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GrainGenes Sequence Report: AA005533

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Sequence
AA005533
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005533
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGACAGAATCCGATCCAAACCCTCAAGAAAAAAAAAAGACAGAATCCGAT
CCAGACAGCCGCTGCTAGGCAAAGCACTGTCAAACGGATCCACTCGCCGG
CGGAGGTAATTCGTGTTCCACTCGACAGAATCCGATCCAGACAGCCGCTG
CTAAGCAAAGCACCGTCGAACGGATCCACTCGCCGGCGGAGGTAGTTGTT
TACCATGGAGGAGGAGCTGCGCGCGCTTCTCCGGGACCTCGATGCGCTCA
AGCAGCGTCCTGACCCTGCCTCCATCGATCGAGTAACCGACCCGCCGCTC
CGTAGATCTTGATCCTTCCCTTTGGCGACTGTCTCATCTTCTTCTCCATG
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CAGACGCTTTCTGAAATAAATCCTGATGTTTTGTTGGAGGTGAGAACAAT
ATCCCTTTGTTGGAGTAACAATATTCCTGCTTTCTTGTGCAAACTGACAT
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TTGGTATCGCTCTTATTATCAGCACTGATATCTTCCTGATATTGTTCTAT
CACACTTTACATAGAAATTCTACCATCCACCTTGTCTTCAAAAGTTGCTT
TGCATTCCCTTATGCCTGTATATGAGTTGGAAAACTCATCCACAATATAT
TTTGACTATCATTCCTGTGTTGTTGGTAAATTGAGGATGAATACTTTTGC
AAGAGCATGGTGGCCTCTTTGTACACAAGTATTTGACAGGTCTGATTGAA
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AGCGGCCCAGGCTTGTGGTGGTGTAGGCTACGACCAAGAAGGGGCATGTT
GCCCAGGAGTCCTATTATTATATTCCTATGGAAAGAATTCAATTCGTAGT
TGGATTGGATAGATTGCCCTTTGCAAGAGATGAGCTTCGTGGTGATCACA
ACTTGTCCATATAACCTCATGTCCACTGAGCTGAACTCTCCACGGAGATT
TTCAACGTCCCCCAGTATTGGATCCAATGAGCAGCACCGCAGTACATTGA
TGTTCCTGTTACTACCCCAAGAACTAGCGGCATTTATGGATGAGCTTCTT
AGTGAGTTTGAAGACATCTTGGATAACATTGCAAAGATTGCCTTCTGCAC
ACACAACGCCCACTAGGAGTTCCTGGTCATGTCTTGTAGTTGTAGCTTGA
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CCCTCTGACGTTTTGTCCTTGTTTCTTTGATGATATTCTGATATACAACT
CATTATGGTCAGAATATTTCGCCATCTTTGTGCAGTTTTTCATGTCATGC
CACAACACTCTTTCTCAAGCGCTCCAAGTGCATCTTTCTGATATACAACT
TAGGGTGCAGTTAATCCCGATATCTGGGCTGCTGATAATGTCGTGTAAAT
CTGTGCCAGGCCTATTTTTGTTGTCTCTATGGAACTAACCTGTATGGTGT
GGTAGTGTAGTGACGGCTGGCTTGAGGAAACCCTACATCTGGGCAGCAGG
TATATATAGAGAGCTCCAGGTATGGGCCTCATGGGCCAGAAGATAGGGTC
CAGTACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCAAGATGGGTGATATA
TATCGACCATTCCCATCTTGTCACAAGCTAAACTTCATTCTTTAGTCCCC
AGCCCCTTTGTCAAACAATCTGCAACCTGTTTTTCTGAGCTGACATGAGC
