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GrainGenes Sequence Report: AA019572

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Sequence
AA019572
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019572
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAGGGGTCCGGATCCAGGGAATCCTGGTCGACGGAGTTTCTGGAATCCA
ATACAACGACCGCTGCGCTCCGCCGCGGCAGCAAGCGGGGCAAGGGTGGG
ACCTCTACCGCCGCGGCCGGATGACGACCCGGTCGAGGGGGCGCGAACAG
CAGCAGTCCTCGCGCTCCAAATCGGCAAGGAGCAAGCTTGATGGGACCGG
CGAGCGATTGCCATCGGAGGGTTGCAGGACAAGGAAAAGGGCCAAGCTTG
ATGGGATCAGCCGGCGAGTATCATCGGAGAGCTCCTCCAGGAAAGGGAAA
AGGAGCCAGGGTAGGTTGGAGAAGAATGCGGCGAAGAGAAATAGGCGGGA
GGAGGAGGAGGATGATGGCACCTGCTCCTCTGCATGCAGCTCCCCGCTTC
GCGAGCCTTACATGCCCGTGGAGGTAGAAAGGTTACCCGATGGCACTGAA
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GATCCTAGGGTAATAAGCTATTTAATGACATGGGAATGCACTCTTTCTAT
TCATAGTTCCGTCTTAAGTTATCCCAGTTAACTCTCTGCTATGGTGGCAT
GTATCATAGCTAGTTGCAAATTACATGGATTATGTTGTTCTTGTCTAGAA
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GCAACTGGTCTTTTTTGGTATCCAGTCTCTTACAACTGTTGTTTTAGGTT
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TTGAGTTACCCTCTTATAGCGATAAAGTGGAATGTGCTCAAGACATTTTT
GAGCTTGGAAGAAATGAATCTGTCAAACTAGTGATAAATCACGGTAGAGT
GGAATATTCAAATCCAACCGTGTATGAGCGGTATCACCATATGTATGTTG
AAGGTCCACATCGAGATCGTGAGGTACACATATATTCCACTCGAGTTATA
TCTAAATGTATTTTTAATGCTTTATTCGAATGTAACTTCTAATAGTACCA
ATTCAAATGTTGTAGTATGATAAAGGAGGTCCTCTCATTGACTTAGAGGG
GAAGATTGTGGGAATGATTGACAGTAGTCCAGAAAGGTCTTTTATACCCT
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TTAGTAAAGATATAAGTATATATTATGCAAGTATATTTATGATAGATCTA
TTCATATCAATATGTTACTGTAGTCTTGTAGATGATGGCATCTTTCTCGA
TATTGATGGCCAGACCTTAAAATGTTTAGTGGCGAGGATTGCAGAATGAC
ATTTATTTGTGACCCAGAGGGCCAGAGGGGTCCTATTTATAGCAAAAGAC
ACAAGGACATTGGGTGGAAAGCCATGTCTCTTAACTTCAACAATCCTTTT
CCATGAACCGCGATCATATTTCTAGGAAGGTGGCGTATCCACTAGGATGT
ACAGGACATAGGTTTTCTGATAACTTTATTGGTGTTGACTCTGTCAAATT
ATGTTTCTTATTTGAATTCAAGGTTACAACTTATAACATGCCCTTCTTTG
AGCTTCTTAAAACACTATTTGTGCCAAATTATTTAATCTAGTATGGTGTT
GGCAATTTATAAACATATTGGGCAGATGGTTTTAACCAGAATTGCTAATT
TAGAAAGGCTTACCGCTTACGTGCTCATGTGTTAATTTTTTAAATGTATT
TAAATTTCTTTTGTATAGGTGCATCCGTCGACCCCACCTTGGATTGAAAT
TTTCTGCCATCAGCCTTCTAAACCCTGTTCTTGTTGAGGATATATGGATC
GAACATAAGATTAAAGACGGTCTTATTGTTGAAGAGGTAGATACTATTTG
TTGTTGCTTTCCTGAGTTTACTTGTTTTGTCGCTTGTACTAAGGATTAGT
