Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA016005

[Submit comment/correction]

Sequence
AA016005
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016005
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGACTCGTCGCCTTCTTCCTCCCTCCTCCCAATCTCTCCCCCAGGCAGA
AAAATCAGGAAAAAGTCAAAACCCGGAGGGAGAGGAAAATAGAGAGGGGA
AAAAGCGGCGCGGCCATTTGCCGAGATGAAGCCCTCCAACTCCAAGAAGA
AATCCAAGAAGAAGAAGAGGCCCTCGCCGGCGGGGACCGAGGGGGCGGCG
CCGGCCCATCCGGCTGGTGGGCCGGCGGGTTCGCCCCCCGGGGCTCCGTG
CTCGCCGCTCGCGGAAACCCTAACCCTAGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCTG
CTGCTGCGGTTTCCGAGGCAGAATCGGGCAGCAGCAGCGGCGGGGAGGTG
TCCGCGTACACGCGCGCCTTCACCCCCAGCTCCTCGGGAACTGCCTCCAC
CTCCTCATTCTACGCCCCCTCCTCGTCCGACTCCACCGCCTCCTCGTCGG
CCACTGGTGACGAGCGGCGGGACCTCGCCTGGCTCTTCGAGGCCTTCGGC
AGCGCCACGATCGACCAGGTGGACTCGGCCTACCGCGAGGCCGGCGGCGA
TCCATTTCTTGCGGCCGGCATCCTGGGCTCCACGCAAGACCAGCAGCCGC
CGCCGCAGCTCCCTCCGCCGCCAGATCTCTCGCCGCGCGCTGGATCTGCT
GGGAGGAAGTCCGCTCGCAGGCCCAGGAAGCTCCCCGTCGCCGCCTCTGG
CATGGTTGCGGACGTGATTGGCAAGGGCTACTCGCGGCCTGCCACTCCGC
CTGTAAGCATGACCAATGGGTGGAAGGACAGGGATGGTGGGACCGTGAAC
AGTGGCTGGAGTGATGAGAGAAATGGGGAGAGAGACAGCGGATGTGGCGA
TTTAACTTATAATGCTGAGGAGGCCGAACAGTTCCTATGCTCTATGCTTG
GAGATCATTCTGAGCTCAGCATGGGTGTGGTCAGAGACGTGCTAGGTGAG
TCGCTTAACACCTGGTCACTTGCTGCTGTGGTTTTCATATACAAGTGTTT
TACCTGTGATCGTTTCTTTCTGCTGTGGAAGTCATAACCAAGTTGAATTG
CAATATAAGGCGTGTTTGGAGAAAAGGTAGTCTTTTTTTTGGAAAGTTCT
GGTATTTAGTTAATTCAATGGGCATTTATTTGGAATGCTTTGGTGGTTAA
ACTAAATACCAAACCTTTCCAAAGAACTACATATCATCCAACAAAGGCCT
GAAGGTTGAAGCTCTGTCTTCAGTTCAAAATTCATCGTTTAGTGAACTGA
GGAATGATTTGAAAGTTCGACTGATCTGTCAAAATGGGAATAGATTATAC
ATAGGGCAGTCATAACCATCATATAATCCACAAGCCAATCTTCTATGGTT
GTCTTTCAGATATGTATGTTCTTAATAGTCTCTAGTTTTCCTTTCAGTAG
CCCTAGGTATCAAAGTAACCTTGGATGTTATATTTTCCATGCTAGTATCT
GATCTATCAGTATTCTCCCACTGCATCTCTTTAAAGCAACCGGGTCGAAA
TAAAAGAGTGTTAATGTTAGGACATCAAATTGGCTCCTTTCAAATGCTTG