AATCTTGATAATCCCAGCATCAGGTTTTTATATTATGATGAAGAACCGAT
CAATTTCCAGATGCTTAGTTCTTCATGTTGAACTGGGTTATTTGCTATGC
ATATAGCAGACTTGTTATCACACCAAACATTTAAGCACCCCTTCCTTAGC
ATTTTCAGTTTGGCCAAAATATTCCTAACCCGCAACATTTCACTCAGTCC
AAGCAACATTGCTCTCTATTCTGCCTCAGCAGTTGATCTTGATACTACAG
GCTGCTTCTTACTTCTCCAAGACACCACAAGACACCAGATTCCCTCCAAC
AAATACACAATAGCCAGAAGTAGATCTTCGATCATCTAGACAACTGGCCC
AATCAGCATCGCTGTAGCCATCAATCCCTAGTTGTCCATTGTTTTTGAAC
CATAACCCTTTACCAGGGGCCCCCTTCAAATATCTCAAGATCCTATGAAC
TGCCTCGAGGTGTCCACTACTCCACTTCATGTTTCATGCATATATCTGCT
AACAACACTTACTGCATATGCAAAATCAGGCCTTGTATGGCATAGATACA
GTAACCTTCCCACAAGTTTCTGATAACTTTCCTTGTCAACAAGTTCACCA
GATTGGGCTGTTACCTTGTGATTTTGATCAATGGGAGTGGGAGCTGTATG
ACATCCAGTCACCCCCATATCATTCAGGAGGTCCAAGGTATACTTCTGCT
GAGACAGTGATATTCCTTTGCTTGATCTGGCAATCTCCATGCCTAGAAAG
TATTTCAGCTGACCCAAGTCTTTCACTTCAAATTCTTTTCTTAAACTCTC
TTTCAGTTTCATTGTCTCTTCCTCATCATCCCCGGTGATTATGATGTCAT
CCACATACACTGCTAGAATGGGGATCTTCTGTTTAGTATGCTTATAGAAG
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AAACCTATTAAACCAGGCTCTCGGAGATTGCTTCAGACCATACAGGGATT
TTTTCAACCTACACACCTTGCCTGCAGTTTCAGAAGTACCAAATCCAGGT
GGAACTTCCATATACACCTGTTCCCGTAAATCACCATGCAAGAAGGCATT
TTTAACATCTAATTGATGCAGTTTCCAACCGAAATTAGCAGCAGATGAGA
TCAGGATTCTCACAGTGTTCATCTTTGCAACTGGTGCAAAAGTCTCATCA
TAATCGATGCCATATGTTTGACTGTATCCTCGAGCCACCAGCATTGCCTT
GTAGCGTTCAACCTTCCCTTCAGGATTTTGCTGCACCGTATAAATCCATT
TGCAACTGACAACTTTCTTTCCCACTGGAAGATGTGTTGTTCTTCCTTAA
GGCTTGTTCTTCCTTAAGGCTTCCAAGTCTTGTTCTTCCTTAAGTCTTCC
AATTCTGACAACTTTCTTTCCCAAGTCTTGTTCTTCCTTAAGGCTTCCAA
TTCTTCTACCATTGCTTCACACCACCTTGGATCCTGCTTTGTTGTCTGCC
AATCTCTTGGAATTGACACAACTTGAAGAGACGCCACAAATGCTTTGTAT
GAAGGGGACAAAGCATTATAAGAGACATAGTTACTTATATCATGTTCAAA
ACTGTACCTCTGTACAGTTTTTCTTGTAGCTGCTCTATCCCTTCCCTTTG
TGCAATTGGCCAATCAAGGTCAAACTGAACTCCACTAGAAGAATCACCAT
TTGTATGTGTTTGCTCCCCCTGAACTTGTTGTTGCTGTTGCTTTCTTGTA
TATACTTGAAGATTCTATTCCTCATTTACCCGTGGCCACCGCTGCACATT
ACTTGGTGCATTAGTGGTAGCTGGAGTAGTAGGAAGTATGCCCACTATTG
GCTGCATCTTCTTGTCAGGACCTCTCTCCTGCACAGGCTCATCCACGCTA
TCAGTTTTATTTAAATGTAGACTTGTAGTCATACCTGTACTTGTCTTCTC
CCCCTCTTGACCAATGCTCGCAGGCTACAGATGGTCAAGCTCCTCAAACA
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GTGACGTCCATACTCACAAATGGCTTTCGGAGGGACTCCAACACTTGTAG
