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GrainGenes Sequence Report: AA042957

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Sequence
AA042957
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042957
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCACCCCCGCCCTTCCCAGGACGCGACGTGGTTCTGGCCTTCCGTTCCG
TGGGGGCCTCGTCCTCCCCCTCCCGTTCAGCCATCCCCCAGTCAGGAAAC
CGCCTCCTTCCCCACTCCCCAGTTCCCCTCATCTTCCTCTCCCACTCCCC
CGCTCCCCACTAGCAACCCACCCCGCCCTCCCTGATCGATCGCTCTCCGC
CGTCCGCCGGCGCCATGGAGTCCAACGACTCCAACTCCGCCACAGGTACT
ACGCGCTGCCCCCTTCCCCTCGTTGCCTGATCGAACTGGATTGCTGCCCG
GAAGCAGCTCGATCGCCCTACTGTCCGTCCAGTCGGATGCTCCCGGATCC
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TCAGTCTGTCTGTTGTGAAAATACAAGCTTCACTGCATATCACGCCACAA
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CGAGTCTAGGAACTGGAGCGATTGACCCTACAAAAGTACACTCGGCCGAT
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CTAGAAGAAAAGATAAATCTCTTGCTTCAATATGCCGAATGTTCTGGTGT
TTTGCCACCTTTCCGTTCCTTCAGATATTTCTCTTCTTTCGAGATTTACT
TGGGACATGCTGTTATTCTTCAATTGTACTACTTTATGATCATGTACTGC
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ATTTATTACCGCTGTGAGGACAGACACAGAGTAAGCTTAAATTTTCTGCT
TTATATCTGGTTATGTATTTATGTTAAAAACGGTCGCATAATCTCCTCAC
ACCGCCTGCAAACACTAAATCATTCCCTAACTGCTGACACGATGATCAAA
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AGAGAAAACATATAAATATTGAGAATAATTTTTATGAATGTAAATATTTT
TTGTCAATGGAAAATTCAGCTATGAGAGCTTGATATGACTTTATTCAGTT
GTTTCTTCTAAAAACCAGTTTTGTTTGTGGCCCAAGCTTTTTAACTTCCA
TGAACTTGCATTATCATTGTCTCATATAAAGTGCTAATTTGATACCTTGT
GTGAGTTCACGAGTTGGATTTGCTTATGTGCCTTTAATAATATTTGTAAA
TTTATTGGGGTTCAGTTCATCAAACAAACATCTTTACAAATAGTGTTTAT
TCATCTTGAAGCTAGAATTCTAAGCATATGTCTCAGATGTGGCTTTTCTG
GATGTGCTATGAACTTCTGATGCTTTAGTCTTGTGTGTCCAGATTACATT
TAGCCTTTACTGTTATGTATTCATGTGTTGTTAGTCCAGTATTTTAGTTA
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TATAACATACAGGTTCAAAGACTATCGTCAACTTCAACTACACTGAGGAG
GTTGCTAGTACTTCCAGCATTCCAGGACTGTCAAGAGAATAATGGATTTG
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TTAAGCCTGACTGTTTGGGATTTCACTCTCCCACTGACACCTTCCTTACC
TGCTGTTTTTGGTGTATCCTGGCAATATTCTCTTTTAATATGCTGTATCG
TACCGGTATCATCATGATATAAGAATAACTCCACATGCCTTCTTTGATAT
ACATGCAGTTTAGAATTTATGTTTGAATTGTCTATGTGGGTATGCAGCTA
TCATGATTCTACATTTGAATTGTATTTGTATGCATTTTTTGTCCTTTAAC
TATATGTTAGATATCGGAAACTGTCATTGAAGATCGGTTCTGTTTGGAGC
