Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA004019

[Submit comment/correction]

Sequence
AA004019
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004019
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCCATTCCCCGCTCTCCTCTCCCCCCTGTCTCCCATGGCGGCGCCGTCG
GCAGCCATGCGCAAGAAGCTGCAGCGCAAGTTCCGGCTGCGTGGCTTCAC
CCTCAAGGTCGACGCCCTCGAGGAGGCCGCCGCCTTCTTGGACCGCTTCC
CTGACGCGGAGGACGACGCCCTCGACCTCCTCCTCGACGAGCTCGACAAA
GAGCCCCGTAACTACTCGCTCCCCCTAGGCCTACGCGCCGTCGCCTCGTC
TTCTCATTCCTGGCTTTGTTTTTCGGTTGGTTGTGACCCTGTGCGCGTCT
CTGTGTTGATTTGTGGGTGCGCGCAGTGAAATCATCTATACTGGATCGGG
ACGCGGTCCGGCGTGTGGTGTCCCTGCTCGTCGAGGCGGAGGAGGCGGTT
GATGCGGCGTCGCCGGCGGCCACCAGCGCTCGGTCGGCACTGCGTGTGGT
GGACTCGTTCGTCGTCCCACGATTCCACTACGACCCAATCAAGAAAGTGT
TCTACGAGTATGTGGATACCGCTACTTCCTTTTAGATCTGGAGAATTGGG
AACTGGGACTTGAGAATTAGATCTTTCATTTGGCGTGTCGGTATTGAACC
ATGGTTGAGTATTGCGACAAGGGGTATTTATTCACAGCTTGGTTCGCCTA
AATCTTCAATGGACTGATGATGGGTTGCTAATTTGCAGAGTAAATGCATG
TTATGGTTTTAAGGGAGCTTGTTTTTCTGTTCTTCTAAAAATAAAAGTCT
TTCTTTCTAAATGTTTGAGACAAATGTGTTAAACACACCTTATCTGTTTC
TGGAAATTCAGCTTGAGTATAGTTCGTTGATTTGTTAGCTCAGCCATCAG
GACTGGATTGGCTTTTAATCATTTCGTTTCTCTCTAATAGCTGCTATATA
ATTCAGTACAGCGCATAGATTTATCTCTAATGCTAGACTAGAACATATGC
CTTGTTAAAAATGGTTATCTGTATGTTTTAAGAATGTCCGAACCATTTAT
CTCACGGAAAATTGTGAAATGGCAATTATAATGATCTTTCGGATCTTATG
TGTGTTGATGCCACCCTTGATTATGCTGTGTATATAGGCATACTGGAAGA
TTAGCCATCCATGGAGAAGCTGGAGACAAAGCTGCCCTTTATAGGGACAG
GTATCAAGTATTGCTTCAGAGGCTTGCTCGTGATAAATATTTCTCCAGGC
CAGCTTTTGAGACTGTTATGTCTGAAAATGATAGCTGTGAGGTATTTCTC
TTAATTTATGTTGCGTTGTTACTACTATTTATTGACTTCTGTGATCCTAG
TAACTGTAGTACAGTACTTGGTACTTCTCCCCAAAATATCTTTGTGCATC
CTCTCCCCCCCACCCCTCCAATTTTTTAATTAGTCCTTGTTTATGAACTG
ACATACAATTTTCCCTTCATGTAGATAACTTCTATACAATCTTTAATTGG
GTGCGTTGGACGGAGATGGATTATGGGAGTCATATCACAGTTGGAGGAAC
GCCAATTTTACTTGGAGGATCTTACTGGAGCAGTGCCAATTGACTTAGCG
AATGCAATATCCTTAGAACCATTGTCTTGTTAGCTACATATGAATATATA
TAAATAAATATTCATGTCTTTGCTGTGTTAAAAATGGAAATGTTACTCAA
CTTTAATGTTTGTCTGCTCACTTTTCCATGTTTATGAAAAGAAATCCCTT
CATTTTCCAAGTGCTAGTATATAATAATAATCATTTTGCATCAGTGATCC
ATATGTCATTTGAGTATTTTGTTAAACCATATGGATTTCTGCTTATTCAG