CCTTCCTGGATAGAAGGATATCCTATGAAAACACACCTCACAGCACGAGG
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GGAGATATCAAAGCAGGTGCATCCAAATTTGGAGGAACAAGAAATTTGTT
TTCTCCTAACAACAACTCTCAAGGAGATTTTTTTTTTTTTTGCGAATAAG
GAGATTTCATGCCTAGTACCTTGGAAGGGGTGCGATTTATCAAGTATGTA
GCTGTCATAACAGCTTCACTCCACAGAGATTTTGGTACATTTGTGGTATA
CATAAGAGATCTTGCAACCTCAAGGAGATGGCGATTTTTCCGTTCCACCA
CACCATTCCGTGGAGGAGTATCTGGGCAAGAGGTCTGATGGAGAATACCT
CGTTCTGCCAGAAAAGCTCCAAACTCCTGATTCACATATTCAGTTCTATT
GTCACTCCTAAGCACCTGCACTTTGAATTGAGTTTCCACGTATGCATAAT
AATTCTGGAAACATTTCAGAACCCTCATTCTTATGACGCAAGAGATAGAC
CCAGGTCATGCATGAATAGCAATCAATAAAGGTAACAAAATATTCATTCC
ACTAATAGATGTCACAAGACATGTCCACGCATCAGAATGAATTAGCATGA
AAGGGGATATACTTCTGATCCCCTTACTCACATAGGATGTCCTTGTGTGC
TTGACATACTCACAAGCATCACATTTCAACTTGTTTAGACCTACACCACA
CATAATGCTCGGAAATATCTTCCTCATTTTATCAAAAGAAATATGCCCCA
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GCACACAAGTCTTGGCTGACCAAGACATTCACGATCCATATACCATAGCC
CTTTACGCCTGGTTCCAGTCCCAATCTTCTGTCCAGTTTGTCTCTCCTGA
ATCACACAAAAGTACTTATCGGTGACATGACAATCCAACTGATCAATTAA
GCAACTAGAGACACCAAATTTACAGGGAAAGCAGGCACATGAAAAACTGA
AGACAACTTAATCTGAATTGTTGAGCAGTACCATCAGCCGTTTGGATGGT
GTATTTATGAGTTGGGAGGTGTTGATTATATGATTCAAACTCTCCAATAT
TACGAGCAACGTGTTTTGATGCTCCAGAATCCTATATCCATTCAGGGTCA
ATTTCATGAGCAGCGAAGCTTTTTCGGCATTACCTTCATTCGTGATGACC
AAGTGGCCAAAGTTCCCAAACACATTTTCATCTAATCCACCACCTCTTCC
TCTTGCTCCCTGGGTGTAGCCTCCTCTGTTGCGTCCTCTCCCCCTGCCAC
GCATCCGGTAAGTTGGGCAGTTGAACTGCAGATGACAGTTCTACCCTCAT
TGGAAGCAGTCCCTGAATTCCTTCCTCAGCCATGAAGTAGGCTGGAGATG
GAATGCTTTCACCTCCCTTTTCAAGCTTCAGCCTCACATCTTCTTGTGCC
ATTGCTGCAATAGTTTCTTCAAGTGATGGAAGATTGGGATGATGCAATAG
AGCTGCTCTTCTCCCTTCAAAACTTGTATTTAGTCTCTTCAAGAACTTCA
CCCGCCTTCTCTGTATACATTCTGCACTTTTATAATACTTTCAGGATCAG
TCAGCTCAAGTGGGTGACAATGGTCCAAATCAGCTCACAAATGTTGTCTT
TCAGCAACATACTCCATCAGAGTTTTATCCCCTTGTTTCAAGTCTATCAC
CTTTTCCTCAATCTACACCATTATCACATTACCCTTCGCTGAGTACAGCC
TGGACAATGTGTTCCTTACCTCATCAGCCTTTAACAAGGCGTCCACAGAT
GCAGCAATGGTTGGAATTAGGGAGTTCAGAAACCAAGCTACAACCAGCGA
GTTTGTAATGCTCCATTTCTTCCACTCAACACTAGCTTTGTCTTCTGGTT
CACTCACCTTTCCCAGCACACATCCATCCAGATCCTTGGTTCGCAGGATC
AGCAACGCCCTTCTGGACCAACTCAGATAGTTCTTGACACCTTTAAGCTT