ATGGCACCGAAGGATGGTATGATGCGTTGGATCATCACTTCAGGTGGCTC
CTCCAGTACAGAATTAGTCCATTTTTCTGTAGATGGGGCGATAGCATGCG
CATTCTTGCATACACATGCCCTTGGCCTGGTAATGCAAATTTTCTTAAAG
AGTATGTTGCTTTATTGTAAATCTTCACCTGATGTGATTTCCCACTTTGT
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CAAGACTTGCAGCATACGCTGTACCCTACGCTCCTATCCTGTCATGGTAG
TTTTGGAATTTCTACTTAATTTTATGACAGCTTGCTTACTCCTCTTTTAA
ATATTAATTTTGCTTCTTTTTTGATGCACAACAGTACTGATGCAGCAAAA
AATTCTCTGCGAAGAGAGGTTGAAATCTTGAAAACAGAGGCCCATTGGTC
TAAAGCCTACTTCTACTTGTGGGATGAGGTGAGTGGTTTTGCTTCTATGC
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CCATGTGATTTCACTTCAAATTTCAAATCTCAGTAGGGCCTGCCCGGCTC
TATGCAGTTGGAAGTTGTAACTATATTGTGGTTACGATTAATAGAAATTA
TAGAATTGCTTCAGGTTAACATCTTCAATAGAAATATAGTCCCTTTATTT
CAATACTTGGCGCTGCATAAGTCAAAAGTGCGAACTATGTGAAGCAAAGC
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GACCAATTTATAGACTGAGCTTGCAGGTATTGATTATTCCACCAGTTTCC
GAAACATCCATGAGACTCCTGGCAATGCCACCAACCATGACCAAACATCC
ATTTTTCCGAGTCTGAAATATACTAGTCCATATCACACATGTATGAGTTA
TGTGGCATGATCAGATTGTATACGTAAGATCAATTCCAATCCAATCATGT
GGGTCAACAGCCTGCAGAGCCGATCCTGCAAAATAAACCTAGCTCTTCCG
CCCTGTGCTGTGTCACAGGAAAAATACGCACGACACATAAAAATTTCAGT
AGAGCCGATCTCATAATTTCCTCTACCGTGTCCCAGCATAGCCATCCTCG
GCACCTCGAGTAAAATTCATCCATCCTTGGCACCTCGAGTATTACTTCCT
TGAGTGAATTCCACATCAATTATATATATCCCCATCACATACATTAAAAA
AAAATGCATATTTCCACATTGGTTAAAAAATAGACATACTAACCATGTTG
AGTAAATGTTAAAAGCCACATAAATGTCCTACAGTTAATAGTTGCTATTT
AGGCATTTTCTTAATTTTGGATGATGGCAATTGTTGTTATTGTGTAATGG
TGCCAATGATACACGTCGAGAACACTGAATGGGCTACTTAGCACATGATG
AGTGGTGCAACGAATAGCTGCACAGAATCATGAGAAATGTCCAGTACTTA
TTAAATATGCAGGGCAAGTAGAACATGAACTGTACCACAAAACAATTTTT
CTTATAGATCACAACAGTTACATGTAGCAGCTTCTTCGCCTCTACCTCGA
TGACACTAGGAAATGGCCAAAAGGCACTATTTTGGGAAGATCGATGGATC
AATGGCCGCGCCATCAGCGAGATCGCACCATTCCTGTACAATTGCATACC
AAAGCGCCGCCAGCGAACCAGGACAGTTGCCCAGGCCCTGCCAGGAAACA
GCTGGGCCAGGGACATCCATGGCGTGATTGGCATACACGAGATTGGCCAA
TATCTCACAATGTGGCGCTTACTTCAGGACATAATCCTTACCGACGAGCC
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CATGCTACCTAGCCACCTTCCAAGGATCAACTACTTGTTACTCCTGGAAG
CTTATCTGGAAAACATGGGCACCCGCACGAGTCAAATTCTTCCATTGGTT
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CCTGTGTGACCAAGAGCCAGAGACCATCCGACACCTTCTGCTGACTTGCC
CCTTTGCTAGACAAATATGGCATGAAATCCTGGCCTGGATACGGATGACA
GAAGCAGCACCAGACCAAGAACCATCACTCATGGACTGGTGGCGCAAGGC
