Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006678

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006678
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006678
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCATGGGCCACCGCCCACGGGCACGGCGAGAGATCCGTGAAACCGGCCAC
GGTAACCACGTCCACCCGTTCCGCTCTCCTTTTTCTCTGGGTTTCGCTTC
CACTACACTCCGCTCTCCTCGCCCCGTCCCGAGGCCACCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCTCCCTCCCTCCCTCTAAAAACAAACAGAACCGCCCACGCC
GGCGACGACGCAGCTCTCCATCCCCACCACCTGTTCGACGGATTGCGCAG
GAGGAAGTACACCCATGGCATCCCTGCGGCCGCTCGACCCCTCGCTCCCA
GCCGCCACCGCCAGGCGGCGCCTCGTCCCTGCGCCCTCCGCGGGCGCGGG
CGCCCTGCTGCTGCGGCGCGGCGCCCTCCTTCCGCGGGGACGGAGGCGCG
CCTTCTCGTGCCGCGCGGGCTCCGGCGCCTCAGAGATGTAATGCCTCGTC
GCCCTCTCTTTTTTTTCAACCGTTCTCGTTGAGCATGCGCGCGTGCCTGC
GGCTCTGGGGATGGGATGGGGCGGGCGGGATTCTGTTGTTATTATGTAGG
AGGTCTCCCTAGCTCAGTAAGGACGATCGCAGTCTGCTAGCTGGACAATC
ATGGTCGCAGTTTGCAACCGTAGGTCTACTTGCACCGTCTCATTGTCATG
ATGATCGGGAATTAACACCAGAAAAACATGCTGCTGAGGATATAGAGCAG
TACAACTAATGATAACGGAGCAATGAAACAAAAAAAATCGATCTAGGGCG
GCTCTGATCCTAACCCGACAATGTGATTCATCATATGACCCAAAGGGCAG
GCCGGGGCAAACAAACTCACCTAGGCTCTGTTTGGTTGCGTTTAAATCCG
GCTTTTGGATTTTGGCTTACATATAATCCACAAAATCACCTAGGCTTTGT
TTTTTTGGCTTTTAACTGGAGGTAGTTGTATGATGGTATAATCCAAAAGC
CAAAATCAAAAGCGCCTATTTACGTGCTTCCATGGCTTATAACCCAAAAG
CTAAAAGGCACCCAACCAAACAGCCCCTGACTCTATTGGAGTATATATGG
TACCGCCGAAAGCTAAAGGTTCAGGAAGAACATGCTTGATGGTAACTCAG
GGGTGACCTTTTCTTGATGACAATGGCGTTTGTTTGAAAGAGTCCTCTGC
AGAAATGCAGCCGTGCAGTTTTACACTTCCATATTTTGGACAATATAATA
ATGACTTCAGCTCATATATTTATACCATCTGCTACAGAACAAAGGAGAAA
AACAGAAAGGATCCTTCGAAGCTGGGTGCGGTGCTGTTCCAGGTTTGTAT
AGAGCACCAGGTTAAGTTTGGTGAGCATGTTGGTATCATTGGTTCGGCAG
AGGAGCTTGGGTCATGGAAGAACCATGTTGAACTGGACTGGACAGAGGAT
GGCTGGGTCTGCCAGCTTGAGATCCCTGGAGGAACACTTGTGGAGTTCAA
GTTTGTGGTAGTTCTGAAAGGAGGAAATGAGAAAACATGGGAGGGTGGCA
ACAACCGTGTCGTTCAGCTGCCCAAAGATGGCGCAGTTGATATAGTTTGT