GATGTCATTTGGCATGAGCTCAATCCTCTGGACTGTTTCTGCTTGAGTCA
CACCGACAGGAGTACGCCTCCTGTCTTGGAGGAGAGAAGCTCTGCCAGCT
TCTCTAGTGCCATGGACAAACTTTGCTGACTTTCCCCCATACTTGTGTCT
TCCTTCACCTCCTTACACCCTCAGCCTGCTGACAGCTTCCCCTTTGCTCA
CCACCACCTTCAGCCCCAGATCCACTGCCTCCTGCAGCAAATCTGTCCCT
TCTCTTCCTTACACCACCAAGGAGGTGCACCTCCCTGCTGATGTCACCGT
ATGGTGTTGCCACTGATGAACCTGGCTCCGATACCATGTTGTCTCTATGG
AACTAACCTGTATGGTGTGGTAGTGTAGTGACGGCTGGCTTGAGGAAACC
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AGAAGGTAGGGTCCAGTAACTGTCCAACAATTTTTGGTTCAGATACGGGA
GTGCAGCTAGTATGTATTGATGGCCGCGTATTGATTGACTGTATGATGAT
GGATCTAGTAAATTGATGGTGTTTTTCTGAATCTTCCCATCTGATGAGGC
TGTTTGTGATGCGCCGTGGACATCAATAAAGGGTTAGTGGACCAACAGTC
TAGGAAATGATGTGAAGGAAATTTATCGGTGACGTGCACACACCCGCATC
TCAATCCTGTCGTCCTGCATATGAATGTGTTGCACCTCACTTGTCGTGGT
TGACGGGTTGATGCCTCGATGGCACGAAATAGTTCAGTGATCAGCAATTC
GGACAACAGGAATCGCCGGGTGCAGCGGTGAGCAGCAGCTGCGGGGCCGA
GCAGATCCAGGGCTGGTCAGGATGCAGTGTATGCCATGGTCCCTGATCAT
CTCGATGGTGCCTGTGAGAAACGCGGCCAGATGGTCCACTCCACTCAGTC
CTCAGGTATATAAGCACCCGACTCATGCTTGAAAGGGTTCCGTTCCACAG
TCAGACAAGGTTGGGAGTTAGCTAGTTCAGCACATAGAGAGGTAAAAAGG
CAGAGAGAGAGCCGTCCTCCATCCTGGCAAGGAGAGTTTTTTGTTGTAAA
CTCCGTGTGATCCACCATATATAATCAGACAATCAGGTGGTTTTACGCCT
CTCGGCAGCCTGGACCTGGGTAAAGAAGTCCTTGTATGTGGAGTTTGTCT
GCTGCGTGTTTGCGCCCTTAGCCTAACCAGAAAGGGGGTGTCCTCATCAG
CGGTGTCCACGAACGCACCCGAGAAGTGTGTGTTCCATGTTTGTCTCCTG
AACTTTATGCTTTGCGTATGCTCTGGCCGCTACATGCAGCTGACGCTAGC
TGACTTGATTCATCGTGTTGCTCGCACTTAGTCTGGCCAGTACTTTGGTT
GGTCCATGCATGCACCTTCAAAACTATGCCATGCTAGCTGTGTACAAAAT
GACGTCGAACACAGATGGATTGGGAAACGGCAGGTAGCCGCAAAGCCAGT
GTATTAAATGGATGGTATGGAGCCGGAGGAAATAAACTGTCCAGTCCATG
TTTGCCAACATGACTTGCCCATGAACCAAAACGTCTGTGCCATCGGGTTC
TAAAGGTAGCCTGTGTACGGCTGAGAAGATATGTACACCCTTGGTTGCAT
TCTTGCATTTTTTCCATAAAAATACACTACATTCTTAGATCATATACGTC
TGACAGAATAGATGCTCTGTTACTTATACAACTTGCCGTTGGTGAGAAAT
GCACAATTTAAATCATGACGGAACTTAATCTTCATTTCATGCTAATATTC
TTCATTCATAATAATCCCATCAATGTGAAATGCACTTGACACGCGAACTT
ACGCACCAGGTGTTTCTGAAGATGCTGTTTCTGGTCATATACAGCTACTG
ATTCCTGGTGAAACTGCATGCTTTGCATGTGCTCCTCCATTGGTACGTTC
TATGTATCTTCAGTTGTATGCTCTCATTTGATACCTGGCTGTGTTCTGTT
ATGCTTTTGATTATCTTAAATTGTAGTTAAATTAGTCTTGGCAGTTCATT
TAGTTTCTGCCATTTTTTATTCTGCATAGTTGTTCTAATTAGTTGAGGAC
