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GrainGenes Sequence Report: AA038176

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Sequence
AA038176
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038176
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCACATTGTACTGTCACCTTAGTAATTTGGAAGAAGCCAATAACGACATC
CACGTATTTTTTTTCTTATTAGCACCCAAAATGTAAGCTTATTCTCAGGA
AGTATCCAGCAGACAGCTTGTTCTATACTCAGGACAGAAATTAGCGCCCC
TCTAAAGCTGAATACAACCTATATCAGCCACTTACATTACATAGCTTGAC
TAGCATAAACAGAGAAGCCACAAGCATCTACCATACAACCGTAGATTGTG
GAACTACATCACAATCAGAGAACTCAGCAATTTTGGCCATAAAAAGTTAA
AAACACCACAGCTAATTTAACCCGCAACAGTTGAAACAACATGACATCTT
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GAGGATGACGATGGTTCACAGGCATCCTTCTCACTCTCCTCTACATCCAT
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AACAGCTCCCTCTTAGTCTTTTTCTCAGCTCCAGGAGTCTTCAGAACTTT
GCTTTGCTCCACCATCATCATAGTATTCTTCTTCATATCCTCCTGAAATC
CAATATAAAAAGGTTTAGTCCTGATCTGCCAACTAACTATTCTATTCATC
AAGCCAATCTCACTAAAGCAATGCAAGGAAACTATGGTGAAAAACACATA
TCTACAACATTGGTACTGGGCAAAATTCAACAACATATATGCTACATTGT
ACAGAACTGTCCTGCCACACAAAAATTCCCTGTTGATCAGGTGAAGGCAT
TGCAACAACAAAAAATGCTTTCGCGTGAAGAAGTGATTTTTTTACGCTCA
ACAGTAGCACAAAATGTTCGAAAGAATCCATATCGGTAGCCATGGCGACT
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AAGCATACATTGGCCTTGAGCTGGGCGATGATCTTCATGCGGAGCGCGTC
GACGGTGCCGTCGTTCTTGAGCGACTCCAGCACCTCCTCAGGCCGCACCA
CCTTCGACGACGACCCCATCCTCCTCCACTCCCCAAATCGGTAAATCACC
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AATAGCTTCTGGAGAGCGCACAACGGCTACAGCCGGTGATGGGGATCGGC
TCGCCGGAGTTGGCGGGGACGGCGGAGGCTAGGGTTGGGGTTCTTCCGCT
GGGGAGAGGAGAGGAAGACAAGTCTCGTGCCTTTATTAGGACTGGTCTCC
TCTGTGGACAAAATGACGAGAGTACCCCTCCTCCTCCTTCTCCTATCGCC
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CCTCCGCCACCGTAGTGTTCGAGGACGATTGGCTTGCCGTAGTCGACAAG
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TAGTGGCACTGCGAAATCTCAAGAGCTGTTCGTGCTTATGAAATTCAGAT
CTCGTTGCTTTCTGCTTAGTAAAGATATGGGAAAATTTGCTAGAGGACAC
CGTTATTTTTTGGCGTTTGCCAAAACACACCGCTGGAATGTGTCTTTGCT
GAGTACCATTATAATTTCGTGGCACATTTGCCAAGACACACTGCATGCCG
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TTGAACACTTTTTTCTCTAATTCAAATTCACCAAATCCAGCATGTGCATA
TACCGAACATGAATTAGAAACTATACGTAAGTTCACATCAAGTTGGAACA
TCCAGGCCAAGACGCCATCCATTGCAGCATGCAGCATCGTGGTTAAGAAA
AAAATCAACGAGGGAATTGGAAAAAAGCTGGATAGTTTTTTCTATCTGAA
ACATCGTGTATTTCAATTAAAATTCTAGACATATTTGCAACAAGGTAAAA
AGGTAATCTAAAACGTCAAACTTTCCGTTTTGGGCAGTACAGTGTGTTCT
AGCAAATTGTCACGAAATAATAATGGTACTGGGCAAAGTCACATCCAACA
GTGTGTTTTAGCAAACGCCGGAAAATAACAGTGTCCTCTAGCAAATTTTC
TCTAAAGATATTTAAATAGCAATGCCAAAGTATTGCTCCATTACCTGATC
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CTTCTGAATCCTAAGAGCAAATCCTTGGAAATTAGTTATGATTTAGGGAG
