Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA026452

[Submit comment/correction]

Sequence	AA026452
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA026452
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTCAAACCCAGCCCCACTCCCCCGCTACATATAGCCCGTCACCAGCTCCG CTGCGCCCTTCCTCTCCCCCACATCACTCGCTCACTCTCACTCCGTCATC ACTAGCGGAGGAGCGACCGCGGCTCTGCTCCCGTCGATCGCATCGACCCT CCATGGCTCCATCCGGGGCCGGCGCGCTGCCCGCGGCGGTGGCGCTCCTC GCCGCCGTCGTCGCGACCGTGGCCGTCCACGCAGCCGCCAGCGGTGGTGG CCGGAAGATGGCGTCCCACGGCCAGGTTCGCGCGGTGTCCCTGCCGGATT GTGTCTGCATTTATTGTTCGACTGCATGCCACCATTGCTATGCACTGCTG TCTGCTGCTGCATGATGATGCGATAGAGTACGATACAGTCCTGCTGGGGC TACTACTGCTACTCTTTTGTTTTCGACAGAACGGTAACACCCACGTGCGC AGGTGCCTTCTACCACATAGGTCATTTTTCTTGAAAAACCTCTTTTTCGC TTTTCAAAACTTCACTTTGAAAGCTCAAAAAATTCAGAATAAAGTATATA TATGGGTACACATAATTGCCTGGTATGTACGTGCTAAGTCTTGTCATCTT ATCTTATTGGATGTGAACTAGATAAATAAGAAGGCAGAGAAGAAGAAATG ATTTCTTTTGGTGGCCGTGATTTTGTCCTTTTTGCTTAGACTAAGTTATA ATGTATTTTTCAGAGAAACTCTACGAAACTTTTGTAATGTATACTACTGC ATAGATTTTCTTTATTTTTTTTAAAAATTATAAATATTATTTTTGAGTGT TTCAAAATAAAGGGCTACATGGCACCCGAGAACCATATCACCGCATTATC TTGAATTAATGATTGAGTACTCTCTATTGCAGTCCTACGCTAACAAACAT GAAATTTAGGTGCCTTTCACTTCGAAATAATCAAACCAACCGGTATGAAG GGGACAATAAATACAGATAAATATAGTATAACATGGTAGTTTTAGACGGT GTTTTGATACTAATTCTTTGGGCTACATATTACAAAACACATCTGAGTCG TCGCCCCCGGGTCACTCGCGTGACGCGAGTATGGGGCGCCCACCTCAAAA CCCTAGCAGGCCACTGCCAGACCCTCTTCCTTCAGCCGCTGTCGTCGCGC CCTCTTCCTGGTCGGCGGTGGCGGTCACGCCTTGGTCATCGAAGGTGACA GGCGGTTTGCGCGGCATCTGTCGATCTCCTTCGCGCGGGGGTAGGCACCT TGGGGCTACGTCGGTGGATCCGGCCTGCAGGTGGCGTCGCTCCAGCAACG CAGGCTGGCGGCTCGGATGAGAGGCGCGAAAGAGCTAAAGGGGTGTCTGG TGTGGACCTGGCGACGGCGGATGCTGCTCCTGGAGCCCCGCTCAATCTCT GGGTTCGGCCATGGACTTGAAAGGGCTAATGGTTTACCCGCTCGTTTTTA TTGCCGGTAGCCGCCAACGGTATGGGGACTGCTGGTTCGGTCTGAATAAT GGAGGCGGTTCTAGGGTTCCTCCCGCGCGAAGAAGAAGATATGCTTGATG CTTGCCCTCGTTGATCTGGCTGGGAGTGTCGAGTTCTAGAAGGCTTCGTC