Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA008710

[Submit comment/correction]

Sequence	AA008710
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA008710
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCACCACACTCAGTTGTCACTCGAAATCCTCTCCATTCTCTCGGAGAGGC GCCAGTGGGAGGAGGAGAGGCAGCCATGGCAGCGGCGGTGGTGAGGTACG GCATAGTTGGGGTAGGGATGATGGGTAGGGAGCACCTCCACAACCTCGCC CACCTCGCCGGACAAGTCGAGCGGGAGCAGTCCGTCCGCATCCGCGTCAC CTGCCTCGCCGACCCCCACCCAGAGTCCCTCCTCCTCGGCCTCCGCCTCG CCGCCGAGCTTGGCTTCCCAGCTCCCCAGGTACATGACACAGCCTCCAGT CACATGAATATGATATAATCGTTGCCTTGCTGGTTGTAGAATGTTGAGCC AGTCACACATGATCAGCTAGGTTCTGTACTCTCCCGTAGTTCCGTTGGTA CTTAGATTCCATCTGAATTTTATTCAATTGGAAATACAGGTGTATGAAAA GAGTATTCAAAGTCTAGCTGTTCCAGAAATACTGAGATTACTTATGGTAG ACTGTATTTACTGTGCTACTGCGTGTGTTCTCTGCCTGTTACCAAATCCT TAAAAACCAGAACTTGTCAAGACATTTTCAGGTCACCGCGAGTTGCTGGA CAGCGGGCTATGTGACGCCGTTGTTGTGTCGTCACCAAACATGACACACT GTGAGATACTCATGGATATTATTGGTTTCGCCAAGCCACACCACGTTCTT GTTGAGAAGCCTTTGTGCACCACGGTGCAGGACTGTAAGAAGGTGAGGCC ATGTTCTGGTCAGGGTTGTGCTATGCAATGTACTGTACACATTAACTGCT GTAAAAGTAAAATACCTTTTTGATAGAGGAGGAGAAACTCTGGTATAATA TAAATATTTAAGGGAGGCATCAGAAACCATTACAGGGACAATACTATACA AAAATTCTTATGGCCACACAGCCTGCTCAAGCGTACAGCAAAAGCATCTC AAAAGAAAAGTGTCACTTGATACTTGAGTAAAACGTTGAAAGTGAGAACA ACAAGTGCTGCTGATGAATTTTAACTTTGCTACTTTTTAATAAATATTAT CTCAATGCCTTTTATATGTTATGTAGTTTCTCATCGTCATAGCTAGAGAG ACCAGTGGTAATATTCTGGACTAAGGTAGATGGTAGTTGAGTACTCTGTT GCCTTTGATTAACTCAGACGAGATCAGAACAGTGATGCATATGTTGTTCA GTAAATAATTAAGATGAGCTGCTACGTACGATGATTTGGGTATGATAAAA CAAAATTAGGAAATGAGCCTTAACAGGCGAAACGGCAATGTGTCTGGTCG TAGCAGTGTCGTATCAAAAAAACCTCTTATGCACATCAGTTCCGATAATT AAATTACATCCAGGGATACTAGCTTTTATCCCAAGAAATTCAAGAATCCT AGAAACCTGTCGCCAGTACTTATTTGAAATCTTTTTTCCTTCTATCAGCA GACATCTCATACTCTCTTGGAAGACTGTTCCATCTGAATCTTTTTTGACT TTTACTACTCCCTCTAATCCATAATAAGTGTCGCGGATTTAGTACAGCTT ATTATGGATCGGAGGGAGTACCTTTTTTTACCATCTTAGACATTTGTTGA ACAACGTAAATTAAGATAAAGGGGTACCATTCCCATAGAAATAAAAGTGA AAGTGAGCTAGCCACACTGCTGAATACACCGATTTCATGGTATTTGGTCT TGAATCCACATGGATTGATCTTGTGTATTTGTTTATCTGTCATGAAGTGC