTCCGGCCGGTCCTGGATACACATCG
GCGACCTCGATGAGTCTGCGGAGGGCAGCTCCGTGCTCATCCGCGGATCT
GCGCAGGCGTTCCGCCCGGTCAGCAAGAAGATGGCCTTCGTCGTGCTGCG
CCAGAGCATGAGCACCGTGCAGTGCGTGCTCGTCGCCAGCGCCGACCACG
GCGTTAGCACGCAGATGGTGCGCTTCGCCACCTCCCTCAGCAAGGAGAGC
ATCCTTGACGTCGAGGGCGTCGTCTCCATCCCCAAGGAGCCCCTCAAGGC
TACCACACAGCAGGTCAGCCAGACATCTCTACTCTCTCTCTATCTACCAG
GAAATCATGTTAGATGATGATTCTAGAGCCCAATTTAAGGTGGACGGTGA
ATAAATCATGTTAAGATGATGATTCTAGAGCCTCTTAATTTCTTTTCTCC
TAATCTTTAATCTCAAGCGAGCTACATCTGTGGTTTCTTTGGGTTAATGA
ATTGTCATACTTAGCAGTACAATTGAACATGGATGTTGAATAATCATGTT
GGATGGTTGTGTTAACCTCTGCTATTTGTTTTGGATGGTTGTCGCCTAAT
CATGAAGTGTATTTGCGTTACATCTTTGGATTGTTTGGTCTAATGAGTTG
TCTGTGTGCTCGTTTTGACTGGCAGGTGGAGATTCAGGTCAGGAAGGTCT
ACTGCATCAACAGGGCGGTCCCCGTACTTTCAATAAACCTCGAGGATGCA
ACCCGTAGTGAAGCAGAATTTGAGAAGGCTGAGCAGGTAGTATGTCCTTA
CCTTTGCGTCCCTTCTCTTTGCAGGAAGCACTCAATTATTGTTTCCCAGC
AGTTCATATTTCCTGTCTATGATTCTTATAATCCTGGTGTGATTTAAGAG
ATTTACTCTTTGTCATGATTGCAGACAGGAGAGAAGTGGGTGCGTGTTCT
CCAGGACACCCGCTTGAACTATCGATCTATCGATCTGAGGACTCCGGCGA
ATCAAGCAATCTTCCGTATCCAATTCCAAGTTGAGAACGTGAGTATTTGC
CCTTGTTTGTACTCACTGTTATCATTTGTGTCATAGGGTATTCTGCTGTA
CCAAGTGCCATATTGTGTTATGGCTAGCACCATGTGCTTATTTATTGTTA
TGTGAAAGACACCTCAACATTGAGCTCCAGTTTTTATCTAATTGCACCTT
GCACAAACTGGGATTTGACAAACAGCACGTAATACTGCTTTATCAAAACT
ATGCTTATGTTGGTCACATTCATGTGGTGTCTTATGCAGATAGATTTTAT
TACTCCTTATGTCCCAGTTTATGTGGCACACACACAGTTGAAGGATCAAC
TTTGACAGTCAATTTAATGAACAAACATGGGTTAGGTGCCATCAAAATTC
AAAAAGTTACCAGTCGTATATTCTTTATAACTCATCTGTTATTGGTCAAA
CTGATGGTCAGAGTTAAATCACAGATAGTCGAGGGTGCCATGTGAATGGG
GATGGAGGGAGTATGTATTTCTGTAGCATGTAATGTTTCTTTTCTTCTTC
TGGGTCCATGTATGTAATTTAACAGTTGCATTCCCTTGCAGAAATTCAGA
GAATATTTGTCCTCTAAGGATTTTATTGGGATCCACAGTCCAAAGTTGAT
TTCTGGATCAAGTGAAGGTGGTGCAGCTGTGTTCAAACTACAGTACAATG
GACAGCCTGCTTGTTTAGCACAATCCCCTCAATTATACAAGCAGATGTCC
ATCTGTGGTGGCTTTGGCCGTGTATTTGAGGTTGGTCCCGTATTTAGAGC
AGAAAACTCAAACACCCACAGGCATCTATGTGAGTTTATCGGGTTGGATG
CCGAGATGGAGATTAAGGAGCACTACTTTGAGGTAAGGAATACTTTGAAG
GGATAATTTTTGTAGTTCATTTATTGAAGTTATGGTGACCATGGACTTAT
TTTTGCACACAGGTTTGTGACATTATAGATGGTTTATTCGTAGCAATATT
