Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA010326

[Submit comment/correction]

Sequence	AA010326
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA010326
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGAAACCCGCACACATGGACTCCGCCTCCGCCTCCTCCTACAAGCTGCA GCTCGCCGTCGCGGCGCTCGTGGGCGCCTCCGCGGCCGCTGCCTCCGCAT ACTACCTGCACTGCCGCGCCGTCGCGCAGCTCAGCGGCGACATCATCCGC TCCTCCTCCGCCGCCGCCAAAAGCGGCCGCCAGCAGCGGCGCCACCGCGA CGCCGGGAGCAAGCCTCCTCCCCCGCGCCGCGCTGCCCCCGGATCCTCCT CGCTCCCCGACCTCTCCTCCATCTACGCTGCCGGAGGCGTCGCCAGGGGG TACCCCGTGGGGGAGGACTACGACGACGATGAGGAAGGGGTGGGGCCGTA CGGTGACGACGCACTCGCCGCCGCCGCCGACTGCATGCAGATCCCCCAGG GCTTGCCGAGGCTGCAAGTGGGGCCCGAGGGTACGTTTGTCTGTACCTAT TTACAATTGCTACACGCGTGGGCATGTGGCGGCTGCTGGGTGTGGAGCGG ATAGGATTGGGGATGAGTTGGCTTGTGCTTGGAGCTAAGCTAGGCAATGG CTTCTGATTGGGGGCAGTTCGTGTGGTTTCTTACTTGAAGATGAAAACCT TTTTGTAACTTGGTGCGCTTATCCCCTTTGTGAAAAGGCAACTTGCTATC CTTATTAAGTGCTCCTGCGGTGAACACTCAGTGACTTAGTGCTGCAAATT ATATGTTCTTAGAACTTGCAGTGCTAGAATCAGTCTAAGCTTTCCGGTTC CTCACAAAAAAATTAAGCTCTCGGTGCCATGAATACTGTGTGTACCCTGT ACCGGAACTGCTTCAGATATAGAATGATGAGAATTAAGGATACTAGTATC TATGGAGTGATCCAACGTGGGGATGTCACTAGTGATTGCTTATACAGAGA GATGTATTTATATCTTCAGTGTTTGATGTCAGAGTGAGTAGTTATTTATT TCTTTATATAACCTAGGAAGCTCAGACTAGTACACCTCCAGCTATGCATT CAGTATATATTTCTAGTTTCCTATAAACAAGTGGGTGCCATTTATGGAGG GAGAATTTCCCCATGATGCAATAACATTTGTTTCTGATTGACAAAGGAAC CTTTGGTCAAAGGAATTGGTATGCCTTAACCTTGACCAACCTTTTGGTTC TTTGTTAATGTTTCAACTAGTATGTTGATAAGGTCAGTCGGTTGTGCAAT GTGCACAGCTGCTCATCTTTACATTTCCTTTCAAATCAATGATGAGAGTC CAAACTTTTAAGTCCTTACCCAGAAATATTGTCCCTTCTTACATAAGGGT GCTTAATCATCAGGAGATAGACCTGTAAATGTGTTGCAACATCTTGCTCC TTTTTCTTTGATATTTATGGTATTGCAGTAACAACTAATGATCACTGCAG GCAATAAAAAAATCGTTCGTTCAAGTTCAAGCAGGCGTGTTGGATTAATC AGACCAAATTCACCCAAGTCCCCTGTTGCTAGTGCAAGTACTTTTGAGAG TGTAGAAGGGTCAGATGAGGATCTCACTACCAAGGTCAATGGCAAACTTG ATAATGGCCACCTTAACACAAATGGAAATCTAGTAAGTTCCAGTCACCCA GTTGCCATCTATTTCTACCTTTTTGTGTTATACTTGTAGCCACTTACTTC AATGTCCGTCCTTTATATTTTTTTTATGTTACAGTTGACATAAACTTTCA