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GrainGenes Sequence Report: AA004356

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Sequence
AA004356
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004356
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCCTCCTCCGTCTCTGTTGCGGCGGAGTGGGACCTCCTCTCCGACCG
TTTCTACCGCCGCATCACCATCTATTCCCCCTTCCCTGGTCCTCCCCGTC
CACCACCACTGCCTCGCGGCAGTGGCGGGGTCGGCCGCCTCGACCTCTCC
ACCCACATCGTCGCCGCCGCGCCATTCGGCGGCCCGATCGCCGCCGTCCG
CGACGACTCGAAGATCGTGCAGCTCCACTCCGAGCCCTCGCGCCGCCGCC
TCCTCCTCTTCTCCTCTTCCGGCCACCCCCTCGCTTCGTCCCCTTGGACG
CCCCACCTTCCCCGCCTCCACTCGCTCGCCTTCTCCAGCTCTCTCAATCT
CCTCGCCCTCCTATCCGATGGTTCCCTCCTCCGTTTCCACCTCCCCGATC
TGAAACCCACGCCTAGCTCTAGCCCCGTGCCCCTGCTCCCACCTGCCTCC
GGTGGCGTTGCCGACGCTGTTTTCTGGGGAGGTGGCGTGGCTATCCTCAC
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CTGCTTGCAGTTGGCGATCGGGTAGTGGCAGTTGATGAGGATGGCGTGCA
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ACTACATTGATTTTTGGTATTGGAAGCATGTCTCCAGCAGCATTACTGTA
TGATGCTAGAGACCACTATGACAAACAAAGTGCCAAGGTAATGTTTAATT
CCTGTTCTTATGTTGATAGCGTGTGCCTTTAATGATAGCATATCTGCCTT
TTACTGCTGGCGTCCACTTGTTGCTAGCTTAGTGCTTACGCTTAGTCACT
TGAGATGATGTGAATCATCCTTGATTCATGCCTTGATAACCACTCCCTCG
TTCCTAAATATAAGATGTTTTGCAAGTCAATTTGGTTTACCAAAACATCT
TATATTTAGGAACAGAGGGAGTACCTAAGAGATAGTAAATAGAGGAGATA
TTATTTCTGCTTGCTTGGCTGTACTTAAGCTACTAAGATCCTTCAAAGGG
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AGCTCCCGTAAGTAGTACCCCCTACTGTTTTACCCTTACTGGACTCTACT
CCTTTCTTACTCGCCGTAGACTGGATTCATGTCACAATGCTGTCATAGAC
TTTGTCGAATGGTACCAGGCCAAGGTAAATAGCAGTAAGTATAGTCTAGG
TATAGTCAGAAATATTGGCAGAGCTGCCTTTTCTTCTATAAATACATCGA
CAACAAGAAAATAAGAATGTATCCATCCACACTGGTATAACGTTCAATAT
GACTCAAATTAAACATAATACCACATGATTCAGGTCAGCTCTTGCAAATA
GAGCCTTATTGAATAGAAGCATTTCCTTGGATGAGCATTTGGACTATTCA
TACTTGACTCCCTTCACCAAGAACACTGGATTAGTCACGGAAGAACTTAC
TCACTGACATTAGCGGATTAGTCATGTATGACTTATGCTCTTTTTTCTCA
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AAAACTGCACCAATTAAAATTGCTGGAACAAACAAATGCATGTAGGCTAG
