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GrainGenes Sequence Report: AA004289

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Sequence
AA004289
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004289
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCAGGAATTACCCTACCTGCTCGAAGCCTCAAACACGCACTCCCCCCAA
ATCCCCATAGGCCAGAACCCTAGTGGAGAGAGGGCTCATGGCGACGACGA
GCGAGTCCACAGCCAACTCCACCCTAACGAGCGCGACGGCCGAGGCTGAC
GCAGAGCGCGAGCAAGAGCACGGCAATGGCGCGGATGCCGCCCCTGCCGT
TGTGCAGCAGCAGGAGGAGGACGGGGATGAGTTGATCGGGCCGGGCCCCG
CGCCAGCGCAGAAGCGGCAGAAGCGCCCGCTCCAGTTCGAGCAGGCTTTC
CTAGACGCCCTCCCCTCCGCCGCCATGTGCGTCTCCTCCTCCTCGCCGTT
TATTGCTGTAGGATTTGGGAGGCGCTTGTGTTTTCTTCCTGGAGCAGCGA
CTAACTTTGTTCGGTTGCTGCGTTATGCAGGTACGAGAAGAGCTATATGC
ATCGGGACGTTGTCACCCACGTTGCGGTCTCCCCCGCTGACTTCTTCATT
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AAAAGTTATGAAATATAACAATGTCCAGGATGTTGTGGTTTCTGCTGATG
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TTATTTTATCTTTGCGAAAACCTATTCCCGAACAATTGCAAACTTGATTT
TGACTTCATGCTTCCACTTTATACTACTTTAGCTGAAAACTTGGTAACTG
AAACAATTTAATAGTATGGTTGAACCCTGCAATTTCTAATCAGATATTGG
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TAGGAAATGCAAAGGAATTTTGGAGGTTTGTTTTCCTTAGGAATTTTTTC
CTTCAGGGGTGTTCGGAACAAAGGAACAAGGTGCACCCATTCCATAGGAA
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ACCGCGAGCTCATTTTTCGGCAGATGCCCGAGGCGAGGCACTCCAGCAAT
GACAGTTAGCACAGAACACAAGTCAAAAAGCTACTCTGTCCACGTGAGGA
TTCCCTTGTAGCCAAATAAAAAAATAGTAAAACGAATGCTTCACTTTCCT
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TTTTGCACTTGCTATCATTTCTAATTCCTACATTTTTTCCTGACCCTGCG
TTTTGGATTCCTCCGATCCGAACGGGGCCTTAGTGTTTAGATACATGCGA
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GGGGTCTTTCCTTTCAAGATAGCTATATTACATGCGCTCTGAAATGTTCT
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CTATTTGAACTTGCAAAATGTAAGACGAGTGTGTCTGCTATTGAGGTACC
TTTTTATTTGATCATTATAGAGCTAGGTATACGGTTGCACTACAGTGAGC
TTGAATGCTTTGCAGCAGAATAAATGTATTCCCAAATATAGGCTGCCACA
CAGCATGCATTTCTTTCTTTTACCAGCATATCACTTCAATGACAGGGATA
CCTGAATATGTAAGATATATCTTTATCTCATCAGTTGTTGGTTAGATAAC
TTCATCCTTACCTTAGTTATAATGGGCTAAAAATGATGTCAGTCATTTGG
CAAAAAACTACTCACGTCTAGTGCATTATGAAACCTTATACTTTTTAGTA
ACGACAATCACTGTTAATCTTCCTAATATACACGGAATAAGTCTACTTAA
TGAGCTGGTCTTGTCCAGATGAGCAACGATGGAACTCAGTTTGCTGTCAC
ATCCCCTGACCGCAGGATAAGGGTATTTTGGTTCAAAACTGGAAAATTAA
GACGCGTGTATGATGAGTCTCTCGAGGTAAGATACTTCCTCTGTTCAATG
