Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA020378

[Submit comment/correction]

Sequence	AA020378
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA020378
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTGCGCGCTGCTCAGGCCGTGACCCGGCTTCGGGTTCCCCTCGCTCGGGC GAGGCCGTGCGCACGGCCTTGCCGCCGACTGGCTCCCTCCTGCGCCGCCA CCCGGACACCGCCCTCCGCCTCCTCCACGTCCACGCCTCAGCGCTCACGG CATCAAACCTCTGAAAAGAAATGGCATCTCTGGCCCGCGCCGCCGCCTCC GCCAAGAGAGCAGCCCTCCGCCAGGCGCCCCTCGCCGGCCGCAGCCTCGG CTCGTCCCTACCGCCCGCTTCCACCGCACGAGCCGCCCATATCCTCCGCA GGTAGGTTATTGGGTGGTTCAGTAGATGGATTCGTGGGCGTGGTCTGTGT TTGCTTGCGTTTACATCGAGGTTCCTGCAGGTCGGCAGTGGCTGGACTGG AGACGCTGTTGCCCCTGCACACCGCGGTGGCGTCGGCACGCCTCAAGTCC TCACTCTCCCAAGGTAAGCCTGCCGAGCGCCCCCTGCCCTCCTTCAGTTT TTTTTGGGTGATTTTTCTTTGTCAAACTAATTTATCCACTAAAAACAACC GTTGTTGGTAAGTGAAATACTGGAGTTAGACACTTACCATTTAGTATGTA GCATTGTGGTACAGAGTATAGCTGTTGATATGACTTTGTTATTGTGCTTA CGTTACTTAGGAACCTATAAATAAGAGATTGTATCAGTGTCTAATATTGC CAGTAAGAAGTATTGCTCATTCTCTTTTGAGACTGAATCACAGCGGTTTC CACCTTCCAAAGCTTATGGACCTTGATTTCTGTAACCTCTCTGACCATCT CTCCGTGTCCCCTTCCCATGGTTACTTTTACCTTCTTTACCATACCTCCC TTCCTAAAATTTCCTCACCATGTTGTCTCTTGTAATTCACCTCCTGTCTC TCACAACTAGGATTTCGGATGGCCTATGTTGCCTCCATTGAAGAGGTCTA CTGAAGACAAAAGCAGCAGCATCTGATACGCATTACTGAGAACTAGACTC CACTCGTTTGGGGCATAAGATTTGAAAATACTATCGTTGCTACCAGATGC TGCACAACCAGGGTCTATTCTACCATGCCAAAAATCTTGGTGTAAATATG CCAAATAATAGTAATATCAATATTCTACAAAACAAACCTAGCACCAGTTA GCCCTGAGATTATAGTAGGAGCCCTCTGTGTCCGAAAAATTGAATTCGGG CCAGTGAATTATGAGGCGCTCCATTTTATAATTGATATCCCCCGATTTGC AAAGTATGTCACACACCAATTCGGTACTCTATGCTTGCTGAAATTGATTA CGAGGTGCTCCATTTTTTTGATTGTATCTTACTCTAAGGCCACAGTTCTT TGTGTCAGTGTATAAACCAAAATGTTTTCCTTTTTTTTTGCAGAGGTTCA TGATTTTACGGCGAGTACGGGTTTGTCTGCGGGATTCATGCAAACCGATA TTGTGAATGCGCTCCGTAAAGGTGATCGGCAGCGAGCATCCATTATGCTC TCGAATCTTAAGCAAACCAAAGAAGCAGCGTTAACTTCAGAAGATTTCTC TTATATATTGGAGTACTGTGCAGAAGCACCTGATCCTTTGGTAAATATAC TGTCAGATGCATATTTTACCGAAAAACATGGAGTTTGGTATAGTCATTTT GATTGGTGCTTCCTTTGGATCTTCTCCAATATGTCTAGTTTGTTATGGAT ATTTTGGAGATCATGGAGGAGAAGGGCATAGATATTAGTAAAGGCAATTA TAGATCCGTCACTCGAGCACTCGCTGAAGGAGGGTATGCCAAGGAGGTAT GCTATACTTCTCATGTCCCAAGTGCAACTTTTTGTATTTTTAACTTGTTC AGTTGTTAAATAATGGAAACACACTTATGAAACTGCTTTAAGTAGAGCAT TAATAGCATTAATAATGTAATAAACGCTTGTACCACTAAACCCACTGTGT CTTCTGTGTAAACTGTCCAACTTTCCATTTCTTAATGATACAAGCTAGTA