Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002071

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002071
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002071
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAAACATGTGTGATGGTTAAGTTTAAGATCATATTTTGCTAAAAGCATG
CGCTAGATCCAGCTTTCTTTTCCCCACTCACATAATCACGTCACCGTGGT
TATCTTGTTAGAAAGGATGGCGTTGGGGCAAAGATGAGGTTAGCTAAACT
AGCGTGCTTTCTTCCAAGCAATTAAAGGGAAAATTCTCAGGTTTTCTCTT
TTTCACAAATTTGGCAAGATCTCCAAAATTGAGAAAAGGATGGCAAAAGA
TATTTTGGCGTTTGGCACTAGTATTTGGCAAAATGTTATGGCTGCTCATA
CGGGAAGAGATAGATATGTGCGTCATAAAACCCGCAGAATGCAAACACAC
ATGACGGTTAAGAGTAAGATCAAATTTTTTGCTAAAATCCTAAAACACAT
GCGTCGGGTCCGGATTCTTTTTCTTACCTCATGCGGCGGCAGCATTCTAG
TGGCAAGGTCGGCTCTAAGGAAAAGAAGATGAGCTAAACATGCGCTTGCT
TCCACGTAATTAAAAGGCAAACCTCCAGGAGAGCGTTGCTACTAATACTT
GTAGTAGTAATGTGCATCACGTCTACCTCTCCATTGTATTCTTTTCCTTC
AAATCTCGCATCCTCTTTCACTGGTAGTCGATAGCGAAGGAGTCTAGGTG
ATAGGTGTGGGAGATATGGATGGTGGAAACAGTGGAGCGGCCCAACTGGC
GAGGCAGCTGGCGGACTGTAGGCTATCAGACGAGCTAGGCCAAGGGGAGA
CGGAGTACATGCGGAGGTTTCACCGCCGCGAGCCAGCTGACAACCAATGC
ACCTCCGTCGTCATCAAGCACATCAAGGCCCCCGTCCAAACAGTAAGAGA
ACATGCTCAAATGCTTTTTTTTATATATCGTTCGTCCATGCATATGTCAT
CTTGAACCACATTTGATAGTATAAATAGTTACCTTTTATGTAGGAGTATG
TGAGTTGTGGTTGGAACAAAAGTTTGAGAAATCCATTTAGTGTGTACGAG
ATGCCACTTTAGTCTTGTTGGGTGACCCATATTGAGAGACTGAGAGTAGG
GGTGTGCATTCATGTCATGTTTTCTATGTTTTAGTATTCCGATTTGTACA
AATTTTAGTTTTCCAAAAACTCATCCAAATTAAAATAGAAGTTTGTTAGA
ACTAACAAACGTAGCACCAAGGAAAGTGACTGGGATGATGTTTGATAAAA
TAAAAAAACAAAGATGAGAATGAGGCTCTCCAGTAATAAAAAAGCCATGA
TGGTGCACCATGAGATGGAAGGGAGGGCCACCATGATTCATGGGAAAGAA
GCAACATGGCAGGGGAGGGGGCGCTTATGTAGTCTAAGTGGCCGCAACTC
AATGAGAGGCCGGTTAATTTTTGGGATATTTGAGCATGAACATCTTCGTG
ACCTTCATTAGGGACAATAAGCAAAATCATGGGGATAAGGTGGGATTGGA
TGCAAGTAGAGGAGCACAAGTGACAACACCATGACAATTATAATTGGGAA
AGGCTGGGCAATTGAACGGCGATGTGCTATCAAGATAGTTCCTTTTCTTT
CCTAATCTCTAGGAAAAGGGCACAAGGAAGTGGCAGGCACACTCATTTTA
CTCAGTCCATTTGGTTAACCTAAAACAAGGAACAGATTGCCCAGATTTAC
TACAATTTTACACCTTTTCACTTGATTTAGGCACCAAAGAATGTATAAGC
ACCATATTTTGTTCTCTACACCAACCGGGTGAGAGGGCCGAGACCTTGTG
GAGCCATCAACTAGCAAGAACACATGGAACAAAGATAGTGCTGTGGAAAG
CACTACAGAATTACAAAACACTCTAGCCACCATGATAATGATGTAATAAA
AATGTAACCTTGTGACAAGCTAAGGCATACAATACAAAAAAGATCTAGCC
ACACATGAACTAAGGAAGCACTCTAGACTTTACATAATAAATTATGTCTA
GAAGGTGTAACAAACTAACAAGTGCATGTCACAAGATACAAAATAAGAAT
GCACACTAGCAAAGAGACAATAAATAACAATGTCATCACACACGTCATGA
AATAGGAAAACTCTACATGCCTACATATAAAGGAAACACCTAAGCCACCA
AGACTAGTTGTTGTACATAAAACATTATTACTAGGATAGTTTCGACAAAT
TGATAACGTGTGTCACACATGAAAATATAAGGATCACCCACGTACCCAAT
AAGGATGCAAGCTTGCGTCCCTCAAGCCCACAATATGTTAGTGGTACAAA
TATTACTAGAATCACCAAACTCCCTTTTAGGGTAAATATGCGCTAGAAAG
TATGGAACAGGCTCTAGTGTGCTAACACTTGCATATCTATGCAATAAACA
AACACTCTTACTACTAAAGTAATATGCATACATAAATAATAATAGTGTTG
TAACAAACTGATGGCAACATGTCACACACACCACAGTATAAGCAAACAAT
TAATTAGAAAATTCTTGCCACTCATGGAGTAAGGAAATAGTCTACCACCA
