Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA030086

[Submit comment/correction]

Sequence	AA030086
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA030086
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACCTTTTCTCGAGTTCTCGCTCCTGACCTTCCAAACCGGATCTACCTAC AGCTTCAGCCGTGCCGTACATATAGCGTGACCGCCGACGCCTCGATCCCG CCCCGTGCTGCCGCCCCTCGCGCGCGTCGCCGCCGCCATCGCCGCTCCAC CTCGGCCCCGGAACATCGCGCGCGTTCCTCTTGCTGCCTCCACCCCGTCC CGGTCTTTGGCCGTCGGGTCTCCTTCCTTTGAGGTACGAGCTAGGTCGTG CTCATCCCTAGATCCGCCCCCTGCTACTAGAAGCAGTTTATTTTCAGAAA TTTCCGGGGGTCCAACTGATCCCCGTGCCCCTTGTTAAGTTCCGCCTCTG TGATGCTAGAGAGAGAGAGAGAACCTCACTTGCTGCTTTGTCGCGGAAGA ATAATTTGCATGCGATTTCTTCCCAACCAAATGAGCCGTTACCGCACTAC AGGTCTTTAGATGGGTACTAATCGGTGATATAGTTTGTTAGACTGTCAAT TCTGGCCTTGGCGACTTCTTAGCTGAGTGAAGTTTGAAAACATGGATGTT TTCCCCTTTCCGTTTCCGTCACTCAATCAAAGCACACCAGTATTACTTCA CTGATCCTGTCTATGACGCATACCCTACAGCTGCCACCGTGGCGTACGTT ACCGCCGACGCCTCAATCCCGCCCCACGCCCCCCTCCCTGCTCATCATTT TATGGTTGTGCTGTTGAATCACACAAGCTACACATGAAAACCTGAATGAA ATAAAGCAAATTTTATCTTGACACTTTCTTCATCCTGCACTTTCCCTAAG AGCTGCTATTGACACATGTTCTATACTGATTCTAATTGAATTGCTGTTTT TATAATACCTGTAAAAGTATTAGAGACTGTGAGATGATCAAATTGCTAGC TGGTATCTTAATCTATCTTGGACCAATTATTTTGCAGGTGATTGAACTGT TTTTATATTGTTGCCGGTCATCGTGGAAGTCAAGGGTGTTGTATGCCATC ACAAGAAAAGCCTGTGCTTATGCTCTCCTCTAATTGGCAGAATATGGTAA TTGATCTGTTTTGACAACATTGCGGCGAGTACATAGACGGATCAGATACA CCACAGAATCTTCCATATTCGAAATGCCATCATGGTGGGGGAAGTCTTCT TCAAAAGATGCAAAGAAAACCACCAAGGAGAACCTCATTGATACATTTCA TCGGTTGATAAGTCCAAGTGAGCAAAAAGGAACCACAAAATCAAAACGGA GTCATAGACGTGGCAATGATACAGCTGCCGAAAAAGTCTGCCGATCTACC ACAGTATCGCGCGCAACTTCACCTTCCAAAGAAGTCTCTCGCTGTCAAAG CTTTTCGGCGGATAGGTTTCATTCCCAACCACTTCCTGTTCCTGGATTAC GTCCTGCAGTGACGCGCACTGTTTCTGATGTCACGGAATCGAAGCCCATA TTAGAAAAACGTGGCAAGCCACCTCTGCTTCTGCCACTTCCTAAACCTAA CAAGCCTCAGAGAAGGTCGGAAATAGTGATTGCTTCAGTCTCTAGCAACT GTTCTGCTGATAGTGATGACCGTGGAGATTCTCAGCTTCCAAGCCCTGTT GAAAAGGATGCTGAAAACACCACAAATGTTGCTTCGAAGAGCAAGTCAAG