Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA045244

[Submit comment/correction]

Sequence
AA045244
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045244
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCAGTCCGATGCCAGCAGCAAATCTGGCCAAGGGACACTGTACCGA
GGATACCAAGCTCATCGACTCTATCCTTGACATGGTGTGCAAGGAGCCTC
AGAAATCCGACTGGTTCAAAGGTATTAAACACGCTTCCCTGGGCCCTGGA
GAAACCGAGCATTTATCCTGTCCTTTTGTACTCTGAGCATTGCTTTGCTT
ATTTGATTACAAAATTAGTATTTATGCACCTGCATTACTCCGTTTAGACT
CACAAGAGATGAAAACAATGATTTTTAGTACACAAGGATAGGAGTATAAT
TAAGTTCATTACTAATTTACAACTAGATATTGGCACATTATGTAGGACAT
CCGGAGAGCAATTTCCCATAGTTTATGTATGTCTCGTGATGGTATGGGAG
CACATTGTGGTGCTCAGGTTTTGCAGGTTTGAATCTGTATCGGATAGATG
TCTGAACCGGTATACCACAGCTCTGATTATTTTTTCAGTCTTTGAACTCA
GTGGCTGAAGCTAACAGATCTTTCACAGCATCAATACATGAACTGCAGCT
TTGGTCCAACTTCTTTATTCATGTAATTTGCTGGGTATAAGTAGTAACTA
TCCAGATCTTTGAGTTCCCAAATGAAGGTGCTAATGCGTGTGTTAGTTCA
ATTCAATTAAATTATAGCTTTGTCTGATGTCTTATTTTGACAGCACACGA
ATTGATTATGTTATTTTTCTATTGTTACTAGGTTTAGTGTCAAGAAAGGT
CGGTAGCAATAAAAGTTGAGGCCTTTTGGAGACATTTCTCCAATAATATT
CATGGCTTGGTATTCTATGTTCTCACTTCTAATTGTATACATGCAAATAA
ACCCATAATGTCTTATCACAAACAGCAATGTGTTGCTTCTTTCATTCTAC
CACCTCATATTTTCTGCCACAATGAAAGTGTTTGGTTCAAGAGAAAGAAA
TTCAATAAATAATCATTGTTTTGATTGATGCAGCGTATGCACCGATCTAC
TTGCTGCTCAGGATTTACTATGTGTTCTGCCTTTACCTCTCGATTCAGGT
ACATGTATTGTTTAGATGCTTTTGTCAGGATATTCAGACATTGCATGCTT
TGAACGATCATGTGTAACGCATGTTGCTTATTGTGATAGCCCATTGTAGA
TGGATCTTTAGAGATCTTGTGTGCATCACGGTAACCTTCATTGATTATAT
TATGAGGTCTTACATGGTCTTTTTTCCCATGTAAGTTTAGTTTTGCACAC
AAATAAAAAATGGAGTTAGTTGTGGTCATGGAGCTGAATGTAGAGCTGTT
TGGCAGGAAAAGGCATGATTGATTGGTGGGGTTGGCCTATGTTGGCATTA
ATTGCCGTGTGTGATGCCATTTACTGTTGGAGGCGATTGGACCCACCGGG
GTAATATTGTTTGAAATTATTCTATAGCTTAAGCGTAAGCAAAAGCGAGG
CCTCTCGCGCCATCTGCCATGCCTTGGGCCATTGATTGCCACCAAATTTG
ATTGCCACTGACTGTGGGCCAGGGGCGGCAAGCACCCCCAAACCCAGCCC
CGCAAGGCTGTTCCTTTTCTTTTCTCCTCTCTATACTTTTCTTCTTCTCT
TTCCCTGAGCGCCCTAGGGTTTCCGGCCGCCGACGTCTGCCTTCTCTTCT
CTTCCGCACCGCCTTCTTCCCCGTCGACGCCCTCCTCCCCCATCAGAAGC
CACCCGACAAACTCATTCCGGTGAGTCGGAGGTGAGTCCATGTTTCGTGC