TACTGGAAGTTCTGGAGATCATGCGCATGCAATATAAGTGAATTTATGAC TTAACGTTGTTTAGTACTGTTGACCATCAAGTTTTTTTATTGTTTCATCT GCTCATATCATTAGGAATACACTAGCAAGTATTGTTTGCTGATATGAATA AGTTCTATTCAAGGCATATATTATTCACTTTCCTTTTGTATGCCAACTGT AAGCCTGGAACTGATTCTGAAAAAAGTTAAAATAATCCATTTAATCATAA ATATTATTTTGAGCAGGAGGGAGAACACAAAGGAAATGGAATTGTAGAAA ACGGGTCTGCAAAAATCATGGCTCGGTCTCATAGTATATCCAATGATCTT CATGGGGTTCAACCTGATCCAGTTGCTGCAGATATTCTTCGAAAAGAACC TGAGCAAGAATCATTTATCCAGCTATTAACTGCTCCACATGGTATGGCAT TTGAGTGTATACATCATTGTTCAAAATTGTATTCAAGGAATGAAACAGGC GACATTAGTTATATTTACAAGCTTGACTGGTGCAGTTTGTATTTTGCAAG TACCATTCGTTCTTCTAACAGAATATTCACATGCTATACCCCTATACGGA TATCAGGATATGTAAGCTTCCCATTCCTTTTGAGTATGATGTGTAAGTAA GGAACATTGTTAATTGTGTGAATGCCATATTGTTGTTTCCCTTGGTTATT TGCTAGTGATACGTTGAAGATTCTCTGTTATTCACATGAGTAGAAACCCT GCGTACTAATCATTTATTTGTTGCTTTCTCTCCAAGAAATTCTGGTCCAC TTGGTTGACTTTGATACCATATGGTTGGAAGGTTATTAAATGTTATTTCA TACTTGATTCCAGAGATTCCATCTCCTGATGAAATAGAGGTCTACAAAAT CCTTCAGAAGTGTCTTGAGTTAAGAGATTGTTACCTTTTTAGAGAAGAGA TCGCTCCATGGGAGAAGGAGGTCATAAATGATCCCTGTACACCAAAACCT AATCCAAATCCATTCACTTTTGTGCCTGAACCAAAATCAGAGGTACCCTA CTTTGGCTTATTTGAACACATTTTTTTGGTCTGTTTTGCTGCCATGATTT CAAATGTTGATTGTGCTTTTTCAGCATGTTTTCCAAATGGTTGATGGTGT TGTCCAGGTCTATGCGGATAAAGACTGTAAGGACTCCTGCTAGCTTGTTT TTTCCTTAACTAGGCTATTCCAGCATCCTATGACTCATTTATTTCCTTGT ATTGTGTCTCAGTTACGGAAAGGATTTATCCTGTTGCTGACGCCACAACC TTTTTCACTGACTTGCATTATGTTCTCCGGATGACTGCGGCGGGAAACAC AAGAACTGTCTGCCATAACCGGTTGAATCTTCTAGAGCATGTAATCATGT AGTCACATATTTTTTGGCCTGCATAACTAATTGCAATTGTTTGAAGCTCT CCTATCGGTCTTTTTGTGTGATGTTGCTTTTTATTCCATTGCAGAAGTTC AAATTTCATCTGATGTTAAACGCGGACAGGGAGTTTCTTGCCCAGAAGAC TGCACCACATCGTGATTTTTACAATGTTAGGAAGGTCGACACTCATGTTC ACCACTCAGCATGCATGAATCAGAAACACTTGCTAAGATTCATAAAGTCC AAACTGAGAAAAGAACCTGATGAGGTATATTTATGAACGAATTGTTGTGA AGACTGTTCGTACCTCTTTTAATATGGTTGTCGACTTATAATCACAATAT ATATGCTATGTCATTTAGGTTGTAATTTTCAGAGATGGTACTTATATGAC TTTGAAGGAGGTTTTTGAGAGCTTGGACTTGACTGGGTGCGTTTTGGATT TTATCCTATGTATATGTAATGCTGATTCCACTGTCAGCGGGTTAATCTTT