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GrainGenes Sequence Report: AA041173

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Sequence
AA041173
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041173
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGGAAATCCAAACCCCGCTCCTCTCCCCTGCAGTCTCCGGTTCCAGTCTA
GCCTAGCCGAGTGTCGAGTCCACGGACCAAACCAGCAACGGGGAGATCGC
CGAGATTTCTCACATGACCGGCGGCGGTAGCAGAGGCGCCACCAGGCGTC
CAGCCGCCGCCTCCAGTAGCCGCGGTGAACCCTCCTCCGCTGGCCCTGAT
CCGGACGTGCGCCGTGCCGCCGCCGCTGCAGCAGCGCGGCGCAGTGGCCG
CGGCGACCATGGGCCCCTGCGCGTCATGGCCCCGAGCCCCCGAACCTTCC
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GCTGCGCAGGATGGCGCGCTCCGTAACGCCGCTTGACGCGCCCCGGATGA
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TTTGGTACCCCCCCCCCCTGTTCCATAATTCTAAACCACGGCAAGAGTTA
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TTAGCCACCCAGGAAATGCTAGATTTATTTATGTAATCCATAGCTGTGAA
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TTAGGTAGTACAGATGTGTAGGTGTGGTGTACTATTTCTGCTGCTGGTGC
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AGCATGCTGTTTTTTACTAGTTGGAAATAATATTTGTATGTGATGATGGC
TCTTTGCTGCCAAGCTTGTGAATAGTCATGCTAATCCAATTTATATTACA
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ATATGGGTGGGCAGATCACAATGGTAGGGATTATGGACGTCAAGAGTTGA
CTGATCATGGCTTACAGTTGACGACTAGCTTTCTAAAACAGAAAGGAGAG
GGCAGTGGCTATGGTGGAGACTGGGCAGTTCGATTGGATGCTAAGAGCGA
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ACACGAGCCTTCAAGTGGTCCTGTTCTTTTGGCGTCTGGGTTGCATGAAG
ATATTGGTGATTGGGAACTCCACTTGAGATCTGAGGTATACACATCAATA
TCTAGGTTTATCACCTTGTTACTCATAATTTCAGTTTACTTTGTTTTACT
TGCTACTAGTATGACAATAGTGTCATATGGTTGACATTTATGTTCATAAA
GCTCTGTTTTCTCACAGGACAATCTGGAAATTCACAGAGCTGGATTCCAG
TCGATTAATATGCATAATCTAAGCGATCTAGTTCAGCAAGCTGTTGCGAC
TAATGTACCATCTAAACTCTTCTTCATGTACCTTATTGTTGGAAAAAACA
TGCTTTAGAATCTGTGTGTAACTGTATGTTATGAAGTTGTCTTTGCGATG
CATTTAGTTGCTTCTTTGGATGTTTCTAGGCAATGCAAAGTGGGAACCTT
AATCTGCCAGACATGATTGAAGACTTCTCAAATATAATGATCTATCAGGT
ACTTCAGAGGTGAATAAAAATCCTACCAATATAAATGTACAATGGTACAC
CCTCATGTATGTATCAACTGTAACCTAGAATAAGTCAACCTACACCGGGT
GCTTAAGTAGTATTTTCTTTTGGCTTTGTTATTTACATTTTCCCTGTGTT
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ACAGGTGACTCTGCTGCATAGTGCATACTCCGTAGAGATATGATCTTATT
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CGAAACGGAGGGATTTTGAAGAGAGATACAATCAAATTTTCAATGTCAAT
AATAAGGTGCTGCCATGCCGCTTATTGAACGAGCTTTGTAGTTTCCACAA
TCTTTTTCTTAGCACTAGCAGTGTTTAGAGTTGTTGTCATCTCATTGTTT
TATCTTTCCTACCAACTATACATTTACTTGCCACAATCAAATGTACTTCA
