Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA020682

[Submit comment/correction]

Sequence	AA020682
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA020682
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAGGGCGGGGATGGAGAGAAGAACGGAGCTGACCTCCGGCGGCGGCG CGTGCTGCTGCTTCAGTTCGAGGTCGTGTCTGAAGCGAGGCTCGCCCGTG TTCTATTGCTGGAGGGAGAGGAGGGTACCGCTTCGTTGTTTCCGTGCGTT TCCGAGGGGTGGAGCTCGGAATCTCCCGAGGCCGGGCGGACGTGTGCGGG TCGCGGCTCGGAATTGTATCTAGTTTCCACGTTCTAATTCCACAACCTCT CCAAACGAGTGAATTCGGCCCAACAATTCCAATTAGCCAATTCCAAGCTA AAATTCCTACATCCAAACACTACATATAGTTGTTATTTGATCAGGGTGCG AACGGAATAACCTAGTTTTTTTTTTGGTTTACTTGCCTGCTCTCTACAGG CGCCGCAAAGATGCCGCAGGTGATGGTTGTGGCGCGCAACTTCATGGACA TGGTGGCTGCGCTGCCTGCCACCAAACTCGACATGCTCTACGATTCCGCC TTCATCTGTGAGGCCGTGCTCAGGTCTCCGATCCACCAGTTCTGCAGTAC TGCATCTGTGAGGTCTTGTTGCTGTCATTGGGATTTTTCACACCTTCACT TCTGCAGGTCATTCCCGCCTCTGGCAAAGAAGTACGTACTTCAGATGCTG TACGTGTCAGCGCCGGTGCCAGCTGCAGCCATTGAGGAGTGGGTGCTGGA TGAATATGCCTCCAAGCACAAGGTTGCTATCGATCGGCTGGTCCAACTTA GGGTCTTTGTTGAAGTACGTGATAGGTAAGATCTCATCCACCTCCATCCA GTGCTGGATATTGATGGCTAAGAAATTCGAGCAGACCATTTAATCTTCCT GGATTTGAGCTACTAGCAATGCACCGGATAATTTCATTCAGAAAGCTAGG TAGAACTATGTTGTTTGTTTTACCCTAGTAAGATAGTGGGTGTGCGATAG CACATGTTGTATTTTTGGCAGACATGGGCGATTTGATCTGTTATGCATAC CAAGTTGCTGAAACTTGTTCAGAACATTGGTTCTACTTTTGCCTCATCAA TTGAACAAAATCCAGTTGGAGGTAGTAAACATTGTCTAGCCCCGTAATAT TTCAGTGCCAGTCTTTTCGCCTTGATATTGTAAGTATCTGTTGGTATGCA TGCATATAGGCATAGTTAATATGAATTATATTGTTTAAATGTTTGCATTA CTTTCATTATGCAAATGAAACTGTGTATTTTTCCAATTTCACCTGCTCTT GTCCTGTTTGTATAGTCTACAAGATGAACTATGGAATTACTAGTTCACTT GATTTTGCTGTGCATATAGAAGAAAGGAGGTGAGCTACAAGATGAACATT AAGTTCCAGGGAAATATGCAGAAGTATTTGGTCAGTGGGTAAGTTTCCTA AAATACTTTTACGAAAATATAAACATGGTTGTTTGTTTATTTATTAAGTA AAATATCTAGCATGATGTATCTGAGATTAGTGATGCTTCTCAAGGTTTAC TACTTTGGCTTTTGTCCTGTAAGTTCCTCCTAATGGGCATATGAGGTTAT GATACAGTTGGTCAAATTACATTTTTTTTTGCTGCAGTGGAAGTTTACCA AGGCAACCGATACCATCAAGTATCACTGGCAGATTGCCTACACTAACAGA ACTAGAAAACTACGCTCTTGAGCAATGGGAGGTTAGAACGACATAACTTA ACTAAATAGTCATGTTTTGATGTATTTTCACATTGTCATTTTCTATTTTG CTCATGGGATCATACTCTTCGAACAGTTGGAATACTTTGTGTTTAGTTCC TCTAGTAATGTCTTATACTCGTTCATCTATTTTGCGGCAAAACAGTGTTT TTTGCTGCAATTGATCAACTCATCTCAAGTTGAGAAAGGAACAAGTTTCA GCTCGTCTATGATGAAAACGTTCCAGCGAGGTCTTCTGAGTTCAAGGTTC AATCTAGTTACCTCCTTGTTTTGACAATGAGTTATTGAGTAGTGATAGTC CAATTCCATTTCAATAACATGGCATACCAGGTTTAGCTCTTTTCCTGTGC TAGTACAGTTAGGTACATCCAGTGGCAGTGTCGACATAGTAATGCCCTGA CAAAAATCAGAAAGTAAATTTAAGACAGCAAAATGTTGTTGTTTTAGTTT GGTTGTGTTCACTTTTCTGGTTGAAAATGGGATTAACTAGTGGTCCTAAC AACTAACAACTCATTGGTTTCAGCATCTTGAGATTTTGATTTTTTAATCT ATTTATTTGTTGATAATTTTTTGGTGTTTTAACTCCCATGTGGAACTTCT AAAAGCTAATACTTCTGTTTTCTGCTGCATATTCTCTCTTGACTGGTTCT ATATCTCTCACCTTTTTGGTATATTTACTTCAATGAAACCATAAGAAAGA ATTCAATATCACGATTTCCTAATTTTAATATACTTTGCAGGGATAATGAA GCTCCAAAGTTATCTGAGAATGGCTTCCAGTTTCTGGTGTGTGTTTGGCT