Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA010392

[Submit comment/correction]

Sequence
AA010392
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA010392
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCATATTAATCTTCTTCCAAATTCGATACTTCCGAAGTCATTAATAGCA
CAGAAACTACAGAGCAAGAGCAGCAACAGCAGCATCAGCAATGCAGGACG
CCACGCACCACCCGAACGCCACCACCTTCTACTCCGCCGCCATCGGCATC
TACGCAAGCACCCACCCTCCCCTCCACCTCCCCGCCGACCACGACCTCTC
CCTCGTCCCGCACCTCTTCTCCTACCTCCCCCTCCACCACCACCACAGCC
AGTCGCATTCTCCCCCGTGCCTCCTCGATGCCGCGACCGCCGCCTCCCTC
TCCCGCGCCGACCTCCGCCGCCTCGTCTCAGCCCTCGCGCACGGCCTCCG
CCGAACCCACCGCATCCGCGCCGGCACCGTCGTGCTCCTCATCCTCCCCA
ACTCTATCGCCTTCCCCGTCGCCTTCCTCGCCGTCCTCGCCGCCGGCGGC
GTCGCCACCACCATGAACCCCTCCAGCTCCCGCGCCGAGATCGCCGACCG
CCTCCGGGACACCTGCCCGTCCCTCGTGCTCGCCTCCCGCGACAACGCGG
CGAAGCTCCCGCCCTCCGCGGCCCCGGTCGTCCTCGTGCCGGAGACCCTT
CCCTCCGCGGACGACGAGTTCGCGCCCTTCCGTGCGCTGCTCGACCCCGA
CACCGCCCACGCGACCGACGAGTTCCCGTGCGCGGAGGTGGGCCAGGACG
ACGCCGCCGCCATCCTCTACTCCTCGGGGACCAGCGGCCGGAGCAAGGGC
GTCGTGCTCACGCACCGCAACCTTATAGCCATGGTCGAACTCTTCGTGCG
CTTCGAGGCGTCGCAGTACGCGACACCTGCTTGTGACAATGTCTACCTGG
CCGCGCTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCTCCCTCTTCGCCGTGGGC
CTCCTCTCTCTCGGCTCCACGGTCGTTGTCATGAGTAGGTTCGACGTAGG
CGAGGCCGTCAGGGCCATCCGCAGGTACAAGGTCACGCACTTGCCGCTCG
TGCCGCCGATCATGGCGGCGCTGCTCAGAGCCAACTCGGCAGGCGCCTTG
TCATTGGACTCCTTGGTACAGGTCTCCAGCGGTGCAGCTCCGCTCAGCGG
CAGACTCATTCAAGACTTTCTCCAGGCTTTCCCACACGTCGATTTCATTC
AGGTATAAACCTAGTACCAAATTCCAACTGTTTGCAGTATACTCTTCTGG
GAAACATTGGTAGGTGAAGGCAACCCATTCTTTTAGTCCAACTAAGTCCA
CACCTTGAGTGTAACATACCGTATTAATTATATTGCCTTGTCACTCTATT
TATCTACTACCTGTGTGTCCACTCATGTATATCAGGGGCCTTATTATATC
ACTTTAAAGTTCAGCCTGCCAATTCTGTGCAGTTAAAGTTGCAATTGATT
TGACCTTGCAAACATTATAAAGACTTTATATCCAAGTAGGGACTAATTGG
TTTAAACCAAAATTTGCAAATAGTTGATATTTCTGCGATCAAGCACTGAA
ATTTGTTGCTGGAATTGCTATTCCAGTAGCTTTGAAATATTCCCAGTTAC
TGCAAATCTCTATGCAATCGAAGCACTCATAGGTACTGCTGCAATTCTAT
TTCCACTTCAGATTGCTTGTAGTATTCTGAAACTTACTGCTACAATTCAA
