Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA040970

[Submit comment/correction]

Sequence	AA040970
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA040970
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGCATGTTTAGGAACCGAAGGTAGCATAACGGTAGCTCCTAAAATAAAGG GCATAATGGTAATCTTCTTTCCGCACCAATACAATGAAATGACGAATCAA TCGATCGGATGATCCATGGCCTCTCTCCTATAACTAGACGGAATCGCGCT GTACCGCCGGTCGGACACCTCGCGCCGCCGCCGCCTGATTCCGATCGATG GACGCCGAGGCCGGCCCCGCCGGCGCCGAGCAGCTCCCGGTACGCGCCCG TCGCTTCCCTCCCATTGCCCCCCGCTCTTTCTTTTCCCTCCGCATTGTTC GTTGGCTCTGGTTCGACCGGACGTGATTCGGCGCCTAAATCAGAGCGTTT CCCGGTGCCCCAATTGCGTCGCGGGTTCCATTTGATGTCTAGTTCTATCG CGGGATCAAGGATTCCGCGGCGTGTACGGGGGATCTTATATCTTCCTTCC TTCGTTCATTCTGATTTGATTATGTTTTTTTCTGCGGTTTGATTTGGAAG AGGTTCGCTGCTAGTATTTTTTCTCTTGCTGTATTTTACCTCGACGAGAT TTGTGTTTGGCATTTTGTTTCTTTGCTGCGAATGAATGAATTAGACATAG AATGAGTTAGCTTTCACCACCTTCTGCACACACAATTTATTTTTGGTAAG ATTTGATTTTCTAAGTAAGGAAGATCATTTTCATGATGGAAAGAAAATGT ATCTATTGGTTAGCTATCACTCTGTAATCATAACAGAGGTGTGATTGCCG TCAACAGAAAAAAAATGATTAAAAAGACATACAAGTACCAATTTCATGTC TTCAGGCAGGACATTTAATTCATTTCAGTTCCAGATGATAGAAATGAAGA CTTATGATTTTGCTGCTTCAAGCATCAGGCTACCACTTTCTTCAGAGACA TGGAGTGGCATGTTGCTGCATGGCAAAATGATTTTCTAACTGTTCTGTCA TGCATTTTCAGTGGAGGCAACACTACAGGAATCTACTGCTGCTAGCATAC CAGAGCTTTGGTGTTGTTTACGGGGACCTAAGCACATCCCCTCTCTATGT GTATAAAAGTACATTCTCAGGAAGGCTCAGTCAGTACCAAGATGAGCAGA CAGTATTTGGCGTACTTTCCCTGATATTCTGGACCTTCACGCTTGTTCCA TTGCTCAAGTATGTCATTATTGTATTGAGCGCTGATGACAATGGCGAAGG TACACCGTAGTTCCTTTGTAACCAGCTGCTTTTCTTTTATGCCTGTCATT GCTTCATTTGTATTGTTGTAATTGGTTGGCAAATTAATATAAACAGGCTC ACAGCTTAATCCTAACTATGGCACTTTTGTAGGTGGACCATTTGCTCTGT ATTCGCTCCTCTGCAGGCATGCAAAGCTTAGCTTGCTTCCAAATCAACAA GCAGCAGATGAGGAGTTATCTACATACTACAGAGATGGGTTCGCAGCTCA TCAGGGATCTTCAGTTTGGCTAAGAAAGTTCCTAGAGAAGCACAAAAAAG TCAAAACTGGGCTTCTCCTTGTAGTTCTGTGTGGAGCTAGCATGGTGATT GGCGATGGCGTCCTTACTCCAGCAATCTCAGGTCGATACTACCATCATGT GTTACCTTTCCAGTGAATGCACAGTTATGATTTTTAACCTCTGTATGCTT ACCATTCTTTGTTCTGCTCCTTTTCTCGCAGTCCTGTCATCTATGTCTGG GTTGCAAGTTCGAGCTACTGGTTTACAGGAACGTAAGTACAACTCATCCA TTTGAAATGTGAACTCATAATGCACACACATGTGCTTGTATGGAGTATTA