CAAACACCTGAATGAAAATTGCCAGAAGGAACTCGAGACAATAAATAGGC
AGTATCCGTTTGAACCGCTGAAGGTAAAAACCTTATTCCATACCGTTTTA
TGTTATTATCTGTATTCTTTTGCCCAAGCAACTGTGTCAATTTCTGCTAC
TTTATACAGTACCTAGAGAAAACATTGAAGCTAACATACGCGGAAGGGAT
TCAAATGTTGAAGGTATTAGCCTGTACTCTTGTGGCTGTTTCATCATCAC
AGTGACTCTTATACAATATGTTCCTTCGGTATTATTCTCATTGTATGGGT
GATTAGAACTGTAATAGCCCCAGTATTGTTTGCTTGGTTTTTTGATTGAA
CTGTCCAAGTTGAGTCACGTGGAACGAGAATTGTACTGTTGGTTGCCTGG
AGGGGTAATATGGTCTTCACTTCACGAAGAAGAAACCACCTATAAAATGA
TATTGCAATGTTTTGCATGTTTATTCACCAATTTGAGGTTTTCTTCAACA
ATTGTTTTGAACAAATGCTATGTACCAACTGTTACTAGCAGCTTGTCCAT
TACTATCATGTTTCCTTTGTTGGATTTTGTATCCACTGAATTGTTTTGTT
AACAAAATATAATCATGTTCTGGTAGAAAAATTGGCAGCCTTTTCTGGCA
CTGTGAACAGAGTGGTTTCCTGGTTAGCTGAAAAATAATTACATCATAGG
TGGATGTGCTGAGCTTTTGAAACAAGCACTACATTATTTTCTCTAGAAAC
CAGGTTCAGTCGTTCAGTGAAAAGCTGGCGGTTACTGGATAATGATTTCA
GAATTCAATCGTGCAAGTCAATCCAGTTTGTGTGTAGTGGGCTTTTAGAC
CCTTGCTGTGGAGGCAAAATTCAGGGGGCGTCTCCAGAAAATATTTTTGT
TCCATAGGTTTGTTAAATCATGTTTAGGTCTGTGATGCCAGAAAATGAAT
GGTTTATGTGTATTCTCAAGAATAGCATAACCTGTTGGTTGTAGAACTCA
CTATTCTCACGAATAGCATAACCTGTTGTCTTGACATTTGAAGTGGAAAG
AAGTGTATGAGCTGAACAAGTATATGCTACAAAATCTATTGCATATATTA
CATTTTTTTCGATCTTGGGTTTAGTAAACCAGTTTTTGTTCAATTACTTT
CAGTGTCTAGCTACCCAGAACCTTGCTTGGTGTCTTTGTTATAATAGGAT
GAAACTAGTGTGACGCATTTAAGTTTTCCAAAATCTCAGTTGTTAGTTTG
GTGTTAAAAGAATAAAAATAGATTACTTGACTGTTTGGCAGGATGCTGGA
ACTGAAATCGAGCCTATGGGTGACCTCAATACTGAAGCTGAGAAAAAACT
TGGCAGGCTTGTTAAGGAGAAGTATGTGGAGTCTACTTCACGTGTATAAT
TATATTGCTTTTCAAATTTTAGCAATTCTAACTTACCTGTTATGTATAGG
TATGGAACAGAATTTTTCATTCTCTATCGGTATCCTTTGGCTGTGCGTCC
TTTCTACACCATGCCTTGCTACGATGACCCCGCTTACAGCAACTCTTTCG
ATGTCTTCATTCGAGGTGGGTGTTTCAGTCATTACAGCACCAGCAGAGAA
GTTGTTTGGCTTGTGATTGCAGTTGCACAGGCATAGCTTTTGTTGTTTTT
TAATACATTTGAATTACATCATGTGGGCATGTTAAAACAGTACAATCAGC
GCCAAACAAGAAACATAAATGCTCAAATTAAATCAGCTATCAATTTTGAA
CAAAAAATACATGGATTTCCTAAAAACTGTGTGATAAATTAAGATTACCT
TTTCGGGCGAGTTTCTACAGCATCGTTCAACTCGGTGATAGATGTTGCTG
TTATAATGGGTACTCATCTGTTCCTGAAAAGGTGCATTCTGGGACCTTGC
ACAGCATCCAAGACATATCTAAATAATACCATACTAGATTTAGGGGTGCG