GCTGCTTGCAGTATTCTAAGAGTTCTTTTAAGACTCTTCCACTCACCTTC
TTAGGAGGCTAGGAAGTAAGAGTGCTGTTTAATCCTAACCGTCTATTGGT
TGCGTGTTAGACAGGACAGTTTTAAATGGAATTAATATCTTCCATATATA
GCAGAACACAACTTTTTTATTTTATATACCACATGAAACGGTTTGGAAGG
ATAATATTTCTGTTAGACCTAGATATGCATATGAGCATTTTCCGCACAGC
ACATGTATCGCTTTAAAGTTCAGCCTGCCAATTTTGTGCAGTTAAAGTTG
CAGTTGATTTGACTTTGCAAACATTATAAAGACTTTATATCCAAGTAGGG
ACTAATTGGTTTAAACCAAAATTTGCAAATAGTTGATATTTCTGCGATCA
AGCACTGAAATTTGTTGCTGGAATTCCTATTCCAGTTGCTTTGAAATATT
CTCAGTTACTTCAAATCTCTATGCAATCGAAGCACTCATAGGTACTACTG
CAATTCTATTTCCACTTCAGACTGCTTGCAGTATTCTGAAACTTACTGCT
ACAATTCAAGCTGCTTGCAGTATTCTAAGAGTTCTTTTAAGACTCTTCCA
CTCACCTTCTTAGGAGGCTAGGAAGTAAGAGTGCTGTTTACTCCTAACCG
TCTATTGGTTGCGTGTTAGACAGGACAGTTTTAAATGGAATTAATATCTT
CCATATATAGCAGAACACAACTTTTTTATTTTATATACCACATGAAACGG
TTTGGAAGGATAATATTTCTGTTAGACCTAGATATGCATATGAGCATTTT
CCGCACAGCACATGTATCACTTTAAAGTTCAGCCTGCCAATTTTGTGCAG
TTAAAGTTGCAGTTGATTTGACTTTGCAAACATTATAAAGACTTTATATC
CAAGTAGGGACTAATTGGTTTAAACCAAAATTTGCAAATAGTTGATATTT
CTGCGATCAAGCACTGAAATTTGTTGCTGGAATTCCTATTCCAGTTGCTT
TGAAATATTCGCAGTTACTGCAAATCTCTATGCAATAGAAGCAAACTGCT
TGCAGTATTCTAAGAGCTCTTTTAAGAATCTTCCACTCACCTCTTAGGAG
GCTAGGAAGTAAGAGTGCTGTTTAATCCTAACCGTCTATTGGTTGTGTGG
TAGACAGGAAAGTTTTAAATGGAATTAATATCTTCCATATATAGCAGAAC
ACAACTTTTTTATTTTATATATGATATGAAACGGTTTGGAAGAATAATAT
TTCTGTTAGACCTAGATATGCATATGACCATTTTCCGCACGGCACATGTT
TTACATTTGGTAAGCTCTTGGCTCAACTAAGAAAACTATCCGTGTCGTAC
TTATGCCGCGCTACAAAATCATTGTACAGGATTTTCTGCATGTCCTAGCA
GAATCGTTCGAGGTTAAAAAAATTGTACGCTTCAAAGTAACATATATTAT
CTATGTATGTGTTATTATGGCATGAAAAATAAATTCAGTTGTCAATGAAG
TATAAAAAACGCTTATATTCATTTACCTTTTGTTGTGATTGATGTACATG
TTATTATGTTTCCACTTGTACCTGATAGTTAGCAAGATCCTTATTTAGCA
TTGTGATTTACTGATAAAATTATCTATTTCCTTTATTTTCTTGGACTGCA
AAGTCCATATTAACCTTTTGTAGCCATTGATGGTCTATTTTCTACTAAGA
AGTAAGAGTACTATTAGCCATTTCATCACACAATATTGACGGCCAATATC
TGTCTCGGTGTACATTAAAAAAAATTCTCTAAAATTTTACACTTCACACA
GGGGTACGGCATGACAGAATCGACAGCTGTGGGAACTCGCGGCTTCAACA