GTATGCTCCTTACTGTAGTGCATTAAATTTGGCCTCTTTGTTTAAACTTG CTCTTACACATGTTTTATTCTGTTTGAACCCTGAAGTAATATGCACAAAG AGCGCCCTTGTGCTATTACCACCAAGAGTACCAAGGCGACGACAAAGGCA GCTAATCAATTCCTTAGTAACCATACAATGTCGACATCACCGAGAGGCAT TGCAGCTGACTGTCACCAATCCAATATACAAAATCTTCGGCCAGTAGTCT TGGAGAGTGCTCCCAATAGTTTGATGTCAAGTCCTTCTAGAAGTCCAAGA AGAATATGCCCAGATAATATTCCAACTTCAGCCTTTTGGGCAGTGAAGCC TCATGCGGATGTTACTTTCCTTGGCTCTGGTCAGTGCTCCAGTCCAGGAT CAGGGCAAACATCTGGTCATAACTCGGTCGGTGGTGATATGCTAGCCCAG CTTTTTTGGCAGCCCAGCAGGGGTAGTCCAGAGTGTTCACCAATTCCTAG CCCAAGGATGACAAGTCCTGGCCCTGGCTCCAGGGTGCATAGCGGAAGTG TTTCTCCATTACATACGAGGTCTGGAGGGATGGCACCTGGATCTCCAACA AGTCAGAATGATGGTGGAAAGAAGAAACAAACCCACAGATTGCCCCTTCC ACCATTAAGCATATCTAATAGTTCATTTTTTCCAAACAAGTCCACGCCGA CCAGTCCTATTTCAGCACCTCGCAGTCCTGGTAGAACAGAGACTCCAGCA AGTCCGGGATCACGATGGAAGAAGGGGAAGCTGATTGGCCGTGGGACATT TGGCCATGTATATGTTGGCTTTAACAGGTATGTGTTTCCCTACATGTGAA ACTTCGAATTTTCACCATATGACTCTGTACATTAAGCATGGTTAGAGTTT TTTTTAAGATGGTTGCATTAAGACATAACTTATTCCGTTCTGGCTATCTT ATTTTTCTGCAAGGTCTTTGTGTGTATGAACATTATAACAAGTCTTGTTT TATTCCATATGTCTCTATACTATTTCTGTTTTGTAGAGCTATAGTAAATA TTTTATGTGATGATCACTGTAGCTGGTTCCTACTACATATTCTACGGTTA AGGCTAGATGGCCAGCATGTTTATATAAATTTATGGCGTGCCATGTCTGT TTCCGTTGAGGAACTTAAAACTAGTGAATAAAGATCATTCAAATCATAAC CTTGTGTAACTTGCATAATGTTCGCGACTCCCTACATATATCATTCTTAG ATTGGTCGACATCCTTAGTTTCTATGACTTTCAGCAAACAAGATTGAATA ATCTAGGGTACATATAGCCAAAAAGGGCGTTTCCCCGAGCCATTTGTCCT CCCAAACTCTTAACAATTCGCCATTCTCTACACAAAATGACTCAAACTGC ATGAAATCAGCCTTAACCCTCATTAGGCCCTTCCAAAAGTATGAGTCTGT CGGCTTGGTTGTAAACAAAGAAGTGGCTTTTGACTCGTATATTTATTACG CAAAAGCACTGTAAACCCAGTCCACAGTAAACAACTTGTAGAGCCATTTA CTTAGTAGGCATTTATTTTTAACATCCAATCTTAATACCTAGGCTTCCTT GGTCCTTTGGGATACACAAAATCTCTCATTTCGCTGAAAGATATTTTCTT TTATGCTTATTTGAGTGTAAAAAAAATCAAGAGTGTAAAAATCTAGTCTC TTCTGAACCTCTCTCAAGATCTCCAAAAAGATCATAAAGATGGTCAGACT ACTCAGCACATAATTAATCTAGACCAGACGTCTGCCATAGGATAAGTTCT TAGAGCGCTAACTGCTGAGATGTTTCTCAAAACAATTTTCGATGTCCTTC CAATCCTGGTTACAAAGCTTGAGATAATGTGTTGGAATACCAAGGTATTT