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GrainGenes Sequence Report: AA012173

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Sequence
AA012173
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012173
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TATGGTCAGTTGCCAATACAAGTCGCGGCATGTCTTGGTACACGCGAAGA
TGTTGAGATCCTGTTTGAAGTTACTTCTCGTATTCCAGCTAAACATGAAT
GGAGCGTTGATGGAATAATTAGTTATGTAAAGTCACAGCCAAAGTTAGAG
GTATGATCAAGAACATCCTTGGCACATGAGAATATATATTTACTTATGTA
CCGTAGTCCCAAGTAATTTTGAAAACTGTATAGGCATGAAACTCTATATT
CATCTCTCATATTGTAAAGACTGTTGATCTTGTATTTTTCGTTAATTCTG
TTTTGACACTTTTGAACTATCAAACTTCTTATTTTGACACTAGATGACAT
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GAGACCATGGTGAATCATGATCACTGTTTTCATCACAGTGGTTTTAGTTT
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ATGCTGTTCTTTGTTTGGTACTAAGTATTTGTCATTCATTTACTTCCGAC
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GGGAAATGGAGAGAGTGCTTTAAACGATGCCCATCATTGCAGGACAATGC
GACCTGACTGTGCAGATTCATGCTGGCTGCAGGGGTACTCACATTTGCTA
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GAAAAGGCATGCGATGCATTTCTTGATGGTCTCAAATTGAAGCCATGTTT
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AATTATCCAGCCTGCCATCCATGAATCCCAAAGTACCGTTTCGACCAGAT
GCGAGCTCCAGCCTGCGCCAGTCCACGGGTTGGCTCGACACTTGTGGTGC
CGTTAGTAACTTTTATGCTTTCGATAATTATCTTGAACATAAATGCAAGG
CCTGACCCAGCAAGTCATGGCCCACGGTGAGCGTGCTTGGTTTAATTATG
AAACATCATAGGAAGGCTCACACCATCTTAATTCGTAAGTCGCCGGCTGG
AAGCCGAATGATGCCCTGTGCCTCTGTGTGACAGATGCAGCTCGGGCTTT
TTAGTAGTCCCATATTGCAAAATTAGTGAAAAAGCTCGGGCTTTTTAGTA
GTCCCATATTGCAAAATTAGTGAAAAAGCTCGGGCTTTTTAGTAGTCCCA
TATTGCAAAATTAGTGAAAAAACAACCACCTTAAATAGAACCCCCCTCTC
TCAAGTTACAAGCAAGTTGCATATAGGAGGGTGCAGCGCATGGATGCTTA
TGAAAAACGAGCGTTAACTAAAAATTCCGGTTGGTGAGCACCAAAGATGG
ATCCATGCCATAGCAGAAGCGTGCATTGGAAGTGGAACTCACATGTTCTA
GCTGCGAGATGGAAAATAACCTAAATGATGGGCAACTGGGCATGGACACG
AAATTTGGAACACGGGAGGGGAAGCTAGCCGGCTGGGCGGCCTCGGTTTG
AAGCTTGGAGAGGCTAGGACCATGGTGTGATTGGCCTGCTCGAGCCAAAA
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GCAAAATGTTAGTCGTTCCTGAGTTCGTCATCCAAAAGTTGACTTTTTTC
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TATTATCTAGCCCGTAGTTGTTTTTCTTGGATCAATCCTGTCCACCGGAT
TAGCTTTGGACGCCAGATAGAGAGGTTAATTTGCAGCTTGACAGCGACTG
GATCCGGCTACCGTCCTTTCCACTCTTCTTCTCCACTCCGACCAAACCCT
CCCGCTTCTCCGCTTCAAACCCTCACCAACTAGCTCCCACCCCGCCGCCA