CTTCAAAGCACAAGAAATATGCTTCTGTAGGTCTTCTAGCCCCAAACACA
CATGCCAAAATTATTGACCTGGAAACTGGCTTCTGTTTACCTCCAGGCTC
TTGTGGGGACTTGTGGCTCCATGGGCCAGCAATAATGAAAGGTAGCATTT
CATGAGCCCAACTGAGTCATTGCAACAAAAAAAAAAGAATGTTCACGTTT
CTACTGATGCAAATCCTTGTTCAGTTAAAAAAGATCGCTTCAACGAACTT
GTATATTCTTAATCTGCACTTTTCCTGTACCTGTCGTTATGCCTGTCTGC
AGCCCTGGTGGGCTGCCCCTGTTGTCCTTGGCAAGGCTTGGGTTGGCTGT
GTTATCTGTGGACGCTAGAAGTAATCAAGTTGATCACAGGAAACCTCAAG
GACGCTTCCTTCAACGAGTTGATCACCGCCAAGCCTCCCAATGGTACAAG
ATGGCTAGTCACCGGAGGCTTCAATCAAATATGTAGAGCTCGAGACAAAA
AACCGTGCATATGTGAACCGCAGAAGGCTTGTTCGATTCCGAAACACTCT
CAATACTTGCTACTTCAAAGAGATCCATCTTCAAAATGGAAAGTTTACTT
GGAGCAATGAACAATAGGACCCAACTATGAGCAAGCTTGACACTTTCTTT
TGCAATGAGGATTGGGATGTCACTTTCTCCAACCACATCCTACACGCCCT
CTCGTCCTCACTCTCCGACCATTGCCTTCTCCTTCTCGCAAATGCTAGTG
GGCCTAAGAAGCCTAAATCCTTCCAATTTGAATTTTTTGGCTCAAGATGA
CAAGTTTCATGGAAGTGGTCAACCATGCTTGGCATGAGGATTTTCACCAT
ATTGTACCTTGCCATCTATTCCACAAAGCTAAAAATAATCGGCCAGTCGC
TTGCGCAAATGGAGCAAGAGCCTTTTTTCTAAGGCCAAAGTGGAACTTCA
TATGGCCCTAGAGATTATTCTTTGACTTGACATTGCCCAAGAGAATATAG
CCCTTAGTGTGGAAGAAAGAGACCTTTAGACAAGGTTGAAGAAGAGAGTG
GTTGGTTTGGGGACGCTTGGCAAGTCAAGGAAAAGACAAAGCTCGAGGGT
CCACCAACCTAAAGGAAGAAGACGCAAACACAAGATGTTTCCATCTTTGC
ATTAACGCGAGGAGAAGGAAAAACCATATTTTTTTGCCTTAAACACAATA
ATGTATGGGTTACAGAGCACCAACACAAGAAAGAAATCATCCAAGGACAC
TTCGAGCACATCATTAAAAGAGGGCTGCCCCGAGCCTTTGACTTCAATTG
CGTGGTAATCCTAATGCCCCGAGTCGGGATGGTTTCACGGGTGCCTTCTT
CAAGGCTTGTCGGAATGTTATTAAGGATGATTTATTGTCCGTTATCAACC
AATTCTCAACTCTCCACATCAACAACTTACATTGGTTCAACTCCGCGAAC
ATCGGCGCTTATCCCAAATAAGGATGGGGCCGAAGGTATCTCCGACTTTT
GACCAATTAGCCTCATTCATGCTATTGCCAAGCTAATTGGGAAGATGATG
GCCTCCCGCCTAGCCCCCCACATGCCCAACCTTGTCTCCAATACTCAAAG
TGCTTTCATAAAGAAAAGAAGCATCCATGATAACTTCCTATATGTGAGGA
ATTTGGCAAGGAAACTTCACAAATCAAGAAAGCCAACTCTTCTCTTCAAG
CTTGATATCAAGAAACCTTTTGACTTCATAAGATAGGACTACTTGATGAA
CTTGCTAAAACACTACAGGTTCCCGCCAAAATTTAGAGATTGGATATCGG
CGCTTGTTTCCACCTTGTCTTCTAGAGTCCTCCTCAACATTGTTTCTAGA
GGACTACGACAAGGAGACCCACTCTAGTCGCTTCTCTTTGTGTTGGCCAT
