Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031801

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031801
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031801
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCCCCCTCACTGTCTCGGCTGCGCAACCATGAGGTCGCTGTTCTCCAAG CACGCGCGCCACCCCACCACGCCGCCTCCGCCCGTCTCCGGCGGCGAGAT TCCGCCGCGCCGTCGCTTCCCCAAGGAGAACGTGGACCCTTCCTCGCCGG CGCACCATCCCCACGCCGCGGACCACGCGTCCCCCTACCGCTCCCCTTCC TCCGCGGCCAAGCCGCTCGGCACACGCAACCGCAGCCTCCCCCCGCGGCC ACCGTCGTCGAATCCCCTCAAGAGGAAGCTCGACGTATCCCCCGCCAGAG CCGCCGCGGTCCCGGCGCCGGAAGCCGCTCCCGCGTCCGACTCTGGGGTT CAGGTAGGGTCTAGGGTTTCTGAGCTTTCTGGATTTGGTGTGCGCGCTAG ATCTGGCTTAACACAGTGCGTGTGCGTCTGATTTGGTTGCAGGTGGTGGT GAGGATACGGCCGCCGTGCCCGGTGGAGGGGGAGGAGGCTGGGGAGGATG GGCGGGGCCCCGAGGCGTGCGTGCGCAAGATGGCGACCAACTCGGTCGCG ATCCAGGGACAGGACTTCACGTTCGACGCCGTTGCCGACGCGGCCTCCAC GCAGGTGAGACTGAAGCTGCAATTTGGGGCTTAGAGGCGTTACCTTTCGC GTGGCGAAGGTTTCTGTGGGATCGTATGGATTTGGGGTTAGCGAAATGTT CTGTGTTATTCAGTGGGTTTAGCACATTGTCGGTGACAGGTTAATCCTCA CTTGATTCGAACCTGTGCTATACTTTCCTGACCTGCAGTGCTACGAATTA CAGTCAGTTTTGAGACAGCTGATACTTTATACCACATTGACATAATTGAG CTTGTGATTCTCCCTTGTGGATATATGCCAGGAATTTTATTTATTTGCTG CTTTTAGAACGCCTGCAGGGTGATTTAGCTAGCACCTTTATGGTCAGGTC TAGTGGGGTTCTAGTGGAAATTACTATGTTCAGTTGTTATGGCAGTAACA TACTTACTGTTTGCTGTTCTTTCAGTGTTACAATTGATTTGCAAGAATTT TTTTTTGGGGGGTCTGGGTGTGAGTGTGCAACTTTATCATTTAGTTCCTT TATTTTTTCTACAAAGTTTTGCTTTAGCTGTGGTTAGTTTTATTGTGTTG TTTTGCCGGCTAATGGTTTGATTGCAGTGTTGTTCTTTAGTGCTGTCAAG GTTTATGTCTGCACATTTAATTTATTTGTGATCTACAGGATGATCTGTTC AAGCTTGTTGGGTTACCGCTAGTTGAGAATTGCTTGTCGGGGTTCAACAG TTCGATATTTGCCTATGGCCAGGTGGATTTACCTAAACTTATCATATATA TCTTTTTATAACTAACTGTTGGAAAATATTGACTAAGTTTTCTTTTTCAT CTGCCCATCTTGGAAAGACCGGGAGTGGAAAGACATACACGATGTGGGGC CCTCTCTCTGCACTTTCAGGAGACTCGATGGGCTGCGAGAGGGGACTGAC ACCCCGTGTTTTTGAGCAGTTGTTCTCCCGGATTAAAGAAGTAATTTGAC AGATTCCTAAGCTATTGTTCGTGTTGATAGTTTTCGTACTTGAAGCTGAA ACTCGCGATTCCATCTGCAGGAACAAGGGAAACACAGAGACAAAGAGCTA AAATACAATTGCACCTGCTCCTTTCTCGAGGCAATTTCTGTTCTTAGTAC CTACTAGAACATATCTGCAGCTGTTGTTTGTTGTGATAGAAAATCTGATG