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GrainGenes Sequence Report: AA044706

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Sequence
AA044706
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044706
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTTGTTGCGTGGGCCTAATTTTAAACATCCCTTCCTCTCCGGCCTGCCA
TTGCCCACCTCCTCAACCTCACGAGAAAAACCCTTCTCAACCTCGCCCAC
CCAGCCGCCTCCTACTCCCTCCTCCCACCGGCGCCGCCTCCGCTCTGCCG
CCGCCGTCCTTATCCCACCTCACCTCTGCTCGCATATCCCATCGGCGTCC
ATCCATGACTGAGCCGAAGCCCAAATCGAAGTCCGCCAAGAAAGCGAGGA
AGCCCGCCGCCGGTGGGGAGGAGAAGAGCATGAACGAGCTCAAGTCCGAC
GCAAGCCCCAAACTGAAGTCCACCAAGAAATCGAAGAAGCCGACTGCTGA
CGGGGAGGAGGACGGCGCGGTTGAGGTCAAGCTCGACGTAAATCCCAAGC
CCAAGTCCGCCAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTCGCCGCCAGTGAGGAGGAG
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TTACCTTTTTAAAACTGAAGTTCCAGTTTTACTCTGGTCCCTTGATAATA
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AGCCACATGAATTGGCTGCACCATTGGTCCGTTATTAGTTTAAATTAATT
ATTCTGTTTTCTTTTTGCTAGTATGCTAGGCTTGCGCAAGTTAGGGAAAG
AAACAACATGCCTGCAAAAGCCTTTCATGCCTTGACTCAAGCATTGTGAT
TTCCTGCTCTAAACATCTGACTAGGCGCCCTCTCACGTTATCTGCTTTTG
TTTCCTTGCACTATAGTTTTTTCTCATTTTGTTCTGCTATGTTTAGTTGT
TTACCACTTCTGTTATTCTCATTGTTTGTGTAGTAGCAAATGGCAGCATT
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TTGGATATGGCAATCTGGAAACAGTTTAATGGTTCACATCTGTTTACACC
TCTGATACTAGTTGAGCGTAGATCATTTGAATACGCCCACAATTAGTCTA
GCTTGTTTAGAAGGGTAGGTCTACATACATACTTAAAGAAAACAAGTTAT
GATGTGTACCTGTTCTGTTCCATTTTCTCTAGTTTTATTGGGGTGATAAT
AGGGGAAAGTTCATTTGTAAAGGAACTATGCTGCATGGGTACACGTGAAT
GGAGAGGGCAACGGCTGTTTTATGAGTGACATTATTTAGAACATTAACCA
GACTATTTAATTAGCACTATAAGATTTTATTTTCTTATCAAATAAGATCT
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CTAGGTTATTGCCTGATCGTAAGTTGAAAAGTCTTATTCAGCGCCCACTA
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GTAACTTATGTTTGAGTTATCCAGGATTCAAGTAGATGCTATATGTAGGT
CTGAACTCTGGAAGAAAGAAGCCTTTACTTCACTTACTGACTTAAAAAGC
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CATTATTAATTTATTATATGTGACACCTTTATTGTTGTTCTATTGGCCAG
AATTTTAAATACCAAACTGCTAGTTGAGATGTTCATCGAGTAAATTTCAG
AGAACCGTAGATTTTGGGGCAACGCGAACACAGAAAGAAGGAGCCTCCAT
GTTTGATGGCATGTGGCACCTCTTATCCACGTGACACCTGACATGTGTGT
CCGTATGGTCAGAAACAAGGATTAGCGGGGAAATGGGCTACTGGAGTCTG
TGGTTCCAATTGTCCCAGTATATATGGTTATGTGAAAGTTTCTGAAAAAC
TGTACTCCCTCCGTGACATTTAATTTGGGACGGATGGAGTAGTTTCTTCT
TGCCACTTGCCAGTGCTCCAAATATCTGAGTTATGTGAAACTTACCCATG
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TGTTGACCCCTGATCATCTATTTTTCTGATTACTGTTACAGGTACGAGAA