ATGGTCTCCTGCCGCTGCATGAACTATACATATTTGCTGTAATTCCTGTT
AATACTCTGCTTTGTCATTGTGCTGCTGCTACTGGCCCTTGTGTACATAA
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CAAGTTGGGAAAGTGTCACCTGTGTAACTAGCACGGTGATAAGTTGTGAC
TCTTTTGGGTGAATTAGCATCGGGCTTGGGAAGAGATATCCAGCAGCCAA
GTCCGCTTGCTTACGGAGTGATGTCGGCAATGTTGCCAGGTTTGTGTCGG
TATTGTTTTCCTGATTGGTTGAGGCTGTTTCCAAGCTGAATTTGGTTGAT
GAATCCTCATGCTATCCTGATTGCGTAGCAGCATTAGACAAGTCCAGTCC
TTGTAATCTTGTTACTGAAACAGCAAGAAAGTTTTCAGAAGAGTATCGGG
GCTTCTTGCGACGGAAGGGGACATGCTCCACCAGCAAGGAGCGTGATTAT
TCGCTCCCGTGATACCATTTTCTCGCCAATTCTAGCTCCAAAGACCATCT
TCTTCCGTGTTCCGTCTCGCTCGCATTCCCTCTAGTTAAACCATAAGCTA
ATTTACAAAGATAAGAGGTGCGTGGTCCATGTGGTTCTTACTCAGCGCAA
TACTCTGAAGCGCTCTTTCGAGCTAATTCATTTTGCTAATACTTTCTTAT
AATTTTTTGATTTCTCCCACACAAAATATTAGTGGGTAAAATAGGGCTTG
AATGATACCCAATTTTTGGTTGTGGTGCCTACCTCAGTACTCCCTCCGTT
CCAATGTAGATGTCATTTTAAGTAATTGCTTTGGTTGGAATACTTGTCAT
TTCTTTTGTGGAGGCAACATTTCCACGAGTACTCCTATTAATTGCTTATT
GGGTTATTGGTGATAGTGCTTCTAGAGAGATGATTATTCAATTAATTAGG
GGAAATTATACCAAACCTACAACTTTAATTTCCTTCATTTTGGAGTATGT
GTTTGGAGCTATAACTACAAGTAAAATTTGACTAGAGGGAGTATACCATA
CAACATATGCAACAGAAACAATTTATATTTAACCACATCACCTGTCAATT
TTCATGTGCAATCTCACACCTGCACGGTAAGATGCCACATCTTGGGCTCA
TTGCTTATTTCACTTTTTGTTGGCATTTTTTTGAAGAGGATGATTGGCAT
TTTTTAGAGTGCACTTTATGGCATTCACCATGTACAGCTTGTGAATTATA
TCAGCACTGTTTGATATTCAAATATTAACCATTTTGGAAGTTGTTCTTAC
GTCATCTCATAAATAGGTCCTCTTTCCCCTGAAAACTAAGATGGGGTATT
AACAAAGATCTACACTCGCAGGCTTATGATAACTATCAGCTAATATCATC
TTCCTTGCCCGAGGCGATTGAAGCGTGTATTGATGCTGCTGGCTATGAGT
TTGATGTTTCACGCCAACATACATTACTTAAAGCTGCTACTTATGGCCTA
GCTTCCTGCAGGTTATTTTTTTTTGCCTGTCTTTGGGATGCTGGTTTTTT
GCATCTTTGTTTTCCTTATTGCAAGCAAGCACATGCTTATCTTTCAGCCT
TACTGTCATGGAACCAGTACATCTTAGTTATCAGTTTATTGCTTACTAGT
GCCAAGCTCAATCTGTATGAGTACTACATATCCTTGATATGTAAAACTTT
CTAAATTTAAGATTAACATATATACTCCCTCCATTTTCATATTAGAGGGC
TTACGCTTGTCACAGAGATTAAGATGCATCAGAAGTACTAAAAACAGTGG
ATAAAAAGACTACTATGCCCACATAAGAGTTTTTGGTGCAGATTAATGTA
CTTCTAAGGTGAAAAGCCATTGATTGAGCACTGCATGCATCTGCCAACTT