CATCTTGATTTCTATGTACAGATCTACAATGAACAGATAACGGATTTGCT AGATCCCATTCAAAAAAATCTTCAGGTGACATGCAAACTTTGAAATATAG TACTAGTAGCATATTTATTTTTACTGTTATACTGATATGACCTATTCGTT GGCAGATAAGGGAGGATGTTAAAACTGCCTGTGTTTATGTTGAATCATTG ACAAAGGAATTCGTTTTCACTATGAAGGATGTAACTCAGCTGTTGGTGAA GGTATGTGCATCTCGATATTGACATCTAAAGAGAATTACTGAGACATATG TGATCTCATATTTTTGTGCTATTGAGTATTGACTGAAAGTGTTGTGTTTG GTACTTATCAGTCTCAATTTCTCAAATATGTTTCTGGACCTCATTATAGT ATTATCACTTATCAGTACTCTGATCTTGACTGCTTAATCAGCATGTGTTT TCTTAAGATATTACATTTATTATTTGCCCTAGTCCCGCATCTGGTGATAT ACTCTGCTATGTCAATTATGCGGATTGTGTACTTCGCCCTGGAGGCAGGC TTGCCATGGTCCCACTCCCACCGGAGTGCTGAGCCATTGGGAGGAGTATG ACTTTAGAACCGTGTCGGGTTTTGTTTCTTTGCTGTCTGTCTGTGGTATA ATACAGTATAAGTTGCCCTGGTCCAAGATCTTCTATCGATTTGCTTCTGC TCGAAATGAATAGATGTGCTAATGCATTTTGCACATTCTCTGGTTTTCTA TGTGGACAAGTTCTGGTTGTTTTGGAAGTCAATAGTACTATCTTGGAATA TTTTTATTGCAAGTACTTCAATTACAGATGCTCCATTCTCTTGTTTCTGC AAAATCTGATTACAATAGTTGCACGGTTATTTCATCATGAATCATACTTT TCAGTACCCTCATATGTCGTAATTTGATTTTGAACTTCATGCAGGGACTG GCAAACCGGAGAACAGGGTCAACAAGTGCAAATGCAGACAGTTCACGCTC TCACTGTGTTTTTACATGTGTGATTAAATCTGAAACAAAGGTACTTGTTG AAGTGGGACATATTACACTATAGTCTAATTTGTCATACCTATGAGATACA ACTATTTTACTCCAGTAAATGTTCCAACTTTTGGTAGTCTCATTGTCTAA TTACATGTGTCATAAAATCGGAACCAAAAGTATGTCTTAAATTTGGGCTA ATTACTTTGTAGTTTCATTAATCATGGCTGTGGGGCACAATTATTGTACG TGCAGTAAATGTTCCCATCCATTCAGCGGTGATGCTCTATCTTTTCCCCC CTTGCTTCTACAAGTGATAATTATTCTGATTCCGCTTTTACTGCTTCAGC TATGCCCTGTTATATGTGTAGTTTAAGTCATCACTGCAAATGTATGTACC GACGAAAGGAGCTTGTGTGCTCTATGATAGCTTGAAGTCACCATTCAAAA TGGTTGCACTTTGTTCTGAATGGTGTAGGACAGGTGCTCAATCTTGCATT CTGTTTTCTTCCTAGTATTAGGACGAGTTATCTTGGGACACACTATTCTA TCATAGTTGCTTCCTTTTTCTCGGAAACTGTAAACGGAAGTCTCAGTTCT GGCAGAAACATGGATGCGTTTACTCAAAAGCAGCACCAAATAAACTATTG CTTTTGTCTATATAAATATGATAAATTTGTTCCTGCAGTCCCCTCTTCTG TTCATATTAATATATTGTTAATGGTGCATTTGATGGTTGGTCTGTATGGG ACCATACAATGATTTTGGTGGGTGACTCGATTATCAATTTCGTACTAGCC TCGTTCTTAAGAGTGAGGAGGTGACGATGGACGAACTAATTCCATTACAC AAATAATACTAAATTCTTAACAATTTTTGTTTTCAATCATTGCTAGTTTC AGCTAGGATGCATCCCTTAGTTCATTAATGGTTTGTTATTGTTCTGTAGA ACCTTGAAGATGGCTCAAACAGCATCAGAATAAGCAGGATAAATTTAGTG