TGCTTTTCCGCCGGTGGATGAGACGCGGCGGCTGAGGCGTGGGGTCCTTT
TAGTCTCAAAGCTCCACCGCTGTTTGGATTCGCCGAGCCACAGGAACCGA
ACATGCCCACGTCTCCTTTCTCCTCTTTTCCCTCTCCTGGCCGCCAGACT
CCCTTCCATCTCATCCCCTTCTCCCTTGAGGAGACGCTAGATCTGATCTC
CCGAGATGACAAGCGAGCGGGGAGAATCTCGGCACACGAGCATCCCTGCC
GCGGTCTCCTCCCTATCAGATCAGAAAATAGTAGAAGGGGAGGAACGGCG
CCGGCAGGGAGAAGTAGGTGGATCATCTTGATGTGCCCTTGCGGTGCTCA
CCACTACCCTCGCCGATGGCCGTATCCAGAAAAAAGGCAGGGCCCTGCCT
TTGTTTCTCTTTCCATTATGGCTCGCCGGCAGAAAGCCCGGTAGCTGCGA
CTCACTCTACCTTATATTTTGTTTGACCTTCTCTGATGTTATCGATTTAT
CATTCTCTGTTTTCTTGCGTGTCTTCTCATCCCATCTAGTTTTCCTTCTT
TCTGCAGGTTCTCCATGAGTGCGGGTGGTGCTGCCGGCCTCCTTCTTCTT
CTCCTTCTCTGGCTTAGTGGCATCAAGCTACCTCCTCTCTGCGGTTGTTT
ATCTTCTGGTACCCGTCCAGGGCCAAGTAGGCCTCCATGTCCTGGCTTCA
TGGGCGAGCCCGCGGTCGATCGGTTCATTACCAGCGGTTCGTACTTTCTT
CTCTCTATTGCCCTGAGTTTTTTTGGCTTCGGGTGTTTTGTTAGAGTCTT
ATTCTGAGGTGCGTGAGGTTTGGTTGGAAAGCGACCTGTTGTTGATATGT
CTGATGGTAGTGTCTATGATTCTTTTGTTTTTTCTCTGCTATTGCGAGTT
TGGCTTTTTTTCTAATTTCCTTTCCTACTTATGCAGAAGCAGGCATAGTG
CATCGTTAGTCCTTTTATTGGTGATGTTACTTTAGGGTTATGGCTGCTCG
ATTCGATTTCCGTTGTTTGATTGTAGTTAGACTGGGGATACAGATAAGAG
GTGATCGCCAATATATGTTTGTTCTAATCTTTCTTTGTTCATCTTTCCTG
GTGCACAAATTTAACTAGCTCCACGAGTTAGCACACATAGTATCCAAGTA
CGACCGGTTTTTGCTAATACCCAAATTTGCATCAGGGAAGCCAAGGCCAA
GACTGGTCCTGCATGCTAGCAGCTTAGGTCTTGCATCAAGTTGGACTTTT
GGACCTCCGTTAAGATGGTCTACCTATTAACTCCTGCTATTTTCGGTCTA
TCATACAGCTAGACAAAAGTTTCTTTGTTGTACATCCTCAAATTGCATGA
CATGCAGATCAGAAATATGATGGACCTACTAGGAGACGTTTATATATGGA
CTTCCATTATGGTTTTATTATTTGTGCACACCCTACGAGTTTGATAAATT
GTTCGAATAAATTGTATGAGGGTGGCTGTGTGATGTTATTCCCAAACAGA
ATTACTACTCATACAATTTCTCCCTCGGCAAACAGGAGCAAGAGGGCCGG
CGACTCCCTTGGGCGAGTAAACAATCGTCGATAGGAAGAAGCACCTGGGA
CGATCAAAAGTTGATCGGTCACCAGGAGTAGCTAAGTTGTTCATTAAGCT
GAGTTGGAATTGTTTCTGTAACTAAGCTTACATCACATAGTGATGCATGA
GAGTACATCATCAAAATTGTAAAGGAAGTTGGAATACTGAATTACAATGT
TTTTTTCTTGATGTGCAGACAATGAAGGGGATTAATAAACTTGGTCTGAG
ACTACGTCTAATGGAGCCTTTATCAGTTTGTTCATCACGCAGCTTCCCTT
TTGGTTTTAAAAGGTAGGCTTCTTAATATGATTTTTCTTCCACTTAGATA
ATTTCCCCCACACGCAGTTATTCTACTCTATACCATAAACATCCTGCATC
