Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA020144

[Submit comment/correction]

Sequence
AA020144
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020144
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGCGGTCTTTGCGGAGAGACGTTGTGGGGTGGGGGGTGGGGGGTGGG
GATATTCTGGGCGATCGCGCCCTCTGACGACGAGGAAGGGGAAGTCTCGC
CGCCGATATCGCCATGGGGCTCGCCGGTGGATCAGAGATCCCTATCGAAG
ATCATAATGGCGTCGATCTCGCGGAAGGAGAAGAAGAAACAGAGGCAAAG
GGAGATGGTGGTGATCCTCGATGCAGGTATGTCTCCGGTAAGATCTCGCA
CTTTTCCTTCCTGTGATGCAGGTCTGAAGACGAGGGGGGGGGGGGGGGGG
GGGTGTTGCCGGTTCTTTCAACGGCGATCTTCTACCTGGAGGATTTCAAT
GCGGCAGATTGGATTACCGTGCACAGGAGAAAGGCGATCAAGTCGAAGAC
GAGATTTACTAGCCGGTGGAGAGACGGTCCGCCGGCGCCGTGGGTACGCT
CCTCGCCGGCGTCGAATGCTCGATTATTTTCAAAAATACATCCTGATCAT
GCGGGCCAATTGGGCCAGAAAACAAATAATTTGGTGTCTCAGTTGTTTGG
TCGTGTGGGCCAGCGATCTGCTACGGGTGTCGAACACAGACAAAAACCAC
AATGATTTACCTCTAGGGTGCGTTGTGCATCCCTAGGGTTTATCCAACAA
AAACGTGGGGCGCAGGCGCCGGCTATTATCCCTATCAATCTCACATCGGG
TGGTGTTGTTGCCACTGCGATGGCGAGCCGGGGCGGTGGGCGTTTTCCCA
ATGGTAGCCGAGGTCGAGGGGGTGATGGTCGTGAAAACAGGAGATGGGAA
GGTGGCTTCAATGGAGGCGGTGGTAGGAACTTCTACCAAGGTAGCTCGAG
TGGCACCGCAGGAGAGGGCGAGGGCTCGGGGAGCGGTCAGAATGGTAACA
ATGTCTTCAACCATGGTGTTTTCAGAACTGGCCGAGATAATCTAGATGGT
TCCCGTGGTGGTTACAATCACAACAGAGGAAGGTTTTACGACAATGCCAA
CAACTACAATCGAGGTAATGGATACATATATAATAATCGGGGGAATTAGA
ACAATAGGAGAGAGTATCATGCTGGCCAAGGAGAGAATTACAGGGGTGGT
TTTGTGAACAAAAATCGTTATAATAATAATAGGCAGGAATTGTCTACAGT
TCAAAGTCAAAATTGGTGAAGGAAGCAGCTGCAGATTTTGCCAAACAGTT
TGCTGAATTACCTAAGGTGCCGAATGTATCGGTTGTTACTGCTGTGGCCT
CTGCTGCTAACTTGGGTGTGGCTAATTCCTCTGCTGTAACTCCTCAAGTG
CAGCCGCAACATACTTATGCTAGACCTGTGCTAGTACCCAAGGCTCGCCT
GGCGCAAGAGAATAGACCTACATATCAGCGCCCTGAAGATGTGTTCATGG
CTGTGGCAGGCATGGCGACAAGAAAACAGTCTGCTCCTCATGTTCTGGCC
ATGGAAAAAATTAAAAAGAAACTCTCAGATTGTTTCAAATGTGGAAAACC
GGGACATTATTTGAATGATTGTCCAACACAGCTGTGTTTATGCTTTCAAA
GTCCGGACCATGAGTATAAGTTGTGCCCATTGATCACTACTCCAAAGCCT