TAGTGTTCCTGCTGCCTTCATTTTATTTTATTTCTTTCTTGATGAACCAC GAGGCATGAGGTGATACATGCACTTCTTTTGGTTATATTTCTGTAGTATT ACACAGATTTAGTCATTTGGTCACATCTGATTTGCTACCTAGAGCAGATC ATATTTACTGGCTCGATGCACAGTAGTATGGTGCAAAACCTAAGGTCTAC TGAATCGTATATATGCTGTGAGCATTTGGCGGTCTCTTCAAATACAGCAT TGAATATAGGCCTTTAGTTTTTCAAATGCTAATTTGTGTACATATTATAT ATTTGAAGTTTTTGTGTAATATTTCTGGACATTGGATTATGTAATTGTAT GATTATGCATCCTTACTTTCCTAACATTTCTTTAGAAGTCTGGACCCATT ATATTTTTAGGATTGACTGCTGCAAACGCGATTTGTTTTTACACAGGTTC TGTGGTGCTACTTTCATGCATTGTATTGGTTGGTCTGTTTTCCTTGCAAC ACCGAGGTACTCAGAAGGTGGCATTCATGTTTGCACCAATTGTCATCATC TGGCTCTTATGCATTGGTGGAATTGGATTGTACAACATAGTTCATTGGAA CCCACAGATATATCAAGCACTCTCTCCATATTATATCATTAAGTTCTTTA GGACGACCGGTACAGATGGCTGGATTGCTCTAGGAGGAATACTACTTTCT ATGACAGGTTAGTAATTGTCAGGATGTCAGGGGTTACAATTGTGCTTGCT TGTACTCTTTTGTAGGTCAAATACTAGTAACGGTTTATGTTTCTTTTGCA CTTTACAGGCAGTGAAGCTATGTTTGCTGACCTCGGTCATTTTACAAGTG CATCTGTCAGAGTAAGTTGCGCTAGTGATGATCTTCTATCTATTAGTTTC TTCACTGAGAACTTCCCACTGGCTGTATACATCCTATTATGTCCTATAAT TACTTTTATGTTGTGGTGCTGTGTAACAAAGCAACTATGAAGAATTAACT TTGGAATTTTTTTTGCCAAAATTTAATCTTATAAAAGGAGAAAAGTTCAT GTACCAAACCTTTTTGTGAGAAGAGATTGATTTAACCTGCATATTTTAAA CATATGCCATTTCCTGAAGAGCTCAGTTAAGTTATTTGTTGTGGACCAAA TTCTTGCCTATCTAATGCTTTTATGGCACTATTTGGTTGATTATACTTAT GCTTCTTGTTTTATCCCTGATGATTTATAATTCTATACATGCCCCTTCTG GCACGCTTTGCTGTTGAACCTGTATATATATTTTGGAATATGACCGAGCT TTCTCCTTGTTGCAGCTAGCTTTTATTACCATCATATATCCATGTCTTAC ACTGCAATATATGGGCCAAGCAGCATTTCTATCAAAGAACATGTTTCACA TGCGCACAAGTTTTTACGACTCCATCCCAGGTTTTGACCTCTCTCTCTCA CACATCTCCCTCCCTTCCGCTCCCTCCCTCTCTCCAGTGTTGTCTAACTT TAACTTGTCATCCAGGACCTGTATTTTGGCCTGTATTTGTGGTGGCTACT CTCGCTGCAGTAGTTGGAAGCCAGGCAGTCATTTCAGCAACGTTCTCTAT TGTAAAGCAATGCCATGCTTTGGGTTGTTTCCCACGAGTGAAGATTGTTC ACACATCGAGGTGGATCTATGGGCAGATATACATTCCTGAAATAAACTGG ATCCTTATGGTGCTCTGCGTAGGTGTCACAGTTGCGTTCGGTGATACAAC CCTTATTGGAAATGCCTATGGTAAGCTTTAAATAGCAATTGAGTATCTTT CTTGTACACAGGCTTTTGATTTTCCAGCGTTTTCTTTACTAAGAGTCTAA GCATTGTCCATTTTTCATATTTGCAGGTGTTGCTTGCATGACTGTTATGC TTGTTACTACATTCTTGATGTCATTGATCGTCATCTTTGTTTGGCAAAAG AACATAATATTCGCCTTGTTGTTCCTATTATTCTTCGGGACCATTGAAGC