Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA029481

[Submit comment/correction]

Sequence	AA029481
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA029481
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGGAAGTCGTAAGGGACGGGCTAAGCTAAGCTAGAGGCTAGAGCAGCCA GCAGGTAGGCAAAGCGAGGGAGATGATGTTGCGCATGCTCCTCCATGGCG CGGCGCTCTTGCTGCTGCTTCTCGCGGCGGTTGCGCATGCTCAACAGACG GCGACGACCCATCCGGGTGACGGTGAGCATGCTCGATCCACTCCGTCCTC CCTAGATCTTTCCATTCCTCTTTTTTTTTTTTGAAGAAATTCATTTCAAA ATAGTTGTCTCAACTTTATCTAGATATACGCTTATTTTAAAACGGATGTT GTAAGTGTTATTAGGATTTTCCATGTTCTCCATTTCCAAATCAATCACGA CCCGATGATTTGCCTTTGTTTGACTGTATATGGCTAAGGACGCCCGGAAA CACTCTACGGCTCTCCTGAATCTTCGTACAAATCGTTCCACGACTCGTTT CATTTCTAATTTTTCGAGGAATCAAATGGTTGATATCTGGGGATTATCAG TCGGGTCCTTAGCTCTTCGATATGTGTTTCACAAAAAATCTCTGACGTCC GGCCAATGCAATGTTTTTCACGACGCGACAACTTTTTGTAACATTTTTTT GTGAATATGTATTGTTGCTAAAAAATGATGCAACATTCGAGACGCTCGGT TAGCAAAAGGCAAATACAAGTGCAAGAAATCTCCAATTTAGTTGTAGCAA AACATAAAAAAAAAGTGTGCCCCGTTTGTATAAACAAATTAAGCATGCAA CATATGTGACAAACGCATCCAAACATTATAGAAACATATTTACAACATTT GGAAGATCTCGTTGTAGCATATGCCTAGAAATCATTGACATTTTACTCGT GCTTACATAACCAAAATGGTAGAAACTCATAGCATTTTGAAACACCCTTT GCAACATCGGAAAATCCCCAAATAAATGACCTCCACCGTCAAGCAATGGA GGCACCGACCTCACTTCCCATGGGTTCTCCAGCGATGTTTCTGATTCACT AGTGCCATGCCATCGCCAAATCGTCTCACCCCCGAATACATTCCTCGCGG TTCTAGCAACTCCTTGGAGCTTGGTAGACAAAAAAAGGTTCTTCACCTAC TCCCATGGCAGTCACTGAGGGATAGGAAGACTGACCACCCCAAGGGAGGA TGAGTAGAGGAGGGGGCTAGGAGGGGATTCAGGAGAGGGATGATATGATG TGCTCAAGTGGAGTGGATTTTACTAGAGAGAAAGGAGGCACACAAGGAGA GAATCTTGTATAGGGGGTACGAGCTCGAAGGATAATGGATTTGTATGCCT GGTGCTTACTTGATCAAGAGGCCAAGTCAACGATATTAAAATAAATATGT GAGTGAATGGGCCTAATTTTCTATGATGAGCATTTATAGCATGTGCTAAA ACTAGGGATGCAACATGTCCTCGATAGGTAAGACCTTCCGATGGAAAAGG CACGGGTAGGTGGTTTTTTGCTGATAAATTTGCAAGCTATCTCTTTTCGA TGTAGGTCAGTTTCAGGCAAAGAAAGGAGTCAGGTGTGGGTTTTTTCAAG ATATGGCTAGTCCGTAAAATGAGGCAACTGTTTATGACCGAAAAGAGGAG GCAGTTGTTTACGTTCCAGGTTGACTAGAGAGGAGCGATCCCTTGATTAA GAACGCTATAGCAACTGTTAGTAGATCACCTATGGAGCTCTACAGTGCCC GGGCCCACTTCAAGTACAATCAGAATAAAAATATTAGTTGGGCGGCTCCT TGCTAGGGGATGGGGTAGTGTAATCATGTTGTTAGTTTGTCAACTAGGAG CTAGTAGAGGAAGGCTTTGTAAGCAAGACCGGGTCTTGATTGGGGTCGAC