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GrainGenes Sequence Report: AA031802

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Sequence
AA031802
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031802
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGGGGGAGCAGATGTTCTAGAAGCTGGGCCAAAAGCATAACCATCTGCAG
CGAGACACCTGGTGCCTCCACCTGGCTAGGAGCAGAAGGATAGGTAGAAA
AGAAAATCTCCGCATCTTCCTGGAAATCTCTCTCCCCCAGAAACGCCAAT
TCCCCATTCGCCGCAAACGGAGGCGTCCCCGTCCATCACAGCTCTCTCTC
CCCCCTCCAAAACCTCTCGCGCCCGCGCGAGAATTCGGGCGCGCGGTGGT
CTGGGCCGCCGGATCTAGGGTTTCCTCACCATGCTCTCGCTGCGTGGCGA
CGCGCGCCACCTGGCGGCGCCGGTGGTTCGCGGCCGGGATGACGCCTGGC
TCGGGATCAGCGGCGGGCCGGGGGCGGCCCCAGACGGGCCAGCGCCAGCG
GCTGCGTTCCTGCTGCCCCCGGTGTCCCTGGACGCGAGGACTAGTCAACT
CGTCGCGGGTGATTACCTCTGCTGACCCCTTTCACTGTTCAACTTTTTGG
CGCGCGTGGTGTGGTACCGCGGCTATGTTAGTGGAGATTCTTCTGGGAAC
GGAAGTTTGTTTGAGGTTTTGATCGCCAGTTTGCCAGAAAGTTTTCTTTT
TTTCTTTCTTCTGTTATTGTGCGAAGATCTGAGCTCATTTTTGTTCATGG
AGTGGTAGGTGGGTGGGGGCGAGTGTATTAAGTTTGCTTGTAGTTTACGT
TGCCTGCGGTGCTGGTGTTGGTGTTCGGATTTCTAGGAGTCGGTCAGCTA
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GTGGACTGGCAAAATAAGGAACATTATATGAGTTGGTTTTAGAAGTAATG
AGTCGTCCCATTTCCACATTTTGTAGTACTCCCGTGTAATTCATCCTTTA
AGTTAGGGATTTGTTGGCATGTACATGCTTGCCAGGTTTGTATTGTAGAT
ACAATATTTTGTTGCTGTTGTGTTTGCTATTTAAATGAATATGCACTTTG
AAATTGACCTTTTGATATAAATTATACACCCTCCCAACTATGATAGATAA
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATATTCTAATTGCGTTCTCTTGG
TTCTTCAAATGATTTAGCTGATGAAGAGGGGCACTTGGCTCTTGCACATC
AGAGCTACAGAGCAGGAAAATATAGTCAGGCCTTGGAGCATGGAAATGCT
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TATTTATTTCCAGGTTATTACTATTGTGATGCTTTTGCATGTTCCTTGCT
CTAAGTCCATCACTCAAAGTTTTGTTTTCTCTGTAGCTTCGTAATTTTGA
TCTGTGTATTGCAAAGAATGAAGAGGCCCTTGCTATTGATCCACAATTTG
CGGAGTGCTATGGCAACATGGCAAATGCTTGGAAGGTAAGTTGAACAGTA
AGAACAATCTTTCGAGAACAGACATATGTTTTTGGATGGTCCCAATATTT
GTGGAATAGTGCTTTCATTTTATCATCATATCATGCAGGAGAAGGGCGAC
GTAGACCTTGCAATTCGTTACTATTTAACGGCTATTCAGGTGTGTTTGTC
AATATTTCCCAGCTTTAACTTCTTTTCACTTCCTTCCAGTATTTTGCCGT