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TCTCCCTCCGCCGCCCCAAACCCTAACAGCAACTCACTCGGCCGGCTCCG
CCTCTACCTGCAGCTGACGGGACGCCGGAGTTGCAGCTCCTCGGCGCGGC
GATCTCGGGCGACCTCGCCCACCTCGAGCGTACGATTCCGCCCCTCCTCC
ACCTCTCCTCGTTCTTGCGTGGTGTGAGCCAGCCCTGATTTCCTTTCTTG
TACGCCGTATTTGATTTTGGGGGCCGATCGACCCGTACCGTACGTACGCG
CAGGGATGGCGATGCAGCTCGATGGTGGCCGCGGCCGGCTCGCGGAGGCA
GTGGAAGCCGTAAAAGACCACGGCGCTGGGGCGCTGCACCTCGCCGCCGC
GGGCAACAGGGCGGAAGTGTGCGAGTACCTGGTCGAGGACGTCCGGGTGA
ATGTGGATGCCGTTGACACAGGCGGTCTGTGTCTGCTCCCTCATTTTTCT
AACATAGAAAGTCTGGATCTATGCATATAAAACTTCATTTGTTTGTTCTG
GTGTTGTAAATGTATAATCTTCCTCTCGTTCTTGACAGGTAGAACACCTC
TGGTTTATGCAATTACTTGTCGAGGTGGGCACGTGGATATTGTCAAGTAT
CTGCTTGATCAGGGTGCCAATCCAGATAATGTCGACATACAAGGGTTTAC
TCCCCTCCACGAGGCTGCCAAAAAAGGTAGTAATTTTCTCTGTGCTAATA
GAGTAGAAAATACGAATGATATTTTTTTTTGGCATAGAACAATGCCACAA
ATTGTTCATCTGTTCAGAGCCTTTTGTGCGTAATGCATACCCATGCATGT
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GAGTCAAAAGATCTGAAGTGTAGCATAGAGGAATCGCTTCTCCCTCCGAT
CCATATTAGTTGTCGCTGATTCTGTACAAAGTTGTACTCAAACAGCTAAA
ACTAATATGGGCCGGAGGGAGTAATAAAAAAGACTTGTCATTATTTAGTT
ATATTTAGTGGATGAAGTGATACATAAGGGATTGCAATTATGGGAGATAG
ATTTATACTTGTGCTAATAGAGTAGAAAATATGTCTAAATATATATTCTT
TGGCATTGAACAATGTCACAAATTGTTCATATGTGCACAGCCCATTTTGT
GCCGTAATGCACACCCATGCACGTAGTGGTCTATGGCTTTGTAGAATTGA
TTCGTGTTACTACTCAATTGTTACGAGTCAAAAGAACTGTAGTGGAGCAT
AGAAAAATGGCTTATAAAAATAATTGTCAGCTATTTATAATTATATTTAC
ATTCCGAACGTCTGATTCAGGGCACTGTGAAATAGTAGAACTCTTGCTCT
CCAGAGGCGCTTATGTCGATCCATTTTCTACTAATCATGGAACACCGTTG
CATGTTGCCACTGAACATAAGCAGGATGGTGCCATGAAGATTTTGTTGGA
TCACCATGCAGATGTAAGTCCCATTATACGTTTTTTTATAGTTTACTCAC
AGTTGGATTTGATAGTCTTGGGCTTTCTACTTTCTCCATTTCTCACAGTT
GTATTTTGCTGTTTTGTCTCTGGAATCTGGAGAAGTAGACATAGTTATGA
ACATTTGGAAATTAGATTAACATTCTCCTTTACTCATTAATTAGAACAAT
CATGTCCCGTCAAATTTTTAAGTGGTGTTGAAAAAGTAGTTGCACTGTAC
ATGCTGTTCTGCAGTAAGCAGAGAGTCATGGACTCTTTCTATGAATTATA
TGTTTCTTGTGTACACATCGTTTCACCTTCTAAGGTTGAAAAAGATTATC
ATGTAGCACATTCAATAGATAGACCTCCACTAAAGTGTCATTTCCATTGA
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GTGGATTGCTTGACAAGAAGTAGCCTAATAATTTCCTAGGGCCTGTTCGA
TAGGTTTTTCCTTTTTTTTTGAATTAATAAAAGGTAGAGGATGGCTCTAC
CTTATAGTTACAGACTCAGCCAAGCGGCTGCAAAAAGAAAAAACAGCGAC
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GCTATTAGTCAGAAAGCTTGGCCACCCAAAGCAGAAGCTCATGTTGTAAT
