Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043998

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043998
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043998
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCATACCGCTGTACTGCTCCCGTCGGCGACCCACGGCGACCTACTACTC
CCCAGGTTCCTCCGCTGCAGGGTCGGTCCCGACCCGTACGTCCTCGAGCC
CGGCCGGGCTCCACCACTCCCCCGTGTCCGTCGCCCACCAACTCCCACCG
CCCCGAGACGTACGTCGAGCACCTCCGTCTCCTAGGTCCACGACAACCTC
GACCTCAACCGCAGCGATAAGGTAACCTGAATTCGTGCCGACTTCTATAT
TCCCTCACCCCTAAATTTGTGCACATGGTCGATTGCTGAAGGCTGAAAGC
CATCGGCCATGCTCGATCTGAGGTCGTGGTTGATGTGAGCCAATTTTCTT
ACCGCAAGTCAATGAGACCAAAAAATAGGGCACGCTGTTTTTAGCATGTA
AGCTGCGGACTGTTGTTCAGTATTGGCATTTGTTTTGGGAGTTTTCTACT
GTACTAGCACAACTCGTAGCATCATAAACTGGTGCATTTGGTGCTGCATG
ATTGAAGAGGAAATCAAGTTATGTGGACAAAGGACGTATTTGGTGTAGCT
AACACAGGGATCAAACAGACACCACGATATTATTTCACACGCTTTTGTTT
GCTTGCTTATTACGCATTCAAACTAGTTGGCAAACTGCGTTATTAATATA
TTCGTCTATGGTATCTTGATATTTAATATATTTTTACCACCAAGTCAATG
AGACAAAAAATTAGGGCACACTGTTTTTTAGTGTGTAAGCTGTGGACTGT
ATAAATATCAGAAGGTGACCGTATAATCCGGTCATGGGATTTCGTTCAGG
TTTGTATTCTTAAGGATCATGCAGTTAGGGTAGGTCAATGTACTTGTCAG
CCTGTAATGTGCGTATATCTGTGTTTGTGACATATGATTTACGGAGCTTG
TGATTTCATCTCCTACAGGCGGACTACGTGAGGAGAATATGCGAGATCCA
TTCAACACCCCTGTTGATTCCATTGACGTGGATCGTCGTGCTGGGAATGA
GCTCACCAGAACTAATGTGACCTTGTCTGTTAGGGACTATGGCTTGCAAA
ATGGTGATGCTAAACCCTTCATTCCGAACTCCGACACTCTAGTCAGGTCT
TTCATTCTTGTGGGAAAGTTTGCTGTTATAGCTGCAATGTTAGACTGCCA
TCAAATTTTTTTTTTTGAGAAATGAGGCCGTACCATCTTCTGCCAGGCAT
CAACTCCAGGGTGCATCCCTCCACAATGACTTAGTTGCAGAAGATCCCAA
TACTCGTTTGATGGATCCTGCAACCAAGGTAACCGTATGGGATCCTTGCT
ATTTTCTGCTCCTTCAGTCCTATATTTGCACCAATTGCTGAAACTAATGA
CATGTTCTTGCAGGAGCTTTACTTTAGATCTCGGACACAAGAGGAAGAAA
TCCTGCTGCTTCGCAAGCAAATTTCTGATGCATCTCTGAAGGTAAAAATG
TTACCAAACAGTCAAACATATTTCCAAGCGCAAGTGCCTTACCCTTTCCT
TTTTTTTCCACATCTGTTGAACCCATACCTATATCCATTTTTGTATGTTT
GTAGGAGCTGCAGTTGCTGAGTGAAAAACATATTCTGGAGCGTAGGCTTT
CAGACCTGAGAATGGTCTGTATCAATGATACAATTTACAGTTGCGGCATG
ACCAATTTGTAGAGTCTGTACTAATGAAAGTATATACCATGACAGGCTGT
TGATGAGAGGCAGGAAGATGCTATATCTGGTGCTTTGAAGCAATTAAGCG