GGCAAACTCTCATGGGTGCATTAGGCCTGGAGATTGCTGGATCGGAAGAT ATTCGGTCGTCCGTACCCTTATTTTCTGGCCGTTTGGTTTCAGCGAGAGC GTTACGAAGCTCTGTTGTTTGTTCCTACCAAGTGTCATTCAACGAGCCAT GGTGAAGTCAGATGCAGAGAATGTCAGGAAAAAAAACATGAGGGCAGCGA TGGTGATTTGGGTCTTTGTGGCGATGACGAACTAGCTGCGTGATCTGTGA CTCGCAACAGTGATTGTTTGTGGGTGAAGACAACACATGAGGAGTTTTCA GTCTTACCTTGCAGGGTGAAAATCCAAGGTCTGGCCTTAATTGGTTGTGC GTGGCAATGACCTTGTTGAAGGCATTATTTTGCGAGTGAGGATTTTCTCT AGGGTAAAAGTCTATGATCTTCGATCGGGCAATGACGACGCTTGTGTATT AATTTCTTCTTAAAAGCATTGTTATTAGAGTTGAGGACTACTGGTGTTGT TTTGGTGGTGTCAGTGTTGTTGCTTTGAAAAATAGTTCTCTGTAGCGGAA CTTTTCTTTTTTGTATTTTTTTTCTGAGCTGTGTGCGTCCGTAAAACCGC TAGGGCATGTGTTAATGCAGAGGCTGGTGTAATTGGTATCACCGTGATGT TAATATATATTCTTTTTCAAAAAAATATTATAAAACACATGAATAGGAAA ATGGCAGAAATTTGATAGGGTTGTATGTGCAAAACAGATGATTGCAAGAC AAAGGAAAACATATGAAACAATCATTTGGATAGAACACATGAAAACATAG AAAATGTCCGGATCAAGAAAAGAGGTTAGAGTGATGCTAAAATTTCTATG CGATCGACATGTAGAAATGCAATCCACAGAAATTTTGGAGGTGTCATCCA AAAGGCTTACTTAGAAAATCACTATAAATTGGAATTTCTTTAAAATTCTT TTGAAAATCCTGGGTCTTTTTAAAATGTGTAAAGAAAACACATACCATCT TTCTCTCCACCCCTCGCGCTAAACCCAGCGCGATGCACGCACGCAGGGCG CGAATCTCAAGATATCTCCCGCGCCGCCCGCGCCGGCGGCGGCGGGCGGC TCCGCGGGCCAGTTCCGCGGCCAGGCGCGGCTGCCCCGCTTCGCCGCACC GCGCCACTACGAGCTCCGCCTCCGCCCCGACCTCGTCGCCTGCACCTTCT CCGGCACGGTGGCCATCACCCTCACCGTCACCGCGTCCACCCAGTTCCTC GTGCTCAACGCCGCCGACCTCTCCGTCAACAGCACCTCCGTCCGCTTCCA GGTAAGAATAAGAGCTCGCTCGAAACTTTGCCCTGTGAATCCCTCGAGCC AGAGACAATGTCATCATCCTCGCCTGGTGCCACCTCGCCCAATTCTCGCA GGCTCTGACGCCCACGGAGGTGGTCTTATTCAAGGAGGATAGCATATTGG TGCTCGGGTTTGCCAAGCAGTTGCCTCTTGGAGAGGGCGTGCTCAAGATG GACTTCAGCGGTACTCTGAACGACCGGATGAGAGGATTCTACAGGAGGTA TGCTTCCCTGACTTCTTTCTGGAATTAACCGTTGCTGACATCCCCACCAT ACACGAGGATTAACAAACCCCAAAATTTGTGATATGTACTAGCAAATCAT GGTGATAGAGACAAAAGGGGAACATCGAACTGTTGTTTGTCATTGCATAC CGACCAGTTGCTCACTAGTAGTATATGAGGTTGGGGATTTCACTCTGAAT GCGTTCTACTTCTAATGGTTTCTTTCTAAATTAAGGATCTAATCGAGCAA TTTGTGGACACCATTGTTATGAATTTCTTTCCTGTTATTTATGTTCTGTG