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ACACTTGGAACCAAACCAACTAACGAGGAATTTACCAAACAATCAAATAA
TCCATAAATAAACAAGAATATCCAAGAATCATCAATATACAAGAATTTTA
GCCAAGAGCTGACCCAGAAGAGGATCTTCATCAAGTATCCAAGCAGTCTT
GTCAAAAGTTGACAAGGTCCATCGCAGCGTGATGACATGCGTGAAGGCAT
GCACAACACGCTTGGTTTGTCAGATGTCGGCAAGGAGATAATGTTCTAGT
GGGATTGCAAGTAGCAGAGTGGGCGAGGAATTGTGTTTAACCTCCTTTTG
TTTCAAGTTATGCTTTGACTCAAATCTCATGTGCCAACATAATTGTGTTT
TGTTTTCACTTGTTTGCACATATTTCCTGTCATGTCGGGCCAGGTTTATG
GCCGCCACAAGAAGGAAGAAGTGGCTTGATCCCTGAGTCAGGCTTGGTCC
TTACGTTAGGATCTATATTAGGATTTTAGTTTTCTTATAGTTTGTTAGTG
CTTACGTTATCCTTCAGATTCGGTTCAAGCTTTCCTTTCCTCAAAACCCT
CTTTATAACAGAGGCAACGTTGGAACCATGAGTTATCAAAGAAATAAACC
CCAAAGGAGATTAAGCTCCCAACTAAGCACGTGAAATTTCCATTAAGCTA
AGATCACGTGAAATTTCCATTAAGCTAAGATGATTTATTTGTTTCATGGA
TGCCAATGTCCATCACCATTATTCTTATGCTAAATATCAATCTCTATCAG
TTTGAGTACATGCCATCTTTACATGGTTCCATTTATTTGATTAAATCTAA
AAGCAATTTATTAGGGAATATTTTGTGTAGTAAGGGGTTCATGGTGTACT
GGTGTACCTGCGGCGCAATTAGCACCTCTGATAGCCATGGAAATTTCTGG
GAAAAGTTTGGCAGTATTGACACAAGATGCATCTACCTCGCCACAAAATT
TCAAACCCAAATTTTATCCGCACAGTGAGAAACAAAGGAAATACTCCTTC
TGTGAATAGAGTGCACTAGTGTTATTCACGTCAGGATTTTCTTTTCTGTT
TCTTGGCATGTGGATTGGATTTGGATTTGAATTTTTGTGGTGAGCTAGGC
GCATGTTGTGTCGATATTGCCAAAAATATTCAGATTTTTTCATGGCCGTC
AGTGGTGCTAAACTGCTAATTGCCCTCCAGTACATTAGTACGCCTCATGT
GGCTAGTGCACACAGTATGCCCCTCTTTGCTCTTCAGTCATAAAAATTTA
TACATTCGGCAGTTTGTAAGATGGATTTTCAGTTGCAAGGCTGTAAAAGA
GATAAGTGGTCTGATTGGGAACTTTTTTCTGTAGCTGCGTCCAAATTTTG
CTGATGCATGGTCAAACCTTGCAAGTGCATATACACGCAAAGGGAGAATG
AATGAGGCAGCACAATGCTGTAAACAAGCACTTGCCCTGAACCCACGTTT
GGTATGTGTATTCATATGTTACCAGTAATTCTTATTCACTTTGTGAGCTG
ACATTTTGTTTACCTTTGATTTAGGTTGATGCTCATAGCAATCTAGGGAA
TCTAATGAAAGCCCAGGGGCTTGTGCAAGAGGTAAGCAAGTTGTGTTCTA
GGCTTTGGCAACAGGTGGTACTGTGGGATGATCATTACCATTTCATGTGA
TTCCACCTTCAGGCATACGCTTGCTACCTTGAAGCAATACGAATAGATCC
ACACTTTGCAATTGCATGGTCAAATCTTGCTGGCCTGTTTATGGAAGTTG
GGGACCTCAATAAGGCTATGCAGTATTACAAGGTAAATATCACAAATGGT
GCGAGATTTTGGTGTAAAGGAGAAATATCTACTAGTTTCTGTATGTAGAA
TGCTTCAACCTGAATTGTATGTACTTTTGACCTGTATGTGAACAATAGAA