AGAAGAGAAATCACCTTGAAGAAAATATGAGACTGGGAAATGAACTAAAA
GTACGGTGCTATTGTACATTTGAAGAATGTATGCTCAATTCTCTTTTTAA
TATTTTTCCTTGCGAATCTGCCAAACTTAAAAGAAATAAAAGGGTAGCCT
GATGGTGCTAGGGAGGAGTCCACTAATATACCTAATAGACCTAGTGGTTC
AGGTGAAAGGTTTTGTGTTAGTAGGCTGCTCATACTTGCCAAGTCATCAT
TACTGTATTAAGTGCAACATTATAAACAATCGATTTTGGCAAATTATATA
AATATGTGTGGTACTTTCTTTTGATGCTGCAGCTCCTTTACTCTTGTTGT
ATCATCACATTTAGTAGTTGCATCAGACCTGAAAGCTTGTTTAGATAAAT
TCCACAACCTATGCATATATAACCTTACCCTACATATCAGTATGATCATG
GTTTTTAAAGCGTCCGAGCGTTTTAAAGCGTGGAGGGGGCACCTCTACGC
CTAGGCGCTCGAAGCGCGAAGCGAGGCGACGCTTTATGGTGATTACTAAA
GCGCCTAACAGCACCATGGCCACCAAAAACAGAGCAGCTGAGACGGGAGA
GGAAAGAGACCAGGAGGAGGAAGAGGAGCAGTATCTTGGTGCCCTACTGG
GGAATGGCTGCGCCAGGCGGAGGAGAAGCCCTCGAGCTTGGCCGGAGAGG
AGGAGGCCGGCGGAGGAGGGAGGAATCTACCGGAGCAGGAGCAGATCTGA
GGAGGACGAGCTGGCCGCCAGAGAGGGAGAGACCCCGTGTGTCTCTCTGA
ATTGTTTTGGTCAACCCTAGGTCTGTGAACCCTCTTCCCTCTTTTTTCCC
TCCCAGGCAGGCCCAATTTCCCTCCCAGGCAGGCCCAATTTCTCTCCCAA
GCAGGCCCAATTTCCCTCCCAGGCAGGCCCAATTTCTCTCCCAGGCAGGC
TCAATTTCCCTCCCAGGCAACCTAGATCGATAACTAAAGCGCTCAGGACG
CTTTGCCTTGCCAGGGCGCCTCGACGTTGTAGCGTCGCTCGACGCTTTAA
AAACCATGCGTATGATATTGAGTGGCATTTATTCTGTCCACTAACTTTAC
AGTGGCATATGCAGTTTAAATGCAAGTTTGTGCCATCTCGCAACTTTATA
GCATTGTGATCAATCTTTTAATTTAAACTAGATTTCAAAATACATACTTT
GCTATTGTCTAATCAAGAATACAATGTTCTTGTAGGTTCAAGAAGAAGAG
CTATACTTGTTCACTTCTTCATTGCTTGGTATGCTAGCAGAATATGATGT
TCGCCCGCCTCAAATTTATGCTTCAACTATTACAACTCTTACAAAGGTAA
GTCTCATTTGGTCATCTAGTAACGTTGAATCGTCATTGCTTGAAAAGCAC
ATACTATTGTATTTGCCTAAGTTAGTCTATTGTTACTTGCATGGTAATAA
TAATGACTTCAGTCATGAATGGTGATTTAAATCTATGAGCTAACAGAACT
TTGATTAAATTATCTTACCTGTTAAGCGTTAAGTCAAACAGATTTTGGGT
CCTCGTAGATGTGATTCTAATTGCCGTCATAGTAGCTCTCTGGGACTGAA
GTTCTTTTGCTGTTTTATTTTAAATATCAGCTATCCTACCACATTTTTTT
CTTGATTTCTGTGGTAGTTCGCTCAATTATTGTGCTTGATGCAGAATGCT
TAGTCCAGTACTTAGAAGTGAGTTGTACTAGTGTCTTCTTAATAACCAAT
GCTCAATGGCTAACATGGAGACGTAATATATTTGTTTTGGCCATAATTTT
CAGCGCTTGTACCAACAGTTGCAATGGAAGATCAGATCTTTAAATGTAAG
TGATTTCAGCTATATGCACAATCAAAAATTCTGGTGAAGTCTCCATTTTT
GAATTATTTTAACTATTTTAAGCCCCTTTTATGTGTGTTCCACTGCCGGA
CATCAATGATCCCTAGTTAAATGAACGTGGTATTGACTATATTCCACCCT
