Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA021438

[Submit comment/correction]

Sequence	AA021438
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA021438
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GAAAAGAGTCGGGTTCCAGTCCATCAGTTTCGGCCTCGTCCCTTCTCTTC CCTACCGGCGCCCTCCTTTCCTTTTCCATTTCCCTCCCAAACACGAGCGC AGACCCCCAAAATCTCTAGGGTTTGCCCTCACCTGCGCTACCAGATCCTC GTCCTCCTCCCAAATGGCGGAGACGCTGGCCTCCATGCGCCGTCCGGTAA GCCCTCTCCCTCCGCCCGGTCTCTCAGCAGCTGGATCCCGCCAATCTTGC CGAGTTTTTCTTATTTTGTTCTCCGTGTGTGTGGGTGCTTTCTTCCTGCA GAAGCGTGGCCGCCCGCCGCGGCCGCGGGAGAGCGACTTCGTGACCGGCG AGGAGTTCGAGGAGGAGGAGGAAGACTTCGCGGAGGCGGAGCGGCTCGCG CCCCAGCGGTCCAAGCGCAAGCGCGAGGCCTCCGCCGCGGCGGCGGCTGC GGTCGAGGACTTGACCCTCATCGGTAAGCGTTTGCTTCTCTCTGCGTCCG TCGCCGTGGTTTCGCTGGAGCGGGGTTCGGTGTGTGTGCCCTGTCTCGGA ACCTGCCGCTAGGGTTTGGCCGTTCAGCTGCGGTTACAAGGAATTGAAGC TGCCGATGTGATTTTAGTTGGGATTTGTGATGCCGGCTGCTGCTTCTGCT GTAACCAGGATAGATTATTCTCAGTGGCTTTCTGCTAGGTGAATTGGCGA CTTTTCTGCTTGGCTTAGGATTGTGTTTGTATTCCTTGCTAAACACTGAC CTCCAGTAGCACAACTAGAAATTAGCAGGAACCGAGGAGCGTTATTAACA TGTCATAGACTGAGAACGCATGATAAGAAAAACAGTAGCGACACTTGAAC TGCTTTTCCCCCCAAACTGTAGCAGGAACCGAGGAGCGCCGTAAACATGT AACATGTAAGAAACTGAGAACGCATGATAAGAAAACAATAGCGCTTGAAC TGCTTTTCCCCCAAACCAGGCATGACTCTTAGCTTCCTACGCTAGCAGGG TGGCTAGTCATTTAGCTCCGGCCCTTGGCCAAAGCAAACCATCAGCCCTG ATATATTTGCTGAATAGGCAATTTTGTTCAAGATTATGTCGCTATGCTCT TTCCATGTAATCTAGACGCGAGCATAATTAGACTGTTAAGCCCTTTTTGT TTCACCCGCAATCCTTTGTCTTGAGGTGACCTACCATGGTACGAAGCATG TCATTTATGACGGGCTTGATGGCAGGATGATGAGCCCAATCAAAAACCTG ACTCCAAATAATGCCAATGACGCAGCAGCTGACCAGCAGATTGTGCAGCA TCCTCACCTTGTGAGTTGCAGGGCACACAACTGCTGTTGTGGGGGGAGTT GCTGCTTAGCCAGTCAATTCCATGAGCTGCATGGGAGTTCTGATTTATAA ATTACTTTGGTGGCATCAGCAAGGGCTATTTGACTACCCATTATTTCTTC CATCCATCTTAGCATGAAATGAATCATCTAAAATTAATCTAGTTTTATTA TTAATAATTATTTTATACATGCAAAACTCATTATGCGTGTCCTTTGCCTT AATTCCACCACTTAAATCAACATGATGCAGAATCTTGCAAGAACAATGCT TCTGAAGGAAATATGCCGAGACATGCGTAGATTAAAAACTGTATTTGAAT