ATTTATGTTACCGAGTGTTACTGTATCTAAATGTTCTACGAGTTGCTACG
CACAAGTAGTTCATCACTATAGACATGAAAAGTTATGTAGATCATTACTT
TATTAATCAAGGAGTGGGAAGAGGAGTATATCATCTACTAACATTTGATC
TATGTCGGTGGTTGAACAACCGAGTTTGTCGTTGATAGATTGTTGGCAAC
ATAATGGCTGTACCTGGCTTTTAAAATTTGTGAAAAAGAATCTGTAGGTT
TGTACTCACATTTGATGCTGTGAGTAACCTAACATACAAATGGACTAGTT
TTGGTTCAACTGCTTGCCGTTTCTTTACAGCAAGCTCATATATAGGCTCG
AAGTTCCCAAGTGCCACTGAGATGCGTAGTACCTCGTGAAAGAAAAAAAA
TCAGTGAGAAAGTGAACTTAAAGAGCCTCTTCTTGGTCTTAAGCATGATT
ATGGTTTCAACTGTAAAACTTTAAACCCTTAGGTCCTTTCTTGATACTCT
CTCTGTATAATTCTTCAAGATGCCCTCCATAGGGGCAGTGGTGTTGCAAA
CAGGAGATAGTCATTTTAAAAGTTACTGCTAATCTGATATTGTAACACTT
TTGTAAGAATAAAAATAGACCCCATCAATTGGAATTATAATTCCTATTCC
TGCTAAAAGTCAAATGAAAATTGCTTTTAGGTTTGCCTATTAATACATAC
ATTAAATTGCTATACTACCTCCGTCCCAAGGAATAAGGCGTCCTTGTTTT
GCGTGTTTTTTCTTTGACCAAGATTTACTCTAAATATATAAAGAATGTTG
GTACAAAATTAGCACCATTGGAAAGTATGTTTTAGTACGAATCCAACGAT
ACTGATTTTACATAATATAATCAAATTTTAGTTGCTCTATTTATTCGGTC
AAACTTTGCTTTTGAATGCGCGTGCGCCTTATTCCTTGAAACGGAGGGAG
TATTAGGTTCATTACGAATATGCTTTCGTGGTGTATTTTTTTTATCATTT
GTAATACTCCCTCCGTTCGCAAATGTAAGACCTTTTAGATATTTCAAAAT
CGACTAGATACACTCTAAAATGAGCGAACCTACACAATAAAACACGTGTA
CATACATGTGTTTTAGAAAAAGGCTAGAATGTCTTTCATTAGTGAATGGA
GGGAGTAGGACATTGAGCTATCTTATAGAAAATCGAGGTATTAATTAGTA
GTCACATACTGCCGTGGAAACTGAAAATACCGAAAAGTGTAGTATTTGTT
CGAGAGGAGTTACTGTGCAGGGTCAGGTCAAACCCTGCATGTTCTTTTTT
CTCTTCTCTTTATTTCATTTTGTCCTTCATACTCAAAAGTCCTATTTTGA
GTCCACATGCCCCTCCTGTTCATCCCCTTTTCTCGCTTCCTACACCCATA
CTGAAGTTACCATGCTTCCCTCTTGCACATCTGTAACCGCACAGAGCTGC
AACCATCCTGAGCACCACCCTCTGGTCATCCTTCACTACATATGTTCTGC
TCCTCCAATATTTGGGTGCAAGTAGAGTCATAGGGGAAGTGACTGGTTAG
CTCTAAGTAAGCAGATCAGTGATGGAAGATTTGACTTTGATATAAAAATG
TAGCTTGTTGGCAGCAACAGCTAATATTCTTCGAGTGTCACCTCTAAGCA
CTTTGTCTGCTGTTGTATCGTAAATGTATTTCACCGTGTCAAGAGATACT
GATTCCATTCTACATACCGGATAAACTTGGTCTCCTGAGCATATTGAGGC
TGTTCTGATGGGATTTCAGTCCCTGTTATGTACAAGGATACAGTACAGCA
ACTATCTAACTTATTTGTTTTGCACTTCCTTATGTGCTATGCAATCAACT
TTCGTGTCCATGCAATCAACTCCTGGTTGGGACATGAAACCAAAATGAAG
TTTTTTGACTTTTTTGGATAGTGTAGCATGCAGAGAGTTCTAGTGCTAAC
CCTTTAAAATTTCGTTGTCAAATTCGAAATACATTAAAATATAAAAAGCG