ATTCCATTTGATTGCAGCAAGTACCAGTATAAGGGGAAGGAGAGAAACAT GGCAGTGACACAGTTTGAGTCCGTGGATGCGCGGCGGTGCTTCCCCTGCT GGGACGAGCCTGCATTCAAGGTAAGTATGATAGCAGGATGGATTGTTTGC TGATCATATTTTTGCACACGGCTTGTTTGTGGTACTGTTAAGTGACATAT TTAGTCTGCTTATAAGCTGAGTATGTGTACTCTGTGAAGCATATTCTGCT GGGCAACACATGACATTATGTTCCTCCCACATATGTGCATGTAGACCATC CGTAAGGGCAGATGCATTTTGTAACATTTCTTGTATCACTGTTTCTGTGT TCCAGGCTAAGTTTAAGCTAACACTTGAAGTTCCATCTGAGCTCACAGCA ATGTCCAACATGCCAGTAGCTAACACGACATTTGCTGGCCCTATCAAGAT TCTCCGTTACCAGGAATCGCCACTTATGTCAACTTACTTAGTGGCCATAG TAGTTGGTTTGTTTGAATATGTAGAGGGCATGACAGTAAAAGGTACCAGC TCTGTTTCTCTCTTTCCTTCGACATTATGCATTTAAATAGTTGCACGAGT CATTTTTTCTCTCCCTTTTCATTTGTTTGTTTAATTATATTCAGGCACGA GAGTTCGTGTGTACACTCAAGTTGGTAAGAGTAGTCAAGGGAAGTTTGCA CTAGATGTTGGAGTGAAGTCGTTGAATCTCTTTAAAGAGTAAGATCACAA TCTACCCTTGCTTCTGCACTTAGGTTTCTAATGAAGGGACATGGTTTGTA TTAATGAAATAGTCTGTCAAGCCATGGTTGTTGCTGAAACAGTATCATTA ACAAAAAGTTCATTTCGTCATTTTTTCAGTTACTTTGGCACTCCTTATCC ACTCCCCAAGTTGGATATGGTTGCTATCCCTGATTTTGCTGCCGGAGCCA TGGAGAACTACGGATTGGTCACTTACCGGGATGTAGCTTTGCTTTTTGAT GACAAGTCTTCATCAGCCTCTGGCAAACAGAAAGTATATATCATAGCTCA GAAACTTATTGAATTACAAATGTTCATCATTTGTGGTTCACTTATCTAAG CATTGTTACCATACATAAATAAGATTTACTGTATAAAAAAATACACTTAT CTTATGATCATCTGTAGTTCACTATAATTGATAATGATTTTTTTTTGTAA TTGAACCTTTTTATGTGAAAAAATCCTTTCTTTTATTTATGTCAGCATGT ATTTTTAGGTTGCAATTACTGTGGCACACGAATTGGCCCATCAATGGTTT GGCAATCTTGTAACCATGGAATGGTGGACTCACTTGTGGTTAAACGAGGG ATTTGCTACATGGGTAAATCAATTCAGTGATACAAAATTTGAAAATGAAA TATCAGGTTACCAATGTATACTGAATGAATATTCTCTGTTTTCACAGGTG AGCCATCTAGCAGTAGATACCTTTTTTCCACAATGGAATATCTGGACACA GTTTCTCGATAGCACAACCACTGCTCTCAGATTGGATTCATTAGAGGAGT CTCATCCTATTGAGGTAATCTCATGCTTACTCCATGACATATCCTGGTCC GATGGTTGGATAACTTGTGCACTACTTCCTCAAACACAACAGATGCCATG CACTATATTGTCGTAGAACTACGAGAATACATTTTAAACCGTAAATTTTG ACAGTGGTGAGTCTTAAGTAACGATGCTGCATTTCTGTTATGGTCACATT ATCATGCTTGACTCGTAAAGTTTTATGCCTCTATGGAATATTGAATATGA