TATTCCTGTATTGTGGGTTCCCTATGGGCCTTTACATCTTGCATGATGAA
TGAAGAGAAGGCAATTGAGTGTAGAAAAGAAAAATAAGAGTTAATAGCAC
TTTGGTAGTTGTGTGTGCCCTGCAAAACGAAAAATCCTGCTCAAATTTAT
ATGCCCTATAAAATGTAAAAGCGGGAGTCTTTAACAAATGTTCCTTAGTT
TTTCCAAAAGTCAAACCAAGAGTGTCCTTGAAAAGTTTGGCCAAATATGT
TACTTATTGCATGACGTCTTTGCATATCTGAACTTCTTGGATTTATCGAC
CACCTTTGATAACCCTTGTGGACAACACCAAATACGGTAATAGTGTATGT
CATATGTTTTAAATTGGACACTAGTATTGATGTTCTGTTGCTACTGTCAT
AAGTCTTGCAGATAGGAGGGTTATATTTTACCACCTATGACCATTAGTTA
ATTTCTAACACTTCTCTGTAGGTAGTATTTCTCTGTATAGAATAATTTAT
TGCTGATATTTGAACTTGGTATTGATACCCAGTTGGCTTTGGCAGTCAAC
TTCGGCATGGACGCTTTCAAGAAATGTGCAAAATGTTACGAGTTTTAAAT
GCTATTCGTGACCCTGAGATTGGAATGCCACTTACCATTCAGCAGTACAA
GGTTTGTGTTGCTTCAGATTTTGTATAGAATGTTTCCTCTACCTTTGTTA
GATTTTACTATATCTTATGGTCCTTTTTTTTGTTCCATAGCTTCTTACTG
CAACTGTGCTCATTGGACATCTGATTAAAGCTAATCAGCATCTTTTGGCA
TTTCGCATCTCTGAGTACCTTAACCTCAATCCGGTAACCGCCGTTTTCAT
CTCCTTCACATGTTCTTAATAACTCACCATATGCACAATGAAGTTTCCTT
CTCCTTTCTATTTAATTGTTTTTTGGGGCAAAGATAATTCAGACACTGAA
CTTGTTCTTCTACTACTTATCGGAGTTTCAATGGATCTCTTAGTAGAACA
TCATGTTTTCGAACTATAGGCTGGTCTGAACTTGCTTTTGGTGAAGTAAA
TGTCCCGTGAGTTCTTAATCATAGCAGTGGGAAACTGGGAATACTTTCCA
CCTAGTTGTGAAAGCCTTGCACTAATTGCAATAAATATATTTGGTTAAGT
AATACCAGTTCCATTTGTACCTTAAATCTTTCGTAGGAGGTTGTAATTAT
GCATTGGGCATGCGAGAAGATAGCAGCATCAGCTGCAATTCCAGATATAG
TCCTTCTTGAAAGTTTGCTTGACAAGGTTTGTGTTTCTTATAGTCAGACT
CAATACTTGATGATGTTACCTGCCAATACTTATGCAATTTCATTTTGTTC
CTGCTTTACATTTCCTTCTTGCAGCTCAGGTTATGCAAAGGCATATCATA
TGCTGCAGTGGCAGCTCATGCAGATAACACTGGCCGGCGAAAATTGGCTG
CCATGCTTGTTGACCATGAGTCCCAATCCTCGAAGCAGGCACGTTTTTCT
TTTGACTTTTGAGTAAGGTTTTGTTTTGGCTTGTGAGTAAGGTGGATATA
TGTTATAACTTAATAAACTAGAAAATACCCCGCACGTTGCTGCGGAGCAT
TTTGCATTTCATAAATAGTGTGGAAGAAATATTTATATCCAAAGATGAGA
ATGCATATGAAATTGAATTAAAGATCTTGAGGCTAACATTTTGGATGTCA
TAGAAACACAAATAAGTCCTCTAAAAACACAATTAGGTATATGTAAACGT
AATAAGAGCTATCACAAAAATGATGTTCTCCCACCCAATAGTCTCTTCAG
ACTTTTACACCACTGTAGTTTACATAGTAAAATACTACTTTGGTCTATCG
TCCATTTACAATGATCAATGTGCACTCAGCTCATCTTAAGTGACCTCAAA
