Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA032341

[Submit comment/correction]

Sequence	AA032341
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA032341
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCTCTCTCCAGGCTGCACTGTCCTAGCCTCCCCACCAAACGTCTTTTCT CCTCCTTGTTGCTTCTGCCCCCACTCAGGCTATTATCCTCTCTCTCTAGC CAGCTTCCTTCACAACCCTCTGTCTCTCTAGCTTTCTCCCGAAATCAAAA GGACAGAGAGGAAATAATTTGGCTACTCTCTCCTAGATCTCAAATATATA GGGTACAGGAGGCGTCGTCCTGCTTATACATATCCCTTGGGTTGCTTCCT CTCCTTCTCTTCCGTGAGTAGGTGTGCTTCGAGATCGATCCCGGGGAAAA ATGTCGTCGGTCCAGTTCGCCTCGGAACAAGTTTGCTATGTCAACTGCAA CTACTGCAACACCATCCTTGTGGTATCTTTTCTCTCTCACTCGCTCCCGC TAGCGCTATCTCTATCTCTCTTTCTTTCTCTTCCGTAATCTGGGTTTTAT CATTCTCGTCCCTACTTAACTGGATCCAAGATTATGTATACGGTTCGATC TGTGAAGAAGGCAACATCATATTTTGAAGGTCAACAATATATATATACTG TTCATATAGTTTTGGGGAACAGGCCTTTACCGCATATTTCTTGGCTACGT ACAATAATTCAATTTTTCATCAAATTATAGAATTTACTGTTGTATTTTCA GTAGAGTTGCCCACTTACATTTTTGTTAACATTCGTCATCTTTCAGTAAT AAGTGCATGAATGAAGTAACACATGCACCAATTTCTTTCCTCCATTATAA TATGAATTCAAGGATCTGTTCATATTTCATCTCAGCGGCATTTTTTTTAT TATGGCATCGTTTTTCCCCATTTTTCAAGAAAAATATGTTTATCTTGTTC ACTACGGCCAGATGTACCATTCTTTCCTGTAATTAACATAACTATTTCTC CTTGAGCCATCTAATTCTGTTGTTTGAAATGTTGTTACTTGAGAGTAGAT CCACACATGCTGACTAGCATGCATATATAACTCAGATTCAGCACTATTTG ATGCAATGGTTCTGATAAAATTTATATGGAATTCACTTGGTATATATTAT CTTCATATATAGTTTGATCAGAGTCTTTCGCAGAATAAAAGATTATCATT CACCATTAGATAAAAAAAAAAGATACAGATTGGCCGGATATTATTTTGTG AGGAACAACCATTGCACATGGGATAACGATTTTACTGAGAGTAATTATTA GGACATAATCTTCATGGTTTCCTCATAAATACTCTTTTAGGTCAAAACTT TACATGCATGCGTGCATCTGATTAAAGCCACTTTTGACTCGGCATTACTT TAGTTTTGTTCATGTGATATTACCCCAGTACTGCTGTTGGACTCAGTAGC TTATTAACTATTATTTTAATTGGCAGAAAATGGTTTAAGCTACGAACATC CTTGAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCATTCTGCACATGTTCAGAGGGAAGTGGATCTGCTTGTCATGTCA TTTTCCTCTTTCTCGATGTTTGGGCAGGTGGGGGTCTGTGTTTATGCGTG TTGTGCTGAAAGAGAGGCTGGATCGAGAGGGTGGCATGAACTTTCACCTG TATAAAGTTTTCGCCACTTTTTCATCCTGCATGCCCTAAGAGGGGGAGAG AGATGTCATGTCTGCCTGTCACCTGGAGGCGATGCCATTTGCTTTCTCAT GACCAGGGAACGATATGGATATAGACATGGAGTAACTTTACCATGCATTC GTACCTACTTAATAGGCGCGACACATTGACCATCGCCATTGACCACTTCT