CTTGCACATCACAGTTGAACATGTTCAGTTTGTAATTTCCAACTGAATAC
TGTTACTTGTAGGTGGCACAAGATCTTCAGAAAAGTGATGTTCCGTTGTA
TCATCTTGATGCTATTGATTTTGGGCGAAGAATGGCTGTTGAGAAGGAAA
TAGAAAAGACAGAAAATGTTCCACAACCTAATGCTGTATTCGATGAGAGC
AGCAACTTTCTTATTTATGCCACCCTTTTGGGCATAAAGGTATGCCTTAG
TTCCTTTCCTTTTCCATTTTCCCCTTACATTTGGTTCTTTATGTATTACC
AGTCTATTATTGTTACATTCTGGATGATAAACAATTCTCAAGGAAACATG
TTAAATGATGTTAAAGAATATACTTGTTCTTCTGAGGTAACATTTATATA
TAGAGTTGGCAGTTGCTCATGTTGAGTGATTGACCTTTTATCGCACATAA
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ATGTATCTAGACTTCTTTTAGTATGTAGGTTCACTCTAAAAGAAGTCTAG
ATACATTTGTTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAATGGAGGGA
GTACTTATGTCTGGCATCTTGCACCTGTGATGTGAGCTACTCAGCTGAAC
ATCATCCTGTAAGACTTATTATTATAATGCATATGCAGGTTGTAAATTTG
CACACGAATAAGGTTTCCCGTATCCTTGGGAAGGTCGAGAATAATGAGAG
GTTTCTGAGAATTGCTCTATACCAAGGCGACAAAGGCAATAAGAAGGTTA
GGAAAATTCCTGCATTAGCTGCTAATGTCAATGACACCAAGGAGCCTTTA
TCAGACCCAACTCTGCTATGTTGCGCCTTCAAGAAACACAGAATATATAC
CTTTAGGTACGCCAGTATATCATCCTAGGAGAATGTTTCATTGGCTGGGG
CCGGTGACACTCTTCTGAATTTTGTTCATGTATGTTACTTCCTGGAAGCT
TGACACCCTGTTTCATCCTTATTACTGTACAGTCGTAGAGAACCCGAGGA
GCCGGAAGATGCAACTAAGGGTAGGGATGTTTTCAATGAAAAACCCCCAC
CAGAAGAGCTTTTGTCTGTATCAGAATTAGGGAAGACTGCTACGACATCA
CTACCAGACAATTTGGTATGTTCTCTGAACATTTATATTTGGTTATTACA
TACTTAATATCCAAACGATATATGAAACTGATATCTTAATTTGTCATTTT
CTTCATCGCCTAAATCTGTAAGGTTTTATTTTCTGTTTCAGGTGTTTCAT
ACTTCAATGGGTGATATTCATTGTAGACTATATCCAGAAGAGTGTCCAAA
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TCATATTTCATCGTGTAATTAAAGGATTCATGGTCCAGACTGGGGATCCT
TTGGGGGATGGTACTGGTGGGCAATCAATCTGGGGTAGAGAATTTGAAGA
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ATGACTTTGTAAAGTTTGTTACTTAGTGAAAAAAATCTTTTCACAGTTGT
GTAAATTTCTACCATACACACTGTCCTTGTTGTCGAAGAAAGCACCACCT
TTAATTGATAACACTGTCTTTTAATCCCTTGTATAGGCTTATAGTGACAA
CTTGTTCGTATTGCAGCTTGAGACATGATAGGCCATTTACACTTTCAATG
GCTAACGCGGGACCGAATACAAATGGTTCTCAATTCTTTATCACTACTGT
GGCTACTCCATGGCTAGATAACAAACATACCGTGTTTGGTAGAGTTGTGA
AAGGGATGGATGTGGTTCAGGTATCAAACTTTTGCATATTCCCTTTAGTG
GCTGAATGTTGTCTTCTCATTTCCTTTATTTTGTCTTCTTAACATTCTGT
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CTATCAGGATGTGAAGATCTTGAATGTTACGGTTCCTAAGACATAAGCTC
CTGTTTAACCAATTGGTTAGTACTTCTCGCGGTTTCTCCCTTAATCTTAT
CATCAATTTCAGGATTTTGGTATGTTTTGGATTGAATTCTGGACACAAAC
TTGACAACATTTGTAACTATGTGTATTATCGGTCTGTTTATCTGGGAAGT
TAGATCTATTGTTCTATTATGTGCATCAAGATGCACAGTTATGAATCTCA