AATAAAATAAAAAGATCCTTCGTTCATTTACTTTTTGGTCTTGAAGCAAT
TGTACTTATGGCAATGATCTTGGATTGAAGATCGCAAATTTGTACCTAGA
GTATGGACCACCATGTAGTAAATGAACAAAAAGCACAAACAATGGATGAT
AATGGAGAGCAAATAATCTTATCTCAAGTAGTAACACATCAAAACTCCTG
AGAACCAAAATCTCAATCCATATCAATGGCTAGCTTGATCAAGTAGAATC
ATGTGTGAATTATTGGAAGGTCTTATTATATAAAAAATAGATTGATGATA
CATGCTCATGTGGGGAAAGAGCTTTTATCTGTAAACCAATATTAAAATTT
GAATGGTCATAGAAGAAATCACCTATTTTGCTCTCAACATGAGCACAACA
TACCATTTATTTACCTTCTACCATCAATAATCAATCATTCCAATAATGTC
GTTTGCTAACTCTAAAAACTGCAGCCTTATGTTTGTACCTGTAGCCTGCA
GGCATAAGAGAAGGCAACGCAATAACCCTATAATAAATTGGAAACCCCAA
AGATTCAACTACTAAGTGATTTTTTCTGTCACATGTGCGCACTAAAAGAA
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CAAAGCACACGAGCTCAACACATACTCGTGATCTTGCTCGCCGGGCAGCA
TGGACCGTCTCTGTGACAGTTCATTGGAGGTGGCGGTCGGGGTCTCCGGA
TGAAGTCTAGCCTGACTTGTTCGGTGCCGACATCAGCGGTGCTTGAGGGC
GCCGTTTCCCTCTTGGGGGCGTTGTCGTGGAGCCCCGACACCCCTCCGTC
CATCATTCCGGGGTGAAAACCCAAATCTGGCTCGCCGGATTGGATGACGG
CGGTGTCTTCTTGACGTCGTTACCTCCTTGGAGGCGTCATTTTTCGGAGT
GTGCGGAGCCATTCTTTGGATGCTAGTGATACCGGTAGAGCTGATGTCTT
CGGGTTCTGTCGGTGTGCGAGTGCCGCTGGCGTGTTTGTTGCGGCCTGCC
TCTCGCCATGAAGCTCGAGAGGCCTAGCCGTTCCTTCGGATCTGACTTCC
TCTCCGGGGACGTGGACCAGGCTCTCGTAGCACTCGCCGTTGCCGTCGTG
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CATGTGTGCGGTTTTGCCTGTTCTTCCTGAAAAATAGGCCGTGTTGGTTT
TTCTCGTCTGGTTTCCCTTATAAACCAGACACATGTGTTTGTATTGGTTT
TCGGCCAGTTTCCCTTCAAACTGGCCAATTCTCTTCTAATAGAAAAGGCA
GAGTTCCTGCTGGTTGCTCTAAAAAAATACTCGTGTTGGAAATCCATTAA
GCACTTACCAAGCTTGAAACATGAAAGATGAAGGAACATAAGAGGAGGAG
GCAGATCTGGGGATTACCAGATTGCAGACGAATTTGCTTCTCTTATCTCA
ATTACTCCAGTTCAAGAGGAAGGTTTCTAATCCAGTCGGAACTCCAGGTT
GTTGAGCAGGACCTTCGTGGATCTTTCACTGTGGCGATCTACGATGAGCT
CTCGGGGAGAGTTGTGGGGGAAGCAAGCTTGGGGGGAAGGGAGACCCAGA
GCAAGCAGGAAATTGAAGCCGTTCACGGCAGGACCAAAGAGGCGGATGCA
TTTGTGTTGGACTGTTGGTGCTGGAGGGGAAAAAGAGGTCGGAAAGGTAG
TCTTATAGGCTGAAGAGAGAAGAGAAGGCATAGAGAAAGGTAACGGCAAG
GAGGGGAAGAGACGCAGACTGCAAAGATTTATACCATGCGCTTGTAGAAC
CAAGAAACAGCAATAAATTTGAGTTGATGAGATGGACTGAGTGACCTGGA
AGGTTACCCACTATCGTAGTGAGAAATTCCCAAAAGAAAATGAACGAAAG
