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GrainGenes Sequence Report: AA019437

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Sequence
AA019437
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019437
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCTTTATACGAATTAGCAGTTTTTGATCCCTATGATCCTGTTCTGGA
TCCAATGTGGAGACAAGGTATGTTCGTCATTCCCTTCATGACTCGTTTAG
GAATAACGGATTCCTGGGGTGGTTGGAGTATTTTAGGAGGAACTGTAACA
AATCCGGGTATTTGGAGTTATGAAGGTGTGGCAGGTGCACATATTGTGTT
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GAAGACAAGATCTTCTTGTTGATCCAGAACATTGCAAAGGAAGCACAGTA
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AGCCGAGGAACTCACAAGGTCTCCTACTCGGAACATCAAGTTCTACTTCA
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TCTAAGACCCTATTTTTATAATATGATATTTATCACCTGTTGCATATTAA
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AAGACAACATTTAAATTGTGGGGTAACTAAAAAAAACTAGAACCATATAA
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GCCTCCCATGTTGTACATCATACATGCATCATGCTCGATCTTTTGTCGTA
GTATTAAATAGTGCATCCGGTGTTTGTTCTAGTGCTTTGCTTCTTCACGG
ATTAGGCCGATGAGTTGATGCGAGAGTCGACCCGATCTTCGGATGAACCT
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TTGACACCTGTTCCGAGATCGAGCGCGCTAACCACAGGTGGGGTGTGTGG
GCACGCCCATCGATTTAGTACCTGATTTCAAGTACTGTACTGGGGGCCAC
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GTGTTTTCGCGGTATCGACAAGCCCAGTCACACTTTCGGGTTCCCAGTCG
TTTACAGCCATTGACGCAAACCCTGGGTCCGTCTCGGAGACCGGCCGACT
TCGTTACGGGTAGCTTAGTGGGGTGGCCCCCTGTGCTTGCTTTGGGTCTG
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GTGATCTTGTACCTACCTGATCTGACAACAAGGGTGTAGGTGCGTGTGGG
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AAGTTTACTGTTATAATTTGACGTGTATCCGATATGACTAGTAATCAGCT
TCACTACAACGGAATGGCTAAATAAAAGTACCAACAACTGCTAGGTTTGG
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AATGGTTAACTAAAAGTGCCCACTTCTTATTATATTAGGATGACTATCTA
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TTCTTACCCCTCTCTGATAGCAGCTATTTTTATCGAGTCTCTATAGGTTG
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GGACCGCCGAATTCTAGTCTCGCCGTGTACTGGCCTCAGTACTGACCGCT
CTCTTTTTCCTTTGCCCTTTGCCGGCACCCCTTTTGTTTTTAGCAGGTTT
TGATCGACGTCGTTAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTTGGCCTGGGCAGGGT
TATGGACGCCATTGGTTATTCTTCAGGGCTCTTAGCTCAATTTGCATCTT
