Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA007837

[Submit comment/correction]

Sequence	AA007837
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA007837
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CATCGATCCAACATCACGAAAGTTGCATCTAAGAACAACGGAAATCTTAA GACTGAGCAGCTGCCTAGCAGCTATGGGGTTCGCGGTGACGAGGACGAGC ATGTCTCTGGTGCCGCCGTCGTCCTCGACGCCGGCGGAGACGCTGCCGCT GTCCGCGCTGGACCGCGTGCCGGGGCTGCGGCACCTGGTGCTGTCGCTGC ACGTCTTCGACGGCGCGGAGGGCAAGGGCTCCCCGGCGAGCGTTGTGCGG GAGGCGCTGGGGAAGGCCCTGGTGGACTACTACCCGTTCGCGGGGAGGTT CGTGGCGGAGGAGGATACCGGGGAGACGCGGGTGGCGTGCACCGGCGAGG GCGCGTGGTTCGTGGAGGCGGCGGCGGCGTGCTCCCTGGCGGAGGTGAAG CACCTCGACCACCCCATGGCCATCCCCAAGGAGGAGCTGCTGCCGGAGCC GGCGCCCGGCGTGCCGCCGCTCGACATGCCGATCATGGTGCAGGTACGTA CTTGTACGTGCATGCGTCTACGAGGGAAAATATGATGGAGTACCTACGTA CGTGACCTGCAGTGCAGCTCACAGGATAGCTAGGTAGGTGCACAAATAGC ACTCCAAACTTGCACCCGCGCGGAAGGTGTAGGTTTTTTTTTTTTTGCGG GGAAGCGGAAGGTGTAGGTTTCCTTAAAAAAAAACATTTTCCTTCAACCG ATGCTATAACTAGCATTTCTTTTGACGCCTATCTGTTGATGGTGAACTCT TCGAGACGAATTTGTAAAAAAAACTTAAATAATTACTTCCTCTCCGTCTT AAAATATTTGTCTAAGATTTTTAAAAATTTAGATGAATCTATATATATAC TAAATAGTTTCTAGATTCATCTAAGTTTTGATAAATTTGAAACATATATT TTGAGACGGAGAGAGTAGTAATTTTCAAACTTTGTATACAAAGATGCAAC CTTTTGAGAGGATAATTGTCAAGTAAAATTTTTTGAGAGGAGGGAGGACC CGCATGATCTTCTTGCAAAACGTTTGGGCGATAATTGTGGTGGATATACT AAATAGTTAAAATTTGGGCACCAGAGTGCAAATTTTAACTATTTAGAGAA ACATATCAGAATGTAGAGAGTTTAGAGTCTCTAAACTCTCCTTTTGTGGT AGGTAGGTGGATAGTGTCTTCACCAGAGTGGAGAGTTTAGACTCGAGTTC GATCGAGCACCTACCTAGTGTGTCACGCACCACCTTATGCTTTTGCACAA CTTGTTTTCTAGTTAAAAGTGACAAAAATGAAGATGCACATGATATGCGG CAAGCAAGCACCACAACCTGTTTTCTAGTTATGATAAGACTGGTCGCCCA ACACCGCTTCCAAGAATCATCATAGCTAGATATACACTAGTAATTGTATA TTATTCCTGCCCACCATTTAAAAAAATTTATTGTTGGATGCACCACTAGC TACTTTTAATGGGACTAACTGGTTAGAATACTGGATGAAATCCTATTTCA AGAGAGTGGTTAATTTTGTGTGTGTGTCCAAAGAGAGGGTACCTACGTAC ATGCTTGATATGTACTGTACATGTCGTCTCTGTGACATGCATGGAGCATG CAAATGTCATGCTCACAAGCTGTTGCTACGTAGCTATATATATTCTCGGT CCTGCATGCAGCCGTGGTGATGCTTTATGGTCGACGGGTACACAAAAAGC CTTTTAGACAATGGTGTTGCTGTTCACATCTCTCTGCCCCAACTTTGTTG