Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA033215

[Submit comment/correction]

Sequence	AA033215
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA033215
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGAAACGTTTCCTTCCAAACCGTGGCGGGCTCACCGGACAGACCCGATCC GATCCAACTCACCGGCCACGGCGACTCCGTTCACAGTCCTCTGGTCGTCT TCCCTTCCGAGCTCGATAAATAAAGGAAGCCGTGCAAGTTACTTCCACAA GCAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTTCCAACCATCCCCTCCCCCCTCTCCCGT CCCTCGACCCCTAGGTCTTCGAGTCGGAGGAGCAAGCCCATGGCGGGGTC GATCCACGTCACCATGGAGGTCGGCGCCGACGGCGTCGCGCTCATCACCA TCTTCAACCCACCAGTGAATGCGCTGCACCCCATCAGTAAGTAGCGACGC CCTCTTCTCCGGTCCGTTCCTCTTGGGCGGGGGCGATTCCTGAGAGTCTA ATTCCGTGCCCCGACCCGACTCTCCTCTCCGTGTGCAGTCATCCAGGGGC TCAAGGAGAAGTACGCGGAGGCCATGGATCGCGACGACGTCAAGGCCATC GTGCTCACCGGTGAGAATTCGCTTCCTTGATCCCCTCTCCACTCCAAACA AACGAATAGAAAGATGGTGGGATTTGTTTTTTTTTTCTATTGGGGGATCT CATCGAATCGCTGCTGTTTCTTATGTGATTGTTACAGGAACTGATGTTAG TAAGTAAATAGCTAGCGATTTTGTTTTGTTTTGACGGTGTTTATTTCGCT GCGAAATTCGTCCAACGCCCAGCTATTTCTGGGTTTTTTTTTTGGGGGTC ATCCTAGTCCTAGTATATATTGCAGGATGGTTGTGGAGCGGTCGCCATCG TATCATTTCATCTCTGCTGATGCCAGTTAGCTTAGTGATTGGGTGGCTTG AGCTTTTTTTTAGTAAATGTTACTCGTTGTTTTTAAGATGCTGGCCGTGG CCGGTGGGCTGAATTTGGGATCGCGCTAAAATAATTACTCAAGTAGGAGC AAGTAAAGAAAGGGGGTTGCTGTTTCTTTTAGATTTTCGACTACCCCCCT GCTTCTGAACAGGGACCGAAAATGAGGAGCGGGTGTTATAGTTTTTTATA TTGGAAGCATATATCCTGATTATAGATAGATTACATAGAAGACATATATG CTACTATGACTACTTAATTTACCACAATTTATCACTGCATAGAGAGGACT ACTAGAGAGTTGTAGATTTGAGGGATGTCGGCAGGGGATTAAAAAAAATT ATTGATTGTCACATCGGAGTTCTGACACTTGTTATTTTGTACTAAAAACT TCTATAGGTGCCACAGGGAAATTTTGCGGAGGCTTCGATATCAATGTCTT CACAAAAGTTCATGAGACTGGTAAGGGGGGTGCCTTTATTTGTACGGCTT GTAAATCGATTGTTCACAGCCTAACTTCTTAGGACGAACTCTCTTCTCTT CTTACACATTGAACATGGTTTGGCAGGCGACGTGAAACTGATGCCTGATG TATCTGTTGAGCTTGTGTCAAATATGATGGAAGGTTTGGCATTGCTTCTC CTAATTTTGTTTGTAGTTTCTCTTATTTATGTACGATGGATGTCATTAGG ATTCTCATTCGCATCGATAACGAGATCATGAGATTTGTACCTGACTGTAA AACCCTGTTTATATGCAGCGGGCAAAAAGCCTTCTGTAGCTGCCATTCAG GGCCTTGCTCTCGGTGGTGGTCTAGAGTTGACTATGGTCTGTCATTTTTG TTGCTCTTCTGCTTAATATTTTTACGGCGCCTTGCATCTGAACTGAACTC TGGTGTATAATACAAATGGCAAATTGTTCAGGGTTGTCATGCTCGGATAG CTACCCCTGAAACTCAACTTGGATTACCAGAGCTAACTCTCGGAGTGATT CCTGGATTTGGAGGTAGGGAACTAGGGATACCTCTTTTTATGAAACCTTG