AAAGGGGAAAGAGCCCAACGGACAACCAAAAAGACGATTATAATCGAGTT CATGTGCCTTAGCCTTTCCAAAACAGTATAACTTGCTTTTAAGGAAATTA AATCTTTAACCCCGAGAGTTGTTCGAACACACATAAAATTAATTTCGTAT TAGCTTAGCTAAATCATGATCCATAAGAGGGATCGTGTCGTCGGCATACT GTAAAATAGACAGCTCATTATCTACAAAGTGTGGAATAAGTCCGGCAATC TGTTCGACCTCCTTTGCCATATTGCCAGCACATCAGCCACGATGTTAATA AAACAGGAGATAAAGGACCCCCCCCCCCCTCCCCCCGTCGACGGCCTTTC TTAGTTTGAAAGTACGGGTCAACATCATCACTGACTTTATTGGCAATACT ACCCTGCTGGACAAAATTGTCCATTCACATCCTCTGAGTTGAGAAAAACC CCTTCATTCGCAAGGCTTGTCGTAAAAAGGACCAGTGTACCTTGTCATAG GCTTTCTCAAAATCTATTTTAAAAACCATACATCTTAGTGTGCAGCTCGT GGATAGTCTCATGTAGAATAGCGATTCCTTCCATAATATAACATCTGGGT AAAAAGGTCATGTATGGTTAAATGACATAATTGGTCTTGTAAACATGCAT TACAACTTTTTTTAAATCTGTAGCATCTCACAGGTTCCTTGTTAGTACTA TATGACGATTATTTGAGTGTGTTTAAATCATGTCCTGAGTCCTCACAGTT CTCTCCCCTTTTTTGTTTTCACCATCTATGTCAGTGATAGCGGTGAGATG TGTGCTATGAAAGAGGTTACCCTGTTCTCGGATGATCCTAAATCAAAGGA AAGTGCAAAGCAGTTGGGGCAGGTATGGTTTTTCAATTGCGCTTGCATCT AAAATTCTATACCGGTGAAAAGATCGGTTCATTTGTTATTCTCATTATTG TTTTCCATTTAATCTACCATTTCTTTTCTTTTTCTCAGGAAATATCACTC TTGAGCCGCCTACAACATCCAAATATTGTACGATACTATGGCTCAGAAAC GGTATAAACAGTTGCCTTCCATTGTTATTTACTTGCTTACTCTTGTTTTA TTTTCTTTCCAATTACCGTTGGTTATAAGAGAGTTTATGATAGCTTCTTT TATGCACCACTTTTAATTTTTGGCATGACTTTAATACTTTATTCATTAAT ATGCCCCAAAGCAGGTTGATGACAGACTATATATATACCTGGAGTATGTA TCTGGTGGATCTATCCATAAACTTCTACAAGAGTATGGAAGGCTTGGTGA ACCAGCAATACGCAGCTACACTCAGCAGATACTTTCTGGATTAGCTTATT TACATGCGAAGAATACAGTCCATAGGTATCATTCAATTTGGTTTGGTTGC ATTTATTTGGCTGTACGCATTAGTGGAACACTGGTGTATTAAAATCTCGA TTACACAAAATGCAGGGATATAAAGGGTGCAAACATACTAGTAGATCCTT GTGGTCGTGTTAAGCTTGCAGACTTTGGAATGGCTAAACATGTAAGTTTT CCATCACTTCACTTTCTTTTAGAAGAATCTAGTCACATCACCGTTTGAGA AATAACTTTACCTGTTTCCCAAGCAGGAATGCTGTCCTTTCATTCATTTT CTCCTCTATGTGTTCTGCGTTTGTGCCCATAAAGTCATTGCCATAACCCA CTTGAATTAGATCGACATGTCCTATTTGCTGTCCTTGTCAGTGTCTGTAT GCCAACTTGTTCTTGTATCTCGTGGTCAGCAGTTGCCCTGCTGTGCATAC TTACTACTGATGTTAATGGTGCTCCTCTTAACCTCTGTGACCATGTTTTA