AGACACGGGTGCCGTCGAACTTGAAAAAGAGCAGCAAGCTGTCATTCACA GGGGGAGAGGGAGGAGGCACCACGACATGGGTAGTTTGTCTAGGGAGGAT GCCTCCTAAAGAGTAATAGAGGTGTGCGAAGGTAGCCTCGAGCGTCGTTT CTTCTCCTGAGCATAATGGTATAAGCATGACTACGAGAACAACTCGTCAA ACAGAGATGCGGTTAGACATCCTTAGACGAAAGTGTGGTCTTTTAGGACA TAGAGTCATAGCAAATAAAATAGCTAATTCTTATTACAAAAGCGAAGGTG ATTGGCCGATGTGTGTCACCACCTCCCAAGTGTCCTATACATTCGATTAA TGTTGTTACCGTGAAGCTATAGTCATGGTCTTATCGTCTAGCCGTTGGTA CTCCACATATTCATGGAGAATTCAAGTTCACACGGTCAACGTCAGAGGAT GGGAGGGGGAGAGGATACAAGTGTGGAGCGACCGAGCCAGTTGATGGATC AGCTGACTGGTAAAAAAATTCCTCCAACCTTGACTTTTGGACCGTGCGAC GTCCTATAGCACAACCCACTCAAGATTATTTTATTTGACTTGAACCCACT CAAGAATTACCTTGACTTGGTTTGATGTCAGTTGTCTGTCCACCGTCTCT TATTAGATCTGACGGTTGGCAACTCATCCGGATTTTTAAAATCCAAATGT TTGACTTGTGCTCCTCCAGACACAAAAGTCAGAATCTGGTTTTACTCGCG GTTTCTTTTCTTGTAGCCTACTAGACTAAGTAGATGCTGCCTCTCGGCCT GTCAGATCACTATCGGACGGCTGAGCGGCGACGTGGATGCCATTTTTTCA CCCGTTATTTTTGTTTGTCTCGCAGCGGCGGCCTTGAACGCGGTGTTCGC CAAACTCGGCCAGAAGGCGGGGCCGTCATGGAACATCAGCGGCGACCCCT GCACCGGCGCTGCCACCGACAACACCAACATCGACAACAGCGACATCTTC AAGGCCGCCATCAAGTGCGAAGTCTGCACAGGTGGCAACACCTCCGTCTG CCGCATCACCAGGCTGTAAGTGCTCCTCTTAGGCCCCGCCGCACTCAGCC TGTTCGATGGAATGCCAGATCCAGCGGCGGCTTCATTCCGACCAATACGA GCGATTGGTAGATCGATAAGGCATTAGCTGATCGGATGCTTGCAATTTAG GAAAATATACGCCCTGGATGCGGTGGGCCCTATACCAGAAGAGTTGCGGA ACCTCACAGCCTTGACCAATCTGTATGAACTCTCAACCTGCACACATGAA TGAAATGGTCAATACTCGATTGTACTAACTTGAAACTGACGTTCTGTATA TAATTCCAATCTCACGCCAAATTTACTCTTCTATCTGATTCAATGTTGTT TCAGAGATTTAGGGCAAAATTACTTAACAGGGCCTTTACCATCGTTCATC GGGGAGTTGACTGATATGCAGTACATGTGAGATTCACACAACTCAAAACA TGATTGCAACAAATGAATACATTTATTCCCTGGCATTTAATCTCACACTT CCTCTCTTCAACATATAAGGACTTTTGGTATCAATGCATTATCTGGACCT GTACCAAAGGAGCTCGGGAACCTTAAGAATCTTATAAGACTGTAAGAAAT ATTTTTTATAACTCTATGATTGTATTTCATTATGCAACTTTAGAGTTAAT TTCGGTTTGAAGGGTAGCCATGCTGATAGTCTTCATGCTTTTTAGAATAT AAAGTTCACATGCCGAACCTCCAATTTTTGGTGTACTTGTAGCGGCCTTG GCGCAAACAATTTTAGTGGCTCGCTTCCTTCGGAACTGGGAAACCTGGCA AAACTTGAGGAACTGTACGTATTTACTGAAATCTGGGAACACTATTTTTC TTCTGCCAAGCCTGTTTTTTTCTTGGATTAGTCAGCTCCTTATCTAATGT GTATATATTGTTTCTGTATTTCTCAATTACAGGTATATTGACAGTTCTGG CCTTAGTGGTCCACTACCATCATCACTTTCCCAGCTTACGAAAATGAAAA AATTGTATGCCTATAGTTGAAGTGTTGTTGATATATTATAATGTTCCACA