TGCTTAAATCTTTTCAGTCTGACATCTTACTTCGAAGATTAAGTTCAGTA GATGGATCAACACATATTCAGCTTGTGACGTTAACATTTTGGCTTCTCAT GCTCGCTTGTGACTCACAGAATTTTCACTATTCATTTTACTTGATGCTCA GGTTGAAATACACCATGCCAGTGAAGTTGATCAGATTTTTGATGCTATTA GCTATGAAAAGGGTGCTTCTGTTATTCGCATGCTACACAGTTACCTAGGT GCAGATCGTTTTCAGGTCTAGTACTGCCTCTGCCTGAAACTCTTATCAGA ATTTTTCTTTGCCATGTTGCTTAAAAGTGTACGGAATCAGTCTCAAGCTC TTTCTTTCGTTCTTCGAGAAAAAAGTGATACTTTAATGTCAATTCCCCCT ATTCATCTAACAGAAACACTAGTTGACTCACTGGCTTGGCCAATATATTA AATGTTTGTATGCTCTTGAATCGTATTACTTGTTACATTTGTTTTTATAA GCAGTGTTTTAGGGAGAGACCGTTGTTTATCAAAGAGATGCTATAAGATC AAAATAGCCATTTCCAAAATTGACCTGTCCTTCACATGAGTAAGGGTGCA TAGAGACATATTTTATTGTTAGAGGTCATATTCTAGATGTGGCAGTCATC TTAGTATTGTGTGGTATGCATCACACTCACAGGATAAACGTTACCTCAAT TTGCAAATGGATGGAGTAAAATTTAGCTATCCTTGACTCTTTTGTTGATG ATATCATGAATTTATCAAATTGCGCACTGCATAATATTCAAATTTTAATT AATTGTTAGTGAAACAAATTGCTGTGCTCTCCTTGCTATTTAGTTTCCCC TTGTTACTATTTAACTCCCTGGTGTTTCCTAGTGTATTCTGATACACTGA AGTTATGAAACTGTATCTTTTCAGACAGCACTGGCCTCATATATAAAGAA ATATGCATACTCAAATGCTAAAACCGAGGATCTGTGGGCTGTTTTTGAAA AGGAAACTGGTGAACCTGTCAAGGATTTGATGACTTCATGGACAAAGCAA AAAGGGTACCCTGTTATTAATGCAAAACTTAAAGGGAATGACATGGAACT TGAGCAGGTAATAGGCTATCTTAAATGCCACACTTCATATTTATCATGCA TTTATTGTCACGTGAACGACCAAGTACAGGTTTGTTTTTGTTAAATTTTC TTGTTATTATGCCCTCCATTCTGAATTATAAGTTCTGGCATTTCTCTAAG TCACATGTATATAGACGCGTTTAGTGTGTCTTTTCACTTATTTTAGTCCG TATGTAGTCCATATTGAAATATTCAAAACATCTTATAATTCAGAACGGAG GTAGTACTTTGTTAAGGTATAGTCGTGCCATTTAGAATTGCTTTATAAAA TCCACTAGTTATAATAAAGCTTGACCAAAACTAGTTTTTTTTCTTATCAT TTTGTGAACAGATAACTGACTTTTATAAGTGCTCCTCTGAGAATACTGCA CTCAATGATGGACGAAACTGAACATATTCTAGTTCCCCTATGCAGGGGCG GTCCCAGAAATTATTCATGCCCTGGGCTGGGTCTTTTCATCCTCCCTTAC TCTACATTAAGTTCTTGATCTATCAATGTTTTTTCTATTTTTACAAACAT TCTAAAGAGGGTTTTTGGGCCTTGACCCTGGGCTGAAGCCCGGTTGTAGT CCGAGCCTGCCCGTATGACCATAATCCATCCCTCAACATTTTCATTTATT TACGCAGCAGCCCCAAAATCTGATCAAATATTGTGGGGTTTTAGCCTGCG CGTCAACAGTATCAAGAACACATTTGATGAATCCTGTAGAAGAACCGAAC