TGATCCTCTACATCACATGCTTCGAAAAGCAACCGAGCAAGGACACCTTC
ACCCAATAGGTGGAATAACTCCAACAATTCGCACCTCCCTCTATGCCGAT
GATGCCTCTATTTTTGTGGATCCAAATAAAAATGATATCAACTTTCTAGC
ATCCACCTTGGACAAGTTTGGCAACACCACCGGCCTTTCCACAAATTGCG
CAAAGAGCCATGTGGCACCTATTCGGTGTGATGATTTAGATCTTGATGAC
ATTCTTCAAGCCTTCCCGGCCATCCGATCCACCTTTCCAATGAAGTATCT
TGGTCTCCCTTTGTCCGCAACGCGTCTGGAGAGGATCCATTTCAAACAAA
TAGGAGATAAAGTGGACGGTAAGCTCGTCCCTTGGCTCGGTAGGCATGCC
ACAATGGCCGGTCGCACGGTGCTTGTCAAAGCGACTCTCACAAGCATTGT
CATATACTACATTACCGTGCTCGAGGTCCCTTTGGAGGTCCTCTTGAAGT
TTTATAGCATTGGATGGGCTTTTGTTTGGGTGGCTTGTGACAAGGTGACC
GGATGAAAATCCAAAGTTAATTGGGAGCAAGTATGCAAGCCAAAAAAAAG
TATCGTGGACTCGGAATTCTCAATCTCACAAAGTTTGCCTCGGCCTTGCT
TTTAAGATGGCTATGGAACGAATTTGACGGAAGATCCCAAACCTCGGGTG
GGGCTTGGAAACCCTTGCACTACTAACAACCATGACCTCTTTGCGGCGGC
CACAGTGGTCACCATTGGAAATTGAGAGAAGGCCCTTTTTTTGGACTCGG
CTTGGCTTGAAGGAATGCGGCCAAGAGACATTGCGGCAAAAATTTATGAG
ATTGCAAGAAGAAAGAAATGCTCGGTGAGGAAAGCTCTTGCAAATGACTT
ATGGGTCTCTCATTTGAACACCCAAGAGGGCCTCTCGGTGGAACACATCA
CGCAATTCTACAAGCTTTGGGAGATGCTTCAACGTGTCCATAATGATCAT
AATACCCCGGACTTGATTGCATGGAAGTTTGGCGAGGACGGGAACTACTC
GGCTTCCTCGGCATACGCTATGCAATTTTGGGGGTACACCTCCTCTGTCA
TGAGTTCTATGGTTTGGAAGCCATGGGCACCTCCCAAGTGCATGGATTTC
ACATGGTTGATCCTTCAAAAACGAGTTTGGACGGCGGATATGCTTCATAA
ATGAGGATGGCCAAATTACGGCCAATGCAAGCTTTGTAACCAAGTACAAG
AGTCGGCTCCCCATGTTGCTTGTCTAGACGCATTTGGGCAAGCTTGAAGG
ATTGGCTTGGACTAATTGACATACATCCGCAAGATTGGTTGGCTTTTCAC
TCCGTCAAAGATTGGTGGAATGAGGCGATACAAAAAATGGGACAATTGCG
TAAAGCTTTGGCTTCTCTTGCAATGTTAGTTTCGTGGGAAATTTGGAAGG
AAAGAAACACTCGATTTTTCAGGAATCAATCTTCAACCGCCAATGTGCTC
TTCATGAAAATCAAAGAAGTGACTATGTGGAGCCTCGCTGGAGCCAAAGC
GATTAGTAATATCATTTGCCGCGAAAGTAGTTTTTTTTTCTTTTTTTGGC
CTTGGTTTTGTCCAAGGCTTGGCTTGTAAGACCTCTATAACCTCTTCTTA
ATCAATGAAAATGGCAAATCTTTTGCCTTGTTCCAAAGAAAAGCACACAC
ATATTATTAAATGTTACAGGTCTAATTTCACTTAACTCATTGGTAGCTCG
TTATTGAGGATCCTATGAAGACTTGACATATGTGCATTTTCTCTGCTGTC
CTATTTAGCTCCTTTAGGTAATAGGATATTTCCTTCTACAGTACTTGCAC
ATGATTTCATCGTCATCTTAATGGTTAACTTATACCATCCCTTGGTGTAT