AGTAACAAATAAGTTACTGAGGTGGCAGCTTGATGAGGTGGCATTCTTGC
ATGTGGAGAGAAACCCCTTAGCGGGTTGCTCCTATTTAGTTATTATAGGT
TAGCAATGGAGCCTTTCAGCACTTTCTTGTGCTCTGGACATTTTAGGCAA
CAGCTTTGAGGGTTCATGTGACATGTATTCATTATCTTCATCTTTTTGAG
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TTCAAATTTGAAGTATGTCATATAGGATTGTAGGTGGTATAGGCCTATAG
GGGTAAGGATTTATGAGTTATGACACATCATACTTCTCATTATATATGAA
GATTAAGAACAACATGATTCCTACAAGCATACATGAAATAATAAGATATC
TAATGAACATAGGGACAAAGTAAATTCTACCCTAATAATTTAGGTTGTCA
GGACTCGAGACTTCAGGTATCCTAAAGGTGATATTGTTTACAACAAAATG
CTTAGACTAACTATTTGAACAGAAGTATCATGGTTGTCCTGCTAGTCAGG
TTCAAGTGGAGGAGAGTGGCTATGATGTAACTACTTTAAGAGATTTTCTG
ATAAAATGTGTATTTTTTTGGTGCAATCAATCTCCATTTTAGATGATAGT
TTCGTCTTGTGAGCTGCCCTATGGCTCAGCTGATCTTTTACCTTGCAAGT
TGCTACTATACTGTAAGAATGTGTAAGAATAGGAGAGATTAAGTACTCCC
TCCGTTCCATAATATAAGATGTTTTGGCCTTTTTCTGAGACACATATATC
TAGATACCTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCATTTTGCTCCAAACCTACACA
CTAGAAGGCGTCTAGATACATGCGTTTTAGAAAAGTGCTAAAACATCTTA
TATTTTAGAACGGAGGGAGTAACTGCGTACGAGAGAGAGAGAGTTCATGC
CATCCTCTGAATTGAGAGTGGTGATACTGATCTTGTGTACCTTGTGCTTT
TCCATATCTGGCAGAAGGTAGCTGTAGAAAAGGTAAATTAAATGTCCCTC
TCTCTCTGAGAATGGTATGCCCAAATAAGGCACTTCTGCTGGGAATCGAT
AGGAGCAACTATGAACATTCTGTAGTTACCCGTTTGCCACCTTTGATCTT
CTAACTACTTCCTGGGAACTGGAACAGAAATGGCTTCCACTCATAAAGTT
CTTGGCAATGTTTGTTGACATAGTTCTATTTGCAGAACGCTCCTTTGGAT
TTTTTTGGTATAATCAATGCAAGGCCTTTGGCTAGAGATTTGTTTATGAC
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TTGCATATGTGATAACCTGTCTCTTACTGTCTACTGTTCTAATGTGTCGT
TTCCATATTATTTCAGTTGAATAATTTTGAAATGGGCTCAGTGAGATATT
TTGCTTTCCATGAACTAAGCAATTAGCTGTACAGTTAGTAAGATATGCTG
GAAGGGATACATGGCAAATTTAACGTGCTTCATTCAGTAGTATCACCTAG
CATGACTTGCTATTTTACATTGTAAATAAATCCAATTCCCTAACTATTTA
GAGCACTTGCAGGATGCTGCCTTTCTTTTGCTGAAGGAGTCGAGAGAATT
GGAGAAGAATCCAATGGCAAGCAAGGGGTCTCCTCTCCATGGTCCACAAG
TGAGGCTTGTTGAGCAGGCCCACAGGCTTTTTGCTGAGACCAAGGAACAT
CTTTTTGAATCTAAATCTGCTGAAGAGCATGCCAAATTGCTAAGGTATAC
GATGATTTATCACAGTATCTTGTGATATGAGGACACTAGCGCCTCATTTG
