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GrainGenes Sequence Report: AA026318

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Sequence
AA026318
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026318
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGTCCTTCGTCCGACCTCTATCCTCCTTTGCCCGGAAAAAACAGATAGG
AAACGCTCCTCGCTTCCCACGCCCTCGAACGATCCACGCATGGAAAAAAA
CTGGATCGGAAACGCTCCCCGCTTCCCACGCCTTCGAACGATCCACGGTT
GCGGAGTTCTCCGTCTACCCTCTCTTGCATCCGCCACCATCTTCCCCGTG
GTCGCCTCCGCATCCATGTGTGCACGGGACTCCCCGAAGTCATCTTCTTC
TCCGGCGTGAAGTCCGCCGCGACACCACAGTGCTGCGAGTCCTTGCGGTC
AACCTGGAGGGCGACCATGATGAGCCTGTGACGACGGGTCGCATTACCGA
AGAGGACGACCTACTTCCTCCGCCCCCATGCTTCTCCTCCAATCGTCCTC
CGTTGATCCACCAAGGTAACACGACTACACCGTAATCCCTAACCCCCTTC
CGCAGTATCCTTAATCCTACCGCAGCACATCATTGTTCGTTCAATTCTGA
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TGAGGTTGATAATCATTTAAATTCTATAAATGACCTGCTAACACTTGGTC
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AGTTACAAACTTAAGATAGTGAGTTTTCTACTTTATCTCAGAAAACAACT
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TATGCTCCATCATCAGTTGAAAGCTTAGCAAAGACCACCGGTGTTCCATC
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TTATTTTACTTACCTTGACTTATTTATGAACCCGGCGTTAAGCTGCTTTG
CATCATTATGACCAAAATTTTCTAGGTGATGCTCATTAAGTTGATATGTC
ACAACCTCGACCTATGGTAATTAAAGTTTTTGTCTACTATGTGTGATCGA
TCCAAAAATTCTACAACTGATAACTAAGTACCATCATCACTACAACAGAG
AACGTGATGAAGATTTGTATACGCGTCGTCATCCAATATAGACTCAGATC
AGTTGAATATCATAGTTGGAGGCCATGACTTGTCGTATTTCGCCATGTTT
TTGTATATTTGAGTTAATAAGATTGTCGTATCTCTATGACCAATCTACAA
TGCGCCGGAACATCAAATGCGAATGCGGAATATCAGATGTAGTGCTGAAA
CTTTAATCTCATGGCAAGGCATTGGAAGCGTAATTTTATGATGGTTTTAA
GCAAGACGAAAGTAGTATCAAAGCACTAATTGAAGGGTTTCGCAGCATAG
TAAATCAAAAAAATTCTACGGAAGCGAACGGAAAAGCTAAGATCTAATCT
AGGAGATGCAATCAACGAGAGGGATAGATGAGATCTTCATACCCTTGAAG
AAATCGCACAGCGGAAACGTTCAACAGAACGTGGGTGATGTAGTCGAACT
AGCCTTCTCCTCCTTGCGGTCTGATCCGATCTAACGCCGCAAGTGGCGAC
GCCTCCGAGAGATGCACACGTACGGCACCGCGATGTCTCCTCCTTCCTCA
GTCCAGCAAGTGGGGTGGAGAGATAGATTGGATCTACAGCATGACGGCGT
GGTGCAATGGTGGAGAGTTTTTGCGGCAGGGCTTCGCCTACGCGCTGTCG
GGAGAGAGAGAGATCTCGAGGGCAGCAGGTAGGCGGCTAGGGTTCAAGGA
GGGGTGTGGGGGGAGGGTGCGCCCCTGCCCTCTTTATATAGAGGGCTGGA
CGGCTGCCCTTTCCCCTCCTCCAAGCCCTAGGGTCGGCGGCCACATGGGG
TGGAGAGGGGGGCAAGTTTCCCCCTTCTAGAAGCTCTCCCTAGGGTTTTC