TAGAGCTTGTTCTAAAGTTGAAGCTCTTTTAGGGTGCTCTATCTCACCAA ATTAGGGTCCCCTGAAATGTGAGTATCCATGTATAATTTGACGTTACAAT GATAATTAATGTGTATTAAGTCATATTGGCTTCATTTATTGTTTTTGTTG ATCATTCACATTTACTTTGCCAATTACTTCTTGTAGTGCAAATAAACCAT TAGCCTAGCCACTTCCCACTACGAGGTAATATATAATCACCCGCCACTAA ACCAAAGCAAACAGAGGTTTGTCAGTTCTCAGAAATGTGGCTGCATCATT AAATTATCCTAGTCTGCGCCTCACTCATGTTTACACGGCATATGGTCATT ATTCATTAAGATGTGTCTCTAGTCTTTGCAATTTTACATTATATTGGCTA CATTATACTGATGTATCATATCCATGTTAAAACATAGCTGGCATTTTATA TCTGTAAAGGAAAATAGAATGATGAAAATACTGACAAGTTGATATTTGTC AATTGATAGATCCATGTTATATAGGAGTAGTATTTTTCTCTACGAATGTG CTGATTTTTTTTGTTGCAGGCTCAGTTTTTATTAGATGGATCCTCTGGCC CTGGCATGTGGATTGTCCCTATAACTTCAGGCTGTGGTGCATATGATACA CAGAAGAAGTTCTTATTGAAACTTAAACGTGATAAGCTGGTCATTGCTTC ACAATGTGGTGACCGAAAGAAGGGTGGAAACTTTTGGACTAAGTTGAATG TAAATGGAACAGGATTTTACCGAGTTAAATATGATGATGAACTTGGAGCT GCACTTCAAAATGCGTTGGAGACCAAGAAGCTCTCGCTAATGGATAAAAT TGGTAAACGCAACATGTGGCATATTGAATTTGCTTGGAATACTTTGGTGT CAGGTATTATAACATTAGCATTGCAGGCATTTTGGACGACGCACATGCGC TTTCTATTGCCCGCCAGCAAACATTGGCATCATTGCTACGTTTACTCTAC TGTTACCGTGGGGAAGCTGATTATAGTGTTCTTTCACACATTAACTCTGT ATGTAAATCTTGTAGTCCAGTTGATTCCATCATGTTCGATTTTCTGAAGA TAAATCACCTATATATTTTTTTCTTTGGCTTGCCAGGTAACTGCAAGTAT TGCTAAAATATCGTTTGATGCGACTCCTGGCTTGGCTGCTGACATCAAAC AACTTCTGATAAAGATTCTTTTGTCACCTGCAGAGTATGCTCAACCTTGT TATATAACTGCTTATGAGTGTCTTAATGTGTTATGTTCATAAAATATCAT CTCTTCATTTCACAAAAGGAGAACAAATATAAATACTCCCTCCGGTCCAT ATTAATGGCCTCAATTTTGTCTAGATACGAATGTATCTAGTCTAAATACT TAACTAGATACATATGAATCTAGATAAAGTTGAGGCCATTAATATGGACC GGAGGGAGTAAAATAAATCTCTACTTGCTCATGTTGCTTGAACAAGCCTT TATGCATGCACAATCATTTATTACTGTGTATTTGCACAAATTTGTACGTT TCTTCTTTTTGACTATATGACAAGTGATCTAATGTTTCAGAAAGTTAGGC TGGGATCCCAAGAATGGCGAGAGCCACCTGGATGTAATGCTTAGACCAAT GCTCTTGATTGCACTTGTCCAACTCGGACATGGTAAGACCATTAACGAAG GAGTTAGGCGCTTTAACATCTTCATACATGACCACAATACTGCTCTTCTT CCTCCGGATACTAGAAAGGTCCTACCTTTTGCTATTACTTACGTGGTGCT