TACATACCTTAGAGGTGATGTTCATTGTTCTTACGATTTGCAAGTCCTCT GAATCTCTGCAACCTTATTCTTTGGATATCTGAAACTTCTTTTCTCAGTA TAGGTCATAGAAGCTGCTAAACAGAGACCGGACATACTTGTGCAAGTTGG ATTAGAGTACAGGTATATGCCTCCTGTGGCTAAGCTGATAGATATTGTTA AAAGTGGTACACTAGGGCATGTCAGAATGGTGGCTATTCGTGAGCACCGG TTTCCTTTCCTTGTTAAGGTACAAGATCCAAATATGTGATACTTGTGATA AGTAATAATTTCCTTGTGTCTTTAACTCCTAAAACTCTTGCAGGTGAACG ACTGGAATAGGTTTAATTGCAACAGTGGAGGGACTCTGGTTGAGAAGTGC TGCCACTTTTTTGATTTGTTGAGATTGTTTGCAGATGCGAACCCTGTTCG TGTGATGGCCTCTGGAGCTATTGATGTTAACCACAAAGATGAGGTTTATG ATGGAAAGGTCAGGGTTCAGTGACTACAAGCTCTCTCCTCTCACTGTACT ACTTACTACTAGTAATTGAGCACGTGCACATGCACGATTTTATAGAATGC CCAAATTAGATGACAATAAAACACATGCACGTTTCATAGAATGCCCAAAT TAGATGACAATATACTAATATTACATGTGCAATGCACGTGTCTTCTCTTG CTTTAAAACATTTAAAAAACATTTTTGAATAATGGTTTTAATTTTAATGC CAAGCAAATTTTGGTGTGCGGGTAATTTTAAAATAAATGAAATAATTACA GATTTTGAATTGTTTTCATCAATAAGGAAGAATTGTGTCTTGTCAACTTC CAGAATTTTGAAACAAATATGATGTTTGTATGACCTGGTTGTCTTGATTA GGATACGTTTTTCTAAATAAATTGATTTGCTAATGCCGTTTAATTTCTCC CATGCTTTTTTTCTGCCATGCTTGATGGTACCGACGTTCCCATTGCGAGA GAGCAGTTTACAACATGTAAGGAACGCTATGCAGGGAACACTCCATGCAA GGTTTCAAAATTGGATTCAAATAGTCCCTGCTTCTCGCAAGGGTGACCTC ACATTAAGGAAATATCCAGGATCAGTTTCAACATCTGACTTCCTTAAGTC TGCTACTTGGGTACAAGACAATTGCATAGAAGCTAGTCAAAGATTTAACT TATTAATACTTTCTTAAAAACTGCTTATTACGAACATCTATTATCTGCCA CTCAGATTGCATTTGCGACATGTAATCTCCACAACACCTATTTTTAAAGA ATTAGGGATGCATTTGAGGACTATGATATTGGAAATTTGGCATAATCTGG TGTAATAGGATTTTGAATCCTTGTAACAGAAATGAAATTATGGAGAGGCC TGCAGGGTGCCCTACCAGATTAGAAACATAAAAAAACTTTATATCTTGCT GAAATTGGGTGTAAGCCTTTTAAATTGCTTCATTCATATTCTAAGACCCT TTGTTTTTTTCTAGCAGTCTCGTGGAAATGATAAACAAAATCGCCAATGT TAGAAGGATAATGAAATATCTTAGAATAAGAAATGGAGTGAATTCTGGTG ACAAAAAAAACTTACATACGGCTGTGGTCCAGAGAACCAATGGCGGACAT CCATGGAGGCAGACATCAAGCTATATGTTGTGTTTATAGTCAACTACCTT TGCTTTGCCCATTGGTTATATCCTGAAATGGAGCACGGTTTTGAGATGAC ATACGGATTTCTGCTTTATATATCTAGGAAAATAAACACAGGTATTAACA AGTACCGACTCAACTTTAGTCGATATACACATGAATTGCACATGCAATGC ATGTTCTGAAAAATATAAATTTATAGACAAATGCATTCTGAACCCGTGCA ACTAATCTCAATATGACAAATAAGCTCACTCTGCATTTCTACACAACAAT TAAGCAGTCCAATGACTGCTCTCAAGATGACAATTTATATCCTAGGCCAC