AAGTTTTCTATGAATGGTAGCATTTATCTTTTTGTACTCCCTCTGGTCCA
TATTAATGGCCTCAACTTTATCTAGATTCGTATGAATCTAGTTAAGTATT
TAGACTAGATGCATTTGTATCTAGACAAAGTTGAGGCCATTAATATGGAC
CGGAGGATGTACGTTTTTTTCCTACCCTTTAATTTATCACATGTTAGATT
TTCCCATTTTTGTTACTCTGAACAGAAAATGAATATGAACCTGAAATTTT
TCATAGGTGGTAAATTGACTAACTCCACCCTGTAATTTTTTTCGGGGAAT
TTTTCTTGTTCACGAATGCCAAAACCAAAAACAATTGCATGGTTGTGGCA
CACAGTGATCGCATAGCAAGTGTTGCCTGTATGTACTGTAGCTCCATGTG
TAGCGTTTTGTTATGTTCTCACAAAATAGATGGTTTATTTGCTTTAACCT
TCCTGACTAGCATTCTGATGGGTGATGTCCAATGAGTTGAATGGTACCGT
TGCTTTTTTTTTTTGTTTAAAAATCTTGCAGGAAGCTGTTAAGCTTAAGC
CATCTTTTGCGGATGCACATCTTAACCAAGGGAATGTGTACAAGGTAAGT
CTTATGAACTATGGCATTTGCTTGTGGCCTGGGAATTCGTCAACAATTGG
TTATGGAGCAAATATTTTGGCTCGTCCAGGCTATGGGAATGCTCCAGGAG
GCAATTGCTTGTTACCAGCGTGCTTTGCAGGCGCGCCCTGACTATGCGAT
GGCTTATGGTACAGTCTTGCTTTACCCTTTGTGTGCAAGGACGTATGGTA
GGTTTGGTTTGTGTCCAACAACTGTAATGCTAATTGTTGGCAACTCAGCA
TGGCTGACTTTTCTTGTTCATAGACCAAATGAATACCAGTCTTTTTGGAA
TTAAATTATTGGCAAGAAATTCTAGTCTCACTTGCCATGGAGAAATCAAG
AGAGGAATTTGGCTGCCATTCGTTGAACCGTACATGGAAACATCCAAAAG
TAGCTAGAATAATGTCAGGCAAACTTTTAATCAAGTACCAAACAAGTCTA
GATTTTATTTGCTCTGGCTGAAAATTGGTATGGTACCTGTTGGATACCTG
ACTAAACCTACCATTAGTCCTTTTCTCTTAGGATCTTGCAAGTTTTCTGA
GTGTAAATACTAATTTAGTTACATTTTCCTTCTTAGTCCATTTATTAGAT
GTTCATCGTGGATGAGATATGTTCAAGCTTACAAGAGAATGGTCCTTTCT
TTACCTTCAAAGTAGAGCCTTAGTATACCTCGTAATGCAAAGGACGGGGG
GACATTTTATGCAGGTAATCTTGCTGCTATCTACTATGAGCAACGCCAGC
TTGATATGGCAATTCATTGTTACAGTCAAGCTATACTATGCGACTCTCGG
TTTGTGGAAGCATACAACAACATGGTAAGCTCTTGAACTACTCACTGTTC
ATAACTGATTGCCGCAGTAGTTATGTTGGTAACTTGGCTAAAGTTGGCTA
TCTTTGATAGGGTAACGCACTTAAAGATGCTGGGAGAGTAGAAGAGGCAA
TTAATTGCTTCCAAGTATGGTATACTTCATTGCTGTGACTTTCCATATTT
TGTTCTACTCCTAATCAGTTCACATATTTTTTTGGTGCAGTCGTGCCTTA
TGTTGCAGGCAAACCATCCGCAGGCTCTTGCTAACCTTGGAAACATCTAC
ATGGAGTGGTAAGATTCTCATACGTTGTTATCTTTGATACCCCAGTATGT
TGATGCCCTTTAAGTGCATAGACTAAAATAAGATTGTAGGAACATGATAA
GCGCGGCTGCTTCATTCTACAAAGCAGCAATTGCTGTTACATCTGGGTTG
TCTTCTCCACTCAACAATTTGGCAGTCATATACAAGCAGCAGGTACTGGC
TTCAAGATTTCGTTTTGTATAATTTTGTAGAGGTTTATGCTTTTTTACTT