AAAGCACAACACCCCCAAGCAACTCCAGAGCGCGCTCGCATCCACAGCCC
TCATGATCCCCTGGATGATCTGGAAGCACCGGAATGACTGAGTCTTTAAC
GGCGCCCAACCATCCGTGCCCTCTCTAGCTGCAAAGATCAAGGAGGAGAT
TAGCTTGTGGGCACGAGCAGGAGCCAAGGGTCTACGGGTTGTGCTGCCAT
CCACCTGGGATGTGCACTAGATTTTTCTGTTATTGCCTCTGTATCTGACC
TCCTAGTGAGGGTGTACCTTTAACCCTACCTATTCAATGAAATGAAACGC
AAAGGTCCTTTGCGTTTTCTCTAAAAAAGTACTGAGTGCGAGTGCTAATG
GTGCAACTTACTTGTGAGTCATGATTCCTTGGGAAACTTTATAGTGAGTC
TTATGTGAGTTGAAAGTGTAGATTCGGCCTTAGATGTGCTAGTAATTGAT
GGTTGCACCTCAGCATCTTGCGCCTTGGGAGATATTGTCTGGTACTCCCT
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CTATATATAGGTTCACTCAACTTTGGGATGAATCTACACACTAAAAAAAG
TCTAGATTCATTTTCTTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACAG
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TATAAAAATCTTACTAGCGGTGTTCTTCCTTTGCTTGTTCTTCATCTGCT
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GAGGGGGCCTGGCCCGCCCTCGGAATCTAGGAGTCAAAACTCAAAGGGAA
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TTTTTCAGCCATTGAATATGGAACAGTATGAAGTGATCCGCAACATATCT
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TAGCACTAACAAGACACAGAAGAAAATGGTATGATTTCTAAAATTTACTT
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TGAAGGTGAATTCTTAGTTATTGCAAACTGAATCAACCACAGGGTTGAAT
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CATCTGATTACAACTTGATTGGGATAAAAGGCATGGTTGTTGTTGTAACG
TCTGATTACCCTGCTTTTATTAGATTTTATGGATATTTATATAATGATTA
TGGCATGTGGAAGCTGACCATGCCTGGGAAGCCTTATGTTTCTCTAACAT
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TTCTGTAAACATAAGTAGACCAAACAATTTGAAATTATCAGTTCCCTGTT
TGAGAATTTTTTTGTGCTGACACGTAATTGACAATTTGATGAAACTGACT
GCTTTGCTACATGTTGGGGATGTGTTGGCACTATGTCGATGTGGGATATG
CGACATTGTTGCTATTAGAAGTATTGGTGGATTGGTGCAAAGTGCAAAAT
AATGAAAGTGTCATACATTGTTCAATCTTGGAATTGTTAACAAAAATGCA
TATCTTACAGGACTAAAGAACCATTTGCATCACTTATTTTTTGTTTTCTT
ATACAGCGAATGGGTTCTTGGCACAAGAGAAGACTTAGTGAAGGATATTA
TTGCCGAACTACGACCTGAGCTTGGTGAAGTAACTACAGATTCTGTCCTC
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CAACATTCTTGTTACTGCATCGATATTCTGCTTCAAATTCTAGTAAGCAT
GTTTTCATTAAGTTACACCATACTTTTCTGGATAATATTCATTGCTCATG
TATTTTTATGGAAAAACAACTAAATTTGAAGTTGTTGGATGATATGGTTC
TGTTTTGTTCTCATCAGTATTTTAGGGTGTGCAATCGCCAGTCGGCATGA
TGCTTACTGTTTAACATTTAACTTTTTGAACTATAAATCACCTCAAGTGT
CCTGGTCAACTTCCTTAAAAAACTGTCTTGGTCAATGACATTTTATACGG
GTTTTTTCTCATACAAAGTGGTTTTATGAATTTTGAAATTTCTCTCAGGT