CCATTCAATCTTATGTACTTCTCTTCTCTTTGTTTAGATGGGCATCTGAT AATGATTTTACTGGGCAAATACCAGATTATATTGGGAGCTGGAGTAGTTT AACAGAGCTGTAAGATCACTACTGTTCTCAGTCATAGTAATTCCCTAAAA AATGAAAATACTGCAGAATCTTTACACAATTTCGAAGTAATTTATTCACA GGGAGGTTTGAAAGAATATTTTTGCAGTTTGCTATAGTTATCTGCAAGCT GAGCTTTAGTTTTTTCTAAGATAAATTCGTCTGTAAGTGGAACACTCATT TTAAATAGTAACAGTTTTAGTTACTAGAGCCTATCTTGAACGTGCAGAAT CTCCATCTGTGGCCTCTTAAGAAACAATCCATTTAAGTTGTAAGATGTTA GATTAGTACCGGATAAGCATTGCATGTTTCTTCCCCCACTATGCATTAGA TGGTTACTAGTTACAGATAAGGTGATAGTATCATTGAGCATTGAATTCAC TTTCCTTTTCTTCCAAGGTATAGAGATATCTATTCTTTCACTACTTGGTT GTTGCATTCGTCAGGAGACGATGCTTTAAATGACTAACTAGAACTATGGA ACTGTAGGAGGTTTCAAGGAAATTCTTTTCAAGGTCCAATTCCAGCTACT CTTTCCAATCTTGTCCAATTGGCAAGCTTGTAAGTGCCTATTGCCGGTGT AAGAGCTAAATGTCATTCTGAAATGTGAAGGTTGCAGCAGGGAAAATTAA TAATCTACTTCTGTGGTGCAGACGAATTGGTGATATATTAAATGGGAGCT CTTCTTCACTGGCTTTCCTCAATAATCTGACATCTTTGAACACCCTGTAT GCATAACTTGTCATTCAGTTAACGGCTCAAATTACAGTTTTAAATCTCCA AGTTCAATCCTAAAACATGTAATATATTTTCTTTGCAGGGTTTTGAGGAA CTGTAGAATATCTGATAAGCTCGTATCCATGGACTTCTCGAAATTCACGA GTTTAAACTTACTGTAAGCATTTTATTGTGACGATAAACTACAGTCAAGT GCCTTTTGTGCAAGATACTTAAATGCACTACTATGGATTATACACTGGCT GATGACATCTTTTCCTTCTCGTTCTATTATTATTATAGGGATTTGAGTTT CAATAATATCACAGGACAAGTACCACAAACCTTGTTGAATCTGACCTCAC TGGCCTTCTTGTACGGACTCTTGATTTGCAAAGTTTATTTCTACGGAAGG AAGAGTTTCGTCATTCTTCTTGCTAATCTTTATAAATTTTGTTTCTGACT AGATTTCTTGGGAATAATAGCCTTTCAGGAAGTCTACCAAGCTCAATAGG ATCATCACTTAAAAATTTGTATGTAATGCGGTTCAGTTTTATTTACCCAA TAAAAGCAAGCCGGTGCTTATGTAATTTGACTAATTTCTAATGGTGCTTT CATTCTATTATTTTGTAGAGATTTTTCTTACAACCAGCTCTCAGGAAGTG TTCCATCTTGGGCTAAAAATTCTCAATTGTAAGTTCGAAATTCTGAAACT CCCATTACTGGCTGAACCAAATCCCACCTAAGGGCATGTTTCATCTAAAT TAGGCTCCGAGGCTGACTTATCAGGCTTATATGTACACATGAATAAGCTA GATTCCTATATAAATCTGAAAGGCTGTTTTGATGCATCTATCTTAAGTAT TTATAAAAAGAATTAAGATGCCTATGGTATGGAGTAAGATATTAGTCTTA CAGCCTAGCACAAAATTGAGCCAACTATTTATGAGTAGGTCAAGTTTTCT TATTTAAGTTATAGCAAAGAAGTCCTAAATATGCTATTAAAGTATGAATA GTGCATTCTAATTGTTGCCTGTTGTTCATCCTACTCAGGAATCTGGTGAC AAACAATTTTGTGGCCGATAGTTCCAGCAACAGGTTTGTCCATATTTCAG TATATCCTCAAGACCTTCAAGTATGATTAGTATGTTCTCCCACCTTGTAT TTTGGGTTCAAAACGCCACTTTGTTACATTTGCAGTGCCTTACCTACGGG GTGGGGGTGCCTTCAGCGTAATACACCATGTTTTCTTGGTTCTCCAAAGT