ATAGAATTAGTCTTTTGGCTATCCCAAGTCTGATAGGTCACCGATGACCT CTCGTAGAAGACATAAATGTATTTTACTTGTTACTGTGTTGTATTAATTG TGTCTTCTCACCTTTTTGGGTCCTTTTCGCAGATCAACGGGCAGCAGTGT CCTTTCTCATTTAAGGGTAGTCCATATTGGATGGCTCCAGAGGTATTATT GGAAATCCTATGCTCCTACTTTACTTTGTATATTTTTCAATTTAGTTTCT TATGTATCTTGTTATTCTCTTTTAATTACGAGTTCACACGTAACATGCTT GCAGGTTATAAAAAGCTCAAATGGTGGATGCAATCTTGCAGTTGACATAT GGAGTTTAGGATGTACTGTCCTTGAGATGGCTACCTCAAAACCCCCATGG AGCCAGTACGAAGGGGTCAGTATTCTTACCACAAAGATGCACTTTATATT TGTTTTGTAACATCAGATGGCCAATGTGAGTTGCAAGCTGCATTTCTTGT TTGTGTGCTATACACACCTTTGAACTCGACGAATACTATTGAAGTGTATT AAGACCAATAGTGCTGTTTCCTGCTGTTTGTTTCGGATGATGGCTATCTT GGGTTTCTTGAACTGGACAGTGTCCTGGAAGCAATTTTTTCCAGTTTACC TTGATAGAGTGACCATGCTGTTTGGAGTAATCATTGATGTGCAACATTCT CAGTAAAATAACCTATCTCATATAAACTATGAAACACTTGTACTCTGAAT AGTGTCAAGACATTCACCTGTACATATCTATTGTCTTGTTTTCACCCACC TTCTGAAGATAAAATACCTTTTTTTGTAAAAATTTGTATAAAAATAAGGA AAGTTTGATGGCTGCCTGCCCCTGAAACATTTCCAGTTACCAACATAATT TTTTTTTTGCGAAAACGAAAAGCTTTGTGTTTCGATGCATTGATAGAAAA GAAGGTTGTACAAGGTTATGTACCGGCCCTAAGAAGGGCGAACACCACAC CATACAACTCGACCAGAAACCTAGTCCAGGGGAGTAGCTGGCGAAGCCCT CGAGCTCCCGCGTTCACCCAATCACGAGCTTCCGCTCTGATCGTGTCGAA CAGGGAGGACACCGAGGGGCGCGCGTTGTCGGTAATAGACCAAGAGTTCT ATGCAACATAAATTGACCAGCTACCCACTTGTAAACACTGATACTAGGAG ATAGACCAAGAGTTCTATGCAACATAACTATTCCATTAAACTGGGAGAAT ATGACAAAAGATGCTGTAAAAAATAAACAAACTAGTTATTAAATACACTT TGCTCCACACCAGATGATTGGATATGCCACCTTTATGTTCCTGAGTTGTC TAAGAACTTATTACTGTCTCAAGTGGAAGCTCCAAAACTCATTTACTTGC ATGCAATTTTATGAAATATATGGAGATAAGGCTTGCTCTTTAGGCTGGTA ATCAGAAGTGAAGTAAATCATCAAATACTTACCCACTTTTCTCTCCTACA GATTGCTGCAATGTTCAAGATTGGAAATAGCAAGGAACTTCCACCAATAC CAGATCACCTCTCAGAGCAGGGCAAGGATTTCATCAGAAAGTGTCTACAA CGTGATCCTTCTCAACGTCCCTCGGCAATGGAGCTTCTGCAACACCCATT CATACAAAATAGTGTCCCACTTGAGAAATCTGTTATTTCTGATTCTTTGG AACACTTGGCTGTTATATCTTGTAGACCGAATTCCAAGGTACCACCTGAA TACTTCTGTTGTAACTGACATTTTGTGGATGATCGAGTGTCTTTGTTTGT CATGCTCGTGGTCTGCTCACTCTGCTAGGCTTCCACTGATCTTATAGGTG GTTGGGCATACAAGAAATATCTCGTCATTGGGATTGGAGGGTCAGACAAT