TTTTGCGCCAATTTAATTAATAGGCACCACCATGACATAATTCCCGAAGT
TGTGATTTATCTAGCGATCTTGGTGTAAGTATGCCCACAGAATATACTCA
GTACCACTTCTATTGATTTGCTGAATAGCTTGTGTACAACTCTGCATGAC
TGTACGTTGTTCTATCTTGACTGCATGATTGAACCCTGTTATTAGTAATA
TTAATGTGTTAAAATGTTTGATTTTTGTAAGGCACTCAATTGATCGATTA
TACTGATCCAGGACAGTTTACGCGATACAACTCAACCTGGAGACATATAT
GATCCCAATCATCAACAAGCAACTCCATCAAGAAACGAACCTTCCTCATC
TTACAATATGGTATGATCTTATGGTCCTCTAATTAGCTTGCCTGACATTG
TAGCTCCATACATGACTCTTTCCTCTTTATAGGAGGTGAACAGGAACACC
TTTTCTCAGTATGCTCAAGATCCAAATGATCGACATGCTGACCAAGTATA
CCACGGATCCACTTTTAATCAGTATGTTCTCTATTTAGATTTTGAATTTA
TGGTTACTTACCACAATTATGAGCCATCCAGTAAAATGTGTCATTGACAT
GGAAAGATGTTGATCTCCTTGTCTTGCCTGGCACTTTCTTTCAGGGATAT
AGTATCTGCTACTCCCTCTAATTATTTTCCAGAAAATGCTGGTCCTAGAG
AAGCAAGATTAGATGATGACTCACAATTCTATAGGAATGATAATCAAGAG
TACTCAGCTGATGGTAAATAAAGAGCTAATTGTGCAACTAGAAAAGATTG
CAGATCATATCTATTGATATATACGTACTTCTAAACCAGGTGATCCACTA
CCTGGTATTGAGGGATTTCAAATTGTCGGTGATCCTAGACCAGGGTCTAC
TTTAAGAGCATGTGGTTTCCCTACAAATGGCACTACACTTTGTAATTTTC
AGGTATGTTGTGTTTCGACTCTGCATTGTGATTCTTTTATCTTTCCTGTG
AATTTCCAACCTCTAATAAAAACCTTTAACACCGAGATGTTGTCAGTGGG
TTCGCTGTCTTGAAGATGGCACCAGGCAATCTATTGAAGGTAAAGAAGGG
ATTTTTCCTTCAACCATGTGATAATGTTCAGAGAAATAAATGTACTGACT
GGTTCGATATATTTTGCAATTCAGGTGCTACGATGTATGATTATGTCGTT
ACTGCAGATGATGTTGGCACTCTTCTTGCTGTAGACTGCACTCCTATGGA
TGATAATGGCCGCCAGGTGGTTAATAAGTATACTTTAGAGGCAATTTAAT
GTCACAAACTGCAACCCCATATGGTGAATCTTAGTTAACTGCCATGTAGT
GCTCAAGTTCCAAAACTACCAAAAACGCTAAAGACCATCATTTGTTTGCA
TATGGGAGGAAACAGAGAACTTTTGACAGAAAATTTTCGTCCAATGACTT
TCTGCAGTGAAAATTGAGTCCCATTTGCATTGTTGTGTTAAAGTGAGATT
TTCTGCAGCATATGAAAAATAAACTAAAGCTATGAGAAACTATTTGCTGA
ACCTGATTTTTTGGAACCCTGTTTACTCTAATACACCTGGGATAAAATGC
TGTTTACTCTAATACACTATCATGCTCTCTATGGGCCTGTTCTGCTCCTT
CATATGTATTGAAATGCTGGCCTTACCATTTGAAATATTTGCTAGTATAA
TCTTGATTTCAATCTGATTTACCAGTTTAAGTTTTGAAGCATTTTGTGGC
TTTTTTAATGTTGGTATTTGCTTAATTCCGCCCCTTCCATTTTAACATAC
TAGTTTGGATATTTTTTTGAACATTCTTGTTGTCCTGATAGGCTGATCTT
GTTCTGTTATTTCTGTTTCATTATTTGTTGCTCCAGTGTGAACCCTTAAG
GATGCTATTTCTTGCTTTCATATATGCATAAGCGTACAGCCATCTGACTT
AAGAAAAGCCTGTTTAGCTGTTTGTTTCCTGGTACTTGTACTTTTTACAT