GATCTTGCTGGATCTGAGCGGCAAAAGCTAACTCATGCTGTTGGGGATCG CCTGAAAGAAGCAGGAAATATAAACCGGTCACTTTCAGCGCTCGGGTATG GTTCTATTTATAATAATAGCTAAGTCAAAGAATAAAGTCAGATATTTGGT ACCCAAAGGAGGTGGTGTATAAACTCAAATTGAAGGTCAATGTTTTCAAA GTTTGGCCAAGAATTTATACAAAAATATGAAGATTTGTAATACCATATCA ATATCAGCTGACTCATCATAAGATATAATTTCTTTAATATATTTGGTCAA AGTTAGATAACATTGACTTTTCGGCTAAGTTTATACACCACCTATTTGGG GACAGAGGGAGTAACTGTTAATTTCTTCCAACATGTTTATATTGTTGTAT TTGTGAGACCTTTTTTGTTAGACTTGGTGTATTTTCTGCTTGATCGTTGT ACATATTGTTTGTTGTAAAAAGGAAAAGCACCTGTCACCTGTGCATGTTC TAACGGGGGTGAAATTAGGTTCTGATTGTTATGTTTTTCATCACTGCAGA AATTTGATTAACATACTAGCGGAAATTTCACAGTCCGGAAAACAGAGGCA CGTACCATATCGTGATTCAAAGCTGACGTTTTTATTACAAGAATCCCTGG GTGGTAATGCCATGCTTGCGATGATTTGCGCTGTTTCTCCGTCAGAAAGG TATTATCCAAGTTGAGCCAGAAGTCATTTTCTCCCTGTTCTTCTGATGTT GTTTCATTAATTAATATATTCTGTGTTACTATACAGATGTAAGAGTGAAA CATTAAGCACACTTAGGTTTGCTCAACGCGCTAAAGCTATAAAAAACAAT GCGGTTGTCAACGAACAAAGAGAGGATGATGTCAATGCGCTTCATGAGCA GATCAGACATTTGAAGGTACTAAGTGTTCAAGTGTACATATCGGCAAGAA AATTCTCCGTAATATTTTGCCCTTTTACTCAAGTTTCACCACTAATCTCT TTGCAGGATGAACTGCATCGTATGAAGTCTAATGGAGGCTCGGAAGGAGG CAATGGCAGCTTTTCTACCGGATGGAATGCTAGGCGCAGTTTGCATCTGT TAAAAATGAGCTTGAATCGCCCCACGACATTCCAGGCTATCAAAGAAGAC AGCGATGAAGAAATGGAGATAGATGAGGATGATGTTGAGAAGCCCAGTAA TCATGAAAATATGGTAATATGCCCTGCTGGAGATAATGATTACAAAATGT TCCGACCTACAGGGGTGACAGATGCTGGTTCTTCACATATTGATGCTTTT GATGGAGATAACAATTTGTTGCCTACAAAAAGATCATGTTCTGATGTTAC TAAACTTGGAGATGACAGATGCAAGTTAAACCTTGCTGCCAGTATACAGA GAGGACTTCAAGTCATTGAAAGTCACCATAACAATGGTGCATGGAGGAGA GCCTCAGTGGGGTTGAATGCTAGGATTAGGGATGTTCTGCCTTGCAAGGT TGATGTAGCGACTCAGACTGAGCCTGAAGAATCTGAAGCAAGAGATAACA CTCTGGCTCTAGTTCCTACTGGTCTAGTTGAGGTTTCTGCAAAGGAGAGC AATGTTCCAGATGCTTGCAGGGATCTGCAATTAGTACCAGCTGATGGAGC ACTACCATGTGATGAACTAAAGCAGCAGCAAATTCTCAAAGTAAGTTCAA ACAAAAGAAGTTCTTGTGCATGTGCACCAGTTGGTTAGAATAACGGCAGC ATTTATTTGAACTTTTCTGTAGGCTGTGGAGAAGGTCCTGGCTGGATCAA TAAGGCGAGAGATGGCACGTGATGAACAGTGTGCAAAGCAGGCTGCACAA ATTCAACAGCTAAATCGTTTGGTGAGTGTTTTTCTCTCCCTTCATGAACA ATAAACTGATTTCTGTCCCCATATAATGTTCTGTGATATTCCAGGTGCAA CAATATAAGCATGAGCGTGAATGCAATGCTGTAATTGCACAAGCAATGGA