Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA013921

[Submit comment/correction]

Sequence	AA013921
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA013921
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTCTGGCTACGGTTTTCTCTCTCGCTGTGCCACTCTGATTAGATCGAGGC CCCGGCGGGCGCACCAAGAACCCTAGCTAGCAACCCCCAAAATCCTCTCC CTGCCTGCCGGTGCCGCCGATCTCTCGTCACCTGCCTCCAGCGGCAGCCA ACCTCCACTATCCGCACCACCTCCGACCCATCCCTGATAGTTCCTATATA TCTCCTCCATCCATCGTCAGCCGCAGCTGCTCCGTTCCGATCCACCATAT GCCCCCCTTACGCCGCCGCCGTCGACACTCGCCCTCCGTCTCTGTCTCTG TCTCTGTCTCTGTCTCCATCTCCATCTCCAACCCCATGGCGGCACCTGCA GACGTCGTCCCGCCAGCGCCAGGTATGTATACATTCACGCACCTTCTAGG GTTGTTTGGATGATGATGAAGATTAGCGATCGGTTTATAGGAAACGAGTT TTAATAGTAGGATTTTTTAGGAGAATCGGTTTTACTAATTAACTAAAAGG TGATTGCGACCAAGAGTAGCTGGCTCATCTTGGATGACGGCGGTAGTTGG AGCGGCGCCACGAAGGGATCCCCGGCCGGCAGTGCTAGCTGCATCTTCAT TTCTCGGCTGCATCATGCACGCACGCGCCGCCATGTATGCATGTGGTTTT CTGCTCTAGGCGGATACTTTTGGTCATGCATGTATGCCAGTATCACCGGT TGGTTTACAACAAACCGGTTTTACACTTTTAGTAATCCAAACATAGTTTT CCGTGAGCTTATTTTTAACTAAATAAATGTTTTAGTAAAACTGGTTTTCC TAATAATCGGCTCAAAGTTCGTTCTGCTAGGTATCCAAACAACCACGAAA CGAAGTTGTGGTCGCTACGACTCTTTTCTATCTGCTCACCGGTGTGCGTT GGGAGGCCAGACGCTCCTTAATCCAATTTTCTGGCACTATACTTATTTTT CTGCATTTAAACCTCTATGCAAGCGTCTAGCATAGCATGCATGTTGAGAG CAGGGAAAAGGCCAAAGCGATCCAAGCAAAGGTGCTGGTGAGAGTAGCAT ATAACTGCTCTTAGTTTTTCAACTTATCTCCGCCCTTCTTCTTGGCACAT CGTCTATCGCCGTACGTCAGTGAGATGGGCCGTGGCCGTCCATGACACAC CGAATAAGAACCTTGCTTGACTCTGAATTTTTTTCCAATTCCTCTTAAAA AAATTCCAATGCAAGTCGATCAGATGAATCTCGTGCTACTACTTATTATT CAGGCGGTTAATTTGTTTATTTCTGTATGCATGGTAGATATCGCAGGACA GCAAAACGTAAATCTCCCAAGACCTCAAAACATTACCAGCAGTCCACCAC CTACCATGGAAGGCGGCGCAGAAGGTATCTGTGCTCAACAAAATCTCAGC TTTCAAGAGCAGCAAAATCACCAACAAGTAAGATCAGCAAACCCAAGACC TCAAAACGTTACCAGCAGTCCACCACCTACCATGGCAGGCGGCGCAGAAG GTATCTGTGCTCAACAAAATCCCAGCTTTCAAAAACAACGGCAAAATCAC AAACAAGTAAGATCAGCAAACCTTTATATTACTAGCTACACGCTATATTC CACTTCACTAGCTACTCGTGCACTACATATATACATGCATATGTTTAATC TATATATCAACAAGTAACATCAGATTTTCTTGACATGTTTTGGTGGATCA AGAAAACTAGCTTAGAACTTGAAGATACCTCGGCAGACATTATGAAGCTA CTAAAGCACGAAATAGAATCCAAGTTTCTCCAAATAAACGAGAACTTGGC ACACAGTAAAAAAGGAGGCCCTGTTGACGACCAGGTGGCTGATGCAGAGG CCGAGTTTGCTCAATTACAAACGGAATTCAAGGTATGTACCTACCCATAC AACGTTGATTTTACTTACGACCTCCTTCACAGACAGTATATAATATGCGC TTCCTTTTTTTTTTGTCTAACATCACAACAGGAGCTTAACCACCAAATTC AGATTTACACAAAGTCAGCACCAAAGGCCCCATCATCGGTATGTCTTCTT TTGTAAACTTTCTCAGTTCAAAGTCAAACTCCATTTCTGCAATTGGTTGG