GGCAGTCAAAATGTCAATACCAGTGTGTCCATCCTTTTGTATAAACGAAG CTTCAACTCTAGCCCAAGACCTGTTTCATTGTACTTGATAAATGGTTACA TTATTTCACGCCTTGGCCAAACTGATATATTAGCTATTTCTTCATGGGCC AGTGTGTCCCCAAGTTTGTGCGTGGGCATGCCCTCAAATATTTCATGCTC ACCCATTGTTTGGTTTCACATGTAGACCTTGAGTTTGGCCATCGTTTGTT CGGTACCTAAACTTAAAAATCATCTAGAAGCATGGTTCTATTAAGCGCTG AGCGCTGAATGAGCATTTTGCCTCCGATTTTCCCTTTTCTGAAGGATTAA AGTGCTAAGCACACACTTAAGTGCAATTAAACGCTAGGCGTTTTGCCTCC GCTCAGTGGTTAGGTGTGCTTAAGTGTGCACTTAGGAGCGCTTATAATTT AACAATGTCTAGAAGTAATCTTGACCGCTCTCTGTCTGCAACCATTGTTT GCATATGGCCTGGCAATGGTCTTCCCTTATGCAACAGTGTCTTTTCTTCT GATTTGCTGGTGACATGGCAGACTCGTGATAGTGATGGTGTAAGCACATG GCATCCACGTCATCTAACACTGCTCCAAATTGCTGCAAGGGAGTCGCCTG GATGGTATTGGAAGTTGAGGGTCTGATTCTAGACTGTTTTGAAGTTATAA GATGAAAAGCCGGCGAGGTCCAAAGTTCAGGGTTTTAAAGTGGACATTGT CATTGTTTGTATATATAGCATATCCGTAGGAGATTGGCGAATTAGACAGC GAGTTGTAACAAGCGATCTCTTATTCTGTTTAATCTTTTATCATGAGCCT TTTTGATGAAAAATATGTTGTTTTGTTGATCTTTAATTTTATCTTCTTCT GCCACTTGTGCTCTGCAGTTCTTTATAATTTAATTTCTTAAATTTATCCT CTTGTGTTATGTGTTTATCTGCTTATATTGAATAATTCCTTGTAGCGTAT CAGTCTTTGCAGGAGATTCTGGTAGCTCCTTTCAGTTTTCTAGTTGCTGA CAATCATCTTTTCCGATGTAGGCACTTAAATTGCTCACTCTTCTCGGGGA AAAAGAAAGCACTTATGGTGTTTTGCCGATTTTCAACATCTTTTTAAGTG CCTGCAGAACAAATTTGAACGATTTTGGGAGCTGTCTAGAGAAAATGGAA GGTCATCTTCTTGGGAAGTCTGAAATAACGTACTGTGAGCTTCTGAAGGT TCGTGTGGATAAATGTTCAATATGCCTACTTATGATATTCAGATTCAGAA GTTTATTTTCATATCTGGAGAAAAAGTATTAGTATACCAGACCTACCTTT TGTGGCTGCAGCTGTGAGGAGACATAGCCATCCATGGTATTGCTGACTAT TTGATACTTCTTTTCTGAATTAACATTTGATTGCATTTTTTTGCAATTTG TATTCCCTCTGGTCCATCACTGTAACCATCACTTAGTTTGTGATGCTTTT GTTGGGAACTGTTGCATGTAGATCTTAGTTTCTTTTACTTCCGGTCACAT CATTTTCCATTCTATCTATTTCACTTTTAGGGCGTATCTTGAGATTTTTT CTTCTGTTTTCATGTTATGCTGCATTTCACATGTTTCTTGGGATAAATCA GCTCCTACCACATATATGTTAAGATGTTCATCTGTACATGGTTTTAGATC GAATGTTGTGCGAGCTTGCTTATTTGATTTATGCATCTTTCCAGGTTGCA GTTTTGCAGGGAAATTTGTCTGCAGTTCATGATTTATGGAAGGACTGCAC TAGGTACTATAGTCCAAGCATTATTACTCTGAGGAAATTCGTGAAGGCTT TCTCTACGCTAGGTGACCTTCAATCTGCATATCATATCTTGCAGCGTATG GTTGTCCTTGCTGGAGAACGCACTGACCATCTGAGGGTGTCTTCTAAAAG GAGATGTCAATCAATAAGATTAGACATTCCTGTACCTGCTTTAAATGAAG TGGAAGATCTCAAACTTGTATTGGACTATGATCCACCATCGTCATTTCAA GGAAAGATGGGAACTGAAGAATATTTGGTTGATGCTCAGCCGGAGCCGTT CCAGGTGGAAACTCAATCATCAAAACATAAGCAATTGAAGAGTTATGTGT CAGTTATTTCTGCTGGTCTGTTCTCATTCCAATTTCATAAGCCCAGTTGT ATATACTTGTAAAATCTGTTTTAATTATATTTATAGAACTTATTTGCTTT