GTGATATGTTTACTGCTTATCATTGTATTTCTAAACATAATAATTATCTC
ATTTGCTACAAAGAAATATTTTATTCTGCACTATATGGGAATTTTTGGTC
CTTAGACAGGTAAACAAACTTAGCTCTCAGATATTGTCTTTAACATCATG
TGGCTGTTATCTTTTTTCACTTGAATTACATTATGATGTATTCCATATTC
TGTCCCCTCATTGTATTTGGGTTCTTGAATTTTTCTTCTTCACAGGTTAC
TTGAATGCTGAAGATACATGCACAAGAAATGATGGCTGGTTGCAGACTGG
CGACCTTGCTTACTTTGATTCAGATGGGTACTTGTACATAGTGGGCCGTT
TGAAAGACACTATTAAGTACAAAGGATTTCAGGTATGGCTTCCTGAAGCA
GGCCTTAAAATACACTGTCTTTGCTTTTGTTTGTGACAAATTGTGCAAGT
AGCTATTGGTATAACAAATTATCATTCTGAATATCAGATAGCTCCAGCTG
ACCTTGAAGCAGTTTTGGTCCAGCACCCTGGCATTGTTGATGTTGCTGTA
ACATCGTAAGTTTGAAACCCGTTTGTTAAAGTTACGGCGGCAGTTGAACT
TACGTGTTGTCATGTAATTGAACCTTTTTTTCTTTGCTTTTCCTGATTGT
TCCATAGCGCTGAAGACGAAGAAGCTGGAGAGATACCAGTAGCTTTCGTG
GTGAGGAAACCTGGAAGCACTCTGACCTGTGAGCAATTGATGGAGTATGT
GGCCAAGCAGGTAAAAAGATGCTACAACACAGCACCTCACACTCTTCTGC
TTCCTTCCTTAAAATTGACGTGTCATAACAGCATGAATATGACGCATCCT
TTTTATTCATAAAAAATTGTCAAACCACTCGAACATGACAAACATTCTGA
ATCAATCTTGAGATATTAGTCGTTCTCAAACAGTATCCACGAGTGATTGT
TGTGCATGCTCCCCACCTGTCCTGACTTGCTGTACGGATGGAAATGCATA
CTCAGTGATATGAGGTCAGGTTGTTTGGCAGATGGCACACATGCCCTTCT
TTACTCCAGAGTTTGTGTCGTATAATAGGTCAGGCTGGCATGCACTCCTC
CCCCTCCCTTTGTTGACTTATCAATTATAAACCCATGATTCGTTCAAGGA
TGATGCACGGTGTGGACAAAATGCAAGAGCTCAGCTGTTCCTGGGAGACA
TATTCAGGTAGTCAGGAAGGAAGAGGTTCAAAGAAAAATCTGCGTCAAGA
ATTTTTTGTTTCTTATTGACCTTTTCGAGGTAGCAGATGATGTGAGATAG
GACTACTAGTAGTTTATTACACGTTGAAAAGCGTTGCGATTTGTAGGCTG
TCACAACAGTATTCTTCTGCTGAAGGTGCAAACTGATGATCTGTTGATGC
TGGGTGCAGGTGTCCCCGTATAAGAAAGTTCGGAAGGTAATATTCGTGGA
GGCAATTCCCAAGTCACCTGCTGGCAAGGTTCTTAGGAGGCTTCTCAAGG
AATTTCTGCACCTTGATGGTGCTGCTTCCAGTTCCAAGACCAATCCCAGT
TCAAAACTGTAGTAACTAGAGCAAAATGGAGTGCATGTGTCTTACTTCTT
GTGAGTTTTTTTCTTTTTGTGATATATGGAGTATGTTGGTCCACCTAATA
GTAATAGTACCATGTCATACCATACCACCATAGGGTGTGTTCTCAAAATG
GGAAAACTATATATACTAGTACCATATAATGAGTGACTGAAACAATGGAA
TGTCTGTCTGTGTGCTAGTACTATAGATGGAATTTGTTGAAGCGACATAA
AAAGAGTATTGATTGATTCTTGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.