AACTACTGATCTTGTTCGCTTGCTTTGTATTGTGTTCTGTCATGGATCTG AAACTCTTCTTACTTATCATTTAGGAACCCAACGTCTACCGAGGCTTGTA GGTCTGCCCAAAGCAATAGAAATGATGCTGGTGCGTCTAATCTATCTTCT TCATAAGTTGTTACATTGACTAACTACGTCATATAAACTTTGTTCCCAAG TTTGAAAATATGTACTCACTCCTTTCTAAAATGTAAGGCGCCCTTTATTT TCGCGGGTCAACAACTTACAACTTTGACTATGATTTACACTTACAATATG TCCACAGAATTAGTATAAAGATATATGAAATATTGAAATGAAAGAATTTT GTAAGAAAAATGCAGAGATGCCATTTATACATTCCAAATCCATATAATTT TGTACAATCTCCATTCACAATTATAAGATGTTTTAGATATTTCAGTGTAG ACTATAGATGGACCAAAATGAGTGAACCTACACACTAAAACACGTCTAGA TACATGCGTTTCAGAAAAAAGCTAAAACATCTTACAGCTGTGAACAGATT GAGTATATATTAGTGTTCAAAGTTGTGCATCAAAGACCGTGCAAAATAAA TCACAGCTTACATTTTGGATGGAAGGAGTATGAACTAAACATACCAGAAT ACATATAATAATGATAGATATTTTTTACTCGTCACAGTTCTTTAGGTAGT TTGAATTATGTTTATTCATATCCAGTCGCAATAGTTATATGACTGTCAAA GAACAATAAGTGTTGAAAATTAAACCATATTACCATGATAAGAATCCTGT TTTTTATTGCCTCCTCTCCTGTACTCGGGCATTCTTATGGCGTTTCTCTC TCCTTAATATATACATGCAGCTCTCCTGCATGGTTCGAAAAAAAAAGACT CCAGTTTTTTATGTTAAACCCTGGTACATGTATGTACCGTCGAACATATC GGGCACCAAATATTTTGTTTGAACCATGGGCATAAATGTATGATCAGCTG TAAATTAAGTATCACCCATTTTTCTTAATCCTATCATATAATTGAGGCAT TCATTATGATTTCTGCAGCAATCAAAATTCATTACTGCAAAGGAAGGCAA AGAACGTGGTCTTATTGATGCCCTTTGCTCCCCTGATGAGTTGATAAAAA TGTCACGCTCTTGGGCTCTGGAGATTGCAAGTTATCGCAAACCTTGGATA AGGTCTCTTGATAGAACAGATAGGCTTGGCTCTCTGTCTGAAGCTCGTGC GGTGTTAAGTATGGCAAGACAACAAGCAAAGAAGGTTGCGGCAAACATGC CACAGCACCAAGCCTGCCTAGATGTTGTTGAAGAAGGTGTTTTATTTGGA GGCCAAGCTGGTGTTGTGAAGGTTTGTATCTCCCATTCCCCATTTGTCTT ACTATGAACACTTATCACATATGAACTTATTTTTAGCGCAACTAGCTGGT TTAGTTTTTTCAGCCGATATTTGCCCGCGTTGGCATCAGTGCTATGCTTG ACTTGAAATCAATAACCAACTTTCATCTAGCAATGGACAATACTACCTAT GTCCCTATTTAGGTGGCACACACGTTTTCCAGGATCCAAGTTTAACCATT GATTTAACCAAGTAAATGTGAATTATATGTCAAAAAAATCATACCGTTGG ATTTGTATTTGAATAAAGTTTCTAATGGTATAAGTTTTATGATGTGTGAC ACATGTATTAAAGGTTAACTTGATGGTCAAAGTTAATTCACGCAAAACGA GGGCGCCGCCTAAATAGGGACGGAAGGAGTAATTGTTTGTTTGCTCTGTT AACTGTTATTCATGATTCCGTGTGCATGTGTTTGCTGAATATACCTAAAT GATGCAGGAAGCCAATGTTTTCAAGGATTTGGTACTATCAACAACATCAA GGTCACTTGTCCATGCATTTTTTGCCCAACGTTCCACCACAAAGGTTGTA TTCCAAAGTCTAATTTTTGGTTTACCTTTTCTTTTCCTGATTTACTTTCC ATGTGTTGCTACTCTCTTGATTTTGCACCAAATAATTATCCCGACTTGGA AATAGTTCCAATGCTATTGATTTTGTTTATAAATGGTTACACTGCCTATC