TGCACAAGATCTGCACCTACTTTTTTAAGCATCATCTGCACCTACTTTGA TGAGCACACAAGTTACCTGTGCTGGCTTATCTACGTACGTGTTGGGCTAA TCATGCATGAAGCCTGGTTTGCTGGTTGGCCTTCGGCTGAAAGAGTATCT CCTACGTAGCATTTAATTTGTTCACGCCTTTGTGGCGAACTTAAAAGAGT AATCGACGTAGAGAGAGTCAATCACACCTGGCAATTAATAAGTACTACCT CTCAGTAAAAATGCCATTCCTTTTACTTAGGTTTTGACCATCTGTAGTGC TGGTAGTTGCAAAGCTGATAAGTAAGTTGCAGTCAAATAGAAAAGCGAAA ATGGGCTCGATCGGATACATTGAATGATCTAGCTAGATAATATATAGATG CATGTGGCCATGGTATATTGTTAAAAGCAAGTGCGCGAGTTGTCGCGGCA GTGAAAATAGCAAGATTTGACCAACCATTGATCTGTTAGTCCTGCATGTG GCCATGGTATATTGTTGGGTCACATTCTTGGAGTAGGTCAGAAGAGTCGG TCATATCGTTCGACCAAGTAGCTCTCATATGGTGATGACCACGATTGGTG TTACCTGCTACCAACCTTGAAAACCAGAGCTCGCTTGCCACCTTTCAGAA ACTGGACATATGTATATGCTTAACTAACTCTACACATTAATTAGTTGTTT CTCATGTCCATTTCATTGAGTAGGCAAAAAAGTTGTACTACATATATAGA GACAGCTAGATCGAACTAACTCAAGTCCTAATTGCTGAATTGTACAAGTC CACAGCTAAAAAGACCCTACAAGTTCATAACGGCAGGCTCCTAAGTCCAT TGATCAATGGAACATAGTAAGAGATACTCCCTCCGTTTACTAAAGAGCGT ATTTCCAACATTCTTGGAAGTCAAACTATAGTATACTTAATTATCTTTAT TCAAAAAGGGACATACATTTTTGCAACCAAATTAGTATAACTAGATTCAT GATAAAATATGTTTACATCATATTACTATTTTTGGTTTCATAAATATTGG TTTACGTAAATTTGGTCAAAGTTTGACCTAGTTTAAACTTAGATTGTTTC CTTTAGATAGATGCATGCATCAAGTTAGAACTTAGTGGAAGCAAGTACGT GAGTTGTTGCGTCGGTGAAAAATGGCAAGTTTTGACCAACCATTGAATGG TTAGCACTGCACACGGCCCGTGTTATATTGTCGGGTCGCATTCTTCGACG TGTCACGTACTAGGTCAGAAGATTCGATAATATCGATTCGACCACGTAGC TCTCATATATATGGATGACTGGTGTTACCTACTACCAACCTCTATAACCA GAGCTTGCTTTCCACTAGACAGCTAGTTCGAACTACCTCAAGTCCTATTT TCGGAATCTTACAAGTCCACGGCTAAAAATACGATACAAGTCCCTCAAGG ACTGGCTCGTAAGAGGTACTACCTCTGTGTCGATCGGTAAGAGTGTGTTT CCAACATTCTAGGAAAGTAAAACTATTTTATGTTTAATTAAGTTTATTCA AAAGAGGACATACATTTATGCAACCAAATTAGTATCATTAGATTCATGAC AAAATATATTTCCATCATATTAGCATCTGGTTTCATAAATATTGTTTCAT ATTTATGTGAATTCGGTAAAAAGTTTGACATGGCTTAACTTTAGATGGTG TCCTTTAGATGGATGTGTGCAAGGCAGGGCATCGAGCTCCATTCACGGGT AGCTTTGATAGTGGAGACCATATCTCCACTGAAGTGGAGAGTGGAGAGAC TCGAGATCGATCGGGCACCTAATGACACGCACCACCTATCTGCTTTTTCA CAATCTTTTGTCTAGTTGGTCAACCACTTCCAGGAATCATGCATCATTGC TTTGGTACGTCGTACTACTAGTATATTCTTGTTGGGTATATTAGGTTAAG