Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025577

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025577
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025577
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAG GAGGAGGTGTGGTGTGGTGGAGGTGGCGGCGGTGGCCGTGGCGGTGGCAG CGGCGGTGGCGGCGGTAGGATTATTCGATTCCGCAGTGGGCTGGCATTAA TATTGGAGGACGGGGGAGGCGGCGGCGGTAGGATTGTTCGATTCCGCAGT GGGTTGGCATCCATATTGGAGGACGGGGGAGGCGGCGGTGGCGGAGGAGG AGCAGCAGGAAGAGTGGCACATGGCCAGCGGCGTGTTCTGCCGATTTATC GGCCGCTGTTCGATCCTCTAAGGGAGCACGGAAGAAGGATGGTGAGTTCT CCTCCAGCCCCGTGCGTTTCTTTTTGCATTGTTTTGATTATTGTAGCGTT AATTGCTGAATCAGAAATAGATGAAGGCAGGTTTATTTCTCAATCCGGTC ACGTACTTGTGTTGCAAGCATCTGATATGCAAATTTAGTAGTTATTTTGA TTGTTCAATTGCATCTGGTGAACGATCTATTTGCTTCTAGGGTATCATAG AACATCAGTAATAACCATTAAACCAATACACAAAAAGGAATATATTTTTG TGAGCATGCACATATTGCTCTACCATCTGATTGGATTTTCATTTCATTTT ACACCATACTTATTTTGCTGAAGAACTGGCGGTATTAAAACTCTTCTCAT GTTTGTCTAGCCTGCCTACATATCCTGAAGTTATCTAGTTAAGCATGTAT TCTCTGCTATTTTGTTACTTACCCTTAGCGGTATCTAGCTGGGTCAAAGA ATGAGTTGCGATGTTTGACATAGTTACAGTGATATTGGAAAATCGATGAT GAATAAATTATAAAAAATGTTTTCTGTTGTTTTATAATATCGCAGGGCAG CATTACCTTTGTACCTCTTTTGGGTAAACATTTTTTAATAGCATTGAGTT TTTTGTGTCACCCGTTTCTACCTAGGTGTATGAATGTGAAACTTCCTTAT TATTGCAGGTACTCGGTAAATTCAATCCCCATGGAGATTCAACAGTTTAT GAAACTTTAGTGCGAATGGCTCAGGTAACATTTCTGTGGGCATGTTATTA TTCTAATGCACTATTGTGTCCAGCCCCCTCTCTGGGTCAAGGGTAGGTGG TGTCATGGCATCATTATATTTATATGACGGGTCATCTGTTTAACTTTGTG TATCCTTCTACGTATTTCACGGAAAAATGACATACACTGTAAATTCATGG ACCCCACCAGACACATTCACCTTCTGGGTCTACACAATAAGCAGGTGCTG ATTGATCCTCATTTAAACTTGGACACTTGCATTGTATGGCAATTTAGATA TCAATGACCAGGAACAGAGTTTAGTGGTTGGACAATCTTTGTAAGGAGCA TAACAGTATTAATTGGTACTGTAAGAAAACAGAAGTAACAGTTCACTTCA TGTTAGGATGATACTTGAATATTTTCAAATTGCACTTCAATATATTTTTT CATTTATTATGTTTTATGTCATATCTCATCTTTCCAATTTAATACCAAGC TACACTCCCAATGATTGTGGATATTTTCTACTTTGGCTTCACTCTGCTGT CAAGTGAAGCTGCATCACATATGTCAAATTTGATTACTTCACTGTAACTA