AAAATATCCATGGATATCAGTATATTATCTGCCTTTTTCTTAAATAATAT
CCCGATGTGTCTGATTTTAGTACTGTTTTTCTTTTGTTCCCCTTCTGAAC
CCTCTACATTTGTTCTATGCCCATTGGCACTTGCTCAAGATTTTTTAATT
GCGCAGTCTTTTAGTTGCTTGAGATATTGGTTTACCTTATTTCCTTGTAG
TTTATAAGTAATCTTATCATTTGTAGAAGCAATATGTCCTCCTATAAGGG
AAGATTTCTTCTCTGGCGGCCATGCTCTGGCCCGGTCTCAATGATCTTAC
GCGCCTCCAGGTGTTCTATCCACTATTTTGAGAGAAATTGATAGACAAGC
AATTTAATGGTTTGTTGGTCTCATTTTTGGGGACCAAATGACAACAATAT
GGAGGGGGAGGGGGAAGAAGGTCCAGTGAAACTGTCGGAGGATGGTTTCT
GACTGATCTGCGGATAATTTTATAATACCAACCATGAACATAACATGCAC
CTACGGTCTCATTGTTTAAGTAGTTCCAACTTATCGAAGCAACCAATGAT
GGAGGATTACCTGATTTGTTTTACTGAAACCATGTCGCTCCATTTTTTTG
CAGGCTGTGCTCTTTTCTCAGATTGATGTGCTGCTAGGTTATTTGGATGA
TCAAAGGCAACAGATTTTATTTGATTCGGCGTGTTTGAAGAAACCGTGTC
AGATTCCAATCTAGACATTATTTTCTGGGAGGGATGCAGGTAACCATTCC
TAAGTAATGCAATTTATGTACAGTTGTCTATGAATCAAGTAGTTCTTGTG
TGTTCACAATAATTACGGTGGAGTGGAGACAAACAATACATATTATTTCT
CCATTACCTCCAGAACACATCCTGTACATTTCTCTTATTTACCATACCAT
GAGTTCTGTTTCCGTTTTGGAAGAACACGACTAAGATATGGAATTCTTAC
ACATATCAGATAGTCCATTGAGTGAGGCCACTTATTGATAAAACGAGAAG
AGTGCCTTCGAACGTATCTCATTTCCATTAAGTAGTCAAAATCTTATTGT
TTCATTTTTCCAACAAGGCTGGATAGAAAACTCCATACCCCCATAGTGGA
TTTACTTGAGGAGGTACCATTTTTGGATTAGCTCTGTGGACATTGTTTTC
TAAGGTGACTGGCTCTTCTTGCAAATATTTGGCAATGCAAATCGACCTCC
GAATATCCTTACTTGAGTTTGCTATAAATCAATGCAGGCTGAAAGTGACT
TCGATATTGCCCCATCTGTAGTGCAAGTGCAACTGCAGCCTCCATATGCC
ATTTAGAAAATGAACTGCCAACTATACTAGGTCATTACTTAACTGGTTAT
TTGAACTCCGTTTATTTATTTATTTTGGCAAAAAAGTTGCTGCTACAGTT
TACTTACTCATGTTTACCCCTGCAAGCTAGCTATATTAGATGCTCTCCTA
AGACCTTTATCTATACAACTACATACTACATTTAATAGTACTGGGCATAA
TATATTCTTTGGCTTTGGATGGAGACTGCAGAGAGAAGACAAGCAGAGAA
GTCCTACCATTCCCACCTTGCTGCTGCACAGAGTCTCATTTTAGTCTCTT
TTCAATTGGTAGATGTGAAGGGAAGAAGAAAACCATTAGGTCATGTTCTT
GAGCAGTAGCGTACTAGAAAAATCAAAATGAGTGGCCAAAATCACTTGAT
CTGCAAATCAAAAGTTGATCGACTTGGTGAGCAGTTTGGAATTTCTAATT
TGTCTGACCATACATGCTTCTTAATTTTTGTATATTGTAACCGATCTATT
CTGTTTTTTCTCATCTTGACTGATTTGTTTTTGTTAAACTGTACCAGCAA
TGCAAACAACCAAGCTCATCTTCACTTTGATTTTCCTTCTTAGGAATAAC
TATTTTTCATTCATGCCACTGTTTGTACCAAAGAAACTGTGGGGTTTATA
GTACATATTATTTCCTGATAAACTAATTGGTTAAATAGCAATAATATCAT
