Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA007938

[Submit comment/correction]

Sequence	AA007938
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA007938
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCACATCCCGATCTGGCTGAGACCTCGCCTGACTTTTAATCGCCCCGCC GGCGACCACTACCACCATCACCGGGGACGGACAGCGCCGCCGTGCTGCAT CGCGGTTGCATCCCGCCGCTGTACTAGCCCTCGGTTCTCTCCGCCAGGGT CGCCACCAGCGCGCGCCTTTGACCCCCGCGGCTCGCCGGATACTCCCAGC GGAAGATGAGCGGCGTCCCGTGGAAGCGGCTGGAGCTCGCCGCGCTGTGC GCCTACGCGCTGGTGTTCTACCTCGTCTTTATCCAGAAGTCGCTCCGCCT CTCCCAAGGTGCCCCTCCATTCTCTCTCCCCTCCCCTCCACTTGCTCTCT CCCTTCAGCATCTCCGCGCTGCTGCTCAACATTCACACTATCTCCTGACT GGCACGCAGAGTACTCCGGGAGACTGTACGGGCTACGAGCAGGATCACTC GCCGGCCGTCTCAACGTCTGTAAATTCTGCACCTCGCCTTCTTACTCAAG TCTTCTAGCTCACCTCAACAGTGAAGAGCCACCGGTTTGATTCCCTGCTA CCATGTTGCAGGACCTGTCGGACGCACAATGGAGAAACTTCCGTGGAAAC CTACCTGTTCTTACAGCCGTAATGGGTGCGTTTCTGATTGTGGCGAATGG GTTGCGCTACGGGTATAGCTTGAAGTGCAGAGGGGCCTCTTTGGTGTGGC TAATACTGTCTCTGATCTATCTATGCTATCTACACGGTGCATGGTACGCG ACCGACCGACCGACCAATCCCCGTTTTCTGTTTTCCGAACTTTCTTTATA GATATTCTAATTTATTTACCTGTGTGACAGTGTTGCCTTCATTCTCGCAA TAGCAGGGATTAATTACTCCATTGTGAAGGTTAGTGCTGACATATTTCAT AAAAAAATATGCAGTTTTTTAAAATCTTTTTAGGTCTGTTGTCTGTGTAA ACATAGCGATATACTTCTAGGAAACAAATGGTGGAAGAACCTGGTATGCT AGTCGGTTCAGTAGCTGAAATTCTTGTTGTGAATCATCGTCAGTCAAAAG AAACTATTTGTGTGGAGCAGGTCAACTTTTTCTAGGCATAATACGTGTTT TGCTGATGCGTGTGTTAAGAGCAAAGCCTGTTGTCTTGATTATCCATGTT CCATTCACCAAGAACCTATTAACCAGAACAGTTGTGACATTCAAGAATTG AGTAGCTGGGAGATTGAACATGGTGAATTGAAATTCAAGCTGATGCCTGA TCTGCTAAGCGAGTCTAGATCTTCTACCAGTAAGGGACACCAGAAGTTGA AGTTAGTCATGTGCTGCAGTGTGGAAATCAATTTCATCATTGTCCTGTTA TAATTTCGATTAATGGTTATTTGATGAATCTACTAAGAACTAAGCTAAGA GAATGGTCAGAACAAACACGGAAACACCATTTATCATTTGCTTTGTGAAG TTTAACTCATTCGATCTCCTGATAGGTATCAAATTAGCATTTATTTTTAA CCACAACTTTTTTTTCTTGTAGTTATTTGCTCGATTTAAATATTGCACTG GTCTCATATGGAGCTTCAACTTAGCTATGCTTATACTTAACCGAGTCTAC GAAGGTTATTCATTTTCATTGTTCGGGTGAGATTTCTGATGCTGCCGTAC TGCATTTTGCACTTTCCCTTTCTAAGACTCCTTTTCATTTAGGTTTTGAT CATTTTTATGTTCATATAAATAGGAAACAGCTGGCTTTTCTTGATAACTA TCGGGGTACATTTCGGTGGCACATATGCTTCAATTTTGGTATGTTTCTCA CGTCCTGTTGGTTACTTGGTTTGAATTTGTTCGAAATAATGTCATAAATT CTGCTGTTGATGCTTATCGTATGGAAATGTAGGATTACTCTTACATGAAA CTATTAGGAGGCCATGAAAGGCTTACAGTCTGTAGCATTTATTTTTGTTA