CACTGGGATAAGACAGAAGAGCCTCTAGGTCTTCCGGGAACATCAAAGGC
TGATAGAGTTCCCAGACATGTTGTACCAGAAAAGGTTTCACATGTTTCAG
TGGCTGGGAATGGTGATTTAGCAGGATCTGACTCCAGCAACTTTGGTGGG
CAATGGCAAGGTAGCGAAGCTGTTTTCATGAGGTCAAATGAGCATGGGAA
TAAGTCGACCGACAGGATGTGGGATACATCTGGGCTTGGTGGAATGGCAT
TGAAATTTGTGGAAGGTGATAAAGAATCTAGGAACTGGTGGAAGAAGGTA
GGTTGTCTTTATTCGTTTTTCACCTTGTGAAATAGGTCTGATGCTCCATG
TTCTGTTATTTTCTTTTTTATAAAATTGAAAGTAGTAACTTCTTCTTTTA
ACAAGTTTTTTTCTTGCAGTTGGATCTTGTTCGTGGACTCTTGTCAGAAC
CTGTTGATGATCAAAGTAGATTGGATGCACTTATATGCTCTGCTATTTAC
TTAAAGGTTTCTCCAGTTGTACTTTACTGTGCTACTTATCACTATTTTAA
CTAGGAAACTATTTTAGTAATTTTCTTTGGAAGTGTTCATCTGAAAATAT
ATGATCTCCTATTTATATAAAAGTTTTTCCATCTGTGCTTTAATATGCTA
TTTGTCATTATATTTCCTTGAAAATTTAATTTTCCTTTTAAATTGTTGAT
CTCAAAAAAGCAAGACCGGCTAAAAACGTGTATATATTTTTAAATCTGTT
CCTTCTGTTGCAGTGGATTTATACAGGTCAGATATCGTGTTTCGAAGATG
GTGGTCATTATCGGCCCAACAAACATGCTGAGATATCGAGGCAAATTTTT
CGTCAAATTGAAAAGATGTACTACACAAAAGGCATATCACCTGAGGTTTG
TGCATTCCATTACAAATGTTTCATAGAGACCAGTATTTGACTACCTGTAA
TGTTGCTTTTGACCACTGTGCCTTTAGCTAAGATAAACTAGTTTGACTTT
GCTACTGTTATTATTCTTTTGCTAACACTGTTATGCTTAAGATTATTTAT
TTTGATCTGCAATCTAATGCTTTTAAAATCATTAATTATTCATCTTGGTA
ATACTGATCACCATCATCTTTCCATACACATTGGGGCAGGATGTGCTTGT
GATTCGCAAGATCCATCCCTGTTTACCTTCATTTAAGGCGGAGTTTACTG
CCACTGTTCCTCTAACACGAATTCGTGATATTGCTCATCGGAATGACATT
CCACATGATCTCAAGGTGATGATCTCTTTCGAAAGCGTAGTGTAACTTCC
CAACTGATTATTTGCTAACTCACTTGATCTTCTACTGTCAACAGCAAGAA
ATCAAGCATACTATACAAAACAAGCTACATCGAAGTGCTGGCCCTGAGGA
TCTTATTGCTACAGAAGCCATGCTTACTAGGATTACGGCGAATCCTGGAG
AATACAATGGAGCTTTTGTCGAACAGTTCCAAATATTCTATAGTGAACTG
AAAGACTTCTTTAATGCTGGCAGGTTGTCTAACTCTCTACTTACATTTTC
TACTTCCAAAATATCCATTTGCTAAAAGAAGTTAATGAAACTGTAACTCT
CTGAACTTCTGTCCTACTGAAAGATATTGACATCAGTTTCGAATATCTAT
TCTTGTTGCTTAACTTTTTTGGATTTCTAATTCTGGACTTATTGCCCCCG
GATGTACCGATAGACAAATGGAAATTTGATAGTGATAAAGACAGAAGATT
GCACTAAATAAATAGAAAAGTTATGGCAGAAGACTTCAATCTGTATATTG
