Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA015736

[Submit comment/correction]

Sequence	AA015736
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA015736
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCACCTCCTCCGCGGCGTGCAGGGTTCGTCTTCTCACATTCCTGCCGCCT CCGGGAAGCTTCCAGGCCAGAGAGAAGAGCGGGGTCCCCGGGGCTGCAGG GTCATGGCGCCGCCGTTCGTCTACTGCCCCTCCGCCGACGCCGACGACGG CACCGGTACCTACGTCGAGCCCTCGCCTTTTTTCCTACCGTCCTCTCGCT GCATCTCTAATTAGTGGCGGTCGTGCGCGCGTGTCTGCAGGTGAGAAGGC TCTCATGAAGGCGGCCATGGACGGCAACCTCGGCCGCCTCAAAGGTACCC TTTTCGGCTTCTCCTCTTCTCCCCGCCATAAATGCCCTCCTTTTCCCCCC CTTAGGACGGAGTTCAAAATCGGTCCCGGTATACTATTTGTGCCTGACTG CGTGTGCTATGTTCCCGGGGTTGCGGGGTCGGAGGTTTGTTCACAACTTC GCACAGGCTGCATTGCGGCGTCTATTCCCGCTCGCGTTTGGAAATATTTG TAGGAAAGTTCAATTTTTCCTGTCCTGTAGTTCACTTCTTTCGGGGATCT GTGTCTGTGGAATGGTTACGTGGCATACGAGTGTGTTTGTCGGATTCTAT TTTTTGTGATGCTAATCAAGGGTGTCTTGATTTGATAATATGCTATTTGT TTGAGGATGTGTTTACAAACATGGTCGGGAAAAAACTTTCACCGAGTTTT CGTGGAAATTCACTGAAATTCAGTAATTTCAGTAGACACCGAAATAATCA CCTTTCGGCCAAAATATTTCAGTCATTTCAGTAATACACATTGATCTAAA AAAGTTTTAGTTTTTTTGATGAATTTTGACAGAAAAATTCGCTACTTTGA CCAAAATGAAATCTGAAATCACTGAAAATCCTGAATTTCAATGATTTCAG TAGGAGGTGAAATTTTTCCGAAACTGAAATCTCAAACACATGATCTCATG ATTCTAGAACAACACAATTCTGATTAGCAGTACCTTTATCACAACAACTC AGGGTATAAATGCGACAACTTTTGACAATGGGATCCAATTTTCTTTACAT CCCAATTTGCAATGCAGTCAAGTACTATAAATCGATATGTTGTTAAAGTT TTAACTATGTAACTATAGACCGGTTCAGTTGACCTCATCAGATTCTAATG CATTGCCCGCATGTCTTCTTGTTTCTCTATCTTTCCGATCTTATTAATTT GGTATTCATTTCTGTAATGCCTAATGATCCTTCTTTGTTGGAAAGGTGTT GTAAAGAGTCTTACCAAAGGAAATGACGACCCGTCTGCGATTTTTTCTTT CAACACCGGTGGACTTAATGTGTTGCATGTCGCGGCATGCATGGGCCATC TGGAGGTTTGCAAGTATTTGGTGGAAGAGCTTGGGGGAGATGTGAATGCT CCTGGATGTGGAGATATATGTCTAGGTCATTCCCTATCTGTTTCTTCATT TTGTAAATTGGTGGCTACCATGTCAATGTTTGCCAGTGTGAGACCTGAGT TTGTGTTCATGATGTGCATCTTTTTACAGGCGCGACTCCTTTTATGAGAG CTGCTCAGTCTGGTGATGTTCCTACTGTCAATTTTTTTCTTGAACATGGT GGTGATCTAATGAAAGCAGACGACAAAGGACGCACAGTTCTCCACCATGC TGCGGGTAAAGGTGCTTCCCCTAACACACACACTCAACCTTAATTGCTGT AATTGGGTCCATTGCACTAGCGATCATTTACCCTACTATGCTCAGTTTGT TAAATGTTGGTGTCTAAACGACTTACGGAATCATCTCATTAAGGTTACTC TACTATGATCATTTACACAGGAAGTTGCAAGGTAACAGAGTTCATCCTTT CAAAAGGAGTGCCTGTCGACTTAGACTGTGGCCGTGGAACCCCACTCTAT ATGGCAGCTACAAACGAGCAAGATAAGACATTGAAGATTTTACTGGACCA CCACGCGAATGTATATGACCTCTACTGTTTCTTATTTCTTTTGATTAATA GTTACTTTGGACAGATTGTTTTTAGTATGCAAACCAGTTAAATGACATGG ACAAATATGGCTTAACCTGGGGGTTTCTTAGTTGCTTGTATTGAAACATA CATAGATATTGCAGTACACAATCGTTTTCTAGGTTTATGACATTGAATAG