GAGTATGAATCTGTATGGGATGGCTCATGAGGAGCTCATGTTTTGGGAAT
TTCCCTCATCTGATATGGTTAGACCTAGTTTGGACAATATAATACTAGGC
TAAGTAGGGTTACAATTTCTGATGGTAACATGACAATTGAGAAAATTATT
GCACAACTAAAATGGATTGTTCCAGATGATCAGTACCAGTGGGAAGTTAG
GCATGTGGAGGAGAATGTTTACATGGTTACTTTTCCTAGCAAAGTTGATT
TAACAAGAGCACAATACTTCGGGACCTACACTATTCCTAACAGCAAGGTG
ACAATGAAGTTTGAGTCCTGGAAGAGACCAGTGTAACCTGCCTGGTCAAT
TGATAATATTTGGGTAAGAATCTATGATTTACCATCTGAGGCGCTAGATG
ATTTTTTGGGGCCGTGGGCGCTTGGCTCTCTGTTTGGCAAAACTCTGGAC
ATAGATATGGAATTTACTAGAAGAATTGAAGTTCTTCGGATAAATATCGA
TTGCCTTGATCCTTCACTTATTGCAGCAAGGTTGGACATAAGGATTAAAG
GAGAATTCTATAAGCTAAGGTTTGAAGTTGAGGGGGTACGACCACCACCT
CAAGATGAGAGGATGGAGGACGCCCCAAATGATGATGCGGATGGTGATGG
TCGGGGTCATGAGGAACAGAATGGGACTAAGGATAGAGAACCAAAGAGAA
ACAAAAATGATTTAACTGATAACAAACAAGGAAGTGGAGCAGGTAAGGAA
TCAATGTCCTTTGAGGGGAACCAGGTACGCTTGGATACTATTCAAGTAGG
GGCTTTCCATTTGTCTATACAAAAGGAGAAGAAGCAAACCTGGGCAGATA
TGGTAGATGAGGACGAAGAGAAAGCAAGGTATGTGCCACCGATGCTTAAT
CCAATAAGAACTATGTCTGTGACTCCTGTGGCCGCACCTAGCACTACAGG
ACCGGGAAGACGTCGGGGCCGTTGGCGTAGCCATCGTTCAGGCCAGCCCC
GCCAAGCAGCCGTCGGCGTAAAATTGCCCTCGGCATATTCTATGCTACGC
CGACGGCTGCCCTCGGCGTAGCTATTTTTTATTTTATCTCATTAAACTTT
AAAAAATTAACTAAATCATTCTAATTCGGAAAAATACAAATAATATATCA
AAATTTGCAGAAAAATAAGACCTATCTATCTACACTTAAATATTACACAT
TTATAAATAAAAATTAAGTAAAATATAAAACATTATATATAGTTTAAAAC
GGGCATAAAAAATTCAAAAACGATAGAAACAATGCGAAACCTTCGCGTGG
TGTCATATTATGTGACATATTTATAAGGAAAAATAGCAAACTTGATATAT
TGATTATGTCTCAAAAAACCCTTCACAAAATGACCTATCTCATTCGAGGT
TTCTTGGCTTTCGGGTCAAATGACCAATGTTATGGCTAGAACCAAGGCAT
AGTTTGTGATAATGTGCCCATATTGTGCATACACATGCATCATGGGATGG
CGAACAATGTTGCAGGAGGAAGTTTTCCTTTTCGTCGCACCAAAAAACCA
TTTCTCATTTTCCGAGCATAAAAAAACGGACGGTTTTGTGAAGCAACCAC
CAAATGGCTAATTCAAAATAGTACCACCACATTTTAAAAAAATACTATAC
CACCTTATATGGACAATGTCCCAACAGGGGGATCCGAAACCTTTCCGTCC
ACCTTTGGTGAAAAAGACAAATTTCTGCCGAATCGGCAGGAAGTGGGTCA
TATATGAACTACAGGTACATGATCCGATGCTCATGTTTTTTTACAAAAAT