AACATAATTCCTAAAAGGCATGTTTTGATGTACAAGAATATAGAATACTA
AATGTTATTACTTGGAAAATGCGTATAGTAGACATGTAGGATGTATTGCT
TATTTTCACTCAACACTGAAGCTAAAAGAGACGATTTTCAGCCAACCTTG
AAGTTAAAAGAGACAATTCTTTGAACAATGTCAAAAGCAGCCCTCTACTA
AGCACTAGATGTTTTCTATAGCAATGACAAGCCCCTCTGTTAATGAAAAG
CTCAAATGATTTTCTGTGCAAATAATCAAATCAAATTCATTTTAAATGTA
CGATAACGTGACATGGTATTGGCCAATTCTGCAGTCTGTTTGAACAACTG
GAATCCATCAAGGAATCTTTGAGTGAGTCTGGCGTGGAAGCACTCTCATC
ATTTGTGAATGCCAAAAAGGTCAGTAATCATTTTTATTTTCTTTCATATT
TTTTTATCTGTTATACAAGATAGTACTCTGGAGGGGATACTTATAATTTT
CAATAATTTAGGCACTTCTGTGATCTGTTTAATTTTTTTGAATTGTCTGT
GATCTGTTTAATAACTAATATGAATAAGCAAACAACGGTAAACAGCATAG
ATTATGTTACTAAGTCCTGCATGACGTCATCTCTATATTTTTGCAATTGT
ATAGGAAGCACTTGTTATAGTGGAGTTCACCATGCACTGCAGTTCTTGTG
AATCTAAATACGTTCATAATATATGATGTTACAATATATAGGTACTCAAT
GGTTAACTGTGCTTACTAGCTGCATGTCATGAAAGTTCGATTGTCTACCA
ATTTATTTGTTGGATGGACCCGGTGCTTCAGTTGTCATGTCTAATTCATA
TATTGTCTTGTAAGTTTTTCTATCACGTATTTTCAGAGTTTGGACGAAGT
TAAAGATGTAAAAGGTAGCATTCAAGTTTTGATGAAGACCTTGCAATCAT
TATCGTCTTTGAGATCAGTTCTAATGAAGGGCCTTGAAAGTGGCCTTAGA
AATGATGCGACTGATGCTGGTATAGCAATGCGACAAAAGGTTATTTGATC
AAGCACAACTCAAGAATTTTTCTTTCATATTGGCCGCATACATTTTCAAT
TATAATTACTTAGTGAATTTCTGCAGTGGCGCCTTTGTGAGATTGGTCTT
GAGGATTACTCGTTTGTTTTGTTAAGCAGGTAACGATTTACTAGTTTAAA
CTGATTTTTTCTTTTAAAAGCATGTTGTCTTGGAAAACTTGGTTTTTCTG
TGCAACATTTTTGGTTGATCTTTCATTGATTTTATAGTAAATCTTACAAA
CTACAACTGTGTCCCATTATCAAAGACTTACAGGTTTAAGGAGCAATTTC
ACATTGCTGTAGAATAAAGGGCTATTTGTACCATTGAGCTACATGTTATA
CCGTGTATCATAACTCCAAACTGCCCTGACCATCCTGACAACCGTAGCCC
ACATGCCACCTTCTCAAGCCTTTCTCTCTAACTGCTCCACCAAGCCACAT
CCTGAGGCCCCTTGTACACTGACCGTGCAAAAGAAAGGTGCACTGGGGAG
GCACACCTATCGCATGAGCGAGCATCGCTAGTTGGTGTTCCTGGAGGAAG
AAGACAAGGTTTGGGAATTGCTGGTCCGGTAGCATATAATGCCAGCGGTT
GAAACATTACCTGGGAGCTACTTTCTGAATTCTGTCATTGCTACCCTGCA
TTCCAGCTTGAGGACGATCTGTATTTCAAGGAGGTAGGAGAATAGGAAAT