TGCAAGTCCTGCTACTATTTTATGTTTACCAATAGAGAATACATGGAAAA CTTTTTTACTTTCATGCTTAGTGCAACCTTTTCCCCTTCTGTTCTTTTTG ACCTAAATTAGCTTCCATTCCATTTATCTTTGGAGGTGTTTATTTTTGTT GTTAATCATACTAACATGCAAGCAGACCATGTTATAGAGTATCATATGTG ATCATAAGTAAATATGCCCAAATTTCAGTAAGCTATATTTGGACACACTA AAGCTAAATTGCTGCGAGGACGTCATTTAATGTGTCAACTTCTGTTTTGC TCCATTAGGTTATTTATAGCCTGGTACCACTGTCTGAATCTTGCAGTTGG TTTGTTGTAGGTGCCAGGTGTTACTGATATTCAACTCAAACCCAGGCAAA TAAGAAAAGTTGCTGTTATTGGTGGTGGTCTTATGGGCTCTGGAATTGCA ACAGCCCTTCTTGTTGGCAACATATCTGTTGTACTCAAGGAAGTAAACGC TCAATTTTTGCAAAGGGGGCAAAAAACAATAGCAGGTCAAGTTTGTTAAA TTTCTGCTGCATTTCTTGGGAATTTCTTCCCGGTGATATTTGCATTATGA TTCCTCCTTGATGTATTATTGAAACATGAAGTTGTCATACATGTTACTGA TAAGAACCAATCACTGTTTGCACAGGAAATCTTGAGGGCCTTGTCAAAAG AGGCTCATTGACCAAAGATAAGATGAACAAGGCCATATCACTTCTCAAGG GTGCACTGGATTATTCCGATTTCAAGGATGTTGATATGGTTATTGAGGTA GTCCTCGTATGCGTTTAGAATTTTAACAAGACAAAAGTATTGGTGCACAT TATTTGGGGCTCCTCTTCCTCTTGTGTCTGCAACAGATGGTCATGATATT ATAGTGGGTTGATGAATCTTATGAAGGTTTACATAAAAAAAAATCATCTT GGGAATTCTAATACAGTAGATAATTTTGTTTAACACATACTTTTTTGTTA GGTTCTTACGACACGTATCTTCTCCTCTTGTAGGCTGTTATAGAGAAGAT TCCTTTGAAGCAATCAATATTTGCTGACCTCGAGAAAGTCTGCCCACCAC ATTGCATACTCGCATCGAACACGTCCACCATTGATTTGAATGTTGTCGGC GAGAAGACAAATTCTCAAGATAGAATTATAGGGGCACATTTTTTCAGGTT TGTTGTTTCTTTTGCGTTGTTATTGTAGCACGTCCTGAAAACTAGCAGTT TACCAAAAAAAATTTTAGAGAAAACGTAAAGACTTTGCATTTCTTCTCAT TGCACAGAAAGAGTTTGGGTTACAAGCCTAAGAGGACCATTACAGTTTTG CAGTTTACCAACTTAAGGGGTGCACTTTAGACCTGTGCGTCAAGGTTGCT GAAACACATCACATCAGTACATTACTAAAACTCGTTAACATCGCATGCTA GCATGTAATTTTCAAATCCTTGACACCATGCTTACCAGTTTAACTACATG CATGTAATTAACGATTTGGAATCCAACCTAATTTCATAGAACGAGAGTTG ATGATTATGCCAACAGTGAAAATATCCAGAGTGAAACAAAATGTTTTGAA AGCATGTTATGGACGTGGGATTATGGAAATAATACTCTCTTTAAACTTTA ATCGTTTGGATGTTATATCGGACCTTCACACTTAACTTTCTTATATGGAG GAGGCACCTTCCTAACGTTATGCTCTTTACAGCCCTGCTCATATTATGCC CTTGCTTGAAATTGTCCGGACAGAGAAGACATCACCACAAGCTATCCTTG ATCTCATCACTGTTGGGAAAATAATAAAGAAAGTCCCTGTTGTGGTTGGC AACTGCACAGGCTTTGCAGTCAATCGTACATTTTTCCCTTACACACAAGG TGCTCAGCTTCTAGTTAGTCTTGGCATTGATCTTTTCAGAATTGATCGAT TGATAAACAGCTTCGGCATGCCAATGGGACCTTTTCAGTAAGTGATCGGA CTCTTTTATCATGTCTATGTGCAACAACTGCCAATTGTCTCAACTTAAGT TCCTTCGGTGCATGAACAAGCAAAATGTTCCCAGTCAACTGTAGATATCT ATATATTTTTTGATATAAGCTGTTTGCTCAGTTTCCTAGGATAAATAAGA