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GAAAGATTTACATAAAGGGCAATGAGAGTTTTACAAACCAAATAGCAGTA
GTACTACGCTTGTTACAAACAACTGAGGTCGTCGCCGCTAGGCACACTTG
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GTTGCTCTCTCTTACACTTTGCTAGTTCTCCACTCTGAGAAGAACCGCAG
CAGATTATGTGCCTCCTGCTAGCAGTACACCATCATGATCGGTGCACTGT
TTTCCTGGGCAATGCTTCATGAAACGGAAGGAAGCAGAGTCAGTCTTGAT
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GCACAACTACCGCGGTAATCTCTGCTACATCTGCATGCACACAACTGAAT
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TGTTTCGTCTGCCACCTTGCCTCCGCATACAATGGCTGTTTCCCTTTTGT
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TATACGTTAGCCGAATATTCTGTTTTACCGTCGTGTTCTAGATGGTGCTC
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CGTGATATTATTGGTGATCGCTTCCACCTCATTGCTCCTGGAACAAGCAC
TACAGAGTGCCCTGTTGCTTTGTTTCTGATTTGTCGGCTAGTGAACCCAA
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AAACCCGACACATTAAACCGACTTTCTCACAAAGCACTCTGATCTTTGGA
GTTAAGCTTCGAGAGTAGGGCTATCAAAAAAGTTCGGGCTTGACAAACTG
TGCGAGTTAGGCGCGTTAACAGCTCGGCTCGAGCTTGATTCGTCTCTCTA
ACAAACCAAGCTCGAGCCTGTTTTCGAGCTCGCGAGCTTAGTCGAGCCGA
ACTCAAACAGTTCGATAAAGCTCGTGATTTTTGTACAGTCGCAAAATTGA
GACTACTATTATTATTCCATCTGTGTAAGACCGCTAAAATAATTATGTTG
GCACTGTATTACTATTATATGAAACTCCAAGCCATTTCTTTTATTCCGTT
TTCAAGCTTTACTATTTTCTTGCTATGTAGCTGCATGTCGATGTACTAAA
ATTTTCTTACTGAGCTTCAACGAACAGAGCTCAAGCCTACTCGAGCTTTG
GTCGAGCCGAACTCGAGCTTAGATGTAGGCTCGAAGGTCAACCTAGGCTC
GCTCGAGCTCGGCTCGAGCTTCTACCGAGCTCGAGCCGAGCCTAACAATG
TTCGCTCGAGTTCGGCTCGTTGACAGCCCTATTCGAGAGCATTCGTAAAT
CATATTACATTGGTTAATTGGTCTGAAATATGTTCTTCTGGTTAGTTACC
GTTCAGGAAAGTAACTGTGCCGTTCAAGCCAGCCAGCATAATCCCTGATC
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GGGCCTGTTCTTATACTCCTTGACTTCGTGCTCAAATAGTGCTAGCAGCT
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GAGACCATCTGTTCTGTTGTTCTTCATTGTCCACCCAATTCCAATCTGCA
TCTCTCAGTTTTTTGATCCGATCTTTCTTTGGATGCCAGCTTGCCTTTAT
ATGGAAGTACCTGTTTGCTCTGGTCTCCTTCTCAGCCATTGCACCCAGGA
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CTTTCTTGACACCATTTGCTGGAAATATTGACATTTCACTCACATTTAGT
ACTTGTGCCAACTCACACTTAAGCTTGTGCACAACTCTAAAATGACATCT
ATTATGGAATGGAGGGGGTATTTCTTTATGCTATTCTTCTCTTTAATTTT
TTGCTGCTGTTTATCAGTTAGAAAACATGTTGCTGAGCATAGTGGTGAAC
AGTGGAAATGGCCTTAATTCTGATCTCGATGTGCAGGTAAGCTTTTATGT
TTTAATAGTGATTTAATTGATCTGTGAAGTTCGTGTTTTTATACGAAATC
GTGATTAGCACAATGTTATCACTAAGAAATATGTCTCGCTGGCTTTATAG
ATTCAGGTATACTACCCGCGTAGATATCTTCGGAGAATCAAAGTGTTGAA