AAGAGCATTTATGCCATCTTGCAGGACTTTTCAATGAAGTATCCACTTGT TCAAGGACATGGTAACTTTGGCTCAATCGATGCTGATCCTCCTGCTGCAA TGCGAAATACGGAGTGCCGCTTGGATGTAAGTTTTGGTTCACTTAAATGT TGTCAAGCGACCCACTTTTGACCAACAGAAGTCTCACAGGACCATCTTTG TTATTTTGCAGCCATTAACAGAAGTCATGTTCCTGACTGATCTGGAGCTA AATATAGTATATCATTACATTTCAGTCCATGTTTTTCTCTCTTTGTGCGT GCGTGTGCGCACAGATTGTTTAATGTGCATGTTCCTTTTCCCTACGTATT TCATGCCACTTGTTTGCCATTTGACAGGTTGACTACGTTCCAAACTTTGA TAATTCTCAGAAAGAACGGTCTCTGTTGCCTGCTCGTGTTCCGTCACTAC TGTTGAATGGATCTTCTGGAATTGCAGTATGAACTCTTTTTCAAGCTTAA GAAAAGTTCAGCTCATCTGGACACCCATTCATTCAAAGAAGAAAACATGA TGCTATGGATTTGATTGTTTTGTGTGTGGTATTGTCTCAGGTTGGAATGG CCACCAATATTCCTCCTCATAATTTGGGAGAACTTTTTGATGCACTTTCT GTTATAACTCAAAATCCTGAAGCTACGGTAAGTATTCTATCATTGTCTCC TTTTCTGCCATCATTTTTTGTCTGTTAATTGCATCATAGTCCATAGCATG ATGAATCCACAAATAACCATTTATTGGTTGGTGATGGCAACTGGCTAGCA TTTAGGACTCAGCTGATTCCTGGTAAACCTTTACCGATAGAATATGTCAA AGTATGTTCATATAAATCAAGGACAACAAACTTTGTTCAGCACAGTAAGT TATATGGTCATGTTGTCCTTTTCTGATCATGACCAGTGCTTTAGAAGTAG AATTGCAATACTTGTTGTTTGGTCTTCGTTCTTTTGTGATGAAACATTGA AGGTTCTTTGGTAGAAGACACTAGGGCCATGATACTAGAGGGCCGTAGCC CAGCCGTGACTTGCTGATGCAGCATGTTTAGCCTATTGTCAGATTATAGG TGCTGTCATGATGGTCTTGGATTGTGTCTGCAAATCCTTCCGAATGATTG ACTTTAGTAGCAAAGTGTTGAAATATCTTCTTTGCTCAAACTGAAATGTT TAATTTACACATCCACACATCTCAGCTGTAGAAGCAACACCACTAGATTG TTGTTTTTTTACAAGTGAACAACAATCTCTGAGTGTAGTTAGCATCATTA TTCGTAAGTATCTAGTTGATATGGCCACTCAGATACAGTACATGATTAGA ACTTAGAAGTAGATTGAAAGTGATCTATTCAGTCTGACTAGTTTACTAAA ACAAGCCCAATACATGTCACTATAAATTTAGAAGTGTTTATAAGGTTCAC TTTTTTTTCAACTTGTGCTATTCCACTAATAATTGTCTGGTTCGTGTAAA AAGAAAGAATAATTGTCTGGTTTTGGTGCATCACTTAAGACATACTAATT CAATCTAAGTGTATCTTGGTGGCAAACCCTTGTAGATGTTTATTTTGCAT TTCCTCTTAACCAAAATTACAGTTCTTTTGCATGTTCTCTATAGAGAAAA TATCATGAAAGCATTGTCATTGTAGACATGCTAGGATATATTTTTAGAAT CACATAGTCGACTGTTGCTCTCAAATGGATTTCTGTAGTTCTGTTCAGTC GTCTCTTATATTTCTTTTGCTTCGACATGTTATAGTTTTTTCATAATCTT GATTGCAATTTTCTGTTGTATGCAAGCTCCAAGAACTACTAGAATGCATG