TGAACCTGATAAGTAATTCCATATTATCCTAAATTAGCAGACACTAAGTA
ATAACTAAGAGGTTTATATTTGATTTAAATGTATCTTTTTTGGACTAACA
TATTCCTTTCACGTACACGAATGGTTTAGATGTGAGTTGCACACGGGATG
ATAGTTTATAGCATTTCAGTTTACATTGTATCCAGCACCGCTCTAAGTTA
TGGACATGTATTCTTATTTATCTATCCAATTATAAACTATCTATCTTAAT
TTGGTGTCGTTGTCTATCTATCCGTTGCACATAATTATGAAAAACATAGA
TATACGAAGTTTTGTTCTCTTCCTTTCCTGCATGCATGTTTCTCCTCTAA
ATGCTAATAGTTAATGTTGGTTTCATGTCTAGCTCATTTACTTAAGTTTC
TTTTCTACCATCTGAATACAAATATTAGGGGTTCAAGGATAAGTTTTTTA
CCAGACCACATTAAGGCCAATATTTGTACTTGCAAGCATTGGTTACTCGT
GATAATATTTGCTTAAATATGTAAAGATCATCTATTGATCATAACTAGAA
AATTAAGTGAGTTCTCTGTTGTATAACACATGAGGTCTCTTTTTGGGGAA
GCATGGATATAAGACATAAATCTACCCAGAAGCTGAACTTTGGTTCATGA
ACTTAGTTCATATCAGGAGACTGAACTTCTTCACGAGATTTGTATTAAGA
GTTGCAGTATATGTTTCCTTGAAGTGAAATTGTCATATCAATTTATTTGT
TTTGGATGTGGGTTAGTACACTAGGTTAATTTGTGTCTCATATCAGTAAT
GTTTCTGCTTTATCAGTAGGGAGCTCTCCTGTTCCTGGATGTTTGGAGCT
ATTGCCATGTCTTTAATATGTTGGGTCACCAGCATGCAATATTCATACTC
ACGTTCTACCACTAAATTGAATTGCTTAACAACAACTTCCATTAGTTTCT
GAATTTTATCTAGAAAATTTAGAGCAAGAGTTTGTGTACCGCCTTTCGCT
CAATAAAATTAGTACGAATGGATGTTATTGATTTTTTCTCATTAAATGAC
TACTTACTTTAACAAATTCTTTCAGAAATTCAATGATTGTGCCTTTGATG
GTTTGATCTTGACTCAAGAAAAGCTACAAGAAGGAAGGTTATATTCTATG
TCAGACCCCACTTCTCCTTTTATCAGTCAGTTATGTATAATTTTGAGATG
CTTAGCTTCTGAAGTTTGGAATTTACATTGTAGGAGTTAAAATTATTCTT
TGGTTTCTAAGTTAAGACAGTGGCACTCCCTTTCTATTATGGAGTGCGGT
GTTTTTGTACTGGAAAGGTATGTTGTTAGCTGCAAGCATGTAAAAGGAGC
GTGTCACAGGTGAATTGTTGTGAATTATGAATAAATAAATCATTTTATGG
TCCAGTTGCTTATTAGTGCCGAATACAAAGTTGTTCGAAATTGCTAAATG
CATGTTCTACGAGACAAGGGGTACTGTGTTTCCTCTGGAACTCACTCTAT
TAATTAAGAACTTCTTTGGTAGTAATTTTTTCTCCCTGTTTCTCTCTTAT
CACCACACAAGCAGATCAAACTCTGCTGTATAGGAATATTTCGCCCAGGC
TAGCACACAATTGTTGCACCACAAGGAAGTGGCTGAGAAGCTGCCTCTCC
ATAAGGTACGATAGTATAAAATTATAACCAACTTCTAAATAGCATTTAGT
TTGCATGATGCTTTGGCCATTGTGCTTCATAACTGTAGCTACTGATCTTG
TGTTGTTTCTCCATATAAAATGGCAGGTTTACAAGTGTATACCTCCAACA
GCAGCACACACGGAGGTGAACGACTAGGTCACGCACGATCAAGTTTTTCG
ATGCATCCTGTTAAAGCTATCATATAGGATATTTATTTAGCTACCAGTTC
ACTATGTAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.