GCTGCACGCTTCAAAGTGCTCAATAATTCGATCTGTTTTGATGTTTTAAT
GCTTTGTGAACAACTCTGTTAAAAAAATAACGTACCTTATCAAGCGGGCA
GGGAGTTCCTGCAATTCCAGTAAGATAGTAGAATTAATCCATTTTGTGAG
GGAAATTGGATACACCAGGGATGCAAGGTGTGTTTGACTTGTCATAATTA
GATTTTTTTAGGTGAGTCTTATCAACTTTTGGCTCCTCCATCATTTAATA
GCAAACCAAACGCATCTTCTTGTGATTTAGGCAAAACTTGTGTGAGATCA
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ACAAATTTGGAATGGATGGAGTAGCAATTTACATGAAATCGAAGTGGAAT
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GTCAATTCTCTTGATCTCTGCTGTGGTGCTTCGGGTTCACCTTCTTCACC
AGGCCAGGAGAGCAAGACAATACGACTTGTGCCTGGGTAATGTCTGTACT
ATCAAAGTTTTAGTGAGCCTTTGAATGAGAGCCATGGCTCAAAGGCTAAC
AACCATAACATTTTTCGCCGTCGGCAGAATTATTATTTCCCCAAAGTCAG
TAGGGGAAAAACTAACAGCTTAGTAGCATGAGCATACGAGGAGGATTTTG
TTTCCCAATGTACTGTACGTGTTAAGTTTGTAAGAAGTGTTACTGAGAAA
CCCTGATACAGTTTGCTGCAGCCTATACGCATGTTGACGTTGACGGTTGA
ACTGATGGTCGCTAACCGAGTGTAAACGGACAAGGAAGGTGGAATCTTTC
CATTCCTTGGCCGTCGGCGTGTTCCTTTTCTGTTGGTAAGCGATGGATAT
TATTGCCGCGGGACACTCTGTGTAGGAGACTGTGGGGGCATCTGTTTACG
TGTTCGGTGATCACTGTCGTAGTAAAGGATACCCAAACTCTAGACGTCTC
TGGGCTGTTCTGGGAAAATATGTAGTACTAGTGTTTAGTGTCGCTGTTCA
GAGTAAGTGTGGTGTTTGTGCTTGCAACAGTATTCATCCGAGTGACACGT
AGAGAAGAGAAACGCTGGTTTGTTAACTGTTGTTGTCCTTGCTGTCTTTG
ATTTGAGTAGTTGTAGAGGATATACTTGTATAATCATCTCTTTATTTATT
TGAGACGCATGACGCCAGGCCTTAGGTGTACATTCTTCTTTCTTTCTGGT
GGGGAAAGAGACGCATGACATCTCTTTCCAGGCCTTAGGTGTACATGCTA
TAGCGAGCCGCCAGCGAGGAATGGTCAGCCAGAAGAGCGCCGCGTGGACA
GGGCCCGCTCCAAAAGTAGCGGAAACGTCAGCGGAGGAAGCGATCGGCCA
ATGGGACGACGCGAATAAAAAGCGGGCGAACGGCCGGGTTTTCCTCCCAC
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CCTTCATTCATTCATTCGTTCGTCCACCGGCACCGGCTGCTGCTTTTGAG
ATCGCAGAGATGGCGGCCGAGAAGCACTTCAAGTACGTCATCCTCGGCGG
CGGCGTCGCGGCGGTTCGTGCTCTCCCTTTGCGTGTTTCCTCTGGAATGT
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GGCGAAGGAGTTCGCCAACCAGGGCGTCCAGCCCGGGGAGCTCGCCATCA
TCTCCAAGGAATCCGTACGCCACCCCTCCCTCTCCTCCTCCCTTCTTCTT
CCCGACGCCACTCGACTCGATCGAACTGAAACTGGACCGTTTCCTGTTGT
GCCTTTGTGACCACTTATTATCATCTAATTACTGAATTGATTGATCGCCG
TGTGTCTGTCGCGTTTTCAGGTGGCTCCGTACGAGCGCCCGGCGCTCAGC
AAGGGCTACCTCTTTCCCCAGAGTAAGTAACAAGCCCCTGTCTGCAGAGA
CAGTGGGGCACTTCTCCTCCTTTCTGCCCCACCATCGACTATTTTTTATT
ATTATCTGCTGCTCTTGCTGAGAATGTCTATTCTGTTCTGTGCAAACAGA
TGCCGCGAGGCTTCCAGGGTTCCACACCTGCGTCGGGAGCGGCGGGGAGA
AGCTCTTGCCGGAGTGGTACACAGAGAAAGGTAAGGAGAAAATCTCCTCC
TCTCGGACTCGGAGAGTGAGTGGTCACCTGCTGATTCTTTGAGATGGATG
