Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA012441

[Submit comment/correction]

Sequence	AA012441
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA012441
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTCCTACCCCAAGGTCATCACCATCCTTCTCCCTCAACAGAGCCGGTGAC TTGAGAATTGAGTGTAGCGACGGCGCTGACTTGCCTCGGTTCTTGCTCCG AGAGTTCGCGACCTTGATCCCACGTATCCCGGTGTGATCGATGGATCAGC GGCTCCAGAAAGGGTGTCATGTCCCCGGCGACGCCCCTACCTTGTCGTCA GAAGAAGAAACCAAGGAGACGCCGGTTAGCTCATTCAAGTAATCTATCTC CCTTAACTTTCTCTAGCTTGCTCCATTTTGCAAACGAGTATTTGTACTAC CGGTCCACCATGCCTTCATGCTAGTGGAAGATTGTATACATAGTTGAAGG TTTGGTTCAGTTCCTCTACTAGTATATATTGAGGAACCTGCCACCATCAA GCCATCTCCAAATCTCAAAATTGTTCGGATTCAGAATCTTCAGTTCGCAT TTAATTGCCATTTAATTGCCGCAGAATTAGGGATGAATGGTTTGACTTGT TAACACAGCCTAAGAGTAGCAGTCCTGCATTCATGTATGCTAGCAGCTGA ATTGAGAAAAAATTGAGCTATAACATGTCGTGTACTGGTGCGACTGGTTT GCACATTTTCACCAGCATGGATGCAATTCAGCCTTTGGATTAGCTAGTAG CCATTTTTCTCTCTAGTTCATTTGTTAGTCCTGTTTCGGAGATCATGAGA TAGACTTATACTTCTGCTTTATATTGTTTTACTGGCTATGTGCACTATAC AAATGATCAGATTTTAAATATTCATTGTATCATCTTTATGTTAAACAAAC CACTTTCACTTGTATACACACACGTCCATTACTAGAGAAATTTTTGAAAG GTACCCATATGAAAAACTGATGGATGCGACACATAATCCACATGGCTAAA GTGTTTCAGAGAATGCAACTTACATATTTATTATGCGGCTCAAACGACAA TGCTAGTGCATTAAATTATGCTCTTTCAGTATTCTCGTCCCAGTCGATAT GGTGTTGACCATATGTGCAAACATGTAAAAGTAATATACTTATTTTTTAC TCCGAAAATACTTTTACATAATAAGAATTTTATTCCATTGTTCCCTAGTA AAGCTTTTAACTTAATTCTATAACTATACTGTAGTACTACTCCCATTATT TCTGAATATAAAATGTTTTGGTAAGTCAAATTGACATGCGAAGTCATGTT AAATTTAGAAGTGGATGGAGTATTATACAATATCTGTCGAAATTCATAAA CTACAGATGTGTCCTGAGGTACATCTAGCCCTTTTCTGAAATTTTTGAAA ACAGCATTTTGAAGTTTCAAAAAAATCTAAAAGAATTTCAGATTTACAAA GCGATGCATCCTATCCGCGTGGAAAATATCAACTATAATTATAGTGTATT TTAGGATGTGCAAAAATAACAGAACTAACACATTTTGGAGGTTTGAAAGG TTGGAATGATCACTACTTCAAATTCTTTTTTAGAAGAACTACTTCAAATT CTCACTTTCGTCATTTTGCACAGTCTAGAATAAAATACATTATGAGTTGA AATTTTGCATGTTGATAGAATATATAATTTTATAAGGCTAGGACTTAAAA GAACTTTCAAATGGCATTTTCAAAAAAATCATCAGAAAGGGCTAGATGTT GCTTGGGCTAATTTTAGCGCACTCGGTCGGAAGTTAGACTTCATAATTAT TTCGCGAATGTTATTTTTGCGAATCAGTTTGCGAACTTATATGCACTGCA GGTAGTATTAACCTTTTCGGATACGGTCCACTATGTGGATGTAATTGTTA TGCATGCAGCTTGGACTTGGCTGATGGTTTTCCCCGTGAAGATGAAATTA CCAAGGAAACTAGTGTGATGCCGATAACTTCAGCAAACGGAGGCCTCGAC ATTCAGAGTTATTCTCCGGTCACACAATTACCAGATTATCCTAGGTAGTA TTGATGCTTCTCCTCTAAAATACAAACTTCTGAAAATAAAGATTGATTTT CAAGACAAATAACTACCCATTTGTAAATAAAGTGCCCGTTTTAGTGCGTA TTTCTTATGAAATAGCCTATGATGATCTTTAAAACAGGAAGCTTATGGTA