TCTCATAGCTCCTAGCTATTAGTACTCTCTACCTTTTCTATCATGCACCT GTGTGTCCTGTGTGGGCAAGAGAAAGAGAGAGAGAGAAGTCTAAACACTG TTGCCCATAACTAGCTAGCCTGTTGACCGTTGAACCATTTGTAAGCTAGG CAATAATAATAAGATATCAATCATTTAAGGGGTGCTAAACTGTGTAACTC CTCCCCGTTCAATTGGATCTAACATAAACTATTTATATGTATGATGTATG ACTAGCATATACACATAGCTGTACTATTTAGGTACTACTTGTAGAATTGT AGTTCGCTGGCTCCACATATATTCCTTGAAAAAGAAATGAATATCTGCAA TCTAATTCATACCCTATACAAAAAATACATTTTGCATGAAATACAACACT CCCTCTGTCCTGTAATAAATGACCTGGATTTGTCTACATTCACATGTATC TAACTTTTTTTTAGTGTGTAAATACATGTGAAATTTAGACAAATCCAAGT CACTTATTTCAGGATGGAGGGAGTAGTATGTTCAACAATACAACACATCT ACATAGGGCTTAGCAAATTAACTAAGCAATTGATGAATACACTTATATTT GCAGGTGAATGTGCCAAACAATTGTTCCTACAACATTGTTACTGTTAGAT GTGGGCATTGCACAATGGTGCTCTCCATGGATCTTGGCCCTTTCCACCAA GCACGCACTGCTCAAGATAACCAGGTCCAGAATTAAAAGTGTTCTAGTTA CTTTTTTATTCACTTATATAACGCATGATTACTATTTTTAATTACATATA CATAGTCTAAGATGATTAGACATTTTTTAGAAGACACTATCTACTGTACT AATTTGAAATTATATTCTGTCCTTTTTAGTAAAAATTAATGATTTTTTAC TTACATCTGATAAAGAATTTTTTACCAATATTTACAAGTAATGGTTAATT ACATGTGTATTTGTCTTTAGGTCCAGAATAGAGTTCTATCTAATAATCTT GGGAGTTACGAGCCAGCTTCTAGGAACCAGCGAACATTGCCCATGTATCC CGTGTCCAACAATCAGCAGCAGGTGTCAGCGATACGCCGTATGTGGGATT TTTTCATGGTTTCATTTCTTGAAATATGATTTATCGACACACTGCAGATT ATTTTTTATTTTGTTGTTCGCTATGACCACACACACTATATTGTTGTACG TATTTCCAGTAATCGATTCTTTTTGTTGTCTCCAGCCCCCGAGAAGAGAC AGCGTGTTCCATCTGCGTACAACAGATTCATCAAGTGAGATTTCATGCCA TACATATTGGTCGCTTGTACAATACATAAAGTTGCAGTACAACTCTACAA TCAAATCTCTAAAAAACAATTATATTGAATGTCTTCACATTAACCAGATC GATTGGTCCATCAATTTTCTAGTTGGCTAGCCTCACTAAGGATAGCCATC TCAAACATGATTAGGCAACTAACCATTGTGTACCTAGCTTTGTAATCTGT TTGGAAAGGGAAAAATTCGATATCAAGATCTTTGGGTTACTATTGCGCTT ATGCTTGCACCAGAAGGATACAAAAATAATTTAGGGATAAGTTTTACTTA GTTCGTACATTATTAAAGACATGTTCTACTTTAACTCTTATGGGTGCTGT TTGGATAATTTTTTTAAACATGTAATTCTAGAATTGTTAATTGCAGCCTT ATGTTTTTTGTCTGTTCTATCGATCATTTAGATTTCAGCAGTTGGTATCT CTTTTTAAAGATGTTGCATTTTCCCTTTGTGTTTCTTGTGAAACTATGTA ATCTACTTAATTTCTTGTACAAACAATTTTGTTCTCTTATAAGCAGTTCC GTGGAAGTACTGATTAAGCAAGGCTTCTTTGTGGTTATAGCTACAAGTAA ATTTTAATTTAATTTTCAAAAAGTCACGACAAAACCTTAATGTGAGTTCC AAATTGTTATATGGTTGTGTTAAAATTGAAACAAACTTATGGATTTTAAA