CCTTGGCGCACGACCCCATGGCTCTCAAATCATTTTTTTATAGCACTAAT
AAAAGCAGGTGGGAAAATTGTGTCTTATATATGGATTAGTTTTCATATAT
AACTCATTACCATCCTTATTTATTGATTTTTCTAGTTCACACCGATAAAA
AACACTATTTTAAGCATTAATATAAATCGATGATAATCAATCAGCACATA
ACCACACAGAGAATGCCTGAAAAATATATTACACATAGAAGCTGGTAAAA
ATTTATTGCATCTTTAGCAGAGATATAAGCAGACAATAGTTCTTCGAAGA
GATCAGCTGAACGCTGATTACTGATGTGCAGAGCCAGTAACCCTGGTGCA
GAGCATAAACAATCATCCGATTCAATTTATCCGATGGATAGAAGAAATAT
TAGTGGAGGGAGAAATAGAAAAAAATACCCCATAGTCTGTACCTGTACAT
ACATATCTGCTATAGAGCAACATACAAAACACAGAGTAGGGAAGCTGCAG
CACGTTTAACATGGCGTCAAGCATGACCCTCATGGTATTTCCATCAGATC
CATTGCTTTCCCCGGTACAATAGAAAACCAAGCGAAATCGCAAGTGGTTT
ACAAATGACACGACGATCATATAGATTACTACCCAAAGCTGAAGACCGAA
GGTAGCTAGCATACAAGGAGAACGATCCCTGTAATCTTTTGGTGATCAGA
TCTTATCAGTACCATTATTATACGTAAAACAGTATGCAAGAATAAAGATG
TTATGTCCAATTGTAATAGTAAGTAAATAGAAAAGTGAGTACCATATTAG
TTGCAACAATATTGCAAGAAAAAAATAGTACTCCCTCCGACCCATATTAG
TTGACTCCAACGGACGTATCTAGCAGTAAAACTTGACTAGATACACTCGT
ATCTAGATAAATCTAAATCAACTAATATGGATCGGAGGGAGTAACAGAGA
GATAAAAAAACATGTTTTATCATTATATGTGAGAAAACACCTCAATATTG
ACTTTCCTAAACAGTACTTATTTCTTGAAGTGTTTGCGATATGTTGTATG
CAACAACCCCCATCGAATAGAATAAATAAAACAACTTATTTGAAGTTCAT
ATGAAGAAATGGATAAGAAAATTATGTAATTTTGGGAGAAAATATACCTC
ACTTAGCAACAAATGTTACTGTATACCTATTCATATTGCAAAGATCCAGT
GTTGCTATTCTGTGAATATATATATACCAAATAAAATGCTCGCTGTATGA
GAATTTTTCTACTTAGCTTATATTAACTGCCTATGCCCATAAAACAATTA
GAATATACCTAAAACCAGATCGTATATCATCCATTTATGACAGAAATACA
ATCGAAAGAACACAGAAGTCTGGAGGGCATGCATAACTATATGTATATGA
ATGTTCATGGATAAGCTTACGCTTAAAAAATAAGATTACTTATTCATCTA
TCAAAGATATCAAGAGAACTGAACTGGATTCCCATGCCGTATGTAGCAGC
ACATTTTTTAAGGAACACCGAACATGTGATGATTACCGTGGAGAAGAGAA
GGAGCATGAATGCAGCTCAACCATCATTTGTGAAGGAGGAAGAGAGGAAA
CTCGGGATGTCATAGACATTGCGAAACATCTAATTTTCTGTCCGAATTCA
TGCTTGAGTGTAAAACTGCAGGGCAAAAAAATATTTGAGCGAAATCTCAT
AAAGCATCTAATTACCTACCGTGGATTCGACAACCCATGTTATTTTTTAG
TTTAGCAAACATCAGCAGCCATTTAGTCTCCACACTAACTATATCTGAAC
AACAGGTTTAGCCGGTGTGAGATATTGTATTTTGAGGATGTTTTGCTCAT
GGAGACCATACACCCGAGGCAAATAGGCTACAAGCCTGCTATAATGCTCA
TAAATATTTAATTACATGTGTATTTTTAAAAGCTAAAACCTGATGGTATG