GGCGGGCGCCTTTTGTGCTATTGGTGGGTGCTGCTGGATTTTGCTTGTTG
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GATTTGTAGTTCTAACCGACAGTGGTTGGACCGTTGGAAGTGAATTCTGA
GTTTTGCTCTAATCATCCCATGGATTTGCTCAAGTTGCTTGACTAATCAG
CAGCTGTGGAAGTTTGAAATGAAACGAAACCGGCGAGGCCACTCGCTGAT
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CGTTTTTTATTTTATTTTTTCAAAACGATATGCTGTTTTAGTTGTTTTGT
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GACAGCATGTCTGGTGTTTATGCCTGTATCTGACAGCTTAGTTGGAAATG
CGCGAAAAAAGAGAGCATCTAGTGTGTTTTTGCACATCTGAGAAATGAGA
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GATATTGTCAAGGCTGATCTTGCCTCCAAGACGTTGACCAGTGCAGCTGG
AGCAACCTTTACCTATGACACCTTGCTCATTGCCACTGGCTCCTCGGTGA
GTTTTCCCACCGCATGATAAAATAGTCTGCGGCATGTGCAATTGGTTCTG
AACCTGTCAATCTTACTTTTGCCCGAGTCAGCCTCTCCAGATATAAGGTG
TGACTCATTGTATTTGTATTTCTCTGCTTGCTCAGACCATAAAGCTCACT
GACTTCGGTGTTGAAGGAGCAGAAGCAAACAACATATTGTATCTAAGGGA
TATCAAGGATGCTGACAAGTTGGTCGCAGCTATGCAAGCGAAGAAGGATG
GGAAGGCCGTCGTTGTCGGAGGTGGCTACATAGGGCTTGAGCTCAGCGCT
GCATTGAAGATCAACAATTTCGATGTCACTATGATATACCCAGAGCCGTG
GTGCAGTAAGTCCTCGTGTTCTTTGTCTGTTAAGCTTACAGCGCTTCATT
TTTCTGAATGGTACTTAGCAAAGAAAATGAAAAACCGTTTTCGCTACACA
CATTGGCAATTATGTCAGAGCAATCTCAAATGGGAAATGCCATCTATTGT
AGTGCCCCGTCTCTTTACTGCCGGCATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACT
ACGCTAGCAAAGGAATCAACATTGTGAAGGGTACCTATGCAAGTGGTTTT
GATGCTGACGCCAATGGAGATGTGAGTTCTTACGCTCTCTTCTGTTTCAG
TGTGATTGGGGGTGTTCCCTCTGCAGGACAATGCTCACCTGCTTCGATCT
GTTTTTTGCTTGTCAGGTTTCTAAAGTCAAGCTGAAGGATGGAAGAGTGC
TCGATGCTGACATCGTCATCGTCGGAGTAGGTGGCAGGCCAATGACAGGC
CTCTTCAAAGGCCAAGTTGAGGAGGAGAAAGGTGGACTCAAGGTTAGCTC
ACTGTTATGTTGATGAATTCTAGAAGTATGTTCAACATTTTTTGGACAAA
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TGAAGCTCTACAACGAGCCGAGGAGAGTGGAGCACGTCGACCATGCCCGG
AAATCAGCCGAGCAGGCCGTTAAGGTAAGCACATCCTTCTTATGCCCCGT
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GAGTCCGGCGAGACGGTGGCGGAGTACGATTACCTGCCCTACTTCTACTC
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CGGTCCTGTTCGGGGACAACGACCCGGCGGCGGCCAAGGCCAAGTTCGGC
ACGTACTGGGTCAAGGACGGCAAGGTCCTCGGCGTGTTCCTCGAGGGCGG
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CGGTGGCCGACCTGGAGGCGCTCGGCAAAGAAGGGCTCGACTTCGCCGCC
AAGATATGAAGATATGAAGATTTGTACATTTTGTGTTTGTGTCTACGTTT
CCTAGTTCTTCGCTCAGCAGTGAGATTTTATTTTTTGGAACTTGATGTTG
TGAGTAATGACACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.