GCCATATATTTTTTGAAGAATATACATAGCAGCCTAAACTGTTGTATTCA TGTTATTAGAAGGAAAAATGTTTAATACAAGGATGGCCAACAAAGTCAGA TGCTCTGATATAACCATCAGCGAGCTAAGCCCATCCAGATCGCCTTAAGG AAGAACGCACACATGCTCTTGACAGCGGCTGGACACCTTTCCTGCAGATG GCTGTAAACATGAACCATGGATTGGAGTGGTGCAACTTCATTTTCACACA AATGGTTGGAGAATCAGGCCATCTTTCTCTACATAATTTCACGGGACAAA GGTCAAATTTTCACACAATATGCTAAAGTGAAAAACCGATGAGTTCATTC GCTAGGTTTCTGAGGTTGCCAATATCATATCTCCTGTACCAACAACATTT TTAATATGCTCCTCCTTGTCATCTCTAGCAATTTTTTCTTGCACCCTAAA AGGACAATATAAGAAGAAGAATAAGATAATGTCAAATTTAAAGGCTAGAA ATACGAACTTTATGAATTGTTTCCTAGTCTGGCGTTACATGTGCTGGATT TCTGCTCTATATATCTGGGAAAATAAACACAACTATTATACAATACCGAA TCCCCGCAAATTGTGGCGACGGATTGTGTTGGCGCACTGGCGTTAGGGAA GCCTTTCCTCCCGACGTGCAGCGCGACCTCGGCGGGGGCGGCGACAATCG CGTCTCAGCGGGGGAGGAGGCGACATCAGGGAGGCCTCTCCTCATGGCGT ACAGGCGGGGCAGCGACGGCAGCGTGTCGGCGGGGGGCGGCGGAAGAGGC GGCGACGGTGGATTCCACGGCGGCTTCCGCGAGGCGACGGTGGATTCCGC GGTGGCGTCCACGAGGCGACGGCCGCGTCTCAGAGAGGGAGGAGGCGGTG GCTTCCGCCGCGGCGGCGGCGGTGGATTTCGCCGCGACCTCCAGGGCGGC CTCTCGTCCCAGCGTGCAAGCATCACCTCTCTTCCTGCGGGGGACGCGAG GGCGGCGATGGCCGGGTCTCGGCAGGGCGGAGGCCGCCGCCTCCGGCGGA GGCGGGGGCGTTGGCTTGCGCAGGGGCGGAGGCGAGGGCGGTGGCTTCCG ATGGTCTGGGCGTGGGGTGTGAACGGTTCGTGCGTTGATAGGTAAAAAAA AAGGCTCGCGGGATTGTCCGCCCACTACCGTGATGAGCCGATAAAGACGG GACAATTTTCATCCGTCCGATAATCGCATCGTACGGCCACACTGCGTTGG ATTTGACCCTCTGGGTCTTTTTATATTAGTTTAGAAGTTTAGATGGTCTT GCAAGTTAAAAAGCATGTATGCTGAAGTAATAGCGCAGTGGATACATTCG TCATACTCGGAAAAAAACTCCCCCTTCCGCGTCGCTCCCGCGAGCGACCG GGGGGAACCCTAGCGCCGCCGGGCCGCTTCTCCCCCTCCGGCTCCTCCCT CCTCGCCGTCGCCAGGACGCGCCGGCGGCAAAGCCGCTCGGCGTCGGTGG TGGCGGGGCCCCTCTTCTCCCCTTGGTTCGCCAGATCTCGGTGCGGGCTG AGCTCGACATCCGGCGGCGGCGCCCAGCTAGGTGGCGCAGTGGTGGCCGT GCTGAGTCTTGGCGTGGCGGCGACACCCTGCTGTAGCGAGGAGGGCTGCG TGGAGCAGGGGTTTTCGTGCTCGGGGCTGGCGGTTGCTGCGCCAGGGCGG CGAGGGCCATGGGCGGCGTTGGCCGTGGGCGGCGGTGGTTCGGGCGGCGT CTCGGAGGCCGCTCCCTGGCAGGCGGGCGCTCCTCTAGCAGATGCAGCGG CGGCGCAGGACGGCGGGGGTGCTGCAGCGACAGGACTTCTACCGGACGGC GCTCCGACTCGGGCCCGGATCCGGACCGGCCATGGGCCAGGTGGGCCTGG GGCGGTCTAGTACGGGCAGCGATGAGGCTCCCCACCCGTGAAGCTCCTGA