CTTGGTGTTCTGACAGACCAAAGCTTTATATCCTCTGCCACCTGCTGTAG
GAAAATCCTCCTGCTGCTCTGTTTATCATTGAAGACTCGATCGTTCCTTC
TCTTCCATAGGTTCCAAATTCCTGCCGCGAAGCATACCGGCCAGGTTTTT
CCTTTTTACAAGTTAATAAAATTTGTAACACAAGAATCACTTCAGATACA
CCTGTAATGAAGATAGATCTTAAGCATTTTAGTTAGGAATGTGATATTCA
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TAGAGTTTTAAGTCCCACAAACTGATAACAATGGTTTAAAAGAATGATCA
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CTTGCTTGTCGGTGTTGCTACAGTCATGCTAAAATAATGAAATGTTGGAG
ATGATTAGAGTCAGTACAATGATCCGTGGAGCTGATGAGAAGCATCAAGG
GAATTAGAGAACAAGGAGGTGCAACATGTGCGAACATCAATACAAAAAGG
GGAACAGAGGCATACATGTCGTGCGAATTATGGGGTTGGGGGACACATTG
AGTAGTAGAGGTTGAACTTGTATGGGAAATTGGGAATGGGAGGTGGACAT
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GTACCCAAGCACAACTGTTAAGGTCACCATTTTTGTATTTATTCTCGGGC
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TTATCTTTATATCTATTTTTTTGGTTTTCATAAGGATTTGAAGACGAATA
GTTGAGAACTGACTAGTGACGCACTGAATACTCCACTACCAAAATATTGT
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ATATGTATTTTTTATTTATGTATCTGATATTTGTAATTAATCTGGTGAGC
TAATTACTTGCTTCTCTTTGTTAGTGCAACAAGATTCTAAAAGATTTCTG
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ATGCATGGTATGATCCCCTTGCAAGTTGCCGTAGCAACTGGCCTAACTGA
CGTCTTGAAGCCCCTATTGGATGCTGGTGCAGATCCCAATGTTCGAAATG
ATGTATGTTTTGTCTTCTACCGATGTATATTTTATTCACATCGTGGTTGG
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TAAATAACTAAGCATTGTCCATCCTTCAACTTTGGTAATACGAGTCCCAC
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TTGTCCGGTGTAATTGAAGATCAATCTTTTGAAGCGATAACATATCGAAA
ATTCTTAAAATTACTACAATTTTCAAAGAAATAATTTTGGTTGATTTATC
TTGCCAATTTTAAATGCATTTTCTCTTGTAATTTGAATTTGTGATATGGG
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CTCTCCTACAAATACATTGATGAGATTTAGCTTTATCTTTTTCTTAACAG
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CCGTAGTCCCAAGTAATTTTGAAAACTGTATAGGCATGAAAACTCTATAT
TCATCTCTCATACTGTAAAGACTGTTGATCTTGTATTTTTCATTAATTCT
GTTTTGACACTTTTGAACTATCAAACTTCTTATTTTGACACTAGATGACA
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CATGAAGAAAAAATAAGAAAGCAAAGATAGATACAGTGAGATCCCATGGG
GCGTGTCAGAGTATGACAAATGTAACCGTGCAACTGAGCTTGGGGGGTTT
GGGGTTAATGTGGTACCTGAATTTCAGCTTGTTTACGGTAAGTCAGTAAC
ATGCAACCGTACCAAATCAGTGAAATTATAACACTTAAATATGAATATAT
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CGGTTAATTTTGATTTGACTTTTCAGGATCTCCCTTTGTCTAAAATGTCA