TGCAACCAAATTCAGAGTGCTTTTAGTATAATGTTATGGTTCACTTGAGC ATGTAGTTGTGATAACATTACTGCCTCTGTGATCACTTGGTATACTTGCA GTCAAACAAATTTGTACTTCAACAATACCTTCACAAACATTTTTTTTATA GTAGTAAGCATTGTTTTTCCTCAGACAATATTATAATTTCATAATGTTCT ACAAATACATTAAATAGAAATTGTTGGAGCCATGTTCTGCTTTAGAGACC GCTTCAATGTCAAAACGTAGGTTAATATTCTCATCATCCAAGTGTCAATA ACTTGGTATGGCCATACGATAAATTGCCGTCTTGAGCTTTCCAAAGTTGG GATTTAACCACCATCTGGAAAACAGTTATACCGACATTCAACCATCTTCC AGATATGCTTTCTGTGCCTTAAATTAGCTTGTTACAATGAAATGAACAGT TCAGTTCTCAGGCATCATTAATTGAGTATCTTGTGTTAGAAAAAAATCAT CAACTAGTTTCAAATGTTGTGATCATGATTCACATGAGTTCATATGTTTG GCCATTTCTGTTCTCCTGCAGACTCCAAGATTTAGCTGGATATGGAGTAG CCTTGGCAGTAAAGGATATCTATGCAGCTGCCTTTGGAACACGCAATTTC CAGTCTGGTCTGGTGGATTTGATGACGGAAGGTGGCCGACAGGGTATGCT TCTGAACACTCTTTTGCTTCTGCTACGTGTTACAGTTAATAGGATGGGAT GAGATGAGACCAACTATTACTGCACCATTTCACTATATATTATTTTATCA ATTTTTGTTTCCCTGTTCTTGTACAGGAAAGATTAATGGAAAAGGTTATT ACCTTTATGAGAAGGGTGCAAAGCCAAAGCCCGACCCTAGTGTTCAACCT ATTATTGACGAGTACAGAAGACGTGCAAAGACAATGCCGGGTGGAAAGGT TTCTCTTCCTCTTTCAAACTGTCTACAACATTGTTTCTGCATTTACATGC TATGTCATTTGTTACTAGAAGGTTTTACTGACACATTATGTTGCTTGCAG CCTGTTACTTTATCGGATCAAGATATAGTGGAGATGGTTTTCTTTCCAGT TGTTAATGAGGCATGCAGGGTCATGGATGAAAATGTTGTGATCAGGGCTT CTGATCTTGATATTGCATCTATCCTTGGGATGGGCTTTCCCAAGTACAGG TAGGCGGCTACTGCTTATCTCTAACGGTGTCCTAAATCCTAACTAACCAG TGATAGTTCGTGATCCCTTGAAATATGATTAAATTAGATATACATGTTGA GATTCTACTGCTGGTTATGTGCTATTACAACTTAGGAACCTAATTTAATC CTTACATAGGCTGGCATTCTCTGTCATATATCAGAGTGGACTCTAATGCT CAGTTTGCGGTTACTGAACAGTGTTGTATTGAACTTTGTTTTAAAATCAG CTGTGGAAAAGTAACCAACAAAGTAGACAAAAGTTGATTAGCCAGACAAA GAAAACGTTAAAGGCCTGTTGGAGAAGTTAGATAATCGTAGTCCACCTCC TGATTAATTTTGATCTATCACTTAAGTTTAGCAAATCAGCCAAATTGGCA CATGTAGAGAACTTCTTCCCAGTTTAGCTGAGAGCTTTAATGATACTAAG CAGTTTTTAGCTTCCATTAATACACACTATAATTTAGTCAATCAAGGATA CAGTCACTATTAGTACTGTTTGTGGAAGGAGGTGCTGTATTAGCTGTAAC ATGTACTCTGTTAATGAAGGGGTGGCCTCATCTTCTGGGCTGATACTGTC GGAGCATCTTATATATATTCGAAGCTTAGCAAGTGGTCTGAAACTTATGG TGACTTCTTCAAACCATCATCATACCTGGAAGAGAGAGCGAAAAGCGGCA GGAAACTGGTACAACAATCTCTCTCGAACCGGATTTTAAAACGATTCCTG TACTGTGCATCTCTTGACACTGTAACTTGTGCCCACCTTATTAACCATTT CACAATCTCTGCAGGGTGCTCAGAAAGATTCGACAAGGTCACGCATGTGA GAAGCTGCTGTTGATTGCTTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.