GTTTGTTATTGCACTGGAGGATGCATTAAAAGATATGCTTCCAAGTCTCA
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GACAATCTTGCATTAGATCTAATCTAGCTGTGACTGTCTTGTGAGTGGAG
ATATGATGTACTCTATTACTAAATTGTGGGCATTGGTTATTGAATTGATA
CCGCATCATCTTTCAAACTGAGTTAACGTGGGGCTAGTAAGCAAGGCAAT
TTTGTAGTCAGGCTTTTGTTCAGATATGGAATTACATTTTAACATTATTA
TTGGTGGGCACTATTTCCTGGCAGGCACCAGAAAATTTGAAAATCAGCTT
AGTCTTGTAACTAAATATGACGATTTGAGTCTTCTGGCAGTATTTTTGTC
GAACCAGCCAGAGTTTCCCAGGAACTGGTTGTGAAAGCAAAATTACCTTA
TCGACTTTTGGCTTTGAAAGGAAACCACGAGGTTTGAAACTGGTTCTTGC
CTGTAACTGTCCGGTTGACAATTCTGGCCAAGGTGTAGGGGTTTTGTCAA
ATCTGGAATTTTTAACTCTGTCACTGGTTCCTCATGAGATTATCTGGCAT
TCTTTTTTCGAGGATTTAGTTATCCCAGCTTCGTAAAATAGACTTTCTTT
CGCTGATTTGTGCTATTACTAGGATCACTGACTATATTCTTGTGTTTCCA
TGTCATGAATGTGTGTTCTTTGTTGTTTTCCTCTCTCTGCAGACGGTTTC
CACCCTTTTAAAGAGTAAATCAGAACAGGAACGCCGGTTACTTACAGCTC
TTGTTAATAAAGTAAGTTGTCATTTTTTTGGCATTCTCCATTTCCACTTA
GTACAAAGTGCCCAAAGCAGGCACAATTTTTTTATAGTACAATACTAGAT
TACTTCTGAGAAGCAATCAAGCAATACCCTCAATTTTTATGGGAAGCGGC
TTTATTCTTAGTCATCCTGATACAAATCTATTGCAGCTTGGAGATCCTGA
AAAAAGGGCAGCGTCAAGTGCCGCGTATCTGTTAACAGGTCTCCTATCTA
CTCATCCAAATATGAAGGTATGTACATTTGTTCCGTTAAAAAGATGCGGC
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CTGACAAAGCACTTTTGTGTTGTTGGACATTTTATTAAATTTGCAGATGG
TTGTGATAGATGAGGTGGACTCATTTCTGTTCAGACCACATGTTGGGCTT
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TTGCATCTGAATTTCATACAGTGCATATTAGTTCTTTGCTTCTGAATTTC
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TAAAGTTGTACTTTTTGAATACTAGAATATGCTCATCTATCCAAACTACT
CCCTCCGTCCTGAAATAAGTGACCTGGGTTTGTCTAGATACATGTCTAGG
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TTGTGCAGGTCAACTTTTTGAGCCATATTTTACTTGCTAAAAAAGGAGAT
GGACCTAAAATCGCAAAGCGGTTGGTGGATGTCTACATTGCCCTTTTCAA
GGTTTGGATGTGATTCAGCAGTGCCTATTTTTTGCTATGCTTAGGAATTT
GTTACTTAACCGGTGGCCCTTTTCCTGCCAACTATTAGTTTAACTGTCTT
TTCATCACATTCTCAGTTCACCATCTTGTTAGTCCCATTTCTCTTTGCAC
TTCTGCAGTTTACATCATATGATTTTTCCCTATGGCTTTAAGTTCCATCT
TCATAGTCTGCTCACTTATATAGTGTTGCTTTTAAATATTTAAAATTGTT
ATTCTTGTTCTATGGCTCTGTTGTCAGGTACTTATGTCTTGCCCTCGTGA
TACTAAAGGAGATAAACAAAGTAAACATGGCAAGAAAAAAGATGAAAACG
GAAAAACAAAGGGAAGAAAGGACAAGGTCAATGACTCTAATTCGCATGGA
AACATTGAAGTGGATCCACCAGCAGGATCAGATTTAGAGATGGATTCCCG
CCTTCTCTCTGCACTTTTAACTGTATGTCTTTCTGCAGACTTGCGTAGTA
CTGTCTCTTTGCTTCGCCGTGTTATTTGTTAACATTATGCTTACATGCAT
GTGTTTCCCTTTATTGTGTTCAAACTGGTTATTGAAGTCTCTAGGTTTGT
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GCAAGTTCTGAAGTTGATGATATTGTGGAAGTTCAGACACCAATTCTTTT
