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GrainGenes Sequence Report: AA046826

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Sequence
AA046826
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046826
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCACTGGACTACCCAAAAACAGCCATCCTGAAGCGTTATTTTCTTTC
TTCCTGTTTGTGTTCTCTGCAGATGGAATCCAGACGACTAGGGCAAGCTG
CCGCCCCATCTCTAGCCCGGACTTGGGCACCCAGCCGCCCCAATCTCAGG
CGGGATTTCTCCCCAGCAGCTCCGGCGACCCCTCCCCTTCTGCCACAACG
TCCACCCTTCTCCCCTCCAACCTTGTTCACCCTCCTTTCTCCCTCCGCCC
TCCACTCTGTTCTCCGTCGTGTGCAGTACCAAGAAATGGGAAGAAAAGCC
ACAGTCTCCTAGGAGGAAGCCACTGTATCATTTTCCCGATAACTATCATT
GCCTGCTCGTGGACTTGCTTCACGAGGGACAACACCTCTAATTTTCTAGC
CTGCTTGTACCAGGACTCGCCGCTGACCTTCAACAGCAGCTCGTCTCCAC
CCACAACCAATCTTGACAAGAGGTAGCCAAAGTGGCCACCGACCTTTCCT
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ACATCGATAGGAAAAAATAAAAAAATAGAGGGTATTCTAGACATTTTACG
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TTTGCTACTCCAGAGCACTTTAGGTGGAGTGGAGTTTAGAGGTGGAGTGG
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GGATCATAGAAGGTGATGTTCTTCGGAAGCTCTTGTGATTTTGTGTAGAA
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TATTTTTTACAAGACTTTCTAACAATGGATGTAAATATAATCTGGTGATT
TACATGTTTTAATCGAATTACTATGTGTTTGTGCAGATTTTTTGTTAATT
TGCATGAACCATTTTTGAGAACTGATATTTCTAAATGCTTCACACAGGTA
ATGCGTCATGCTGCGATGAATTTACCTTTTATTAGCAAGATTACACAAGT
ATATGATCAAAATCAGAGCTGTTCATATACTAAAAGTATGCGTATTTCTT
ATTATAAGCGTGTGCAAATATATTTTATAGACTTTTGCATATAGTCCAGA
ATCTGTAGTAAGGATTTGTTGTTGCTGCTTCAGCACTGCATTTTTACTGC
CTCTCTAATATTTATGGTTTTCAGTATAACAAAATAATTACTGTTGTGAC
AGGGTTGGGACAGGGTTTAAGTGAAATTTGGAAGTTCCCACCCGAGTCTG
AACTTCACTTGTCATGCTTGATAAACTACAGATATGAGAAAAGATGATGT
TCATCTTATGGAGAGCTTGGCATCATTGAAATGATGCCATTTTGGGGAGA
CTTGTACGCCACTTACATAATTATCTAGCTACTGTTCAGGGCCTTACAAA
TGGACATGTTACTGTATAATGACGCTCTCATCCGTGCTACTCCCGTGTCT
CCTTCTCAAAGAGTCAAAACCTAGGCGCCTCCGCTTGTCCGTCTCCTCCC