AGATCTTGAAGTGTGTTTCATTTGAAGGAGCAACCCATTCCAATTCTCAA ACCAAACAATCTGGATTAGATTTGATGGTCCACTTACCATCGGGTCTCTT GTAACACAAAACACACCATTAAAATAGTAGATTATATGATGGCATGATTT TTAATCTGTATGTCCTTGTTTATCACTTTATCTCAAAAGAAACTCTCGAG TTCATCATGCCACATGCGTTTTTAATACATACATGACATAATACCTTGCT TTCAGCCAAACATCATTATTAGTGATGGTGCTGGAGTTCCCCTGGTGAGT GCTCTTATTTACCGTTCTTTGAAGTGCGTGAAGCTACTCATTAAGGTGAG TTTTATCTTGATTACTAATCGTTCCTTTGTTTGCTTAGTCTACCTGTCTA CCATCTCTGCCATGTGTTGATGTGCACCATGAATGTTCTATTGCACACTC CATTTTACAGGCTGGTGCCGATGTTAACTGCAAGGGTTCCATGATTACTC CTCTGGTATTTGCTACAATGCAAGGAGGTTACACCGACTACATTAAGTTG CTACTGAAGGCTGGAGCAGATCCTAATATTCCTGATGATGTATGTTCTGT ATATTTGCTTGATATTTTACTGACGTCGTATGCAGAATTTCACTATATTC TGTTAATGCTTCTGGTTATACTATTCCCTCCGATCCAAATTACCTGTAAC AGTTTTAGGCAAAATGTTGCACAAAATCTGTGTAGGTCCAGTGAAACCTG CGACAAGTAATTTGGATCAGAGGGGGTACTGTTATTCAACTCCACTGATA ATGTTGGGGAGCTATTTGGCAATGAGTTTAGGTTGCTTTGTGTCCTTGAT TGTGCTAATGCAAAATCTCACTTGTACCTGCTAAATTTGTGTCATGATCT TCCATTCAAACAGTCTTTGAAGGACCTATGTGATGTTAATTCTTCCCACA GGATTTGAACTGTAGTGGGCGGGGTGACCTCACTGCACATCCAACACTGG AATACAGCTCAATTCCCAATGGTCTATATCAATAGACTTGTTATTTTCTG TTGATCATCTACTGAGTTCCTATGGAAAGGACCATGCCTATTCTGTTCCA GAAGTACCCAACATATATCGATATTTTTCATTTTTGAAATAACTTTATAT TGGTGCTTAACTTAACAGTTTATGAGATGCTGAAATCTCATTATTTACCG TTCTGGGTATGTTGCAGCATTCCTCAAATGTACTCATGCAGTAAACACTA TAATAAATGGACTTTTCTTAGCATACTTTTGCTGTTGATCATCCTGTTGG TATTCTGTTTTCATTCTTTTACTCCAAGAACCTGTTTATTTTAATGTTAC CTTCAGCCAAAGGACGAATTAAAACAAACCATATGCATAACTACTTCTTG ATTTTATCTATATGTTTACATGGGGACCAAGTGTATTCCCACTACAAATT TTTGTGGTGCCGGGTGCCCCAGTCTCAACTTGTGCTGAAATGCTCTTATA AACCTTGTAAATGCTTGCTGGGTAAATCTTTGTTGAATCATTTGATAAAA TATTCAAAAATCCTAGTTCTTTCCTGCGATGTTTTAATTTGTCTTTTCTT GGCTTAATGGACGTGGTTCTTCATCCCAATTGTTGGTATTCTCTCGTTGT TGAAACATTTGATAAAATCGTGATCCTGGTTTTCCTAATAATATTATATT CTCTACAGTGATTGTACGTTAAGTAGTGATCACGTTCTTTTGTTATAGTC TCTTTAGTTTCATTCTTTAATGGTATTATTAGTTCTTAAAAGAAAATGAC ATTTAATTTTTGTTGCCCAGGTGGGTACGTTGCCAATAGAGTATGCTGCA TTACGTGATTGCATAGAAGAGGTTGAAATGTTGCTTCCTGTGACTATCCC AATTCCAAATGCACCAGACTGGAGTGTTGACGGAGTAATTTCTTATGCGA AAATTGAAGATGAAAAGCCAATAGTATGTTATCTTCTGTTATCATGCTGT TTTCATACTGAGTTTTGCTTCAAAACTGAGCAATTATTTTCTTCTTCAGT CATTTGTGTCCATTCAGTGTGCCGCAAGCTGTTGTTACTACTCCCTCCGT TTCAAAATATAAGATGTTATAGGTTTGTGAAGAAAATGAATCTAGACTTC TTTTAGTGTGTACATTCACCCCAAAGTTGAGTGAACCTACATATTAAAAG AAGTCTAGATATATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAA CGGAGGGAGTATATGCATGACACCACATCTATAGTGAGGCATTTCGAAAA