AGGTGGTGCTGGCCGCCTCGGGCCCTCTGGGCTTCGGTGTGTGAACAGGC TAGATCTAGGCCAGGCGGGCCTGGATCTGACAGCAACCTCATCGCGATGG GCCTTTGCTGGTGTTCTGGAGGGTGCCGTGGCTGCACAGTGGTAGGGTCG TCGGGACGGCATCTGGTGGGTCTCCTCAGACCGGCGGCGGTCCGGTTGGA CCGGGTGGGCATGATGGCGATGGCGCTGCTGCTTGGCTGCGGGGATCTGC GGTGCACGGATGAGTTGGAACTAGCGCTATATGGTTGGTGACGACAGTGT CACCCTTGCTGCAGTGTGGCGGCGGGGCTTCACGAGTCCATTTGGGCTTG GCCAGGCCAGCGAGGGCCTGGTTTGCCCCTGCTGCTACATCCGGTCGGCT ATCGCCCTCCGGCGGTGGAGGAAATTCCCTCCCGCGTGGTACTGTACTGC CGATCCCGCCGAAGTTTCGTCTTTTCGGTCCTACCAGCCGTGCATCGTGG GTCACGGTGAGACGGACGGTGGTGATTGCAAGACCGTGGTGGCGTGTGCT GGTGGGCGGCAAGCTTGGTGGAGCTATCCTAAGAGTCCGGGAGTGTGTTT TTTTGAGGGGTCGGGAGAAATCCTTGTCGTCTAGACACCGATGTGGTGAC GCCTGCGGGTGTTGCCGTCCTTCCTGAGGGGCGTTGGTCATATCTCTTCC CCACCTCCCGTAGCGTATCGGGGAAACCCTAGGACCTGTCCGGGCAGCAG CGTCGTTGTCGTCGCTTTCCTTCTTGGAGGTGCTGCTTGGTACGGAGAGC TAGGAGCGAGGTGGCAATTCTCCGGAGGACGCAGCGGTGACGGGTCACCC CTGTTTTTTCATCGAGCCACTGTTGTCGGCTTTATTTTCTCTCCTTTTTC TTCTCTTTTTCTTTTTTGTTCTCTGTGTTTTTCTTTTGGGAGTTGTGCTG TCTGGACCAGCAGCGGTCTCAATCGTGGTTGCTATATTTATATAGCTGGG CGTATGCCTGTTTCGAGGAAGTAATCAGTGTTAATGATTCCTTATTAATA TTTTCTGTTTGATTTATGGAATACTGGATGGGATTTGAACTCATCAAGTA ACCATGATATATAGATTTTTAAGCTATCAGGCAATCTTCGAGCTCTTCCG AAGTTCTGATATAGTAGACACACTTCAGTTAAAACAGTGGTGCTTGGTTT CTAAATTTTCTCTCTGGATGCAGGTGCCAGATATAATTGATAATGCATAT GTAATCGTAGAATTCGATAATGGCTGCCGTGGCATGCTTGATCTCTGCAT GTTTGCTGAAGGTAGTAAAAATGAGCAGGAAATTTGTGTTGTTGGTGACA TTGGAAAGGTAGAACCAAACGCTTTTGCTACTTTAATTTTCGAAATTAGA TGCACGTATTAAATAACTCTAGATATATGTTGTCTGGTATGGTCAGTTTG TAGTCTGGTGTCATTTATCATTTTTTTCTTCACCCCCATATTTCCTAAAC GATTTGTATTTTGTGGGGAGTTTATATAGTTTATACTCAAATTTTGATAT GTACGATTTTCGTTTAAATAGTAGGCAATTGAATGCCAGGTAAATAACCT GAATTTTTATATGTCTAATAATCACTACAGGTAGGTATTCCTCAAATTAC ACTAATCCATTTCTAAGAAAATTAATGATTCCGAGATTATGAATAACATT TGGGAATCTACATAATAAGTTATATTGGAAGCAGAAAAACATCTGTAAAT ATGGCATGCATGTTTTGTGCATATGATTGAACTACTGATTACCAGCTTAC TTTGCTAAATTCCGACACGGTCACATTTAAGAAAAACAGAAATAATTTGT TCTAGGATTTTGGAGACACGTGATACGTTTCCCAGCCATGAAATGTGTAG GTTTGCACAATGTTATAGCCAAATAAGTAGCATTAAGCCGTTTGATATAG TGGCTGTATATAATCTCTGTTTGACTTCCTCCTGGTGCTAGCATCTTACC