ACGTCCTCTCCCCATCGGCCGTCGCTGCTCTGGCTTTCTCCTTCGGGAGG
AGTTGAACCGGAGGAGCAGCGCTGCTCACGAGTCCTCCATCCCCACGTCG
GTCCTCCTCATCCAACATTGTTCTTCTCAAGGAGGACCGGATCTGAGGAG
CTCAACCTCCACCGGCCGAGCTCAACCTCCACCGGCCTGTTCCTGACTCC
ATCAGGACCGGAAACGGCGGCGCTCGCCCGCAGGTACGCCTCCTGCCCTC
CCCTATCCCGTCTCAACTCTCTTTCTATCTCTCCCATGTCACCTCCTCTC
ACTTATGGTGCTTGTTGCTGTTGTCTTGTGTATGATATTGCTGCTTGCAG
TCATGCTGTGTGTGTGGTGCTTACTGCTATGTGGAACTGCTGGTGTGTGT
GCTTACTTGCCAGTGTAGCGATGTGCAAGATCTGCTTGCTGGTTGCTGCT
GCCTGCCTGCATCCTTGCTTGATGTAGTATTCTGTGTTGATTACTTGTTG
GTGTGTGATATTGCGATATGTGCATTGGCGGTGGTAGAAAGAAGTGTTGG
CGTCACCATCCTTGAGGTTAGCAAGGCGGGCCCGCTGCCTGGCTATGGTA
CGCTCTAAGGATGCGAGGCCTAGGTAGGAGATCTTGAGTTGCTTGCGCAG
TTGGTTTTCCTCCGACGTGAGCAACCTATTCTCTTGGGCTTTGTCGAAGA
AAGATATCAGCTCGCGGGAGATCGCCAGCTTGTGCTTGATGTTACCTATT
GAATGGGCATTCCAGCTGGTCAGCTTTTTGCTTGATGTTACCTACTACAA
AGGGTCCGCCTCATCTACAAAACCCCAAGCCTCGGCCACGGTCTCATGGA
ACCCATCCATCCTCAACCAGAAATTCTCGAAATGGAACCTCATGTACATC
GCTGGCATGGGGAGCATTCCAGGAGAAGTGGGCAATGATCGGACACCACC
GACACTAGGCATATGAGGTGGTTCTCACCGTGCGCGTCTTCCCAGTCCGT
GGTGCAAAGCACGCGGTCGAGATGTACCAGGGTAGGGGGTGATTGCTCGG
TAGACCATGTGTATCTATGACCATTCAAGTAGGCCTCCTTGAGGGCGAGG
TCGTTGATGATTCTACGGAATCTTCCCATCATGCGGTGATTCAGGTTGTC
GTTCTTGACTTCTGCACGGTAGATGAGGTTAAAATCCCCATAAAGCATCC
ATGGGCCGGGGGAATCGGCCCGGATATCTCTCAACTCCTGGAGAAACACA
ATTTTCTCCTCGTCCTCTTGAGTCCCATATACTATCGAGATCCACCAGGG
GGGTGCCGGACTCGTAGGAAACATTGGCAGTGATGGCGTTGGTGGTGAAC
AGTGGGTCCATAATCTTGACCCTGCTCTTCCACGCAAGCAAAATGCCGCC
TCGCGTGCCAACAGCTGGCAGGTAGGTGTAATCGTCGAACTCCGGCCCGA
GAGTCTTAAGGACAATGTACGAGCACAACAACTCCACCTTAGTTTCTTGA
AAGCATACAATGCTAGCACCCATGGTGTCGATCAACGATCTAATGGCTAA
CCTCCTGGCTCGAGAATTGAGCCCTCTAACGTTCCAAACTACCATCTTAA
GACCGCGATCCATGGGAAAGAGATTGACATGGAGGAGTTAACAGATGGGC
TAAGTCTTGCTCGTGCCGTCAAAAAGGGCCGAATCGACCGGCGGCAGCAC
GGATATTTCTTGGTCCACGAGCTTGGCGATGGCTACCAACACAGATTGCG
GGATTAGCATCGCAAACATGCAGTTATAAGCCTTCATCTCCTTCGCAGTA