AGGCAATAACCCAACAAAAATGTTAATATTGGCAGGTGGCATGACACACA
CACCAAAATAAGGAAATGTTGTAGATACTAAAATAAAAGTTATAGACATG
TAATTGTGTATAGCTAATCTACTCATATTAGATAGTTCTATCATATTGTA
GCGCATTATTTTTATAGTCTAGAAAAAGAGAACATAAAGATAAACTAGTC
TATGTTTTTCTTAACATTGATGGCCTTGCCTAGGCCTTGCCCAAGGTACA
CGAAGACTCACCCACGCACGACACAGGGGAGCAGAACACACAAAGTCTGA
TGCACACGCACTTGTTTTTTTCTCTTATTCAATCTTAGCAAAATACAACT
TAGTTACAAAGCCTTTTAAAGGGAAATATGAAACGCACGTATGCACACTC
ACACTGGTCTAATCTGTTTTATGCTCTACTAGCTACACGCACGGTTCAAC
TTAAGTTACAACCAAGTCTGCAGATCCTTTGGATTCTCATGTTCAGGACC
AAGCCTCAAATGATTGCTCCCATTTCTTCCTCCACACTGATCATCCACAA
GACTCGGAACCTCTAGCTCCAACAACTAGCTAACACATGTTCATGTAGGT
AGACTCCTGCAGCAGCACACACATTTGCCACTACAACACACACATGTACC
ATGCATCTTTCTAATCAACTACCCAACTACTAGACTGCATATACATACAT
GATCTCATCCATACGCATGTACAATGCCGCAACCTAGTGGTTGGACACAA
CTACATGCATGAACCGAAATCTAAACATGATTAAAACAACTAACCAACAA
GGTTAACTCCAACAAACATATTAGCATCACTCAACTTTTAATTATAATAT
ATTAGTTTCCTATTTTTTACAATCTAAATTGTCCCCACACTCCAACAAAA
AAATTATGTGAAAAGTGTTTGAAAATACACCTTTAGCTTGAGCGGAAGGG
GAAATACCAGCTATTCAAACTGGCGGGTGGGTGGATACCCTAGTTCTTAT
TGCTTTGTCGGATCAGGGGCATAGAGGGTTCATTAGTTTGACAACACAAG
GGTGTCATGTGGAGAAACAGAATTGAACTATTCTTTGGGTACCGGTACTG
CTACACACATGTACTAGCATTTAACTTAATGCGATAACTTGTACTGACAC
ATCATGCAAAATCCATACATACTTCGGAACATAGTAATATTAATATTTAT
TTAATGTCCATATTTTGTCTTCACCACATTTAGGTTTGGTCACTGGTGAG
GAGGTTTGATCAGCCGCAAATTTTCAAGAGATATATTGTAAGATGTGTCA
TGCATGGGAACATTGAGATTGGAAGTGTTAGAGAGGTAAGTCTGCAAACT
GGGTTTCCCGCTACAAGGAGCACCGAGAGGTTAGAGATGCTCGATGAAAA
TGAGCATATCCTAAGTGTCAAGTTTGTTGGTGGTGATCATGTACTAAAGG
TACATTATTAAATTTTGAGACTGCAACATATGCTTAATTTTTATTGTATA
GTATCCGTACAGAGAAGTACATACATTTAAATGATCCACAATAGGTTACA
CCTTGGTGATGAAACATATATATAGGATAATTAGCCGCAATCCTTCATGC
TAAAAAATAGGAGGATTTGGAATATGAAATTGTCATTCTAGTTCTAAACT
CCTATGTTAATAGTAGGAGTAGAACCAATGATATTTCAAGATAACAACTG
TACTTGTTTTTAAAACCTGTCTTTGGCACAATTAATTTTGACACAAAGAA
ATCCCCTCACAAGAATGAATGAGAAAGAACCGGCACCCAATTTTAAATAA
AACAAGCCCTTGACTGATCTCAGCTCACGCATGGGAATAATTGTTAGAAT
ATTATTATACTCGAACATACCATCCTTAAATAAATATTCCTAATAAAATT
GTGCAAACAAACACATAAAAGGTAACCACACTATTCACTGCAAATTTACC
ATCCGGAATTGTTTTCAACAAAAAAATGATATTTATCATTGAAATTCAAC
AACATGTAAATTTAATTTGACTATTGTATTTTACTAGCATATGTTTACAA
ACAAGTTGTAAATTATTTTTATTGAAAGTATTTGTACAAATTTTGGGATA
AGCAAGGTCAAAAATTTATGTGAATGATGTACAATATTCAAAATGATGGT
TAGAAACTAAACATAGCATTAGGATTACTCTAGTTCATATAATACTTTCG
GACCCCCAAGACACCAAAAACATATAGATTTATTGATATTATATCTATAG
TTTTTTCTAGTGATACTAAAATCCCATCTTGTTTTTAATTGTCTAGAACT
ATTCGTCTATTTTGACGGTCCACCCTGAGATAATTGATGGCCATCCTGGG
ACGCTGGTGATCGAGTCATTCGTGGTCGATGTCCCAAAGGAGAACACCAA
AGATGAGATCTGCTACTTTGTGAAGACCTTGCTGAATTGGAATCTTAGGT
CTCTTGCTGAGGTGTCAGAGCAGCGGGTCAATCACCGCACAATAAACTAA
TTTTCTCTTAATAGTTGGTCAATACCGATGAATAAGGTTGATCAACCAAT
GAAACTTCTCTATCCAATTGACAGAGTGCCCAAATTTCATATTTGGAGGT
TCTTAATAAATTAATCCCTCCAATGTAATTGGAGCATTATCTAGTTTGGT
GCTTGCATGCAAAAGTCTTCCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.