CAGACTGGTGAGGTTATTAGCTAATAAAAGTACATTGCCAAGTTGTCTGA
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CAATGTCGGTGTTCAGGCGTTAATGCTGCTGTACCAGATCTCGACCAAAA
ATCAGATTGCAAGTGACCGTTTTTACCGTGCATTATATGCAAAACTTTTG
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CATCCTTTCAGTTTGCTCTTTATTTTAGCGTACTTCGATATTAGAACGAT
AAAGTGGTTTTAAAGTCTTCTCCCTGGCATAACCTAACCATGAAGAATGT
AGCTATGCGTTTTGCACCCGTATATATTGTTAGAAGTCTTTTCTCTTTTG
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ATTTTCGAAGCGGTTACTGCAGGTCTGTTGGTTGATATTTTTTAACGTGA
AGCTGATTTTGATGATGTGGATAATACTTAAATTTTCTATCTAAGCTTGT
GATTACAGACATGGTTGTCATGGGCTCATGAGTCATGACCTATAAGGCTA
TTATGCCTTAATCAATTTTCTATCTAAGCTTGTGATTACAGACATGGTTG
CCTGAAGGATTGGCACTAGTTACACTACAACTATACTGCACTAACAGCAC
TATTCTACAACACCAAATAGGGTATAAAAATATATGAAATGAAAGAATTT
TGCAAGATGAATCCAATGATACCATTTATACAATCCCAATCCATATAATT
TAGTATATAGTAGTGATCAAAATCGTGTATCGAAGACCAGCAAAAAAATA
GTGCGCCTTATGTTTTGGGACGGAGGGAGTACACAGAACTAAAAACTACA
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GTTTGGGTCCAATGCCTTTCGAGGGAGAAGAAGATGCATAATTGTTTTAA
CGAGCTGTCGGCTACTCCCCAGCGCTAGGAACACAGTGCGCAGCCCTGTT
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AGCCGCTGTGCGCCTGTGCCGATGCAATTCATGCAAGCTTTGAGCTTGCC
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TGATTTGGAGAAGATGTGCTGGCATTCCTGCCGAGAAGACTGGATCCAGT
GAGCTGGCATCAGCCTGCGTGCTTCCCATCGCTGGCTGCTACAGCCGAGG
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CCAGTTTATTTTTTCTGGGTGTAAGTATAAAAAAGGTTTCTTGCAGCCCA
AAATTGGTCATCCTAGCATCTATTGCAAGTCTGGGCTGAATATTTTATGG
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CCTAAAAAACTCATAATTTGTAGTACTATGGATTATGTAAGAGTATGCTG
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GACTTTTTAAAGCTAATCGATGTTTGGACCATAGTCATTTCCAAATCCCG
GCAAAGAATGTATCTGAAAGCTGGTGTGGTAGCACACGATAATTACAAAT
TTGAAGTGTTGAATGCTTTAGTTTACCAGTATTATTAATGATTACGGAAT
CTCATGGAATTAGGGAAGTTCTATAATTAAATCATGTTGTCTCTAAACAG
GTGGCTCTTCAACGCCCTCCACAGTATGCTTGTGGATGCCTTTTCATACT
GTCTGAGGTCCTTAAAGCAAAGCCACCATTGTGGTATGTGGTTACTTGTC
ACCATAACATGTCAGCGAATTTTATCGAGGCATAATTTACATAATTTTTT
CAGGACGATTGTGCTCCAGAATGAATCTGTCGATGATGGTATTGAGCACT
TTGAGGACATTGTAGAGAATCCTGAGGAGCCTGCTATTGTTTCAACAACT
CTAAATAAAGAGGATGGTATGTCGGCTTCACTTGAGAAATACAATTCTGA
TGATGAGGATGGTTCTGATACTATGAAACAAGCAGAAGTGACTGCTGCTG
ATGAGAAGGGTCAAACCAATTCATCAGCTGAGGGATCAACATCACATGTA
TTGTATAATCCACGACACAGAGAGCCTTCTTACTGGTATTGTCTTTTTAA
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TATACTATTGCAGTCCAGTTACAAGAAAAATCTATAAAAAACAATTGGTC