TGTGTATCTTTCCTCATCGCTCATGAAGGTTCATCAGGGAGGGTGGGTGC CTCTTGTGCTTGGTTTCATATTCATGTCTGTCATGTTCACTTGGCACTAT GGATCAAGGAAGAAATACCTGTTTGATCTTCAGAACAAAGTGTCAATGAG ATCAATCCTGTCTCTAGGTCCAAACCTTGGCATAGTTCGGGTTCCAGGAA TCGGACTGATCTACACAGAGCTGGTGACTGGTGTGCCCGCCATCTTCACA CATTTTGTCACCAATCTCCCTGCCTTTCATGAAGTCCTAGTATTCCTTTG TGTCAAGTCAGTACCAGTGCCATACGTGCCACCAGATGAACGATACCTCG TCGGTAGGATTGGACCCAGAGCGTACCGGATGTACCGTTGCATTGTCAGG TATGGTTACAAAGATGTGCAGAGAGATGATGAGAACTTCGAAAACATGCT AGTCATGAGCATCGCAAAGTTCATCATGATGGAAGCTGAGGACATCTCAT CTTCCGCAAGTTATGATATCGCTAATGAGGGCAGAATGGCCGTGATAAGA ACCACTGAAGATGCCGGCACCCCACTGGGCATGAGAGATCTGAGCGGCCT GGCTGAGTCCATCTCCACAACGAGGAGCAGCAAATCCGAGAGCCTCCGGA GCCTGCAGTCGTCCTACGAGCAGGAATCCCCGAGCGTGGGCCGGAGGCGG CGCGTCCGCTTCGAGCTGCCAAATGAGGACACCATGGACCAACAGGTGAA GGACGAGCTGCTGGCGCTCGTGGAGGCGAAACATGCTGGTGTCGCGTACA TCATGGGCCATTCTTACATCAAAGCTCGGAGGAGCTCCAGTTATGTGAAG AAGATTGTGATTGATGTCTGCTACTCTTTCCTCCGGAAGAACTGCAGAGG CCCGTCAGTCTCGCTGCATATTCCTCATATTAGCCTGATAGAAGTCGGTA TGATCTACTATGTGTAGTAGGCTGATGTGATCTTCTGCTCACATGGGGAT CAATCCGGTGGCAACAAGCATGGTGAGTCTGCTACACAAAGATATTATTT CGACATTTTTTGCGGGGGTGATATTATTTTGATATGCACATTGCCTTTTA TCAGTCCAAACTGACGAACTTCTCTTTTTCCAGTGCTACCTACGAGCCCC CATGCTTTTTGTCTGGAGTTCATGCTGCAACATGTAGTATGGAATGCTGC ATCCAGCCGTCCAACTGCTGAGATGAAGGCGCTGTGCATGCTAATATCAC TTCTCAGCCCCAATAAACTGCCAGACTCATATACTTAGTTTATGTTTCTT TGTTTTGGGTTTTTGCATCCATGATATGTATTTACTTTTTTGGAAAAACG TTGAAAGAAATCATCTGTCATATTAATTTTGCAACTTTCATGTGAAGCTT ACAATGTCAGTCATCTGGATTCACATACAACCATTCTATTCCTCTTATGC TTGGTACTCCCTCTGTGAGTAGTATTTAACAAAGGATAGCACTTCTCAAG TTTGTATCCCATGTTCTCAGTTTACAAGCGTATAGAAAACAAACATATGA AGTGCTTGAACATAAGACGTGTGTAACATATGAAACTAGCCTATCCTTTA TTGGGATATCTATTTTTTACATCAACTGCCAACAGAAAAGGGTTCAAGGA CTTGGTGAGCGTCAGTAGCGTCTAGCCGAACCAGCAGGAACAAAGCTTCA GACAGATGAACCAGCAGCAGCCACCGTCTTGTTGAGAAGCTCACGGAGCG CACCTGGAGAGGTCACCGGAGGGCTGCACTTGAACTCTTGGCACACATGC GCCACTGCTGGTTTCTCTGGTGGGCTGCTATGTGCCATCTGCGTGATGTT TGCATTGTTGCTCTCCCAGAACGTCATTTCTTCCATGTTCCTGGGGTCTA TCTGGATCACCTGGATCAACGAATGATGTATCCAGATCAGCAAATGTATA ATAAGGTGCTATGGTGAACATACAGTACAGCCAATTAGCTCATCACTCAC AGTTCTGTTTGGATCATATGATGAGAATGCAGCTGCAACCATGTCTTGAA