GTGGTTTGATTTATGGAGCTTACAGAGTGATGTGTGCAGTGAGCAAGGCA
GTATTGATTGTTTTGGGCTGAAGTATCCTTCCAAAAAGTCAAGTCAGCGA
ATTGATATTTGAGCTTATCATGTGCAAGGATGCCCAGAGTAAAATAGAGC
AAGATTCACGTATGATCAGTCAAGCGCATGTTTGATAAGGCGACACATAT
TGCACCCTTGTTCTCTTAGCTTAAAAATTGGGATGTTAATGAGATTGTTG
CATGTAATTTTTGTTTTGTAATATGTGCTTTCTACACTTCAAAATTACCA
CGATATCACACTCAACTGATAGATTCACTTCTCTTCTTCTGGTGCAAAGG
ATATATTGGATAGGAGATTGCTTACAGATTGCACAATACTTTTGTTATGC
AGCTGAAACCGATCCACAAGTTTAGTTGGACAATTTTTTCTCCACGGAAC
GGCTGTATGGTTGACTTATATACAGCTTCTGAAAAATGTTAGGCGATCAA
TCTAAATCATTAGACTGAACCTGGTGTTTGAGCCGCTGGTTTAAAAATCA
TTCATAGTTATTCTTATTCATTATGAAACTGCTTAATGTAATTTTCTATT
GAACTATAGCGTGCTGAGATACATATCTAACATTACTATTGCATTTGGTA
AGCCAGTTGGGCATGCTGTTTAGCTTATCTGAAAGTGTTCCTCATGTTAT
AATTCTTTCATTTTGCAGGTCAGTATGGATATGATGTTGAGAAGGTAAAC
CTATATTCACTTCATCTTTTAGTGCCTTAACCAGTGTACAAATTTCTGCA
TTTCACTAAAGTATTGTTGATTGATTGTAGCTAGAATCTTGCCTTCTTGG
TAGCATCAGCAGTTTGTCTTTTCTGCTTTACTTTTAAATTTGGACAAAAG
CATTTGTGTATGTGGTTCTGAGAATTTTCTCTAGTTCTATGATCCTATGC
TGCTAAGCTAAGAATGTTAAGATGTCACCATTGGCACAGGAGGAATACAT
GCAGGTAAACATAAAAGCTGCTTCTGTAACAATGTATGTGTGCTTCATGT
CAACTAGTCATCGATGACCATATAAGAGTAACCAGTTCGCAAACAACACA
TGCCTTTTTCGTGCAGTCATGCGGTGGCAGTTGTCAGGATCACTATGATA
AAGAGACATAAATATAGAGAAACTTACATACTCAATTGCGAAGAAAGACT
ATTGCCTTTTCTACTGAATGAGATGCTGTAACTTAGCAGCAATTTATTGA
GATTTTTACTAACCAGGTACTTTCAGGCTCTCGATACATTACTTGATATC
TCTGGTATGGGATGGTGCATTTCTAATGCTGATGAAAAGAATAGCACACA
CCCTTCAGATATCTTCCCAGAATATGGACTATATGAAGAAAATCCTACTG
CAAGGATTGAACAAAGTCCATGCCAGGTAGTAGCATCACATTGTTACAGT
TTGGGCTCCTATTCTTCAGTATTACTCTTGCAGATATTTCAAGTAGCCGT
AGTTGAGTTATACATTAGCAGCTACAAAGTTCATCAATAAGTATATTGTC
CTATAAATATCATGGGAGCATTGATTGTTTATTAGTACTTCATGTAGTAT
TATCCCTTCGTACTTGCCAACTTGTGGTATGTTGATTATAGGGGACAGTT
TAGGTTGTTTCTTTCAAAGCACCAAGTACTCCCAGTTTGCCATTGGTGTG
TTCTGTGACCTGGTTTTCTAGTCATAGAAGTTGTTGCCAACAAGTCTAAA