CATGATGGTTGTCTCTCCACTTTAGCGAGAGATCTTTGAAGTAGGGATAA GCCAATGCCTGATTTATGTATAGGACACTTGTTTTATTCATTATTCGAAC CACAATGTCTAGCAAAAGCCATCACAAAGATCATAGAAACCGGATCCGCC AACTCAACTCTGAATGTTCAATGGCAAGCTAGATAAGAGAAGTATACCTA GATGGCAGCGTTGAGCTTTCTTTTACCTGCGGCAATATTTCTATGACACA CGGCAACTGGTCCACTGCATTTCAAATGGTGGAGGGCATGTACAAACACA TAAAAGTTTGTTTTAGAATAGAGGTCCGATTCCATTACTACAATCTTATA ACGGGTATCAATCATATTTGTTTAACATGTCCAGTTAGAAGGTTACTATT GTGTGATTTATGCATTTCTTCATCTATAATTCAGTTTTGCTCTTACAGAG GCTTCTAGATGTATTAACTTCACAAAATAATATGTTCATGGGTATGCACA TACAGTGCATACGTTAAGAGCAGACGCTAGGCTCATTTTCCTGTCCGTTA GGCCCAAATCCCGTCCGATCCTAGGATTTCCCCTAGCGTCGACGAGAAAC GAAGTTGTGGTTGCTAGGACTATTTTCTATCGGCTCATAGGTGTTTGATT AGCCCTTATAGTTGTCCCTAGCGACCGGACTTAGTGTTGCGTGTTGGAAG CCCAGACGCTTAGCCGTAATCTAATTTTCTGGTATTTATTATTCTACACT TAAATGTCTATGCAAGCGTCTAGCATAGTACATGGCTGTGTGCATCGCTC GATGCAGCCGGGGCTTTGCTCCCCATTTCGAAAAAAAAATTACCTTCTTT AACTTGTTGTTTCCCATCCATTTTCTTTTTGAACTTGTGTGTTCCTTTCA AAGTCATTTATGCATATAAATGAGACATTGTCTGTTTTTATTTGCAGCCA ATATTGTTAACCTGAAGGTAAATTTCTAGTAAATCATAGAGCCTAAGCCA ACTAAAATAATTCAACCACACAACTGCAAGCAATTGTGAGGCTGTTCTAG TGTTGCAAGGATTATTTCCAAAAGTTGGAGTGGCATATTTCCAAGTTTGG TTTTTGTAATGGCATATTTCCAAATGGTGAAAATTGTAATGGCATAAATC CAGTTAACCCTATTTTTTGTGCTCACATGTCAACTTCTAGAGAACTGGCA GTGTCAAGCCACAACAAGTTCAGTTACTGACTTCTACATTTCCTCCTTGC TTACCAATAGAGCAATTAAGCTGATATATATATAATAAGCAAGGTGCTAG AAAATTATACTATAGTTGTTTCTAACAATGCTAAAAATGGGCTTATCGAC ATTCCAAAGTAGAGCATTAAATGGATACTACACAGTAATTGTTTCCCCTG TTGTTGTATTGTACTATAACTGCCAATGTAGTTGTTTCTATACTACACAG TAATGATTGCTCAAATGGATGTTTAATTAGACATGACAAGTTGCTTACAG ACTTCTCCTTAACTTGGATGCTTGCAGCATTGTTATTTTTTCTTTATGAA CCCATTGTATCTTGTTAGGCTTAGGGACTAAGCAGATACAGACATTGTAT CATTAGGAAGTTCTTGTGGTACAAACGTTTAAGATTCTGTACCAGTAATT GTGTATAATGAAGATCTGTTCATTGAACTTACTGATCTTACTGTAACATG CCTCAGCAACTCCACTTCACTGCTGCTTACTTTGTAATCCTGCATTATCA ATTCACAGTGACTTATTGTGATTGATAAATTATTGGCTATTTTTGAAAAA CTACTTATGATCAAAGGGATTATCCTGTAGCCATACTTTCAGTAAAGATC ACTGCTTCAAACATCAGTTATAGTACCAGTGTCTTCCTTTACCACATAAG AATTAGATTAAACCATCTACAGTACCGGGAGAGAGCGCAACGCTTTGGTG ACGGATGGTACTATCGTGAAGCAATAGGAGAGCACAAATTTCCTGAGCTT TCTTAAACATATCGTATCTATTTGTTGATCAATTTCAGTTTGGTCAACTT ATTTCTTGCTACAGTGCAATCTACTTAGCAGTTACTAGCTATGCAGAGCT CTCTCTTTAAGAAGAACGTGCAGCTTTTAAAAGGGAGATATGATCTGTTT CAGCACCCCAAAAAACAGGGGAGGATAAGATTGATGCATTATTCTGAAAG TATTTGGGGATAGTACCCATGGATTTCGCAATGTCATTAACACTGGAAAG TGGAAAGAGGAAAAGGGTACTTCATGTGTTAGCTTCCGAATACAAAAGCT GCTTGTGACAGAAAACAAGCATAAATGTTACTCCTTTTGAAGAAATTTTA