ATTCTGCAGATCCTTTGTCCCCCACCAGCACTACCTGCTTCCTCGATGGG ACAGTGAGCATGTCTGCTGCGCAACACATCAGCGGCAGTGCTATACCAAG TTCTCTCAGTCTGGTCTCAAAGACCGCCTGCAAAGCAACAAATGCATAAG CGGGTCTCCTGTCGTCATATCTATGGCTGTAAAAATGACCATGACGTATG TCCAAACGTCTGCTGTTACTCGTGATAATTTCATCTCCGATGACATGCTA GATTAGTCACGATAGATACTCTTTTTTATTATTTACACCAATTCAAGCAC CAAGCGTGTGAAGTGAAATTCCCCTGTCCTATCGTTGCCCAAACCCACAT GTTGCACGATGATATAAATGTCTTAGCATAACAAAGATGCACCTATCGTT CTATCTGTTAGAAAAACATTATAAGCTATACAAATAAAAATGCACAATTA TTTATGTTACTGTGAATTGTAAACCTTTTGGTATAAAACAAAACAACTGC TGCAGTGTGGAGTATATAAATGTACACCAGATAAGTACATACCAGGAGAT GTTCAACATTACGTTTGTAGCCTTCAGATTTTGCAGCATCAAATATACTG GAGAATCTGATCATGTTGATCGCCGCCATCGAGTTTCCAGAGGGCTCTGC ACCATCATAATCTTCTTTAACACGCAAAAGGACAGAAGGGTCTTCTCCAG GAGTATTGAAATATCCACCCCCTTGTTTGTCCAAGAACAATTCATCCTGC AGATGTTTATAATTATGGCAAAGTATATAGAATAGATGTGAGATGTAACA TTGAGGAATTTATTATGTTTCACTTGCCTGAATGGCTTGCAGCTGGACAG CCCACAGAAGCCACTCTATCTTACCACCATATTCATAGAGATCCAGCAAG CCATTGATTAAAAAGGCATAATCATCTAAAAATCCTGGTGCTTTTGCTGG GCCATTTCGATAACTATGATGCAGCCTTTTTGAGCTTGCATCATAAAGTT TTTCCTTTATAAAATTCGCTGCCTTTTCTGCGACTTGGAGATATTCTACT GGCTGCAATATACAGAAATATGAGTTTCCAAGAGACAATTCATGTGACGG TAGCTATAATTGGATAGTGGATAAACACGGTGACGTGAAGCAGTAGAAGA AAAAAAATCTTGCACACAGCAGATAGCCATTTTAGACCTGATACAAAGCA ACAGATGCAAAAGAGAAGGTCCATGTACGACATGATGGTGTTTTCTATGG CATGCACAGCGCAAGATAATACAGTTTCATTTTAACACTTCTGAACAAAT GTATGGGCCTGCATTCCTAGGGATCGGTTTGAACAATGGAATCTAACATA GGCAGCAGGGATGGAAAATAGCTCCTGGCTTATCGATCGGCTGATCACAT ACATAATTACATAATTATAATAAACCTGCTGTCAATGAGGGAAAATGAAA TGCACATGGCAGAGCACAAAACTTACATCACATCCCATTACTGGGAAATA AAATTTGGTCACAGGTGGTTCTGACTTCAAAATTTGTGAAGCTCTTGCAA AGGCTGATATTGCTAATCCATTCCATGAAACAATAACCTAAAACAAATCA TCGTTAGTAGATTATGTGATCAGCTTAAACTTTAAAATGAGCTGTAGTCA ACATGTAGACAAGCACCTTGTCATCCAGATGTGGTCTTGGCCTTTTCGAC CGGACATCAAACAACCTCTGCCTGCAGTCTCCCAGGATTTGATAATACTC ATCAACAGACTTGCCAGACTTCGATGCTACCAGTGACCCCGATTTTCTTT CTATTAAAACATTTTTACCACTGAACTCGTTTTCAGGATCACTCATCCCC GAAAGGTCACAGTTGCCAGATGATTTAACATAGTAGTGATTCTTGAATAG CTCTGCGTTCTCCCCAAGTGTGTCTTCGATCTTTTCAACAAATATTAGGC AGCTTAAGCACACAATATAGCAGAAACTGAAGCCAACGAAATCAAAAAGA