AAAATATCTATAGTGAGAGGATCACGACTTATTTTTAACAGTTTTTTAGT GAAGATCATTTTAGTACTGATAAGCTGAGAACAAACTATGGACTGTCGTT CAGAAAGGTAATATGATGAAGAAGAGATAATACCTCAGCCTGGCCTAATA ACAAGGCCGTCCAACAATAGACATCATGAAGACATGAACCCATGTAATGG ATGCACTATCAGTTCGGTAACAGAACATAATATGAATAACCCAGGATTGT AATGAATAGAAAATGCTAACCAAACTCTGGTTATTTGCTGGATAATAGAT TGAAGTCATTGAGGAAAAAAGTTACTGCTACTTCCATGGTTGAAAAGTAC AAGCGCCTTTACACCTGATAAGATAAACTCTTAAGATAAGGCAACTGCTT TACTATTTGCCAAATGATATTTTGCATGTAAATTGTACGGCAGTGTCAGT TCTGGTAACTGCCATCAACTTATCATGGTGTAGAGCACTACCGCAAATCT TGTAATGCTACAGAATAGTTAGATGCTCTCTGGCACAGCAAATTTATCTA CTAACTATAGGAAGTTTCACAGTAGTCTCTTTAATACCTCGACTTTTGGG TTTGGCCAAAATAAAACTTCGCATCACTGAATCTCTGAACCAATGAAACA TTCAGCCACACCGTTTTGGAAACTCCTAGGGCTTTTGGCCAGATTTTGCA CTTTGAGCAATGGCAAAATTTATTTATCATAGTAAATAATGATCATTTCC AAAATCCAAATATTTTATTCCTGTTTTTTCTACTTATTTTGTAGGAGCAA CGGCACCTTGAAAGAAGAACTGCCGTGTTCAAGTCACAGGCTGATACAGC ATTCAGGCAGAAGGAGTATAAGTTGGCATCACAGTTTTATAGTTTGGTAA ACCTATTGCAATTTATGTCCTTATCTATGATGGTTTAGTAGATATTTTTT GATGTTTATAGGAACCAATTGGAGAGCATTTTTCTTCTAACTAGTTTTGT GTTAGGAAACTCTCTACTCCCTCTGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGAC TTTTTCTAAAACACACGTGTCTAGACACCTTTTGGTCTATAGGTTCGCTC ATTTTGCTCCGAACCTACACACTAAAAGGCGTCTAGGTACATGCGTTTTA GAAAAAGGCTAAAATATCTTATAATTTGGAATGGAGGGAGTATTTGGTAA AACTATCTAACTAGTTTTCTTCTAACCATGGGCTCATTAGATAGCTGTAT GCCTGTACCATCATTAAATAGTTTTCTACTTGTTTGCATGTGTGAAATCT CGTGAATAAGCGTTCATATAGCCTATGACTTCTCATGTTTGACTGTAGGC AATAGATCATGGAGAGAGTGCAATGTTGTATGCAAACAGGAGTCTTTGTA AGCTGCTCATGGGCAATGGTGATGGTGCTTTGTCAGATGCTCTCAAGTGC AGAATGCTGCGACCTAAGTGGGCAAAAGCTTGCTTCCGTCAAGGTGCAGC TCACATGCTACTCAAGGTGGGTCTAGCTAGCCACTGTGTGCGCTTATGGC TTATTTCATTATTTCATATTGATCTTAGAGTCTGGTCACATTCCTTGATT TGCTCTGCACTGCCAGGAATATAAACAAGCTTGTGATGCTCTCGAAGATG CACAAAAAATGGAACCTGGGAATGCCGAGACTGAGACTGAACTACGGTAA CCTGATCTCTTCTGCTTATCTCTTTCGATTTCGAGTTTCTTCCAAATGCT AGAGTGCAAGTCCTTCCACACCTCTGAAGAACTTTAATTTGTTCTTATGT GCAACTTGTGCCCTCATATACAGTAAAGAGGAATCATGTAGTTATTGAGT TGCATGTTGAGGAAGTTTTGGTGGAGCTGACATTTCCATTTCATCATGTT GAATTCCTGCAGAAAAGCTAGGGAACTCCTGAAGAATCCTCCTGGTGATG GGTGAGCAGTGAGGCCTGGCGATGCGCATTGGACTGCAGGCTGCAGCATC TTCCAGTTTTCACTGAAGTAGAACTAGCAGGAACTTCTGATCCTTGTGTT TCGATAGGAACTAAAACTCTCAGGCCGGGGCATACCCCTTTGCTAAAGAG GAACCGTAACTCTACAAAAAGTCATGCGTATCTTGCATCTGTAGGGTAGT AAGACAGCTCTGTATGAAATAGTCTTGTCTGACCCTGGATTGTGCCGGCA GTATGCAAAAATTTCTTGGCTTCTGGCTGAGTATGTTTACACTTCTATTT TTTTTTTTGCGAATTGAAATACACTTCTAATTATTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.