GGCAAATAAAACAAAACGTCTGTTAGCGATGTTGTTTATTTAGTGGCCCC
AGCGTAAAGTGAACTAAACAAATCTCCAGTTCCCAGAACTAAACAAATCT
CCAGTTCCCTCTTGTGTTATTTAGGAAAAAAGGAATACATGTAGCACTGC
TTACCTGTTTCCTTGCTAAATATCATGTTCTAACATTTTGTTTATTCAGT
TCCCAGAAGGAACACCTGGTATGTCATTCAATCATTCTGAAAGACAACAT
GAGTTATTCTGGGGGGTACAGCAGAGCAGGTGAACCTCAACTGACCATAT
ATGCTTTTCCTGTGATTTTTAGTAATATTATATAGCGACTTTTTAACGAG
CCAGTTCCTTTTTTATGACAGTTTAAGAGTAAGGTTGATGAACTTGATAT
GTATATTTTTGTCATGTGCATATACTTAATGCAAAAAAAATCTTTGCAAG
TACTTTTGTTTGGAAAGCTAGAGTGTGGGAAAAAAACAGTTGGAAACTGT
TGCATATAGAATATTCAATGCTTTCTCGCGATCGTTATGCACATACTGGT
AGTTCAGAAGTTGCAGAGTATATGTTTTCGCTAAGAACATATAACATCCA
TGATCGTCTAGACAAATTAATTTCAATAAAAGCTTTACGCACGCATAGCA
TGTGCCGCATGCTAACAAAGTTGTCCTCTGATAGCTTATATTTTGTTTTA
GTAACCTAAATGAGTTATGGCGTCATAAAATACACTAGTTCAATTTAAAT
TCCTTAGTAATTGTCGACTTCAACAGTATTGGCTTGGCTGTGCAGCTATT
TATCTCCTAGGCATCTATGATTTCAGTAATCACAACAGTACTTGGCTGTA
CATATCAGTAGTTGCACTATGTGCTTGCATTTCCATGTCGGTGGTTCTTG
GTTTATGATATGCTTTGTCTTTGGTTCAATAGCTACATGAAAGCTGTTTG
CGAGGTACAACACTCACCAACACCACCTTCAAGATCAACCGTGGTCGATT
CCAAGATGCCACAACAAGTCCTGGAGTCGCTGTTCAAGGTACCTGAACAG
GTTCAGCGCACACATGATCCAAGTAAAATGGACTGGAAAAAGATAGTGAA
GAAGCTGCAATCATACAATCATCCCATCACAGCAAACAACCAAGGAAGAC
CAAAGAATGGTATATCCTGTTTCTTATTGCTGTGCTTGCCAATCGTACAA
GACTTGATTTGTGTGTGCCTCTAATAATGCTCAGTTCATTGTGATTCAAG
ATTTCACTATTTTTCCATTGTACCAAACTGGCAATTTCCCACTTCTCATT
TCTTCACTTTATAGGTTTTCTTTCAAGCGTTTTCCTTACCGTTAGGTCAA
TAGCTCCCTCGCCTAAACTGTTTTGATTCAGTCTTATAAGTGAAATTGCT
ACTTCTCAGTTTCTGGATCTCTGTCTGATGCATTCTCATAATGCTTACAG
TTATATAGAATGGAACTACTTTTGATTGATTTGCTTACATATATACATTC
AACTGACCTTGTTCACCTATCATGCTTTGTAATTGTTGTATTTGGCACTG
CTGCAAATGATATAACTGTAATTTCTCACGTTAAGGGGATGGGTATCAAG
AGTTCCGTGGTGTTGCTGCTAGGCATTATGATAATATGAAAGGATACTAT
CAGAAAGTAAGAATTTATTTTTTGGAGTTCTCCTTGTGCCAGATCTTCCT
TTGTATTTCTTATTTTTTGTCTATTATTTTCCCATGCAGGCTGCCCTGGC
ATATTCCAAAGGAGAAAAATCTTATGCCTCGTACCTTGCAGAGGAGGTCA