TTGGTGTGTCTCCGACACGAGAGAGTTCCACAAATGATATGGACACGTCG TCCTCTTGGGACATGCATGCATGGGGCATCCAAATGCCATGCATGCAGCA GCTACCTAGGTACACCCGGCCCGGTCGTTTATGCACCCGTGGGATCTCTG TTATCGTTAGTTGTAGCTGGTGATGACAGTGGGACGACACTATAGGACCA GAAGACATGTGATTTCAGTTCTCTTCTCTGAGTGAAATTCATCATCTGGT AATTCAGAAGTCCCATGCTAATTTGCTAGGTAGCTAGAGAATGCCTTCTA GTTCATGGGGTTGCTTTTTTATCTCTATTATTCCACCAACTTTTGTGCAC AAGATCCGCACCTACTTTGTTGAGCACGTAATAACTTGCCCGTGCTGGCT TAATCTACTTACGTGTTGGGCTGAGCATGAATCTAATAAAAAATAAGGAA AAAAATGGGCTCGATCTGATATATGCCAGGCAGGATCTAGCTAGCTAGAT AGATACATGCATCTCAAGATAGAAAGCAAGTGCGCGAGTTGTCGCGTCGG TGAAAAATGGGAGGTTTTGACCAACCTTGATCATTTTTCGCCCTGTACGC GATCGCGGTATATTGTTCAGTCACATTCTTGGATGAGTCAGCCGGCAATA GGTCAGACGAGCCGATCATGTCGATCGATCAAGTAGTCTCTCATTGAGAG CGAGTGGTGGTTACCTACTAGTACCAACCTTGAAAACCAACTCGCTTTCC ACATTTCACAAACTGGACATATATGCGTAGCTAACTCTAAACTACTACTA AAAACTAAGCATGGCTTGGTGGAAAGACTAGCGAGTGATTCGTGTCTGAT GAGCATCATGAATATATATATATATATATAGTAGAAATAATGTATATAAA AAGATAAAAATAACCGAGTCGTCCATGTCTGCCTTTCTGCTATCTCTGGT CAGAGAACTAATCAAAAGTGTGATGGATCGTGCTAGCTTGCATCGCACCC GGCCGCCACTAACGTAGCATGGACATGCAGCGCCACTCGCTCGATCCCCC GTACTGTTGTTGGAGTGCTGGTCTCTCCACGTACAAGCTTTAATTTATTC CCGATCGAGCACGCAAGGGTTACCACCCAATTTTTTCATACGTGTTGCGT TACACACGTCAAGACATGTACGTAGGAGCGTATTAATTTGCCCTTGACGT TGACCTCCGTCTCTGCTACTAGTGGAACTGAAGCAACTTATTATCGCCCT AGCTGCGCTACGTTTGGAAACATAAAATGTGCTACACATTTCAGTGGTAT ATCAAACTGTAAAATTTTGGCTATAATTTAAACAATTAATCATGTGCTTA AAACAAAAATCCTAGAAATAATTTTACTGTACAAGAAAAATGCACTAATA GTACTATCATCCTTAAATATGTTACTAATTGTTACTTATATTCATAACCA ATGTCTAAAGATAGAAACTATCTTAATGCCTTTTATAGTTTTGGACGGAC TGAATAAAAATAAATCATCATCCAATTGGGATGATATGAACCACACGCAT GCAGGAGCTAGGTTTGTGTGCCGATCACGCATCGGCATATAGCTAGTGTA ATAAATTAATTAGTAAGTGAGCGAGGTTGTTGAGTCGTCGGTGAAAAGGG CAATATAGCAAGATTAGTTAAGTCAGATACAAGGTGAGAAGAGTCGATCC ACCAGGCCACTTTCACCGGCAGAGTGGCAAGTGGCTTGCAGTTGTACCAC ACGACAGTGACTGATCTTATCTGATGTAGGTAATCCTGTAGCCCGTGCGC CAGATTCCGTAGATCGATCCTTTGGAGCTAGCTAGCTAGCTACCTATTGT ACCTTTCAAATATTCTTTGTGCTGGATTTGTCATTTTGTTTAGCCAAGCA GGTTGCATATTACTCCAAAGTTCAGCAAATGGTTTCAGAATGTAATCCAA