AGTATACCATATTTCATTTGTGTGAAGTATCCTTACAAACTTGCGACTTG CAGATATTGTCAAACATAATGGCAGGCTAATCAGTCATGCTGTAAAAAGA TTGCTGGAGAATTATGAATCAGACCCAAAGTCTGTGTTATTTCAGATATT AACAGTGCTATTTGAGGTACTACCAGCTTTATATCATAATATGCTAGTTT TGCTTATTTTATTGCTGCAATTTATTTTATAAAGCTGCAAATCTTATGAT AACAGGCTTGTGGCGCCAGGCATGAAATTAGTGCAAAGGACCTTGACCAG GCAGATGTGGATGACATTGTATTCAAACTTGTTGATCTATCAAAACAAGT ATCCTATTGTGATTTGTTCAAAACTGTGAAGGGAGAACAATACATGTAGC CTTTTAGACTATCCAATGATCATGATTTAGACTCTCCAATGAGCATGATC TAGATCTATTTATCTATCCTATAATTCTATAAATAAATTGTTCTATTGTT GTACACTTGTAGTTATATATATATGCTCTCTTTTGTTTGAATTTTGCAAC CTTAACTTGAAAATAGGGCCTGGTGGATGATAATTATAACTCAAAACGAA AGGACCTTAAGAACTTCAAAGAAAATCTTGTTTCTTTTTGGGATAGTTTG GTCCTCGAGTGTCAGAATGGTCCATTGTTTGATGATTTCTTATTCCAAAA AATCAAGGATTACGTGGTTGCTATGTCATGGTAATTAAGTCTCACTAGTC ATCATCCTTATTTGTTTCTTGATATTGTATGCATGTATGTGCTGATTCAT TGTGCTTCAGTACTCCTCCAAGGGTTTACCGACAAGTGGCTTCGTTGATT GGGCTCCAGCTTGTGACGTCCTTCATATCTGTTGCTAAGACTCTCAGTGG ACAGCGTGAGACCACTCAAAGGCAGTTGAATGCAGAGAAGAAGAAGCAGA GTGATGGACCAGCTGTTGAATCTCTCAACAAAAGACTATCTGTTACTCAT GAGAATATAACTTACTTGGAGGAATTGATGCGTAAAATATTCGGCGGGTG AGACTTCCTGTTAGAAATCATTTGCACTAGCCTTCTAACATACACTTCAT TATGTTTTAATTTATTTCGAACATTTGAGGTAACTCATGCATTGGTACCC TGAGACTTGCTTGTGTTGTCTAATCTACATTAATCTGCGTCTAGCAGCTT GTTAAATATATTATTTTTGTCCATGTAGGTTATTCATGCACCGTTATCGC GATGTTGAACCTGATATCCGAATGTCATGCATAAAATCTCTTGGTATTTG GGTTGTCTCGTATCCATCACTTTTCTTACAAGATATATATTTAAAGTATC TTGGGTGGACACTGAACGACAAGGTAACAATCGGTTTAATTCTTTTATTT TTTGTGCCTATTAGTGCCTCTCTGATCACGAGGCTTACACACTTTATTTC TGCACTTCCTTTTATAGAATGCTGGAGTTAGAAGAACTTCCATTCTTGCG TTGCAAAGCCTGTATGATGTAGATGCCAACATACCTTCACTTGGTCTCTT TACTGAGAGGTTTTACAGCAGGATGATCCAGCTTGCTGATGATATTGATA TTTCAGTAGCTGTTTCAGCTATAGGACTCATCAAGCAATTACTCCGGTGA GCTTACTGTCTCATGGTCTTTTTACTGAGGTTTCACAGCAAGATCGTTTG CCTGTCTAGTCTAGATGGCTACTGGGCAAGCTTACTTATACTGCCATAGC CTTCTTAAGACAGGCCAAATGTTTGGGATGTCTACTCTTTGATGTCAATG CTTATCAACATGGTTATTGTATGTGCTAATAAAACAAACATTCAGTTAAG AAGATTGTTACTGAAGAATAAATCAGAACTAGCTGTAAAATTTGATGTTC