GGTGTGGGCTTGTTTCGGTATTACATATCGTCATCGGCTTATTGCACTAG
GGAAGATGGCAGCGCATGGCAGCCTGGCAGGCAGCCAGTCTAACTTAGCT
GGACTTATACGATACTTCAAGGGTGTGCTGGAGATTGAGTGGACTTATTT
AAGTTAGTTCAGGATTTGGTTAACTTGATCAACTATCATATCTCTAAGCT
AGATATGGTTGTTAGCAAGCACCACTTAAAGAGGTTGCCATCAGCCTACT
GTTACTGCTAGGAATAAGTCTCGCCGTTGCTAGGACAGTGATACCTTGTG
TACACCACCTTGTTATCCAATGCGATCAAAGCCTGAGAGCATCATTCATC
CTTTCCTTCGATAATCCTTCCATAAAAGCTACTAACACTGGCAATGTAGA
ATTAATATCACCAACAGTTCTGGTTCATTTTAGTAAAGGTACTCTGGTAG
GTAATTAACACCATATATTAATGTTTAGCTCACTTATGCTGATGCATATG
CATTATTAAAACGGTTTTCACTGCTGCTAATTATTTTTAATCTGTTTAGA
GATAATTCATCTGGCTATGCTCTTGTTTCGAGTTTTCAAAATAATGGATC
TAGCTATAGACTTGGATTATTCTTCTGGAGATGCAGTGAGTTTATTTTCT
TTGCTCTGGTGCCTTAACAGATACATCAATGGTCTTGAAGCTTTAGGTGG
ATCAGCTTCGCTTGCACAATGTGTGGCTAGAGATACAAGTGTATGGGACG
ATACCCTTGACGCCCTCATTATTGGCATCAACCAAGTTAGCTTTTCAGGT
TGGAAGCCAGAGGAATGCATTGCTATAGGGAACGAGCTTCTTTCTTGGAA
GCAAAAAGGTCTATCTGAAAGTGAAGGTGCTTCTTTCTTCGTTAACATAT
ATCGTGAATGTTTCATCCTTTGTCATTTTAGTACCTCGTAGTATTTTTTT
GGTGCCCTGAAAGCATTTCACGTCATGTATGTAGGCAGTGAAGATGGGAA
GTATATCTGGGCACTAAGACTTAAAGCTACACTTGATAGAGCAAGGAGAT
TAACGGAAGAGTATTCTGAAGCGCTTCTTTCTATATTCCCTGAAAATGTC
AAGGTGAGAATTTGCCAGTTATTGTGTTCTCTTCCTATGATGGATAACAA
CTGCATTTTGTGCCTAGATTGGCTTGTCAGGCCACCTGATGATAATGTTA
GTCATGTGCTCATGCCTAAGTTAGGTTAGGAAAATTGTTATCTCATGTAG
TATTTTGTTTGTGGAACCGCCCCATCATGGGATTATTACCCCTTGATTTT
TCTGGGACTATCCCATTCCTCATTTTACTACAGACTATATGCTTTTATGG
GGAATGATGAATATAACTACTTGAAGCAATAAGTTCTCTACTATCACAAA
TAGCACCTTAAACATTTTGTAATCGTGTGGTTTACTTACATCTATAACTT
CTGTTTGGGCGGTATTTTCTATGTGATGTTTGACTATCGCACTTGAATTT
TTTTCTTATTTGGCTATGTTTTGAACTGGGATCATATGTGGATGTCTGTT
TCCGTAGGTCCTTGGGAAAGCCCTTGGAATTCCAGAGAACAGTGTGAGAA
CATATACTGAGGCTGAAATCCGTGCTGGGTAATTTTTTTTATCTAGTGAA
CCACAGTTAGATATTGCTGCATATAATCTGCGTAATCCTAACTTTGTATA
TACTTTCTAGTGTTATTTTTCAGGTCTCCAAACTTTGCACTGTACTTCTG
AAAGCTGTTCGAGCAGTAATTGGATTGTCTGGCTGGGATGTTCTTGTTCC