ACTGACTCTGGTATTTGCTTTTGTGGGTGTACATGATAGGGTGGTCCATT
TTTGCTACTCCCTCCGACCCGAATTAATTGTCGTGGGTTTAGGCAAAACT
TTGCCCAAGCCTACGGCAATTAATTCGGGCTGGAGGGAGTAGTGTTTGTG
TGCTTGAGAGTTGCAGGCCACTTTAAATGCTAATTGATTTCTTGCTAGGG
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AACTATCTGTTGGTAGAGTTGCCTTATCAAGTCTTCTTGGTGGTATCGGC
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TTTGAGATTCACCTCATAGTCTTATCTCTCTCCTTTTCATCATGGGTGTT
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TGGATTCCCCGAGAGCAAATCTTAGGTGCTGAAGCTTTAAGGTTGGTGCC
CACTAAGAACGATGAACTATGCTCATAGCTAATGATTTCTCATTCCTTAT
ATCATCTAGTCTTGGCTTCATGCAGTAAAGTTCCCGAGGAGTTTGTTCTG
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GTCAGTGTTTAGAATTGAGAATTGAGATATCTGAATTATTTCCTAGATTT
TTTTGTTTGATTTTGCAATTTGACCTATTTCATATTTGCATTCTTTAAAA
TGAAAATTGTTGAAATATAATCAGGCGACACAAAAAATTTCCCCACCTTT
GCCTCTCTTCCCTTTTTATTATGAAAAATGCGCATGGAGCTTTTTAGGAT
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CCTAGGTTCGGAGGTTAAACAACTTTCCTACCATCAGTATCCACTAGCCT
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GCAAGAGAAAACATGGCTTAGAAGTTCCGCAAATTTTGTGACATTAGTTT
TTTTTGGTGCATGTTTATAAAATTATGTGCTGAGTAAATTATTTGAATTT
TCCAAGCATTAACAACAACAACAACAACCAACCCTTTTATCCCAAGCAAG
TTGGCGTAGGCTAGATATGAAACCCAAACAGAAACTAGTGGAAAATGCAA
GTACGACAGAAACTAGTGAAAGTGCAAGTCAAGCAGAAAATAGTGGAAAG
TGCAAGTAAAATAAAAGAGCAAAAGAGTAAATCAAGGTTCAGGCACATGG
ATTGATGATTTCCATGGAGCCCTATCAAAAGCCAAATCTCTAGGTACATT
CCACTCCTTCAGATCCCTTCTAATGCCTCCTCCCATGTCAACTTTGGTCG
ACCTCTACCCCTCTTTGCATTATCGATACCCCTTAGAATACCACGTTAAC
CGGTGCTTCTGGTGGCCAAGCATCAGAATTTTGTTAATGTGTGGATCTGG
TCAATCAACAGAAATGATTAAGTGCTTTCAATCCTGTGAATTTAACCATC
TTTTTTAATCTCTTATCTCAGACTTGGCAAGTGGCATACATGCGCACCAG
TTTTCTGGTGAGGAAGCTGAAAAGATATCCACGTTCCTTGAAAGGGCTTA
TGTACGGCTGAATTCTTGGTTTCAGTGGTTCAACAGTACACAATCAGGTG
AGCTTTGCTGTTCCAGTGTTTTATATTCTATATTTACTATGAAGATTGCA
TAACCTGCAAGCATGGGAAGATAATCTTCTTTTGTTCTGGCAACCATGGG
ACAGTGTTCAGAAAATGCATGAACATGCTGAAAACCTGCAAGCTGTTATA
TTTTTTTAGAGAAGGCGCAAAGACTTTTTGTTTCTTTTCATTGAACAGAG
AGAGTTAATAGTACATGCCTCCTAGGAGGTGAGTTACAGCAAGATGTTAT
ATGATTAGGTCTGTAACAATCTGATAAAAAAACACACCCTAATTGTAGTA
AGCAACTCAGCATAATTCCCAGAATGTAACCGAAGCTAGGCCAGAAGGGC
AAACAGCTAACCTGTTGATCTTCTAGACCAGAAGTCAACCGACCCTGCTT
ATACATTTCCATTATCTGTGGATTACCCATTATGTTCTTACTAGTCCTGT
CCACATTGCCTATCTTTGGCTTGTTTATCATTGAAGTTTTTTGTCCTAAA
AATTTGTTTCTAGGGAAATATGAAGGGACCTTTTTTTGGCATGGAAGAGA
CAATATGGCAACAAGGGAGTTAAACCCAAAGGTTTGGAACATTTCTTAGT
TGCTTGCTTCCACTAGAAGTTAATTGATTTGAAAGAAAAATATGGAGTTC