TTCGAGCTGCAATAAATAAACAGAAAGAACTCTACAAATTTCTAGAAAAC
AGTAGTAGGCAAGAACTGAGCATACCTAATTCTTTTCTAAGAAAGAGAGC
CCAAAACAAAATCAGGACCGGGAGCCTGATGACCATACTTATAGTTTTTC
TATCTTACCAAAAGGCCAAGTTGGAGATCTGATGAGAATTTATTTCAGGT
CACGACCCAAGAACCAACATCAAAATCATAAAGTATTTCCAATACTCTGC
TATTCAGAGATATTAAAATTTGAAAGGTATACCAAAATCTGTAGCAAAAG
AGGCCAAGGAGCTCGAGTATCCTGGTGTAGCTAGAAAGGTAATATAAATT
ATAGAATAAAGTCAAACACCTGATAATACACTACTGATTATTTCACATGC
ATTTGATCTTTTGATGAAAATGTCCTATTCTAGCCAGACCAATTAACTCT
TTTGATGAAAAAACCCTATTAAAAATCAGCATCTGAAACCATGCTTTCTA
ATCGACCAACATAGCATTGATGAGAAGCTCTATATATCTTTGCAAGGAAC
AAATAACATAAATTTCCATCCAATCAAATATATTTCCAGGACTACTATTG
CAAGAACTAATAAAGAGAAGCAATGTGATGTACCTCAAGATTAGATTATT
GGGACTGCATCAGACTTGCTGTTGTATACTCTTAGTAGGGCTGCAAAAAT
GAGTAGCTTTTGAAGCCCTCTCGCTAGCTGGTCTGCACAAATGAATTTTC
CCCAACATGAGGTACAGACCATGAACACTAACAAAAAACAAATGACGCAG
CCAGGGACACATGGAGGTCCAAGATCACAAATGAACAATCGGTAAGAAAC
ATCCTGAGACCAAATCAAAGAGGGAATCTTTACAAAATAATATAGGAGAC
ATATGAGGAGTAAAAGGGTATCGTCACAAACCATGACCTGTAGATTTTCT
TGTGATGAATCCCTTTAAAGAGTTGAACCTGCAATATAATCTGGAGACCT
ATTTTTAAGATTATTTAAGAACTAATAACAAGGATTATTTCTACACCGAA
CCCAATTCCTAGCACCTTTTTTCTTGTGCCCTCGGGTCACTGATCCCCTC
ACATGCAGCCCACTGGACTAAATCAACACGACAATGCAAAATTACATCCA
CCATAATGCTGCAAGGTAATTAAGGAGGATGCAAGTAAAAAATGGAGATA
TCTTAGCATGTTGTAGATGACCATGTTGAAGCAGTGTGTCGTATCGGCTC
CAGGGACTGGGCTAGCGCAACACTGCCACCCTCCCCACCGCCGGCCTCCC
CCGTGCGTGCTCCTGCAGCGCCTCCTTCAGTCGACCACTGCGGCCGTCCA
GGCTCCTCCTACTGGGCAACAAGGAGAGGAGACGTGCTGTACCGGCCCCT
CGGCTGGTGTGCCATCGCCACCCGTCGCGCCGCCGCCCTGCAGCTCCTCC
TCTAGCCCGCCACAGCCACCCGCCTCCGTGTGTGCTCCTGCAGCCCCTCC
TCCAGCCCGCCATCGCGGCCGTCCGAGCTCCTCCTGCTAGGCACCGAGGA
GTCCACAGCCAGAGGAAGAAGGAGAGGCAGTAAGGGAAGAGGAGGAGACC
ACGAGCGGCGGGGCAAGGAGGAGGTGAGCGGCGTGTTAGCAGGAGGCTGT
TCCGGCGCTGGCAGCATGAGGGATGAGAGGAGGAGGATGCCACACAGAGG
GAGCTTGCGAGCAGAGGAGCGGGGATACCACACGACGTGGCGGCGGATGC
GGATTGGGGAAAGAGAAGACGAGGGGATTGGGGAGGAGACGGCGGAGGTG
ACTGCGCCCAGGGTTTCACTGCGGGCATCGGTTTTGTCTGATGCGGAAGG
GCAAGTGTGTCTCCTTCACTTCCTCACAGCCGTGACGTCCCAAGCAAAAA
TAATTGTAGATAGACTGCCGAGCGGGCCTAAAAAGCTCTGTTCCAGTGTC