ATCTTTTGATCGAGCTCAATGAGCCCTAGAGTGCGCAAGATCTGGACCTG
GGCCATGTGCTTAGATTTTGGTGGGGCGCAACCCGTCTTCGCTGAGTTTG
CCGAACGACCGCGCTTGGGCGCGAAGTTTAGCTCCCTGGAGATGGCAAGC
AAGCGTCGATGTGCCTGGTAGCCGCTTGAGAAAGTCGCCCAGCGTCCAGG
TGGTTGCTGTCGAACCGAAGCGAGCACTATCGTGACGGTAGGTTTTCGGT
GGCGTAGCGAACCGACCTGGTGCCGTGCACAATTAGGCGTGGGCATCGCC
TGAGCGGCCTGGCACGACATAGGGAGGGGATCTCGCCTCCTCGGTCTGGC
AAAGCGTCATGGGCAGCTGCTGGACAAGATCCGGTGTTGACTGGGCCGTG
GGCGTGAGGCCCAAATCCGCCTTGAGCGGGCGACTAGAGGGAATAGGAGT
TCGCGACACGGGATCTGCTGGCTACTGATGTGCAGTAGTCTCCAAGGGTT
GGTCTGCCCCCATGCCAGCGAAAGAGTCCAAGGGCTGATTTGTCTCCAAG
CCAGTGGGAGCTTCTTTTTGCCCCGACAGTGGATCGACGTTGGAGACTAG
GTTGCTGGCCTTGGAATCCTGGACCACCGTGTTCGAAGATAAAGCTTCGC
GGTTTTGGGGAGGGGGGTTGTCCATATCCACATGGCCCCCGGCTTGGGCA
TCGTCTGGCGCCCTAGAATTTGAACTTGACGACTCGGTCGTGCCAGGCTC
ATCAGAGGATGTGATCTCTAGCTCGAAGGAAGACGAAGAGGTATGCGACT
CGTCCAATGGGAGCCCGCCAGCTATGCTTCTAGAGGGATCGGCGCGTCCC
GGATCTAGGGCCACCTAGGTGGTGGCCGCCCCTATGTCAGTCCTGACAAA
AGCGACCGCCAGCTATCGGTCTTTGTGCATCCAGACACATCGTCCCTAGG
CACGAGAGTGGCGGGGCCCACCCTGGAACGGCCATGGGCCCATGCTTTGA
TCGTGGGCGGTGCTAGTGGTAGGGGAGGCCTTGGCGGCGGCGACACCGAC
TGACGAATGTCTGACCAACGCACACCCACGACTAGGCTGTCGACCTGTTG
AGCACGGGCGTCTAGCGCGCACGTGAGAGCATTGCGCTCCATGCCATCAT
CATGGCCGGATTGGTGGGGGAGGTGCCGTTTTGTTGGCGCTTGCGATTCC
TTCGTCTCTGGCCGCGCCTTGGTTGCTGCTTTGCGGGCCCTCCCTCCATG
TTGCTGCCCTCATCTCCCTGGCTCTTGTCGGCATGGTTGGCCGGTCGTGG
GTCTCCACCGACCGGTGCGCTGCTAACCACCCTGATGGATATGGGATAGG
TGAGCTTAAAAATACGCAGTGACGGTGCCTCGGACTGAGAGTGTGCTAAG
ACGAGCTCGACCACCTCGAGGATGGCCTCGCCGTGGATGGTGGTCGGGTT
TGGCGTGCGCGTCGTCAGGCGGAACGTTGCCATGTCCGTGCGCGAGTGCA
TGTCCGGGTGCAAGCGCTCCACCCAATAGCTCTTGTGCAACAACGCCTCC
ACCGTCGACAGGTTCTAGGAATTCGCGGGAATGCCACGGAGCTCGAGCTT
GGCGCTGTAGTCCAGCATGCCCACACTGGCGTGAGCCAACTTGCACCAGG
GCCTGAGCGAGAGGGTGAAGCCAGTGTTCTCGTTTTGCCGATAAAGTGGT
CGTTGGCGATCCGGTCCTTGATGGGATTGCATGTTGCAGATGATAAATGC
TACATCTACGGACAGATTCTACAGAATAGTCTTACGGACTAACAACCTAG
GCGTAACAGTTTGAGAACGTGGTCCGCACTTTCAGGAAGAAAAAAATTAG