GATAGTTTGCGCAACAAGTGCAGATGTTAATTTTCATTGATGATTTGAGC
TTGCAGGCAATCATATCTGTTACCTAGCTGATAGAAATGTACTTGCAATT
TTTGCTAGATGCATGGGTCTGAATGGAATTATGTGCACCACTGATACATG
AATTTGTTATCTTGATAGTTTTGAATTAGTCTTATGCACAGTGCTTTTCT
TCTAGACTTTTAAGTTTGATGATTTCCTCCTCTTGATTGTAGGGTGATTT
GGTCAGGGAGTTTGCTAATGGTGAGAACAAAATAACCTGCGGTAAGTTTT
TGATGTGTATGCTGTTTCCTCTTTTGGATTCGTGATAACATGGATTGTAA
CATTGCCACGCCTTGTCTAATTTTATTGGATCAGCATTTGGGTTCGATGT
ATTCTTCCATATTTTTAATTTTACAAGTGCGTAGATACTACCGCTGCTTA
GTAGTCCAATGTATCCTGTTGCTGAAGTGGAAGCTTCATCTTATTGCATT
AACATAAATTAGCCAGAGACAACATTTTTGCTCTTTTGTGATTGCATATT
TACCTCTACATACCTCCTCCTGAGATAGAGCTGTGATACGCTGATACTGA
TTTATCAAATAGCACTAATTTGGAGATATTAGAATTTCTACGCATTCATG
TTTATTTGAAGAAAAAAATTTAAATGATCGTGGCAACGGTATAAGCTGGG
AAAACACATTTTGTTTTATTAGAAGATTAGTTACAGCCTCACGGTTACCT
TTTTTTTGAAATAACCATATATTCCATTAGACAATCTAGAGATTACATAT
ATGGTCAACACCTAAGACAAACATGCCTGTCAAGCAATTTTGCACAAAGA
ACTCCGCAAGTAAAATTACAATTCTACCCTTGGAGAAACTCATGCCTCGC
CGAACCGTCGTCCATCGTCCTCCATCGCCACCATGGTAGCACCGGAAAAA
GAGGCGATCAACCGCCATACCAAGATCTGGGAGAGCACCATCGCATACAA
GGATGCTTTTCGAGCCGATGAACCGAGTCGTCGCAAGCGACGAGCCCAAG
ACTTTGTGGCACGTCGGCCGAGGATCTTGCCCGTGATCACCAGATCCTGA
CACCGTCATCTTCATCCAACGCAGTCGAAGAAGAGAAACGCCACCGATTG
CTGTCTTCCACACACACAACTGCAAGACGTCAAACACAACTGCAGCAGTT
GACGCGACCGCCAGCCGAGAGGGTGCCGAACGTCGACCACCTGACACGAA
TCTCACCGGATCCAGAGACCGGCGAGACGACCAGGCCACCTGCCCCTCGA
TGCCACCGGTAGGAGTGACGTCGAGATGGAGGAAAAGCAGGAGCAAATTA
TTCCGACGCGACGCCGTCTCCTCCATAGAATCAGCGCCCCAAGGAAAATC
TAGACCAACCCTAACTACAGCTGGAGCCGAAGCACCGGGTCCCCACCTCC
TCCCGTGGCCGGAGCGGCCAACGGAGAGGAGGCAGGGACAGGCGGCGGCG
GTGAGGTTGGGGGCAGAAGGAGATCGCCCCTGAGATCCTATTTCTCAGGA
GCGACCAGGTTTTTTTAATTATGATAAAACTTGTGTATACCTCACGGTTA
CCTGATGGATAGGTGGCATCGATATTTGTATTGCAGTATTTTGAAGTGGA
GTCTTGTAGGACTGTAGGTGCACATCTGAAAGAACTTGAAAGGGATGGCA
ATGCTTGTCATACGGCAGCCAAGTTCTAAAAGGGCACAAACTTGATGACA
ACCAAATTAGTGATTTTTTTGAACAAAAATTAGTGAAATTATGTCCAGAC
CTCGTCACAGATGACAACATTTGTGAGCCATAACATTTTTATCGAATAGC
CTGGATGGCTGTCCCGTTTGCCACCAAATTTGGGATAAATTATCCACAAG
TACCTCACCTTTGTAGAACTGGTGGTTTTGAATAGCCTAATTTATTTTAT
CCATGTTGGAGAATCTAATTTCATTTTTATCCGTTGCAAATCACAGTTAT