ACTTGGTATACAAAATCAATCACCATTGTGTATGATTGACTAGATCTTTA
GTAACTTATAACATGGTAGTTTTCATTATATTCTCTCCTTTGTACTTCGT
TACAATACAATCAGTATTTTTCATCACCTGTGCCTTTTGCTGTGTTCTCA
GCAATGCAGATCGTGCCAGTTGGTGGGAGCTAACTTTATTGGCCTCACAT
GTGCACCCATCAGTATTTACAATGGCTAGGACATTGCTATCTGGGAACAA
TATTGTGTATAATGGTGATCCATTGACAGACCTGTCGCTTCCTGCCTTCC
TTGACAAATTTATGGAGAAGAAACCAAAAGGAAACCGCATTGCCGAAGGA
AAATGGCATGGTGGATCACAAATTGCACCAGCTAAAAAGGTGTGGATTTG
TTATTTACCTTTATTTTCTTTTGTTGAATTCAAATTGTTCATCTTGTGAT
GTTTCTTCTCTGGATTTGTTTGACTTTTTCATGTTATTTTTTCATATGTT
TGTCATGATTCCCATAATCTCATGTAGCTTCACCAATAGGAGGCTATGCA
TTAGTACCATTGATGTGCCTTTGTCATGTGGCACATAATGTCCCTGTGTG
TCATGGACAGTACACCAGTAACCATTCATAGACTAGCATGTAGCACAGCC
GTTGCTAAATTGTGGATTAGGTTTATTAGTTCGCGTACTTGTTCCTTTAA
GTTAGTGCTATCTTTTGTGGGTTTTCATCCTTCAGGTTGTACCACCTTTC
CATAAGAATGTCCATTGTTGTGCTTGGAATTTTGTGAGATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATCAATTTTCCTCATTCTTAACTTTTCTCC
CTGCATGTGTGCTGCTGTGCACCTGCGCCATTTAAATCCAGTGACACCTT
GATCAGGCCTAAGGGTCATTACGTAAAAACATTTATCTCTTCATAATTAA
TTTGAATATGCTTACGTGAAATCAACCTTTCTCTGTGTATATCTGCTGGC
CACTATAAATAGCTGTTTATGTGTTACCTGGCCACATGTTCAATGATGAT
GTTTGACTGTGCAATCTGTTGTGGATTTTATCATCAATGTGGCAGCATGT
GTGGCACTCTCCATACTCTAGATTTAGTACGAGTTGTCACTGCCGCCAAT
TTATTGGCTGATCTATCTACGTCGTGTCCCTGCAGCTTGACCTGAACCAT
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TGAAGATGTTGTTTTCCACCGTTTCTACATGAACAAGACTGGCCCTATTA
AGCCGAAGGCAAAGAAGAAAGCTTCAGTTCTCGATGATGATACTGGAGAG
CTCTTAGCTGATGAAGCTGACGATGCTAGTGATGAAAGTGATGATGAGAT
GCAGGAGCTGGAAGATGGGTCTGCGTCAGACGGGGAGGAATATGACTACG
ACAATCTGGACGAAAAGGCATTTGAGGAGGAAGGGGATTTACTTAGAGAT
GACAGTGACGTTGATGAGTTGGTTGACATTTCAGATGATGATGAAGGAAT
GGAAAATGATGATGACGAAGATGATGATCTTAACATGTCCTTCATGGACT
CTGAAGCCGAGAGTGCTGATGATTCAGATGATAACATTACCAAAGTAAAG
GCTGCAGCCCATGGAAAAAAGCGGAAGCATGGTGGAAAGAGCGGCTCAAC
TCCATTTGCAAGTCTAGAAGAGTACGAACATCTCATGGATGGGAACGCCG
ATAAGTCTATGTTGAAGAAGCAGAGGAAGCACAAGGAAGCTGGCGACAAT
GCAGGCCGTAAGGAGAGACCGAAACAGTCAGGATCACAGAAAAGAAAGTC
AAAGAGATCTGAATGAGAATGAGCTTATACCACGTTGGAAAATGTTCGTG
GCGATGGTGCTCGCAACCAAAGTTTTGTAGTTCTGGGGGAAGCAAGCGAA
TCTTTTGATGTGCTGAGTGCTGCAACATATTCGGTTATCTTTTGCTGTCA
GTGCTCTTTACCCGGTGGAAGCACTGGTTTCTGCGGGAAGAGAGAAGGTC
TGCAATGGTATCATTGTTGCACCAGCCACCTCGTCCTAGTATCCGTTGTG
CGGTACAGCATGTATGCTCTAATTTTGACATTTATGTATGTTGCATACAT
AATTTTCGACAATCATGTAAACGGGCTGTGAAGCAGAAACGCACTTCACC
TGAAATTATCCCTTTTTCTCATAAAATCCTTGCGAAATCCCTGTGCTAAA
ACAGAAATTGATGTAAATAGGGGATGGAATTAAATAGAGGACACACGTGG
ATCGATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.