ATTTGCAAAACTACAGAATTGTAAATTGTGCGTGTAGATCTCATCTAGAG ATCTGAGGATGGAATTGTTAGCCCAGAAGTTATTATCACATGAACTGTTC TTAATTTTATTTCAGTCAGTAGGAAAAGATACCCAAACTTTCATTTACTA TGTATGATTGTATTAACATTTTCAAACCGATGAGGCTGTAAACTGAAGTT AATGAACTAGACTAACTTCCCGTGTCAAGTCAACAAACACTGTTTTGTTT GATTGTTCTTGTGGGATCAAGTACCATACAATTGACTGACTACCTCATAT AGACAATTGTCCTATTGACTTTATCCTTGTTTCACCTTTCAAGTTGCTGT AGGTTTTATCCGATTATCACTACAGTTACTTCATATATATAGTTCATCAT AGTGTCTATGTATAATATTTTTTACTTCTTGTATTTCTTCTAATATTTCT ACTCCCTCTGTCTCGAAATAGATGTTGTAAATTTGGATGTATCTAGTGTC TAAATAGTGTCTAGATACATCCAGATTTAGACAAATTTGCGACATCTATT TCAAGACAGAGGGAGTAGTTTATTGACACATATTATTATTCTAAAGTTTG CATGTTTTCATTCCATTTTTCATTTCATGTGACAGTTGTGTTGCGGATGA TTAGCTTTGGATGTGATTACTGCTGGACGCTTCGTTCATCTCACTTTGAT CACAAGGTACTATGTACCCTGATAAGTGATAATTTAACCTTTTGTTCTAT ATGTTGCATACATTAGATGCTTTACAATTGATTGAGATAGCTTACAACAA GGGGTATTGACTTCCACACATTTATATTCAGTAGTTTAAAACCAGATAGA ACCCAGTTTATCTTTTTATCCACTTTTGAGAATGAGAACTTGTGAGTTTT GAGGTGAAATGCAAACTTGCAAGTATTTGGTGGTGTACCTTGAGAATATA ACCAGAAGCGAATTTGTTAGTTTTCAGGTGAAATGCAAAGAACTAGTTGA TGATGTGTTCAAGTACCGAAATTCGAACTTGCGTGCTTACATCAACTCTC TGAAAAACTTTCCACTCATTTTATCTCTCTTAAAATGAAAAGGAAGGCAC TTCGGTCATGGCAAAATTGGCTCTGTAGCACCAAAAAAATAATCCAGTAC TATTTTTGTTGAATGCCACCGAATGAATCCACCAAAATAACCTTTGCCAA TCGCCATGGCTTGCTGCAAGAAAGGACAAGTCTTGGATTTGACTTGGCAT AAGATAAGAGGGTAGATTGAAAAGGGTGACGAGACTTATCAGAGCTTAAG GAGGACATGACAAAGCAATCATACTGGACGACAATATTTCTATATATTCT ACTGTAATAGCAATACTGATTACTTAAACTGTAAAAGAAAATCGAATGTT GGAACTGTAGGACTGAGCGCTGCTCAGTTGGCAGAGGAGCGAGTGCGTGC CCAGCCCATCCTGGTTTGATGCTATCCCGTATTTTATTACCACATTGAAC ATATTTATATCACTGGCATACCATCATTTTACATTTGCACAGTACACTAT CTTGTCAAATACTGGACTGTGCTGACATGAGCACTCTTGGTACAGAAACA CATGCAGAAGTGTGAAGTTTGTTATTCTGGCAAGACATGCTACTTTGCTC TGCAGGTACTTCACTATTCCAGTTTATCTCTTAACAGCTAAGCTATTGTT CTCCAAGTGATGTGTAGTATGGCACTGATTGAAGAGAGAGGGGGCCACTG TTGGTTTTGCACATCTGTAAGGTTGTACTGCTTGACTATATCTGCAAACT TGGTGTTGACACACGGAAGAATGGAGCTAGGAATTTTATTTAGAGATGTC GATAATTTCCAAGCATAAATGAACGGTTAATGTTCTGTTGATGTGATGTT TTCCTGTTGTTCACAAAAGGCAGATACATATAAAGCACGTCTCAACATGA CCATATGTTTTTCTCCTTTTTGCATATTATGCCATTCTTGTATTTCAAGC CCAGGTCAACTAGGTCAATATCGTACAAGATCATGTTGTCAAATATTCAT GCTCTGTATCAGTGATTTACGTTGCTCTTGGCAGGAGAAAGGGCTCAGTG TTGACAAATACACATTCCTAACATATTTATGCTACTTAACATATGCTCCA CTCTATATTGCTGGACCTGTTGTAAGCTACAACGCCTTTGCAGCTCAGGT