CCTAGGGCTTGGCCAGCTGGGCCTATGGGGCCTTGTGCCCCTGGCCCAAT
GCGGCCAGGGCACTCCCTCGTAGGCCCACGCCCCCTCCCGACAAGTAGGG
CCACGTTGGTCCCACTCCGGAAGCTTCTAGAACCTTCCGGTACAATACCG
AACATTCCGAAACAATTCCGAAATCCAAAAACTGCTTTCCCTTATATGAA
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CCGAGACTCCGAACAAAAACTCATAAACCAATTATCCATTCTATCCTAGC
GTCGAGACACGTTAAGTGTGTGACCCTATGGGTTTGAGAATATACAGACA
TGATCTTCTATCAATAATCAACAGCGGGGTCTGGAAACCCATATTGACTC
CCACATATTCATCGATGATCATATCGGATGAACCACGATTCCAGGATTCA
ATTAATCCCATATATATATTCCCTTCGTCACGCGATATTTTACTTGCCCG
AGATTCGATTGTTGGCATCGGAATACCTAGTTCAATCTCGTTCACAGCAA
GTACTTTACTCGTTCCGTAATCCGATATCACTTTGTGATTAACTCCTTAA
CCACTTGCTTTCAAGCGGTGTTGATATCGATTACCGAGTGGGCCCAAAGT
ATATCTCTCCGACTTGGGAGGGACAAATCCCATCTCGATACATACAACCC
AACAAGTACTTTCCGATCACCTGAGAGACACCTTTATGATCACCCTCTCA
GAGGATGACGTTTGATTACCTCAAAGCTTTCTTCCGATACCAGGGAGTTG
CATTATCTCATGGTCTAAGGAATACAATATTTGACATAAGAAAAAGCTTC
GCAAAGATGAACACGATGCCATGATCTAATTACTCTGCTTAATTTGGGTT
TGTCCATCATATCATTCTCCCAATGACATGATCTCATTATTAATTGACAA
CTCATGTCTATAGTTAGGAAACCTTAACCATCATTAATCAATGAGCTAGT
CCACAGAGGCATACTAGGGACACGGTGTTGTTCATAAACCACACAAGTAT
CAAAGTTTCCGCTTAATACAATTCTAGCATGGAATATAAACTTTATCATG
AACAAGAATTATAATAATAACATCTTTATTATTGCCTCTAGGGCATAATT
CCAACACTAATATGGTTGTGTGAAGAAAAGTAGTACTCCCTCCGACCCAT
ATTAGTGTTAGAAATAATGGGACAATTCTTTTAGGCCCATGTGCATTTCA
GATTTTTCCTAAATCTCAAAGCCCAAATTTGTGGCAGCCCATATGTGTTT
GAGCCCATGTTTGTGGCAACTCACATGGAAGTATGGTGGGAGCTCAAGTT
TAGTCCCACTTGGAAAGTTGGAGGAGAGTTGCACCACCTTATAAGGTGGA
GTGTTGCACCACTTTGTAAGTGAGTGGCAATAAGAGAGATACACGCGCGC
GCTCCTCCTCCGACGATGCCACCGCTCGCACGCCCGCCCGCCCGCTCGTC
TCGTCACGTCATGTCACGACACGGGCCGAGGGAATCTCGCCGAGCTGAGC
TTTATTTTGCTGCTCAGGAAAACTGCGAGGTTTTGACAGACGTGTCAAAC
AGTTAGCTTATTCGGGTCGCTTCCGGATCATGGGCTATTGTAACTGACCC
GAATGTGCGCAACGTGGACTCGGCCCACGTTCGCCTCCATTAGGGTTTCT
TGAGCTCCTCTATATAAAATCCTGCGCGGCTACCGCCACAACACCACCGA
AAACCAATCTCGGGTTTTGCCATCCTCTCTACTTGCGCCGTCACCGTAGT
CTACTCCATCCCGCTTGCCGATGTGCACCGGCGGACGGGAGCCGAAACCA
CTCGCCCTTGAGATCATGTACGGGAGAGGGCGAATAAGGTTTTTGGGAAG
CGCTCCGCGCGACTGCTCAAGTTCGTCATCACGGCGCGTCTTCCCGGTCG
TCAAGTCGGAGCTCGTGCTCGACATCTTCAACGCCGACTTCTTCGATAGT
CTACTGCAAACGCTACACCAACAGCGACTTCATCGGCAACCGATCAGTAC
GTATACCGTTGTCAGATCAGTTGCTTCAGTATGGTTATTAGTGCGTATAT
TCTGTTACTGTTCATGTTTATCAATACATCTAGTATGTTAGAGGTTCACG
TGATTATAGCTGTTGTTGTCATGATTTATATTATGGAATTAATCGTGGAA