CGGCGATGCACAATTTGTCTGTTACAGAGTTTTAGCTTGCTTTTTAAACT
GCGTCCGCCTTTTCTTGTTAATCCTATTACTTCTAGGAGATATGTTGTGG
CTGGTTAAGACTTGGTTCATCTCATTCATAGGATTCGCTCTTTACATGAA
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GATATGCTCCCCTTACTTCCATAAACTGAAATACAATATGGATGTGATGA
ACAGCTGTGTATGTATGCGCGTGACACACTGATGGCAAGGGTTATGGTAG
TGTGTAATGTATGCAAACTAAGCTTGTAGGCTGCCTAGATCTCGCTCTAT
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CGTGTGTGGTAATTTCAAGAACTGTACCTGCTGATGAAATTCAGATTTGA
TTGCTTTCTGTCTTGTTTACTACTGCAGTAATTAGCAATGCCGAGGGTTG
CTCTTTTAACTGGTCAATTTTAAAACATTATAAGTAAAAGTATTGGCAAT
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GTTGGCCGTTTCTTCTAGGATCTCTTGTGGCTGGTTAAGACATGGTTCAT
CTCATTCATAGGATTTGCTCTAATACGAAATCACCTAGAGTTGCCTTTCT
GCAAGTAGAGTTTGTTGGTTAGTATCAATTCACCGGCTATCCTCAGATGA
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TTCTGACTGTGACTGGATGTTCGATTCATCTAGTATGACATAATATATCA
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CCAAAATGTTTTGGAATTAAATTGACCTATGAGGTGAGAAAATTATTTTC
TCAGAGTTACTTCTAGTATTATTTAAGTCTCCTTTTGATTTACTAGTTTC
TTTCTTATTTGGTTGTAGGAGTATTAAAAGATTCCATTGGACTTTGTCCT
GTAGCCATGCATGCACGTGCACGCCTTGGCTGGCTGCACTAGCACGTCGT
TGGTTTTTCTCCCCCTCCGTGCCTTTCTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTTT
CCTCTATCCTTCCTCTCTGAACTGGGCCACACCCAGCCCAATAAGACCCA
TCAGAGCTAGCCCAGCCGAGTAAACACTCGCTCGTCCTCACACAGGAGTT
CCTGCGCAGCATGCACAATGCTGCCCCTCAGAACGCCCAGCCCATTCTTC
CGCGTTGAACCGACTTTTCACTCTGCCAATTAATTCCGAGACCCACCCCC
TCGTTTTCTTTTTTCCCATCACCACCACCTAGAGACCTAGCTCGCACCAC
GTTCTGGTCTCGCGGAGTACCGCCTTAGAGCGCCACCAGACGCGGTGCTC
GTGGCCGGCGACTCCGGCCTTCTCCTGTGCCACCAAGACCACAAGCAGGA
GGAGAACCAGTGCAAGGACCAGCAACTTGAACCGTCGACCACACCAGACA
CAGTTTTGCATCTTATTCATGTTTGTTCGTCTACTTCACCGGACGATTTC
GTCGCACTTGTTGAGCACCACCACAATTCCTTGCACCCATGAGTTACTAT
CGACAAGACCTACCTCCTAGAGACCTAAAAATACTTTTCAGGCTAGTTTG
GTCGTTGGCACATGCACCATGATCTGGTCGCGAACTGAATGCCATCCAAT
GGCATTGGTGTGGCAGACCATCTTCCTTCCTTCCTTAGATCTTGAGGCCA
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TTGTGGTTGAACTAGTTCGATCGTAGTATTGTTCTTTGCTTAAAAATACA
GTGTAGCTACAAAATTAATTTTTAGATGTATTTAATTAGTGTTTATATCC
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GTAGGTGCTCAATTAGCATATTACTTTTATTACAGTGGCTTTGCTAGATG
TTTACTGTCGCTGTTCATGTTACATTGATTAGTTTATGTTCTTTATAACC
TAATTAGGGTGCCTCGTTATTGCATGTGTAGTCTTACTAGTTGTAGTTTA
TTCACTTGTGTAATTGTGCATCTGGATAGCACGTAAGGACAATACTTCGA
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GTAGACTAAGCATATGTAAACTACATGAATAATACTGCATGCTGAATTTC
ACTGAATTCAAATCCCTTTGAATTTGGACTAAATTTATATATGATTTTAA
GTAAATTTGAAAACCATTGGTGATATTTGAAATCTAACTTTGCTACTGGA
TTCCTATAGTTATTTAGAACACTTTCTATGTTGGCCTTGAGATCTAGGGA
CGAGTAGAAGATGGTCTACCACAGCAATGCCATCGGATGGCATTCGTTTT