GGGACAAAAGTTACGGCGGTTTGGTCATTAGCATCATGCAATATCCACAA
ATGAGCCCTAGACTCTGGTTGGTGCCCAGTTCGTATAAAAGGGTTCATCA
AATGAATCAAAGCTTTGGGACACCAAGGAAAGCATAGCTAAATTGCCTAT
TTCACTCAAACATAACGAAACCAGTATTTGCTTCCCAGCTTGTAGGATAG
GCTCACACATCTTTTAGCTCACAAACCTCCATTTGCTCCCATGCTGTTAC
CAATTTTAGTGTGTGTTTATGTGTGTGTGTTGGTGACTTTGACCATTTTC
TTATTCTTATTCCTTACTCTCAGAGTGCAGCATCACCTAGAAGTTTCGAC
AAAGCAAGCAATTTTATGGGTTCTAGTGTCAGTGATACGATAAAAACTTG
TATTGCAATGGGAAATGACCGGGCTGCAGCCAAAGTGAAATCAGAGTTCA
AGGTATGGAAAATGTCTTCAATAAACTTCTATTTTTTCTGATGATTATTC
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GTGGTACTGGCTGAAAGCATGTGCTTTAGCAACAGTTGGTAATTGGAATG
CTTTGGAAACTTTCTCAAAAGAGAAGAAACCACCTGGAGGTAGGTTTTAC
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AAGTTCTTGTTTCTTTCATGTAAATTACAATTTTCATCGTAAAAACATTA
TTTCACTGTAGTAATGCTTCATGGTCGTATTATATCGTTGAATATGTCAT
TATCCTTATTTTTTTGTTTCCAGGCTATAAACCTTTTGTGGAAGCATGTA
TTGATGCTGGTCAAAAAACTGAAGCTCTCAAATATATCGTGAAATTAACA
GATAGTGCTGAAAAATCTCAGGTATGATTATTTATAACCGAAATCAACAG
GTCTTCTAACAAATGAGGGAGCATATTAGTAAGCATGCATATCAGAGAAG
CACTTGTCCTTTCAATTAGAGCGAATTCCACTTTATACCTCATGTTTGTA
CATTTGTGATAGGTTTTACCCCATGTAAAATTCTGGCACATTTTACCCTC
AAATTGTTACATTGTGTCAAGTTTTACTGCATTTACCATTTTTTTTCTGA
TCATGACTGGCCAGATGGGAAGCATAAAATTCTTTGGCATGACCCGCTCT
CGCCCGAATCCCTAACAAGAGCGAGCGTGCAAGCATGATAAGATAGACGA
ATTCCTAAGCCTTGAGGATTTTGTTTTTTTAACTGGAACATTTGGGAAGA
TATAGCTTGTTGGGGATGCAAATAAATCAAGTGGAACACGGGTAAAACAT
GTACAAATTTCAATACTGTATCAACCCTGGTTTACATGATACGCCACTAG
AAAGTCTCCCTGGTAGTTTGTATGTTTTAGAGCAATAGCACATCCGTTTT
AATTCTGAGCATTACATCAGCATAACATGCCCCTTGCGACAGTTTAAAAC
AGAACATTGAACAGTTCAAGTTTGAACTTACCAGAAATTAGGAAGGAAAC
AAGAAATTAACTGTACATAGACACTTCTTTGTTTTTCGCATATGCAAACA
CACACCTAATGATCTTGCCATCATTCTCCAGGCATATACACGTCTCGGTA
TGGATAAAGAAGCTGAAGCAGCAGCATTACAGGCTGCTGGCAATGGCGAT
GAGCTATTTAGTCGTCTAAAGTTTACTCTGGGACAGAATGCTCTCATTGA
TACGTTACGGGATCGGCTATCGTCATACTGAGATATGTGCAAGCTCATGT
CGCCATGCCTTCTGTTTGTGTTTCATTGTGTATCAACCCCCACCCGTGTG
AATATCCCATCCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.