TTTCTTGTTTTTCTTAGGTATGACTTGAATGTTGATTTGCTAGACGTCCA TGCAGACAAAAGTACGTTTCATCGTTTTGACAAATTCAACCTTAAGTACA ATCCATGCGGCCAAAGTAGGCTCCGGGAGATTTTCCTTAAACAGGACAAT CTAATTCAAGGTATTATTTTGTTCTGGGTCGCATTCTTTTTTGGGGGGCT TATTTATGTTATTGGCACTGTGGAAGTCATATGGAATGTATTTTTATGTA AAAGCCAGGGACATTTGTCTTGATTTATACACGATCACATCCAAACTATT GCATTTATTGACTGTTATGCATGTATAGTACATATGTATGTAGGTTCTGA GGAAACCTGACCAATTTTTTGATAAATACTTTTATATTAATCACTGAGCC TTTAAAAACTATGGTATCAGCTTGGGTGCAATTTCACAAATTGAGTAATT GTTGGGCTTGTAAGCATACGTTTAGCACTTAGCACACAGTGTGGGACCCT ATGAATTAAATGATTTATGTTGTAAGCTCAATAAGTGTAAATTGATATAC TTGCTAGTCTTCTTTATTATTTCCAAAAACTAACAACGGTAGATGTACTA CCTCCGTTTCAAGGCTTAAGGCGCACACGCTTTCCAAAGCAAAGTTTGAC CAAAAGAATTGAGCAACAAAATCTTGATTATATTGTACATAATTAGTATC GCTGGATTCATATTGAAAAATACTTTCCAGTGATACTAGTTTTATACCAA AACTCTTTACGTATTTAGAATAATTCTTGGTCAAAGAAAAAACACGCAAA ACGAGGACGCCTTAAGCCCTGAAACGGAGGGAGTAGCATTTAAGCTGATG AGTGGCATAGTGGTGCAGTTACCACTTAATGCTTACCTAGTGCAAACAGT GTTTGGTGCCTCAGAAGGACATAGACATGAAAACATGATGATATAAAAAA ACATGATGAGATTAGTACATCATTGGATGCCCTTATTTTGTTGCAAAAAT GCTGATGTGTCAGTGTACATTCAGACTACAAAATAACATGTATATATTTT CTCCAGCACACACTGTTATTGTTCCATCAGTATCACACATATTACTGGAC ACCACAATGGTGTGTGCGATAATAGATCCCATTCAGGGATAACCTAACCA GTTAGCCCTTCAACATATTGTTGTAAATCTACTTCCCTTCAACAGATTGT TGAAATCTACTATCTTTTGCATTTGTGCATCAGAAAACTGGCCTAGTCTC ACATGTCTGGAGATACGTGTTGAAACTATATTTACATGTTAGAAACTGTA TTTGATTTGGCATGCCATGGATACACTTGAGAGGCATGATGGTGTACAAC ATGGTCACGCTACAAAGATAGAAGGCCAGGGAGACTTTTCAACATTGATG GTTCACAGGGGCAGGTCTAGGGAAATTAGATGACCAGATTGGCAAGTCAT CGAGGGAACAGGAAGTGCCCCATAGCCAATTTAGTATAACTGGTTGGATA TTAATTGATGTGGAGAAACAAAGGAGGCAAAATGAAACTTCTTGGAAAAC CATGTCTGTGATGAATAGCTACCAAATAAAGCTGAAATATTTCTGCACAG AAGTGCCTGCTATATTATTTGTGCCATAGTGGTTTGCGTGTCCTTTTTGC CCTGCATCTTCAGATAGTATTGTCGACACTTTGAGTGGCCATAACACATG CTTGCTGTAATGACGCTATAGCACCATATTTGAAACACTGGGTCAAACCC TTGGGTGCTTGGACGTTTAAGTTAGTCCACTTAACTGCAGGTGGATAAGT CCTTTTTGGTGTCCATTCTTCTTTTCTTTCAATCATATCATTCACAAGGG TCTCTGGCCTAAAGCAGGTTTGGTGTGAGCTGATTTATTGGGCTTAACTA ATTAGCTTCCAAGATAAACTCAGCTTATGAGCTCCTTTGCTTTATGTTAA