TACTGTCCCATGGTACTTCGGCGCTATGCTGCTAGTAGTTCATATGTCGC ATTGAGAGGATCAATCCTTGATGTCTCATTTAGACAGCTAGACCCACATC TGAGAGGAGATGGCACTATGGCAGTGTTATGGGCAGTAATGGGTTTAGGT AGAAATTGAGAGGAATGATGCCTACACAGCAAGTATTCTCTGTGAACATT TGCCTTGCCTGTATGGACCAGATTTGACTGGCCTGGTCAAGCTAGACCTA GCAAAAAATTACTGATCCAGTCACCCTTGCTATTTCTAAAGGAGTCCATG AATTGTCTTGCTCCAGTGAGCAAAAGAACCACACAGGCTTTTCGTATTCG TTCTCTCTTCTTTAATATATATTGTTTCTTTCTTTTGCAGGCATCAACTT TTGAGCGATGATGATTTAGGTCCCCTGTATGATTTGCTTATTGACGAGCC TCCTATGATCAGGCGTGCAATAGGGGAGTTAGTTTATGATCACCTGATAG CACAAAACATCAAGACCTCTTCAGGAGCTAGAGGTAATTGCCTCCTGAAG GATTGTACTGTTATGCTTCCGTGTCTAGTTACCGAACTACTTTATTAGTT CAGCCATTGATTATTCTAGTGAATTCCAGACGGGGACAATGAATCCTCTG AGGTTCATATTGGTCGAATGCTGCAAATCTTGAGGGAGTTTTCAGATGAT CCAGTACTGAGTTCTTATGTCATTGATGACATTTGGGATGACATGAAGGC CATGAAAGTATGCTCCTTAATTTATGTATCTACTTTGATAAGAGTTACTA CCTCCGTCCCAAGGCTTAAGGCTTACATTTTTTTTTTTGAAAAGTCAAAC TATGACCAAGTTTGTAGAAAAATATATTAATATTTACAATATGAAATACA TACCCTTTGATACATCATGAAACATATATTCACATGGTATCTATATAATA TCATAGTTTTTGATAGTTTTTTCTAGAAGTTTGGTCAAAATTTTCGTAGT TTGACTTTTCAAAAAATAGGCCTTAAGCCTTGGGACGGAGGGAGTACTAT ACATTAATGTTACTGTGATATTACTGTTGCAATTGCAATATTTCTGTTCT GTAGGACTGGAAGAGTATAATCTCCATGCTTCTGGACGAAACTCCATTGT ATGAGCTTACTGACATGGATGGAACCAATCTTGTTCGGATGCTGCGAGCC TCTGCTAAGAAGGCTGTTGGCGAAAGGATAGTTCCTGCAACAGACAACAG GAAGCCGTTCTATAATAAATCCCAAAAGGTATCAGTGTATTATCTGTGGC ACCATATATTTCTGGTGCAAAATTTCAATGATTGATCTCTCATGGATATT TTTCTTGGCCATTAATATTTGTAACATTGTCTAATTAATGTGCTTTAGAC TAATTATTTTCCATAGTTCCAGTTTGGTAGATTGTGCTTCTGAGTACATA AATTAGGTTTGTCCCTAGTGGATACTTCCAGTGGTGAATGTTTGGTTCCA GATGCAGAGAATTCTAACTTCCTAAAACAATTACGCTTAAGAACCTGATA TGCTTTTAAATTTGAACCAGAGATAATCCTGATAGATAGGTCAATCGGCA AGGATACTCATGCTATATAATGAAAACAATACTGGTTGAATATGATCACC CTCTGTTAAACACATTACCTTATGTGTTGATTGTTACCTTACCTTCTCTA TCACATAGATGTAAAGTCTTATAGTTACTCATGAGAAGCATCTTGATCCT ACACATTCACCTTAAATTGACTCTCTTTAACTTTCTTTTGATTGTTCCTT TGACTACTTGAGCTTTATATTTTGTGCTGTTTTTCAAATTCATCCTGGTC AACTCTAGATTATATAATACTACTCTGCTTACCTCTGCTGTTTATTTTCT