GTGGCCAGTGACCAAACTACGCCTGAAGAGTATATCTAGGAGGTAGGCCT
TGTCGAGAGTAACTCGTGGGTGCGAGGAATTGTGGGGGCGATCCCGAGTG
CGATGAAATTGTCTGGCTACAGAGACGAACAGAGTTGAAGAAGATGCAAA
ATTCATCTGACTCGTGATCGACGGTTCAGGTTCCTGGTTCCTGGACTGGT
TCTCTTCCTTCTTGCGGTCCTAGTGGCACACTAGTTTGGCCTGAGATGGC
CGGTGGCATATGGCAGTGGTCTGAGCGGCTCTACGCGAGATCGTGGTGCA
AGATAGGGCTTGGGGTGGTGGCGGAGATGGGAAAAAGAAAACGAGGAGGT
TGGGTCTCGGAGTTAATAGTCAGATGGAAAATGGGTTCAACGTGGAAGAA
TCGAAGTCAAGACTTTCCGCGCAGTGGTGATGTGTGAACTCCTCCCGTGC
GAGCTAGCTCTGTTAGGCCTTACCGAGCTGGGTGTGTCCCAGTTCAGAGA
GGAAAGAAAATAAAAGAAGGAAGGTACGAAGGGGAAGGCATGCATGGCTA
CACAACCAAATTCATGAGATTTTTTAATTAAGAGAACCAAAGAAAGAATT
GGTATCAGGAGTCTCAAATAATACTAAAAGTAAGTCTGAGAAAATGTTTT
TTTGGAATTAATATTTACAACTCCAAACGAAATATTTATTTATTTGATCA
CACTGTAACATATTTTGCTTTTAAAAGAAAAAATTCAGCCCATAAAATTA
GGATGTTACACATGATGGCACAACTGAAAAACTTTTGAACCTATTCTCCA
TTTCCCACATGCACGTTAAGTAGTACTATATGACTAGAGCTTACATATAC
CAACAAATGGGAGCCTGAGCAGATGAAGACAAAGAAGGGTTTTCAGAATC
CTGTCATACTCTAAAGATTAAGCTGTGCGTACTTTTGAAATGGGAGGCAG
TTGGCTTTAACCAATTGATTCTCCAAAGAACAACAGAAACAAATAGGTAA
AGGATTAAATTTATCATTCTTCTGTTAAATGTGCATTGCTATACCTGTAT
GTTCTATTTTTTCCCATCTTTGAAATTTTATGTGCGACAGTGCATTCTAG
TAATTCTTGCACAAAATACTAGTCACTCCATGATACCTTCAAAATATTCT
GAGATGATAAAATGAGTTCCCCAACTAGTTAGCAAGTCCTCCTAACATCA
ATTTTTCTTTTGAGCAAGCTTTTGATAGTGATTAACAGGCCAGGAGCCTA
GGAGTTGTAAAAGGCAAATTCGTTTCTTTCATGTTTATATCTGAACCACA
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TCCGTTCCAAAATAAGTGTCTTGACAAAGTTGAGACAAGAACATTATGGT
GTTGTTAAAGTAGCCTTGACAATTTAAAGATGTCACCTCTAACAGAGTTA
TTATTATTGCTGATTTCCTATTTGTTACTAAATGGAACTCCTTTTATGAC
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GATCGTGATACCAGTGGTCTCATGGTCATCACCAAATGCAACAAGGTTGC
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TAGCTCTTTGCATAGGTTACCTACCAGCGTGGGAGAAGATTAAGATATGT
TCTGGTCATGGGCGATCGAAACACGGTGCTTGGCGTGTATACGCTATGTC
TGATGTTGGCCGAACACTGCCAGGGGGTTCTTCTGTAAGGGACATGAGCA
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GGCAGCTGATCACACTTCAAATGTTGATGTGAAGAACAGCACGATTTTGG
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CAGTATCTTGGGTTCCCTATCAAAGGTGATGTGAAGTACGGAGGAGTGAT
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TGTCATTTGTACACCCAGTCACTGGATCCCCCGTCACATTCCGAGCACCT
CTCCCTTTTTGGGCCAATGAAGTTATTTCAACAATGGGATGAAATTCCCT
GGAACTTATTCTGATGTATAACCCTCCAGTTTTACTGAAAGTTTCAGCAA
CATTTAACTGTCAGAAGCACCTCTTACATGTCATTACAGTGAGCAGTATG
GAGTAATCACAGGAAAGGGAATTCCAACAATTGTTTGCTGCTGGATAGTA
GCTTTCTGGGTGAACAATCCTGGACATATGTACTTAACGACTCATGTACA
GTTTTGACTTCATGGTAGCGCGACTGTAAGCATGGGATACATTTTTTCTG
TAGGCGACTTCGCGGTAGCGCCACTGTAAGCATGAGATACATTGAGACGT
GTCACACCCGGAAATTTTAAGAATAAGAAAAATTTAGATTTATGTGAAAA
TTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.