TGGTCTTTTCTCTTTGTAGTTCTGATTTGTCTCATTTAAATTTCAAAAGC TGAAAACAGTAGAAGATGTTTTTTCTTGAGTGGTTTTAGTTAGGAGTTAT GATTTATGAAAGGAAAATAATTTTTAACATTATGTGATTCTTAGGCTACA TAGTAAAAACAATACATAAATAATTTCTATGATTCGAATAAGACATCGAC AATTCTTATCACTATCTCAGTATTACTACCTCCGTTTCAATGCATATGGC TTATATTTTTTTCCAAAAGTCAAACTAGGAAAGTTTGACCAAATTTTTAG AAAAAAATATTAATATGTACAATCCAAAATCGACACCTTTTGATACATTA TGAAGTATATTTTCATATGATATCTATATAATATCATAGTTCTTGATAGT TTTTTCTAAAAGTTTGGTCAAACTTTACTTAGCTTGACTTTTAAAAAAGG GGCATTATTCATTGAAATGGAGGGAGTACCTCTCTTATGCATTCTAACAT ACATGGTGTGTTAATAGCTAAAAAGGGACAGTAGTAGGAATTCGGTGTAT CTAAAACATAGCATGTTTGCTAATTTGAAAATTCAGCTTCAGGAAGAAAA ACGTGAACTACATTTGCAATTTAGAGTTGACTGAATAGTAAAAGATCAAT AGCGAATTCATCAATGTGAATATGTCTTTTGCAGTGTGTACCTGAATTCA GGTTTCATTTTATTTGAAATATATATTTGAACTCTGATTCCAAGTGTTGT TTACTAGGGTTTAGGGAGTGTTGCTTTATTTATTCCTCAATCCTCACAGG GGGTCCTATTTATATCTTATCTCTAATTGGCTTAAGGCCCAGGCTAAAGA TATAATCATAATTTAAATGATAAGCTACCTAAACGAGGAATGAGGATCTT ATCCCATAATTGGTAGCTGCCACGGTGAGACCACATGCTCCCATACATAC CATAACTGATTTGATACTGTACACGATGACTTTAGAAACTGTGTTGCAGT AGTCCATAAAAGATTTGAACTATGTTTCAAGCAGTGATTTTACTATTTGG TACTTATTAGGAAATCTGCCCAGTTACACGTACTAACAGGCTGTTTACGT AGCGACCTTGCAGTTAGATGTGCCTCAAAAAAACTATTCAGTGGGGCAGA TATGTTTTTATGGATTGAGGTGGATCCTGAATTTCCTCGTAATCGAAGCC ATGACACACTTTTTCCACTACAACGCCTTTGTAGTCAGGTACTTCTGTTT GTACATTATGATTGATCCTTATGATTACCACTATACCAATTCTGAAACTT GAACTAAGTACTCTGATGACAGCCGACTATGGAAGCAGTTGACACCGTTT GAGGTCTTTATCATTAGTTATGGGGTAAGATTGTATACATGTTGCAGTTA ATTTTCATCAGTAGTCACTTAGGGTGAGCGTGTAGCAGTTGATATCTTCT CTCATGCTTATTGTTTCTGCTTTTAGTGAAGTTCACGTTAATTGAATGTG GCCTGCATGTAAGTTTAGGGTGAGTGTGTAGCAGTTGATATTTCGTGTGT ACAACAGAGTTTTTATTTTCAAAAGGATTTGCATGGGTTTTTCTGATGTA CTAGATTACCTCATTAGTCACTTACACCATTTCTGATGTCTTTTTCTTAG CTAATGCACCGCAGGTCCTAAACTTTATGTGGTTAAATTCATCCTTATTT TGCGTCTTGACATACTAGATTACCTCATGAGTCACTTCCACCATGTCTGA TGTCTCTTTTCTTAGCTAACACACTCCAGGTTCTATGCAGGTGTTGAACT TTATGTGGTTAAAATTCTTCCTTATTTGGCGCTACTTCAGGTTCTGGTCA CTGGTAATACACATTGAAATTGTGTACTCAATACGCTCTGTCCAATGTAG CCTTGCATACTTCCTCTTGGAGTGCTAATTCCAGTTTGTTGTAATTTTGC ATACTTCCTCTTGGAGTGCTAATTCCAGTTTGTTGTAATTTTGTGCTTGA CAGTATTTTTTTGCTAAAATTCAAGCGATCTAAGGAAACAATGATTTAAA CTTAGCATTTTATTACAGGTAGGAGGAGTTGAGACACCTGAAAACATGCC AAGGTGCATAAATAATTGTCATGACCTGGAGAGTTTCTGGAAAAGCTGGC ATGCTTCTTTTAACAGATGGCTGGTCAGGTCTGTTCAAAAGTAGGATGCT