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GrainGenes Sequence Report: AA039823

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Sequence
AA039823
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039823
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGGCCTCTCCACCACGGCAGCCGGCACGGAACCTTGGAATGCAGAACAG
CGAGCAAGAGCAACCGGCCAGATCTCCCCTCCCCGACGTCACGTCACCAA
ACAAAAACCATTTCAATTTCAAATTTCTTCGTCCTCTTCCTCTGCCGCAG
CCGCACCCACCCTACCACCAACGCCAAACCCCCACGCGAGCCGGCCCCAA
GCCCGAACCCTAACGGAATCCGCCAATCGCCCCGCCATCTCCCGTCCAGC
TCGGGAGCGCGGATCCGATGGGGTTCGTGGATCCGGCGGCGCCGCTGCTC
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ACGCCGTCAAGTGGAACCACACCAGTCAGTAACCAGCTCCCTCCCCCCAG
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GCGTTTAGATACATACGAATCTAGACAAATGCAAATCTCTTATTTTGGGA
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AGCATTTCTATGCACGTGAATTTGGGCTCTCTTCGTGGTTTCTGGTTCCT
TAGCGATGCAATTCTTATAATAGCTCCTTGTAATGCCTACGTCCTTGAAA
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GCAAGTTATTATCTTTTGAAATCATGTGGCCTTACTTGCAGTGCATCCTT
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TTTATATTTATTTTAGTGCAATGTGTGCTAAGTCACTCTTGAGTCATACA
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TCTCAGATTTATCAAAATTTGGATGAATCTATATACTAAATAGTATCTAG
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AATAACACCTATTCATTTCTTTAATAAACCTGCAGATCTTATCGTGGCAA
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GTGTGTGGTAGTCATTTTGCATAACATTTTATTGGTAATTTATGTAGTAG
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ACGCAACAACCAAACATACACTGATACCTTTGTAGGGAAATTTATGACAG
TGCCACTAGTCTGTTTTAGAATATTGATTGTGCATTGCTTTTTGGCTAAT
TATGAAAATGCCACTCTTCTGCCAGTTATTTATGATTTTGTTGTTGCCTT
CAGTTTTTGGCCATTTCCATCCAAACTTCAGTTAGTCCAGTCTGAAATGA
ACGAATTATCCCTCACTCCACATGGCAATGTCTTCCCTTTCTCACACACT
CTCTTCACTGATGCCATGGTCCCACAGCTTCATCTTACCCTTCACTCTCT
CATGTGCCATGTTTTCTCTGCTGAGGTTCCTACTGAACTAGCTATGCTTC
AGGTCTCCGTTTATATACCGATGAGGAGATCCAAGGAACCCTACGCATGT
GGAAGCAAAAGTACGAAACTTTGAGCAGCTTAGACAAGCCCAGATCATGC
CTCCTTTGAATTAAGTTTCTTTCTCGAATTGCCCCAAGACGAGGAGTACC
TTTGTGGATCAGCTCGAGGTCGGGGTGGCTGGTGTTCTCGCCGGCATGCA
GCCGAGCGACACCTTCCCACCGAGGCACAACCCTGACAAGTAGGCAGTCA
TGGTGTTGGCCTGCGGGCTCAAAACCCGATGCGTTTATTGATGCCAGCAT
CCGGGCCGCAGTCAGCAGGTCGCTGATGCAGTTCTCAGGCAAGTTCGAAG
CCAGCTTCATGGAGTTACAGATGCTCAACCATGAAGAAGGGGCCTACAAG
TCTTTGATCTTTCATCGGGATGAGGGTACTACAAGTCTACAATACCCTTG
TCGGCAGTCATACTACATTGGAGAACCACGCAACTTGAGATCGGAGATTG
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GTGGGACCATGGTGCTATTGGGAGAAAATATGAGGAAGAGAAGACCCTGT
CATGTGGACAGAGGGGCTAATTTAGTCATTTCACACTTGACTAATTGAAT