GTCCGTACTCGGACGCTGTATCGTTTTAAAGGTGATTTGGATCTTTGTAT
TGTATATCTGTATTCTTGACTCATTGAGTCGCTGTTGTATATATGTGTTT
TGTGGGTTCCATCGAGGACTATTGTGTAATGATATTACTTCGTTTTCCAC
CCGCACAAAAGTGCCTGGTGGGCACCTTTGAATCGTTTCTATGCGGGTTT
GGCGGGAATCGCTAAAACTTGCATAGGGCCGATTTTGAGGGTGTTACAGA
GTGGTATCAGAGCTCAGCAGTTACGATACCCCACTGGTCCAGCCTGTAGG
ATAACCTAGCTAACAGACGTTGTAGAGTGTCAAAACTATTTTGGAAAAAT
CGGTTGGATAGATCTGATTAGGTCTGCTTTTACTCCTTATCCCTTTGCTA
TTCTTCTCTTACCTCGACGTGTTTTGAATCTGCTCTCTTATCTTTTCTTC
GAGTCTAGGACTTCTCGTGGTTGGGTTTCCGTCGTACCTTCAGAGTTTCA
CTTCCTCCTCTTGTAACGGTGCTTCGACATCCGACCTTCACGCTATCTGA
TGAATCTTTCATCTATTGTACCTTTTCAGTGGACCGAAAATTCACTAAAA
TTTTTCTTTCTATCCTCCGATGTTTTCCGATACGACGAAGTCATCTACAT
CAGATCTGATGAGAATCTCCATTCCTCCTTTGATTTCGAACCTCGCTTGT
CGAGATCTTCAGTCTAATTCCGAGAATGGGTTGCCTGATTTTCTACTGCA
TGTGCGAAGTAATAGTTTGGGTGCGTGATGGATTGGCCCCCATGCCGACT
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CGCTTGTTGGTGGTGTCGCCGATTTCAAGATGGAGAAATAATCTTTGTTA
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TCTTCCCCATACCAGGAGGCGGATCTCGAGGGCGAGATCCATTGTTAGTG
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AAAAGCCATATTTTTGTTTTCTATAAATACCCCTCTCTATTTTAAAACAT
AAAATCCTCGGCCCGCCTGGATCTTCTATTTGTCTAAAATGTTTTACAAA
ACAATATTTAAAACTAAATAAAATTAAATGTTTTATAAAATGGGGGAGGC
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CGCCCCTGGGCCCCACCCCGAACACCCCCTGCACGGGAACACCTCTCCTC
GTTCGATCTTCCCTCTACCCCACCCCGCGCCTCCTCCCACATCGCGAGCC
CCGCCGCCGCTGCACATATTCTCCCTGGCGTCGCTCGCTCCAAGCCCGCT
CCTCCCTTGCCTGCTTCTGGCACTGCCTGTAGTTCCTCCCCGCCGCCCTC
CTCTCCTTCCCCCGGTCGAGCGCCACCACCGCCCCTTCTCCTGACCCACC
TTAAGCTCCGCCGCCGCGTGGCCTTGGCTCGAACCGCGCCGGTCCTCCGT
CCTCGGCCCATCACCGACCCTGCCTCGCCGACCTCGAGCCTCCCCCGTTG
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TTCTTCTTCCGGCGCCGCACGTGTCCCGGACACTGCCAGCTGTCAACGCC
TCTGGCCCCGATCGTCCTCTGCCTCTCCTCGTGTTCCCCTGGCCGCCACG
CCCTCGAGCGCCTCCTCCGCCCACGCGAGTGCAGCAAGGACGGCCACCAC
CGTCTCCCGTCGGTCCCGTCGGTCCAATCCTTCCCGGCCGTTGCCGCCCT
TGACTTGCGCCTCCCCTGCAGAAGTCCTTCTCGTGACTTCGACATGGCCC
TGGACGCCCGATGTTTTTGCTGCAAGCTCATCCGGCGTCCTACTGCAGCG
ACTGCCGCGTCCCCGAAGCTCTGGCCACCCTTTGCTCAATCCGCGCGTGC
GTCGCCGTGGACACATGTCCCCGTTCCAGTCGTCTCGATGCCTTTGGTTG
CTCTGTTGCTGCTACATGTTCGAGTACATGACAAGTTGACCTACGCCTCT
CGTGTAGTGTATTTTGTAAGATCTAGCTCATGCCAACCTCTACAAGATCT
ACATCAAGGGTGTGTGTGTGAGGTGAAGACAAGATCTTCTTGTTGATCCA