TTACCAAAGAAGGGGTGCAAAATTTTCTTCGAAACACAGGTACATCATTT CCCAAGTTCTCCTTATTTTCTTTAGAGCACATACTGTCAATGTGTCTTAA CATATTGCAACACGCTAGTAACCGAGAACTAAAGCATTAGCTATGCAAAC TGAAGGCATACTGTTCAGTACTTTTTGCACCGCTGATCATACGGCCGCCA GACCTCCTACTGTTTATACTGCCAGTGTCTTTTAAGGCTAGGTGGTGCGG TGCCGCCTAGCACCTAATTGTGGACTATTGAGGCTAAACAGGTGCCTAGG TGTGCTGGACTGACTAGAGGGCAGCGCCTAGGTTCTCACCATTTTTAGTG CACTGTCTAGTTTGTACAGCTAACCTGATGCTTACCAGGAAATGGATTTC TGGTGAACTTCATTTATCTTTTCATGGCACCTCAAATTGTTGTTACTTTT TGCAGCGATCTCCATATACGGAGCAATATATCCTGTCCAGTTTCTCCATG TGGAAGTCCTCTGCTAAGGTCAAGGTCTCCCCAAAATACGAATGGCAGGA TGTCACCCTCTCCAATTTCGAGCCCGAGAACTCTTTCTGGCGCTTCCACT CCCCTGTCTGGTGGTAATGGTGCCATTCCTTTTAACCATTTGAAGCAACC AACCTACAGCAATGAAGGATTTGCGATCGCATCAAGAGGACCTACCGATC GGAACCCTGGACAATTTGTTAGAGTGCATCAAGCCTCACAGGGACTTCAG CAGAGGGAAGTTTCTGACACCGACATTCTGAGCCCTCAATTTGGAAAGAG GCTTGGAAACGTTTTTGATTTGCGTGATAGACTGTCACCTTCTGAACATT TCACTCGTAATGCCTTTGTGGATCATGTGAAGCCAAATCCTTCACTGGAC TTCGCATCTGGTTCTCCACACCTTGGACTCAGGCGTGATAACTAATTATC AAGGATAAACAGCCAAGCGGTATTTTTTTTGGAGCTTGGCAAGGTAACTG AGTAGTTTTCAGCTGCTTTGGCCATTCAGTAGCTGGAATTGTATCATAGC ATGACTGTATGGGGAATATCATTGATTTTATTTCGAAGCTAACAGCTGTC GACGGATGGGGGTCTTTGTTGTCATCTCACAAAATAGACAAAGGTATGTG TACGATGTGATAAACTCACAGTTTTTAGTTGATTATTTGTGTTTAATCAC ATGAAGTAAGGATTAGTTGCAAGTTCAATGTTTTGTACATGCAATCCTGC TAAATTCACAACTGGTTTTATACCATGCTAAGCTAGCTGCCAAGTGAGCA TGTCTCAAAATGATCTCCTGAGCTTGGTGGGTTTGTACAGATAAGAGTTA GATTAGATTATTATTGCATGAAGACCCTAATTCCATCTTAATATTTTTAC GAGGTGGCAGTTTTACTGATTAAGTTTTCTCTATATACATTGCAGACCGT CCATCTCTGTCAGGCAGAACAATTCGGCGTCGCAAACTACAGCTGGCATG CTAACATATGTCTCCAAATGACAGAAGTGTATACTACTAAGATCCCGTAC AAACTGAAGGGCCCAGAAGCAGTAGTTGGCCGCCTGTATACTCCCGCTTT GCTGCTACATGTAATTTATTCTTTCGGTGATGCCCGTTGTACAGAAGCAG TCTCAAGTGAAAGCCAAACATTTTGCACAGAAGAAACAGCTGAGAGCCGT CCATCCAGCACCCCGGTCTCCTAACCCCGAGGGTTGAAGCTACCACCGCT GCAAGTTACGCCAAATTGACCCTTAATAATACTGGAAGTAATTCGCAGCA CCGCTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.