CCTATGATTACTGCTTCCATTTCTTACTTCCGTTGTTCTGCAGGCTGCAT ACCTTGCTGTGATGCAAAATGTTACTAGCTCAAACAGATCAGGTTATGAT GCTCTTCGAAAAGTCTACAAGGAGTCAGCTGAAGGGGAAGAAAGGTTACG TGTCTTAGGTGTGTAGCCATTCGACCATGTTAAATTAACAGAGCTTGCTC ATATTTTTGGTTGTTTTGAAAGCACTTTTTTATTGTTTCTAGGCATATTA TCTTCTTGCCAGGATAAGGGTATTGTCCTTGAGTCATTGAATTTGATTTT CACTGATGAGGTAAATGCAAAAATTGTTAATCCCTCTGATCCATAACAAG TGTCAGTGATTTAGCACAAAGCTGTACTAAATCAGCGTCACTTATTTTGG ATCGGAGTACTCTCTTCCACGATTATTGTGTAAGGTCTCTATGAGCTTGT ACTTCTGTGTTAACTTGTTTGCATGCTGTACTCAGATCTCTATGCTTCTC TTGCTTGTCAGGTCCGCAGTCAAGATGCATATGTCCCACTTAGAGGTCTT CAAACAGAGGCACGTGAAATTGCGTGGAACTGGTTGAAGGTACAATATCT TTTAACTGTGACCGATAACCCATTTATCTGCGCGTGAAGTCATGATTTCT GGGCCCTGTTTGGAACATCAGATCTTTGCAGAAATTCCAAGCCAAATGGA ATATCTAATCACTGGATGTTCTCTTTCTACAAACTTCATTTGAGATTATA TCCAACCATTGGATGTGTTTCCCTACCAACTTCATTTTAGATTTCTGCAT TACAAAGAGGACCCAGGGTGCTTTTGTATTTGTTAATAAGCAGTATTCAA GTGGCATATTTTTTAAGCAAACAAGTGAACTATATCTATGAATTGTTTTG TGATCCCGATCCCTTCATACGGATGCCCTTTCTATATCTTTTTAAAGTAG AGTGAACTTGAGGCACCACCCCACCATTTATTTTCTGTGTCGGTATAATA CTGAAATATTTGTAAACACAGTGCTCTGTTTTGTCTGTGCAGGAAAATTG GGAGCGTATTTCGAACACAATTTCGGCGAGCTCACTAGTGGGGGATTTTA TTAAAGCCATTGTCCCATTGGTAAAATTTAACCACAGTTCTATCGCCGAG TCTGCCTATTTCCGCAATCCATACTCCCCAATTTTGTCGGTATTATTTCC ATCAGGCCATAGCTAATGCGCACTCCCTTGTTTCTTGTCAGTTCACCTCC AATGCGAAGGCATCAGAGATTTCCCAGTTCTTTGCGACCCGCACAGCGCC AGGATTCGAGAGGACGGTGAAGCAGAGCCTTGAAAACGTGCGGATCAGCG CGAGATGGGTTGAGGGCATCAAGAGTGAGCCTGGGCTCGCACAGACGGTG CGTGAGCTGCTGGGCAAGCCCTGATGGGGATGCGGGTAGTGTTATATTTC TGTTGATGCGAGTTACTGGGTAAACTTAGGAGCTGCTTCCAGGTGTTACT GTTGGGGTTGGCCATAAGAATGCGTTCCTGCATTATCATCTGCTGAAAAT GTTGCTTGCCATGTTCTTTGATCGCAGTAGTTAGTCACGTGGTGTCAGTT TTTAGCCAAAGCATTGTAGGGCAAACAGATTGTATAAAGTTATGAGAATG TCGACCTAGAACTGATTAGCATATCAGTTAGGAAGAAATTCAAGCACTGA AATGGCTTGAATATTTTTCATAAGGGGGGTTTTGTATTTAGCTTAAAGTG TTTGACTTGAAATCAGTGGAAATTGTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.