AGGAAAGATTGCTAGGCTTGAAAGCTTGATGGATGGTACTTTACCGACTG ATGAGTTTGTACACGAGGAGTACCTATCTCTTATGAATGAGCATAAGGTT GTCTGAAATTGCCATTTCTTCTCCTATTAAAACCAATATTTTTCTTTCTA GGTCATCATTCTTATTACTTGTGATCTAATTTTCTTGAACTGACAACTGC AGATCCTCCAAAAGCAATATGATAACCATCCTGAAGTGTTGCGTGCTGAA ATTGAGCTGAAGGTACTCCAGCAGGAATTGGATTTGTGCCGGAATTTCAT GGATGAGAAAGAAGTTCTACAAGAGGAGATACAGCATCTGAAAAGTCAGT TGCATTATATGGTTTCTTCTTCTGCATCAATTCGCAGGCTTTGGCCTCCA CTGCAATTGCGTCAGAGCATTAATCCTTCACATGGAACAAAAGATGGTGA TGGTGATACTAACATAGCAGACACTGCTGATTGTGCTGCTGAAGCTGAGA GTAAATGGATTACTCTGACAGAAGAGCTCAGGGTTGACCTCGAATCAAAT AAATCTCTTGTTAAAAGGTTACAGACTGAATTGGATTCGGAGAAAAAGTG CTCAGAGGAATTGAAGGAGGCATTACAAACAGCAATGCAGGGACATGCTA GAATCTTGGAACAGTACGCTGAACTTGAAGAGAGGCATATTACTTTGCTT GCAATGAACAGGAAGATCCGTGATGGTGTTGAAGATGTGAAGATGAGGGC TGCAAAAGCTGGTGTCAAAGGGGCTGAGTTACGGTTCATCACCTCCCTTG GTGCTGAAATCTCCGTTCTGAGAGCAGAAAATAGAGGCCTTCAGGACCAG CTAAGGGATACTGCTGAGGCTGTTCAAGCTGCTAGTGAATTGCTAGTGCG GTTGAAGGAGGTCGAGGAGGCGACAACACTTGCCCAGGTACGAACTTCCC ACATTGCTCAGATGTAACACCATTTCTGTCATTTGAGGGAGATCTAATAA CCATTTTTGGTAAACGTAACAGCAGGATGCATGGACTGTGCTAGATGTAG ATAGCTGATTATAACATAGGTTATGTAACACGAGAAACTTTAGAATGAAA ATGCGCATTGAAAGTGCTCAAACACCGGTTTTAGTGAGCTGATGGTTACA TCGTCCTTGAGTTTGCTAAAGTGCTGTATTAGTTTACTGAGATTACATTT TCCAGTTTTTGTGAGCTGATGGTTACATTGCCTTTTTCGCAGCACCGAGC CTTGTTGGCAGAGCAGGAAACGGAGAAGGCCTATCAGGAGATCGACAACT TGAAAAAGAACTACGACCAGGAAATTGTGTCGCTAAACCAACGCCTCACA GAGTACTCCCAGCAGAATGATGCTACACCACCGCCTGCTGCATCCAGCAT TCTCGAGTCTCCTGCCAGGTATGACACGGTTGGTGGTAGCACCAGTGAGC AGCAATGGCAAGGGGAGTTGGACGCCTTCCACCAGCGCGGATCACTGGAG GTCACGAAGAGCACCGACCTCAACTCGTGGTTCTCCGGGTACGACAGGTG CAACATCTGATTGATGCCTGGCTCTGTATGTTCAGTTCTCTCTTTGTAGT ACGTTAGAGGAAGGAAAGGGCTAGTGGGCAGTATGTTCACCTTGTAAGCA TCACAAAGGGCGATGCTTTTCTCTTCACCGTCTCTGTGAGGCGCGCGTCG TTACATATTCTTCAGATCCCAGGGAAGCTGTACTATTCCCCTATGTATAT TTAGATGGCATCAACATACAGGTTCACTATTACATTCTTGGGGTGAGAGC GATGTCACTGTAATCTGCTGCTTGTAATATTTTATTTCAGAAGAACAAAG CCAGTAGCTGCTCTCAGTGCTCTGCATATGGTAACGTTATGTAGTCTTAA GATTTATCATTGTTTTGGTGCCATATACGGGAGTGGATGCCAGACCTGCT GCATTACAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.