CCTTTCTCAATACTACTACTACTCAGGAAGAGAATTGTCGTATCTATACT TTTTATAAAGCAAAACCTCACTAACTGCAATTAGCATTAGTCTATCTCTA TATGCAAGCAATCCCCATCATCTACTTTATTAGTCATCCCACTAATATGT ATGAAGAATAATGTTTTTATATATGCAAGATATCCATGTCACCTCATCTA ATTATTCACATCACTAATTTATATCTATCTAATATACAACAATTTCATGT CAATTAAACTTAGCATCCCGACTACTTTTTATCAAATGAATCTTGAATAT TTTAGAGAAAAATCGATATTTAATGCATATTATACCATTTCATTTATACA ATAGAATTCCTTAAAAGATGTCCGCTGCAACGCGTAGAGTATCCCTTCTA GCTAAAATAAATGCTACAACCAATGCCCTTCTCCTCTACAAGAAGAATGT AATTAACCTCCTGGGTATTATGCATGCAGCTCGGACTCCGCTGATGGTAT TCCACGTGAAGATGAATATGTCAAAAATTCAACAAATGCAGTCCTTGATA TTCGTAGCCGTTCTCCTGTCATGCATTCACATAAATATACCAGGTATTTA ATCCATCTCACACTCTTAGTTCCAACATTATTTTGCGGAGAAAGATCGAT TTTGTAGACGTATAACAGCCCATTAAAAAATACAAGTTTCTGTTCTTTTT ATTTCAATAAAATCATATATGATATTTATTCTCGCCTTCCTAGATGGCGT GTGAAAAATTAGTATCACCACATGCGTAGTTCAAGAAATTTCCAGCATAT CCACCATGATGTTGAAAATCATTAAAGGGAGTGGATCCCGTTGTATCAAT CCTTTGATAGTTTGGAAATAATGGATGGTGTTATCATTAATCCTTAATCC CACAGTATCTTCATGAAGAGACGTTAATCCCACGGTATCTTCATGAACAG ACGTCGTGGGACCTATTCCTACCATTAATGTGCAAATCCTTTTCTTACAA AGCCTTCTGCAAAAAAAGTCCATATAATTTTAACGTAAGACTGCTCAAAG TCTATGTTAAACATAACACCAAGAAGTTTCTAGATAGTTTCACTTTATGG GCTACCCTAGTAGTTTGATTTATACCCACCTTTATAAATAGTTTAAATCT TATGTTTAATAGGCAAATATACCGATACTGTTGAAATTTGAGCATCGGTA ACGTTTTATTTTGGTAGTAAATTTATAAAACCAAATTTAATATTCAACTG AGGCACTTCTCTTGCTTGCCTTTGAACAAACATATCCATTAAGTCATTCT TAATGACTTCCAAAAAGGTTTGGTAGACCTTTGTATGGAACTCGACTGGT TTCATAGCTTTATTATGCTCCATCTGAGAGATAGTTTCATGTGGTTACTT TTTGGTGAAGTCAAAAATTAGAATGATATTCTCCTCTGGAGATATATAAG TGAGGTATATCATCAATAAGATCCTCAACCATTAAGAAATTGTTCTTGAC TTTTGATCCAAACAATCTCTTATAAATTTAGTTATATACCCCTTTAGGTA TTCCTCACACATAGTTGCCCTCTCATCTTGTTCAAGCTGACAAATCTTTT TATTGCGGTGTTTGTCATTTGCTATTAGGTTAAAATACTTAGTATTATTT ATCCATTCCTCTACATATTTCCCTTTGGTGTGTTGACACCACTTAGTCTC TTTTTCGTGTTGAACTTTAGACAAATGCTCGTTACCATCCTTTTAAGGTA TCCCGCCCGGGTACATTTGGAGTAGTAGTTTTGGCTTTACTATCAAGTCC ATCAATCTTAAGGGCATGTACAATGGTAGAGAAGATACGTCTTTCTAGAC TAGTCACAATAGGGAGTATTATATAGTAGTATCATGCATATGATACTAGT GTATAATATCATCTCCGCAATGCATAACATCATGTAGTAATACCATAGTA TCAGTGTATTTATTGTTTTGTAGGATCTCATTGTAAAATTTGTGTACGAG ATTTATCTGGCATTAGTTTTTCTAGTTATATGTGTTATGATACCGTATCT ACCTATGATACCAATACAATTTCTTTCACCATTAATTGTAGTGACACATA AGCATTTTGTATGCATGTGGTGCATGATACCACCTACGATACCTCCATTG GGGCTAGTCTTAGCCATCCACATCATCTAGAATAGGAAATAGATATTTGT TCCACAATGCATTAACTCTTGTTATCATTCCTAGCAATTAATAAGAATTA TTTAATTTTTAGAAGTAAATCATATTGCTAAGGCTGGTCATAGTGAGGAG TAACTTAGAGTAGTAACATGCACATGTTACTAGTCTAAGTTACTACCTTC