CATTTTTAGGTTCACAATATGTTATTTTATCAAAGATCTAATGAAAGTTT
AGCGAGGCTCGGCCCCGAGCTAAGAATCTTTATGTCCGCCGTTCGACAAA
GTTTAACGATAGTTTAAAACGGGCATAAAAAATTGAAAAATGATCGAAAC
AATGCGAAACCTTCGCGTGGTGTCATATTATGTGAAATATTTGTAAGGAA
AAATAGCAAACTTGATATATTGATTATGTCTCAAAAACCCTTCACAAAAT
GACCTATCTCATTCGAGGTTTCTTGGCTTTCGGGTCAAATGACCAATGTT
ATGGCTAGAATCAAGGCATAGTTTGTGATAATGTGCCCATATTGTGCATA
CACATGCATCATGGGATGGCGAACAATGTTGCAGGAGGAAGTTTTCCTTT
TCGTCGCACCAAAAAGCCATTTCCCATTTTTCGAGCATAAAAAACGGACG
GTTTTGTGAAGCAACCACCAAATGGCTAATTCAAAATACTACCACCACAT
TTTACAAAAATACTATACCACCTTATATGGACAATGTCCCAACAGGGGGA
TACGAAACCTTTCCGTCCACCTTTGGTGAAAAAGACAAATTCCTGCCGAA
TCGGCAGGAAGTGGGTCATATATGAACTACAGGTACATGATCCGATGCTC
ATGTTTTTTTACAAAAATCATTTTTAGGTTCACAATATGTTATTTTATCA
AAGATCTAATGAAAGTTTAGCGAGGCTCGGCCCCGAGCTAAGAATCTTTA
TGTCCGCCGTTCGACAAAGTTTAACGATAGTTTAAAACAGGCATAAAAAA
TTGAAAAATGATCGAAACAATGCGAAACCTTCGCGTGGTGTCATATTATG
TGAAATATTTATAAGGAAAAATAGCAAACTTGATATATTGATTATGTCTC
AAAAAACCCTTCACAAAATGACCTATCTCATTCGAGGTTTCTTGGCTTTC
GGGTCAAATGACCAATGTTATGGCTAGAATCAAGGCATAGTTTGTGATAA
TGTGCCCATATTGTGCATACACATGCATCATGTGATGGCGAACAATGTTG
CAGGAGGAAGTTTTCCTTTTCGTCGCACCAAAAAGCCATTTCCCATTTTC
CGAGCATAAAAAACGGACGGTTTTGTGAAGCAACCACCAAATGGCTAATT
CAAAATACTACCACCACATTTTACAAAAATACTATACCACCTTATATGGA
AAATGTCCCAACAGGGGATCCGAAACCTTTCCGTCCACCTTTGGTGAAAA
AGACAAATTCCTGCCGAATCGGCAGGAAGTGGGTCAGATATGAACTACAG
GTACATGATCCGATGCTCATGTTTTTTTACAAAAATCATTTTTAGGTTCA
CAATATGCTATTTTATCAAAGATCCAATGCAAGTTTTCCTTTTCATCGCA
CCAAAAAGGCATTTTTCATTATCCGAGCGCAAAAAGGGAATTTTCTAAAG
CAACCACCAAATAGCTAATTCAAAAACGGAGGGTTTGTGATTAGTTGATA
TGGATATCATATTTGGATTTCTCTCATTTTTCTGATCAATTTAAACATAT
TATTTGTTGAATTTCGATTTACAGATTTAAAGATATTAATTATTCTATAT
TAAATAGAAAAATACAAAAAAATAAAATTATTATATTTTTATTTGAATTC
AATAATATTTTTACTTATTCATTAATATTTACTTAAATAATTGTTTGTAA
TTTCAAAAAATACAAACATGTGACATGATGATATAAGAGTTAATAGGATT
GATATCATAGTATTGACACCAATGTATGGATTACTTTGCGGAAACGGAGG