CACCAAATCGTGTGGCTCCACGTAATCCCGTAAGCCCAGTCCGTAGGCAA
ATTTCCGTACATACAGCATTACTGGGAAATCCTCTGGGTGATGGAGATGG
ATGGAAAAGTCGCCTGCTTGCAGGTCAAATTCTTGACGAAGCAGCGCGGC
CACGACGTCGGAGGCGACCGTCGGCCTAGTTCCTGTGACAGTGGCCACCA
TCGCGCGGCCTCCACCATCTCAGCGTAGCGCGACACGATGACGCGGGCCG
GACCTAGAGGGTCGATAACTGGCGTCAACGTCGCAGCTGCAGCTGTCGCT
TGCAGAGACGGGGATGGCGCCTGCATCGGCGGCGCACGTGGCAAGGTCGG
GGCGAGCTGGGGCGGCGGAGGTGGTGGGGGCAGTGACAGGCGCGCCTTGC
CTCTGGGACGGACGTTGGGCTGCCGCAGGGGCCGCCACCAGGAGCCGCGG
AGGCGCACGACGCTCGGGCGGCACGCGGGAGCGGTCGAATTCCCTCTACT
CCGTCATGCACTGCCTGGAGTTATGCGTAGAGTACTGGCAACGACGACAG
TGCACCTCGTTGATGCAGTCCTGCACCGGGTGGCCGAGCTCAAGGCAGCG
GAAGCAGAGGCCCTCCTCCTCCTCGGGCGTAGGGGTCCGGCGACGAGGCG
GCCGGTGGTTGCCTCCTGCGTGCTGGGGACGCCGTTGTTGGTGATGACCA
CGCCTTGGCTGCTATCAGCCTTCGGCATCTGCGCTGTGGGTACCACATCG
GCAACGCGATGGACCTCCGAATGGGGGCCGAGGCGGGTGGACAGGGTTTG
TGGCGGCGACCAAGGGCTGTAGGGGTGGAGACAGGGAGGGAGGGAGGGGA
AGGGGGTGGGTGGGGAGCGGGGCTAGAGAGGGAGTAGGCTACCGGCGAGG
AGTTCGACGGCGGCGGCTAGGTCACTGGGGTGGAAGGAGAGGGAGCATGC
ATCTAGAATCGTGCATGTCCATCTCCGATCCTCAAGTCCTATCTCTGCAC
TTCAGAATTTGGTATAAAAGAGTGAATGTGATGTTAGTCCATAGAGCTCT
AATTTATGTTAATTTTTTCGCAAGTTACTTATTCTTGTACCTGTTTACAT
TATGTTCAGATTCATAATGGAATTATGGCTTTCCCTTGATGAAATTAAAC
AAAGACGGTGAGTGATCAGGTTTTTTATGATGTTCCCTTGCTTGGAGAAT
AGTACATCTTAGTAAATCATATAGAAGCATCTCATGCATTGCTAGCTAGC
GCTGCACTTCTTTTTCCATGTTTTTATTCGGTTTTAATTCTGTGAGCACT
CTGCTTTTCTTTTTGATCATTATTTTCTCTTATTGTCTCGTGTATGCTGA
CACTGAATTTCTCGAGACAATGAAGATAGTCAGCTAGAACTCCTGGATAT
CCTTCAGCAAGGACTAAGGATCTCTGTCTCGTTTTCGAACTTTGATCTGT
TAAAAGAGTCATCAAGCAGTGCTCCTATTTTAGCATTACTCCATTGAATA
ACTAAAATGACTATAAGCTGCCTAGAATCGTATATGTTAGTTGACCTACG
TACCTTTTTTTTATGTATGCCTGATCACATGCTTTTGAGATGGTTGGATC
TATATCGAATTATTCCTAGAAGTTTAAATATTGTTTACCTTACTGCAGAA
ATCTTTTATTTTCTTAAAACTTATTTGATTTTATTCTGGTTGTTTACCGT
TTGATTTTTTTGCTTGACTTATCTAGGTGTTCAAATGCTTCAGATTTCAG
TGGCCATTACACTGGATCTTATTCCATATGATTTTGCTAGAGCAGATACA