TAAGTATTATGGCACCATGCCTTGCAGGCAAATTTTCAGAGTCTACTTCT TGTTATCCGTAGCACCACTGCACTTCTTTTAACAGATGGCTGGTCAGGTC TGTGTAAAAGTAGGATGCTTAAGGTAATGGGAGGGATGTGTATAAGGATT AAATAATATTTACTATTACTTAAGTAAAAAGTGCATAACGTTCAGATGTA ATTTATGCCCAGTTACATGAGTATTCAACTCCATGGCCCATGCATGGACT TCTAGAGTTGGTATATGTCTATACAGAGGTGTATTTGCTGTCAATACACA GGCATTGATTAATCCCTAAGTGTAACTTCCTTTTATCTATCTTTTGTTGC AGGTACTTGTACATACCACTTGGTGGGTCTCAAAGAAAATTACTTAGTAT TTGGGTTGTATTCACATTCGTGGCAGTTTGGCATGACCTGGAATGGTACT TTTCATACAATTTCCATAAGTCTTTAAACACCGAACTTGTGAACTTCTGT GACTTACATTAACCATGTGGTTTGCTTTCTCTTAAACAGGAAACTTATTT CATGGGCATGGTTAACATGTTTATTTTTTGTACCTGAAATTTTGATCAAG TCCCTATCCAACAACTTCCAGGTAATAGAAGGTTATTATTGGCTGCTTTT GCAGTTCATCTACTTGTTACCAAGTTTCAATTTTTGGAACAGCTTGCATG CTGACTAAATTTAGCTTTACTGTATCAAGTTACTTTAGTTTTTTCCAAAA AGTCATCAATTCCTTAAATCTGAAGTTAAGAAAGATGTACAATTTGAATG TCCAAACAACAAAGCCAATATGATGTCTAGGTCTCTGCAGTACGGCAACA CTATGTGGTTTCAATTCCCTTTTATCTAGATGTTTCAAGCCCGTCTGTTT GTTCCCCCTTGCATGCATAGATCTTTTAGCATTCTTGCTGGGTGCTTCAG TTTTACATTGTTAGCAAGTATACTTCTAAAATGATTTTTCTGCAGGCAAA AAGTGCCATTGGGCGGTTCATTCACCGTGAGTTAGGTGCTATTGGTGGTG CTGTGACAATCAGCTGCCTTATGGTACTTTTCTCTTTTCTACATTTAGTC ATGATTTTCTGTACAAACTTCACATGTGCAGAAACTACGATCTGCGCGCT AGATTAGTCAGATACATACTTTCTTGGTTGTAAGCAAAGTGCTGCTCTTG ACATGTTCAATGCAAATAGGTGGCAAACCTCGTCGGCTATGTCGTAGGGC CATCGGGCATTAAGGTTCTGATGTCGCAGATGCTCCAGAGGGACGGTGAG TTGCATATTCACATCCATCGCTTTGACTAAAATTTCACTGATTAAATTTA GCATAAACTCTGTAGCTAATACATGTTTCCATGCCGCAGCCCTGCCTGCC CTTACCACAATATTTGCCACGTTCTATGTGGGTGTCAAGGTGATTATCTG CTACTTAACAAATGTTTAACTTCATAAAAAATGAATCTTCTCCTCATTGC TGGTCAATGTGTCTGCAGCTTATGTTGCATATACGTGATGCTAGGAAGAG TAGGGGGTGACGACAAGTCAGAAGAACAGCTATCCAGTATTGATTTGTAA CTTGATGGGCATTGTAGGCGTGACGATAACATGCTTCAACACTTTTTTTT TCTTGCCAGCAAAGGCTCATATGTGCATTGATCCTGGATTCCTTTGCCGT AGGTTAGGGCATTTTTTTTTCTACATATGTTTTCGAATCTTGGGCTCGTG ATATTGATTGATAACATGCTTAAACACTTCTTCTGTTGGTTTCTCTACTT GCTGCCATTTTCTGCTAATTCAGCGGAGTCACTTGGCACTAAATCAACAG CTGGGTTATACTGTGTCATTTAAATTTCTCCCCAGCCCCTCAGATCACTC TTTTGACGACACCGGGGCGACTTTAGCGCTGCCATAAGAAAACAATCTGG AAACACCAAGGATAGACACAGGAATTGTTGACCAAGACAAATTAATAAAT CTGAATCAAGGTGGTTGCTCAGTCTATGGATGGATAATCCCATTGAAATT GGTGATTATGGATTGAGTTTTGAGTGCAGCTGATGATTTTATCTGCTCCG CTCCAGATTATCCATGGCAGGCTCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.