ATAGTAGAAAATAACTTAGGTGTGATAACATGCAATGCCATATTAATTAG GTTATAGACACACTTTGTCTTGGTATGTGTGATGTTACATTAACATAGCT AGTTACTCAATCCATCTCTCTCTTCATTAAATCATTGACACATAAGCAAA AATGCTGACTTGAACTCTTAGTTACTAGTGAAGTTACCCCCACTATGACC AGCCTAAGGGAATACATGTGGTAAAATGGAGAAAATAACCTTCCCTTATT TCATAAGAGATCGTTCCTTAGCTAAGGAAATACATCTTTCTCTTTCATCA TTCTCTCTCCTCCAACTACAAAAAATACGAAGTGCCAACTCTAAGAGAAG GACAACGTCAGCTCATTGTACATGCCATAAGAACATGTCTTTCTTTATTC TTTCTTATATATACCACTTCGAGTTCGAGCCCACCTTGTGAGAAAGAACC TAAGATACCGAATTGTGTTTCCCATCTCTCAGTTTTGGTTGTACAAGTCA TGATAAAATTCCATTTAGCTACAATTAATTTGTATAAACCATCATAGCTT AACCAATTGGTTCAAACGAAAACAAAAGCTTTACTACCAAGGTCAACCTG ACCACCTGAATCAATTACTAATGAAGTATGATCTTACCCCGATTGAATTT TTCCCATTCCACACTAGGTAGTACTAGGTCTCGCTTCTCGTATGGGGTTT CTTTGCGACTGGCCCAAGTGATATTCTACATGAGAGAACTTTTTATTTCA AGTCTATACTTTCAATAATTGCATTACAAACTAAATGCAACTTCACATTA AATTTGTTATCATTATTCTTTTCATCTAGAAGGTGAAGGGTATTAATGTC GTCTCCTACCAACATAGGAAGTGATTCAGTTTCGCACATTTGAACCAACA TGGTGAGAAATCCTCTACATTGTGAGATGCACAGAGCCACCATTTATCAA ATAGCATGTCAACACAATGCTTAAGAGAAATTCAACACCATTTATATAAG GCTTTGTTTGTCATTGCCAGGATTGTCATAATTCCGTTATGCCCACTTCT GTACGCATGTTTTCGAGAAAATGATTATAAATAATCACACCATATAGCAG CTGAACAATCGTAAACTAAGTTATCTACATAGTAATGTATATGCTACTCC CTATGTTTACAATTATAAGATGTTTTTTTTTTGAAGCCCAAGTATCTAGA CGCGTTTTATATAGTATGTAGGTTCACTCATTTTGGTCCGTACATATTCA CATTGAAATATCTAAAACAACTTATAATTATTAATCGAGGGAATAGTAGG TGAGAAAGATAATATTTTTTCTGTATATTTGCACAGTTGAGTGTGGCAGA ATTTTTTTAGAACATCTAAGACACACAATAAGTTATCTGGTAAACGGATG AGTTTATTTTTCGTCTGACTATAACTTTATTTGAAGGTACTATGCAGAGT CCAGAGGGCCTCTTGTGGCCCCACAGTTAATTCGTCCTTTTTTCTTTCAT TTTCCTTTTTTGCTCGATTCTCTTAAATTCCTTTGTGTCTGGACTTGCAC ATCAGAGCTAGCTAATTGGGTGTATCACTTGGGCAGGGGAGGTCCCAACA GTGTTACCACCCTTATGCTGGGATCTGCAGGCAATACCACCGGCAAAGAC CACCCGTTATGCTGGGTTCTGGACTCAGGGGCGACCAATCATGCCACTGG TAATAGGAAACTTATCTTTCAGATGACCACGGACAAAGCAGGAATTCAGT TTAAGTCGGCCAACGGGGGTTACTTGTGGTCACATGGATGCGGACACGTG ATCACTGAGCAGTACACATTGGCCGACGTCCACTACGTCCCAGGTTTGGA CACCAACATCGTGTCCGTGTCCGAACTAAATGATATGGACTACAATTTGG AGTTCACGCGCAACGGATGTATTATCAAGGACGGCCGCACCAATAATCTA GTTGGCAAAGCTATTCGGGGCGTCTCGGGCCTGTTCGAGCTCGATTCCCT CCGAATCCCCCTGGAGCGAACTTAGATCTGAGAGACAGAAGAAAACCAAT TAATTGGGTGTTTCATCTCCAGAGAGAAACACCCAATTGTGTTCCGACGC CTGGAATAAAAATACACACTGCTGAAACTTTTGGATGCGTGAAATTTCGG AAAACATTGATTCCGTCTTGGGGTTTACTCAACCCCTGTATTTATTTCTC CTTCGATCGCTCAGTACTTTTGCCTGTACCCGAATGTTTGCATCTCTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.