AGCCACCAGACCGTGTGTGTATAGCTTTTTGTATTTGCGGGGTAAAAAAG
ACTTACGGTGATTAGACGGTCCGGACGCGATTTGGAGGCTTGATCTAACG
GCCCAGATGCGCTAATTGCTATGGTAAGACATGTGAGTTGCCCCTATTAT
ACTTTTAGATTACCCACATTCATTTGGTCCTTTGTTTGGATGACGGTTGC
CACTATTGTCCATCTCTCCATTTGCATAACTGACATTTGAAACAGCCAAA
GAGGATACATTTTTAAAAGAAAAATGGTGGATGATAAACTCAAAATCATA
GAATCAGACAGTTGAAGGCTAGTTTGACATATTTGGTAAATGGAGGGGGT
ACATTTATACATGTGGCAGACCTAACTGATTAGACTGAAAAAAGTACTGT
GGTATAGAATATTTTATCACTTGGGACATTATACTCTGAGCAGTACAGGT
ATTCTGCTTGATGCTGTTTCTTGCACGTATATTTGAGGTTTGGAGCTGTA
GGAGTGTGTTCTCTATTGTGCATGATTGGTGTCCAGTTCTCTAGTTTTCC
AGTCGGGTGTACTGTACAAAAGCTGTCCAGCTGGCATTGCCGAATGTATG
GACAAGACCTGGGATGGGAGTTTTTTTTGGAGAGAAAGACTCGCTCTTGC
TTGAAAAAAACATGCTCATCTCCTCTATTTATGTAGGTGTCGAAGCTAAT
TTAACAAAGGTGGAGTAGTATTTATGTTTGACTGGCTTGTTTTGTATCAC
ATCATTAGTTCAATGCAGAAAAGACATACTGGTGTGCTGAAAAAATTATC
ATTCAATATATATGTGAATAAAGACCATAAGATACATATTATTTTGTAGT
CTTGCATATTAAACTTTGTGGTATATATATTCATGTATATTCAATCCGAT
ATTGGACCAATTATTTTGATATATGACAGGCGAGGAAATTATTTCTGGAG
CTCAAAGAGTGCACACGCCTGAGTTGCTGAGGAAACGTGCAATCGAATGT
GGCATCGATGCGAGTACAATATCATCATACATTGAATCATTCAGGTTTGT
TCCATGACTGCAATCTTTGAGAATTGCAGTATCTAGTACTAGATAACATG
TGTTCCAACAATTCATTGGAATGCTAATACATACGTGCTCCCTCTGGTCT
ATATTAATGGCCTCTCAACTTTATCTAGATTCGTATGTATCTTGTTAAGT
ATCAACTTTATCTAGATTCGTATGTATCTTGTTAAGTATTTGGACTAGAT
GCATTCGTATCTAGACAAAGTTGAGGTCATTAATATGGACCGGAGGGAGT
AGTATTTTTCTCCACTTTGGTACTCAAATTCACCTTGTTGACAATTACAG
TTTTGGTGCCTCTCCTCATGGTGGTTTCGGTGTTGGGCTGGAGAGAGTGG
TGATGCTGTTCTGCGCCCTCAACAACATCAGGAAGACATCGCTTTTCCCT
CGTGACCCACAGAGGCTCACGCCATAGGTTTCTTTTGTGGGACAGACAGC
TTGTGCCCAACGCTTTCACCATGTTTACCAATCTGCTAGTCAAGTTATGC
CTATACTGATTGTTGCTGCATTGTGCTGACATAACGACACTACCAATGAG
TATAGCATGGTCAATGGGTTTTGGAGCTTCTGCTATATTCACAAAGCTTG
TGTTGGCACCAATTCTGGATAATACTTGTTTCTATCATCAGTTTGCTGAA
GGTGTTTTGCTTTTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTTGTTACTTCGGTTGTTC
TGTTAGCTTTTATGTTCTGTTATGTTTGGCTGGGCTATAGAGTTTTGGAG
TGAAGTTGTTTTGATTTTGTTAGGATGAAATGATTCGTGGATCTCTTTGT
CTTTTTGTCATAAACAGATATCATGGGTGAAACATCAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.