ATTATGCCTAATATTCCAACAATCCAAAAACCTTATTGTAGGCAATTTCC
TGAATTAATAATGGATGGTTTTACCGATGCACTAAGGCCGGATAAGTTTA
CCGGTGTGCACTTTAAGAGGTGGCAGTAGAAGGCTGAGCTTTGGCTGACC
ACGATGAAAGTGTTCCATATCAGTAAAGGCAAACCTGAAGAAACTATATC
TGACGAGGATACCAATACTGTCTTTGTGGGATGTATTCTGAGCATTCTTG
CTGACCGTCTGTGTGATGTGTTTATGGACATAAAAGACGGGAAGGAGCTC
TGGGATGCACTGGATGCAAAGTTTGGTGCTGTAGATGCTGGCAGTGAACT
GTATATCATGGAGAGCTTTCATGATTTTAAGATGACAAAGGACCTTCATG
TGGTTCAACAAGCTCATGAGATACAGTGCATTGCCAAAGAGCTCGAACTC
CTTAAGTGTACCTTACCCGGCAAGTTTGTGGCGGGTTGCATTATTGCTAA
GTTGCCCCCTTCATGGAGGAACTTTGCCACAACTCTCAAACACAAGAGAC
AGGAGATATCAGTTGAAAATCTGATAGCGTTCCTTGAAGTTGAGGAGAAG
GCTCGGGCTAAGGACACTACTGAGAAAGGAGAGAGTCATGCTACTGCAAA
CTTTGTGCAGAAAGGAAAATCCGTAGGCAAGAACAAAGGGAACTTCAAAC
CCTCCTTTAATAAGCCTATAAAGACTACAACCTTCAAGAAGAAGAAGACG
AACAGGGACAAGAGTGAACTGTCTTGTTACACTTGTGGAGAGCCCGGCCA
CTTTTCCAAGGACTGTCCAGAACACGCAGACCACAGAGAGAAAAAAGCCA
AGACTGTCAACGTCGTGACCGCTAGCAATACTGATGGGTATGGTAATTTA
TTTACTATTCTTTCAGTATTTCAAACACCATGTTGGTGGCTTTATATGGG
TGCTAATGTTCATATGGGTGCTGACATCTCTATGTTCACTTCTTATCAGG
TTGCTCGGGATTCATCCGTCCTAATGGGCAATGGATCACATGCTTCTGTT
CGTGGTGTTGGCACGGTGGATCTTAAGTTTACTTCCGGAAAGATCGTGCA
GCTAAGGAACGTGCAGCGTGTCCCTACTATGAACAAGAATCTCGTTAGTG
GCTCCCTTCTTTGCAGAGATGGGTTTAAGGTTGTCTTAGAGTCTAATAAA
GTCATTGTTTCAAAACATGGACAATTTATTGGTAAAGGTTATGAATTCAG
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ATATTTGTGGTGGTGTTAATGATGATACCAGTATTTGACATTCTCGTTTA
TGTCACATTAATTTTGGTTTGATATCTCGGATGTCCAGTATGAGTTTAAT
TCCGAATTTCACTATTGCCAAAGGTTCTAAGTGCCATAGTTGTGTGCAAT
CAAAGCAACCTCGAAAGCCTCACAAGGCTGCCGAGGAGAGAAACTTGGCA
GCTCTAGAACTCATACATTCTGATCTATGCGAGATGAATGGTGTGTTGAC
AAAAGGTGAAAAGAGATATTTCATGACGTTGATAGATGATGCTACTAAAT
TCTGCTATGTTTACTTGTTGCAAACTAAAGATGAGGCTTTAGACTACTTT
AAAATCTATAAGGCCGAAGTTGAAAATCAACTAGAGAGAAAGATCAAGCG
TCTTAGGTCGGATCGTGGTGGTGAGTATTTTCCCAAAATATTTGACGAAT
TCTGCAGGAACATGGAATTATTCATGAGAGGACGCCTCCCTACTCGCCCC
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TTTGTTGACTTCATGTCATGTCCTGAATAGAGTTCCTAACAAGAATAAAG
AAAAGACCCCTTATGAAGAGTGGGTTGGGAGAAAACCATCACTTTCGTAT
ATGCGCACTTGGGGGTGTTTGGCGAAGGTCAACATACCGATCCCTAAGAA
ACGCAAGCTCGGACCCAAGACAGTGGATTGCATCTTTCTAGGATATGCTC
CACGGAGTGTAGGCTATAGATTTCTAGTGGTTAAATCTGAGGTACCTGAT
ATGCATGTTGATACTATAATGGAATCTCGTGATGCAACATTCTTTGAGAA