AACGAGGATGTTAAGCGTGCTGAAGCTGGAGTAGTATTAGGATGGGTGAC
CTGCTGGGAAGTTTGACTAAGACTGAAATTTAATCAAATAGTAACTATAA
TTAGTGTTAAAAATGTTCAAAGTAGGAGATTAACAAGTGAAACAATTCAA
AGAATAAAAAAATTGAGAAAAAAAATAAAAAAAAATTATTTTCCAAAAAA
AAATAAAAAAAAAAATATTTTTGCAACCAGTCGACAGGCTATGCCGACGG
CCGCTACGCCGACGGCAAAGCCCTCGGCGTAGCATACGCCGACGGCATTT
TGATACGCCGACGGCTTGAGTGTGCTCCGCCGAGGGAGATCTTTGCCGAG
GAGGGCCCTCGGCGTACCATACGCCGAGGGCATTTTGGCCTACGCCGACG
GCCTTTTGCCCTCGGCGTAGCGTGCGTGTCCCGTAGTGTAGGGGCGTCAC
TGACTTGGACGCCTCAGATGCTAGTGCTGTTGCAGATGCTTTTATCTCTG
CCGAACGTGAGTGCCGGGCTGCCGAGGCTTCGCAGAAGAAAGTTGTTGTC
GGAGTTGCCGTGGAATATGAAGTGAAAATTCGAGGACGTGCTAAGCCACG
CCGTCATGGCAGTGAGGATGTCTCTACTTCTGTATCTCTTGGACGGGTGG
GATCAGATGGAAAATTCCAACTCGTTGAGGGGTGGAAAACCTCATGAAAA
TGAAGGTATAGTTTACGTACAGACACCATCTCATGTGTCACCTAGTTTTA
ATATGTCTAATGATGCTGGCTCGCCACTATATTTACCTGGTGCTATGTCT
TCTTGTTTGAATGGCAATCATGAATCGTTCTGTGTTAATCATGTTTTTAA
TATAACAGGACATGTCCTCAAGCCATCAAAGGCAGAGGTGATAACCTTTG
GTGGTATTAAAGAGGCTTCGACAGCTGGGGTTCGAACGAGTGGGAGGTTG
CGTGCGCTGCCTAATGCCGATGTTACACAGATGGAGCGGGCGCAACACCT
AGCCTAGTGTTGTGATGATTTCATGAGCTCAGGTAAAAATCTAAATAAAG
AATTTTCTTTGTTGCAATTTTCGGATGACGAAATTATAGAGAAAGTGAAT
AATATGGGAATTGCTTTAAGAGGACAAAGTGGGAGCGCTGTAGCTTCTGC
TAAGTTAATTAGGGACAATGAGATTCATCGTGCTTTAACTATACTTAAGA
AAAAAGAACTGGTTGAAGGGGAGGGTCTGGATAGAGATGTCTCTCACCAT
TTGTTGGTGTCCCGAGCATCGAACCTATGTGAGGATTTATTAGATGAACA
AGATTTCTCCGCCGACGAGAGTGTATAATTTGTTGAACCAGAAGTGAGGG
TAGGTCGTTCGCGAAGACGGAAATCATATGATACGACAAACGTTAGGAGA
AGTAATAGAGTGATATTTAAGACAAAAAGTTAAATGGAAGGTTTACGAGG
GATGTCATGGTATAGTGAGGGTTTCAAAGATTCGGAAAAACATCGGGCTG
TGCAAGAACATATAAGAGATTATTGTTTAGATTTTATCGCTTTGTTGGAA
ACGGGAAGGTCCAACTTTACAGTATCTTTTTTAGAACACCTCGCTCCTAA
CAAGGACTTTGCCTGGTTTTGCCTACCGCCACATGGGCGGTCGGGAGGTA
TACTTGTTGGAATTAATGCGGAAATATTGCAAGTCACAAAAGTAGTTACA
GGGAATTTCTGTGTTAAGTTACATATTCGAAATAAAAAGGTGGCTTCGAG
TGGGTTCTAATTCCGGTCTATGGGGCGGCACAAGACATACACAAAGCTGA