GCAATCAACCTTAGCTTCAGCCTGTGGTTTGTTGAATCTTACTGCTTTTG CTTTTTTTATGATGATATTTCTAAGCTTTCAGTGAATCAGGACAAAAGAT TATCATTTTGACTAAACAGGTGGACATTGGTATATGTTCGTGATATTAAT TTTTTTTTTAGGGAAATGATGTGATTTTTTCTTATGATCATTTTATCACG CATTTCTGTTTCCAAGAAGCTATCATGGTAATTTTTTGAGATATTTATAT CGCTATTTGATTTCAACTAGGTCGTTTTCTTGCTGAGCTGACCATGCAAG TTTTCTCTGACCTTAATGCAAGCAAATATCAGGTAAAACTATCTGCTGGA TTATTTATTTTTCCTGTTTCTTATGCAAACACAACTCTTTTTTGTGATCC TTAACTTTGTCCACTGTAATTTGCTTCACCAGATGGCTGAGTATAGGATT TCAATCTACGGGAGGAAGCAAAGTGAGTGGGACCAACTTGCGAGTTGGAT AGTAAACAATGAGTTGTATAGTGAAAATGTTGTTTGGCTGATTCAGGTAC CCTTTCTCCATTTTCTGTGGTATTTATCATACATACAACATAAAGTTCCT ATGATGCCTTGCAATTGTGGAGCTATACACGCAGACCGTTGTTTCTGTAT AATGACTTCCCATGGCAATCTAGTACTCCCTCTGTCCCGAATTAGATGTC ACAGATTTGTCTAGATTTGTGTCTAGATACACGTATCTTCGACAAGTAAT TCGGGACAGAGGGTGTAGTTTATATAAGTTGTCTATCCTTCTTCTCTTGG TAGTGTCATACTACCTCCGTCCCAAAGTTTAAGGCTTATATTTTTTTGAA AAGTCAAGCTACGGAAAGTTTGACCAAACTTTTAGAAAAAACTATAAAGA ACTATGATATTATATACTCCTAAATACTATGTGAAAATATGTTTCATGAT ATATCAAAGGGTATGGATTTCATATTGTAAATATTAATATTTTTCTCTAG AAACTTGGTCAAACTTTACATAGTTTGACTTTTGGAAAAAAATAAAGCTT TGGGAGAGAGGTAGTAGTATATTTCAGATATCTTCTTTTGTTTGTTCTTT GTACTCCCTCCGTCGTCGCAGGTTTGTCAAAATTTAAATGAATCTATATA CTAAATAGTGTCTAGATTCATCCAAAATTTGACAAATCTGCGACATCTAT TTTGAGACGGAGAGGAATAACTAATATTTACATTGAAACATACTGTTGAG TGCCTAATTATGCTGTCCCTCGGTTTATGATCTAGCGACTGCAGTAAACA AATTATTCTTTCTACTTGATTAAAGTTCAAAATGGCTATTGATGCAAAGT TGATATTTTATTCAATGTTTTGATATGAAGTATCCATGCAGATAATTATT TTTTGGTACTGTTTTGCAGATTCCACGCTTATATAATGTGTACAAGCAAA TGGGAATTGTTACATCATTTCAAAATCTTCTTGACAACATTTTCCTTCCT CTGTTTGAGGTTACTGTTGATCCAGCTTCACATCCGCAGCTTCATGTCTT CCTAAAGCAGGTGCAGAAATATGTTCTCATTATTTTGATTTGAATGTTTA TCGTATCCCTGGCACGGTTCTTATCCCCACAGGCATCTGCCTTTTCTATC TACAGGCTTCTGTTTATCTACATTTTATATAAACTCAAGATTGCTTGCTA GTCACTAATGAGTTATAAAATAATTTCATGAAATTTCCATTTAAAAATAA GATGAATCTTTAGAGTGATGGATTTTACGAAATAAAACTATGGGAAGCCC CTACAGTATACGAAGTAACCCAAATTCGCATTTGTGTGGACCTGAACTTA AGTAATTGGGTTGTACATCCACTTTCCCAACCAAGCGAGCAAGGCTCAAT