GACTTCCACTTTTATGATGTTAAGGCTGTGAAGTATGACAGAATAGAAAA
GAAAGCGATAATGCAGAATCTCTTGATCTTTCATCATTGAAGGTTGAATG
ATTGAGAGATTTAAGTGATGTGCTGCTCTTGTGTTCTTATCTTAGATTGC
ATAAATTCAGTAACTGGATGTTTGTCCTGTTATAGCATTCTAAGATTCCG
TTGTTTGTGGACATTTTCGGTCACCATGCCTATAGCTGCTATTGCGTTGC
CTTAGCGTCTCCAATAGTCCAATCTTTATTTCTTTTAGGGAAAACATTAT
CGGGAATTGGGTCGCAAGGAAGATGAGAAGGCCAGCAGGGAGATATTTGA
AGCCAGGTAATTGCATTCTTCTGATAGCCAGGGAGGTACTTTCTGAATCT
GTTGATACTAATTAACACTCCTGTGATATCTTCTGTTGGCAGAAACAAAC
ATATAATGAACACGGTTACTATTGACTTGCATGGTCAACATGTCAAGCAA
GCTATGAGGCTCCTGAAAGTCAACATGTTGGCTTGTGTATGCATGCCATG
TAAGTGTTCACATATATTTGGGTGCTGTAACCATTGCCACTGTAACACCA
AAGTTTATTCAGCTTCACTGGCCTTGATCTAATGTTTTATTGTCTAAATC
CTGTTTCTTTTTTCTCTTCCTTAAACAGCTACCCTTCTTAGAGTAATTAC
TGGTTGTGGTAGTGAAGGTACAGGGAAGGGGAAGATAAAACGATCGGTAC
GTACCTGCTTGAGTAAATAATTCTTGCTCATGTGCTTGCGACATCTATAT
GCTGCCTATATTCTTGTGCCTTTTTAGTTAATGATTCCTGCAGTGATTTT
ATATCAAATTAAATGAACTTTCGTGAATTGCATTTTCCTGGAATTTGCAT
CCTCTTATGCTATCAACATTTATAGTCTTGTGGCCATATGATTCAGTAAG
GTAGAATGTTGCTGTGCAGCTCTAGGTGGTGTTTGTGTTGCTGACATCCA
TTTGGGATCAAGTGTGAACACATCACTTTTGGTGCAATTGTGAAATCTTC
CAAATGAAAATGTGGTTGCTAAGTGCTCTGAGTGAGGGGGCATCCCACCT
CCTATCTGGGCCTTACATCTGCGATCCTTTGGGCTGGAATTATTCACATT
TGCACGATTTGCAGGATACTTTGCCTTGCTTTATTCTGTATTCAGTTCAG
TTATAATAGGTTAAAATCTCCTTGACTTCACATGCCATGCTCTTGAATGC
TGTAATATGGCTATAATAGGTTATCCAGCTCGTGGAGAAGGAAGGCATTG
AATGGCATGAAGGAAATTCCGGAACCATAGTACTACGACTAGGCGGGCCA
AGAGAATATCGCTTTCTCGAGCATGACAGCGATTCCGACTAGCGTAGTCG
GTGTCTGTTTTGGAGTCTGACATAGATCAACAGCCGTTCTAATCTATGTG
TATCTCCTGTATCTATCTGTATTTACATGTCCTGTAATTATGGATAGGAG
GCCTAGGTTCTGGTGTAGTAAGATAGTTTCTGACAACACAGTCGGGGGAG
ATAGAAGAGAGACAGTAGGTGCTGTCTGATGTTGTGATCATTCTAGCCAG
GCTGCTAACCTTGTAATGCACTCTTGAAGCTGTCTAATTGTATCATGTGC
TCCCCAGGACATTGTAAGAGGGGAAGAGCGAACAGTGTAACTCTCCCCTG
ATGTTTCCTTGTAAGATACGGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.