TATTTCTCCTATGAAAGATATGCATAGCATTGGTAGGATTTCTTCTGAAA
TACTTCCTGAATCTAGTGCATCTATTGAGAATTCTGAACAACCACATGAG
GAATTTCTTGAGAAGGATGACGATGAACCTCTCACGAGGAGTAAGAGACA
GAGGGTTGGAAAATCCTTTGGTAATGACTTCATCGTGTACCTTGTGGATG
ATACTCCCAGATCCATTACCGAGGCATATGCATCTCCTGATGCAGATGAT
TGGAAAGAAGCTATCTAAATTGAGATGGACTCAATTCTTTCTAATGGAAC
TTGGGAATTATCAGAACGACCCTATGGTTGTAAACCTGTGGGATGTAAGT
GGGTGTTCAAGAAGAAGCTAAGGCCTGATGGTACTATTGAGAAGTACAAG
GCGCGTCTTGTAGCTAAGGGCTACACACATAAAGAAGGCGAAGATTAATT
TGACACCTATTCACCTGTCGCTAGACTGACCGCCATTCGAGTACTACTAT
CCCTGGCTGCCTCTTATGGTCTTCTCGTTCATCAAATGGACGTGAAGACA
GCTTTCCTTAATGGAGAGTTGGAAGAGGAGATCTATATGGATCAGCCGGA
TGGGTTTGTGGTAAAAGGTGAAGAGACAAAGGTGTGCAAGTTATTGAAAT
CTTTATATGGCCTGAAACAAGCACCTAAGGTATGGCATGAGAAGTTTGAC
AGAACTCTACTTTCTACTAGCTTTGTCATTAATGAGGTTGATAGGTGTGT
TTACTATCGCCATGGTGGGGGCGATAGCGTTATATTATGTTTGTACGTGG
ATGACATTATGATCTTTGGTACAAACATGAAAGTGATAAATGAAGTCAAG
TCTTTCCTGTCAAAGAGTTTTGATATGAAAGATCTGGGAGAGGCTGATGT
CATTCTGAACATCAAGCTTATTAAGAACGAGAATGGGATTACTTTAACAC
AATCTCATTATGTTGAGAAGGTCTTGAGCCGATTTGGCTTTAATGATGGC
AAGACTTCTCCAACACCTTATGATCCCAGTTTGACATTACGAAAGAATAA
GAAGGAACCAACAGATCAGCTGAAATATTCATAAGTTGTTGGTTCTCTCA
TGTACTTAGCAAGCGCTACAAGACCCGATATCTCTTTTGCTATGAGCAAG
TTGAGTAGGTTCATGTCTAACCCGTGTATTAATCATTGGCATGCACTTGA
AAGGGTCATGCGCTATTTATGTGGTACAATGAGCTATGGGATTCACTATT
CAGGGAACCCTGCTGTACTTGAAGAATATAGTGATTCGAATTGGATCTCT
GACATTGATGAACTCTACACCACGAGCGGGTATGTGTTTACCCTTGGAGG
TGGCGCAGTGTCATGGAGGTCTCGTAGACAAACCATATTGACGAGGTCAA
CTATGGAAGCAGAACTTACTGCTTTAGACACAACCACTGTTGAGTCAGAA
TGGCTGCGTGAGCTCTTGATGGACTTGCCTGTGGTTGAGAAACCTGTGCC
GGCAATCCTTTTGAATTGTGACAACCAAACCGTTATTGTCAAAGTGAATA
ATTCTAAGGATAACGCAAAGTCATCAAGACACGTGAAGAGACGTTTGAAA
TGTGTCAGGAAATTGAGAAACTCTGGAGTAATAACTGTTACGTATATTCA
AACAGACAAAAACCTGTCAGATCCCTTTACAAAGGGACTATCACGAAATG
TGATAGAAAGTGCATCGAGGGAGATGGGGTTGAGACCCATGGATATCACA
CCTTAGTGGTAACCTAACCTATGTGATCGGAGATCCCGTGAATTAGGACC
TGGGAAGAACAAGCTAGTGGTTCGACGAAGGAGAGTATTATAACCCTCTC
TATGTGAAGATGCATAACTCTCATAATCTGTAAGGCAGGTTGGCAACATG
CCTTAATGTTTTTCTGTTGGCTTTAATTAGCAAAGATGCCGTCCTACAGG
GCATTCTTGAAAGAACACACCTATATGAGCTCGACTGTAAATGTCGCGGT
CTATGAGACTTGGGTGATCTCTAGTAAACTCATAAAGAGACCAGGGAGTA
TGACGCATATGCTCCAACCCGCGGGGTAGGCTACTGGCAGCCAAGTACTA
GTTATGATTTTGAGTGAAATCTATTGGCACCAAACTTGCAATTCAAGGTT
CGTCCATTGTTCAAGTTGTTGATAGACGTAGTTCAAGATTCTAGGCGGAA