TGTAAACTAATACTTCGTTCATTTTTATCTTGTTTCATTACTATTTTTTT TCTACAGGAGATATTAGAAAACAGCAAGAGCGAAATAACCAATGCCTTGA TGAAGAGGTACCCGCAGCTTTTGAGAAAATACATACCTGACAAAGCTAAG ATATCCCCTCTAATTGATATGATGATGCTTCTGAAACTTGAGATGTACTC ATTAAAAAGGCAAGAGCAGGTCAGTTGCAAAGCTATCACTTGGCCTTCTC ATTTATTTTATTTTATTTTATTAATAATCTTGTGTACATTTTGGTTCAGA ATTTCAAGGCTGCCATAGATCTCATCGTTGATGCTTTCTTCAAGCATGGT GACAAGGACACCTTAAGATCTTGTATCAGGGCAATAGCTTTCTGTTGTAA CAATTGTCAGGCTGATCTTCTACATTATGCTGAAAATAAACTTAAGAATC TTGAAGATGAGTTGGTTTTGAAAGTCAAAACTGCAATCAAGGAAGTAGAG GTATGTCTTGTTCATGTTGTTTGTGTCTGCACCTAAGCCATGAAGATAAT CTGACAGTATCAACCTTGCAGGCAGGTGACGATGAATACTCCCTCTTGGT TAATTTGAAAAGACTTCATGAACTCCAGCTGTCAAAACCTGTTAAAAATG ATGGTTTATTTGAAGATATGTATCGAATCCTCAGTCATCTAAGAGAGATG GATAATGAGGTATAACTCATTATATTTCTGAGTTATTAGCATTTCAATCT TACTTGTAGAGTCAACTTTAAGTAACACATTGAACTAATACTTTCATGCT TTATATTAGGTAAAGAGCTTTCTCCTCATCAATATGTACCTTGAAGTAGC ATGGTGCCTGCATGCAATTGATGTTGAAAACCCATCTGAAACATCCATCG ATGGGCTTTTATCCAAGCAAAGCTCTCTCTTTGAACAACTCTATTATTTC CTGGTGGTTCTGCCTACTTGTCAGAAAGAGGGAAGGAGCACGACTGTACT TTCCTGTAGAGTAAGTCTTCTGAACTGGACATCAGCAAACAGAGAGATAT GTTATTTTCATAGCATTGGTATGTCTGCATCTAAGTATATTGACCCATTG ACGTCCTTCTTTTTCTTTCAGGTCTGCATCATTACTGCAGAAATGTGGTG CTTGTTTAAGAAGTCAAAGTATTCTTCAACAAGGCTAGAAAGTTTGGGCT ATCTCCCACAATTGGACGTTGTTCAGAAGTTCTGGAAACTATGCGAACAA CAGCTGAATATATCAGGTTTTCTTGTTGCACACTTTCTATTTCATTATTG AAATATCAAGTCCTGAATGAAGCTTTCTTATTATGTCGTTTTTTAATTTG ATTGCTAATGACTGAAATTGAACAAATATCCACCCTCAGATGAAACAGAA GATGAAGATGCAAATGAAGAATATATTGAAGACACAAATAGGGACGCCGT CATGATTGCAGCTGCAAAGTTATTGCTTGCTGATACAGTTTCAAAGGTTT GTGCTGCATTTTCTGGCTGTGATAGGTTCTCGAACAACACTCTTCTAGAT ACATTGTTGGACTACTTTCTATTACATCAAAATTGGTTTGCGTTGAGAGG TTCCTATTGGCAGATAAATAAGTTTTGATCAATTTATATTGTTTGCAGGA TTATCTTGGCCCCGAGATTGTTTCACACTATGTATCTCATGGAGCAAGCA CAACAGAGATCATCAAACATCTCATTACCGCATTAAAGAAAAATGGAAGC ATCGATATAGCTGCTCTATTCTTTGAGGCATTGAGACGGGTAGATGCTTT GCTTTTATCTTTGAATGCACATTATATTTATTCATGACTATATAAGTGGG TCATACCAATATGGTGTCTTATGAATCTTATTTGTTTTCTTGTACTCACT