AAGAGAAGTAGTTGAAGGTAAATTAAAACTCAAAAGATTACTCCGTTGTT
GCCTATTTGTAGAATCTTTATTTCTTTTTTCCCCTAGAAATAGTACATCG
AGCAGTATTTAACATTCCAAGATAATCATGTGTAGGCTGATGACTTTTGA
AATGATGTGACCTTGCCATATTTTTTTTGTGGTGAGCTTTCATATTAGAT
AAATGATCACGCTGCATCATTTATATATATATACCTATTACATAACTGAA
GTTTTTCACCTGTTTAAGTGGAAATAAATATTGCACACGTTGAAATCTGA
TAATGCTACCAGAGTTGGCTAACCCGCTACCTTATGGTTATGATTTACCA
GGTGTAAATCCCATAGTGATGCCAGTTCTGGTTAATCCATTACATAATGA
TTATGTTCCAGTTAATGAATATCAGATGGTAGAGCCAATGGTTTTCAATC
CTCTGCCTGCTGGGAATATGATTGCGGTGGAAGAGCTGTTTAACCCGCTT
CCCGACCGTGATCTGCTGTCTGAAAACCCTGTCACGATGACCGTGAAAGT
ACCGGTTACCCCATTTACTCATAAAAAATATGCACCAGCTACTGTAAATC
AGACTGCAGCCAGTGATGTTTACCTTGCTGCCTGATTATGTTTTCCAATT
AAAAATCACAATTTGTCTAATGATTCTATGTTCTCTGAACCAATCACAGT
TGATACTGCGTTTACTGAACCCCACTTGCAAAAGATTGGCCGTGTCCATG
TTAAACGAAATACCTACTTCATTACACAATCACATATACTAAATATTATC
TTGTTTTAGTTTATGTAGAACCAGATAAAATTGTATCTTATTCTTCTGTA
TGTGCATATGTACCAGGACTTATCAAGCACAGGCAATTTGCTGACTACTC
CAATCGTAGGTCCAAGTAGTCCACATATTGTTACATCATCATTTGACAAA
TTGTCAGGGACATGGACAATGTAAGCCTTTTGTATTTGTCAACAGTCCAA
GTATCTTTTTCTATGTGGTACGTTTGTGTGTCAGTTAACAGTCAGTATGT
GAGTACAAGAAATCTGGATTGAATAATTGCTGCTCAAACTACCTAATAAC
TCCAAATAAAAATTTCATGGTATCCATTTCCTCATAATAAGTACACCAGT
ATTTGTTGGACATGCTAACAATTGTGAAGTTGTCTGCATGGTACCAAGAA
GTCTCCGTTCAATTCTGTTTACTAGTGGTAACTTCTCCCGTTTTTTACTA
CTGATTGTAAGCCTTTGTACCCTGTGTACCATTAGAATAAAAAATTTAAT
AAAACAAAATATTGCTCCATAAACATGGGATAAATCTGTTAGCAATCTAA
TTATTTTGTTACTGAAGTATGAGCTATAAGATGTCTAATTGGGCATTCCT
TTTGTCTTAACAGATTGGTATGGCTCCTTTCAAAATTGGGGAAGTTGAAA
TGGGGTGATAGTGTAACTGAGCTAAACTAGATATTTCCTGGTTGCTGTGA
TGAAAGACTAATAGTTTGTACTATCTTGGCGCTTCTCTTTCATGGTAGCG
CCCTGCCACGCCAAGCGTGTCCGGTGGCTCCCATCAAGTAAATTTTGTTG
TCTTTATGGCACATTTTGCTATTGTATACTTTCTTTCATCTCTCCATAGG
TGTGTTAAATGTTCCATGTAAAATCTAGCCTTACCTTATGTTTAAGCCAA
CAATTGTGTATTAAACTATTAGTAACTCTAAACATTGGTTAATGGCAAAC
TAAAATTGTTGGGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.