TGTGGAGGTATCTGAAGATGCTGAATTTGTTGCAAGAGGTATACAGGTTT
TCTCAGCAAAGTTTTATTTAAAGATGATCCATATTGTTTGTTCCATGTTT
GAACTATATAAATTTGTCCATGTGCAGAGTTAGTATAATAGGCCCCAAAA
TATAGGAGCATGTATGTACAACAAATATGTATACACCATAATACGTTAGA
TAATAATCTAGCAAACAGTCTTAACATAGTTGAGCACTTCAAAGTTCAAC
CCGCTCTCCCATGTCCATTCCCTGCCCCCAAAGATCAAGCAGGCACTGGC
AGGGTGTGCCACAGTGACCGTGGTACTCCTTTCTCCTCTTACCTCCGTTG
TTCTTCTTGCTATAAGGAAAAATGAGGCGTGTAATGAAGCAGCGATATTT
GGAGAGAATGCCTCTGATATCCTTGCAGGTATTACACAGATGGAAGCAGC
TCATAGCGTAATTAACTACAACTTGAGCGGCAGATCTTAGCAACGCCTCT
CCTCTGGCAAAACTCGATTTCTTTTCCATTGGAAGCCAGGTTCCTTACTC
TCAGGGATTTTCTCAAAGGCCTCCTTTGTTTAGCTATCTATCAGAGCCGT
CGGAAGCCCAGATACTTCTGTAGCGCTGAATCACAAGATATCAGGCATAT
TTATGTGTGAACAAACTGGTGTATTTTTTGCCAAATCTGACCTTTTGGCG
AAACTAATTCCACGTCTGACCCCTCTCCGAAACTAATTTGGAATCTGACC
CCTGGGTTGGCGCCATTTTAAATGGCGCCGAAGTTGTGCAGTTCGGCGCC
AAGTCGTAGCAGCTGGGAGGCGGGCCAGAGGGGGTTGGCGCCATTTGATA
CGGCACCGAGGTGAGTTCGGTGCCGTATCAAATGGCGCCGACCCTCTGGC
CTGCCTCCCAACTGCTACGACTTGGCACCGACATGCATAACTTCGGCGCC
ATTTAAAATGGCGCCGACCCCACGGGTCAGATTCCAAATTAGATTCGGGG
AGGGGTCAGATTCGGTTGAAGTTATGAGATTTGGGCAGATTTGTCAAAAA
ATACCAAACTGGTTCCATTCCCATTGTATGACTCCATTACTCGTGGGGAA
CCCAAGGGCATGAATGCCGATGCGGAGCCTGGTATTTCAACATGCACCAC
AAACCATTAGGGCGCAAAAGTAACAAGAACAAGTACGGTCTCAATGTTCA
TTAACCCTGACAGAGAAGGTGTCAGAGCACACACACTCTATGATTCGTTA
CCCATCTTTGTCAATTAATACTCAATATGACCCCATTCAAGCCAACCATA
TGTGCCTTTGTCTTAATAAATCTTGATATCTCCAGATTTGCCCTTCTTTT
CTCTCAGATAGTGGATACATTAGTAAGCCATGAGAACTTTTTTTTTGCGA
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GCATTCTGTTCCTCAATAATATATCATCCAGAATCAACCAGAGTCTATTT
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ACTTCCTTAGTGATGTGTCACCAATTAGGTCTCAATGCTTTTGGTAAATC
CTGCTGTAAAACCGTCAATGCCCGGGATGCATGGCTTCATGTACATAGAT
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TGACTTCTATTCGTTTTGTGTAGCTTCCCATCTGGTCACTTCACCAAGTG
AGCCCAGGCAAGTGACAATTGCTTTCTTGGCATTTTTATTGCTCTGTCAA
CTATGCACGGTGTCTTGTGCTGTTTGTACAATAGAAAGAAGAGCATCTTT
AATAAAATGACAAAAATAAATCCCTGTACTTTACCTGCGTCTTACAAATG
GCTGGTCTTTTTGGGAGACACACTACAGTTAGCAGTCTTTCTATCTTTTT
GCTTTAGATATTTCCTGGGTTTTTTTTTAAGCAGACTAAGTGGGCTTTAA
CTGTTGTTATGCACAAAACACCCTCTCCTATACTTGAGGTGCGATTTTGG
AAAACATTTACGTGCTCTTGAATGTTCTGTATGGAGTATACCATGCAAAA
AGAGCGGCGGGGGTATATTTTCTTTGCATCTGTGTACTTTTTTCTCACAG
CAATATGTCGTGTGCTTTTTCTTTAACAGGACAGACGAACTTTATTACGC
CTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.