AGAAGCGCACCTCTTTCCTTAACATAGAACACAAAATCACTTCAGGTTTC
TTTGTTGAAAACACTGTAATTGTAGCAGAAGGGGAACTGCTTTCGAATGG
CATTTTCCAGGTCTGGATTCTCGTCTACCAGAAAATCTTTAGTTTTTCTA
TGTATTATTCTCTTTAATATGGTTTTGTTTCAATCATCTACAGGTTAATA
CGTGTGGGTTTCCTCCCTTAGAGGACAGAGAGTCATCACTTTCACTGCTT
ATGGGACTTGATTTCTTTGGTGGAGGTGTCATACCAACTGAAGAAACAGT
AAGTCTGTGATTGCGTTCCACATGTTGATTAATAGGTCTTGCAGACAACA
TCTTTACTGATGATATTTGTTACATTTGTATGAAACAGCTAAGACTAACA
TCACTAGAAAATAAGGCCGTGAATGACATGTTTGTCATACTTTCAGATGT
GTGGCTGGACAATTCTGAGGTATTTATGTTTGGTATCTGTTCTTTATTTT
ATGTAACTTTATTGTTTAGTCATACTCTCATAATGTGCATATGTGTTATC
TCGTAGAGTAGACTATGGAGAAGTTAGGCGTTGTCCTTGATGGCTATGAA
AGTGTGGAAGTGGTTCCTTCTCTCTTTGTTTTAATGGGCAATTTCTGCTC
TCAGCCCTGCAATCTGGCATTCAATTCATTTGAAGAACTCAGGTCTGACT
TTCGTGTTTCATGGGAAATAAATAAAAGCTGTGCTAGGTGTTGTGCATTC
TAATCCAAGGCAAGTCCTTAATCACGTATCTTTGTTCAGATTGCAGTTTG
GGAAGCTTGGTGAGATGATCGCAGCTCGAACTCGGTTAAAGGAACATAGT
CGGTTCTTATTCATTCCTGGTCCTGATGACGCAGGTACTCTAATAGTCAA
TGATATGCTTTTATCTGATAACTGCTGATATCTACATATAGGGTTTGCTA
CACTATATGCGATTTCATTATATCCACTTGTTGTTATTTTCCTTGCTACT
TTAAAGTTTAAACCAAGGACTGGCTTCTGTAATAGGATATGGAATGATCT
TGTTGACCATAAATATTGTCATCTTAGTTTCCCTGATAGCAGATGTTTCC
TTGTTTCTCGTAGACTTCATATGTTGTTTCTTCTTACATGGGAGCAAATT
TGCAGGGCCTTCGAAAGCTCTCCCAAGGTGTGCACTCCCGAAATATCTAA
TTGAGGAACTTCAGAAGCACATCCCAAATGCTATATTTGTAAGCAACCCC
TGCAGGTTCGACATGAAAGCATTGCCTTCTGTCATTATCTAAATTCCATA
TGTTAAACACTTGTGATAGAGATATAATCACCCATGCAAAAGACAGGGAT
ACATTTTTTGGGGGGTTCAAATTATAAAACAAGTATGTAGCCGACGAAAA
TCAATAAACCCTTCAACAGGGATGGGTAATGCTACTATTTCTTTTGGTGC
TGTAAATTATATGCTCCATGTGAATCTCCATGGCGACCTTTAACAGGGTC
GGGGCTGCGTTGAAACCAAACTGGACCATGGCCCGCCCAGCCCAGCCCAA
AACAGTGAAGAGTGAGATAAATTGGTCCATGAAAGAAAAAAATCGTCGTC
TTCTTTGGGCTGGCCCACCCAACAGTCTTGCTGTAGCTCCGCTAGTGCCA
TCAATCAATATGTTACACATTTTGAAATCATATTTCATGATGGATCTAGT
AAACATCAATTCAATACTGTGTATGTTGGTAATTATTATGTTGATGGTCA
AATCTAAAGGTGGGAGTGTCATCCAATTGTTCTCACTGTGACTCGGTCCA
ATTTTAGCATAAAAGGTCAACCATTGGTATGCTGTAGTTATTGTGACGAT
CCATACAGCTAGCATCTTCATCTTCAGGAGATATATGTACAAAATATCAT
GATCATGATGCATATTGTCCATAGGTAATAAGTAAATGAAGAGGCTTAAT
CAGCATACCTGTACTGGCCTATGGATGTTCATACTTAAACCATGTTTTTT