CCTGGCCCCGACTTTCCTACAGGAGGGATAATCATGGGAAATAATGGGTA CTTGATTCTTATTTCATTGGTCTTATTTGTCTTCACTGTTTCAACACTAA GGTGGTACATTCTGCATATGTTTTCTGCTTGTATAGTATTTTGGAGGCTT ATAGAACTGGGCGTGGTCGAGTTGTCGTCAGAGGCAAAACAGACATTGAA ACGATTGATAAGAAAAGCAACCGCACTGCTATCATAATTAAAGAGGTTTG ATTCTCGTTATTGTTTTCAGAGCAATGCCTGTGATATTTCTTTTGGTACC TGGTTGCTTTTTTGGGTAGTCTTGCTACCTGGTTAATTAACAGGGAACAT ATTGCCTGATTTGTAATGCTTACATGCAGATTCCATACCAGCAAAATAAA TCTACTCTTGTGCAAAGGATAGCTGAGCTTGTTGAAGACAAGGTAACTTT ATTTGTGTTATAGTTAGTTGCATTTCTCCTCTACCAGGAACATGGTTATT CCGATTAATCTTCTGTGGCATTTTGGTATTTAGGTTTATCCATAAAAAAA GGATGTAGGCTACGCTTAATTTGGCTTCTGTCATTGGTACCACCACTATG GACCAACAACCCTTTGTTACTGAGTGTAGGTTCTAGAAGGCATCAGTGAC ATCCAAGATGAAAGCGACCGCTCTGGAATGCGTGTAGTTATCGAGGTTTG TACTATACTCTTTGACTCCGTGCTCTGAGCTTACCTCCATCATTGTAAGA CTGAAGTAGCCAGGGCTCAAGGATAATACTTGTCTTGTTGCTTACCTTGA ACTCACTACCTTTCTTGCACACTGTTCCAGGTCAAAAGAGGTGCAAATCC TGCCATAGTCCTGAACAACCTGTATCGTCATACAGCATTGCAATCTGGTT TTAGCTGCAACATGGTAGCGTAAGTGTGCTTTAACCATTTATACAGTTTA ATGATTTTATTTCATTTGCTCATGTGTTCTACGGCACAAAAATGACTTGC TAACCCACAGTGTGGCTACACCCCCCACCCCCATAAAATGACACGTATGC ACATTGGTTAAACACTCTCTATGGTTAAAGCAAGACTGTTAATTGTTCAC AATTCACATGGTGCATAATATTTCGTCTGTCATGTTATTCCTTTGCTCAA TTGATTTTAAAAGCTGAGTTCACTTCAATAAAAATATGCTTTTGTTTTAC CGCAGTTTTATTTTCCTAGTATTGGCTACTTCATTAAATATTCTTGTATG TTCAGAATTAGGATATTATCGCAGATTTAAATCTTTAGCCATTAAATTAT TTTAAGGCGTTTCCTTGATTTTTAAGTAAATCAACTGCATTACCCACTGT TAAAAGGAAGTATATGGCACTATGCTTTTTTACTCCTTGAATCATACTCC CTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAAGTTTGTGAAGAAAATGAATCTA GACTTGCATCAATTTGTGTCTGCTAATTGCATCATAGTCCATAGCATGAT GAATCCATAAATAACCATTTATTGGTCGGTGGTGGCATAACTAGCTAGCA TGGGCCGTTGCCCAGCCGAGACTTGCTGATGCAGCATGTTTAGCGTATTG GCCAATTATTGGTGCTGTCATGCTGGTCTTGGATTGTGTCTGCAAATCCT TCCGAATGATCGCCTTTAGTTATGAAGTGTTGAAATAACTTCTTTGCTTG AACTGAAATGCCTAATTTGCACACCCACACATCTCAGCTGTAGAAGCAAC GCCACTAGATTGTTAGATTTTACAAGTGAACAACAATCTCTGAGTGTAGT