GAACATTGCAAAGGAAGCACGGTATCACGAGAAGACCGCACCGAAGTTGA
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GTTCTCCTTCACGGAACCCGGTTTTCAAGGACCCTTTGTAACCAAGATCT
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TAATATTGCCTAATTGCATCGCATGCCTGCCATGTCGTACATCATACATG
CATCATGCTCGATCTTTTGTCGTAGTATTAAATAGTGCATCCGGTGTTTG
TTCTAGTGCTTTGCTTCTTCACAGATTAGGCTGATGAGTTGATGTGAGAG
TCGACCCGATCTTCGGATGAACCTTCGGCAATGTTTTCAGGCGAGCAATC
TCCCCCTTTCTACCTATCTTACTTTTATAGTATTTATTCCCTCCTGTTGA
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TTGTAGCCTTATATTGCCTTGGACACATCCTATTACCTGTTGTTTGGTAG
ATAGTTGGACTTGCGCGTCGTAGTCGCTTGCTCAAGTGCTGTTGCGTGTC
GTCCAGTACCACAGCTGTTGAAGGCTGCCATATGATTTATGTTGGAGAGG
ATCATGGCTTTAATTATTGTTTAATAACTAAAATTGAAAGTAGGTAAATG
CAGAGGCACAGGTGGGTAATAGACAATATTTGGATTTTAACCGCTCACTG
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TCCGTCTCGGAGACCGGCCGACTTCGTTACGGGTAGCTTAGTGGGGTGGC
CCCCTGTGATTGCTTTGGGTCTGGGAAACGTCGTGTCCGAAACCCCGTCG
ACATACCGTTGGGTGTATGTTTTGTGATCTTGTACCTACTTGATCTAACA
ACAAGGGTGTAGGTGCGTGTGGGAACTTTGGTGCACCCCTGTAGGGTTAA
ATCTTTTCGAGAAGCCGTGTCCGCGGTTATGGACGACTTGGAGCACAGTT
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ATCCGATATGACTAGTAATCAGCTTTACTACAACGGAATGGCTAAATAAA
AGTACCAACAACTACTGGGTTTGGGATATCTCATGCTTATTGTATCTGAC
TAGTAAGTGTTGCAACTACAACGAAATGGTTAACTAAAAGTGCCCACTTC
TTATTATATTAGGATGACTATCTATACCTGACTAGTAATTGCTGCAACGA
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TCGTTTGGTCTCGAGGGGGAAACACCAGGATGGGTATGTTTGGTGGTAGT
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TTTTTATCGAGTCTCTATAGGTTGTTTAGTGCATGCCGCGCTGCCGCTTT
AGTCCACCATACCTATGTAGGCGAGGACCGCCGAATTCTAGTCTCGCCGT
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CCTTTGAATCGTTTCTATGCGGGTTTGGCGGGAATCGCTAAAACTTGCAT
AGGGCCGATTCTGAGGGTGTTACAACAGGTAGGGGTAATGATGGAGTTCT
ATGGTGGCGAACTTAATGGAGTAAGTTATTCTGATCCTACTACTGTAAAA
AAATATGCGAGGCATTCTCAATTAGGGGAAATTTTTGAATTAGATCGAGC
TACTTTGAAATCAGATGGTGTTTTTGCAGCAGTCCAAGGGGTTGGTTCAC
TTTTGGTCATGCTACCTTTGCTTTGCTCTTCTTTTTTGGACACATTTCGC
ATGGCGCTAGAACCTTGTTCCGAGATGTTTTTGCTGGTATTGATCCAGAT
TTGGATGCTCAAGTGGAATTTGGAACATTCCAAAAAGTGGGAGATCCAAC
TACAAGGAAACAGGCAGTCTGATACACATTTTTATGGTATCTTTGACCTC
TCTTTTTTGATTTGGCTTGGGAAACATCTCCCATCCTTTCTTTAACTCTT
TTTTTTCTTTATATGGGAAATTCTCCCAAATGACAAATGAATAGGTGTGG
AAGTTATAATTGTAAATAAACCACGATCGAATCTATGGAAGCATTGGTTT