TGCTGTGAATGCGATGGATGACCTTTAGCCACCGATTACTGGTATTAGTT TGAAATTCACATGGCATTCCTAGAATGACCATATTTATCTGAAGCATACA TTTAATTTGCAACATCTGGGAATCACCTAAACTGGCCCGATTACCTTATT TTTCTGCATAAAATATCACCGATTAAGATTGAGAGGCTATTCTTCTGTGT AATCATGTGTTAGAGTTGGTTGCAACACAGCCATCATAATCCAGAATCTG TTGCAACTGTGAACTATATAAACTTTTGATTCTTCAGAATATACTTGGTT CGTCGAACAACTGAGTCGTATGTGGGTGTCTCAGGTTGAGCTAAGGAAGT ACTGCTAACAAGTTGATTCTCACCATTAACTAGGTGAATATGTTGATATG GAATTTCTTCTTCTTTTGGACCTTGCAGGTTGTAGGGTTGGATTTGGTTG ATGATGAAAGTAAACCTGAAAGGCGTCCAACTAAGCACATGCCTACACCT GAACAATGGACGAATGTCTTTAACCCTGCATTTTCATACTATGCATACTA CTGCTATGCTAACTTATACACATTGAACAAGGTAGACATATTGTTCTTGT AATACATGTTACTGGTAAGTAATACATTTGTTCAATATTTCAAGTAATAC ATTTGTTCAATATTTTCAACTTTCAGCTGCGTGAGTCAAAGGGATTGAAC ACTATCAAGTTCCGTCCACACGCTGGTGAGGTAAAATCTCTTCAATGTTC CAGTGTTCAACTCCGACATTCTGGTTTTGTGTTTCCTCTAATTGGTATGG TTTCACAGGCTGGAGACGTTGACCACTTGGCAGCCACATTTCTTCTTTGT CACAGTATATCACATGGAATCAATTTAAGGAAGTCTCCTGTGCTTCAATA TCTGTACTATCTTGGTCAGGTAAATACTCCTGTTTTGGTATTTCCATAAT CAGTGTAATTTTGAGCAGTATATGTAGTTGCATTTTTCTCATAATGCGAA CTTCGTATTTTAATGTTTAGCTGAGAGTGTTATTACTTTTTAACATGTTG CTTTTATATTTTATCAGATTGGTCTGGCAATGTCCCCATTAAGTAACAAC TCATTGTTTCTTGATTACCATCGGAACCCCTTTCCTATGTTTTTCCAACG AGGGCTGAATGTGTCACTATCCACGGATGATCCATTGCAAATTCTCCTGA CAAAAGAACCATTGGTGGAAGAATACAGCATTGCTGCTTCGGTACCCGCT CTTTCAGTATCTTTTTTCATTTTCATATCATGCCATAGCACATGTTTATG TGCTCCTGCATATAAGTGTGTAAAGTCACTATGCACATACGCCCGTGTAC ATGGGTACAAAACCACTGCATTCACGCGCTAAAAGCATCAGGAGCTCATA ATCATTTTGGTATTATTTCAGCTGTGGAAGCTCAGTTCTTGTGATTTATG TGAAATTGCGAGAAATTCTGTGTATCAATCAGGGTTTTCACATGCTCTCA AGGTAAGCAAGCCTTCTTTTGGAAGCATTGTTGGTGGTGGTTGTGATCAA CTGATCATTTTACGTTCTTGCAGGCACATTGGATTGGCAGGAACTACTAC AAGAGAGGCCCTTCAGGAAACGATATCCACAGAACGAATGTGCCCACCAT CCGGCTTGAATTTAGAGACCTGGTATGCACATCTTTTTCCTTCCCTCTTA GAACACAGATCAAGATCGCCTTACTAGACCTTTTCGTAAATCTGAGCTAA TATTCTGGCTATAAAAAAATGCTGCATGATTTTCAGATCTGGAGAGACGA AATGCAGCTAGTCTACCTTAACAACGTCATCTTGCCTGACGAGGTGGACC AGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.