TGGCATCATTATTCGTAAGTATCTACTAGTTCACATGGCCACTCAGATAC AGTACATGATTATAACTTAGAATACAAATTGAAAGTGAGCTATTCAGTCT GACTAGTTTACTAAAACAAGCTCAATACTTGTCACTGTCAATACCTATTC AGTAGTGAGCTATTCAGTCTGACTAGTCTGACTGAATAGGTATTGACAGT GACAGGTATTCTAGCTTAAATAGGTTTGATTCACGTTATAGTTTTCAGAG GTATTGAGCTTGTTTTAGTAAACTAGTTCCAGGTTAAAACAGGTGCAAAT CCTGCCATAGTCCTGAACAACCTGTACCGTCATATAGCATTGCAATCTGG TTTTAGCTGCAACATGGTAGCATAAGAGTGATTTAACCATTTATACAGTT TAATGGTTTTGTATCTGTTCTACGGTACAGAAATGACTTGCTACCAACAG GGGTCTCTACGGTAAAATCAAGACTGTTTTTTTGAGTTTTAAATGAAGAC TGTTAATTGTTCACATGGTGCATAATATTTGTTCTTCATTTTGTTCTGTG ATGTTATTCCTTTGCCCAAGTGATGTTAAAAGCGAGTTCACTTCAATAAA AATATGATTTTGTTTTACCAGTTTTATTTTCCTAGTATTGGCTACTTCAT TAAATATTCTTGTATGTTCAGAATTTGGATATTAACGCAAATTTAAATTT ATACCATTAAATTATTTTAAGGCGCTTCCTCAAATTTTATATAAATCAAC TGCAATACCCATTGTAACAGTGCTAGACTATACGTTTGCAATTTTCTGTG CTTTATCCATGAACCTGTTTTTTTCTAGTATAAACTATTCTGAGGTGTTT AATTCACCTTACTCAATGGTTACATATTTTATCACATTTTACAAATTATC TTGGGAGTCCTCTAGTGTCTCTCTCAAGTTTGAGCCCACTGACAGCTCCA TTGAACATCCTGTAGTAAAATTCATGAGTTGATCTAACACATGTAAATGT AATTGACCATTACTCTATTCAGTAATATGACGAAATTCTTGTAGTACCAG ATGCGCTTGACTTGACATGCCGAGTTTCTTGTGGTAGCTTTCTAGGTTTA AGCTAGAATAGGCAATACCACACAATACTAAGATTACTACGATTACGGAT GCTGATGAGGGCCAAAAACTCTAGACTGAAATTTAATTCTTGGAATTGTA GATAACTACCCTGATGGTTGTTCCTTTCACATGTCTTCTTGGTCTTTTTC CTGAAGGGTCAGATATGGTTTCTTATTATACTATGCATGGTCATTTTCTG TGAACAAGTATTATCAAAGTACTAATTGCCCATAATTTAACGTATCTTAT TTTCCTTTTATGAAGGTCCTGAGGTGCTAAAGCAAAAGCTGAAGTGATAC CACCAAGGATAGTAAATCGCAAGGTAAGTACAACATGGGATTCTAACGTT CTTCAAGTGCAACACTAATGAAAAATTATCTGCATATCGTTCAACAGTAA TCTGATGAACGACGTTTCCTGTTACCATTCGCATGCATGAATGAAGCAGG AGTGCGAGGATGTGAGCAAAAGAAGACGAGATTCTTCTTTCAGCTCAAAG CTCAATTTTTTTTTTCTGTTGAAACTGATTTTGACCAGCAAACAGAATGC TTCCTAGGACACGGCCATGGAGTATTGCTGACTGGAGGTGTTGTGAATGA TAAGTAGGTCCACCGACTCGTGTATATCTCATATCAGGTTCTCACTAATG CTCGTGTCCAAACCTGGAAATCACGCATAGCTTGTGCTCATGGAAATCGT AGAGGTGATCTGTATTGTTCTCTGCCATTTCCTTTAAAGCTCTTCTATTC