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GAACAGGACAGACTGCTGGCACTGTCATAATTTTCCCAACTTTAATAGCA
TCGTTTCTGTCTATTATAGCCCACAAGGTAATAACTTTGAAAGTGTGTTT
GCTTCTTTCAACTTCTTTGCCTCTTTGCAAAAAAAGGGCTTATTTTGCTT
TGAAAGACTTCTCTAATGTGAACATATGGCAATGGGGCTTTTATTTATTT
TCACATACCCGTTGACATGTACCAGCTGCCTTTAACTACTAGACTATGGG
CTGACAACATTTTAAATATTTAATTTCCTATTTATAAGCTGTGGCTGAAC
ACAGAAAATTGTATTTTCTTGGCAGGAATCTATATATTCCATTAGTTTTA
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CATCAATCAGCATGAAGGGCGATCTGATTCTTCATAATCTTGCTTCTGGA
GCACGTGCTGCTGAACTTAGCGATCCAAATGGACAGGTATATTGATTGTT
CTATATTTTTTGGGGGGTAAATGACAGTGCCTCATAGTAGGTTATAACTT
TACTGGAATTCTGCAAATTTTGTTTCTGAGTTCTATTGTACTTTTGCTGC
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TTGGCAACAGCAGGAGATGATGGTTCCGTGCATCTTTGGGATACAACTGC
AAGGACTCCAAAGGTACCAATATTGCCTGGTCGCTAGTTAGATTTGACCT
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TTTAGTGCCAAAGTAGAATGCGACATTGATAATAGCAAATTGTATAGGTG
AAAAGTAAAGTTGAGCTTCAGTATTCCTTTGAACTTTGCATTTATGCTTG
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TTAGTGCTAGATACATCCGAATCTAGACAAATTTGAGTCAATTAATATGG
GTCGGAGGGAGTACTTGTATTGTATTTTTTAAGAATAATGAATGTACATT
TCATCCTCAGATTTCTTCACAATCTGTCTCTTTGTGATGATCGTTTTGAT
AGGAAAAAGCTATGCTTTGATGTATCTTCTTCACTGAGATTCCCTTCATT
TTTTTTGGAGAACTTTCGACATGAGCTTCATTCGAAGTTTCAAGTTTGAC
AAATTCATCATAACAAATGCAGATACACCAAGTATATTTGTAGTATTTAG
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GTCCATATTAATGGGCTCAATTTTGTCTAGATACGAATGCATCTAGTCTA
AATAGTTAACTAGATACATACGAATCTTGATAAAGTTGAGGATGTTAATA
TGGACCGGAGGGAGTAGTAAAAATACTTAATCAAGTGGATTATTTAATCT
GAGTGATCTGAGATTTTTTAAGTGGTTTATTTTGTATTGCTAGCAGTTGA
AATTTTGTTAAAATAATTGAGAGAGAACCTTTAATCTACTCATACAATTG
CTGCTTCACATGATTAATATTAAAAATGAGATCAGTTATGTGAACCGTCC
TTTCTGTCTATCTCTTGATGTGCTGGCCAGCTTTACGATTGCGCTTTCTT
TAATGCTTTTCTTGAATTGACCAATGCCTTGTGCAGGTCTCATGGCTGAA
GCAACATTCTGCACCCATAAGCGGCGTTTGTATTTCACCCTCCAGTGATA
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ATTACGAACCAATCTAAATCCTACTATGTGAAACCATATTCCGAGAATAA
ATGGTTCATTCCTTCGAAAACTGAAACCTGCATGTGAAGACAGAACTGTA
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TTCTGACTCTCTTGTATCTAAATCTTAAAACATGCTTTGCAAGTGAATTC
ACGATTTTGTTCTGATCTACTCAGTGTTGCCAATAATTTTAGTAATATTA
ATATATTTTGCAATGAGTTATTGCTTGTACAGAATATTCTGCACTTTGCA
GTCTTTATTGTGTCAACCTGATAAATTCCTATAAACAGTAAACGAACTGA
CATGGTTTTTGATTTATACCTGTCTAACAGGTTACTTATATCTGTTTTTT
TAGTTCTTTAACATTTCAATACATTGTATGTCAGGCTGTGACAAGTTTAT
GCTGGCAACGGTCGAAGCCTGTCATTGTTAAGGAGAACAGTTCTTCAGAA
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ATGATATGGATGTATTTTCTCCACTTGTTGATGTCCAGCCTTTCACGCCA
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TGGAGGGGAATACTGAACCACATCCAATCTCAGACTGGAGATCTAATTCC