TGGAGTGGCCCGTGGAGCTTTGATACAGGTATCTTTTGGAACTAAGAAGT
AAAGCAGGAAGAGACTTGCGATGAACTTCCATATGTTTTGCTACCATGTT
GACAAATGTTCTCACTTAGCAAAATGCTACCGTTTTGAAAAAAAAGATAC
CAGTGTCACTGTTAAGGCCGGTCCTGGTCCCCGTAACTCTTATCTTGAAA
CTCTAGCAGGTAGTTAATCCTTTTGTTACATATTGCAATCCTTGTCACTT
GAAGATGTCAATTGTGCTATGAACAAGCTTGATGTGAACATTGTAGCCTG
ATGCAATGTGAAGCTTCAGTGGTTTCTATTTTCGCCATTGGCATAAAAAA
AGATTTACCCTAACTTTAGTGCCTCTACTTTAGAGTCGCATATAAAGATT
TATTCTATTTGTTTTGTATCTGTTATACTTGCTTTCTGTTATACATAATA
TATTTGTTTGATTTCATAAAAAAATGTGTAAATTTCGTAGACTTCATGCG
TTATTTAATTATGCTTGGGCCTGGGCCATGTGAGACATATTTGTGTGAGC
ATAGGCTACATGATTTTCTACATGACTTCATGAATTCTGTATGGGCTCAG
TCCAAACTGAAATATGGTCTGGCCTGGAGTTTATCAACCAGTCTAAAAGA
TATTAAAATTGGCCTGTGGCAACTGGCGACATTGAAACTTTGGTTTTGAA
TCTGATCATTCGAACTGTTTGGTAGGAAACTGTTTCTAGTGGTAAAATGT
ACCGGAATATTATCTTATCAGCCTATTATGGAATCCTTGATATCCTTTCT
AGTTGTATTGCAGTCAAAACTCATGCTTTTATTGCAATCGTTTAGGTAGA
AAGAATCATTCCTGGATCATTGCCTTCATCCATCAAAGGACCTGTGGTTC
TACTTGTAAATAAGGCTGATGGAGATGAAGAGGTACTCTTGGAACATCAA
ATGGTTGATCTACTGATCTTGTCTCCACAAATCACTCACATGGACAGGGT
TTTTTCTTTGTTTGACAGGTCAAAGCTGCTGGTGATAATATAGTGGGTGT
TATTCTTCTACAGGAGTTACCTCACTTATCACATCTTGGTGTTAGAGCTC
GTCAAGTTAGTCTTACTTAACCTATGTTCTTGTCCCTTTACTGGTGCCAG
TTCTGAAATATTGCAACTGCTGACACATTTCCAGGAAAAAGTTGTATTTG
TAACTTGTGAAGATGATGAAAGAATTGCAGATCTGAGGTTGCTCGAGGGA
AAACATGTCAGGTTATCCACTGTTTTCATATACATGTTTTTTTCTGGTCT
CCTACAAGAATTTAATCGAGATGGTACCAGTATAGGTCCATAACTTTTCT
GTGTGGAAACTAGAGAAAAAATCACTTTGATTTATTACAGGCTGGGAGCA
TCATCCAATGATGTTGACTTGTCAGTAGTTTCAGCTGAAAATGCCAGTGA
GGTATCATCAGAACCATCTAGTGCAGAGAAACCCTCAAATGAGCTCTCTT
TACCTTTGGTTACGGACAAGTCATCGTACATATCTGAGGTATGGTATTAT
TCAATATCATTAATACACATATTACAGAAATGCATGTCTCCTGTTTACCA
TTTTATGCTAGATGTTCCTAGTATCCTGCATGCTTTTTGAGTTTACTCGT
ACTTACTTTTTTCTATCCTCAATGGGACAACAATGCAGCCTAAAAGCTAT
ACTTCAGGAGAAAATGTCAATTCCAGTGTTCTGGAGCTTTCAGAGGCATC
AATTGAATCATCAGGTGCTAAAGCTAAATCTTGTGGAACTCTTTCCGTGC