AGAGCTAAGTTGAAAGAAGAAGGACACAAAGCTTTGCATGAAGGGGATTA
CAATGCTGCATTAGAATTCTATACTATGGTATCTATTGCACCTTTTGTGG
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GAGTTATGGCTTAATGGTGCCCTTGTTAGTGCTAGCACAGATAAACCTGC
AAGCCAACACAATGGAGTTGCTTTTGAGCGTGTCATCGCTGCAGTGTTGT
TCATATTGATATCACCGAGCAGTCTCACCTTCACAGTGGCCCTGATAGCA
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TGAGCATTGGGTGCATGACTGGTCGCTTCAGTGCTAATATGAGTATCACC
ATGTCTGGAAACCTTCTTAGCATATTTTCTTAAATAAAGCGGCCCTTCAT
TGAGACCATGGTGAATCATGATCACTGTTTTCATCACAGTGGTTTTAGTT
TGGGAATTGTGTGGTGTTGGGCTTTGTGATTTATCTCGCCATTCATGTTA
TATGCTGTTCTTTGTTTGGTACTAAGTATTTGTCATTCATTTACTTCCGA
CTCTTTGTCCTAGAAATGTGAGGATTGTATACATGTTTGTTAGAAAATAT
GTAATTAATCATTTGATTTATTGGCTGTAGGCTATGGTTGTTGATCCTGA
ACACGTTGATTCAAACTTGGTCGGCACTAGGGGTTTTGCCCGTCTTCTAC
TGGGAAATGGAGAGGGTGCTTTAAACGATGCCCATCATTGCAGGACAATG
CGACCTGACTGTGCAGATTCATGCTGGCTGCAGGGGTACTCACATTTGCT
ACTAAAGGTGATACAGAATCAAGATTTGGCACTTGTTCAAATCTTGCGGC
TAAACCATTTTGGCAATCCTCTCAAATCTATCTCTTCATTCTTAGGAGTA
TGAAAAGGCATGCGATGCATTTCTTGATGGTCTCAAATTGAAGCCATGTT
TAGTTGGAATCGAGAAGGGGTTAAGGTAGTCTACTTGATCTACTTTAGCT
GCATGCTTTATTTAAAGTCCAGTTTGTTGTGATATATATAGTACTATTTA
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CGTCGAAACTGTACAGAGGCTAACAAATAAATGGACTTGTTTTACAAAAA
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TTCTATGGAAAAGCATTCAGATGCTTTGCTGATCTGTATTTTCTGGAACA
TGCAGGCAAGCTCTGAACTTATTGAAAGTGTCTCGTGCCGACAAGGACGG
CTCAGAAAGGCTACGTCTTGAAACACGTGTTTTCCTTCCAAGAGAGCAAA
GTCTGAGACATCAACTCTTTTGACAAAATAGCCTGCTGCGTGCGTGCGCG
CTGAAGAGCGTGGCGCTTGATGCCCTGTTGAGTATTGAACTGTAGGTTCA
TTTCTTGTTTGCGGCTGCAACCCTGAACATTTTGCTGGTCATGGGTACTG
ACTGCGCTGGGTGCTAGAAAGTAGAAACTGTTGCTAATATTTATCTTTAA
CCATGTGATTGGTGTGTAGCACTCTGTGGTGACATGGTTGCGATGATTCA
GCCTAGATTTGAACACTGACTTCAAGTCATACGCTGCTGATGGTTGCATG
TTTAATTTCCTCCCGAAAAGATCTGCGTGCCTCCGTTTTTGGCGGGATGT
TTAATATTTATCTTTTAGGCGAATTGATGCTCTCCAGAAACATGCCCTTT
GAGAAATACGAAAGTAACACTGAATTCTGAAATAAAAAAATTCAAATTTG
TTTTAGTAGAATTATTGTGAATCCATTCCAATTAAATATTGAATAAAATC
CTTCGATTCAAAGTTCTGTAATCCTATTATGGGATTTGAGTCATGTCACA
TTGAAATTCTTTTGAGGACTAAGATTGATGTTGATGTGTTCAGTTTGGGT
GGATTCGGCGCTCACGAGGATGTCACTGCTGCAAGCAGAAAGGTTTGAAA
AAGGTTTCCTAAATTTTCTGATAGCAATAGTTCGTGCTGAGCTCGATCTG
AAGAAGGGAAATGGGGACTATCAGGGAGACATGACATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.