GTGAGACTTCTGCATTTCGAAATTTTAAGAATGTGACTACTCTAGTCTAG GAACTAAAGAACCAACAGCAGTTTTACTAAACTAATACCAATATTAAATA ATTTACCCTGCTTGCAGCTTCTTCCTTCGCCGTGGACTGTGGAAGTATAC GATCTGTATCAGGCTCAGATAGTTCTTTGTATGAACCTGATGGTGCCAGT CTTGGAGCTTCGTCATTTTATGTTAGTGGAGCACCAACATGGGGTGTTAG CAACGTTGGAAAGTTCATGGAGGCAAATAATGGAAGTTATATAATCCACA GTCCATACCAGTTTCTGAATACACTTGATACAGAACTGTTCCAGAATGCA AGGATGTCACCGTCTTCCTTGCGATACTTTGGTATTGGACTAGAGAATGG AAACTATACAGTTACACTTCAATTTGCAGAGTTTGACTTTCCAGACATTC AGTCTTGGAAGAGTAGAGGTAGAAGGGTTTTCGATATATATGTCCAGGTA GGTTCTCGCTGTTAAGTGACAAACAATACTCTTAGCTTATAAGCCAGTCA TATTTTTCTTATTATTTGTATATAGGGTGAACGTAAGGAGCAGAACTTTG ACATAAGGAAGGCCGCTGGCGGGAAATCTTTCACAACTGTTAGGAAGCAA TACACTATTCCTGTTACGAAGAACTTTCTTGAGATTCATCTCTTTTGGGC TGGCAAGGGCACTTGCTGCATTCCTTCTCAAGGCTACTACGGGCCTGCAA TCTCAGCTTTGAGTGCAACACCAAGTACATCCCTTGATTCGAAATAATGG TTTTTTATTGGCTACCATATGTGATACGCGCATTTTTTTTGCTTTGAACT ATACATACCTGAAGGTATACATATTAAGTTAAGGTGGATAGAAACACATA TTAAAGTTATGTTGAATGCAATCTTATGTCTCTTGAAATAAAATCAACCG AAAACTACTAGAGCATCAATATGAAAAGGGCACGACTATGTGGTGATGGT TATTTATTTAGGGGAAACTACCGAACATCCACAACAAAGTAGTTCACATT GCACGCATGTCATCAAGATTCACTCTAACACTGAAAATTCAAAATGATTT AATCTCTAACGGCACATGCGACTTAACATCCTTTTTTACCACTAAATATG TTGTGACGAGATCTTCGAAACTACAACCCATGCTGATATGTTCCGAAAAC TTTTTTTGTTTGAAAGTTATCAACCTGCAGTACATGAGTTGCTAGGCTGA ACATAAGTAGTTTCCAGCTTAAAAAATACATGTCATTTGAGATTTTCTAG TGTCTTTTTTCAAGCTATAATAAGTTTTCATCCGGTAATGTGAGTTATCC TACTATTCTCGCATTTTTACTGGCTTCAAAAACTAAGCTAGGTTAGATGT ATCGTCGACTTTTTTTAGCAACTTAGTAGTTCTACAACATGTGAGTTACT GGGCTAATTGTAAGTAGTTATTAGCTTCAAAAGTATGCCATTTGAGTTAC CGTGTTGTTCACATGTTTTACCCGCTTCAAAATCTTATCTCAATTTGGTG TCTCGACGTCTTTTTTTGGAGCTCACAAGTACCAACGCTAACTATTTTCT CAATACATTGGTAACTACACCGTCACTGCGGTGATTACTTTTCGCTCGAC ACCGACACTCTGATAATTAAATTATCATCATGTTGGTAACTATGTACTCC AACTTGGTAAAATGGTAACTACATAATACCTTGATAACAACATCAAGACC ATGGTGATAAAATTACTGTTTAGATTTCTGTGAAGAAAGTTTTAGAGAAG TGAAATACCTAATGCAATATATAGTCTGACATTTAAGATGCAATACACCA ACCTCACTTGAAATATACTCACTCTGATGACATCACATCTCTAACAAGTG AACTTTGTGTCAGATTTCACCCCTACAGTGCGTAATGCTGCGGCAAAGAA GAAAGGTAGTAAAACTGGTGTGGTTGCAGGAGTTATAGTTGGTGTGGCAG TTTTAGGATTGTTAGCATTTGCTGGAATCTTTGTTTGGAGGCAGAAAAGG AGAAAACTATTGTTGGAGCAAGAAGGTATGGGATACACTAGGACTACACT