CAGTCTTGTTCCAGGTGACAATTCTGGACTAGACAGTGGGAAGATGACAA AGACATTGAGATTTGCACCTGTTGCAGTAAAGAAAGTCTTGAGATGGTCT TTCAATGATATTATACAGATGTGCGTGCAACTTGACAACTACCAGTTGTC TGAGCAATTATTTCTAGAGGTAACAAATATGTATGGTTTTGTTAGCTTAA GTTATATTGTGGTTTGCAGTCTTTCTGCTGACTTACGTCTTGACCTAAGC ACTTCCCTTGTTACATTAGATTTTGTGAACGTTTCTTTTCTTCTAGATGG TTGAACATCAGTGTGTTGACATTCCAATTAATTACGTAATTTATTTCATC TGCTGTACCTGTTCCATCTAGGTCACATTAATTGATTCGAATTTTTGTTC TGTAATATTGTGCTTTCGATTTACTATTTTTCTTAGATAGTCACAAAAAA TAGAGCAAGTCCATTTCTGCACGAAGCATGAAATTTGTTTGAACTTAGTA GCTGGCATGTGGGCCAGCACCACCAGCAAATTGCCCAGTATTTTAATTGT TTGTTGATTTGATGCTTTTTGAATGGTTAAAGTATTTAAACTGAAAACTT TACATGTTCATACAAACTGGTGATTTGAAGACCAAAAATTTCTGCTGTAT ATTTTGCATACAAGAAGTTCAATGTTTATGCTCAATGTTGTCCTTTCTTT CTAGATGCACAAGATTGGACTGCGACCGTCAAGTTTTACATATGATGGTT TTATCAAGTGTGTGCTAGCTGGGAAAGGAGTTGCACATGCTATGAAAGTG GTATGCTACCAATTTTATGATATATCCAGTTAACACGAAAGGATATCTTG TTAAATATGCTTGTGTACAGTAATTATTTTCTGAAACCCTGAATATAGTT ATGCTATACCTACATTAGCATAAAGTAACATGCTGTACTGTTTTAATTTA TATAGATAATGTAATTCTGATGTTAATCACTGTTATTTACTCCCCGTCCA TAAAACCTACTACTACTACTATAATATTTTATATTTTTGTGCTTTCCAGA TTGAAGTGATGGAGAGAAGGGGTATTCAACCTTATGATGGTGCACTTGTT GCTCTCTCAATTGGCCATAGCAAAAGTTTACAGTTGGATCTGGCTGAGCA CTTCCTGGGAAGAATTTCAGATATAAAACCGGACTATATTCATGCTTTTA ATGCTTTGCTTTCTGGCTGTGACATTATGGTAACACATTGACTTTGAAAA GAGATTCTGATATGTCATACCTATTGTCATCCTAATTTCAGCAAGGTCAT CTATGCTAAGTTACCGATCTGCTGACATATGGTCTATCAATTATCTTTGT CTTTTCCTGTCTTTAATAGTTGTACTCTATTCGTATCAGCGATAATATTC TTTCTGTTTTTTTCAGTGCACTTGATTTTACTTGATTGTATAGAACTACG AACTAACTCTCCTCATTATTTTTGTAGAATGAACCAGAAAGAGCTCTCCG TGTACTAGCTAGAATGAAACACTTGGGTTTGAAGCCACATATCTGGACCT ATGAGATTCTGTTTTCTCTGTTTGGCAACGTCAATGTTCCTTATGAAGAA GGAAATATGCTATCACATGCTGATGTTTCCAAAAGGATCAGTATAATCGA GATGGACATGTTAAACCATGAGATCCAACATAGTTTTGTGTCTATGAAGA ACTTGGTATGTTTACTTTACTACATTCTATCTATGTAGATCTTCATCTAT TTTTTTCTTTCAGTGTATCAGATGTAATGTTCTTGCGAGAAACACACCCA TTTTTACCTACATACCTACAAGTAAGAAACACGCGGTAGTTGACTGTTTT GGTAACGATTCTTTTTCATATGCTGACTACATGGCCTTTGCTATGGTCAT TGGAAAACAGTGAGTCTAATTTTCTTGTTTCCTTGTTTAGCTTTTGATCT AAAATTGCTCCATCAATAGAGTTGGCACTTGGTGCTAGTAAGAACTAAGA AGTATGCAGCACATTTGTTTCTAACTATTCTGTTAAGAAATAATGCCATT TTATGTCTCTGCTCCTTCGTTTCACATCATGGTCTAAGCTGGCCGAGATT TGTTGTTGCTTGTTGATGACAGCCTGTTTAATTTATTGAGTCTATACCAT GGCTGGCTTGCATGATCTGTTTAAACTAGCATATGTCAGCATAAGTTATC CTGTCTTATCCAGCATTCCCAGTGTCTAATCCGTTATAAACTTATGATTC