CTCAGTAGATCCAGTTATCTGACACACTTCCAGCTTTGGTTCTCAATTCT TTTCTATTTAACCAGCTAATGGAGACAAATGCACAACTTTGGTACATAAT GCGGGAATACATTTCATCAGCAGAGGTATCGGTATCGTGCACTTTATAGA ACTCTTTTGATTGGAAATGAGTTTTCATTTTGTACTGACTGTTTGTATTA TTTAATAGGAACGTGGAGTGGACCCCACAGAGTTGATATCATTCCTCTTG GAACTTAGTTTTCATACACTGGGAGATGTAAGAACCATACAAAAGAGAAA AGTTACCAACCTTTATCTGCAATTACCATGAATTCCTATTTTTCACAGCA TAATTTTCTTCAACAACAGTATTTTATATCTATGTAAAAGAAGTGTGCAT GGTTCAAATAGGAAAGGTTATTGACCTGTAATTTATGGAATATGAAGCAG AGCATAAAAAAGATACAACAATTTTGTCTATCTACCAGGATAGGGACCGA ATGACATCAACTTTTCCCCCTTCTCATTAGAGTTTTTAATTAAATAATAA TATCATAATTGTTGCACTTGAATGAAGTTAAGGGGCTGCATAGCTACAGT ATTCGGATTAGATTGGTTCTTTTGTGCTCATACTTTGTTGCCTGTAAGCT GGGTGTAAATTAACAACCTGTGCCCCTATGGTCATGCTTCAGGCTTATAG CTTGAATACTCTGACGGATGTCCAAAGAATGGCTATTAGGGATCTGGCGG AGCTGGGGCTAGTCAAACTGCAGCAGGTAAGTGATTTAGTTTTTGTCCCA GTTCAGAGTGATGAATATGAATTTCGATAGTAAATCAATAACAGGGTCGA AAAGATAGCTGGTTCATACCTACAAAATTGGCTACAAATCTCTCATCAAG CTTGTCGGATTCATCTGCCAGCAAAGAGGTTTCATGACATCCTCTAGCCT TTGATATTGTTTATGCTCTTCAGATCATCATAACTTCCAACTGACTTTCC ACGTCAGAGTTGATAGTGTATGATATTGTTGTGGCAGGGTATTGTGGTGG TGGAGACAAACTTCAGGCTGTATGCCTACTCTGCTTCCAGATTGCACTGT GAAATCCTACGCCTTTTTTCGAGGTACATTTGGTTTCAGATGAGTAACAT AACCTAGCTCCCCCTTCACTTTGGTTATTGCTTAATAGCTTCTATTGCAA GTTTCTCCTTGCTCTTGTTTATCGATATATGTTGAATTTTTGGTATGCGA AGGAGCTACTATTTTTATTTGTTTGTCTTGACTGACTAGGTTATGCAATG CCAACCATCCAACTGGAGTCCAGTACTTAATCTTTGCAATACAAAACTCA GCAACATTACATCGCCAGTGATGATTAGGGTGTGATAAAAATTTCATATG GTTTTTGGAGGATTTGAATCCTTAGAATTCTTCCTGCCTTAGTCACTTGA TTGGCAGGATTTGGAGGAAAATGTGCATCAACTCAAACCTTTTGCTACAT CTTTGTGGAATGCTTTAATGATTACGTGTTTCTAGGGTGGAGTATCAACT CCCAAACCTCATTGTGGGAGCTATTACAAAAGAAAGTCTTTATGGTGCTT TTGATAATGGGATCACTGCTGAGCAGGTATCATCTGAATTATACACGTAT TTCTACTGGATTCATTACATAGGCACACAGACTTATGCTTCTGTTGTTGT TTGTTAGATAGTTGCGTTCCTTCAGCAAAATGCCCACCCTCGTGTTGCCG ACAAAATACCTATAGTCCCAGAGAATGTCACAGATCAGGTAAGCAACAGC CTATCCCTCATAGACCAGGCATCACTGTTCAACATAACATATATAACACA GAAGACCGCCAATTCTCTGTTGCAGATTAGGTTGTGGGAGAATGACCGTA ACAGGGTCGAGATGGTCCTGTCACATGTGTATGAAGAATTTCCGAGCAAG GTAAACCCTTCATTTAATCCAATTCAGGCCAATGGTACTTGTGGAATTTT TTTGGAATTTTGGACTTTGCTTAATTACAAATGTCCATCGGTGCTTGCTT TAGTTTTTCTTGCAAATTAGTGCTTGTTTTAGTTAAAACACACACTAAGC ATATACTATTTTGGGTGCCTTTTTCCTTGCGCAGGACGTGTTTGAGCAAT GCTGTGACCATGCAAGGGATAATGGGTTCTTGCTGTGGGAGGACGCGAAG AAGATGCGATTGATAGTGCGTGGAGAGTTCCACCAAGAGATGCGTGAGTT CCTCCGCAGACAACGATGAAGAAAGGCATGGATCTCTCTACTGCCATCTT TAACACACTTCTTGGTGTGGAAGGGCGAATTCACCTGATAACTCTTGAAA AATATTCAGCTGCAGCAGGCAGAGCAATCGCTATTCTCAGTTCAGTGTAA TCTTATATACTCCCTCCGTCTCAAAATAGATGTCGAAGATTTGTCAAAAT TTGGATGAATCTTGACACTATTTATTATAGATACATCCAAATTTTGATGA ATTTTCGACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTAGTAAAAGTGTTAGGCTT AGTTTTAGTTTTAAAGCCGGGATAAAAACAGAAGTGAAAGAATTTTTTTG GTTGAGTGAATCAACTTAAATGCAGATTTTATCTAGTGTTGTCTTCTCAA CTTTCGTATCAGTGTCTGAATAAATTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.