TTCCACTGTTTGATGCCAAATGTCTGTACTCAGGAGGGTGGACCTTTTGA TCTTTTAACGGATGCCGATGAGCGCAGAGTTCGTCATGCTCTTGATGGCG GGAATAGGTGTTGCCCTCTTTTACCCTCGTTAAGACATAGTAGGCTGCAA CCACATTTCTGAAGTCTATCTTAATTAGCACTGTCTGAAGTCTGCCTTTT TTCTTCCAGATCTGAGAAGTTATCGGAGCATAAATCTTCAAATATTGTAA TAGAAAGAGAGACCTTGCAGTGCTTGAATGATGGAGGCTTGCTACATAAT GAGGTATTCTATTTTTTGTTTTGCTATATGTTTAGCTGATCTCTCTTTTC GGACTCCAGAGTAAGCATATAGAATTTGACATTAGTATATAACTGTTCCT GATTATTTTCAGGTCATAAATTTGTATCTCCAACTTCTGAAAGAACGGGA ACTGAGAGAGCCTAACAAGTTTCTAAAGTGCCACTTCTTCAATATCTTTT TCTACATGAAGGTCCATTGCTATGTCCAATGACTTGTAACATCATTTTGG CATGGCTCTGCTTTTCCTTGCAATCGTCTTTACTTGAGTCCCTGTAGGGT TGCATTCAAGTATTTCCTTGTGTGGTTGCGTAGTGTTTGCATACTCTGTC CTAATTCTCTTTCTCCAATTTTTGGTTAGCTTGTTTGATTATTGTGTTTT TTTCATTACTAGAATTTTGCACTTGTGTAGGATGGTTTGGTTATTGGTGT AATACCATTCATTAAAATGGCTCCTTATTCATAGTGTAAACTGATCTCAT TGCATTTTCTGGCAGGAAATTATCGATATTGATGCATCATACCTAGCTCA CTTTATCACTAAACATAACTCATAATAGGTTGTTTATGCCACGAGAACAA TTTAGTCAACCTCATAATTTTTTTCACGTTTCTGTTAACAGCTGATTGGT GGGAATGGTGGGTATGATTATGAGGCCGTTAGGAAATGGACAGAAAAAAA GAAGTTAGGGTACAACATAATTGATTGTGATAAGGTAAATGCTCTCATGG TCCATATTTTTCAAGATTTAATCGTCATGTGATTTGACTACCCTTCTAAC TGGAACTAGTTACCATGTCCAGATTTTTGTTCCCATACACAAGAAATTCA TACACAAGGAATCCCATTGGTGTTTAGCGGTCATCAACATAAGGGACAAA AAGTTCCAATATCTGGATTCAATTGACAACGAGGATATGAAAGCCCTGGA AATCTTAGTAAGTGATATCTCCCTCCTTCCCTAAGCTGTTTTTTCCTTTA TTTTCTGTTCAGGACATCAGCCTAACGTTAGCTTTTTCCACCTCTACTAC CAGGCTATGTATCTTGTGGATGAGGTAAAATACAAAAATAACAAGCAGAT CGATGTTCTTTCATGGGAGCACGAAGTAGTCAAAGAACGTCCTTCCCAGG ATAATAAGTATTTCCCTTATCTTTGGCAATAAAGTGCTTTCATGGTTTTT CTGCTTGAACTTATATATATACAGTAGTATAAAGATAGGTTTTTCATGAC ATGCTCCTCGATGTTAGAGAAAATTATAATTTCCCACGTACTGTATTAGT ATTTGATGAGGTGTTTGTTTTCTTAGAACAGACTGTGGCATGTTCATGCT CAAATACATTGACTTCTACAGCAGAGATATGGATCTTATTTTTGAACAGG TACTAATGAGCTCTGCTTTACCTTTTCATTATTACATGCTAAAATAATAA ACTAAAGTGGTGTTTTGAATGTGTTATCTTTTCATAGAAACACATGCCTT ATTTCCGTAGGAGGACTGCCAAGGAAATATTGGATTTGAGGGCTGGATAA GTAAGAAGGCGCAGCAAGCGATTCCGAGGCGGGAAGGCGTGGCCAGACGT GGTTTTTGTCTGGCTACTAGACTTCAGAGCCACTGAGCTTTGGGACGGAT ATGTTTGGAACTCCTGTTTAATGGTTTGGGGTGTAGACCTTGAGTAGTAT GCGATCACATTTCAGCGTCAAGTTACAAAGCCTGTGTTTGTATGACCTGC CACCCTTTGGTCGCTTTGTGCTCTGGTTCTTCGTCTCACTAGCTACTAGA AATCCGTAGTTTATTTAGAGCCATGTACCCTAGGTGAAATGCAAAAAACC ATATAGGTAAAGCATTTATTTACCTAGGGGGGAGACGCTAGGTAAAGAAA TTGAGTCAGGTGAAGATTCCAGCGTCATAAAAGTGTTTATACATCAGGCA GG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.