GCAAGGATTTTAGATGGTTAAACTACAAATGTAATATTCATCTCTAAAAT GTGCTTAAACTAGAAAACAACTTGCTCGATAACTCTCAACAAATCATACA GAAAACTAGAATATAGCTAACATGTATAGTAATACATTCAGTGCAAACTG AAACTAAAACACGGAAATGGACTATCAATTGTTAATATACACTTAGCTAG TGAAATAAATTTATGAATTATTTGTTGGCTTTTTAATGAAAAAATTCTTC CACACTCCGATCCATATTGGTATCACAATTACATGAACAAAATAAGAGTT GTGCTTAAACATGTATACTTATGTACTAGTAATTATGCTTTTGCTTTTAC TTGGCATAGTTCCCAATATAAAGACTGTGCACTTCAATTTGGTTATATAT AAAAAGGCATTACATAATAGGTAATTTTCACTACAATTTAAATATTTAAA TATATATGAGTTGTGCGTGTTCTTCTACACCATAATATGTTTGTGAAGGT ATCTCTCAACTTAAAAGGGAGGTACAATGTGAATCAGAAGTATTTCCCAA GTTTATGTTTTGATTCATTTGGATGTATACATATGCCATCATCAATACAT ACGCAAGTATTATTTTCTATTTAAAAAAGTATACATGATGGTACTATGGA TAACATACACCTGTTTGTAGATTTGTTCACTAATCAAGATGCGCTTTCAA TTGGCAGGGAAGAGATACAAAGGATAAAATCATGCAACCCTGAGATTAGT CACCGAGAGGCATTTAGTACTGCTGCAAAGAACGTAAGTACTCCTAAATG TAGTAAAATTGTACTATTTACCATGAATGTAAAGTCAATATTAAGTATGT CATCATCACTATATATAATCAACTTTGAAGAGTCGGAATTAAGTACATTG GTATGGAACATATAGATTGAGACCTCCTAGGTTGCTCCTAGGCTGACTTC CAGAAGGTACCACTACAAAACTTGATTTCCTCCCCCACCCCACACTTGTG CGCACACACACCCAATATAGTTGGAGGACATTGGTTGGCAAAATCCATGT TGGCATATGGCAGTGACGTGGTCTCGCATGGACACATTTCCAAATTTATT GTGCCCCATCAGATCTGGGGTGACCCAGTCACCCATGTAGAGTAGCCCGC AATCATGGTGCAAATACTAGGTGTCACATACAAATAATAGTGTGATGTCA CATATCGTATCATCCTCATTTTGGTGAGAGATGGTGGCTTGTCTGGCTGG TGAAAGATCGCGGTGGAGTGTTAGTGTACTAGTAATTGATCTTAGTCTAA TGATGTGGTTTTCCCCATTTCAACAATTGTGATGCTTCCCAGCAAACCCT CCTGTGGCTTCGTGGCATTACGTGCGAACACCGATGTCGGAGATATGTCA AACCGAGTATTTTCACTAGGAGGGAATTGCCTAGAAGTCCAAGAGGGCCC ATGGGGACTAAGGATACACGTGGTCAGCCCACGGCTGCTCCCCTAGTGGG CTTACATGAAGAACAAGGGCATGTGCCGACTAACTCAGACTTTAGTCGGT TCAGAGGAGTCACAGAGATATCCGACATCCAAAACTTGGCATACAAGACA CGTAGAGTATTATATGATATATGTTAGGACTCCTACTCCCGTACTAACAC GGGGGTCTTGTAAACCGCAAGCCAGTCGTATATATAAGGCCGGCTAGGAT CGCCCTTAGGGGCATACCCAACACTTATAATCAATCGCAAGCATAAAGCT AGATCCCTATCGACTAAGCGTAGAGCCTTAGCCGACGGAACCTTGTAATC GATATACAATCAATGCAAAAAAGCATGAGTATTTCTATACCTCTAGAGAG AGGGGTTTGACCTGGATAACTCGAGTGTACCAATCTTGTCCCCGATTCCT CCCATGTCGCTATGCTCCACATAAGTTGTACCTCTCCCGATGGTACCTGT CGTGGCTTTCCCATGACAATGGATCTTTTCCCTTGCCCCAATGATTATTG