TAGTTGGCATCTAACATCATAATGTATGTCGCACACAATATGCTTTTGTA
GTAAAGTTCTCTTTGTGCTAGGCATCATTCTCTTCTGGTTTATTTTTTCA
AACATGCCTGATTTATCTTCACGGTTTGAGGCTCTAAGGCTGCGTTTGGG
AGCTCAGCTTTTTGTAAACTGTAGTATTGCAAAACCACAGTATTTCAGTG
CGTGGCTAAGGAATACTTCAGTTTCCTAAAACCAAAGTTTTCTTCAGTTT
TGGCAAAAGATGGAGGCGTTTGGCAAGTGCCGCTTTGCAATAGATTTGAC
CGATTGTTACATTGCATGTGATGCCTTTGGACCGGTAATTACGTGCGTGG
TTTTTGCATGAGCTGCTGGCATTGTTGAACGCTTCAGGTATGCATTGAAC
CTAAACGCCTTGAAGTATTCAATACTCCATTATTTTTAGAAACCAAAGTA
TTCACAGAATACTTAAAAAAACGGAGCTCCCAAATGGGCCTAACATTCAG
TTATGTCTTGGAAAAAGATTCATACACTCATTACCCACTAAGACTACTAT
ATTTTTCGCCAAAACGCAAAAAGCTTTTCGATGCATTGATAGATAAGTAT
ATGTTACAAGTCCTTGAGAGGACCAACACCCGCACCATACAACTCAACCC
GGGAGGCTAGGCTAAGGGAGTAGTTGGCGCAACTAAGACTACTATATAGG
CGATAGATTTGCAAGGAACATATATTCCAAACTACGGCGTTGATCCATAT
TGACTTATCATGATTAAGATAAGATTGAACTTTCAGACCTCCCAATTACT
ATCTGTTCTATCTCCAATAATATAATTAATTTTCCAGGGTGAAGTTTTAT
ACACAAGAAATTGTGTTTTTCCGGCAAGATCTCCTTTACAGGATGCGGCG
ATCCTGTCTGATTCCACCAACAACGGAAGAAACAAGCGATCCATTTGAAC
ATGCAAGTTAATTAACTTTATTTATTATTTTAGTGAGAATATATGCTGTT
GACTGTTGAGAAACTAACCAATCCTTTTTGTTCAGCTAGTAGCAACTATC
ACCCACCAGAGTCATCTGTGTCCATTGCCTCTTACAGTCCAACCTATCAT
ATGGAACTACGATCATTGCCTTCGGCTATATCCAACTCCTCACACGGTAT
GTAACTTGGCACATAGTTTATGCACACCTTGAAATGTTTTCTGACAGTAA
TCTCGATGAATATGCTTCCTTGCGAATTTATTTTTTGAACATGCAGAAAA
ACATAAATATATGTCTGCAGTATAATTACAAAAGTTTGGGAGTACTTATG
CTAATACTTTATATCTTCTTCAGATAGTATTGGCTGACAAGAGCGAGCAG
AAGGCCTTCAAATATACAGGAATCACTTGCTTCAATCCTGGTTCTTTTGC
CAATGACAGCACTTTTGCAGCATACCGTCCTTGCACTAAGGAGGTTGAGC
TTTCTGCATTGGAAAGCTAATGTTGAAAGGGGGACAAACGGAAGCTGGAA
TGTGTAACACCCAACTTGGCTTTGAACCTTTGATGAGCTGCCTATCACCA
CTGTACATCAGCCATCAGATTGATATATGACTTTAGACATTTAAGTTAAG
GATGAGGCCATCGTGCAAGCGAATTCGCAAGGATGACATAGCAACATCAC
GCGTGGAGTTGGTGCCATGTCCCAAGTGAAACTGATGCTGACATCATGTC
GTAGGGGTCACAGATTTGTAGCATCCGACTGTTGTGGACCTTGTTGTCTT
GGTGTAACAATGAATTTGCGATGTCTTTTTCCACCTATGCTTTGCTGAAG
TTACAGAGCTGAGCTCAGTCTTGTAATCTGTATCTGTAATTGTTTCCATC
ATCTTAAACCAAGTTACAGAATTCTCCTTTGTGTTAATGTCGTAGGGGAT
TGCCCAGTTGTGTAAAATTGGATCTGATTAGTTAGACCAAAATGCAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.