AAAAAATATAATTGCTGGCTGTGATCCTGGTATTTGCTTCAGTAGCAGGA GCATCGTGAGAATATTATGATGGGCAACAAGGAGTTGGGCCAAGTTATCA AGGGATTTATTTCCCAACATGGGTGGCAGTTTAGCACTAACTTTGTACTA ACTAAGTTTTAGTGACTCAACAGCGTGTTGTATTTTCCTTTATGCAAACT TTCGTGACCTTGTAATAAATCGGGATGCCTATGTATTTGCGTCAGAAAAA AATCGGGACGCCTGCATCTTCGGATGCAGAGGCCTGGGCAATTGCTATGT TCCATTTTCAAGAAAGATAAAATATAATGCGACTATTCAGTGAAATGATG CATAGCACCATGGTTTTTAAGGCGTCGCTGACGCCTAGGCAACGCTTAGG CGTCCAGGCGCGCCTCCTCCGCCTTGAAAAAATGGACGCTTTAGGCACCT AGGCGTCCAAAGCGCCCGCCTAGGCGTCAGAGCGCCCCTAGATCGCCTTA AGACGCCTTAAAAAACATGCATAGCACCAAGCATGTATGTATATGACCAA GAAGTTGACTTTTAGGAAGTATGTATATGACCAAGAAGTTGACTTGATGA GAACAGTTTACTTAAAATAATTTACTATAAGGAATTACGCAATATAATCA AGAAGCGCTTGCAGCTTTCAGATCCTAAGTTTTAACAATGGTATGACCTG AATCCTAACTACATTTACTGTGTAACAAGAATAGTGGAGACCATAATGGT CATCTAACTGAAGTGCATGCCCATTTAAAGAGCTCCGACATGTATACAGA CTTTTTTTGAGAAACCAGCAGGAGTGCAGCATTCCCCATGTAAAGAGAGC TCCGACATGAAGTGTCTACCATGTAATAGCGTTGAGCTCAAAGTCAACCA CAGATGGACTTAGATGATTGTATACAATAGTTTAAACTTCAAGGCCATTT TCTAAAGAAGTGGGGAAGGTTGTGCATTACGTTGGTGCATATATGGACCA ATAAGAATGTACCTCTTTACTAGTCCACACATAAAAGGAACCCTCCTTTT TCCTTGGAGCACCTTCATATTCTGCACTGTCAGCATCTTCTGCGGAGAAA ATTTCACCTTCTTCACCGATCATGTCTCTCCTCAAGTAATCAAGTATATC ACGTGCAACCGAAGAATAATACTCATCTCCCGTGATAACAAAAGTATCCA AGTAAACATTGGCTATCTGACCCTGGTCGTACAGCATCTTCTCAAAATGT GGAACTGCAAATAGAGAAGATATAAGAGGAGGATTTTGCAAAGACTTGAG AAGAAATTTTCTCCTTAATCTCAAAATGCATTTACCATGCCAGCACTCGT CCACACTGTATCTGTGAAAGCCACCGCCAATGTGGTCATGAACTCCACCT CTAGCCATACATTGCAGTGTACGACTTACCATCTTCATTATGTTTTGGGC TTCACTCTCTTGCCTAGCTTCCATGTGCTTCCGAAATTTATAGAGCATTA TACAATCTTCAACAGGTCTTGGAAACTTGGGAGCAGAGCCAAACCCACCA AATTTCGGGTCATAACTGCTTCCTAACTGCATGGGAATAAGGTGAAGGGC TATTAATCAACTAAACCACAAGAATTAACACCCGTTCTTCAAGTAATTCA AGTACACACCCATTGCTGATGTTCAACTATAACCAGCCAAAGTTAAGACC TTCCTACATATCAGCTTTTTTGTTGTTTTTGGTTGCCTTGTAAAATTCCC AATAAGAGGTGAAAAGTAGTAAAAATAAGCACAAATATGTCCATGTCAAG GATTTAGAATATCATCCACAGCAGGCTCTTCCTCAGAAGTTGTGGCTATG CCATTACTATGCTTGTTACAACACCATCTCAATTAAGGACTAAGGAAATT GACATCCTAATAGATGCTGGTCAAGGTAGTGGTGCCGAGTTAAGGATAGT CAGTGTCCTATCAAGCCATGAAATAAATC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.