AGTGACACGTTGTGGGTGATGGGGATGGACACCAGTTGCAAGGTTCAGCC ATGTCCTCTTCATGGACATACACTCCACATTGATGTCTCCCTTCCTTTCA GCAGAGGATAAGCTGTCTCTGGTGGGTCAACACACCATATGTGGTGATCT TATCACTTCTCGTATGGCATGCATGATCCTCACTGCATCAGAGGTGGTTG CCAAAACCACATGTGAAATGATCCATCTATGGCGGCTGGCCCTTATAGAC CTTTTAAAGATGTTGCCAACCAAAGGCAAGATCCAATAGAGGTGACCCTT TATTGCATGCACCAATTATAGTGTAATAAGTCAAGTGGTTTAACCCCTAC TGACATGCATTACAAGGGCATTTTTCGTTGTATCTCCTTCACATAACAAA GTACTCCCTTCGTCCTGAATAAGTGACTTGACTTTGTCTAGATTTAAATG TATCTATACACTAGAACATGTCTAGATACTACACTCGGATCTAGACAAAG CCAAGTCACTTATTTATGGACGGAGGGAGTATATATAAATACCACACATT CACATCATCATTTACAAAGCATTTGGCACACATGAAATGTGGCATCACTA AGGGTCACATATTAATGCAACCATTCTAACATATATTGAAACCTTAAAAA TAAGTATAACTTTTAGATTTCTTATACAACATTTCTAACTTTCTTGGTCA CTTCTTTGCCTTTTGATTGTTCCTTTTGTTACAAAAGTACTCTTTGATCA CCGAAGCGAGCATGAAGCCCTTAGTATACAAGAAACTGCTAAAAAGACAC ACATCTGCTAACAAGAAATGGGGCTATAAGTAAGAATGTGGAGAAAATAA GAGAGCTAAGCTCAAGCTTTATACCCGATGTGAGATGGCTATTTCTCAAT GCCTCGGTTAGAAGACTTAGAAGCCTTTTTGAACATCAATTTGTGCACAT GCATGTGTTCTTGCACGTGAAAACTTGTGACGCGGAGGGTGTAGAAGAGA TTGAACATTTTACAGGAGGGTTTCAGCCACACCAAAGAATACATATATGA AGTACTATCCAACATTAACACATAAACTAAACTTAGAAAAATTGGAATGG TTAATATTCTATAAACTCACATCAAGAGGTGTCTTCTTCATCGTTGGTCG TAACTATTTATCCCTGACATATTTTGTAAGACGCTAAATCCAGATGACAC ATTAGTAAGTAGTAAATAAGTATTCTAAAACGCCAGGTATTTCTACTGAA CAATTGGGAAAGTGTCTGAGTTGATATATGGCTTTCAAATTAAGTTCCAA ATGATTAGATGCTACAAAAGGGAGAGGGACAAGTTTCTCCTACATCATCG GGGGGTGAGAGGCAAGGCGGTGGCACGGTCGATTTGTGGTAGCTAGAGGT GAAGGCTAGTGGTCGGGTCAGGGTAGAGACGATGCGGAATATGTAGTACC AGATTGATACCTTAACAAAAAAATGTCCATTGTCTAAAAGGAAATGTCCC TAGACTAGCGAGACTACAATTGTTCTACACCAGTTTCGAGCCTGCTCTCC GTTAATTTCTTTGTTAAATTTGTCCTTTTTTATCAAACCTTCAGGTCTAT ACATGGTCTCACGGATATTGATGTGTTTATGTATATATATGTGCATGTAT GCAGTGGGCTCATCTTCCTCGCCTCCACTTCGGCCTGAGCGTCGTAGACG GTGGCGGCGGTGGCGGAAATTAGCTCCCGATCAAGACCAGAGTTGCATAC AGAAGGCGGTGGATCGTGTGATCGTCGACGCCGTGTGTTCACGTCCATCG ATCTCGATCGTATGTGTGCTCGTACGTGTGTTGGTGCAATGCATGCATGT CCTTTTTAAATTACATACCTATGTTTGCCTAATGAAGTTTTAATTACTAT GTATTGCATGTCGATCCTGCGGAGTACATTCAGATCATGCGCTAAATAAA TGGACAAAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.