TTAGTTGGTTTTCTTAATTCAGTGCACTGTTAGCATAGCTCTCATTCCAT
TTACACCTTTCAGTTTCTTATAATTATCCTAGTGTCATTCTATATCATGC
AGATCAAGTTTCTTATAATTATCCTAGTTGGTTTTCTTAATTCAGTGCAC
TGTTAGCATAGCTCTCATTCCATTTACACCTTTCAGTTTCTTATAATTAT
CCTAGTGTCATTCTATATCATGCAGATCAAGAGATGCAGAATGACATCAA
TATATGTATTTCGAGGGGGAGAGCTGACTTTGATGTTTTTGTCCTGGTAT
GTCTAAGTATTTGTTTACCCATCAATCTTTCTGAACTAACTAGTAAAAAT
ACTCTGCCTAGTAGAGCTAACAGAACCTTCAGTTTGAAGGTGACATTTGT
TAGGTCGCTTACAAGCAAAATTTCTTCTAAACTATAAGTAACATCGTTTT
AGATCAAAATGCTTGGGTTCTGGAACAAAGCTTGATAGAATTTGTCATAG
CTCAATAAAAAATTTAGTTGAAACTTGTTGGAAATAGAATCCCTAATTTT
TGGAAATTGTGGGGAACTTCCTATGAAGTACATTAGCAAAGGAACAAACT
ATAGATGGATGAAGTCACTTAACACGGGTTTGCATGGCAGTCAGCTGGTT
CAACTAATCAAAGCGCTAACTCTAGCCTTTTAAGTTTCTTAATTTGTGAT
TGGTTGAGATGGGATTAAATATCACCATAACTGATTTTACCTACCGAGGT
TAGTTGACTGACTGCTAGATGTGTTAACTGTTATGCACAGTTTGTACCTA
CGAGGAAATAAAAATGTTTTCCAAAAGTTGAGGCTGACATGACCTTCCTT
TGCACAGCAGGAATATTCTCCTGATGAATGGGAACAGGCAACGTTGGTGC
TTAGACGAACCGGGTATCAGATTAACATCAGCCATAAGGATGAAGTTGTA
ATTGATGAGAAATATTCACCAAATCTACAGGTACATTCCCTGTCATGCAT
GTTTGTTCATCCAGTTTTTAAGATTGCTGAAGCCTGATGTTGTTTTATTT
CTCTGTATATGTTTCTTCTTCACAGACAAAAATTCCCAATGGACGAACTA
CTCAGTTTGTCTTAGTAAGTTCTGGGGGTGTAAATCTACCATTTAACACA
CAGGGAATAACTGAGCCGAATAGTGAGGATAACGACGTTAGGTGCCAACT
TTTACCTTACCTTCTACTTCCTCTGTTCCCTATTATAAGATGTTTTGGCA
AACTAAATTAGTTTACCAAAATGTCTTATATTAGGGAGCAGAGGGAGTAT
TTGATAATTATTTGGTTTAAACATCATAGATTTGATTAAGTGATACTTTT
GCAGGTTACGCGATTTAATCGTATTGGTCATGAGAACTTTCCAGAATAAG
GTAGTATCTCTTATATAGGGTATTTTGACTTTTAATTTTCTGTGTACAAA
TAAATCTTTGTTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTGACTGAATTG
CATTTGCAGGCATTAGATGCTAAAAGGAAAGGCAAGGCTTAGGTGTGTCG
AACAAGCGATTTTCATCTACTCAGTAGAAGAATTTTGCTCATTGTTTTGT
GCAGTGTTCATTTTTTTGCCATGAGGTGGAAGCATTCTTGATTATACCAC
ACACTCTATGCTTTGTCTAGAAGGTGTGAAATTACAGAAAAGGCTGGGTG
TCCTACTAGGTATTTTGTGTATAATGCTGTAATTCTCCGTAGCGTCTTTC
TTGCTTTCCTTCCATTTTTTCTCTCTACATTCTTTTTGGTCTCTCACTGT
TCCTTCCCCACTAGGTTGTTAGACACGAAACAGCAACTGTTGATAAATTT
GAGCAAGCCGGTTAATGTAATGAGTTTATGAGGTGTTTGATGGCAGAAAC
TAATTTACAAGTACAGGTGCTGATAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.