ATACGTTCCTTTTAGTTTCTACTTTAGGGATAATTTTTTTCGCTATCATT
TTACGAGAACCACCTAAGGTTCCACCAACTCCAACTAAAAGAATAAAATA
ATTTCATTGAAGTAAGAAGTCTACCCATCTGGTAGACTTATTACTTCAAT
TAGTCCCCATGTTCTTCGAATGGATCTCTTAATTGTTGAGAGGGTTGCCC
ACAAAAAAGAAAGAAGACGAGTTCTTCTTTCTTTTATCACTTAGGAGCCG
TGTGGGATGAAAGTCTCATGCACGGTTTTCCATGAGAGAAAGAAGAGAGG
AATCCTCTTTTCGACTCTGACTCCCCCACTCCAGTCGTTGCTTTTCTTTC
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CTTTTTATTTCTCATCAAACGAATGGCATCTTCTTCTGGAAATCCTAGCT
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TTGGAATAATTGTTGGAGACTCAGATGATGGATATGCAAGCATGGTAACT
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ATTATTTGGTCTACGTACCGGAACTGATAGCATTTGAGATTATGCAGGAT
TATACACGAAAGATCCTTTTTTGGCTCTCTCTTTAGCCCTATGTCTCTTA
TCCCTAGGAGGCCTTCTTCCACTAGCAGGTTTCTTCGGAAAACTCTATCT
ATTCTGGTGTGGATGGCAGGCATGCCTATATTTCTTGGTTTCAATAGGAC
TCCTTACGAGCGTTCTTTCTATCTACTATTATCTAAAAATAATCAAGTTA
TTAATGACTGGACGAAACCAAAAAATAACCCCTTATGTGCGAAATTATAG
AAGATCCCCTTTAAGATCAAACAATTCCATCGAATTGAGTATGACTGTAT
GTGTGATAGCATCTACTATACCAGGAATATCAATGAACCCTATTCTTGCA
ATTGCTGTAGGACTTGGGTTCAAGCTTTCCCCAGCCTCTTTTCATCAATG
GACTCCTGACGTCTACGAAGGAGTGTGGTTCGTTCGACAAATTCCTACCT
CTATATCTATCTCTGAGGTGTTTGGGTTTTGCAAAAATCCAAAGACATGC
AGAAGAGAAATGCTATCCCCACTCCGACCAAGACAGAACTTTTACCAAAA
GTTTATTGTGATCTTTTTGTTCAAATAACAATTAAGGTGAAGCAGGGTCA
GGAAAAATGAATCTCTTTATGATAAACAGGTCCATTTTGCAAGTTCGTTA
TTACGGGTAGTTCCTACAAAGAATCGGACGAATAACATATACAATGCTTG
AATTATCTATGTAGATGCTACATAGTGGGTTCTCATCCTTCAGAGACTAC
GAGTGTAATAGGAGCATCCGTTGACAAAAGGATCACCCTAATATGATCAT
CCCATGGCTATTGGGAACGAATCAAAACAGATGGTTCTATTTCTCAACCT
TTCTGACTTGCTCCTACGGAACCAAGGTCGAAAGGATTGAAAAAGTCAGT
CATTCACAACCACTGATGAAGGATTCCTCGAAAAGTTAAGGATTTGTAGT
TCTTTTTCGAAATCGATTTTGAAAAAGAATGGATTCGGTCTTATACATGC
AATAGTACCTAGAATTACTACTGACAAAATATATGAAGTATATCCCTAGG
CTACTTTTTTTGTTTATAAACTCCCCAGGCGGGTGGCTAATCTCAGGAAT
GGCTATTTTTGATACGATGCAAACGGTGACACCAGATATATATACAATAT
GCCTTGGAATAGCCGCGTCCATGGCGTCCTTCATTCTACTTGGAGGAGAA
CCCACCAAAAGTATAGCATTCCCTCACGCGAGGATTATGCTTCACCAACC
TGCTAGTGCTTATTATCGGGCAAGGAGACCAGAATTTTTACTAGAAGTAG
AAGAGTTACACAAAGTTCGCGAAATGATTACAAGGGTTTATGCACTAAGA
ACAGGCAAACCCTTTTGGGTTGTATCCGAAGACATGGAAAGGGATGTTTT
TATGTCAGCAGACGAAGCCAAAGCTTATGGACTTGTCGATATTGTAGGGG
ATGAAATGATTGACGAGCACTGCGATACTGATCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.