CGTTCAACATAATTTTCTAAACATTTGAGGAGAATCATACAAAAACTTTG TTTGTCTACCAACTTTCAAAATCATTTTTATATAAAAAATCATATTTATA ATTTTTAAAACTGAAAAATACTGAACATTACTCAATATCTACAAGCATGC AAAATCACAACACTAAATTTTTTAAACTGTGGGATAGATGAAAAATCTTA CAAATATCTGAGTTTTGAAAATATGCATTGTTTTGAGCTGAAAATATGCA TTGTTGACTATACTCAAATCCATACTTATTTTAATTCTTGTGTAGCTCAG AAAATACAATATTTTAAATTTATTTTTTGCTTGCTTTGTTTAATATGCTC TTTAAATAATAAACTTGTAAAACGGATTTCAAAATTATAAAAAATATAGG AGTCACTAGATCTTGGGAGTCAGAAATCGCCACTCGGTATTACGGACATA GAATAATAATCTCACATTGAACAGTTAGGTACCTCCACTTCAAAGATTAA GGCTTATGTTTTTTTAAAGTCAAACTACGTATAGTTTAACCAAATTTTGA GGAAAAAAAACCATGTCAAATGGAGGTAGTATGTGGCTAAACTAGATCGA CATATTCACACAAAAAAAAACCTAATCGATATAGTTGCCTTAATTTGATA ACTTGGGAAAGTACAAATACGATGCACCTGTTAGAAAAAAAAAAGTAAAA TCAGAATCTTTGTGAAGGAAAAACGAACAATTCAAGTCCAACTTCTTTGA CGTGCAGGTGACGGAGTTCAGCTGCGGCGGCTTCGTTGTAGGCCTGATCT CGGTGCACACCATCGCCGACGGCCTGGGCGCCGGGCAGTTCATCAACGCG GTGGCCGACTACGCGCGCAGTCTCCCCAAGCCCCGCGTGTCCCCGGTCTG GGCCCGTGACCTCGTCCCGGACCCTCCCCGCATGCCGGCGCCGCCACCGA AGCTGGAGCTGCTCGACCTCCGCGGCCTCACCGTCGACTTCAGCCCGGAC CACATCGCGAAAACGAAGGCCGACTTCTTCGCGTCCACCGGGCAGCGCTG CTCCGCCTTCGACGTGTGCGTGGCCAAGACATGGCAGTCCCGCACCCGCG CCCGCCGTCTCGCCGGCGGCGCCTTCGCGGACAGCAACGACAGCCCCGTC CACGTCTGCTTCTTCGCCAACACCCGCCACCTCATGCTCCCCAGCGCGGG CGCCGGGTTCTACGGCAACTGCTTCTACCCGGTGACGGTGACGTGCGGGA GCGGGGAGGTGGCGGCCGGGGAGGTGGTGGACGTGGTGCGTGTGGTGCGG AACGCCAAGGCGAAGCTGGCCGGCGACGTGGCGAGGTGGGCGGTGGGCGG GTTCGCGCAGGACCCCTACGAGCTGCGGTTCACGTACGACTCGCTGTTCG TCTCCGACTGGACGCGGCTCGGGTTCCTGGAAGCGGACTACGGGTGGGGC CCGCCGGCGCACGTGGTGCCCTTCTCGTACCACCCGTTCATGGCCGTCGC CGTCATCGGGTCTCCGCCGGCGCCCAAGGTCGGGGCCAGGGTCATGACCA TGTGCGTCGAGGAGGCGCACCTGCCGGAGTTCAGCGACCAGATGAACGCC TTCGCCTCCTCCGCCGGCAAGTGAAGTGAAGTCAGCATCGTCATCGTCGT CTACACCCAGTTAATTAATCAAGGCCTTAATCAAGTGTGCAAATACGGTG CAAGCTCTTCTAGTATAGCAGTATACATGTCTGATGGAATGGTTTCGGTG TGCGTAGTATGTGTACTTTGCTTTGCTTCGATTTCTCCTAAAGTCCTAAT GGATTTATCGCCAGCTCTTATATAATCGATATACCCTATCTCAGGGTGCT ATCGACGAACGAATGATTTGAACAATAAGTGACAATGCCAATTTGTTTCG ATTCTGCCAACCAATTTTTTCGAATGTAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.