GTGCATGTATATGAAGCTCTGTTATCTTACCTTCGTGACTTGTATCTTGA
TGAAACTGTCTCGATCGTGTCTAGGAGTGGTGGACATATGTTTGCATGGG
GCCTTCTGATCCTCAACCAAATTGGCACCTTGGGATGCGTGGTACCCAGC
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TACTGGGGTGCCAACTGCTATGAGAAGGCTATGATTCCAAGTGCTGAGGT
ATGCTTTGCTACTGGAAAACCTCTTAATATAATGAGCTGTTTTTTTTAGA
TCGATGAATATAATGAGCTGTTACTAATGCATGACGGGTATGATCATTTT
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GTGACATGTGAGGTGAAAGTTTGAAAAATTCCCTGGTTCGACCACCATCA
ACATAAAATTCCAATGCCTTTTGGAGTTTGTTCCTAATACATCGAACATT
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GGCATTTTATAGGAGTTAAAATATATTGGGGAGGGAGGGAGGGGTTGATG
AATTTAAAACTATCCCTTCAAAGAAAAAGTTCTTAAGTTTTCATGTAAAT
TTGTTGCTTGAAATAAGAAAAATTACAATATTTCCACAAATAGGCATTTT
CACCTTGCACATTTATTTACTTCTTAGGATATTCATATCCAGCCCATTTT
CCAAGATGCACAGTTTTTGAGTTGCAGCGTCTATATTTATTTAGAAGAAT
ATGCAATATTAAATTTCCAAAGAACAAATGCCTGAAATCTTTGTTGTTTT
AGTTCATGTTTGTGGAAACCACAGAGGTCAGTAAGCCCTTGGTATTTTCG
AAAACATGACAAGATTCTTGTAAATTCCAATGTATCAACTACCATCACTA
TCGGTGGCAGTTTATACAGATATATTCCTAGTGAGCTTGATTGGGAATAG
TTAGTAATGTTTATATTTGGAGCTCATGTTAAAAATCTTACGGGGCTATT
TTAAAGAAATATTACTTACACATGGTTTGGATGTTGAACTTCTATGCATA
TCCATGCACGATTTGCTTGAAGATAAATTCCATTCAGTCCAGCAGTAAGG
CATTGTAATCAAGAAAACATGATTTAGGAGGCTTGCTTGCTCATGTGATC
CTTAATAGTCAGATTAGCTTTTGATAAGCAAAGGAAGAGAATTTGAACAA
GCTATATGTTGGCGTTGAATAATAAGTATAGTTGTGTGGAAAGTGACAAA
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TTTGAACTGAACTTTGAACTTTGATGTTGTTATACAATTTGACATTTCAA
TGTATTATATCCTAATAATCAAAACATGTACTAGTATTAACATTGTTATT
CAGACTTCAAAGTTTATTTTTGCACTTTGACTTGGTATATCGTCCTCTAT
AATTCTACATTGGACAATGATTATTTTGTTCTTTCTCTCAAACTTGGTGT
GGTTGCAGATATGTTTCCGACGTGGCCTTCCTCCAGGTGATGGCGTTCTG
TTTTATCCTGGCGAGGTGTTTTCTTCGTCACATGAACCAGTTGCATCGCT
CAGGCTGGAACGCATTCTCAGTGGCATGCAGGTGATACTTTTCTGAGAAT
GTGTGTCTTCTTGATTACAGTACAAGCCTATTCGCAGCCTTAGGTGTTAG
AATCGTTTAGATTTAGATTTTTAGTAGTCCCGGAATCCTGAAGCAGGAGC
TAAGCTAGTTCATTTTATCTACTTCACCTTACTCTGTTTCCAAGGGTAGA
GCTTCCATCCAGAATGGCTGTTCAGAGACATTATACAACCAAAAGTGGAC
CTTCCAGCCTTTCGCTCGTTTAAATTGATTTTCAGTACATAGCTATCTGA
CGCGGATAGTGCAGTTCTGAAAGTTTTACGCAGTAGCTCATAAGTATGTT
TGTTGATATTGTGACTGCAGGATATCGAATACCTGAACCTCTACTCTTCA
AAGTATGGCAGGGAGGAAGCCCTGGCTCTCCTCGAGAAGACCGGCGCGTA
CCTTGGCCCGGATCGCTACACGCACGATCATGGACCTGTTGATGTGATGC
GCGGCGAAGTATACCGGACTTGCCGCTCTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.