CTTCCCTCGTCTTCTCTACATTATTGAAGCAGCATGATCACGCCTAATGT
TGCTATTTCTGTACAGACTTTGACATCTGGGCTGGATGACTATCCTCGGG
CATCCCACCCTAATGATGAGGAACGCCATGTTGACCTTCGCTGTTGGATG
CTTCTAGCTTCAAACTGTATGCGCTCAATTGCAGAATTCCTTAAAATGGA
CACCTCTCTTGAGAAGGTACTGTATCATGAATAACCACGACTTGTGGATT
TGTCTCAACCATTCTTCAATAATCTTTATTGAACTTTTACAGGATTACTA
TGATATGTCGAACCAACTTTCAGATTTTGGGACACTTAACAAGGTATTGC
TCTGAAAATTCTTCTCATTTATGGATGCTATCTTTTTTAGACCAATCAGA
TATTTAATGTTGAAATCAAAAAATGATGCATTACATTTTGGATATGAATA
AATGCGCTCGATGCAATGCTGATAATTCTGAATATATTACTCCCTCCATT
CACTAATGTAAGACCTTTTAGATATTTCAAAGTGGACTAGATACACTCCA
AAACGAGTGAACCTATACACTGAAACATGTCCACATACATATGTTTTAGA
AAAAGACTAGAGTGTCTTACATTAGTGAACGGAGGGAGTACAATTTTTGT
ATACAGCCATTTTAATTAGATAAAAACTGTGCAGTGGGTGGTGGTTAATG
CCATCGAGAACTTGACTGAGTATTTTATTTAACTTTATTTCCTTCCTAAA
TCTAAGGGGTCTCATAAGAAAATTTCTTTGGAGTAGTTTTGGAATAGAAC
ATTCTGATATTTCTGTTTGCTGCAGAGTATTGCAATATTATGGTATCCAC
ATGCCAGTAGGAGAAAAAATATTTGCACAAATGCCTAAAATTCATTGTTT
ATTATGCACTTCTTTTCAATTCAAAGAGCAGCTACCTACTACTACATGAT
TTTTATCAACTGCTATTGAGTTTATGTATCTCACAAAATTGTTCAAGCGG
TTAGTAGAGTTCCATTTACATTTCATAATTGTTTGTTACATTCACTCTTT
AAGTGTTCTCATCTTTACAGATGCACTTGGATAACAAAATTGGTGCCTAT
TTTGATTATGGTAACCATACAGAAAAGGTTGGTATTGCACTTCATTTAAC
GTCTGAACTTTGTCATTTTGCTTACCAGACATGATTATTGATTTTGATAT
CATTGTTGAAGGTTCGATTGAGATGGTATGAATTGAATGACAAGGATGGC
ATGCGACGGGAACTTTTGAGAGAGACATTACAACCCCCTCAGCTGCAATT
AGTACCCCATGTTGGTTATGTCAGCCTTTTCCCATTCATGATGGGGACCA
TTCCACCTGTAAGCTTGTAACTTCCATCCATCTGCTTGTTTCTCACTTCT
AGTATTTTTTCATCCCAGTTCAGTGATACTGATGCTCATCTAAACTACTA
AAGTGATAAGCACCGTTTAACTCTGTGCAGGAATCTTGGGTTCTTGAGAA
GCAGCTCGACCTTATATCTGATAAGTCTATCTTGTGGACGGATTATGGCC
TCCGGTCACTTTCAAGAACAAGGTATATCTAAAGGTCACTGCTCATTTCA
CTTCGCGAAAGAATAATAGCTCAAATGTTGCTGTATGAAATTTGACTAAG
TTACCACTTCGGAACTTGTAGACCATCTATGTGAAAGAAAAGTGTAACTG
GCAATTCATATTATACTTGTCTAATGTTATTATCTGTTAAATCAGTAACT
GGATTCTCAATTATATTTTGCTGATCCATGGTCCAGTTCAATGTACATGA
AACGCAACACGGAGCATGACGCCCCGTACTGGAGAGGCGCCATCTGGATA
AACATGAACTACATGATCCTTTCAGGACTCCATCACTACTCACATGGTAG
ACTCTTCAAACCGAACACTGTGAAATAAGCAATACCACAGTGATCTAATA
TCGCGCTGTACTGCAGAGGAGGGTCCGTACATGGTCAGGGCAGGGGAGCT
GTACGATGAGCTAAGATCAAACCTGATCCGGTACATCCATCTTCCTATAG
CTTGCTGAAGAACGGAATTTGCTGAACTGCAGCCTCTCTAATAGATTGTG
GGGTGTTGGTTCTCCGCTGGCTATTTTTGCAGGAACATCGTGCGAAACTA
CCAGGAAACGGGCTTCTTCTGGGAAAACTACGACCAGCAGAACAAGGGGA
AGGGAAAAGGCGCGAGGTCGTTCACTGGGTGGACTTCGCTCGTTGTCCTG
ATCATGTCCGAGTCCTACCCATCATTGCACAGGTAGACATATGGGGTACC
TATATCCAAGCAGGCTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.