ATTTCAAGACAGGTTTCTTGATTTATTTTGGTTTATTGTAGGAAAACCTA
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CTCACGCTTTGGGCAATCGGCCTTTCAAACGGGAAGCTTGGCGTTTGCAG
GTTTACAAGATTCAGCTTCGTCCACCAGTCTCTCAATGAAAGGTTCTCTG
ACAAGTAATATTTTAATGAACTTACAAAACAAGGGCATCTTGAGCAATGT
GCAGTCTTCCCTAGAGACATCATCTGCTAGCCTACAGGTCCCCGTTTCCT
CATCCTTTGTGTCTAAGACTGTGCCATCGGTGAAATCTGATTTGCCCGGA
GCAGCGCAATCCAATTCCTCGTGGAAACCCTCAACATTTACAGATAGATT
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CAAAATCAAAGAAGACTGGAGCAGAAACAAAAGATGAACTGCTCACTAGT
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TACCACTGTTTACTAATGGAGGGCCATACACAATTTTTTAGGGGGTAGTG
CCACCGCAATTGCCAACTTCAGGTTTGTCAGCTGATCAACAGGGAGCTTC
TTCCTTCTCCCTTCAGTATGTTCAGCGCATGCTTGAGGAATCTCTAGGAT
CCGTTCACAAGTCTATACACGAGGATGTGAGAAATCTCCACATTGAACTT
CTAAGACAGTTTCACATGCAGGAGGTAAGAAAATTCTAGGTTTCTTTTTT
GTGTAATTTCTTTGTGGCCTTGTTCTTGTTATCAATTACAAGCACCTGCA
CCTGTATGTCTCGTTATGTTTGAGTTGCCAGAAAATATCGTTTTCTTCAA
CTGTGGTGGTGTATGCTGACATGCTGTCAGTGGAAACCAATGGTTGAATG
GGCTAGCATGCAAACTCTAAATGCTCTAGTGATCATGCAAGGTCACAGAA
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GGCCTTGACAACCGAATATAATTTAAACAGAAGCGATGTTAGTTTATTCT
GAAGGAAATCAATCTTATTTAATCTCCAGTTTAAAGGAAACTAATCTCAA
CTATGAAGTTATTAAGTTAATTTTACTTGGATATCTGCTTCCCTAGCACA
CTTCCTAATGTTCCAGGCTCATGGTATCTAGCTGTATTAGCCCATGTATC
ATCGTCATCATCAACTGTTGGTAAATGCAATTCAAAGCATCAGAGCTCGA
CATGATAACTTGGCAAACACATGCAGATCTTGTAATTATGTCAAAATCCC
TTGTATGTAGTTAGCCAAACATGATCTTACCCACTCGATTGTAGTTAAAG
GACTAATATTTGGAGTTTAGACATAGTTTAGCAAGAGTTGTTAATATGGC
ATGGGTCCTTGACCTAAACTAAATGATACCGTTCATCTGGAAACTTGGCC
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ATGCGAGTGATAAGCTCACTGTTTTTGTTCTACCAGTTGCATTTGGACTA
AACTGCAGGTGGATGTTTTTCTCTCTGAACCCTGAACCGAGTAGTCTTTG
GAGAAATAATGTGCGAGGAAGCATGTTTATGAGGATATATATGAGCCTTG
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CTTGACACAGTTGTTACTGCCAGGCCATGGAAAATTCATTTGAACTTTCC
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TCCTCATGCATTTATTTATACCTTTTTATGCTACTTAAGTTTAATGCCTA
TATTCAACATAATGAGCCCTTTTGCAACAAGCAGATGGAAACGTCTGGCG
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AGTTCTGGTGTTCAATTTGATATCACCGTCCATGGTGGAAGGGTGCAACC
CTCGCCTGGATTCCGAGAATGGCTTGGCTTGGCGACAGTGCGGCGATGAT
TTCTTATATTTGATCTCGTGTTTGTGTAGTTCATTCTTTTTGAGGCAAGT
TTGTCTAGTTCGGCAAACTCAATTGTGACACGGTTGTACATAGCATCTTT
CAGTTTAGAGGCATCTTGTTTATCCTTTGTTTTTATGCTTGCTTGCTTCC
ATATGTCTTGTTTGTATTTAGATGTCCTGATTTTGTTGCCCCATGTGAAA
TGCTAATATAGCAATAGATTTACAGTGCAGTTTTACTCAAATCTTATTTT
GTGTCCCGGGTATGATAACATTCTTATGTGACTTATGTACTAGTTATGTT
ACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.