CTGTTGTTTGACATGTTCTTTTTGCGTGCTTAATTTTTGAGCCAGATTTT
AGTCTACCCCTTTTTTTCCTGATTCTTTTCTTTGGGTGCACCAGGGAAGC
TATGCTGATGCTATTGCATGTTACACCGAAGTACTTCGTATAGATCCTAC
TGCAGCTGATGCACTAGTTAATAGAGGAAATACATTTAAGGAGTTTGGAA
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ACTATGGCGGAAGCTCACGCGAACTTAGCTTCAGCTTATAAAGATAGGTA
CGTTCCAATATAATAAGTTCTGGCATTTTTCTGAATCACATGTATATAGA
CACGTTTTAATGTGTCTGTTCACTCATTTCAGTCTATATGTAGTCCATAT
TGAAATATCCAAAACATCTTTAGAGGGTGTACTATTTAGCAATCAAGATA
ATATTGCAGTTTGGGTATTAACATCCAGTTTTTATTGTGTTCTTATGTTT
CTGGTTAAATTTAATCTTTTGAAATGTGACCTTACACTGTAGTGGACATC
AAGAAGCAGCTATAGCCAGCTATAAACAAGCTCTTTGTCTCCGTCCTGAT
TTTCCAGAAGTAACGTGTAACCTTCTGCATACTCTACAGGTAAGATCTAT
TCCACATAATAATCTAATTTATCCAACAGAACACAGAAGCATGCGATCAT
ATATAGAACTCTATACACTCCCCACGTGTTATCAATACCATGAGAACTAA
TTTTATATGTTTACTCGTTAGCATATTTCTTGAAACCCAAGTACCGATGT
ACTTACTTTATGGTGTACTATGGTATCATGGACTTGTTTATATAATACTT
TGGATATTTAATATTTAATGCCCCTGAAAGGAAGCTCATACAATTGCAGC
TATGCCCAGGAAAGACACTAACTAAAAAAAGTGCTACCCATGTTTGTTTC
ACTGCAGAGTGTTTGTGACTGGGAAAACAGAGAGACTATGTTCCACGAAG
TTGAAGATATAATCAAACGGCAGATTAAGGTTCCCCTTTGTGATAAATTT
CATTTAATGAAGTAATGGTAGGAATAGGATAAAGTTGAATAGTGGAAATA
TCCTGAGTCATGACAAGCTTTGGTTATTGTTCAAATAGATGTCACTTCTG
CCAAGTGTGCAGCCATTTCATGCTATTGCCTATCCTATTGATCCACTGCT
CGCCTTGGAAATCAGGTATATCCCCTGTTGGCTCTTACTGCGCTGCTATT
TGCACCATCAGTGGTATTTTCTACTTCGTTATTTACGCTATATATTTTGC
TTTGCAGTCGCAAATATGCAGTCCAGTGCTCGTTGATCGCTTCTCGCTTT
GGGTTGCCACCATTTGTCCACCCACCTCGTTTACCTGTGAGGGCAGAGGG
TAAACATGGTCGCCTTAGGGTTGGGTACGTACCTAAAGGCACTTCTATCA
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TCAGTTTTTGGAATGCATAACCGTGACAATGTTGAGGTAGCCTACTTTTC
TTTACTCTCCTTTTACACCTTATGGATTTATTGTATCAACAACTCATCGA
TTGGCATGCCAGGTTTTTTGCTATGCGTTGAGTCAAAATGATGGCACTGA
ATGGAGACAGCGTATCCAAGCTGAGGCAGAGCATTTCATCGATGTGTCTG
CCATGACATCAGATGCGATTGCCAAAATGATAAATGAAGACAAAATACAA
ATTTTAATCAATCTCAATGGCTACACAAAGGTAATACTTGGAATTCTCCT
TTTCATAGCCTGTCAATCTTTGTTCCCATGCTCACTTCTCTCCAGTGGCA
ATCTCATGCTATTACTCTGTTTATTGCCGAGTTTTTTCCTTCACTTTTAT
TTGCATGTATTATATATTTATGTTGGGTGTACATATGCTATTCTTGAAGT