ATTTTTATCAGAATTAGTAAGAATGTGTGAAACTGAATCTTTGCCTATGT
TGTTAGCGGGTGACTTTAATATTTTAAAAAAAAGAGAAGAAAAAATAATG
CTAATTTTAATCCTTATTGGCCGTTTGTGTTCAATGCGATTATTGAAAGT
TTGGACCTGAGAGAAAATCGTCGAGACGTGCCAACTTATGAAAAGTTGGA
TCGTGTTCTTGCGACTGTAGAACAGGAACAAAAGTTCCCCATGTTTACGG
TACAAGCTCTGACCCGATGCGGGTCAGATCACACACCGTTATTAATTGAT
TCTGGCTCTCAAGCTCATTTGGAAAACAAGGCTAAATTTTCTTTTGAACT
ATCCTGGTTGAGACGGGAGGGTTTTCACGAGATGGTAGCCAAAGAATGGA
ACTCGGTTTCTCATGGTCGGTCACCCATTCAAATATGGCAAAACAAAATG
AGACATTTGAGAAGGTTTCTGAGGGGTTGGGCTAAAAATTTGAGTGGGAG
ATTAAAAAAGAAAAAGAAAGGCTTTTGGCCATTATTGATGTGCTTGACAT
CAAAGCAGAGTCGGTACCTCTAATAGTGACTGAAAAACAATCGCTGAGGG
ATGCCAATGAAAAGATCGCTAATCTAAGACGAGATGAAGAGACAAAATAG
GCTCAAAGAGACAAGGTAAAGCATGTACAGGAAGGGGGCAACAACACAAA
ATATTTCCATCTTATAGCAAATGGTAAGCATAGGAAGAAAAAAAATATTT
CAACTAGAACAGGAAAAAAGAACTATTGTAGGTGAAGATAATCTTAAAAT
ATATATTACTGAATATTACAAAAATCTTTTTGGTGAACATGATCAAAATA
GTTTCTCCATGACTGAGGAAAGGACCAATGACACCCCGCAGCTATCTATA
TGAAGAGAATGCTCTTCTTATAGCAAACTTCACCGAGGAAGAAGTTTTTG
AGGCTATTTCTCAAATGTAGCATAATAAAGCCCCCAGCCTAGATGGTTTC
CCGGCTGAGTTTTATCAAAAATTTTGGTGCATCATCAAAAAGGATTTAAT
GGCCTTATTTCGGCAACTTCACATGGGAGAGCTACCTTTGTTTAAACTAA
ACTTTGGAGTCATTACACTTTTACCGAAAAAATAAAATACGGTGCAAATA
CAACAATACCGCCCTATTTGTTTGTTGAATGTTAGCTTTTAAATCTTCAC
AAAAGTTTCCACTAATCAGATCATTAGTATTGCGCAAAAAGTAATTTGCC
CTACTCAAACAACCTTCATGCCGGGATGCCATATATTGGAAGGTGTGGTC
GTCTTGCATGAGACTATTCATGAGCTACGTCGGAAAAAACTTGGCGGTGT
TCTTTTCAAAATTGACTTTGAAAAAGCATACGACAAAGTTAAATGGCCAT
TTTTGCAACAGGCTCTTCGTATGAAAGGCTTTGATCCAGTCTGGTGCGAA
TGGATTAAGGATTTCATACAGGGAGGGAGTGTTGGAATAAAGGTTAATGA
TGACATTGGCCATTATTTTCAAACTAGAAAGGGTCTGCGGCAAGGCGATC
CCCTCTCCCCGGTCCTATTTAATATTATTGCGGACATGCTCGCTATCATT
ATTGCAAGCGCAAAAGAGGAGGGCCAGGTTGGAGGACTCATCCCTCATTT
GGTTGAAGGAGGGGTTTCAATTTTATAGTATGCGGATGATACAATTCTAT
TTATGGAAAATAATCTTGGAAAAGCGGTTAATATGAAACTCATTCTTTGT
ATGTTTGAGCACTTGTCAGGATTAAAAATTAATTTTCACAAAAGTGAGGT