CTGAGGTGCCCCTATGCTTTTCCTGTATTTGCATTCAAATTTCTGTATCT
TTTGCTAACTTGTTTGTGGTACCTCTTCTTATAGGTTGTAGCATCAGGGG
TGGACGAGCGTACACTTAAGCGAGACGGTGTTTGTGCTGCCTCTTTGCCA
ACTACAATGGTGAGCATTTTAGTTTGTTCAATTTTTTTGTATTGTTTCAG
TTGTTTTCTCAAACGACAACAATTTGCGCAAAGCTATGTGGAGACCTTGT
TCTGATTAGGCACATTCTTGTACTTTTTTAGCGACTATACTTGTGACACT
AGGATTATTATTTTTGTTTCGGGTCTACTTGTTTAAAATCTATGCATATC
TACTGTACCTTTTGAGTGCCAGCCTATATTACTGGACATTTCGTTCTAAT
TAATCTAGCATAGTTGGACATGTTCTTTGCAGGGTGTTGTTGCTAGGACA
CTAGGACTATCCTTGCAACATTTCTCCTGTCCCTATTTGTTTTGGCTGAT
GAACATGTTCTTTGCAGGGTGTTGTTGCTGGCCTCCTGGTCCAGAATACT
CTGAAATATCTGTTGAAGTTTGGACAAGTTTCTCCTTACTTGGTAATTGC
TTGATTCTAACTGTTCTGATGCTGCGAAAGCTGTTGGCATGTTTTAAATG
ACATTAAGTTGAGTTATCCTTTTTTGAAGAAAATTGTCACAAAAAATATT
TTGTTAGTTTCATTTAGGCTCATTTTCTTGACTTGCACTTTTCACTGTTT
CCCGCTTGACTTGCACTCTTCACTAGTTTCTGTTTGGGTTTCATATCTAG
CCTACCCCAACTTGATTGGGACAAAAGGCTTGGTTGTTGTTGAATTTAGG
CTCATTTTCCGTTCCTGTGTAAATACACAAGACCATAATATAATTTCTAT
TTTCAAGGTTGCGTCATTGTGACACATGTTTATCCATCACATTCAGCCCA
AAATTCTGAACATTTGCTGATTTTCATATTGTTGTCATGTCTTCTTAATT
TTGCAGGGATATAATTCACTTAAGGATTATTTCCCAACAATGGAAATGAG
ACCAAATCCACAATGTTCAAATCCAGCATGTCTTGAGAGACAGGTGTTTA
TTTTCTCACATCCTTCCTTTTCTACTCTTTGCTACTCCCTCCGACCCATA
TTAGTTGACTTCGATTTTGTCTAGATTTGAATGAATCTAGACACTATTTA
GTATATAGGTTCATCCAAATTTTGACAAATCCAAGTCAACTAATATGGGT
CAGAGGGAGTAGTTAAAATGGTGACTGTTTCCTAATGACTTCATGGTGTT
CATCATATTGTAGAAAGAATATATGCAATCAAAACCTGCTAGAGATGCAG
CAGCAAAGGCTAAGATGGAAGCTGAAGCATCTGCAGCAATCGAATACCCG
GTTCACATAGACAACGAGTGGAACATTAGGTACATCAGTCCACGTGACTA
TTGTGCTTTGTCGCCTTTTATTTCGTTTTGCCTCCCCTGTTGTGATGAAT
TCCTGACATATACAAATACCAAGCAGATTTTGTTGTAAATGTAATTAGTA
CCAACCAATATAATTAGGATCTTTCTGGTCTGACTTTAGATAGTATGCTA
ATTGTTCTGTTCAGAGTTATCTGCAGTTCCATACCTAGTGGAGCTAACAG
CATATTCTTGACATGCTTGATGAACTGAATATCTACTGCAAAAGTTGCAC
TGGTTTTCTTACTTGTGGTGTTTGTTTTTTCCTTATTCAGTGTTGTTGAT
GATAACGACACAGCGCCGTCAAGCATTCTACGGACTGCAGCAGGTAAATT
AAATTCTAAGAACGAAGTATTTCCTTATTTACCACCCTCTTGATGTATTT
TACCTCGTTTGAAAATTCAAACAGACAGCCTTCCAGAAGGCCTTGTCCGT
GAACTTCCACATGAAGATTCCTATGTAGAGCCACCTGCACAAGCTAGCTC
TGGTGCTATCGATGATGATCTTGAGGAGCTCCAGCGGCAACTTGATGCCT
TAAACTCGTCTTGAACTCGGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.