GTTCAACTTAACAGTCTCTGCTGAAACACTGGTATATAAACAAGTAGCGA
GGATTGGCAAATCTTTAAATGGGCATTTGAGATCTGGTGGGGGATTGTTA
GAAATAATGGGCCAATTCTTTTAGGCCCATGTGCATTTCAGATTTTCCCT
AAATCTCAAAGCCCAAATTTGTGGTAGCCCATATGTGTTTGGGCCCATGT
TTGTGACAGCTCACATGGAAGTGGAGTGGGAGCTCAAGTTTAGTCCCACA
TGGAAAGTTGGAGAAGAGTTGCATCACCTTATAAGGTGGAGTGTTGCACC
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CGATGACGCCGCTAGCCTGCCCGCCCGCCCACTCGTCTCGTCACGACGCG
CGCGCACCGCGGGTTGTGGCCGAGCGAGCTTTATTTTGCTGCTCAGGAAA
ACTGTGAGGTTTTGACAGACGTGTCAAACAGTTAGCTTATTCGGGTCGCT
CCCGGATCTACTGTAACCGACCCGAACGTGCGCAACGTGGACTTGGCCCA
CGTTCGTCTCCGTTAGGGTTTCCTGAGCTACTCTATATAAACTCCTGCGC
GGCTACCGCCACAATACCACCGAAAACCAATCTAGGGTTTTGCCATCCTC
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CCGGCGGACGGGAGAGCAGGTCTCCGGAACCACTCGCCCTTGTGATCATG
TACGGGAGAGGGCGAATAAGGTTTTTGGGAAGCGCTCCGCGTGACTTCTC
AAGTTCGTCATCACGGCGCGTCTTCCCGGTCATCATGTCGGATCTCGTGC
TCGTCGTCTTCAACGCCGACTTCTTCGACAGTCTACTGCAAACACCACCA
ACAACGACTTCGTCGGCAACCGATCAGTATGTATACCGTTGTCAGATCAA
TTGCTTTAGTATGGCTGTTAGTGCGTATATTCTGCTACTATTCATGTTGA
TCAATACATCTAGTATGTTAGAGGTTCACGTGATTGTAGCTGTTGTTGTC
ATGATTTATATTATGGAATTAATCGTGGAAATTATGACTAATATTCCAAC
AATAAGTTGACTTGGATTTGTAAAAATTTGGATAAACCTATATACTAAAT
ATTGGCTAGATTCATCCAAATTTAGACAAATTTAATTTGAGTCAGAGGGA
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ACTAATAGGGAATATATAGTACTTTCTCCGTCCAAAAATAACTGACTTAG
GTTTGTCTAAATTCAAATGTATCTAGACGTGTTTTAATGTATAGATATAT
TCATATCTAAACAAACTCAAGTCAGTTATTTCTGAACAGAAGGAGTAGTA
AAACTGAAGCATATTTAAACTCTCATGCTGATGAGCCAAATAATCACATC
TGCAGATATTGCAGGCACGGGGAAGCATAGTATGCAAAAGGACGAAGCAA
TGCATCTATGAAGCACTTATGTTACAGGCAGTCAAAAACAAAAATAATGG
CATGTTTGTGTCTACATGATGGCAAGCATGAGGGACGATGCCGACTACAG
AAGCAGAACCGTGACTTTGGTTGTGAGGCATTATGCCTGTATGGCAGCTA
GACGATCTGCAAGCGCACTGGGATGGCCTAGGTACCGGCCGTCATGCACA
CCATCCTTACAAGCACAGAACCGGACGGGGCGTCTAAGCACCAGCGGGCA
ACAACAGAAATAGAATGCCCGGACTGTCGAAGTGCATGTTGACGACGATG
CAAACATAGTGCAACGCTGTCAAAGCACTCACAAACGACATAGAAGCAGA
ATGCCAGGGCCGTCAAAGCACCCGTCGATGAAAATACAAACACAACGCCA
AGGCAATGCAATGCAAGCACCCGTGCCAACGACGGAGTGGAGGCAGCCTA
TGACGAGGCGTGAGGTGCATGCTTACTGGTGCTGCATCAGATCGCCAAGC
ATAGGTCCAGTTTTAGTGAATGGTAACCATATTTTGCACTAGATGTTCCA
TGTATCGTACGTATCTTTTCACTTATTCATAATATTTCTATTCTCAACAT
TATTGCAGATCAAAAGCTACAATTAGTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.