ATTTTGTTTTGGAAAAGCTAAGGATACAGAACAACATTATAGGGATATTT
TTGGATGTGAGTCTGGTTTCTTACCCTTTCGGTAACTGGGTGTACCGATC
CATCATAGAAAACTAAAAAATTCAGAATGGAACCCGGTGGAGAGTCGCCT
TATGTCTAAGCTCAGTTGCTGGCAGGGCAAGCTTCTCTCGTATGGAGACC
GTCTCATTCTTATTAATTCTGTCCTCACTAGCCTACCTATGTTTATGCTT
TCTTTTCTAGAAATACCAGTGGGGGTTCGAAAAAGACTAGACTTCTACCT
ATCTCGATTTTTTGGAAGAACGATGGTACACCAAAGAAATATAAGTTAAA
GAGATGGAACATTATATGCCGTCCCAAGGATCAAGGGGGGCTGGGAATCG
AAGTGTTAGAGTTAAATAATAAGTGTTTGTTAAGCAGATGGCTTTTTAAA
CTACTATCAGAGGAAGGGATGTGGCAAGAGATCTTATATAACAAATATTT
AAAAAATAAGACTTTAGCACAGGTAGAGGCCAAGCCCACATATTCTCCTT
TCTGAAAAGGCCTTATGAGAGTGAAAAATGATTTCTTCAAAGAAGTCTCT
TTTAAAGTTGGAGATGGGACGACAGTGCGATTTTGGGAAGACACCTGGTT
AGGCGACACACCTTTATCGGCTCAATATCCTTCATTATATAACATTGCTC
AACTGAAGAATGTTCTCGTGGAAACTGTTTTATCACAAACCCGTTTGAAT
ATTGCCTTTAGGAGGGTTTTAACTGGTGAGTGGAATAACTGGTTGCACTT
ATGCCAGAGACTAATGACGGTACAACTTACCCAAGGCAGGGATATGTTCA
TGTGGCAACTTACATCCGACGGGATTTTTACAGTCAAATCTATGTATCTC
GACCTACTAAATGGTCATGCTAGATTCTTAAGCACGTACTTATGGAAGTT
GAAGATTCCATTAAAAATAAAAAAAATTCATGTGGTTTCTTAATCAAAAA
GTCCTGCTAACGAAAGACAATCTAAACAAACAAAACTGAAAGGGGTGTCA
AAAGTGTTGTTTCTTTGACTCGGTGGAGACTATAGAACATCTTTTTCTCT
CATGTCCCTTTGCAAAAGTTATATGGCACATGATATACTTTACATATAAC
ATAACCCCTCCAACAAATATTACTAATATGTTTGGTAATTGGTTGAATGG
GATGAACAAAAAATTTAAAGCTAGGATCCGTGTAGGGTTTTAGCTTTATG
TTGGTCCATTTGGACAAGCCGCAATAGCATTATCTTTAACAAACAAAGGG
GTACAATTTTTTTTGTAGGTTATCCGACTCGCTGTGCACTGGATCCAACT
TTGGTCTCATTTGCTACTGGTGGACCAGCAGGAACCAATGCTTACTGGAT
GCAACCGCCTATTAATGGTGGCACATGATTTCTTTTTCCAGGCTACTGAA
TGGCGGCATATTAGTAGACTTCAAAATGGATAGCTTCATATTGCCTTTTA
TTTTTCGCTGGTTGATACATGTCTCAACCCTAGCGGATCCTTGATTGTAA
TAAATTACTTCTTAAGAACTATGCAATAAAAGGTTGACTGTGTGCATCAG
TTGATGAAGAGGCCGGGCTACGCTCCCCATTTCGAAAAAAGCACTTCTGA
TCATTTTTAGCAGTACTTTATAGATGTGCCTCGGAACATTTTAGTTGCAC
TTCACACATGTGCCTTTGTATATTTATACCAACAGTTATAAAAGTGCCTC
TGAATATTTGAGGAACTTAATAAATATTGTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.