TATACAGCCGGATACCTTTCTATGATCTCTGTTAGATTGAAGTGTGTATT GCCCTAGGTAAAAACAGTCGTTCGAAATGTTACCAAGATCATAGGTAAGA GATAGTTTCTTTTCAGAGCTAGTTTATGGTAGCCACTTGATTGGATAAGC GCGGGGAAGGTAACCCATCACCTCGCGCCCTCCGCTGGCCTTAGTGGCGG AGTCGCAACATGGCTCGCTGGCGGTTACATCAAGATTCATGAATCATGAT GTTTAATCCCCAAAGAAACTGAAAACGGGCATGGGGCACCGTCATACTGT GCACACTGTCCATACTCCAGCCAGAGTTTGAAGCAGCGGAAAGAAATGTC GAGATGGGTACCCAGTCGGCACCAACAGCTCCCTCCCTGTGAGGCCACAA AACGAGACAGATACCCAGGTGAGCGGCCGGAGCGTGTGAGCCAAGAAGAC CAGGATGGTGCACGGGGAGGCGACGTGGAACACGCCGGAGCGCGAGGCTG CGGCGGGCAGGTAGGTCGCAGGGGAAGAGACCGTTTTCGTGGCAGCTTTG GGTCTCGATGATTTGCTAGTTGATGCGAATAAGAATTTAGAACAGGTTAC TGCAGCTGTGGAGTATGTATATCATTAAGAAGTTATAGAATTGGTTACAA TTGAAGATGCCTTGGCAGGAAACGAGCTGGTAAATAGAACCATGCAGGAC ACATAATGATTGAGTAAGCAAAAAAATTAACTGATTAAGAGTCAGATCAG ATTAAAATAACTACACAATTCCACACTGCTGCTTCATACTGCAGTATTTA GAAGGGAAGTTTTCATTGGGTAACATTTTCCATGTACATTAATGAAATTA GTTCCATACCATTACTCAGATATTTACCATCCTTTAAACCAATGATGAAT ACTAATGTGGCTATCCATGTGTGATGGTAAACTGATTTATCCATGTATGA TGCTAGACTGATATATCCATGTACTAATTTTGGCTGGTCTTGTTTGCTTT GTCAGGCACTCATCTAGATCTAGCTCCTTAGTAATTACTGTTGCTTTGGA TTGCTTTGCATATCCAAGTCCTTTGATTTCCTTATTTCTGTTGCTTTGTA TTGCTTTGTCTATCCAAGTCCTTTGGTTTCCTTTGAAATTAAACATGCAA GATACATGTTTAACATGCTCACAGGGTTAGCCCAGTAAAAAAAAGCTTAA TATGCTCAAATGGAAGTGCTATTGTCAAAGCTTTGTACTATATTATTTCG TTTGAACTTCTGCATGGAGGAAGCAAGTTTAAAAATATGCTCAAATGGAT TTAGGATTGTCGAAGCACTGGAGAACAATTTAAACACAGTAAGTTGCAGA TCTGCCATAAATGATATTCTCATTGCCAGTTGCTACTGAAACAGCTTTCT GTAGTAGTGCTCCATCAGTGAACAGAGCTAACTAGTTTCCTTACATTTAT TTTGCAGATGCTTCTATATCGGAAGAATGGATAACCAACTCTTGAGTTGA TAAAATTGGTGTCCAATGAACTAAAAGAATGAAAGCATGCTTGACTTCAT CCTTTTGTGAGCCTGGGATTTTGCTAGAAAGATAAGAATCGAAGTGCAAT GGTCCATTTGGTTCCAATTTCTGCAATGTTGATTGTATATAATTTTGTAG CGGTTGGGTGCTGGTTGCTACCCTTGATTTTTTGTAGCTATATGTTCTCC TTTGTACTAGTATTTGAGAAGGAATCACTGAACAATAGAATTGTATTTTC AATTATAAGGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.