GTGTTCTAACTGAGCAAAGGAGTCGTCGAAGTAAACTTGTTATATCTTTT GTGATGTCTTGCAGAGCTGTACAATATTGTGGGAAGGCCTAATGTCCTCA GCTATGGGGAACTGAGGTCAGCTACTGAAAATTTCAGTTCTAATAACCTT CTTGGTCAAGGAGGATATGGGTCGGTTTTTAAGGTTGGTTCATCCCATAC AGTCTTGAATTTTATTTTAAGTTTTCGTTCTGGAAGTAATTTCCAGTAAG CCAGTAGTTCAAGTAAATATCAGAAGGCTGACCTATCTATATGGGTTATT TTTATATTTTTAGTTTCTCTACATACATGTTGATAAAATTCCTAAAACGA AGGCGGCAGGGGTGGTTATTTCATTGTATCTGGAACAAATGATGTTTGCA GTGTAGTACCTGAATGAAACTTCTTCCGTTGTTGAAAAGATGTTGTCTTT TTTGCAGGGGAAGTTAACTGATGGTAGGTTTGTGGCAGTGAAGCAGCTGT CTGAAACATCGCATCAGGGGAAAAAGGAATTTGCCACAGAAATAGAAACT ATATCTCGGGTGCAGCACCGTAATCTCGTGAAGTTGTATGGTTGCTGCCT TGAGGGCAATAAGCCATTGCTGGTTTATGAGTACCTGGAGAATGGAAGCC TGGACCGTGCTCTGTTTGGTACAAATTCTGTTGATTGACGCAGCTACAAA TCTGCAAATTTAGGCTTGGTATAGATAACTAAAAACTTAAACCCACATCT GCAGGAAAAGGGAGGTCAAACCTAGACTGGTCAACGCGTTATGAGATATG CTTAGGCATTGCAAGAGGTCTGGCCTATCTTCATGAAGAATCTAGCATTC GTGTTATACACAGGGACATAAAGGCCAGCAATGTCTTACTTGATGCCAAT CTCAATCCTAAGATCTCAGATTTTGGGCTCGCAAAACTTTATGATGACCA GGAGACACATGTCAGCACAAAAGTTGCTGGTACATTGTAAGTGCTCTATT TTGCTAACCTTTATGTTTACATACTATTTTCATATGTATGCTAATGACGT TTATCCTCTCCTTTATCAAGTGGTTATCTCGCACCTGAGTATGCCATGAG AGGCCATGTAACAGAGAAGGTTGACGTGTTTGCATTTGGTGTCGTGGTAT TGGAGACTTTAGCTGGACGACCAAACTATTACACTACTGAGGACCAAAAC AAGGTTTATATTTTCGAATGGGTAAGCTCACTGAGGAACTCTAGGCCCTA GTATTCTTTGTGTAATCGGTAAGAACCATAGTGAAATTCCTACTAAATAT TGGAAATGCAGAGCTCACATGCCTTCACTGAATTTTAAATCAAACCCTCT CAACACAGTTTTGACTATGTGAGTGCTTGCATCATGTAGAAGAACTGCAG TGAAACCGCTACAGTATATCTTAATATGCTAATTCAAGATTCAGTCAGCT CGATTTTTCTATAGTACTTGAACACTGTGTGCTGCATTTTAGCTCACAGT CTCGACGCTTTCAGGTCTGGGAACTGTACGAGGACGGCCACCCTCTGGAC ATGCTAGACCCCAGGCTCAAGGACTTCGACAGCGACGAGGTGCTCCGGGC CATCAAGGTGGCGCTCGTGTGCACCCAGGGCTCACCCCACCAGCGGCCGC CCATGTCAAGGGTGGTGGCAATGCTGACAGGCGACGTCGAGGCGCCCGAC TGGGTGCCGAAGCCCAGCTACATCACGGAGTGGCAGGTCAAGGGCAGCGG CGACACCAGCTACATGAGCTCCAACACCAACGGGCAGTCGAGCTCGGCAC CATTCCTGGGCCCTGTCATCGATGAAGGCCGTTGATATGATCCTCGTGGC CGATCGGGCCGTGGCGGCTTCTTGTGCCGCAAATATGTTGAGAATGGTGT CGGTACAGTCAGTTTTTTCTGAAGTGTACATTATTTGATTTCATTTGCTA GGGTTCATACTTGCATTGGCGCTGGAACTGTACAGCAGTAGTAGGTAGGA GTAGCAGGTAAAAAGTTGTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.