TGAAAAAGGGGAAGCAAATGTTTTAACTTGTCTGAGTAAGATATCTCATT TGCATGTGATGTAAGACTGGACTTTAATTGCTAATATGGGTGTGTTGGTC AGACCTAGGAGAGTGGGAAGCACTTCACTGTGAATGCCATTCACAATATT GCTTGTGTTTTGATGATCTTATATGATTCTGTACTATGGCTTGTACGATA TGTTGAAATTAGCATATCATTGGTCACCCAGTCATACCCCAAGACCTCAC TGGCTTAAAATTTTACCATGATAGTTATCAAATTAGATTGCTAAGACCAA TATGATCTTCGATTGCTCTTACTGTGATTGCATTCTTGTAAGTATTGATG TTTTATTTGCGAATTATGTTATTTCAGATACGAGCCTTTGGAGCCGAGGG AATGATAGATGAAATGCTGAGGTATTTGAATGTTGCCGAGAATGTCTTAT GGAACATGGATCCTTATCAGAGGAGTGATCTCTACGGCATTGTGTTGCAT GCTCTGGTTAAAGCCAAGGAAGTATGGGTCTACTTTTAACATTTGTTTCA TTATATGAAATGATGAATTGGGTTTAATTTTCTCGCAAGGCTATTTTGTA TGCTTTGTGTGTTTTCAATGGAACTTGTTGAATTTGATATCTTTCTGGTT TGCAGACAGACAAGGCAATAAGAACTTTCAAGATCATGAGATCATGTGGT CTTCCAGCTAATACAGCTATTTATAACGTCATGATCGAGTGCTGCAAATT GTTGCCGTGTATCAAATCAGCTGGCACCTTGGTGTCTTTGATGCTCCGAG ATGGCTGCTTCCCTACAGTTGTGACTTATACATCTCTCCTGAAGGTAAGG CTGGTTAATTGCAGGCGCGTTACTACTCACTGTGTAACGTACTGCTGATT CCCATGTTTTAGTTGATTTGAATTTCTGTGCCCCATTTGAGTCTGATGTC ATGTTTTTGCCATGATAGGTTCTATTAGCAAAAGATGATTTTGAGGGGGC ACTGGATCTGTTGGACTTATGCATAACTGAAGGAATTCAACCTGATATAG GGATTTTCAACACAATACTCTCAGATGCCAATGCAAGAGTATGTCTATGA TATAATTTGTCAACTCTTATTTCCTTGAAATGATGTAAAAGTTGAACTCA TGTCTGGTCATTCTTCACAGGGTAATATTCACATTGTTGAATGTATTGTT GAGTGCATTCACAGAGCAAAGATTCAACCCGATGAATCGACGCTTTGGTA CACGTTCTGTGCCTACGTGGATCAAGAACTGTACAACACCGCAGTCGAAG CATTGCAGGTCCTCAGTATGAGAATGATATCCGAGGACGCAAGCGTTCTC AAGGAGAAAGGAGCGGCTTTAGAGGATCTAATCCTCAGCGAAGAACCAGA TGCTGAATTAAGCATCATCAAGGCATGTCGAGCAACCGGCGAATGTAGCG CGGCAGCCTTATTGAACCTGAGGTGGTGCGTGATGATGGGTTCCACCATA TCTTGGTCACCTGAGGACAGCCTCTGGGCAAGGAGGCTGGCATCTTCTTA TGACGCTAACACCAGATCAGACATGCGATGAGATCCGTGGATCAGACCAA TGAGATAGGTTTGCTGGTGCGTTTGCATGGTTTTGACATGCTCTCGGGGA CAACTGCAGGTGATGTGTAATTCTTAACATCATTCACCTGGCTACTTACT AGCAGTTCACCTGCATCATTCACCGGGCTGTTGCATGGTTTTGACACACT CTCGAGGCCAGTAACAGCTATGAGGAGGAGCATCTGGCTCACTAATTTTG CATGAGGTAAAGGTTGATGGTGACGAAGATTGAACCACCTGGAACTCACC TCCACTAAATATGTTGCATGTTTTGATTAATGAAGAGAAAGTTTTTTGGT CATGCATCTGTAATGTATACAGTGGCTGGGTGATTACAAGGCATCCGAAA ATTGGTAGGAGATAGGCCATTTGAGGACTTTGAAATTGTGAAGTTCTTCT CTTGCTCATGCTGACGCTAGAAGGTTGTAAAAGTGTATGGAAGAAACGGA TCTGAATTTTCCCTTGCTCGTTATTGTAAGAACACCTTAATTAAACTCTG TACGTCAACGAAATTCTCTGCGACGACACCTTTATATAACACAGGTTTTG CAGTTGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.