TACTAGGTGGTATCACTAAGTATCTTGAAATATACAGTCAAGTGTGTTTT
GAAATAAGAAGCAGCTCAGCATATTTGTGGGATCTCAAGCAGCTCTTGTT
TGGTTTTAGACTTGTCATTCTGCTTCATGCGTTAACTTTAACAGGGTGCA
AGGAATGAAATTTTCGCGATGCAACCAGCACCTATCCAAGTGTCATACAT
GGGGTTCCCAGGGACAACGGGTGCTTCTTACATAGACTACTTGGTTACGG
ACGAGGTATGAGTTTTTCTAATAAATTTGACCTTGCCCAATAGTTTCTTA
GCTTTAGATGCACTAATTTGACTTTTGTTGTTTGCAGTTTGTTTCTCCAA
CTCGCTTTGCACATATATACTCTGAAAAGCTTGTTCATCTTCCACATTGC
TATTTCGTCAATGACTACAAGCAGGTTCACTTCTGTTGCACTATTTTATG
TTTTGCTCTATTTCATTCATGTTCTTTCTGACTACGGCTACTGTACTAGA
AAAATTGTGATGTCTTAAGTCCTGTGTGCCCGCATAAAAGATCAGATTAT
GGGTTACCTGAGGATAAGTTCATCTTTGCATGCTTTAATCAGCTTTACAA
GATGGATCCAGAAATTTTTGATACATGGTAACTTTCCATCACCTGTAGTT
TTCTGTATAGTTTATTGAAAGCACAGATATATTCATTATGTTAATGTTTG
TCAACTCTCTTTTGAAGGTGTAATATCGTCAAACGTGTTCCAAACAGTGT
GTTGTGGCTCTTAAGGTTTCCAGCCACTGGTGAAATGAGAGTAAAAGCAC
GTAAGTAGTAGATTAAGTATTTCTTTGTTGCCTGAGCTTTTCATCTGGAA
AAGGAGAATCACATGAAGCAACTGAATTTAACGTCTGTAATACTGGAATG
TTTTTTTGTACAGATGCTGCTGCAAGGGGAGTGAGCCCTGATCAGATCAT
ATTCACAGATGTTGCTATGAAACATGAGCATATCCGAAGAAGCGAATTAG
CAGATCTTTTTCTAGACACGTATGCAGTTAACCAGTTGTTACATTTGTTG
TGCATGATATAAGCACATTAGTTCATACTGATACTTGCTGCATTACAGGC
CCCTTTGCAATGCACACACAACTGGTACGGACATTCTATGGGCTGGCTTA
CCGATGATCACACTTCCACTAGAGAAGATGGCAACCAGAGTAGCTGGTTC
CCTCTGTGTAGCTACTGGGCTTGGAGATGAGATGATTGTTAGCAGGTAAG
CATTGATTATAATCTGTTTACGCCGTCTAGGATGGTATATACATAATTTA
CCCTTTCCTTTTTCTGATTTTAGCACGAAGGAGTACGAAGAAAGAGCGGT
CGAACTGGCAACAAGCCCAGCAAAACTCCAAGCACTGACCAATAAGCTTA
AAGAAGCCCGTTTAACGTGTCCATTGTTTGATACGGCTCGATGGGTAAGT
GATTGCTTGCACGAATTCAAAACGTTCCCTCTAGGCACAGTAATTTTGAT
GAGCTCTTCCTTGAAACTGTTTCAGGTTCGGAACCTCGATAGGGCGTATT
TCAAGATGTGGAATCTTTACTGCTCTGGCCGTCATCCGGAGCCGTTTAAG
GTGAAGGAGGACGACAAGGAGTTCCCGTATGACAGATGAGTGGCGTGAGA
TCCCGGCTGTGTAGATAAGAGCAGAGTTTGTAGCGTAGCACAATCATGTA
ACTGGTATATGTCTGCGCCCTGTCCCGCTGTATCCCGCGTGTGTAGCCCC
TACATATTGTACCGAACGGAGAAGCATTCTAGGTTTAGCCTGTCTATTTA
TGTGTGCGCCGACAGAAGATATAGTTCTGTTAGGTGCCTGATTGTTGTAC
TATCAACCCGCGTCTCCTGCTGCTTCGAGTGTAGGATGTTAGTAAAACTT
AGCTGCAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.