TGGCCTCTCTGTCAAATGAAGGTAATATTTTTTTCAGTAACACTCATCGA
AGTTATGTGTAAATTTGTTTTCTAATTTTTTCTGTCGAAACTAACGGTTT
TTGCAAGATCATGGTTACTAAGAGGCTTAGGAAGTTAAGTGTGTTATCAT
TTTAAAATCAAGGCATTTTAAAAAGAGTGAGATGCTCTTAAATTTTCTTA
TTGTCGAGTAAAGATTCAATGAAGTTACTTGAAAAGCTGGGTTCAATAAA
TTTCTAATTAACAGAAAATAGTACTCCCTCTGACCCATATTAGTTGACTT
GGATTTGTCTAGATTCGCATGTATCTAGACATGTTTTAGTGCTAGATACA
TCCGAATCTAGATAAATTTGAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTAAT
ATAAACCGAATCATATTTTTCATATTCAACCAAACTACATCATGGGTCTT
TTTCTGCAAGTGGCATTGTTCTGTAAAATTGTTCATAATAAGTATAAATT
GTAGAATCTCGACACGCTGATGGTTGATCATCCAATATGTATTGTAGACA
TTTTTATGATGAAGATTCTGCTTACGGTTTGTTAAGTGAAAAAAATGATG
TAGTTAAGATTTCCGCCTAACATATCATAACTCAAGTAACAGAAGCGTTT
TCTTCCAGTTACTTCTGTGTAAATATTTTATTATCTAATTTTTTTTGCCT
TTTATCATTGGTTAGTTTACAATGATCAAGGAATTCCAGCAGCATTCAAT
GTTCCTTGCGGTGCGGTGATTCCATTTGGATCAATGGAGGATGCGCTCCA
GAAAACTGGATCACTGGAATCATATACCAGCCTTCTAGAGAGGATCGAGA
CAGCTGGAATAGAAAATGGTGAACTTGATGGCCTATCATCGGAGCTACAA
GCAACAGTTTCACTACTTACACCAACCGAAGAAACCATCAAATCTTTGAA
AACAATCTTTGCCGAGGATGCTCGGCTAATTGTCAGGTCTAGTGCTAATG
TGGAGGATTTGGCTGGTATGTCAGCTGCCGGGCTCTACGAATCCATTCCT
AACGTCAGTCTCTCGAACATAACTGCCTTTGGATCTGCGGTTGCACGGGT
TTGGGCATCACTATACACAAGGAGAGCTATCCTTAGCCGTCGAGTGGCTG
GCGTGCCTCAGAGGGATGCCAAGATGGCCATTCTGGTCCAGGAAATGCTG
GAGCCAGAGCTGTCGTTCGTGCTCCACACTGTCAGCCCCTCCGACCACGA
CACTAAGGTCGTCGAAGCCGAGGTTGCCCCTGGTCTGGGCGAAACCCTCG
CCTCGGGGACCCGTGGCACCCCATGGAGGCTCTCCTGCGACAAGTTCGAC
ACCAACGTCACCACTCTAGCCTTTGCGAACTTCAGCGAGGAGATGCTGGT
GCTTAACTCTGGCCCTGCCGACGGGGAGGTGGTCCGCCTCATCGTGGATT
ACAGCAAGAAGCCGTTGTCCGTAGACTCGACCTTCAGGAAGCAGTTCGGT
CAGCGGCTGGCTGCCATTGGCCAGTACCTGGAGCAGAAGTTCGAGAGTGC
CCAGGATGTGGAAGGCTGCATGGTTGGCAAAGATATCTACATAGTGCAGA
GCAGGCCACAGCCACTGTAGAGTCAAGAGTGTTCGCTAAGAAGAGCAAAA
TTTTGTTAGGTGAATAAAAGCATGCTGAGAGCCTGAAATATTGCGGATTT
TGTAATACGAATTATAAATAAGCCGGAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.