CCGATCCATATAAGTGCCGCTGATTTGTACTAAATCAGCGACACTCATTA TGGATCGGAGGGATTACTATTATTAGGTTATAACACATCTCAAAAGAAAT CATAACACCGGGAAATTAGGCCCATCATGCACTATTGAAGATGCCATTAG TGATTGAAAATTAACTGATTGTGAACCAGGAGCTATCAGCCTCCTGTTGG TCAAAGTGGTTTGCTATTTAATTTTTTTTCCTGTCAACATTGCTCTGTCC ATATTTACAGCACTCAACTGGTGTAGAGGTGTTTGCTATTGTTATTCTTT CAGTGTGCTAAAGAAGCTTGTCCAGAATATGTGCACTGTCTTGGATGCAC GTGCTGACAGGAATTTAAGAAAAATAGTTTCTGGATTTTATTTTTAACTC ATTGTTGCATGTTGCATTTGATTTTGTTAATTTATCTTTCCTTTAGCCTA TGTTTATTAAGTGTGATCTTTCTTGTGTAAATCATTCTTTATGTTTCATG TAATTAGGCATATGAACGGTATATGGCTCATGTATACGATGGAGAGAACC AAAACCTGATAGGCAAGTCCTATTCAGAATGCCAAGATCTTTCTAATCGG CTTGCTGGAAATTATGTTGGCGCTGCTCGGAATAAAAACAAGTCTGAGAT CTTGAAGATTATCCAATGTGGCATTCCATATGCCTTTGCGGACCCTCCAA AGCAATTGTCTTTCCTTGAGGCTGCACTGATGCCATTTGTTTCTAAACTT CCCTCGTCAGATATGCCAGACATGTACGATATTAACTCAATTAATTTTGG TGCCTCCGATGATTTTGTGCTTAATTCAGAGCTATCTTCCTTGCATGTAG CCTGACAGATGTACAAAGGAGGGCACAAGAAACCAGTACGAATGAAGATC CAAGTGCTTGGCGCCCGTACTTCACCTTCGTAGAACACCTACGCGAGAGA CATGCAAAGAACGAGGTTTTGCAAGGTGCGTTGAGCTTTCTCTTTTTGTT CCAGCGCTGCACAAAGCTTTCTTTTAGAAATTGTTGTTGAGTACTGTTTC TGATCCAGAGGAAAAGGAGGAAAAGCTTGTAAAGCGCAGGGGCCGCCCAA GGAAGGTTAGAGATGAACCTGCTGCGAAGAACCTTTTTGACGGACACAAC TCTAGTGACGAAGAGTCTGTAAGTGGCTCTGACCAACGGGGGCGCGGAGA TGACGACGAGGACGACGACGATGATGCTTTTGACCAGCCATTGATCAACA CGTTTAGGCCCTCTGCGTCCAAGTTAAGATCACTGAAGGTTTCTCAACAA GGAACAAGCAGCCAGAAAAAGGCTCCTATGGCTTCAGGTAAGGATCAGAA TCTTACTAGCTTTTACCAGTTTAATATCATGCCCTGAAATGAGGATACGT CTTTGTCTTTCCATTTCCTGAACATAGCATGTAATTTCAGGAAGCAGTGG CTGATCGAGGGGATGCCTTAATTTGGTCCTGTCTGTGAACATTCGGGCTC AAATCAAATTTTAACAGACGGAGGGAAGGACGGCCTTTGGTTGCTGTTTT GTGTTTTAATTGTTTGTTTAGGCGTTGTAGATGATTGTACTTAGATATGC CAACACTTGTGTAAGCCATGTGGTAGGTACTCCGTAGGTTTGTTTCTGTT CCTTCCCCATGTATATCATCTTGTGTAGTAATCTAAAGGTGTAATTGGTG CACCCCTATGGGGCTATCACAGCGATTCAGTGTTTTGAACCGTTAGATCG GGTCCTAAGACGAAATCTGGGCCGTTGCCCTGTGGTAAGACGGTTTTATC CAGGTGAACAGTAAAAATTTAGTTTGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.