TGGTTTATACTGTGCTGCAAGATTGCAAATAATTGTTCAACATGATCTTA GACACTGATGCTATTATGAACCTGGATCTAGAAGGAGATAACTTGGGTAG GGTAAAGGTCCGAAGAACGGGGCTAGGGCACCCACCCTCAATAATCCAGC GACATTGCTCGTCCCTGACGAGGAAGAGAAGCTCTGAGGCTTAAATTATT TTTTATTTCATCACTTAGTTCAATGAGGTACAAGGTAGCTCTCATATTGG CAACTCCATTTGTCTCGCAAGACACAAACTGTATCTCTATCTTTCTAACT AAATTGGTCTTTCTCAATACGTCAATTCTTTCCCAGTTAACTTATCTCAA TCCCCTAACGCTATTATGATTCTTGATTGTTAACAGCCTATTAAGTCCTA TGCTATAAACGGGCTGGCCTACCTATCCATAATAGATGCATATCAGATGC AGTAATAACAAATGCGGGGCCTGTCTAGGTAATACTGCACTCTAGGTGAG CTATAGTACATGCTCAGCTTTCAGAAGGCTGCAGTTCACCGGTGAATCTA TTATGAATGGATTATCAATGGTCACCCCAATCGTTTTTCATATATCACAT GCATCTCTACATTTGATGCATGTGTATCATATGTGGGGCCTGTCAGGGTA ATATTGCATCCTCTAGAGTAGCCATTGTGCATGCTCAAGTCTTCATAAAG GCTACGGATCACCGGTTACCACAACCCTTAAAGATAAATCACATGCATTT CTACACCGTAGCACCAGACAAAAGATTGGCTTTATGTATAACCAAGAGCA TGAAAGGAGACAAATGGCATGAGCCATTACAAAATTATAACACAGTGGGA TCAAATGAGAAAGGGAGGCATCGTGAAAAGAAGTTTCAAGTTGTACATGA AGCAGACGCTCGGTTTCTCTCATCACTAGGATTTGAGAAAAGTTGCTTCT CACTCAAAGACCAAGGTTGTTTAGTTGTTGCATTGCAATCGGTGCAAGGG AAAAGCACTGTGCATGTTTGTTTTTGTCAGATCAATGGATCTGCCTCTGC CTGTCCTCCAACACATTTGCTAAACATAACCTATTACAATTTTAACTGCT TCTGTAGGATAAACGAATTTTAGTTTCATGTGTAGAATAAAAGGGTCATA CTTTAGGCACTCCAGAATACAAATGTACAGCAGCTCAAAAAAAGAATACA GATGTACAGTATATCAATTCAATTTATGAAATTCCAGTATCTGTTTTTAA TAGAAATTTTCAAACAGGGTGAGGCTTTCGTTCCAGAGAGCATTGTGAGG GTTGGGAAGCGAGCAGGAGGTAGAGATGGAGTGGAAAAGATAAAGGCTGA AGACGACCGAATCAAGTATGTTCTACTTTGCAACAATATACTACAACATT TTGTTGATCTTAACATTTCAACAACAAAAGATTAAGAAAAACTTATATTC TTTTGATAGACATATGACGCCTATAGTTCTTCTTCCAGAAATAGAACTGG TTTCGAGTTCAGACCTTCTACTCCCTCAGACCCAAAATAAATGTGGGAGA TGTAGTACAAAATTTGTACGAAAACAGTACTAAATCACCGACATTTATTA TGGATCGGAGGGAGTACTAGCTTTCAAGATAAGTGGTTTACCATGGTTCT GCATCAAATTATTATATACACATATCTAACGAGGTGTTCATTGTTTAGGT ACCAGGGGCTTCACCATGGATCTAGCTACTTGGAGCACCTCAATTTCTTG TCTGCCATCAGGGCTCAAGGTGCCTGTAGCCCAACTATAAACTTGAATGA CGGCTTACTATCTGTTGCGATCGGCGTTGCTGGCCAATTGTCGATTGAGA AAGGCCGTTTTGTTACTATTGACGAGGTGTTATCAAGCGGATAATCAGCT ATTTGCCGATGTACTGTAGATTTTACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.